東北大学研究者紹介

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ミナミサワ　キワム

南澤　究

Kiwamu Minamisawa

所属

大学院生命科学研究科　生態発生適応科学専攻　土壌微生物分野

職名

特任教授（研究）

学位

農学博士（東京大学）

researchmap

https://researchmap.jp/read0052233

J-GLOBAL ID

200901009124178482

経歴 6

2020年4月～継続中

東北大学　特任教授
2001年4月～ 2020年3月

東北大学　大学院生命科学研究科　教授
1996年7月～ 2001年3月

東北大学　遺伝生態研究センター　教授
1990年5月～ 1996年6月

茨城大学　農学部　助教授
1993年4月～ 1993年9月

テネシー大学　微生物学科　客員研究員
1983年10月～ 1990年4月

茨城大学農学部助手

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学歴 3

東京大学　農学系研究科　農芸化学

～ 1983年9月30日
東京大学　農学部　農芸化学科

～ 1979年3月30日
東京大学　農学博士

1986年6月～

委員歴 45

International Congress on Nitrogen Fixation　International Program Committee

2013年1月～継続中
Asian Conference of Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　International Advisory Committee

2013年1月～継続中
Microbes and Environments　編集委員

2011年1月～継続中
農林水産省農林水産技術会議事務局、環境省自然環境局　農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業研究課題評価分科会委員

2015年10月～ 2018年3月
European Nitrogen Fixation Congresses　International Advisory Committee

2013年1月～ 2017年12月
ISME Journal (国際微生物生態学会)　Senior Editor (主席編集委員)

2011年1月～ 2017年12月
Applied and Environmental Microbiology (米国微生物学会)　Editorial Board Member (編集委員)

2000年1月～ 2017年12月
農林水産省農林水産技術会議事務局、環境省自然環境局　生物多様性影響評価検討会委員

2010年6月～ 2017年3月
農林水産省農林水産技術会議事務局　拡散防止措置確認会議会委員

2010年6月～ 2017年3月
国立大学法人宮崎大学フロンティア科学実験総合センター　NBRP ミヤコグサ・ダイズ運営委員会委員

2010年6月～ 2017年3月
日本微生物生態学会　会長

2013年1月～ 2016年12月
International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-legumes　International Scientific Committee

2013年1月～ 2016年12月
国立大学法人東京大学大学院農学生命科学研究科　平成27年度新たな指標細菌による畜産物汚染検出法開発事業事業推進委員

2015年5月～ 2016年3月
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構北海道農業研究センター　外部委員(アドバイザー) 「施用効果の安定性に優れ、低コスト省力型栽培を可能にする新規微生物資材の開発」

2014年7月～ 2016年3月
(公社)農林水産・食品産業技術振興協会　農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業 1次(書面)審査専門評価委員

2013年4月～ 2016年3月
山口大学農学部、山口大学共同獣医学部　中高温微生物研究センター評価委員会委員

2014年10月～ 2015年3月
Plant and Cell Physiology　Associate Editor

2013年1月～ 2015年3月
Plant and Cell Physiology　編集委員

2013年1月～ 2015年3月
Molecular Plant-Microbe Interactions　Associate Editor

2012年1月～ 2013年12月
Molecular Plant-Microbe Interactions　編集委員

2012年1月～ 2013年12月
Molecular Plant-Microbe Interactions (米国植物病理学会)　Associate Editor (編集委員)

2011年1月～ 2013年12月
18th International Congress on Nitrogen Fixation　Chair

2012年1月～ 2013年10月
18th International Congress on Nitrogen Fixation　開催責任者

2012年1月～ 2013年10月
独立行政法人日本学術振興会　特別研究員等審査会専門委員および国際事業委員会書面審査員

2010年8月～ 2011年7月
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構生物系特定産業技術研究支援センター　「イノベーション創出基礎的研究推進事業」書類審査専門委員

2010年3月～ 2011年3月
独立行政法人農業生物資源研究所　農林水産省交付金プロジェクト研究「共生系の解明による生物制御基盤技術の開発(植物分野)」評価委員

2009年2月～ 2010年2月
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構生物系特定産業技術研究支援センター　「新技術・新分野創出のための基礎研究推進事業」平成２０年度終了課題の事後評価専門委員

2009年1月～ 2009年3月
日本学術会議研究連絡委員　微生物学研究連絡委員

2003年10月～ 2006年9月
農林水産省生物多様性影響評価委員会　生物多様性影響評価委員会委員

2004年2月～ 2006年2月
環境省　生物多様性影響評価委員

2004年4月～ 2005年3月
日本土壌肥料学会　欧文誌Soil Sci. Plant Nutr.編集委員

1999年4月～ 2002年3月
日本土壌肥料学会　土壌生物部門長

1999年4月～ 2001年3月
（独）農業・食品産業技術総合研究機構中央農業総合研究センター　「生物機能を活用した環境負荷低減技術の開発」外部委員

2009年1月～
日本微生物生態学会編集委員長　Editor-In-Chief of Microbes and Environments

2007年1月～
日本微生物生態学会編集委員長　Microbes and Environments雑誌編集委員長

2007年1月～
微生物生態学会学際シンポ「土壌における原生生物の多様性と微生物との相互作用」　オーガナイザー

2006年11月～
独立行政法人農業生物資源研究所評価委員　共生系プロジェクト外部評価委員

2005年5月～
独立行政法人農業生物資源研究所評価委員　共生系プロジェクト外部評価委員

2005年5月～
農業・生物系特定産業技術機構　生物機能プロジェクト外部評価委員

2004年5月～
日本微生物生態学会　代表幹事

2001年1月～
日本土壌微生物学会　代表評議員

2000年4月～
日本学術会議　微生物研究連絡委員会委員

1999年10月～
国際窒素固定会議　国際助言委員会委員

1999年6月～
日本微生物生態学会　評議員

1999年4月～
日本土壌微生物学会　評議員

1998年4月～

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所属学協会 11

日本微生物生態学会

～継続中
日本植物生理学会
日本細菌学会
日本ゲノム微生物学会
国際窒素固定会議
植物微生物研究会
米国植物病理学会
米国微生物学会
日本農芸化学会
日本土壌微生物学会
日本土壌肥料学会

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研究キーワード 5

ゲノム
根粒菌
植物内生菌
植物微生物相互作用
共生

研究分野 4

環境・農学 / ランドスケープ科学 /
環境・農学 / 環境農学 /
ライフサイエンス / 応用生物化学 /
ライフサイエンス / 植物栄養学、土壌学 / 土壌微生物学

受賞 13

日本農学賞・読売農学賞

2020年4月　日本農学会　窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究
第28回研究交流会学生優秀発表者ポスター賞

2018年9月　植物微生物研究会　メドハギとダイズの根粒菌ゲノム比較と共生アイランド進化
第27回研究交流会学生優秀発表者新人賞

2017年9月　植物微生物研究会　共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌共生アイランドの実験室進化
優秀ポスター賞

2017年8月　環境微生物系学会合同大会2017　共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌ゲノムの実験室進化：共生アイランドの大規模欠失
第26回研究交流会学生優秀発表賞

2016年9月　植物微生物研究会　ダイズ根粒菌３型分泌エフェクター遺伝子の多様性
2015年度日本微生物生態学会 M&E論文賞

2015年10月　日本微生物生態学会　Low nitrogen fertilization adapts rice root microbiome to low nutrient environment by changing biogeochemical functions
生命医薬情報連合大会2015 ポスター賞

2015年10月　日本バイオインフォマティクス学会　Metagenome-mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia
日本微生物生態学会ポスター賞

2013年11月　日本微生物生態学会　アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N2O発生の特定
日本土壌肥料学会ポスター賞

2013年9月　日本土壌肥料学会　ダイズ根粒菌におけるN2O還元酵素活性を制御している遺伝子の同定とN2O削減への利用
第22回研究交流会学生優秀発表賞

2012年9月　植物微生物研究会　Aurantimonas 属細菌 AU20 株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する
21世紀発明奨励賞

2011年6月20日　社団法人発明協会　遺伝子導入用スーパーアグロバクテリウムの発明
日本土壌肥料学会賞

2003年4月1日　日本土壌肥料学会　共生窒素固定細菌の遺伝生態に関する研究
日本土壌肥料学会奨励賞

1987年4月1日　日本土壌肥料学会　優良ダイズ根粒菌に関する研究

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論文 276

Mitigating nitrous oxide emission by an ultra-fast bioprocess enabling the removal of high concentration N₂O

Ryota Maeda, Mikiko Sato, Kiwamu Minamisawa, Kengo Kubota

2024年10月8日
出版者・発行元： Cold Spring Harbor Laboratory
DOI： 10.1101/2024.10.08.615939 　

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Abstract Nitrous oxide (N₂O) is known as a greenhouse gas as well as an ozone-depleting substance. Wastewater treatment process is one of the sources of N₂O emission, and the high concentrations of N₂O in off-gas were reported from an anaerobic ammonium oxidation process. This study developed a novel N₂O removal process using a down-flow hanging sponge reactor to remove high concentrations of N₂O. More than 96% removal efficiencies were achieved for up to 300 ppm N₂O with 3 min gas retention time (GRT), and more than 99% removal efficiency was obtained for 2,000 ppm N₂O with 18 min GRT. A maximum removal rate of 161 ± 26 mg-N/L-reactor/day was achieved, that was over 10 times faster than the pioneering process. Kinetic analysis indicated that the N₂O dissolution rate is a crucial factor in determining the N₂O removal rate in the reactor. Various N₂O reducers belonging to both clade I and II were detected in reactors, andAzonexuswas thought to play a key role.
P3-1-25 ダイズ根粒菌接種は土壌細菌叢を変化させるか？ -土地利用の影響との比較-（3-1 土壌生物の生態と機能 2024年度福岡大会）

原新太郎, 柿崎芳里, 番場大, 板倉学, 菅原雅之, 鈴木淳夫, 佐々木勇麻, 武田真憲, 多胡香奈子, 大林翼, 青野俊裕, 島田紘明, 新宮原諒, 増田幸子, 柴田ありさ, 白須賢, 和穎朗太, 秋山博子, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　70　36-36　2024年8月26日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.70.0_36_3 　

ISSN：0288-5840

eISSN：2424-0575
P8-2-21 Bradyrhizobium ottawaense SG09接種によるダイズ根粒由来N₂O削減効果のポットスケール検証（8-2 地球環境 2024年度福岡大会）

坪倉美紗, 原新太郎, 武田真憲, 佐々木勇麻, 南澤究, 秋山博子

日本土壌肥料学会講演要旨集　70　162-162　2024年8月26日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.70.0_162_3 　

ISSN：0288-5840

eISSN：2424-0575
Dynamics of N2O production and reduction processes in a soybean field revealed by isotopocule analyses 査読有り

Sakae Toyoda, Fadwa Damak, Shohei Hattori, Masanori Takeda, Hiroko Akiyama, Yuma Sasaki, Kiwamu Minamisawa

Soil Biology and Biochemistry　191　109358-109358　2024年4月
出版者・発行元： Elsevier BV
DOI： 10.1016/j.soilbio.2024.109358 　

ISSN：0038-0717
Does Rhizobial Inoculation Change the Microbial Community in Field Soils? A‍ ‍Comparison with Agricultural Land-use Changes

Shintaro Hara, Kaori Kakizaki, Masaru Bamba, Manabu Itakura, Masayuki Sugawara, Atsuo Suzuki, Yuma Sasaki, Masanori Takeda, Kanako Tago, Tsubasa Ohbayashi, Toshihiro Aono, Luciano Nobuhiro Aoyagi, Hiroaki Shimada, Ryo Shingubara, Sachiko Masuda, Arisa Shibata, Ken Shirasu, Rota Wagai, Hiroko Akiyama, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　39　(3)　n/a-n/a　2024年
出版者・発行元： Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.me24006 　

ISSN：1342-6311

eISSN：1347-4405
Bradyrhizobium ottawaense efficiently reduces nitrous oxide through high nosZ gene expression 査読有り

Sawa Wasai-Hara, Manabu Itakura, Arthur Fernandes Siqueira, Daisaku Takemoto, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Noritoshi Inagaki, Toshimasa Yamazaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Yoshikazu Shimoda, Kiwamu Minamisawa

Scientific Reports　13　(1)　2023年11月1日
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41598-023-46019-w 　

eISSN：2045-2322

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Abstract N₂O is an important greenhouse gas influencing global warming, and agricultural land is the predominant (anthropogenic) source of N₂O emissions. Here, we report the high N₂O-reducing activity of Bradyrhizobium ottawaense, suggesting the potential for efficiently mitigating N₂O emission from agricultural lands. Among the 15 B. ottawaense isolates examined, the N₂O-reducing activities of most (13) strains were approximately five-fold higher than that of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110^T under anaerobic conditions. This robust N₂O-reducing activity of B. ottawaense was confirmed by N₂O reductase (NosZ) protein levels and by mitigation of N₂O emitted by nodule decomposition in laboratory system. While the NosZ of B. ottawaense and B. diazoefficiens showed high homology, nosZ gene expression in B. ottawaense was over 150-fold higher than that in B. diazoefficiens USDA110^T, suggesting the high N₂O-reducing activity of B. ottawaense is achieved by high nos expression. Furthermore, we examined the nos operon transcription start sites and found that, unlike B. diazoefficiens, B. ottawaense has two transcription start sites under N₂O-respiring conditions, which may contribute to the high nosZ expression. Our study indicates the potential of B. ottawaense for effective N₂O reduction and unique regulation of nos gene expression towards the high performance of N₂O mitigation in the soil.
Synergistic N2-fixation and salt stress mitigation in soybean through dual inoculation of ACC deaminase-producing Pseudomonas and Bradyrhizobium 査読有り

Khin Thuzar Win, Sawa Wasai-Hara, Fukuyo Tanaka, Aung Zaw Oo, Kiwamu Minamisawa, Yoshikazu Shimoda, Haruko Imaizumi-Anraku

Scientific Reports　13　(1)　2023年10月10日
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41598-023-43891-4 　

eISSN：2045-2322

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Abstract We investigated the potential dual application of two Bradyrhizobium strains (B. diazoefficiens USDA110 and B. ottawaense SG09) and plant growth-promoting bacteria, PGPB (Pseudomonas spp.: OFT2 and OFT5), to improve nodulation and N₂-fixation in soybean plants. The growth-promoting effects of dual inoculation were observed on plant growth, physiology, and nodulation of soybean under normal conditions compared with plants individually inoculated with either USDA110 or SG09. Both OFT2 and OFT5 promoted N₂-fixation by 11% and 56%, respectively, when dual inoculation with USDA110 and by 76% and 81%, respectively, when dual inoculation with SG09. Salinity stress significantly reduces soybean growth, physiology, nutrient uptake, nodulation, and N₂-fixation. However, these adverse effects were attenuated by the dual inoculation of PGPB and rhizobia depending on the combination of inoculants. In particular, dual inoculation of PGPB with SG09 was more effective in enhancing the salt tolerance of soybean by reducing salt-induced ethylene production and improving nutrient uptake. However, no such effect was observed with the combined inoculation of USDA110 and OFT5. An effective symbiotic association between SG09 and two Pseudomonas bacteria can be considered a beneficial approach to improving the symbiotic efficiency of nodulation and mitigating salinity stress in soybeans.
Seasonal Shifts in Bacterial Community Structures in the Lateral Root of Sugar Beet Grown in an Andosol Field in Japan 査読有り

Seishi Ikeda, Kazuyuki Okazaki, Hiroyuki Takahashi, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　38　(1)　n/a-n/a　2023年2月
出版者・発行元： Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.me22071 　

ISSN：1342-6311

eISSN：1347-4405
ダイズ圃場から放出されるN₂Oとその生成過程

豊田栄, Damak Fadwa, 武田真憲, 秋山博子, 佐々木勇麻, 南澤究

日本地球化学会年会要旨集　70　141　2023年
出版者・発行元：一般社団法人日本地球化学会
DOI： 10.14862/geochemproc.70.0_141 　

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ダイズ栽培土壌で秋の根粒崩壊期にN₂O放出が増加する機構の解明，およびN₂O還元能を強化した根粒菌によるN₂O削減技術の効果検証を目的として，圃場スケールのダイズ栽培で発生し大気へ放出されるN₂Oの生成・消滅過程を安定同位体比を用いて解析した。施肥直後は肥料(尿素)起源のアンモニアからNH₂OH酸化およびNO₂⁻還元(硝化菌脱窒)でN₂Oが生成したと考えられた。根粒崩壊期は，N2O放出量および同位体比が経日変化を示し，N₂O生成経路が，根粒起源の窒素を基質とした硝化菌または脱窒菌による脱窒から根粒菌による脱窒にシフトした可能性が示唆された。
Mitigation of greenhouse gas emission by nitrogen-fixing bacteria. 査読有り

Kiwamu Minamisawa

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry　87(1):　7-12　2022年12月

DOI： 10.1093/bbb/zbac177. 　
Strains of Bradyrhizobium barranii sp. nov associated with legumes native to Canada are symbionts of soybeans and belong to different subspecies (subsp. barranii subsp. nov. and subsp. apii subsp. nov) and symbiovars (sv. glycinearum and sv. septentrionale) 査読有り

Eden S, P. Bromfield, Cloutier S, Wasai-Hara S, Minamisawa K

Int J Syst Evol Microbiol　72(10)　2022年10月

DOI： 10.1099/ijsem.0.005549 　
In Vivo Evidence of Single ¹³ C and ¹⁵ N Isotope–Labeled Methanotrophic Nitrogen-Fixing Bacterial Cells in Rice Roots

Shintaro Hara, Naohisa Wada, Sliver Sung-Yun Hsiao, Meng Zhang, Zhihua Bao, Yoshiyuki Iizuka, Der-Chuen Lee, Shusei Sato, Sen-Lin Tang, Kiwamu Minamisawa

mBio　13　(3)　2022年6月28日
出版者・発行元： American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/mbio.01255-22 　

eISSN：2150-7511

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Atmospheric methane concentrations have been continually increasing, causing methane to become a considerable environmental concern. Methanotrophy may be the key to regulating methane fluxes.
Evolution of rhizobial symbiosis islands through insertion sequence-mediated deletion and duplication 査読有り

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Ryota Noda, Kaori Kakizaki, Satoshi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

The ISME Journal　16　(1)　112-121　2022年1月
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41396-021-01035-4 　

ISSN：1751-7362

eISSN：1751-7370

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<title>Abstract</title>Symbiosis between organisms influences their evolution via adaptive changes in genome architectures. Immunity of soybean carrying the <italic>Rj2</italic> allele is triggered by NopP (type III secretion system [T3SS]-dependent effector), encoded by symbiosis island A (SymA) in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA122. This immunity was overcome by many mutants with large SymA deletions that encompassed T3SS (<italic>rhc</italic>) and N₂ fixation (<italic>nif</italic>) genes and were bounded by insertion sequence (IS) copies in direct orientation, indicating homologous recombination between ISs. Similar deletion events were observed in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA110 and <italic>B. japonicum</italic> J5. When we cultured a USDA122 strain with a marker gene <italic>sacB</italic> inserted into the <italic>rhc</italic> gene cluster, most sucrose-resistant mutants had deletions in <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters, similar to the mutants above. Some deletion mutants were unique to the <italic>sacB</italic> system and showed lower competitive nodulation capability, indicating that IS-mediated deletions occurred during free-living growth and the host plants selected the mutants. Among 63 natural bradyrhizobial isolates, 2 possessed long duplications (261–357 kb) harboring <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters between IS copies in direct orientation via homologous recombination. Therefore, the structures of symbiosis islands are in a state of flux via IS-mediated duplications and deletions during rhizobial saprophytic growth, and host plants select mutualistic variants from the resultant pools of rhizobial populations. Our results demonstrate that homologous recombination between direct IS copies provides a natural mechanism generating deletions and duplications on symbiosis islands.
Community analysis-based screening of plant growth-promoting bacteria for sugar beet 査読有り

Kazuyuki Okazaki, Hirohito Tsurumaru, Megumi Hashimoto, Hiroyuki Takahashi, Takashi Okubo, Takuji Ohwada, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

Microbes and Environments　36　(2)　ME20137　2021年4月

DOI： 10.1264/jsme2.ME20137 　

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Clone libraries of bacterial 16S rRNA genes (a total of 1,980 clones) were constructed from the leaf blades, petioles, taproots, and lateral roots of sugar beet (Beta vulgaris L.) grown under different fertilization conditions. A principal coordinate analysis revealed that the structures of bacterial communities in above- and underground tissues were largely separated by PC1 (44.5%). The bacterial communities of above-ground tissues (leaf blades and petioles) were more tightly clustered regardless of differences in the tissue types and fertilization conditions than those of below-ground tissues (taproots and lateral roots). The bacterial communities of below-ground tissues were largely separated by PC2 (26.0%). To survey plant growth-promoting bacteria (PGPBs), isolate collections (a total of 665 isolates) were constructed from the lateral roots. As candidate PGPBs, 44 isolates were selected via clustering analyses with the combined 16S rRNA gene sequence data of clone libraries and isolate collections. The results of inoculation tests using sugar beet seedlings showed that eight isolates exhibited growth-promoting effects on the seedlings. Among them, seven isolates belonging to seven genera (Asticcacaulis, Mesorhizobium, Nocardioides, Sphingobium, Sphingomonas, Sphingopyxis, and Polaromonas) were newly identified as PGPBs for sugar beet at the genus level, and two isolates belonging to two genera (Asticcacaulis and Polaromonas) were revealed to exert growth-promoting effects on the plant at the genus level for the first time. These results suggest that a community analysis-based selection strategy will facilitate the isolation of novel PGPBs and extend the potential for the development of novel biofertilizers.
Strains of Bradyrhizobium cosmicum sp. nov., isolated from contrasting habitats in Japan and Canada possess photosynthesis gene clusters with the hallmark of genomic islands

Sawa Wasai-Hara, Kiwamu Minamisawa, Sylvie Cloutier, Eden S. P. Bromfield

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology　70　(9)　5063-5074　2020年9月1日
出版者・発行元： Microbiology Society
DOI： 10.1099/ijsem.0.004380 　

ISSN：1466-5026

eISSN：1466-5034

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The taxonomic status of two previously characterized <italic> <named-content content-type="genus"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.1459" xlink:type="simple">Bradyrhizobium</ext-link> </named-content> </italic> strains (58S1^T and S23321) isolated from contrasting habitats in Canada and Japan was verified by genomic and phenotypic analyses. Phylogenetic analyses of five and 27 concatenated protein-encoding core gene sequences placed both strains in a highly supported lineage distinct from named species in the genus <italic> <named-content content-type="genus"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.1459" xlink:type="simple">Bradyrhizobium</ext-link> </named-content> </italic> with <italic> <named-content content-type="species"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.8517" xlink:type="simple">Bradyrhizobium betae</ext-link> </named-content> </italic> as the closest relative. Average nucleotide identity values of genome sequences between the test and reference strains were between 84.5 and 94.2 %, which is below the threshold value for bacterial species circumscription. The complete genomes of strains 58S1^T and S23321 consist of single chromosomes of 7.30 and 7.23 Mbp, respectively, and do not have symbiosis islands. The genomes of both strains have a G+C content of 64.3 mol%. Present in the genome of these strains is a photosynthesis gene cluster (PGC) containing key photosynthesis genes. A tRNA gene and its partial tandem duplication were found at the boundaries of the PGC region in both strains, which is likely the hallmark of genomic island insertion. Key nitrogen-fixation genes were detected in the genomes of both strains, but nodulation and type III secretion system genes were not found. Sequence analysis of the nitrogen fixation gene, <italic>nifH</italic>, placed 58S1^T and S23321 in a novel lineage distinct from described <italic> <named-content content-type="genus"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.1459" xlink:type="simple">Bradyrhizobium</ext-link> </named-content> </italic> species. Data for phenotypic tests, including growth characteristics and carbon source utilization, supported the sequence-based analyses. Based on the data presented here, a novel species with the name <italic>Bradyrhizobium cosmicum</italic> sp. nov. is proposed with 58S1^T (=LMG 31545^T=HAMBI 3725^T) as the type strain.
Levels of Periplasmic Nitrate Reductase during Denitrification are Lower in Bradyrhizobium japonicum than in Bradyrhizobium diazoefficiens 査読有り

Arthur Fernandes Siqueira, Masayuki Sugawara, Haruka Arashida, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

Microbes and Environments　35　(3)　n/a-n/a　2020年6月
出版者・発行元： Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.me19129 　

ISSN：1342-6311

eISSN：1347-4405
Diversity of bradyrhizobium in non-leguminous sorghum plants: B. ottawaense isolates unique in genes for N2O reductase and lack of the type VI secretion system 査読有り

Sawa Wasai-Hara, Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Masayuki Sugawara, Hideto Takami, Junich Yoneda, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　35　(1)　2020年1月

DOI： 10.1264/jsme2.ME19102 　

ISSN：1342-6311
Growth Stage-dependent Bacterial Communities in Soybean Plant Tissues: Methylorubrum Transiently Dominated in the Flowering Stage of the Soybean Shoot.

Shintaro Hara, Masatoshi Matsuda, Kiwamu Minamisawa

Microbes and environments　34　(4)　446-450　2019年12月27日

DOI： 10.1264/jsme2.ME19067 　

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Plant-associated bacteria are critical for plant growth and health. However, the effects of plant growth stages on the bacterial community remain unclear. Analyses of the microbiome associated with field-grown soybean revealed a marked shift in the bacterial community during the growth stages. The relative abundance of Methylorubrum in the leaf and stem increased from 0.2% to more than 45%, but decreased to approximately 15%, with a peak at the flowering stage at which nitrogen metabolism changed in the soybean plant. These results suggest the significance of a time-series analysis for understanding the relationship between the microbial community and host plant physiology.
Molecular analyses of the distribution and function of diazotrophic rhizobia and methanotrophs in the tissues and rhizosphere of non-Leguminous plants. 査読有り

Yoneyama T, Terakado-Tonooka J, Bao Z, and Minamisawa K.

Plants (Basel)　8　(10)　408　2019年10月
Nitrogen cycling in soybean rhizosphere: Sources and sinks of nitrous oxide (N2O). 査読有り

Cristina Sánchez, and Kiwamu Minamisawa.

Frontiers in Microbiology　10　1943　2019年8月
Growth stage-dependent bacterial communities in soybean plant tissues: Methylorubrum transiently dominated in the flowering stage of soybean shoot. 査読有り

Shintaro Hara, Masatoshi Matsuda, and Kiwamu Minamisawa.

Microbes and Environments　34　(4)　446-450　2019年8月
Identification of genes regulated by the antitermination factor NasT during denitrification in Bradyrhizobium diazoefficiens. 査読有り

Cristina Sánchez, Arthur Fernandes Siqueira, Hisayuki Mitsui, and Kiwamu Minamisawa.

Microbes Environ.　34　(3)　260-267　2019年6月
Identification of nitrogen-fixing Bradyrhizobium associated with roots of field-grown sorghum by metagenome and proteome analyses 査読有り

Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Sawa Wasai, Yasuhiro Kasahara, Taichi Koshiba, Kiyoshi Yamazaki, Toru Fujiwara, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

Frontiers in Microbiology　10　(407)　2019年3月

DOI： 10.3389/fmicb.2019.00407 　
Symbiotic incompatibility between soybean and Bradyrhizobium arises from one amino acid determinant in soybean Rj2 protein. 国際誌査読有り

Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

PloS one　14　(9)　e0222469　2019年

DOI： 10.1371/journal.pone.0222469 　

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Cultivated soybean (Glycine max) carrying the Rj2 allele restricts nodulation with specific Bradyrhizobium strains via host immunity, mediated by rhizobial type III secretory protein NopP and the host resistance protein Rj2. Here we found that the single isoleucine residue I490 in Rj2 is required for induction of symbiotic incompatibility. Furthermore, we investigated the geographical distribution of the Rj2-genotype soybean in a large set of germplasm by single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping using a SNP marker for I490. By allelic comparison of 79 accessions in the Japanese soybean mini-core collection, we suggest substitution of a single amino acid residue (R490 to I490) in Rj2 induces symbiotic incompatibility with Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122. The importance of I490 was verified by complementation of rj2-soybean by the dominant allele encoding the Rj2 protein containing I490 residue. The Rj2 allele was also found in Glycine soja, the wild progenitor of G. max, and their single amino acid polymorphisms were associated with the Rj2-nodulation phenotype. By SNP genotyping against 1583 soybean accessions, we detected the Rj2-genotype in 5.4% of G. max and 7.7% of G. soja accessions. Distribution of the Rj2-genotype soybean plants was relatively concentrated in the temperate Asian region. These results provide important information about the mechanism of host genotype-specific symbiotic incompatibility mediated by host immunity and suggest that the Rj2 gene has been maintained by environmental conditions during the process of soybean domestication.
CH4 oxidation-dependent 15N2 fixation in rice roots in a low-nitrogen paddy field and in Methylosinus sp. strain 3S-1 isolated from the roots 査読有り

Ryo Shinoda, Zhihua Bao, Kiwamu Minamisawa

Soil Biology and Biochemistry　132　40-46　2019年1月

DOI： 10.1016/j.soilbio.2019.01.021 　
Publisher Correction: Core microbiomes for sustainable agroecosystems. 国際誌

Hirokazu Toju, Kabir G Peay, Masato Yamamichi, Kazuhiko Narisawa, Kei Hiruma, Ken Naito, Shinji Fukuda, Masayuki Ushio, Shinji Nakaoka, Yusuke Onoda, Kentaro Yoshida, Klaus Schlaeppi, Yang Bai, Ryo Sugiura, Yasunori Ichihashi, Kiwamu Minamisawa, E Toby Kiers

Nature plants　4　(9)　733-733　2018年9月

DOI： 10.1038/s41477-018-0245-3 　

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Owing to a technical error, this Perspective was originally published without its received and accepted dates; the dates "Received: 31 December 2017; Accepted: 23 March 2018" have now been included in all versions.
Variation in bradyrhizobial NopP effector determines symbiotic incompatibility with Rj2-soybeans via effector-triggered immunity 国際誌査読有り

Masayuki Sugawara, Satoko Takahashi, Yosuke Umehara, Hiroya Iwano, Hirohito Tsurumaru, Haruka Odake, Yuta Suzuki, Hitoshi Kondo, Yuki Konno, Takeo Yamakawa, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Nature Communications　9　(1)　3139-3139　2018年8月

DOI： 10.1038/s41467-018-05663-x 　
Mapping of quantitative trait loci related to primary rice root growth as a response to inoculation with Azospirillum sp. strain B510 国際誌査読有り

Sachiko Masuda, Kazuhiro Sasaki, Yuri Kazama, Chiharu Kisara, Shoko Takeda, Eiko Hanzawa, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Sato

Commun Integr Biol.　11　(3)　1-6　2018年7月

DOI： 10.1080/19420889.2018.1502586. 　
Core microbiomes for sustainable agroecosystems 査読有り

Hirokazu Toju, Kabir G. Peay, Masato Yamamichi, Kazuhiko Narisawa, Kei Hiruma, Ken Naito, Shinji Fukuda, Masayuki Ushio, Shinji Nakaoka, Yusuke Onoda, Kentaro Yoshida, Klaus Schlaeppi, Yang Bai, Ryo Sugiura, Yasunori Ichihashi, Kiwamu Minamisawa, E. Toby Kiers

Nat Plants.　4　(5)　247-257　2018年4月

DOI： 10.1038/s41477-018-0139-4. 　
Plant-associated microbes: From rhizobia to plant microbiomes 査読有り

Sawa Wasai, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　33　(1)　1-3　2018年
出版者・発行元： Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.ME3301rh 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Involvement of ethylene signaling in Azospirillum sp B510-induced disease resistance in rice 査読有り

Miyuki Kusajima, Shuhei Shima, Moeka Fujita, Kiwamu Minamisawa, Fang-Sik Che, Hiromoto Yamakawa, Hideo Nakashita

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　82　(9)　1522-1526　2018年

DOI： 10.1080/09168451.2018.1480350 　

ISSN：0916-8451

eISSN：1347-6947
Redundant roles of Bradyrhizobium oligotrophicum Cu-type (NirK) and cd1-type (NirS) nitrite reductase genes under denitrifying conditions 査読有り

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

FEMS Microbiol Lett.　365　(5)　2018年1月

DOI： 10.1093/femsle/fny015. 　
Anaerobic Reduction of Nitrate to Nitrous Oxide Is Lower in Bradyrhizobium japonicum than in Bradyrhizobium diazoefficiens 査読有り

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sanchez

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　398-401　2017年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME17081 　

ISSN：1342-6311
Nitrate Supply-Dependent Shifts in Communities of Root-Associated Bacteria in Arabidopsis 査読有り

Noriyuki Konishi, Takashi Okubo, Tomoyuki Yamaya, Toshihiko Hayakawa, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　314-323　2017年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME17031 　

ISSN：1342-6311
Expression of Two RpoH Sigma Factors in Sinorhizobium meliloti upon Heat Shock 査読有り

Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　394-397　2017年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME17087 　

ISSN：1342-6311
Assessment of bacterial communities of black soybean grown in fields 査読有り

Akifumi Sugiyama, Yusuke Unno, Ui Ono, Emon Yoshikawa, Hideyuki Suzuki, Kiwamu Minamisawa, Kazufumi Yazaki

Communicative and Integrative Biology　10　(5-6)　e1378290　2017年11月2日
出版者・発行元： Taylor and Francis Inc.
DOI： 10.1080/19420889.2017.1378290 　

ISSN：1942-0889

eISSN：1942-0889
Exploration of bacterial N2-fixation systems in association with soil-grown sugarcane, sweet potato, and paddy rice: a review and synthesis 査読有り

Tadakatsu Yoneyama, Junko Terakado-Tonooka, Kiwamu Minamisawa

Soil Science and Plant Nutrition　63　(6)　578-590　2017年11月2日
出版者・発行元： Taylor and Francis Ltd.
DOI： 10.1080/00380768.2017.1407625 　

ISSN：1747-0765 0038-0768
Regulation of nitrous oxide reductase genes by NasT-mediated transcription antitermination in Bradyrhizobium diazoefficiens 査読有り

Cristina Sanchez, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS　9　(4)　389-396　2017年8月

DOI： 10.1111/1758-2229.12543 　

ISSN：1758-2229
Effect of Flooding and the nosZ Gene in Bradyrhizobia on Bradyrhizobial Community Structure in the Soil 査読有り

Yuichi Saeki, Misato Nakamura, Maria Luisa T. Mason, Tsubasa Yano, Sokichi Shiro, Reiko Sameshima-Saito, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Akihiro Yamamoto

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(2)　154-163　2017年6月

DOI： 10.1264/jsme2.ME16132 　

ISSN：1342-6311
Complete genome sequence of Bradyrhizobium japonicum J5, isolated from a soybean nodule in Hokkaido, Japan 査読有り

Kazuma Kanehara, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　5　(6)　e01619-16　2017年
出版者・発行元： American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.01619-16 　

ISSN：2169-8287
Complete genome sequence of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, a nitrogen-fixing soybean symbiont 査読有り

Masayuki Sugawara, Takahiro Tsukui, Takakazu Kaneko, Yoshiyuki Ohtsubo, Shusei Sato, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　5　(9)　e01743-16　2017年
出版者・発行元： American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.01743-16 　

ISSN：2169-8287
Effects of colonization of a bacterial endophyte, Azospirillum sp B510, on disease resistance in tomato 査読有り

Moeka Fujita, Miyuki Kusajima, Yasuko Okumura, Masami Nakajima, Kiwamu Minamisawa, Hideo Nakashita

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　81　(8)　1657-1662　2017年

DOI： 10.1080/09168451.2017.1329621 　

ISSN：0916-8451

eISSN：1347-6947
Mitigation of soil N2O emission by inoculation with a mixed culture of indigenous Bradyrhizobium diazoefficiens 査読有り

Hiroko Akiyama, Yuko Takada Hoshino, Manabu Itakura, Yumi Shimomura, Yong Wang, Akinori Yamamoto, Kanako Tago, Yasuhiro Nakajima, Kiwamu Minamisawa, Masahito Hayatsu

SCIENTIFIC REPORTS　6　32869　2016年9月

DOI： 10.1038/srep32869 　

ISSN：2045-2322
A Sinorhizobium meliloti RpoH-Regulated Gene Is Involved in Iron-Sulfur Protein Metabolism and Effective Plant Symbiosis under Intrinsic Iron Limitation 査読有り

Shohei Sasaki, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

JOURNAL OF BACTERIOLOGY　198　(17)　2297-2306　2016年9月

DOI： 10.1128/JB.00287-16 　

ISSN：0021-9193

eISSN：1098-5530
Origin and Evolution of Nitrogen Fixation Genes on Symbiosis Islands and Plasmid in Bradyrhizobium 査読有り

Takashi Okubo, Pongdet Piromyou, Panlada Tittabutr, Neung Teaumroong, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　260-267　2016年9月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15159 　

ISSN：1342-6311
Metagenomic Analysis Revealed Methylamine and Ureide Utilization of Soybean-Associated Methylobacterium 査読有り

Tomoyuki Minami, Misue Anda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　268-278　2016年9月

DOI： 10.1264/jsme2.ME16035 　

ISSN：1342-6311
Growth Rate of and Gene Expression in Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110 due to a Mutation in blr7984, a TetR Family Transcriptional Regulator Gene 査読有り

Naoko Ohkama-Ohtsu, Haruna Honma, Mariko Nakagome, Maki Nagata, Hiroko Yamaya-Ito, Yoshiaki Sano, Norina Hiraoka, Takaaki Ikemi, Akihiro Suzuki, Shin Okazaki, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Yokoyama

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　249-259　2016年9月

DOI： 10.1264/jsme2.ME16056 　

ISSN：1342-6311
Nitrogen fixation and nifH diversity in human gut microbiota 査読有り

Katsura Igai, Manabu Itakura, Suguru Nishijima, Hirohito Tsurumaru, Wataru Suda, Takumi Tsutaya, Eriko Tomitsuka, Kiyoshi Tadokoro, Jun Baba, Shingo Odani, Kazumi Natsuhara, Ayako Morita, Minoru Yoneda, Andrew R. Greenhill, Paul F. Horwood, Jun-ichi Inoue, Moriya Ohkuma, Yuichi Hongoh, Taro Yamamoto, Peter M. Siba, Masahira Hattori, Kiwamu Minamisawa, Masahiro Umezaki

SCIENTIFIC REPORTS　6　31942　2016年8月

DOI： 10.1038/srep31942 　

ISSN：2045-2322
Identification of the Hydrogen Uptake Gene Cluster for Chemolithoautotrophic Growth and Symbiosis Hydrogen Uptake in Bradyrhizobium Diazoefficiens 査読有り

Sachiko Masuda, Masaki Saito, Chiaki Sugawara, Manabu Itakura, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　76-78　2016年3月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15182 　

ISSN：1342-6311
Sulfur Fertilization Changes the Community Structure of Rice Root-, and Soil-Associated Bacteria 査読有り

Sachiko Masuda, Zhihua Bao, Takashi Okubo, Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Ryo Shinoda, Mizue Anda, Ryuji Kondo, Yumi Mori, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　70-75　2016年3月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15170 　

ISSN：1342-6311
Are Symbiotic Methanotrophs Key Microbes for N Acquisition in Paddy Rice Root? 査読有り

Kiwamu Minamisawa, Haruko Imaizumi-Anraku, Zhihua Bao, Ryo Shinoda, Takashi Okubo, Seishi Ikeda

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　4-10　2016年3月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15180 　

ISSN：1342-6311
Visualization of NO3−/NO2− dynamics in living cells by fluorescence resonance energy transfer (FRET) imaging employing a rhizobial two-component regulatory system 査読有り

Masafumi Hidaka, Aina Gotoh, Taiki Shimizu, Kiwamu Minamisawa, Hiromi Imamura, Takafumi Uchida

J. Biol. Chem.　291　(5)　2260-2269　2016年1月

DOI： 10.1074/jbc.M115.687632 　

ISSN：0021-9258

eISSN：1083-351X
Complete genome sequence of Methylobacterium sp. strain AMS5, an isolate from a soybean stem 査読有り

Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　4　(2)　e00144-16　2016年
出版者・発行元： American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.00144-16 　

ISSN：2169-8287
Draft genome sequence of Methylosinus sp. strain 3S-1, an isolate from rice root in a low-nitrogen paddy field 査読有り

Zhihua Bao, Ryo Shinoda, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　4　(5)　e00932-16　2016年
出版者・発行元： American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.00932-16 　

ISSN：2169-8287
The Type III Secretion System (T3SS) is a Determinant for Rice-Endophyte Colonization by Non-Photosynthetic Bradyrhizobium 査読有り

Pongdet Piromyou, Pongpan Songwattana, Teerana Greetatorn, Takashi Okubo, Kaori Chiba Kakizaki, Janpen Prakamhang, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Neung Teaumroong, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　30　(4)　291-300　2015年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15080 　

ISSN：1342-6311
Possible Role of 1-Aminocyclopropane-1-Carboxylate (ACC) Deaminase Activity of Sinorhizobium sp BL3 on Symbiosis with Mung Bean and Determinate Nodule Senescence 査読有り

Panlada Tittabutr, Sudarat Sripakdi, Nantakorn Boonkerd, Waraporn Tanthanuch, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

MICROBES AND ENVIRONMENTS　30　(4)　310-320　2015年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15120 　

ISSN：1342-6311
Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome 査読有り

Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA　112　(46)　14343-14347　2015年11月

DOI： 10.1073/pnas.1514326112 　

ISSN：0027-8424
Symbiosis Island Shuffling with Abundant Insertion Sequences in the Genomes of Extra-Slow-Growing Strains of Soybean Bradyrhizobia 査読有り

Takayuki Iida, Manabu Itakura, Mizue Anda, Masayuki Sugawara, Tsuyoshi Isawa, Takashi Okubo, Shusei Sato, Kaori Chiba-Kakizaki, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　81　(12)　4143-4154　2015年6月

DOI： 10.1128/AEM.00741-15 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Peribacteroid solution of soybean root nodules partly induces genomic loci for differentiation into bacteroids of free-living Bradyrhizobium japonicum cells 査読有り

Naoko Ohkama-Ohtsu, Sachiko Ichida, Hiroko Yamaya, Takuji Ohwada, Manabu Itakura, Yoshino Hara, Hisayuki Mitsui, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kouhei Tejima, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Makoto Hayashi, Takaki Maekawa, Yoshikatsu Murooka, Shigeyuki Tajima, Kenshiro Simomura, Mika Nomura, Toshiki Uchiumi, Akihiro Suzuki, Yoshikazu Shimoda, Mikiko Abe, Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima, Tadashi Yokoyama

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　61　(3)　461-470　2015年5月

DOI： 10.1080/00380768.2014.994470 　

ISSN：0038-0768

eISSN：1747-0765
Preferential Association of Endophytic Bradyrhizobia with Different Rice Cultivars and Its Implications for Rice Endophyte Evolution 査読有り

Pongdet Piromyou, Teerana Greetatorn, Kamonluck Teamtisong, Takashi Okubo, Ryo Shinoda, Achara Nuntakij, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　81　(9)　3049-3061　2015年5月

DOI： 10.1128/AEM.04253-14 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Genome Analysis of a Novel Bradyrhizobium sp DOA9 Carrying a Symbiotic Plasmid 査読有り

Shin Okazaki, Rujirek Noisangiam, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Kamonluck Teamtisong, Pongpan Songwattana, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Kazuhiko Saeki, Shusei Sato, Toshiki Uchiumi, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

PLOS ONE　10　(2)　e0117392　2015年2月

DOI： 10.1371/journal.pone.0117392 　

ISSN：1932-6203
Bacterial community shifts associated with high abundance of Rhizobium spp. in potato roots under macronutrient-deficient conditions 査読有り

Yusuke Unno, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY　80　232-236　2015年1月

DOI： 10.1016/j.soilbio.2014.10.002 　

ISSN：0038-0717
Elevated atmospheric CO2 levels affect community structure of rice root-associated bacteria 査読有り

Okubo, Takashi, Liu, Dongyan, Tsurumaru, Hirohito, Ikeda, Seishi, Asakawa, Susumu, Tokida, Takeshi, Tago, Kanako, Hayatsu, Masahito, Aoki, Naohiro, Ishimaru, Ken, Ujiie, Kazuhiro, Usui, Yasuhiro, Nakamura, Hirofumi, Sakai, Hidemitsu, Hayashi, Kentaro, Hasegawa, Toshihiro, Minamisawa, Kiwamu

Frontiers in Microbiology　6　(136)　2015年

DOI： 10.3389/fmicb.2015.00136 　
Characterization of Leaf Blade- and Leaf Sheath-Associated Bacterial Communities and Assessment of Their Responses to Environmental Changes in CO2, Temperature, and Nitrogen Levels under Field Conditions 査読有り

Ikeda, Seishi, Tokida, Takeshi, Nakamura, Hirofumi, Sakai, Hidemitsu, Usui, Yasuhiro, Okubo, Takashi, Tago, Kanako, Hayashi, Kentaro, Sekiyama, Yasuyo, Ono, Hiroshi, Tomita, Satoru, Hayatsu, Masahito, Hasegawa, Toshihiro, Minamisawa, Kiwamu

Microbes and Environments　30　(1)　51-62　2015年

DOI： 10.1264/jsme2.ME14117 　
Metagenomic Analysis of the Bacterial Community Associated with the Taproot of Sugar Beet 査読有り

Hirohito Tsurumaru, Takashi Okubo, Kazuyuki Okazaki, Megumi Hashimoto, Kaori Kakizaki, Eiko Hanzawa, Hiroyuki Takahashi, Noriyuki Asanome, Fukuyo Tanaka, Yasuyo Sekiyama, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　30　(1)　63-69　2015年

DOI： 10.1264/jsme2.ME14109 　

ISSN：1342-6311
Divergent Nod-Containing Bradyrhizobium sp DOA9 with a Megaplasmid and its Host Range 査読有り

Kamonluck Teamtisong, Pongpan Songwattana, Rujirek Noisangiam, Pongdet Piromyou, Nantakorn Boonkerd, Panlada Tittabutr, Kiwamu Minamisawa, Achara Nantagij, Shin Okazaki, Mikiko Abe, Toshiki Uchiumi, Neung Teaumroong

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(4)　370-376　2014年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME14065 　

ISSN：1342-6311
Relationship between soil type and N₂O reductase genotype (nosZ) of indigenous soybean bradyrhizobia: nosZ-minus populations are dominant in Andosols. 査読有り

Shiina Y, Itakura M, Choi H, Saeki Y, Hayatsu M, Minamisawa K

Microbes Environ.　29　(4)　420-426　2014年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME14130 　

ISSN：1342-6311
根粒菌の二成分制御システムを利用したNO3-/NO2-バイオセンサーの開発

後藤愛那, 日高將文, 清水泰希, 板倉学, クリスチーナ・サンチェス, 南澤究, 今村博臣, 内田隆史

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集　87回　[3T16p-09]　2014年10月
出版者・発行元： (公社)日本生化学会
The nitrate-sensing NasST system regulates nitrous oxide reductase and periplasmic nitrate reductase in Bradyrhizobium japonicum 査読有り

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Takashi Okubo, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Aina Gotoh, Masafumi Hidaka, Takafumi Uchida, Kiwamu Minamisawa

ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　16　(10)　3263-3274　2014年10月

DOI： 10.1111/1462-2920.12546 　

ISSN：1462-2912

eISSN：1462-2920
Phylogeny and Functions of Bacterial Communities Associated with Field-Grown Rice Shoots 査読有り

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Kenshiro Ohshima, Masahira Hattori, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(3)　329-332　2014年9月

DOI： 10.1264/jsme2.ME14077 　

ISSN：1342-6311
Metaproteomic Identification of Diazotrophic Methanotrophs and Their Localization in Root Tissues of Field-Grown Rice Plants 査読有り

Zhihua Bao, Takashi Okubo, Kengo Kubota, Yasuhiro Kasahara, Hirohito Tsurumaru, Mizue Anda, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　80　(16)　5043-5052　2014年8月

DOI： 10.1128/AEM.00969-14 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Low Nitrogen Fertilization Adapts Rice Root Microbiome to Low Nutrient Environment by Changing Biogeochemical Functions 査読有り

Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Takashi Okubo, Akifumu Yamashita, Kimihiro Terasawa, Zhihua Bao, Dongyan Liu, Takeshi Watanabe, Jun Murase, Susumu Asakawa, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(1)　50-59　2014年4月

DOI： 10.1264/jsme2.ME13110 　

ISSN：1342-6311
Effects of elevated carbon dioxide, elevated temperature, and rice growth stage on the community structure of rice root–associated bacteria. 査読有り

Okubo T, Tokida T, Ikeda S, Bao Z, Tago K, Hayatsu M, Nakamura H, Sakai H, Usui Y, Hayashi K, Hasegawa T, Minamisawa K

Microbes Environ.　29　(2)　2014年

DOI： 10.1264/jsme2.ME14011 　
An assessment of the diversity of culturable bacteria from main root of sugar beet. 査読有り

Kazuyuki Okazaki, Takao Iino, Yosuke Kuroda, Kazunori Taguchi, Hiroyuki Takahashi, Takuji Ohwada, Hiroto Tsurumaru, Takashi Okubo, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

Microbes and environments　29　(2)　220-3　2014年

DOI： 10.1264/jsme2.ME13182 　

eISSN：1347-4405

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The partial sequences of the 16S rRNA genes of 531 bacteria isolated from the main root of the sugar beet (Beta vulgaris L.) were determined and subsequently grouped into 155 operational taxonomic units by clustering analysis (≥99% identity). The most abundant phylum was Proteobacteria (72.5-77.2%), followed by Actinobacteria (9.8-16.6%) and Bacteroidetes (4.3-15.4%). Alphaproteobacteria (46.7-64.8%) was the most dominant class within Proteobacteria. Four strains belonging to Verrucomicrobia were also isolated. Phylogenetic analysis revealed that the Verrucomicrobia bacterial strains were closely related to Haloferula or Verrucomicrobium.
A Rice Gene for Microbial Symbiosis, Oryza sativa CCaMK, Reduces CH4 Flux in a Paddy Field with Low Nitrogen Input 査読有り

Bao, Zhihua, Watanabe, Aya, Sasaki, Kazuhiro, Okubo, Takashi, Tokida, Takeshi, Liu, Dongyan, Ikeda, Seishi, Imaizumi-Anraku, Haruko, Asakawa, Susumu, Sato, Tadashi, Mitsui, Hisayuki, Minamisawa, Kiwamu

Applied and Environmental Microbiology　80　(6)　1995-2003　2014年

DOI： 10.1128/AEM.03646-13 　
Impact of Azospirillum sp B510 Inoculation on Rice-Associated Bacterial Communities in a Paddy Field 査読有り

Zhihua Bao, Kazuhiro Sasaki, Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Mizue Anda, Eiko Hanzawa, Kaori Kakizaki, Tadashi Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　28　(4)　487-490　2013年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME13049 　

ISSN：1342-6311
Involvement of a Novel Genistein-Inducible Multidrug Efflux Pump of Bradyrhizobium japonicum Early in the Interaction with Glycine max (L.) Merr 査読有り

Keisuke Takeshima, Tatsuo Hidaka, Min Wei, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Mikiko Abe, Yoshihiko Tokuji, Takuji Ohwada

MICROBES AND ENVIRONMENTS　28　(4)　414-421　2013年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME13057 　

ISSN：1342-6311
Linked Expressions of nap and nos Genes in a Bradyrhizobium japonicum Mutant with Increased N2O Reductase Activity 査読有り

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　79　(13)　4178-4180　2013年7月

DOI： 10.1128/AEM.00703-13 　

ISSN：0099-2240
Genome analysis suggests that the soil oligotrophic bacterium agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of aeschynomene indica 査読有り

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Manabu Itakura, Kenshiro Oshima, Aphakorn Longtonglang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

Applied and Environmental Microbiology　79　(8)　2542-2551　2013年4月

DOI： 10.1128/AEM.00009-13 　

ISSN：0099-2240 1098-5336
Mitigation of nitrous oxide emissions from soils by Bradyrhizobium japonicum inoculation 査読有り

Manabu Itakura, Yoshitaka Uchida, Hiroko Akiyama, Yuko Takada Hoshino, Yumi Shimomura, Sho Morimoto, Kanako Tago, Yong Wang, Chihiro Hayakawa, Yusuke Uetake, Cristina Sánchez, Shima Eda, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

Nature Climate Change　3　(3)　208-212　2013年3月

DOI： 10.1038/nclimate1734 　

ISSN：1758-678X 1758-6798
The type III secretion system of Bradyrhizobium japonicum USDA122 mediates symbiotic incompatibility with Rj2 soybean plants 査読有り

Takahiro Tsukui, Shima Eda, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Shin Okazaki, Kaori Kakizaki-Chiba, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Akifumi Yamashita, Kimihiro Terasawa, Kiwamu Minamisawa

Applied and Environmental Microbiology　79　(3)　1048-1051　2013年2月

DOI： 10.1128/AEM.03297-12 　

ISSN：0099-2240 1098-5336
Effects of plant genotype and nitrogen level on bacterial communities in rice shoots and roots 査読有り

Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Takashi Ohkubo, Chiharu Kisara, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　28　(3)　391-395　2013年

DOI： 10.1264/jsme2.ME12212 　

ISSN：1342-6311

eISSN：1347-4405
N2O Emission from Degraded Soybean Nodules Depends on Denitrification by Bradyrhizobium japonicum and Other Microbes in the Rhizosphere 査読有り

Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(4)　470-476　2012年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME12100 　

ISSN：1342-6311
Evolution of Bradyrhizobium-Aeschynomene Mutualism: Living Testimony of the Ancient World or Highly Evolved State? 査読有り

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Kiwamu Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　53　(12)　2000-2007　2012年12月

DOI： 10.1093/pcp/pcs150 　

ISSN：0032-0781
Genetic diversity, symbiotic evolution, and proposed infection process of Bradyrhizobium strains isolated from root nodules of Aeschynomene americana L. in Thailand. 査読有り

Noisangiam R, Teamtisong K, Tittabutr P, Boonkerd N, Toshiki U, Minamisawa K, Teaumroong N

Appl. Environ. Microbiol.　78　(17)　6236-6250　2012年6月29日

DOI： 10.1128/AEM.00897-12. 　
Pyrosequence Read Length of 16S rRNA Gene Affects Phylogenetic Assignment of Plant-associated Bacteria 査読有り

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Akifumi Yamashita, Kimihiro Terasawa, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(2)　204-208　2012年6月

DOI： 10.1264/jsme2.ME11258 　

ISSN：1342-6311
N_2O発生ダイズ根粒根圏から分離したFusariumの脱窒能(2012年度土壌微生物学会講演要旨)

南澤究, 池西史生, 板倉学

土と微生物　66　(2)　79-79　2012年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.2_79_2 　
イネエンドファイトAzospirillum sp. B510のインドール酢酸生合成に関する研究(2012年度土壌微生物学会講演要旨)

南智之, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　66　(2)　88-88　2012年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.2_88_1 　
Exploration of natural nod gene inducers for Mesorhizobium loti in seed and root exudates of Lotus corniculatus. 査読有り

Katsuhiro Kojima, Tadashi Yokoyama(corresponding Author, Naoko Ohkama-Ohtsu, Suwat Saengkerdsub, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima

Soil Microorganisms　66　(1)　12-21　2012年1月
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.1_12 　

ISSN：0912-2184

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Tetronic acid is a candidate for an inducer of nodulation (nod) gene expression in Mesorhizobium loti. However, there is no evidence that tetronic acid is secreted from Lotus species, the host plants of M. loti. This suggests that Lotus plants may produce other genuine nod gene inducers that differ from tetronic acid. In this study, M. loti cells harboring a nodA-lacZ fusion were enclosed in dialysis tubing and immersed in L. corniculatus culture solution. Significant β-galactosidase activities were detected in the M. loti cells, indicating that nod gene inducers were present in the seed and root exudates. β-galactosidase activities in M. loti cells were also determined after cells were exposed to seed and root exudates or tetronic acid in vitro. Seed and root exudates induced greater β-galactosidase activity in M. loti cells in 1 mM CaSO_4 solution than in YEM medium. In contrast, tetronic acid induced greater β-galactosidase activity in M. loti cells in YEM medium than in 1 mM CaSO_4 solution. Further, β-galactosidase activities induced by seed and root exudates and tetronic acid tended to decrease as the pH of the medium became neutral. In an LC-MS analysis, we could not detect tetronic acid in the concentrated seed and root exudates. These findings indicate that Lotus plants release genuine nod gene inducers for M. loti that differ from tetronic acid. Finally, seed exudates of L. corniculatus were fractionated according to molecular size and polarity, and it was clarified that a putative nod gene inducer in the seed exudates was a low molecular weight and high polarity substance.
Complete genome sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: insights into symbiosis evolution in soil oligotrophs. 査読有り

Takashi Okubo, Takahiro Tsukui, Hiroko Maita, Shinobu Okamoto, Kenshiro Oshima, Takatomo Fujisawa, Akihiro Saito, Hiroyuki Futamata, Reiko Hattori, Yumi Shimomura, Shin Haruta, Sho Morimoto, Yong Wang, Yoriko Sakai, Masahira Hattori, Shin-Ichi Aizawa, Kenji V P Nagashima, Sachiko Masuda, Tsutomu Hattori, Akifumi Yamashita, Zhihua Bao, Masahito Hayatsu, Hiromi Kajiya-Kanegae, Ikuo Yoshinaga, Kazunori Sakamoto, Koki Toyota, Mitsuteru Nakao, Mitsuyo Kohara, Mizue Anda, Rieko Niwa, Park Jung-Hwan, Reiko Sameshima-Saito, Shin-Ichi Tokuda, Sumiko Yamamoto, Syuji Yamamoto, Tadashi Yokoyama, Tomoko Akutsu, Yasukazu Nakamura, Yuka Nakahira-Yanaka, Yuko Takada Hoshino, Hideki Hirakawa, Hisayuki Mitsui, Kimihiro Terasawa, Manabu Itakura, Shusei Sato, Wakako Ikeda-Ohtsubo, Natsuko Sakakura, Eli Kaminuma, Kiwamu Minamisawa

Microbes and environments　27　(3)　306-15　2012年

DOI： 10.1264/jsme2.ME11321 　

eISSN：1347-4405

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Bradyrhizobium sp. S23321 is an oligotrophic bacterium isolated from paddy field soil. Although S23321 is phylogenetically close to Bradyrhizobium japonicum USDA110, a legume symbiont, it is unable to induce root nodules in siratro, a legume often used for testing Nod factor-dependent nodulation. The genome of S23321 is a single circular chromosome, 7,231,841 bp in length, with an average GC content of 64.3%. The genome contains 6,898 potential protein-encoding genes, one set of rRNA genes, and 45 tRNA genes. Comparison of the genome structure between S23321 and USDA110 showed strong colinearity; however, the symbiosis islands present in USDA110 were absent in S23321, whose genome lacked a chaperonin gene cluster (groELS3) for symbiosis regulation found in USDA110. A comparison of sequences around the tRNA-Val gene strongly suggested that S23321 contains an ancestral-type genome that precedes the acquisition of a symbiosis island by horizontal gene transfer. Although S23321 contains a nif (nitrogen fixation) gene cluster, the organization, homology, and phylogeny of the genes in this cluster were more similar to those of photosynthetic bradyrhizobia ORS278 and BTAi1 than to those on the symbiosis island of USDA110. In addition, we found genes encoding a complete photosynthetic system, many ABC transporters for amino acids and oligopeptides, two types (polar and lateral) of flagella, multiple respiratory chains, and a system for lignin monomer catabolism in the S23321 genome. These features suggest that S23321 is able to adapt to a wide range of environments, probably including low-nutrient conditions, with multiple survival strategies in soil and rhizosphere.
Complete Genome Sequence of the Soybean Symbiont Bradyrhizobium japonicum Strain USDA6(T)

Takakazu Kaneko, Hiroko Maita, Hideki Hirakawa, Nobukazu Uchiike, Kiwamu Minamisawa, Akiko Watanabe, Shusei Sato

GENES　2　(4)　763-787　2011年12月

DOI： 10.3390/genes2040763 　

ISSN：2073-4425
Nitrogen Cycling in Rice Paddy Environments: Past Achievements and Future Challenges 査読有り

Satoshi Ishii, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa, Keishi Senoo

MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(4)　282-292　2011年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME11293 　

ISSN：1342-6311
Nitrate-Dependent N2O Emission from Intact Soybean Nodules via Denitrification by Bradyrhizobium japonicum Bacteroids 査読有り

Junta Hirayama, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(24)　8787-8790　2011年12月

DOI： 10.1128/AEM.06262-11 　

ISSN：0099-2240
The Genotype of the Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Gene (CCaMK) Determines Bacterial Community Diversity in Rice Roots under Paddy and Upland Field Conditions 査読有り

Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Naoya Takeda, Mari Banba, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Shinsuke Fujihara, Yoshinari Ohwaki, Kenshiro Ohshima, Yoshimichi Fukuta, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Tadashi Sato, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(13)　4399-4405　2011年7月

DOI： 10.1128/AEM.00315-11 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Programmed induction of endoreduplication by DNA double-strand breaks in Arabidopsis 査読有り

Sumiko Adachi, Kazunori Minamisawa, Yoko Okushima, Soichi Inagaki, Kaoru Yoshiyama, Youichi Kondou, Eli Kaminuma, Mika Kawashima, Tetsuro Toyoda, Minami Matsui, Daisuke Kurihara, Sachihiro Matsunaga, Masaaki Umeda

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America　108　(24)　10004-10009　2011年6月14日

DOI： 10.1073/pnas.1103584108 　

ISSN：0027-8424 1091-6490

eISSN：1091-6490
Identification of Mesorhizobium loti Genes Relevant to Symbiosis by Using Signature-Tagged Mutants 査読有り

Naoganchaolu Borjigin, Keisuke Furukawa, Yoshikazu Shimoda, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(2)　165-171　2011年6月

DOI： 10.1264/jsme2.ME10213 　

ISSN：1342-6311
Isolation and Genetic Characterization of Aurantimonas and Methylobacterium Strains from Stems of Hypernodulated Soybeans 査読有り

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Takashi Okubo, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(2)　172-180　2011年6月

DOI： 10.1264/jsme2.ME10203 　

ISSN：1342-6311
Involvement of the SmeAB Multidrug Efflux Pump in Resistance to Plant Antimicrobials and Contribution to Nodulation Competitiveness in Sinorhizobium meliloti 査読有り

Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(9)　2855-2862　2011年5月

DOI： 10.1128/AEM.02858-10 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Autoregulation of Nodulation Interferes with Impacts of Nitrogen Fertilization Levels on the Leaf-Associated Bacterial Community in Soybeans 査読有り

Seishi Ikeda, Mizue Anda, Shoko Inaba, Shima Eda, Shusei Sato, Kazuhiro Sasaki, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(6)　1973-1980　2011年3月

DOI： 10.1128/AEM.02567-10 　

ISSN：0099-2240
土着ダイズ根粒菌の亜酸化窒素還元酵素遺伝子(nosZ)の分布と亜酸化窒素還元能を利用したN_2O削減(2011年度大会一般講演要旨)

板倉学, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　65　(2)　154-154　2011年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.65.2_154_1 　
A Great Leap forward in Microbial Ecology 査読有り

Satoshi Okabe, Mamoru Oshiki, Yoichi Kamagata, Nobuyasu Yamaguchi, Masanori Toyofuku, Yutaka Yawata, Yosuke Tashiro, Nobuhiko Nomura, Hiroyuki Ohta, Moriya Ohkuma, Akira Hiraishi, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(4)　230-240　2010年12月

DOI： 10.1264/jsme2.ME10178 　

ISSN：1342-6311
The cbbL Gene is Required for Thiosulfate-Dependent Autotrophic Growth of Bradyrhizobium japonicum 査読有り

Sachiko Masuda, Shima Eda, Chiaki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(3)　220-223　2010年9月

DOI： 10.1264/jsme2.ME10124 　

ISSN：1342-6311
Plant-Microbe Communications for Symbiosis 査読有り

Masayoshi Kawaguchi, Kiwamu Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(9)　1377-1380　2010年9月

DOI： 10.1093/pcp/pcq125 　

ISSN：0032-0781
Community- and Genome-Based Views of Plant-Associated Bacteria: Plant-Bacterial Interactions in Soybean and Rice 査読有り

Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Mizue Anda, Hideo Nakashita, Michiko Yasuda, Shusei Sato, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shima Eda, Ayumi Momiyama, Kimihiro Terasawa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(9)　1398-1410　2010年9月

DOI： 10.1093/pcp/pcq119 　

ISSN：0032-0781

eISSN：1471-9053
Impact of plant genotype and nitrogen level on rice growth response to inoculation with Azospirillum sp. strain B510 under paddy field conditions 査読有り

Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Eiko Hanzawa, Chiharu Kisara, Yuri Kazama, Atsuhiko Kushida, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Sato

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　56　(4)　636-644　2010年8月

DOI： 10.1111/j.1747-0765.2010.00499.x 　

ISSN：0038-0768
Copper Metallochaperones are Required for the Assembly of Bacteroid Cytochrome c Oxidase Which is Functioning for Nitrogen Fixation in Soybean Nodules 査読有り

Hatthaya Arunothayanan, Mika Nomura, Rie Hamaguchi, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Shigeyuki Tajima

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(7)　1242-1246　2010年7月

DOI： 10.1093/pcp/pcq079 　

ISSN：0032-0781

eISSN：1471-9053
Temperature-Dependent Expression of Type III Secretion System Genes and Its Regulation in Bradyrhizobium japonicum 査読有り

Min Wei, Keisuke Takeshima, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Mikiko Abe, Satoshi Ishii, Takuji Ohwada

MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS　23　(5)　628-637　2010年5月

DOI： 10.1094/MPMI-23-5-0628 　

ISSN：0894-0282
Thiosulfate-Dependent Chemolithoautotrophic Growth of Bradyrhizobium japonicum 査読有り

Sachiko Masuda, Shima Eda, Seishi Ikeda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　76　(8)　2402-2409　2010年4月

DOI： 10.1128/AEM.02783-09 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Community shifts of soybean stem-associated bacteria responding to different nodulation phenotypes and N levels 査読有り

Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Shoko Inaba, Tomiya Maekawa, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ISME JOURNAL　4　(3)　315-326　2010年3月

DOI： 10.1038/ismej.2009.119 　

ISSN：1751-7362
Complete genomic structure of the cultivated rice endophyte Azospirillum sp. B510. 国際誌査読有り

Takakazu Kaneko, Kiwamu Minamisawa, Tsuyoshi Isawa, Hiroki Nakatsukasa, Hisayuki Mitsui, Yasuyuki Kawaharada, Yasukazu Nakamura, Akiko Watanabe, Kumiko Kawashima, Akiko Ono, Yoshimi Shimizu, Chika Takahashi, Chiharu Minami, Tsunakazu Fujishiro, Mitsuyo Kohara, Midori Katoh, Naomi Nakazaki, Shinobu Nakayama, Manabu Yamada, Satoshi Tabata, Shusei Sato

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes　17　(1)　37-50　2010年2月

DOI： 10.1093/dnares/dsp026 　

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We determined the nucleotide sequence of the entire genome of a diazotrophic endophyte, Azospirillum sp. B510. Strain B510 is an endophytic bacterium isolated from stems of rice plants (Oryza sativa cv. Nipponbare). The genome of B510 consisted of a single chromosome (3,311,395 bp) and six plasmids, designated as pAB510a (1,455,109 bp), pAB510b (723,779 bp), pAB510c (681,723 bp), pAB510d (628,837 bp), pAB510e (537,299 bp), and pAB510f (261,596 bp). The chromosome bears 2893 potential protein-encoding genes, two sets of rRNA gene clusters (rrns), and 45 tRNA genes representing 37 tRNA species. The genomes of the six plasmids contained a total of 3416 protein-encoding genes, seven sets of rrns, and 34 tRNAs representing 19 tRNA species. Eight genes for plasmid-specific tRNA species are located on either pAB510a or pAB510d. Two out of eight genomic islands are inserted in the plasmids, pAB510b and pAB510e, and one of the islands is inserted into trnfM-CAU in the rrn located on pAB510e. Genes other than the nif gene cluster that are involved in N(2) fixation and are homologues of Bradyrhizobium japonicum USDA110 include fixABCX, fixNOQP, fixHIS, fixG, and fixLJK. Three putative plant hormone-related genes encoding tryptophan 2-monooxytenase (iaaM) and indole-3-acetaldehyde hydrolase (iaaH), which are involved in IAA biosynthesis, and ACC deaminase (acdS), which reduces ethylene levels, were identified. Multiple gene-clusters for tripartite ATP-independent periplasmic-transport systems and a diverse set of malic enzymes were identified, suggesting that B510 utilizes C(4)-dicarboxylate during its symbiotic relationship with the host plant.
Azospirillum sp Strain B510 Enhances Rice Growth and Yield 査読有り

Tsuyoshi Isawa, Michiko Yasuda, Hirotoshi Awazaki, Kiwamu Minamisawa, Satoshi Shinozaki, Hideo Nakashita

MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(1)　58-61　2010年2月

DOI： 10.1264/jsme2.ME09174 　

ISSN：1342-6311
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較 : USDA122株特異的遺伝子の探索(2010年度大会一般講演要旨)

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　64　(2)　142-142　2010年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_142_2 　
ダイズ老化根粒からの亜酸化窒素発生に関与する土壌生物(2010年度大会一般講演要旨)

南澤究, 稲葉尚子, 早津雅仁, 星野(高田) 裕子, 岡田浩明, 江田志磨, 三井久幸

土と微生物　64　(2)　137-137　2010年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_137_3 　
Identification of the Mesorhizobium loti gene responsible for glycerophosphorylation of periplasmic cyclic beta-1,2-glucans 査読有り

Yasuyuki Kawaharada, Hiromasa Kiyota, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

FEMS MICROBIOLOGY LETTERS　302　(2)　131-137　2010年1月

DOI： 10.1111/j.1574-6968.2009.01843.x 　

ISSN：0378-1097
Effects of Colonization of a Bacterial Endophyte, Azospirillum sp B510, on Disease Resistance in Rice 査読有り

Michiko Yasuda, Tsuyoshi Isawa, Satoshi Shinozaki, Kiwamu Minamisawa, Hideo Nakashita

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　73　(12)　2595-2599　2009年12月

DOI： 10.1271/bbb.90402 　

ISSN：0916-8451

eISSN：1347-6947
Development of a bacterial cell enrichment method and its application to the community analysis in soybean stems. 国際誌査読有り

Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn E E Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

Microbial ecology　58　(4)　703-14　2009年11月

DOI： 10.1007/s00248-009-9566-0 　

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A method was developed for enriching bacterial cells from soybean stems which was recalcitrant for a culture-independent analysis of bacterial community due to the interference with plant DNA. Stem homogenates were fractionated by a series of differential centrifugations followed by a Nycodenz density gradient centrifugation. The efficiency of bacterial cell enrichment was assessed by ribosomal intergenic spacer analysis (RISA). The intensity and the number of bacterial amplicons of RISA were markedly increased in the DNA extracted from the enriched bacterial cells compared to that in the DNA directly extracted from soybean stems. The phylogenetic diversity of the enriched bacterial cells was evaluated by analyzing a clone library of 16S rRNA gene in comparison with those of the culturable fractions of the enriched and non-enriched stem-associated bacteria, endophytic bacteria, and epiphytic bacteria. The results indicated that the method was able to enrich both endophytic and epiphytic bacteria from soybean stems, and was useful to assess the bacterial diversity based on a 16S rRNA gene clone library. When the sequence data from all clones (1,332 sequences) were combined, 72 operational taxonomic units were affiliated with Proteobacteria (Alpha-, Beta-, and Gammaproteobacteria), Actinobacteria, Firmicutes, and Bacteroidetes, which also provided the most comprehensive set of data on the bacterial diversity in the aerial parts of soybeans.
SUMO E3 ligase HIGH PLOIDY2 regulates endocycle onset and meristem maintenance in Arabidopsis. 国際誌査読有り

Ishida T, Fujiwara S, Miura K, Stacey N, Yoshimura M, Schneider K, Adachi S, Minamisawa K, Umeda M, Sugimoto K

The Plant cell　21　(8)　2284-2297　2009年8月

DOI： 10.1105/tpc.109.068072 　

ISSN：1040-4651
Aerobic Vanillate Degradation and C-1 Compound Metabolism in Bradyrhizobium japonicum 査読有り

Nirinya Sudtachat, Naofumi Ito, Manabu Itakura, Sachiko Masuda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Yasuyuki Kawaharada, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　75　(15)　5012-5017　2009年8月

DOI： 10.1128/AEM.00755-09 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
The communities of endophytic diazotrophic bacteria in cultivated rice (Oryza sativa L.) 査読有り

Janpen Prakamhang, Kiwamu Minamisawa, Kamonluck Teamtaisong, Nantakorn Boonkerd, Neung Teaumroong

APPLIED SOIL ECOLOGY　42　(2)　141-149　2009年6月

DOI： 10.1016/j.apsoil.2009.02.008 　

ISSN：0929-1393
Molecular diversity of bacterial chitinases in arable soils and the effects of environmental factors on the chitinolytic bacterial community 査読有り

Takeshi Terahara, Seishi Ikeda, Chiaki Noritake, Kiwamu Minamisawa, Katsuhiko Ando, Satoshi Tsuneda, Shigeaki Harayama

SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY　41　(3)　473-480　2009年3月

DOI： 10.1016/j.soilbio.2008.11.024 　

ISSN：0038-0717

eISSN：1879-3428
Genomic comparison of Bradyrhizobium japonicum strains with different symbiotic nitrogen-fixing capabilities and other Bradyrhizobiaceae members 査読有り

Manabu Itakura, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Keina Honnma, Konosuke Fujita, Hiroyoshi Iwata, Yuichi Saeki, Yoshino Hara, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ISME JOURNAL　3　(3)　326-339　2009年3月

DOI： 10.1038/ismej.2008.88 　

ISSN：1751-7362

eISSN：1751-7370
Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成と競合能に関わる遺伝子の探索(2009年度大会一般講演要旨)

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　63　(2)　115-115　2009年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.63.2_115_4 　
Nitrous Oxide Emission and Microbial Community in the Rhizosphere of Nodulated Soybeans during the Late Growth Period 査読有り

Shoko Inaba, Kenji Tanabe, Shima Eda, Seishi Ikeda, Atsushi Higashitani, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　24　(1)　64-67　2009年

DOI： 10.1264/jsme2.ME08544 　

ISSN：1342-6311
Nodulation-Dependent Communities of Culturable Bacterial Endophytes from Stems of Field-Grown Soybeans 査読有り

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　24　(3)　253-258　2009年

DOI： 10.1264/jsme2.ME09125 　

ISSN：1342-6311
Generation of Bradyrhizobium japonicum Mutants with Increased N2O Reductase Activity by Selection after Introduction of a Mutated dnaQ Gene 査読有り

Manabu Itakura, Kazufumi Tabata, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiriko Murakami, Junichi Yasuda, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(23)　7258-7264　2008年12月

DOI： 10.1128/AEM.01850-08 　

ISSN：0099-2240

eISSN：1098-5336
Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics. 国際誌査読有り

Yoshikazu Shimoda, Hisayuki Mitsui, Hiroko Kamimatsuse, Kiwamu Minamisawa, Eri Nishiyama, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Sayaka Shinpo, Akiko Watanabe, Mitsuyo Kohara, Manabu Yamada, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Shusei Sato

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes　15　(5)　297-308　2008年10月

DOI： 10.1093/dnares/dsn017 　

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Rhizobia are nitrogen-fixing soil bacteria that establish endosymbiosis with some leguminous plants. The completion of several rhizobial genome sequences provides opportunities for genome-wide functional studies of the physiological roles of many rhizobial genes. In order to carry out genome-wide phenotypic screenings, we have constructed a large mutant library of the nitrogen-fixing symbiotic bacterium, Mesorhizobium loti, by transposon mutagenesis. Transposon insertion mutants were generated using the signature-tagged mutagenesis (STM) technique and a total of 29,330 independent mutants were obtained. Along with the collection of transposon mutants, we have determined the transposon insertion sites for 7892 clones, and confirmed insertions in 3680 non-redundant M. loti genes (50.5% of the total number of M. loti genes). Transposon insertions were randomly distributed throughout the M. loti genome without any bias toward G+C contents of insertion target sites and transposon plasmids used for the mutagenesis. We also show the utility of STM mutants by examining the specificity of signature tags and test screenings for growth- and nodulation-deficient mutants. This defined mutant library allows for genome-wide forward- and reverse-genetic functional studies of M. loti and will serve as an invaluable resource for researchers to further our understanding of rhizobial biology.
Microbial community analysis of field-grown soybeans with different nodulation phenotypes 査読有り

Seishi Ikeda, Lynn Esther E. Rallos, Takashi Okubo, Shima Eda, Shoko Inaba, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(18)　5704-5709　2008年9月

DOI： 10.1128/AEM.00833-08 　

ISSN：0099-2240
Structural characterization of neutral and anionic glucans from Mesorhizobium loti 査読有り

Yasuyuki Kawaharada, Hiromasa Kiyota, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

CARBOHYDRATE RESEARCH　343　(14)　2422-2427　2008年9月

DOI： 10.1016/j.carres.2008.07.007 　

ISSN：0008-6215
Soybean Seed Extracts Preferentially Express Genomic Loci of Bradyrhizobium japonicum in the Initial Interaction with Soybean, Glycine max (L.) Merr 査読有り

Min Wei, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchium, Mlkiko Abe, Takuji Ohwada

DNA RESEARCH　15　(4)　201-214　2008年8月

DOI： 10.1093/dnares/dsn012 　

ISSN：1340-2838
Ethylene production in plants during transformation suppresses vir gene expression in Agrobacterium tumefaciens 査読有り

Satoko Nonaka, Ken-Ichi Yuhashi, Keita Takada, Masayuki Sugaware, Kiwamu Minamisawa, Hiroshi Ezura

NEW PHYTOLOGIST　178　(3)　647-656　2008年5月

DOI： 10.1111/j.1469-8137.2008.02400.x 　

ISSN：0028-646X
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase enhances Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer into plant cells 査読有り

Satoko Nonaka, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(8)　2526-2528　2008年4月

DOI： 10.1128/A-EM.02253-07 　

ISSN：0099-2240
SEARCH FOR NODULATION GENE INDUCER FOR MESORHIZOBIUM LOTI SECRETED FROM ROOTS OF LOTUS CORNICULATUS 査読有り

K. Kojima, T. Yokoyama, M. Itakura, K. Minamisawa, Y. Arima

BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION: TOWARDS POVERTY ALLEVIATION THROUGH SUSTAINABLE AGRICULTURE　42　263-263　2008年

ISSN：0924-1949
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-producing Agrobacterium confers higher ability for gene transfer into plant cells. 査読有り

Nonaka, S, Sugawara, M, Minamisawa, K, Yuhashi, KI, Ezura, H

Applied and Environmental Microbiology　74　(8)　2526-2528　2008年1月
Broad distribution and phylogeny of anaerobic endophytes of cluster XIVa clostridia in plant species including crops 査読有り

Asami Saito, Makoto Kawahara, Seishi Ikeda, Masato Ishimine, Shoichiro Akao, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　23　(1)　73-80　2008年

DOI： 10.1264/jsme2.23.73 　

ISSN：1342-6311
NAD-Malic Enzyme Affects Nitrogen Fixing Activity of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 Bacteroids in Soybean Nodules 査読有り

Tan Van Dao, Mika Nomura, Ril Hamaguchi, Kensuke Kato, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Suphawat Sinsuwongwat, Hoa Thi-Phuong Le, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shigeyuki Tajima

MICROBES AND ENVIRONMENTS　23　(3)　215-220　2008年

DOI： 10.1264/jsme2.23.215 　

ISSN：1342-6311
A Mesorhizobium loti mutant with reduced glucan content shows defective invasion of its host plant Lotus japonicus 査読有り

Yasuyuki Kawaharada, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

MICROBIOLOGY-SGM　153　(12)　3983-3993　2007年12月

DOI： 10.1099/mic.0.2007/008631-0 　

ISSN：1350-0872
(306) 非培養法による精米関連微生物の多様性解析(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

池田, 成志, 藤, 晋一, 佐藤, 敏郎, 古屋, 廣光, 内藤, 秀樹, 伊藤, 希, 江面, 浩, 南澤, 究, 藤村, 達人

日本植物病理學會報　73　(3)　257　2007年8月
出版者・発行元：日本植物病理学会
ISSN：0031-9473
Rhizobitoxine-induced chlorosis occurs in coincidence with methionine deficiency in soybeans 査読有り

Shin Okazaki, Masayuki Sugawara, Ken-Ichi Yuhashi, Kiwamu Minamisawa

ANNALS OF BOTANY　100　(1)　55-59　2007年7月

DOI： 10.1093/aob/mcm087 　

ISSN：0305-7364
Rhizobitoxine production in Agrobacterium tumefaciens C58 by Bradyrhizobium elkanii rtxACDEFG genes 査読有り

Masayuki Sugawara, Ryota Haramaki, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shin Okazaki, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

FEMS MICROBIOLOGY LETTERS　269　(1)　29-35　2007年4月

DOI： 10.1111/j.1574-6968.2006.00590.x 　

ISSN：0378-1097
土壌における原生生物の多様性と微生物との相互作用 : 陸圏と水圏,相互の生態系の比較を通して土壌微生物生態を見つめ直す(学際シンポジウム報告)

南澤究, 島野智之

日本微生物生態学会誌　22　(2)　79-80　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
DOI： 10.20709/jsmeja.22.2_79 　
野生イネ,栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析(2007年度大会一般講演要旨)

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

土と微生物　61　(2)　154-154　2007年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.61.2_154_1 　
Analysis of molecular diversity of bacterial Chitinase genes in the maize rhizosphere using culture-independent methods 査読有り

Seishi Ikedai, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Kiyotaka Miyashita, Tatsuhito Fujimura

MICROBES AND ENVIRONMENTS　22　(1)　71-77　2007年

DOI： 10.1264/jsme2.22.71 　

ISSN：1342-6311
Microbial diversity in milled rice as revealed by riosomal intergenic spacer analysis 査読有り

Seishi Ikeda, Shin-ichi Fuji, Toshiro Sato, Hiromitsu Furuya, Hideki Naito, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

MICROBES AND ENVIRONMENTS　22　(2)　165-174　2007年

DOI： 10.1264/jsme2.22.165 　

ISSN：1342-6311
Microbial community analysis of the phytosphere using culture-independent methodologies 査読有り

Asami Saito, Seishi Ikeda, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　22　(2)　93-105　2007年

DOI： 10.1264/jsme2.22.93 　

ISSN：1342-6311
Rhizobial networks for symbiosis with legumes

Kiwamu Minamisawa, Kazuhiko Saeki, Shusei Sato, Yoshikazu Shimoda

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme.　51　(9)　1044-1050　2006年8月1日

ISSN：0039-9450
Rhizobitoxine modulates plant-microbe interactions by ethylene inhibition 査読有り

M Sugawara, S Okazaki, N Nukui, H Ezura, H Mitsui, K Minamisawa

BIOTECHNOLOGY ADVANCES　24　(4)　382-388　2006年7月

DOI： 10.1016/j.biotechadv.2006.01.004 　

ISSN：0734-9750
Expression of the 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase gene requires symbiotic nitrogen-fixing regulator gene nifA2 in Mesorhizobium loti MAFF303099 査読有り

Noriyuki Nukui, Kiwamu Minamisawa, Shin-Ichi Ayabe, Toshio Aoki

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　72　(7)　4964-4969　2006年7月

DOI： 10.1080/AEM.02745-05 　

ISSN：0099-2240
Discrimination of the commercial seeds of forage crops using ribosomal intergenic spacer analysis 査読有り

Seishi Ikeda, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

BREEDING SCIENCE　56　(2)　185-188　2006年6月

DOI： 10.1270/jsbbs.56.185 　

ISSN：1344-7610

eISSN：1347-3735
Symbiotic Bradyrhizobium japonicum reduces N2O surrounding the soybean root system via nitrous oxide reductase 査読有り

R Sameshima-Saito, K Chiba, J Hirayama, M Itakura, H Mitsui, S Eda, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　72　(4)　2526-2532　2006年4月

DOI： 10.1128/AEM.72.4.2526-2532.2006 　

ISSN：0099-2240
Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる根粒形成、非根粒形成Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム比較(2006年度大会一般講演要旨)

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　60　(2)　144-144　2006年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_144_2 　
ミヤコグサ根粒菌の共生状態における1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase遺伝子(acdS)の転写解析(2006年度大会一般講演要旨)

貫井憲之, 南澤究, 綾部真一, 青木俊夫

土と微生物　60　(2)　145-145　2006年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_145_1 　
ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける新規共生能欠損変異株の解析(2006年度大会一般講演要旨)

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　60　(2)　145-145　2006年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_145_2 　
嫌気窒素固定コンソーシアムの窒素固定に影響する因子の解析(2006年度大会一般講演要旨)

齋藤朝美, 南澤究

土と微生物　60　(2)　143-143　2006年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_143_2 　
Soil microbial community analysis in the environmental risk assessment of transgenic plants 査読有り

Seishi Ikeda, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

Plant Biotechnology　23　(1)　137-151　2006年
出版者・発行元： Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology
DOI： 10.5511/plantbiotechnology.23.137 　

ISSN：1347-6114 1342-4580
サトウキビに接種した窒素固定エンドファイトHerbaspirillumの動態追跡のための緑色蛍光タンパク質の利用査読有り

清水友, 豊里学, 久綱泰代, 佐伯雄一, 南澤究, 中西康博, Njoloma Joyce Prica, 明石良, 赤尾勝一郎

土と微生物　60　(1)　3-9　2006年
出版者・発行元：土壌微生物研究会
DOI： 10.18946/jssm.60.1_3 　

ISSN：0912-2184

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サトウキビ(RK86-129)の根部に接種した窒素固定エンドファイトの植物体内における挙動をgfp遺伝子で標識したHerbaspirillum sp. B501 gfp1を用いて追跡した。5×10^7 cells ml^<-1>のB501 gfp1菌株を含む懸濁液に根部を1時間浸し,1時問,1日,3日,7日,1ヶ月および2ヶ月後に蛍光顕微鏡を用いてその挙動を追跡した。その結果,1時間後では根の表面の一部に数個の菌体が付着する程度であったが,1日後には,細胞間隙や根の表面での増殖が確認された。7日後には不定根の発生部位に生じた表皮の裂け目で増殖する様子が数多く観察され,1ヶ月後には茎の維管束での増殖も観察されるようになった。以上のことから,GFP標識法はサトウキビに接種した窒素固定エンドファイトを追跡する手段として優れた方法であると考えられた。
Evaluation of the Nitrogen-fixing Ability of Endophytic Clostridia based on Acetylene Reduction and Reverse Transcription-PCR Targeting the nifH Transcript and Ribosomal RNA 査読有り

Asami Saito, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　21　(1)　23-35　2006年

DOI： 10.1264/jsme2.21.23 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Community Analysis of Seed-Associated Microbes in Forage Crops using Culture-Independent Methods 査読有り

Seishi Ikeda, Shin-Ichi Fuji, Toshiro Sato, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

Microbes and Environments　21　(2)　112-121　2006年

DOI： 10.1264/jsme2.21.112 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Incorporation of a DNA Sequence Encoding Green Fluorescent Protein (GFP) into Endophytic Diazotroph from Sugarcane and Sweet Potato and the Colonizing Ability of these Bacteria in Brassica oleracea 査読有り

Kazunori Tanaka, Tasuku Shimizu, Muhammad Zakria, Joyce Njoloma, Yuichi Saeki, Masao Sakai, Takeo Yamakawa, Kiwamu Minamisawa, Shoichiro Akao

Microbes and Environments　21　(2)　122-128　2006年

DOI： 10.1264/jsme2.21.122 　

ISSN：1347-4405 1342-6311

eISSN：1347-4405
Correlation of Denitrifying Capability with the Existence of nap, nir, nor and nos Genes in Diverse Strains of Soybean Bradyrhizobia 査読有り

Reiko Sameshima-Saito, Kaori Chiba, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　21　(3)　174-184　2006年

DOI： 10.1264/jsme2.21.174 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Global Gene Expression in Bradyrhizobium japonicum Cultured with Vanillin, Vanillate, 4-Hydroxybenzoate and Protocatechuate 査読有り

Naofumi Ito, Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Eiji Masai, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　21　(4)　240-250　2006年

DOI： 10.1264/jsme2.21.240 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Microbial Community Analysis in the Rhizosphere of a Transgenic Tomato that Overexpresses 3-Hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme a Reductase 査読有り

Seishi Ikeda, Toshikazu Omura, Nozomi Ytow, Hisayuki Komaki, Kiwamu Minamisawa, Hiroshi Ezura, Tatsuhito Fujimura

Microbes and Environments　21　(4)　261-271　2006年

DOI： 10.1264/jsme2.21.261 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Expression of the nifH gene of a Herbaspirillum endophyte in wild rice species: Daily rhythm during the light-dark cycle 査読有り

M You, T Nishiguchi, A Saito, T Isawa, H Mitsui, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　71　(12)　8183-8190　2005年12月

DOI： 10.1128/AEM.71.12.8183-8190.2005 　

ISSN：0099-2240
Expression of a mutated melon ethylene receptor gene Cm-ETR1/H69A affects stamen development in Nicotiana tabacum 査読有り

K Takada, K Ishimaru, K Minamisawa, H Kamada, H Ezura

PLANT SCIENCE　169　(5)　935-942　2005年11月

DOI： 10.1016/j.plantsci.2005.06.012 　

ISSN：0168-9452
Two rhizobial strains, Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum, USDA110, encode haloalkane dehalogenases with novel structures and substrate specificities 査読有り

Y Sato, M Monincova, R Chaloupkova, Z Prokop, Y Ohtsubo, K Minamisawa, M Tsuda, J Damborsky, Y Nagata

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　71　(8)　4372-4379　2005年8月

DOI： 10.1128/AEM.71.8.4372-4379.2005 　

ISSN：0099-2240
Effect of inoculation with anaerobic nitrogen-fixing consortium on salt tolerance of Miscanthus sinensis 査読有り

B Ye, A Saito, K Minamisawa

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　51　(2)　243-249　2005年4月

DOI： 10.1111/j.1747-0765.2005.tb00028.x 　

ISSN：0038-0768
根粒菌の環境ストレス耐性と共生能の両方に重要な転写因子RpoH_1の機能解析(2005年度大会一般講演要旨)

三井久幸, 南澤究

土と微生物　59　(2)　132-132　2005年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.59.2_132_1 　
ダイズ根粒菌のN_2Oパラドックス(2005年度大会一般講演要旨)

南澤究, 千葉芳里, 平山潤太, 鮫島玲子

土と微生物　59　(2)　131-131　2005年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.59.2_131_2 　
Diazotrophic endophytes in rice: Colonization and nitrogen fixation of herbaspirillum and clostridium species 査読有り

K Minamisawa, M You, T Abe, B Ye, A Saito, M Kawahara, T Sato

Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment　41　339-343　2005年
A-03 リゾビトキシン生合成遺伝子の機能解析と非生産菌への導入(共生・相互作用,口頭発表)

菅原,雅之, 岡崎,伸, 野中,聡子, 江面,浩, 南澤,究

日本微生物生態学会講演要旨集　0　(20)　125-125　2004年11月
出版者・発行元：日本微生物生態学会
Novel endophytic nitrogen-fixing clostridia from the grass Miscanthus sinensis as revealed by terminal restriction fragment length polymorphism analysis 査読有り

T Miyamoto, M Kawahara, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(11)　6580-6586　2004年11月

DOI： 10.1128/AEM.70.11.6580-6586.2004 　

ISSN：0099-2240
Cyclic flow-injection analysis for Fe(II)-1,10-phenanthroline using polyurethane foam 査読有り

K Minamisawa, T Yokoyama, M Zenki

BUNSEKI KAGAKU　53　(9)　1021-1024　2004年9月

ISSN：0525-1931
Anaerobic nitrogen-fixing consortia consisting of clostridia isolated from gramineous plants 査読有り

K Minamisawa, K Nishioka, T Miyaki, B Ye, T Miyamoto, M You, A Saito, M Saito, WL Barraquio, N Teaumroong, T Sein, T Sato

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(5)　3096-3102　2004年5月

DOI： 10.1128/AEM.70.5.3096-3102.2004 　

ISSN：0099-2240
New method of denitrification analysis of Bradyrhizobium field isolates by gas chromatographic determination of N-15-labeled N-2 査読有り

R Sameshima-Saito, K Chiba, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(5)　2886-2891　2004年5月

DOI： 10.1128/AEM.70.5.2886-2891.2004 　

ISSN：0099-2240
Sinorhizobium meliloti RpoH(1) is required for effective nitrogen-fixing symbiosis with alfalfa 査読有り

H Mitsui, T Sato, Y Sato, N Ito, K Minamisawa

MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS　271　(4)　416-425　2004年5月

DOI： 10.1007/s00438-004-0992-x 　

ISSN：1617-4615

eISSN：1617-4623
Expression islands clustered on the symbiosis island of the Mesorhizobium loti genome 査読有り

T Uchiumi, T Ohwada, M Itakura, H Mitsui, N Nukui, P Dawadi, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Omori, M Hayashi, T Maekawa, R Sriprang, Y Murooka, S Tajima, K Simomura, M Nomura, A Suzuki, Y Shimoda, K Sioya, M Abe, K Minamisawa

JOURNAL OF BACTERIOLOGY　186　(8)　2439-2448　2004年4月

DOI： 10.1128/JB.186.8.2439-2448.2004 　

ISSN：0021-9193
Bradyrhizobium elkanii rtxC gene is required for expression of symbiotic phenotypes in the final step of rhizobitoxine biosynthesis 査読有り

S Okazaki, M Sugawara, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(1)　535-541　2004年1月

DOI： 10.1128/AEM.70.1.535-541.2004 　

ISSN：0099-2240
Transgenic Lotus japonicus with an ethylene receptor gene Cm-ERS1/H70A enhances formation of infection threads and nodule primordia 査読有り

N Nukui, H Ezura, K Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　45　(4)　427-435　2004年

DOI： 10.1093/pcp/pch046 　

ISSN：0032-0781
Rhizobial Strategies to Enhance Symbiotic Interactions: Rhizobitoxine and 1-Aminocyclopropane-1-Carboxylate Deaminase 査読有り

Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　19　(2)　99-111　2004年

DOI： 10.1264/jsme2.19.99 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Evaluation of Soil DNA from Arable Land in Japan Using a Modified Direct-extraction Method 査読有り

Seishi Ikeda, Kazuo N. Watanabe, Kiwamu Minamisawa, Nozomi Ytow

Microbes and Environments　19　(4)　301-309　2004年

DOI： 10.1264/jsme2.19.301 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Quantitative and time-course evaluation of nodulation competitiveness of rhizobitoxine-producing Bradyrhizobium elkanii 査読有り

S Okazaki, KI Yuhashi, K Minamisawa

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　45　(2)　155-160　2003年7月

DOI： 10.1016/S0168-6496(03)00132-6 　

ISSN：0168-6496
Phylogeny and distribution of extra-slow-growing Bradyrhizobium japonicum harboring high copy numbers of RS alpha, RS beta and IS1631 査読有り

R Sameshima, T Isawa, MJ Sadowsky, T Hamada, H Kasai, A Shutsrirung, H Mitsui, K Minamisawa

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　44　(2)　191-202　2003年5月

DOI： 10.1016/S0168-6496(03)00009-6 　

ISSN：0168-6496
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの2種類のべん毛と運動性

谷ケ崎仁, 南澤究, 相沢慎一

生物物理　43　S150　2003年
出版者・発行元：一般社団法人日本生物物理学会
DOI： 10.2142/biophys.43.S150_3 　
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum DJ2株のべん毛構造と分泌タンパクの解析

平野貴謙, 南澤究, 相沢慎一

生物物理　43　S150　2003年
出版者・発行元：一般社団法人日本生物物理学会
DOI： 10.2142/biophys.43.S150_1 　
Nitrogen-fixing endophyte in gramineous plant 査読有り

K Minamisawa

NIPPON NOGEIKAGAKU KAISHI-JOURNAL OF THE JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND AGROCHEMISTRY　77　(2)　126-129　2003年

ISSN：0002-1407
Genetic diversity of native Bradyrhizobium population in soybean-growing areas of Northern Thailand. 査読有り

Shutsrirung A, Yokoyama T, Senoo K, Tajima S, Minamisawa K, Sameshima R, Bhromsiri A, Hisamatsu M

Soil Science and Plant Nutrition　49　(2)　255-265　2003年1月
共生窒素固定研究の展開と持続的食糧生産(2001年高知大会シンポジウムの概要)

赤尾勝一郎, 田島茂行, 大山卓爾, 安藤象太郎, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　73　(1)　73-78　2002年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.73.1_73 　

ISSN：0029-0610
Herbaspirillum属エンドファイトのイネへの定着と窒素固定(2002年度大会一般講演要旨)

南澤究, 伊沢剛, 佐藤雅志

土と微生物　56　(2)　148-148　2002年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.56.2_148_1 　
嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着(2002年度大会一般講演要旨)

葉繽, 西岡きよ, 佐藤雅志, 南澤究

土と微生物　56　(2)　135-135　2002年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.56.2_135_2 　
Horizontal Transfer of Nodulation Genes in soils and Microcosms from Bradyrhizobium japonicum to B. elkanii 査読有り

Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Masako Suzuki, Kazunori Ichige, Tsuyoshiisawa, Ken-Ichi Yuhashi, Hisayuki Mitsui

Microbes and Environments　17　(2)　82-90　2002年

DOI： 10.1264/jsme2.2002.82 　

ISSN：1347-4405 1342-6311
Complete genomic sequence of nitrogen-fixing symbiotic bacterium Bradyrhizobium japonicum USDA110 (supplement) 査読有り

Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa, Toshiki Uchiumi, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Kumi Idesawa, Mayumi Iriguchi, Kumiko Kawashima, Mitsuyo Kohara, Midori Matsumoto, Sayaka Shimpo, Hisae Tsuruoka, Tsuyuko Wada, Manabu Yamada, Satoshi Tabata

DNA Research　9　(6)　225-256　2002年

DOI： 10.1093/dnares/9.6.225 　

ISSN：1340-2838
Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成遺伝子の塩基配列と遺伝子破壊による機能解析査読有り

Yasuta, T, Okazaki, S, Mistui, H, Yuhashi, K, Ezura, H, Minamisawa, K

Appl. Environ. Microbiol.　67　(11)　4999-5009　2001年11月

DOI： 10.1128/AEM.67.11.4999-5009.2001 　

ISSN：0099-2240
Endophytic colonization and in planta nitrogen fixation by a Herbaspirillum sp isolated from wild rice species 査読有り

A Elbeltagy, K Nishioka, T Sato, H Suzuki, B Ye, T Hamada, T Isawa, H Mitsui, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　67　(11)　5285-5293　2001年11月

DOI： 10.1128/AEM.67.11.5285-5293.2001 　

ISSN：0099-2240
フィリピン・ピナツボ火山泥流地帯の植生回復過程における共生微生物の役割(2001年度大会一般講演要旨)

斎藤雅典, 大場広輔, 米山忠克, 宮木太郎, 南澤究, Barraquio W. L.

土と微生物　55　(2)　133-133　2001年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.55.2_133_2 　
Two RpoH homologs responsible for the expression of heat shock protein genes in Sinorhizobium meliloti 査読有り

Y. Ono, H. Mitsui, T. Sato, K. Minamisawa

Molecular and General Genetics　264　(6)　902-912　2001年

DOI： 10.1007/s004380000380 　

ISSN：0026-8925
エチレン前駆体およびエチレン生合成阻害剤ガミヤコグサおよびサイラトロの根粗形成に及ぼす影響査読有り

南澤究

日本植物生理学会欧文誌　41　(7)　893-897　2000年7月

DOI： 10.1093/pcp/pcd011 　

ISSN：0032-0781
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium el kaniiによるリゾビトキシン生産はサイラトロの競合的根粒形成を促進する査読有り

南澤究

米国応用環境微生物学雑誌　66　(6)　2658-2663　2000年6月

DOI： 10.1128/AEM.66.6.2658-2663.2000 　

ISSN：0099-2240
2000年東京大会シンポジウムの概要 : 自然界の物質代謝と微生物

徳山龍明, 武田潔, 横山和平, 若尾紀夫, 境雅夫, 太田寛行, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　71　(4)　586-592　2000年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.71.4_586 　

ISSN：0029-0610
Analysis of the Bradyrhizobium nod gene-inducers from soybean super/hypernodulating mutants

Asis Jr. Constancio A., Kubota Masatsugu, Minamisawa Kiwamu, Akao Shoichiro

土と微生物　54　(1)　81-86　2000年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.54.1_81 　

ISSN：0912-2184

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In the soybean-Bradyrhizobium symbiosis, the initial stage of nodule formation is triggered by the release of the bacterial nod gene-inducing isoflavonoids from soybean plant. Analysis of the isoflavonoid contents in the seeds and root extracts of 12-day-old uninoculated soybean cultivars and their super/hypernodulating mutant using HPLC revealed that isoflavonoids daidzein, genistein, and coumestrol were present in the roots but only daidzein and genistein could be detected in the seeds. Moreover, all the super/hypernodulating soybean mutants showed lower isoflavonoid contents in the seeds and roots than their parent cultivars. These results suggest that in all the parent cultivars the genes which are probably responsible for controlling the isoflavonoid production are both affected during mutation despite the differences in the mutagen used and background of the seed materials.
Endophytic colonization in rice by diazotrophic Herbaspirillum sp. isolated from wild rice(The Annual Meeting of the Society in 2000)

Elbeltagy Adel, Nishioka Kiyo, Suzuki Hisa, Miyaki Taro, Yuhashi Ken-Ichi, Sato Tadashi, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

土と微生物　54　(2)　172-172　2000年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.54.2_172_1 　
Isolation and characterization of low-indole-3-acetic acid-producing mutants from bradyrhizobium elkanii 査読有り

Ken Yagi, Taku Matsumoto, Tetsuya Chujo, Hideaki Nojiri, Toshio Omori, Kiwamu Minamisawa, Makoto Nishiyama, Hisakazu Yamane

Bioscience, Biotechnology and Biochemistry　64　(7)　1359-1364　2000年

DOI： 10.1271/bbb.64.1359 　

ISSN：1347-6947 0916-8451
Isolation and characterization of endophytic bacteria from wild and traditionally cultivated rice varieties 査読有り

Adel Elbeltagy, Kiyo Nishioka, Hisa Suzuki, Tadashi Sato, Yo-Ichiro Sato, Hisao Morisaki, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Soil Science and Plant Nutrition　46　(3)　617-629　2000年

DOI： 10.1080/00380768.2000.10409127 　

ISSN：1747-0765 0038-0768
Effect of ethylene on Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer to melon. 査読有り

Ezura, H, Yuhashi, K, Yasuta, T, Minamisawa, K

Plant Breeding　119　75-79-79　2000年1月
In vitro plant regeneration in Macroptilium atropurpureum, a legume with a broad symbiont range for nodulation. 査読有り

Ezura, H, Nukui, T, Yuhashi, K-I, Minamisawa, K

Plant Science.　159　21-27　2000年1月
反復配列RSαとRSβをタタコピー保存したダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおける揮入配列IS1631の存在査読有り

南澤究

米国応用環境微生物学雑誌　65　(8)　3493-3501　1999年8月

ISSN：0099-2240
反復配列RSαとRSβフィンガープリントによる日本の土着ダイズ根粒菌のタタ様性と風土性査読有り

南澤究

ヨーロッパ連合微生物生態学雑誌　29　(2)　171-178　1999年6月

DOI： 10.1016/S0168-6496(99)00009-4 　

ISSN：0168-6496
Use of lacZ and gusA reporter genes to trace the infection process of nitrogen-fixing bacteria 査読有り

S Akao, Y Minakawa, H Taki, MK Khan, K Yuhashi, Y Nakayama, CA Asis, Chebotar, V, UG Kang, K Minamisawa, RW Ridge

JARQ-JAPAN AGRICULTURAL RESEARCH QUARTERLY　33　(2)　77-84　1999年4月

ISSN：0021-3551
ACC合成酵素阻害によるリゾビトキシンの新しい定量法査読有り

南澤究

米国応用環境微生物学雑誌　65　(2)　849-852　1999年2月

ISSN：0099-2240
第8回微生物生態国際シンポジウム雑感(こんなことが,いま)

南澤究

土と微生物　53　(1)　63-64　1999年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.53.1_63 　

ISSN：0912-2184
反復配列RSαを多コピー保有する新しいダイズ根粒菌査読有り

南澤究

米国応用環境微生物学雑誌　64　(5)　1845-1851　1998年5月

ISSN：0099-2240
生育の遅い低栄養性の土壌微生物はダイズ根粒菌ジァポニカ種と近縁である査読有り

南澤究

ヨーロッパ連合微生物生態学雑誌　25　(3)　277-286　1998年3月

DOI： 10.1016/S0168-6496(98)00009-9 　

ISSN：0168-6496
8-12 野生イネおよび栽培イネ在来品種のエンドファイトの検索(8.共生)

西岡キヨ, 佐藤雅志, 篠崎聡, 中村郁郎, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　58-58　1998年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_58_2 　

ISSN：0288-5840
6-21 ダイズ根粒菌HRS株からの根粒形成遺伝子の水平伝達(6.土壌生物)

板倉学, 伊沢剛, 三井久幸, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　45-45　1998年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_45_1 　

ISSN：0288-5840
8-17 根粒菌のリゾビトキシン生産と宿主植物のエチレン生成(8.共生)

市川徳一, 遊橋健一, 江面浩, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　61-61　1998年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_61_1 　

ISSN：0288-5840
6-20 ダイズ根粒菌HRS株の分布とその生態的意義(6.土壌生物)

伊沢剛, 板倉学, 市川徳一, 西岡キヨ, 三井久幸, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　44-44　1998年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_44_2 　

ISSN：0288-5840
ダイズ根粒菌ジャポニカ種とエリカーニ種のダイズ栽培種,野生種,サイラトロに対する競合的根粒形成査読有り

南澤究

ヨーロッパ連合微生物生態学雑誌　24　(1)　49-56　1997年9月

DOI： 10.1016/S0168-6496(97)00043-3 　

ISSN：0168-6496
根粒菌の進化と共生の機構にせまる共生プラスミドの全構造

南沢究

化学と生物　35　(8)　578-579　1997年8月25日
出版者・発行元： Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu1962.35.578 　

ISSN：0453-073X
gusA標識ダイズ根粒菌のダイズにおける根粒形成と競合査読有り

南澤究

日本土壌肥料学会欧文誌　43　(2)　473-478　1997年6月

ISSN：0038-0768
GUS代謝産物のフェノール抽出による土壌中のgus導入根粒菌数の推定

皆川律子, 磯田香保理, 大竹憲邦, 山田真也, 五十嵐太郎, 南沢究, 大山卓爾

日本土壌肥料学雑誌　68　(2)　148-155　1997年
出版者・発行元：日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.68.2_148 　

ISSN：0029-0610

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大腸菌由来のβーグルクロニダーゼ(GUS)遺伝子gusAを導入したダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum 61A124a株は,基質であるX-Glucを与えると,単生・共生のいずれの状熊においても青色のGUS代謝産物を菌体内に集積した.このGUS代謝産物をフェノールで抽出して吸光度を測定することにより土壌中のgus導入菌数の推定を試みた.根粒菌は土壌粒子に強く接着し,分離困難であったため,液体フェノールによって菌体を破壊してGUS代謝産物を抽出し,フェノール層の波長645nmの吸光度を測定した.菌密度とフェノール抽出液の吸光度には直線関係が認められた.土壌中の菌数測定には,土壌ごとに検量線を作成することにより吸光度から菌密度の推定が可能であった.なお,根粒菌の増殖はX-Glucの溶媒として用いたN,N-ジメチルホルムアミドとGUS代謝産物によって抑えられることから, GUS反応中における根粒菌数はー定に保たれていた.プラスチックケースに各種土壌を詰めてダイズを栽培し,gus導入菌を局所接種して接種菌の分布と根粒形成を判定した.その結果,根粒菌の増殖速度や分布は土壌によって違いが見られた.土着菌が多く生息する土壌では,接種菌の増殖率が高いにもかかわらず,根粒感染率は低かうた.一方,士着根粒菌密度の低い土壌では,接種菌の増殖率が低くても大部分の根粒が接種菌により形成されていた.Bradyrhizobium japonicum strain 61 A 124 a, in which Escherichia coli gus A gene was introduced to Bradyrhizobium japonicum, absorbs and hydrolyzes GUS-substrate (X-Gluc), and precipitates an indigo pigment. We attempted to use the absorbance of the accumulated GUS-metabolite as an indicator of the rhizobial number in soil. The accumulated indigo blue metabolite in rhizobia were extracted by phenol-water after they are incubated with X-Gluc (20 μL of 1% X-Gluc solution in N,N-dimethylformamide was added to 1 mL of culture solution) for 4 d. The absorbance of the extracted blue pigment in the phenol layer was measured at 645 nm. The initial number of rhizobia and the absorbance of the GUS-metabolite was positively correlated either in cultured 61 A 124 a or in the various types of soil inoculated with 61 A 124 a strain. In the presence of soil, the absorbance per rhizobial number was low compared with the pure culture. Therefore, a standard curve between rhizobial number of 61 A 124 a and the absorbance should be made for every soil sample. During incubation with X-Gluc, rhizobia did not proliferate because of the depression effect on cell growth of N,N-dimethylformamide and the accumulation of indigo pigment. The proliferation and mobility of inoculated 61 A 124 a strain was examined in a rhizobox containing various soil types into which soybeans were planted. The distribution and movement of the marked strain depended on the soil type. In the absence or very low density of indigenous Bradyrhizobium japonicum, the nodule was exclusively formed by the strain 61 A 124 a. On the other hand, the major part of nodules were formed by indigenous strains in the soil types containing a high population of indigenous bradyrhizobia, although the inoculated strain proliferated very well.
26 Comparative Analysis of Isoflavonoid in the Seed of Nodulation-Mutant Soybean and Its Effect on Nodulation Control

Asis Jr., Sato N., Isobe K., Kubota M., Minamisawa K., Akao S.

日本土壌肥料学会講演要旨集　43　336-336　1997年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.43.0_336_2 　

ISSN：0288-5840
8-8 ダイズ根粒菌のゲノム再編成と根粒形成遺伝子の水平伝達(8.共生)

南沢究, 伊沢剛, 遊橋健一, 市毛秀則, 鈴木雅子, 三上朋子, 板倉学

日本土壌肥料学会講演要旨集　43　63-63　1997年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.43.0_63_2 　

ISSN：0288-5840
2種のダイズ根粒菌によって二重感染したダイズ根粒のヒドロゲナーゼ活性査読有り

南澤究

日本土壌肥料学会欧文誌　42　(4)　917-920　1996年12月

ISSN：0038-0768
ダイズ根粒菌エルカーニ種におけるインドール酢酸生合系のためのインドールピルビン酸経路査読有り

南澤究

日本植物生理学会欧文誌　37　(4)　449-453　1996年6月

ISSN：0032-0781
8-4 ダイズ根粒菌超反復配列保有株におけるDNA再編成と遺伝子水平伝播 : (第2報)挿入配列の特徴と分布(8.共生)

伊沢剛, 三上朋子, 坂井満, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　52-52　1996年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_52_2 　

ISSN：0288-5840
8-3 ダイズ根粒菌超反復配列保有株におけるDNA再編成と遺伝子水平伝播 : (第1報)超反復配列保有株の特徴とDNA再編成の証拠(8.共生)

南沢究, 伊沢剛, 三上朋子, 坂井満, 市毛秀則

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　52-52　1996年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_52_1 　

ISSN：0288-5840
8-15 Bradyrhizobium japonicumのNod factorにより誘導されるダイズ細胞の生化学的応答(8.共生)

横山正, 小林直紀, 河内宏, 南沢究, 加来久敏

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　58-58　1996年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_58_1 　

ISSN：0288-5840
8-7 gus-代謝産物のフェノール抽出測定法によるgus-根粒菌株の挙動の解析(8.共生)

皆川律子, 磯田香保里, 大竹憲邦, 南澤究, 五十嵐太郎, 大山卓爾

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　54-54　1996年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_54_1 　

ISSN：0288-5840
8-17 ダイズおよびサイラトロに対するBradyrhizobium japonicumとB.elkaniiの根粒形成速度(8.共生)

遊橋健一, 赤尾勝一郎, 久保田正亜, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　59-59　1996年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_59_1 　

ISSN：0288-5840
8-16 ダイズ根粒菌におけるインドール酢酸生産と根粒形成(8.共生)

福原英之, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　58-58　1996年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_58_2 　

ISSN：0288-5840
ダイズ根粒菌エルカーニ種はダイズ根に外皮層隆起を誘導する査読有り

南澤究

日本植物生理学会欧文誌　36　(8)　1571-1577　1995年12月

ISSN：0032-0781
6-24 Heteroduplex形成法による土壌細菌逆方向反復配列の検索(6.土壌生物)

伊沢剛, 南沢究, 服部勉

日本土壌肥料学会講演要旨集　41　48-48　1995年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.41.0_48_2 　

ISSN：0288-5840
8-1 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのインドールピルビン酸デカルボキシラーゼ(8.共生)

福原英之, 下山由紀子, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　41　62-62　1995年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.41.0_62_1 　

ISSN：0288-5840
ダイズ根粒菌によって生産されるインドール酢酸の根粒形成への関与査読有り

南澤究

日本植物生理学会欧文誌　35　(8)　1261-1265　1994年12月

ISSN：0032-0781
6-8 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのインドール酢酸生合成系 : インドールピルビン酸デカルボキシラーゼの活性の検出とそのクローニング(6.植物の代謝および代謝成分)

舘野栄司, 小川健一郎, 福原英之, 朝山宗彦, 古賀仁一郎, 足立尭, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　40　98-98　1994年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.40.0_98_2 　

ISSN：0288-5840
4-42 ダイズ根粒菌超反復配列保有株の生理的性質(4. 土壌生物)

南沢究, 中塚陽子

日本土壌肥料学会講演要旨集　39　51-51　1993年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.39.0_51_2 　

ISSN：0288-5840
45 Bradyrhizobium層根粒菌におけるインドール酢酸の代謝(関東支部講演会要旨)

小川健一郎, 飯生宏志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　39　299-299　1993年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.39.0_299_1 　

ISSN：0288-5840
Genetic Ecology of Rhizobium and Bradyrhizobium 査読有り

Kiwamu Minamisawa

Nippon Nogeikagaku Kaishi　67　(7)　1070-1072　1993年

DOI： 10.1271/nogeikagaku1924.67.1070 　

ISSN：0002-1407
Distribution of Rhizobia in Leguminous Plants Surveyed by Phylogenetic Identification 査読有り

Satoshi Matsumoto, Kiwamu Minamisawa, Takuma Gamou, Hiroshi Oyaizu

The Journal of General and Applied Microbiology　39　(4)　339-354　1993年

DOI： 10.2323/jgam.39.339 　

ISSN：1349-8037 0022-1260
反復配列およびその他の特徴によって明らかになったダイズ根粒菌圃場単離株の遺伝的関係査読有り

南澤究

米国応用環境微生物学雑誌　58　(9)　2832-2839　1992年9月

ISSN：0099-2240
ヤーコンの地上部,種イモ,塊根中のフラクトオリゴ糖について

浅見輝男, 南沢究, 土屋哲郎, 狩野佳弥子, 堀幾太郎, 大山卓爾, 久保田正亜, 月橋輝男

日本土壌肥料学雑誌　63　(1)　72-74　1992年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.63.1_72 　

ISSN：0029-0610
6-21 DNAハイブリダイゼーション法による土着ダイズ根粒菌の系統と多様性 : (第1報)新潟農試中沢圃場の根粒菌相の解析(6. 植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 関孝幸, 小野寺新吾, 浅見輝男

日本土壌肥料学会講演要旨集　38　101-101　1992年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.38.0_101_1 　

ISSN：0288-5840
6-22 DNAハイブリダイゼーション法による土着ダイズ根粒菌の系統と多様性 : (第2報)各地土壌の根粒菌相の解析(6. 植物の代謝および代謝成分)

中塚陽子, 関孝幸, 南沢究, 浅見輝男

日本土壌肥料学会講演要旨集　38　101-101　1992年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.38.0_101_2 　

ISSN：0288-5840
インドール酢酸生産能によるダイズ根粒菌の系統分類法

南沢究, 飯生宏志, 斉藤苗緒, 小野寺新吾, 中塚陽子, 中島佐江子, 久保田正亜, 浅見輝男

日本土壌肥料学雑誌　63　(4)　459-462　1992年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.63.4_459 　

ISSN：0029-0610
ダイズ根粒菌の系統と生態

南沢究

土と微生物　40　37-46　1992年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.40.0_37 　
栽培・保存期間中におけるヤーコンのフラクトオリゴ糖など各種糖類の成分変化

浅見輝男, 南沢究, 土屋哲郎, 狩野佳弥子, 堀幾太郎, 大山卓爾, 久保田正亜, 月橋輝男

日本土壌肥料学雑誌　62　(6)　621-627　1991年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.62.6_621 　

ISSN：0029-0610

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アンデス高原原産のヤーコン(Polymmia sonchifoliaまたはP. edulis)塊根の生育期間中および畑の土穴,5℃,25℃での保存期間中におけるフラクトオリゴ糖など各種糖類を高速液体クロマトグラフィー(HPLC)により分析し,各種糖類の含有量および含有率の変化について検討した。1)生育期間中,各種糖類の平均重合度は徐々に増加し4.3に達した。各種糖類の存在割合では,初期に多かったGF_2,スクロース,グルコースなど低重合度のものが減り,GF_4以上の高重合度のものが順次増加し,収穫期には全フラクトオリゴ糖含量が乾物の67%に達し,GF_2〜GF_5が各種糖類の約70%を占めた。この結果は,低重合度のフラクトオリゴ糖がヤーコン塊根の主要貯蔵炭水化物であることを明確に示す。またイヌリンおよびデンプンの含量はきわめて低く,それぞれ乾物の0.23%および0.04%以下であった。2)3種類の保存期間中におけるフラクトオリゴ糖の減少をみると,約2週間で土穴保存では21%,5℃保存で33%,25℃保存で41%減少した。各種糖類の平均重合度も徐々に減少し,25℃保存における減少がとくに著しかった。しかし前二者でもその後フラクトオリゴ糖は減少した。フラクトオリゴ糖の分解は末端のフラクトースが1分子ずつ加水分解されると考えられる。したがって,フラクトオリゴ糖の原料にするのには,収穫時の塊根をただちに利用するか,なんらかの方法でフラクトオリゴ糖の分解を抑制することが必要であると考えられた。保存中には遊離のフラクトース,グルコース,スクロースが増加するので,生食あるいは調理して食べるためには,適度な保存が有効であろう。
6-22 ダイズ根粒菌の進化系統とインドール酢酸の生成(6. 植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 深井克彦, 狩野佳弥子, 飯生宏志, 斉藤苗緒

日本土壌肥料学会講演要旨集　37　94-94　1991年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.37.0_94_2 　

ISSN：0288-5840
ダイズ根粒菌によるインドール酢酸の生産:遺伝型とリゾビトキシン生産との関連査読有り

南澤究

日本植物生理学会誌　32　(1)　1-9　1991年1月

ISSN：0032-0781
Polyamines in Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium and Argobacterium 査読有り

Koei Hamana, Kiwamu Minamisawa, Shigeru Matsuzaki

FEMS Microbiology Letters　71　(1-2)　71-76　1990年9月1日

DOI： 10.1016/0378-1097(90)90034-N 　

ISSN：1574-6968 0378-1097
自由生活のダイズ根粒菌におけるヒドロゲナーゼ合成のリゾビトキシンによる阻害査読有り

南澤究

米国微生物学会誌　172　(8)　4505-4509　1990年8月

ISSN：0021-9193
III-2(1) 農業分野における利用の現状 : (1)生物的窒素固定におけるバイオテクノロジー(III. 土壌微生物分野におけるバイオテクノロジーの利用 : その可能性の問題点)

南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　36　17-18　1990年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.36.0_17 　

ISSN：0288-5840
Composition of storage carbohydrate in tubers of yacon (polymnia sonchifolia) 査読有り

Takuji Ohyama, Osamu Ito, Sawako Yasuyoshi, Taro Ikarashi, Kiwamu Minamisawa, Masatsugu Kubota, Teruo Tsukihashi, Osamu Ito, Kiwamu Minamisawa, Masatsugu Kubota, Teruo Tsukihashi, Teruo Asami

Soil Science and Plant Nutrition　36　(1)　167-171　1990年

DOI： 10.1080/00380768.1990.10415724 　

ISSN：1747-0765 0038-0768
Stimulation of hydrogenase synthesis in free-living Bradyrhizobium japonicum by addition of nitrate and ammonium 査読有り

Katsuhiko Fukai, Kiwamu Minamisawa, Teruo Asami

Soil Science and Plant Nutrition　36　(2)　345-347　1990年

DOI： 10.1080/00380768.1990.10415001 　

ISSN：1747-0765 0038-0768
nifDKE遺伝子塩基配列の相異によるリゾビトキシン生産株と水素吸収陽性ダイズ根粒菌の区別査読有り

南澤究

日本植物生理学会欧文誌　31　(1)　81-89　1990年1月

ISSN：0032-0781
種々のダイズ根粒菌の菌体外多糖組成,リゾビトキシン生産,ヒドロゲナーゼ表現型の比較査読有り

南澤究

日本植物生理学会欧文誌　30　(6)　877-884　1989年9月

ISSN：0032-0781
新しい根菜ヤーコン

浅見輝男, 大山卓爾, 南沢究

化学と生物　27　(12)　813-815　1989年
出版者・発行元： Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu1962.27.813 　

ISSN：0453-073X
アンデス高地原産の新しい根菜、ヤーコンの化学組成

浅見輝男, 久保田正亜, 南沢究, 月橋輝男

日本土壌肥料学雑誌　60　(2)　122-126　1989年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.60.2_122 　

ISSN：0029-0610

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Yacon (Polymnia sonchifolia or P. edulis), a root crop native to the Andean Highlands, was introduced into Japan via New Zealand in 1985. the chemical compositions of yacon were determined and the following results were obtained. 1) Compared with the tubers such as potato, taro, Jerusalem artichoke, and Japanese yam, yacon has high moisture, low nitrogen, phosphorus and intermediate iron, and high calcium contents. 2) Free sugars in yacon were only fructose, glucose, and sucrose. These three sugars amounted to 29% of the total dry weight. 3) Twenty-one free nitrogenous compounds (amino acids, and amides) were detected. The nitrogen content of asparagine, glutamine, proline, proline, and arginine accounted for 87% of the nitrogen in the 21free nitrogenous compounds. Nitrogen derived from the 21 free nitrogenous compounds reached about 65% of total nitrogen. 4) The hydrolysate of the polysaccharide fraction contained nearly the same mole of glucose and fructose, suggesting that polysaccharides other than inulin should exist in yacon.
52 土着ダイズ根粒菌における生理的性質の多様性について(関東支部講演会要旨)

南沢究, 山野稔, 〓原くに子

日本土壌肥料学会講演要旨集　35　290-290　1989年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.35.0_290_2 　

ISSN：0288-5840
6-7 nifDH遺伝子および生理的諸性質によるダイズ根粒菌のグルーピング(6.植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 鶴田恭子

日本土壌肥料学会講演要旨集　35　91-91　1989年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.35.0_91_1 　

ISSN：0288-5840
ISOLATION AND ENZYMOLOGICAL CHARACTERIZATION OF INFECTED AND UNINFECTED CELL PROTOPLASTS FROM ROOT-NODULES OF GLYCINE-MAX 査読有り

H KOUCHI, K FUKAI, H KATAGIRI, K MINAMISAWA, S TAJIMA

PHYSIOLOGIA PLANTARUM　73　(3)　327-334　1988年7月

ISSN：0031-9317
土壌中のカドミウム, アンチモン, ビスマスなど重金属元素の自然界値

浅見輝男, 久保田正亜, 南沢究

日本土壌肥料学雑誌　59　(2)　197-199　1988年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.59.2_197 　

ISSN：0029-0610
ポーラログラフ電極法によるダイズ根粒菌Hup型の判定

南沢究, 任清美, 山野稔

日本土壌肥料学雑誌　59　(2)　200-202　1988年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.59.2_200 　

ISSN：0029-0610
6-11 ダイズ根粒感染細胞・非感染細胞の分離とその酵素活性(6.植物の代謝および代謝成分)

河内宏, 深井克彦, 片桐弘樹, 南沢究, 田島茂行

日本土壌肥料学会講演要旨集　34　90-90　1988年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.34.0_90_1 　

ISSN：0288-5840
4-45 Hup型・リゾビトキシン生産能・菌体外多糖などによるダイズ根粒菌の分類(4.土壌生物)

南沢究, 山野稔, 任清美

日本土壌肥料学会講演要旨集　34　49-49　1988年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.34.0_49_1 　

ISSN：0288-5840
61 安中重金属汚染水田土壌のアンチモン,ビスマス含有率(関東支部講演会要旨)

久保田正亜, 南澤究, 松木正浩, 保田睦, 浅見輝男

日本土壌肥料学会講演要旨集　34　276-276　1988年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.34.0_276_1 　

ISSN：0288-5840
第7回国際窒素固定会議に出席して(こんなことが,いま)

南沢究

土と微生物　32　52-52　1988年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.32.0_52_1 　
優良ダイズ根粒菌に関する研究 : 日本土壌肥料学会奨励賞受賞

南沢究

日本土壌肥料学雑誌　58　(3)　291-292　1987年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.58.3_291 　

ISSN：0029-0610
11-17 日本における土壌中有害金属元素の自然界値(11.環境保全)

浅見輝男, 久保田正亜, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　33　175-175　1987年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.33.0_175_1 　

ISSN：0288-5840
Assimilation and transport of fixed nitrogen in soybean nodule as revealed with 15N 査読有り

Kikuo Kumazawa, Yasuhiro Arima, Takuji Ohyama, Kiwamu Minamisawa

Proceedings of the Japan Academy Series B: Physical and Biological Sciences　63　(6)　223-226　1987年

DOI： 10.2183/pjab.63.223 　

ISSN：1349-2896 0386-2208
Determination of Rhizobitoxine and Dihydrorhizobitoxine in Soybean Plants by Amino Acid Analyzer 査読有り

Kiwamu Minamisawa, Norifumi Kume

Soil Science and Plant Nutrition　33　(4)　645-649　1987年

DOI： 10.1080/00380768.1987.10557613 　

ISSN：1747-0765 0038-0768
SERINOL (2-AMINO-1,3-PROPANEDIOL) AND 3-AMINO-1,2-PROPANEDIOL IN SOYBEAN NODULES 査読有り

K MINAMISAWA, H WATANABE

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　27　(6)　1109-1116　1986年9月

ISSN：0032-0781
Characteristics of asparagine pool in soybean nodules in comparison with ureide pool 査読有り

Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima, Kikuo Kumazawa

Soil Science and Plant Nutrition　32　(1)　1-14　1986年

DOI： 10.1080/00380768.1986.10557476 　

ISSN：1747-0765 0038-0768
水素回収系を持つダイズ根粒菌の接種効果

南沢究, 有馬泰紘, 田中裕之, 熊沢喜久雄

日本土壌肥料学雑誌　56　(4)　292-299　1985年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.56.4_292 　

ISSN：0029-0610

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ニトロゲナーゼの作用により放出される水素を回収するのに十分なuptake hydrogenase活性を持つダイズ根粒を形成する根粒菌株(Hup^+株)と空気中で水素を発生しuptake hydrogenase活性を持たないと考えられるダイズ根粒を形成する根粒菌株(Hup^-株)の接種効果について,無窒素条件下,栄養生長段階の初期に比較検討したところ,以下のような結果が得られた.1)Hup^+株(6菌株)接種ダイズの窒素固定量は,Hup^-株(4菌株)接種ダイズより35%増加したが,根粒窒素量,根粒乾物重は,それぞれ10%,12%の増加にとどまった.別の機会に行った接種試験では,A1017(Hup^+株)接種ダイズの窒素固定量は,J5033(Hup^-株)より10%増加したが,根粒窒素量,根粒乾物重は変わらなかった.いずれの場合も,窒素固定量を根粒窒素量または根粒乾物重で除した根粒当たりの窒素固定能の指標は,Hup^+株接種ダイズの根粒のほうが高くなった.2)Hup^-株接種ダイズと比較して,Hup^+株接種ダイズ各器官の窒素量,乾物重は,光合成器官である葉身を含む地上部で顕著に増加した.以上の結果より次のようなことが推察された.根粒内に水素回収系が存在すると,窒素固定効率が高まり,固定窒素が地上部に豊富に供給されるか,光合成産物の根粒での消費が減少することによって,光合成器官を含む地上部の生育が良好となる.その結果,固体当たりの光合成量が増し,根粒への光合成産物の供給量が増加するので,根粒当たりの窒素固定量が増加し,また根粒の生育が促進されたものと考えられた.
22 水素回収系を持つダイズ根粒菌の接種効果(関東支部講演会要旨)

南沢究, 有馬泰紘, 田中裕之, 熊沢喜久雄

日本土壌肥料学会講演要旨集　31　253-253　1985年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.31.0_253_2 　

ISSN：0288-5840
UNIDENTIFIED COMPOUND SPECIFICALLY ACCUMULATED IN SOYBEAN NODULES FORMED WITH H2-UPTAKE NEGATIVE RHIZOBIUM-JAPONICUM STRAINS 査読有り

K MINAMISAWA, Y ARIMA, K KUMAZAWA

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　30　(3)　435-444　1984年

ISSN：0038-0768
TRANSPORT OF FIXED NITROGEN FROM SOYBEAN NODULES INOCULATED WITH H-2-LABELED UPTAKE POSITIVE AND NEGATIVE RHIZOBIUM-JAPONICUM STRAINS 査読有り

K MINAMISAWA, Y ARIMA, K KUMAZAWA

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　29　(1)　85-92　1983年

ISSN：0038-0768
6-7 水素発生,非発生ダイズ根粒による固定窒素の同化(合同部会生物的窒素固定)(6.植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 有馬泰紘, 熊沢喜久雄

日本土壌肥料学会講演要旨集　28　88-88　1982年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.28.0_88_1 　

ISSN：0288-5840
空気中で水素発生を示さないダイズ根粒を形成する根粒菌の検索

有馬泰紘, 南沢究, 熊沢喜久雄

日本土壌肥料学雑誌　52　(2)　114-118　1981年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.52.2_114 　

ISSN：0029-0610

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MISC 290

土壌由来の温室効果ガス削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023年
温室効果ガス削減と土壌微生物学

南澤究

学会誌「土と微生物」　76(2)　36-42　2022年10月
非マメ科作物の窒素固定エンドファイト

南澤究

協会誌「作物生産と土づくり」　10・11月号　21-25　2022年10月
窒素循環を担う植物共生微生物

南澤究

日本農学賞受賞論文学会誌「土と微生物」　76(1)　4-11　2022年4月

DOI： 10.18946/jssm.76.1_4 　
Bradyrhizobium ottawaense株における温室効果ガスN₂Oの還元能

原沙和, 原沙和, SIQUEIRA Arthur Fernandes, 菅原雅之, 板倉学, 三井久幸, GOMES Cristina Sanchez, 佐藤修正, 下田宜司, 今泉(安楽)温子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022年

ISSN： 2424-0575
土壌から発生するN₂O削減をめざす市民科学プロジェクト~地球冷却微生物を探せ~

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 菊地美穂, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022年

ISSN： 2424-0575
土壌のN₂O発生削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 加藤広海, 菊地美穂, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022年

ISSN： 2424-0575
役に立つ農業微生物の知識（連載8）水稲根のメタン酸化窒素固定

南澤究

ニューカントリー 11月号　(788)　2019年11月
役に立つ農業微生物の知識（連載7）地球環境を守る根粒菌

南澤究

ニューカントリー 10月号　(787)　46-47　2019年10月
Editorial: Metabolic adjustments and gene expression reprogramming for symbiotic nitrogen fixation in legume nodules. 査読有り

Brett James Ferguson, Kiwamu Minamisawa, Nacira Belen Muñoz, Hon-Ming Lam.

Frontiers in Plant Science　10　898　2019年7月
ソルガム由来Bradyrhizobiumの窒素固定とゲノム情報に基づく機能解析

原沙和, 原新太郎, 森川峻志, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　13th　89　2019年3月6日
窒素固定遺伝子を有する脱窒細菌によるN₂O固定の検証

鈴木里俊, 早川智恵, 早川智恵, 増田曜子, 西澤智康, 菅原雅之, 嵐田遥, 南澤究, 磯部一夫, 妹尾啓史, 妹尾啓史

日本微生物生態学会大会(Web)　33rd　2019年
Methylobacterium sp.AMS5株接種によるダイズ地上部の細菌叢シフト

原新太郎, 松田雅敏, 原沙和, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　28th　61(JA),62(EN)　2018年11月

ISSN： 1341-0652
ソルガム根におけるBradyrhizobium属細菌分離株のnif遺伝子群と窒素固定能

原沙和, 森川峻志, 原新太郎, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　28th　53(JA),54(EN)　2018年11月

ISSN： 1341-0652
ソルガム根からのBradyrhizobium属窒素固定細菌の分離と特性解析

森川峻志, 原新太郎, 原沙和, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　28th　51(JA),52(EN)　2018年11月

ISSN： 1341-0652
オーミック解析に基づくソルガム根窒素固定細菌の特

原新太郎, 森川峻志, 和才沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　64　26　2018年8月29日

ISSN： 0288-5840
環境オミックス解析によるソルガム根の窒素固定Bradyrhizobium属細菌の同定

原新太郎, 森川峻志, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　12th　62　2018年3月5日
植物組織からの細菌細胞濃縮法の改良:ダイズ組織別の細菌叢解析

原新太郎, 松田雅敏, 新井沙和, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2018　17　2018年
根粒菌ニトロゲナーゼの水素発生による土壌細菌叢変化と根粒共生の低温適応

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2018　18　2018年
ダイズ由来Methylobacterium属細菌のゲノムから推定されたウレイド分解および炭素代謝のポテンシャル

新井沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　105 (JA),106 (EN)　2017年12月

ISSN： 1341-0652
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌のOmic解析による同定

南澤究, 原新太郎, 森川峻志, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　23 (JA),24 (EN)　2017年12月

ISSN： 1341-0652
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌の探索

森川峻志, 原新太郎, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　103 (JA),104 (EN)　2017年12月

ISSN： 1341-0652
Greenhouse gas emission from the soybean rhizosphere is mitigated by promoting nitrous oxide reductase activity in bradyrhizobia

南澤究

植物の生長調節　52　(2)　127-131　2017年12月
出版者・発行元：植物化学調節学会誌
根粒菌による根圏温室効果ガス発生削減

南澤究

アグリバイオ　1　(10)　40-43　2017年9月20日
出版者・発行元： (株)北隆館
土壌団粒化資材による超団粒土壌の微生物叢変化

南澤究, 原新太郎, 田ノ上明宏, 林利夫, 遠藤圭二

日本土壌肥料学会講演要旨集　63　21　2017年9月5日

ISSN： 0288-5840
ダイズ根粒菌USDA110系統のゲノム多様性と吸収型ヒドロゲナーゼゲノミックアイランド構造変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐315 (WEB ONLY)　2017年
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌接種株の追跡

金原一真, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　11th　63　2017年
土着ダイズ根粒菌USDA110系統株におけるゲノム多様性とゲノミックアイランド構造の変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　11th　60　2017年
接種実験系によるMethylobacterium属細菌のダイズ器官および組織内の局在性

岩崎還帰, SITI Hafidah Nur, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐302 (WEB ONLY)　2017年
根粒菌hupSL1変異によるダイズ根圏のH₂代謝と細菌群集構造の変動

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 高橋智子, 三屋公佑, 菅原雅之, 板倉学, 金子貴一, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐317 (WEB ONLY)　2017年
連作ダイズ莢組織内のMethylobacterium属細菌の動態:組織内分布と分離株の系統・ウレイド代謝

原新太郎, NUR Hafidah Siti, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.O‐073 (WEB ONLY)　2017年
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌の探索

森川峻志, 原新太郎, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐323 (WEB ONLY)　2017年
ダイズ根粒菌Bradyhrozbium diazoefficiens USDA110型菌株における吸収型ヒドロゲナーゼの多様性

渡辺剛, 板倉学, 三屋公佑, 原新太郎, 金原一真, 菅原雅之, 按田瑞恵, 篠田亮, 金子貴一, 金子貴一, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　76 (JA),77 (EN)　2016年12月

ISSN： 1341-0652
連作によるダイズ地上部の細菌叢変化

原新太郎, 鶴丸博人, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　21 (JA),22 (EN)　2016年12月

ISSN： 1341-0652
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種判定および土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別

金原一真, 板倉学, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, WANG Yong, 鶴丸博人, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　62 (JA),63 (EN)　2016年12月

ISSN： 1341-0652
土壌微生物が創る共生の世界−その先端的研究事例と農業への応用的研究展開

南澤究

日本土壌肥料学雑誌　87　(5)　383-387　2016年10月5日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.87.5_383 　
土着ダイズ根粒菌混合菌株の接種によるダイズ圃場からのN2O発生削減

秋山博子, 星野(高田)裕子, 板倉学, 板倉学, 下村有美, 下村有美, 王勇, 山本昭範, 山本昭範, 多胡香奈子, 中島泰弘, 南澤究, 早津雅仁

日本土壌肥料学会講演要旨集　62　166-166　2016年9月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.62.0_166_2 　

ISSN： 0288-5840
メタゲノム解析によるダイズMethylobacterium属細菌のメチルアミン・ウレイド代謝の発見

南智之, 按田瑞恵, 三井久幸, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 佐藤修正, 池田成志, 原新太郎, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2016　17　2016年6月6日
植物共生細菌群集を利用した持続的農業

大久保卓, 池田成志, 南澤究

土と微生物 = Soil microorganisms　70　(1)　10-16　2016年4月
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.70.1_10 　

ISSN： 0912-2184
Are Symbiotic Methanotrophs Key Microbes for N Acquisition in Paddy Rice Root?

Kiwamu Minamisawa, Haruko Imaizumi-Anraku, Zhihua Bao, Ryo Shinoda, Takashi Okubo, Seishi Ikeda

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　4-10　2016年3月

DOI： 10.1264/jsme2.ME15180 　

ISSN： 1342-6311
硝酸供給に応答したシロイヌナズナ根の共生細菌群集の変化

小西範幸, 小西範幸, 大久保卓, 早川俊彦, 山谷知行, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　2016年

ISSN： 1341-0652
微生物環境応答システムの速度論的解析と応用開発

日高將文, 後藤愛那, 清水泰希, 南澤究, 今村博臣, 内田隆史

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2016　2016年

ISSN： 2186-7976
イネとダイズの共生微生物による窒素代謝

南澤究

肥料科学　(38)　79-108　2016年
出版者・発行元：肥料科学研究所
ISSN： 0387-2718
土着の根粒菌を用いたダイズ畑でのN2O発生の削減

秋山博子, 星野(高田)裕子, 板倉学, 板倉学, 下村有美, 王勇, 山本昭範, 多胡香奈子, 中島泰弘, 南澤究, 早津雅仁

農研機構農業環境変動研究センター成果情報(Web)　2016　2016年
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種の判定と接種菌群の追跡

金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　10th　73　2016年
ダイズ圃場からの収穫期前後におけるN₂O発生源の特定と土着ダイズ根粒菌混合菌株利用によるN₂O発生削減

星野裕子, 秋山博子, 板倉学, 板倉学, 下村有美, 下村有美, 王勇, 山本昭範, 山本昭範, 多胡香奈子, 中島泰弘, 南澤究, 早津雅仁

日本微生物生態学会大会(Web)　31st　212 (WEB ONLY)　2016年
Bacterial Glade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome

Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

GENES & GENETIC SYSTEMS　90　(6)　376-376　2015年12月

ISSN： 1341-7568

eISSN： 1880-5779
日本のダイズリソースにおけるRj2遺伝型の分布

菅原雅之, 梅原洋佐, 千葉(柿崎)芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　25th　39 (JA),40 (EN)　2015年12月

ISSN： 1341-0652
メタゲノム‐マッピング法による土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別

南澤究, 金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野(高田)裕子, WANG Yong, 秋山博子, 早津雅仁

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　25th　29 (JA),30 (EN)　2015年12月

ISSN： 1341-0652
大量の挿入配列を保有するダイズ根粒菌のゲノム解析 : 根粒菌の生成と消滅を示唆する共生アイランド爆発(2015年度大会講演要旨)

飯田隆之, 板倉学, 按田瑞恵, 菅原雅之, 伊沢剛, 大久保卓, 佐藤修正, 千葉(柿崎) 芳里, 南澤究

土と微生物　69　(2)　111-111　2015年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
日本のダイズ根粒菌とダイズのRj2共生不和合性

菅原雅之, 鈴木悠太, 板倉学, 千葉(柿崎)芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

土と微生物　69　(2)　124-124　2015年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
10 連作したダイズの収量と根共生細菌の多様性(東北支部講演会,2014年度各支部会)

鶴丸博人, 板倉学, 大久保卓, 柿崎芳里, 浅野目謙之, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　249-249　2015年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
9 窒素追肥と栽植方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響(東北支部講演会,2014年度各支部会)

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　248-248　2015年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
14 根粒根圏土壌微生物相の群集構造解析によるマメ科作物の連作障害の発生機構の解明(北海道支部講演会,2014年度各支部会)

池田成志, 臼木一英, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　241-241　2015年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
S3-2-13 テンサイ共生系をモデルとした群集構造解析の活用による植物生育促進細菌の効率的な選抜と単離(ミニシンポジウムS3-2 土壌微生物研究を農業にどう役立てるか-基礎研究から実用化への展開,3-2 土壌生物の応用と制御,2015年度京都大会)

池田成志, 鶴丸博人, 岡崎和之, 橋本萌, 高橋宙之, 大和田琢二, 南澤究, 関口博之, 森一幸, 富濱毅

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　46-46　2015年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
テンサイ共生系をモデルとした群集構造解析の活用による植物生育促進細菌の効率的な選抜と単離

池田成志, 鶴丸博人, 岡崎和之, 橋本萌, 高橋宙之, 大和田琢二, 南澤究, 関口博之, 森一幸, 富濱毅

日本土壌肥料学会講演要旨集　61　(61)　46-46　2015年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
京都府黒ダイズ圃場でのダイズ生育と根圏微生物叢の解析

杉山暁史, 海野佑介, 小野愛, 吉川正巳, 鈴木秀幸, 南澤究, 矢崎一史

第25回植物微生物研究交流会　2015年9月
テンサイからの生育促進細菌の選抜

岡崎和之, 鶴丸博人, 大和田琢二, 高橋宙之, 田口和憲, 黒田洋輔, 上田重文, 南澤究, 池田成志

てん菜研究会報　(55)　25-26　2015年2月

ISSN： 0912-1048
硝酸供給に応じたシロイヌナズナ根の共生細菌群集の変化

小西範幸, 小西範幸, 早川俊彦, 山谷知行, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　25th　2015年

ISSN： 1341-0652
水稲根メタン酸化細菌の窒素固定能のメタプロテオーム解析,組織局在性と分離まで

包智華, 篠田亮, 大久保卓, 久保田健吾, 笠原康裕, 池田成志, 浅川晋, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　30th　JS5-3 (WEB ONLY)　2015年
共生微生物の多様性情報を活用したテンサイからの有用細菌の効率的な選抜

岡崎和之, 鶴丸博人, 大和田琢二, 高橋宙之, 南澤究, 池田成志

日本微生物生態学会大会(Web)　30th　JS13-1 (WEB ONLY)　2015年
圃場における土着ダイズ根粒菌のnirK遺伝子発現とN₂O発生

星野(高田)裕子, 板倉学, 秋山博子, 中島泰弘, 山本昭範, 山本昭範, 下村有美, 下村有美, 王勇, 早津雅仁, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　30th　PB‐036 (WEB ONLY)　2015年
大豆連作圃場における根粒菌多様性解析

浅野目謙之, 鶴丸博人, 板倉学, 田澤純子, 南澤究

日本作物学会東北支部会報　(57)　55-56　2014年12月
出版者・発行元：日本作物学会東北支部
ISSN： 0911-7067

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大豆連作圃場における低収要因として，大豆根粒にアグロバクテリウムが共存し，根粒菌の同化物を詐取している可能性が報告されている。そこで，連作圃場における土壌微生物相を調査し，連作による微生物相の遷移や大豆根粒菌の多様化を解析し，大豆低収要因との関係を検討した。
水稲根メタン酸化細菌は非マメ科植物の根粒菌か?

南澤究, BAO Zhihua, 池田成志, 大久保卓, 今泉(安楽)温子, 常田岳志, 久保田健吾, 笠原康裕, LIU Dongyan, 浅川晋

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　24th　(JA)6,(EN)7　2014年12月

ISSN： 1341-0652
テンサイ主根に共生する細菌のメタゲノム解析

鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 橋本萌, 柿崎芳里, 半澤栄子, 高橋宙之, 浅野目謙之, 田中福代, 関山恭代, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2014　112-112　2014年10月16日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
O29-05 ダイズのRj遺伝子型が共生細菌群集に与える影響の評価(口頭発表)

海野佑介, 城惣吉, 信濃卓郎, 南澤究, 佐伯雄一, 池田成志

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　112-112　2014年10月16日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
土壌微生物研究の「宝の山」 : 現場とメタゲノムデータ(会員からの声-「こんなことが,これから」,<特集>日本土壌微生物学会60周年記念)

南澤究

土と微生物　68　(2)　59-60　2014年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
第20回国際土壌科学会議シンポジウム報告(こんなことが,いま)

南澤究, 妹尾啓史

土と微生物　68　(2)　92-93　2014年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
テンサイ主根に共生する細菌のメタゲノム解析(共生/寄生/相互作用(symbiosis/paraticism/communication),一般講演,環境微生物系学会合同大会2014講演要旨)

鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 橋本萌, 柿崎芳里, 半澤栄子, 高橋宙之, 浅野目謙之, 田中福代, 関山恭代, 池田成志, 南澤究

土と微生物　68　(2)　109-109　2014年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
P3-1-11 土壌の湛水条件が根粒菌群集構造におよぼす影響(ポスター,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

中村美里, 城惣吉, 板倉学, 南澤究, 山本昭洋, 佐伯雄一

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　39-39　2014年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
P3-1-12 共生窒素固定を促進するダイズ根粒菌III型分泌系エフェクター(ポスター,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

鈴木悠太, Sanchez Cristina, 柿崎芳里, 佐藤修正, 金子貴一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　40-40　2014年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
3-2-3 窒素追肥と栽植方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響(3-2 土壌生物の応用と制御,2014年度東京大会)

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　42-42　2014年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
S3-1-21 水稲根における窒素固定メタン酸化細菌のメタプロテオーム同定と組織局在性(ミニシンポジウム S3-1,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

包智華, 大久保卓, 窪田健吾, 笠原康裕, 鶴丸博人, 按田瑞恵, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　35-35　2014年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
接種したN₂O還元酵素保有根粒菌の圃場における機能発現

星野(高田)裕子, 板倉学, 秋山博子, 中島泰弘, 山本昭範, 下村有美, 王勇, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　60　(60)　38-38　2014年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
圃場条件下でのダイズ根粒菌の多様性に対するRj遺伝子型の影響評価

池田成志, 海野佑介, 城惣吉, 信濃卓郎, 南澤究, 佐伯雄一

日本土壌肥料学会講演要旨集　60　34　2014年9月9日

ISSN： 0288-5840
S3-1-17 ジャガイモ根圏では主要な施肥成分の制限によりRhizobium属細菌が寡占化する(ミニシンポジウム S3-1,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

海野佑介, 信濃卓郎, 南澤究, 池田成志

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　34-34　2014年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
1S-Cp04 植物共生科学の新展開と農学研究のパラダイムシフト(シンセティック・エコロジー: 腸内から自然環境の恒常的維持に向けた微生物生態系の調和,シンポジウム)

池田成志, 南澤究

日本生物工学会大会講演要旨集　66　11-11　2014年8月5日
出版者・発行元：公益社団法人日本生物工学会
山形県におけるダイズ連作による収量低下と根粒に内生する非共生土壌細菌感染率(2013年度大会一般講演要旨)

田澤純子, 浅野目謙之, 大脇良成, 南澤究, 横山正, 吉川正巳

土と微生物　68　(1)　47-47　2014年4月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
テンサイ共生微生物の多様性と窒素固定能の探索(2013年度大会一般講演要旨)

鶴丸博人, 岡崎和之, 大久保卓, 橋本萌, 浅野目謙之, 池田成志, 南澤究

土と微生物　68　(1)　36-36　2014年4月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
根粒菌シグマ因子RpoH1の制御を受ける機能未知遺伝子の鉄硫黄タンパク質生合成への関与

佐々木祥平, 門屋亨介, 笠原康裕, 南澤究, 三井久幸

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　8th　2014年
ダイズ根粒菌高N₂O還元活性株のゲノム解析による脱窒遺伝子の新規転写制御因子の発見

板倉学, SANCHEZ Cristina, 松本貴嗣, 吉川博文, 後藤愛那, 日高将文, 内田隆史, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　8th　2014年
FRETを用いた硝酸センサータンパク質の開発

後藤愛那, 日高將文, 岡部恵美子, 金井研太, 小坂啓太, 板倉学, CRISTINA Sanchez, 南澤究, 内田隆史

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2014　2014年

ISSN： 2186-7976
O33-02 rRNA遺伝子オペロンが9.4kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見(口頭発表)

按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 三井久幸, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　120-120　2014年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P25-41 共生不和合性を誘導するダイズ根粒菌のタイプIII型エフェクターの探索(ポスター発表)

岩野裕也, 鈴木悠太, 柿崎芳里, 菅原雅之, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　259-259　2014年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P23-4 アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N_2O発生の特定(ポスター発表)

森内真人, 葛貫桂一, 池西史生, 板倉学, 包智華, 豊田栄, 吉田尚弘, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　229-229　2014年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P25-6 Phylogeny and Functions of Bacterial Communities Associated with Field-Grown Rice Shoots :

大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 大島健志朗, 服部正平, 佐藤雅志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　241-241　2014年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
3-1-7 ダイズ根粒菌のゲノムバリエーション : マッピングによる挿入配列コピー数の推定(3-1 土壌生物の生態と機能,2013年度名古屋大会)

飯田隆之, 柿崎芳里, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(59)　36-36　2013年9月11日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
P3-2-3 ダイズ根粒菌におけるN_2O還元酵素活性を制御している遺伝子の同定とN_2O削減への利用(3-2 土壌生物の応用と制御)

板倉学, Sanchez Cristina, 松本貴嗣, 吉川博文, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(59)　52-52　2013年9月11日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
N2O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の高効率接種法の確立と圃場における追跡

星野裕子, 下村有美, 板倉学, 多胡香奈子, 秋山博子, 内田義崇, 森本晶, 王勇, 早川千嘉, 吉川博文, 松本貴嗣, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　59　(59)　51-51　2013年9月11日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
物質循環のミッシングリンクを解く微生物研究

南澤究

遺伝　67　(5)　544-546　2013年9月
出版者・発行元：エヌ・ティー・エス
ISSN： 0387-0022
マメ科植物根圏のN2Oパラドックス

南澤究, 森内真人

遺伝　67　(5)　552-556　2013年9月
出版者・発行元：エヌ・ティー・エス
ISSN： 0387-0022
水稲根圏のメタン酸化

包智華, 南澤究

遺伝　67　(5)　596-600　2013年9月
出版者・発行元：エヌ・ティー・エス
ISSN： 0387-0022
テンサイ共生微生物の多様性と窒素固定能の探索

鶴丸博人, 岡崎和之, 大久保卓, 橋本萌, 浅野目謙之, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2013　22　2013年6月19日
Aurantimonas属細菌AU20株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　22nd　(JA)49,(EN)50,49　2013年5月

ISSN： 1341-0652
Bradyrhizobium japonicum Is‐34のRj₄‐gsn遺伝子の探索

橋元祥吾, 鶴丸博人, 山川武夫, 南澤究, 池田成志

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　22nd　(JA)62,(EN)63　2013年5月

ISSN： 1341-0652
世界で初めての微生物を用いた温室効果ガス・N₂Oの削減法を野外で実証

秋山博子, 内田義崇, 早津雅仁, 星野(高田)裕子, 多胡香奈子, 下村有美, 王勇, 森本晶, 南澤究, 板倉学

農業環境技術研究所研究成果情報　29　16-17　2013年3月31日

ISSN： 1882-076X
ダイズ根粒菌のN₂O還元酵素によるダイズ根圏からのN₂O発生削減

板倉学, 内田義崇, 秋山博子, 星野(高田)裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, WANG Yong, 早川千尋, 植竹佑輔, SANCHEZ Cristina, 江田志磨, 早津雅仁, 南澤究

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2013　3C32P10 (WEB ONLY)　2013年3月5日

ISSN： 2186-7976
PG-016 光合成Bradyrhizobium属細菌のメタノール依存的な生育に及ぼす希土類元素の影響(生理・代謝・増殖,ポスター発表)

関謙二郎, 包智華, 三井亮司, 谷明生, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　128-128　2013年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
OJ-002 温室効果ガスN_2O発生削減の根粒菌ゲノミックス : N_2O還元酵素遺伝子の新規制御系の発見(ゲノミクス・メタゲノミクス,口頭発表)

南澤究, 板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文

日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　92-92　2013年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PB-001 N_2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species :

Moriuchi Makoto, Inaba Shoko, Ikenishi Fumio, Itakura Manabu, Kikuchi Masakazu, Eda Shima, Chiba Naohiko, Katsuyama Chie, Suwa Yuichi, Sameshima-Saito Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　105-105　2013年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
ダイズ根圏の N2O 発生機構と根粒菌による削減

板倉学, Sanchez Cristina, 森内真人, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会誌　13　(2)　1-4　2013年
作物根圏における窒素と微生物の相互作用

南澤究, 包智華, 板倉学

土と微生物　67　(2)　49-53　2013年
出版者・発行元：土壌微生物研究会
DOI： 10.18946/jssm.67.2_49 　

ISSN： 0912-2184

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肥料削減は持続的農業の一つの目標である。窒素条件を変化させた水田に栽培したイネ植物体に生息している細菌群集構造の解析を行った。その結果，低窒素環境で特定の細菌群の相対存在比が上昇した。機能遺伝子として，メタン酸化や植物ホルモン関連遺伝子の相対存在比が低窒素環境で上昇した。これらの結果は，低窒素環境がイネ根の共生細菌群集を形作る鍵因子であることが分かった。イネの共生遺伝子が低窒素環境でメタン酸化依存的な窒素固定を制御している可能性が示唆された。ダイズ根粒はN2Oを吸収する能力が高いにも関わらず，圃場環境ではマメ科作物根圏からN2Oが発生するという矛盾に関心を持ち，分子生態学的な手法によりN2O発生機構の解明を行ってきた。その結果，老化根粒では根粒タンパク質を物質的な起点とする一連の食物連鎖と窒素形態変化（根粒タンパク質→アンモニア→亜硝酸→N2O）の中でN2Oが発生すると考えられた。また，N2OからN2への還元はnosZ+根粒菌が担っており，根粒根圏から発生したN2Oを吸収しN2に還元するため，nosZ+/ nosZ++根粒菌接種により根圏全体のN2O発生が削減できることを室内実験および圃場レベルで明らかにした。
植物生育促進細菌の研究動向

鶴丸博人, 橋本萌, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　84　(5)　418-423　2013年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.84.5_418 　

ISSN： 0029-0610

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本総説では，植物生育促進微生物の最新(2009年以降)の研究動向について紹介する。植物生育促進微生物は，分類学的に細菌と糸状菌類に大きく分けられる。ここでは植物生育促進細菌(Plant growth-promoting bacteria(PGPB))の研究動向について詳しく紹介する。我々の調べた限り，分類学的に属レベルで新規な細菌による植物生育促進の報告は，近年ではほとんどない。PGPBならびにその候補のほとんどは，Pseudomonas属細菌やBacillus属細菌などの既知のPGPBである。ここ最近の報告で注目されるのは，1)植物生育促進能を持つ根粒内生細菌の報告，2)PGPBのゲノム解析の報告，そして3)ACC deaminaseによる植物生育促進効果に関する報告である。ここでは，これら三つのトピックについてそれぞれ詳しく紹介する。
植物共生科学の新展開と農学研究におけるパラダイムシフト

池田成志, 鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 南澤究

化学と生物　51　(7)　462-470　2013年
出版者・発行元： Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.51.462 　

ISSN： 0453-073X

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植物共生科学は植物と共生微生物（群）の相互作用の解明を目的とする基礎科学であるが，当該分野の進歩は生命科学の幅広い諸分野に大きな影響を及ぼす．本稿では，植物共生の生態学的意義について解説した後，有用微生物の探索・選抜や機能解析，微生物ゲノム解析の進歩，植物における有用微生物制御系の発見，植物共生系の網羅的分析技術の開発，施肥条件や光環境を通した共生微生物制御，共生科学的視点からの「おいしさ」の科学的解明などの最近のトピックスと，関連する応用科学分野での今後の新たな研究展開の可能性について私見を紹介したい．
S01-3 持続的農業に向けた植物共生微生物のメタゲノム解析と組織局在性(S01 微生物と持続的な食料生産,シンポジウムセッション)

大久保卓, 福島翔平, 按田瑞恵, 池田志成, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　73-73　2012年9月19日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
23-10 ダイズ根圏のN_2O発生機構 : 根粒菌と土壌生物による根粒窒素由来のN_2O発生(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

南澤究, 稲葉尚子, 池西史生, 板倉学, 江田志磨, 千葉直彦, 勝山千恵, 諏訪裕一, 星野(高田) 裕子, 早津雅仁

日本土壌肥料学会講演要旨集　(58)　180-180　2012年9月4日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
23-11 N_2O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の作出とモデル系によるN_2O発生削減(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

板倉学, 植竹佑輔, Sanchez Cristina, 江田志磨, 田畑和文, 松本貴嗣, 吉川博文, 椎名陽子, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(58)　180-180　2012年9月4日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
N₂O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の利用に向けた培養・接種・検出方法の確立

星野裕子, 板倉学, 多胡香奈子, 秋山博子, 下村有美, 内田義崇, 森本晶, 荒木千尋, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　58　(58)　180-180　2012年9月4日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
土壌科学を基盤とする学術の動向と展開 : Part I 作物の生産基盤としての土壌科学(2011年つくば大会シンポジウムの概要)

三枝正彦, 太田健, 信濃卓郎, 南沢究, 稲村達也

日本土壌肥料學雜誌　83　(4)　483-486　2012年8月5日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.83.4_483 　

ISSN： 0029-0610

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地球環境や人間活動を支える土壌は,第1次生産者としての植物の生育を大きく左右するのみならず,その後の食物連鎖により,動物ひいては人間の生長,健康維持にも大きく影響する。「作物生産基盤としての土壌科学」について,1)作物生産におけるペドロジーの役割,2)土壌に根ざした作物栄養学の展開,3)作物生産に対する土壌微生物の貢献,4)作物学から土壌科学へ望むことの4課題に関し,それぞれペドロジー,作物栄養学,土壌微生物学,作物学の原点に遡って討議し,あらためてこの分野の学術の動向と今後の展開を考える。
水稲のメタン発生に及ぼすイネ共生遺伝型の影響

包智華, 大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽)温子, 浅川晋, 劉冬艶, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2012　55　2012年6月10日
OsCCaMKは水稲根と陸稲根の細菌群集構造を変化させる

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 武田直也, 馬場まり, 今泉(安楽, 温子, 福田善通, 藤原信介, 大脇良成, 佐々木和浩, 佐藤雅志, BAO Zhihua

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　21st　(JA)69,(EN)69-70　2012年3月

ISSN： 1341-0652
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum strain USDA6^Tのゲノム構造解析

金子貴一, 眞板寛子, 内池伸和, 渡辺安希子, 山田学, 平川英樹, 南澤究, 佐藤修正

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　21st　2012年

ISSN： 1341-0652
PB-22 イネ共生遺伝型の水稲のメタン発生とイネ根メタン酸化細菌に及ぼす影響(PB 土壌生態系,ポスター発表)

包智華, 渡辺彩, 大久保卓, 劉冬艶, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽) 温子, 浅川晋, 佐藤雅志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　145-145　2012年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
水稲のメタン発生に及ぼすイネ共生遺伝型の影響(2012年度土壌微生物学会講演要旨)

包智華, 大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽) 温子, 浅川晋, 劉冬艶, 佐藤雅志, 南澤究

土と微生物　66　(2)　90-90　2012年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.2_90_3 　

ISSN： 0912-2184
23-13 N_2O還元酵素活性を強化した根粒菌接種によるダイズ畑から発生するN_2Oの削減1 : 異なる土壌におけるnosZ強化株接種の効果(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

秋山博子, 早津雅仁, 南澤究, 内田義崇, 星野(高田) 裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, 王勇, 早川千尋, 板倉学

日本土壌肥料学会講演要旨集　58　(0)　181-181　2012年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
23-14 N_2O還元酵素活性を強化した根粒菌接種によるダイズ畑から発生するN_2Oの削減2 : 黒ボク土畑におけるnosZ+およびnosZ強化株接種の効果(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

内田義崇, 南澤究, 秋山博子, 星野(高田) 裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, 王勇, 板倉学, 早津雅仁

日本土壌肥料学会講演要旨集　58　(0)　181-181　2012年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophica S58^Tのゲノム解析

大久保卓, 大島健志朗, 三井久幸, 服部勉, 服部正平, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　6th　64　2012年
PCRを用いた接種ダイズ根粒菌の簡易検定法の確立と育苗時接種法における接種効率の評価

荒木千嘉, 星野(高田)裕子, 森本晶, 下村有美, 内田義崇, 王勇, 早津雅仁, 秋山博子, 板倉学, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　27th　(27)　70-70　2011年10月8日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
圃場栽培ダイズ根粒根圏におけるアンモニア酸化細菌及びアンモニア酸化古細菌の動態解析

星野裕子, 荒木千尋, 森本晶, 下村有美, 内田義崇, 王勇, 早津雅仁, 秋山博子, 稲葉尚子, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　27th　(27)　71-71　2011年10月8日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
6-23 ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構と根粒菌を利用した低減化(6.土壌生物)

板倉学, 稲葉尚子, 池西史生, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(57)　42-42　2011年8月8日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
IX-4 作物生産に対する土壌微生物の貢献 : 農耕地生態系における微生物群集構造の変動法則の理解から作物生産への貢献を目指して(IX 土壌科学を基盤とする学術の動向と展開Part 1作物の生産基盤として土壌科学,2011年度つくば大会講演要旨)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(57)　241-241　2011年8月8日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
SA-3 植物共生微生物の多様性研究とその社会貢献(SA 微生物多様性研究の現状と可能性,シンポジウム)

南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(27)　38-38　2011年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
202a-2 異なる土壌型におけるnosZ保有・非保有Bradyrhizobium japonicumの出現頻度と系統分布(202a 土壌生態系,口頭発表)

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(27)　62-62　2011年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構とその低減化

板倉学, 稲葉尚子, 池西史生, 南澤究

化学と生物　49　(8)　560-565　2011年
出版者・発行元： Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.49.560 　

ISSN： 0453-073X
P-81 イネ根の窒素固定菌の群集構造解析(E.群集構造解析,ポスター発表)

北野愛奈, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　135-135　2010年11月23日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集 : Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH (Fluorescence in situ hybridization)解析(2010年度大会一般講演要旨)

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　64　(2)　146-146　2010年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_146_4 　

ISSN： 0912-2184
根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析(2010年度大会一般講演要旨)

按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　64　(2)　147-147　2010年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_147_3 　

ISSN： 0912-2184
S25-8 岡田要之助先生とWinogradsky : 彼らが現代の土壌微生物研究を見たら?(S25.過去との対話と交流、土壌微生物通信探訪,2010年度北海道大会)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　196-196　2010年9月7日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-16 異なる土壌型におけるダイズ根粒菌nosZ保有株の出現頻度 : 出現頻度の高い沖積土と低い黒ボク土の主成分解析(8.共生,2010年度北海道大会)

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　49-49　2010年9月7日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-17 ダイズ根粒菌のN_2O還元能による根粒根圏モデル系からのN_2O発生低減化(8.共生,2010年度北海道大会)

板倉学, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 植竹佑輔, 江田志磨, 松本貴嗣, 吉川博文, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　49-49　2010年9月7日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集:Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH(Fluorescence in situ hybridization)解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2010　45　2010年5月21日
根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析

按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2010　48　2010年5月21日
イネ共生細菌の群集構造解析

南澤究, 池田成志, 佐々木和浩, 大久保卓, 北野愛奈, 大島健志朗, 服部正平, 佐藤雅志, 今泉(安楽)温子, 飯田隆之, 按田瑞恵, 江田志磨, 三井久幸

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　4th　53　2010年3月4日
バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510のゲノム構造解析

金子貴一, 南澤究, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之, 佐藤修正

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　4th　2010年
バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510のゲノム構造解析

金子貴一, 南澤究, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之, 佐藤修正

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　19th　2010年

ISSN： 1341-0652
SB-2 根粒根圈のN_2O発生機構とその低減化(土壌-植物園における窒素動態と微生物生態-異分野融合による新展開を目指して-,シンポジウムB)

南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　50-50　2010年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
1C-1 STMによって同定されたダイズ根粒菌遺伝子の根粒形成と競合能力に関わる機能の解析(B.土壌生態系,口頭発表)

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　76-76　2010年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
1A-12 ミヤコグサ根粒菌の宿主植物への侵入に重要なcep遺伝子の機能解析(K.共生/相互作用,口頭発表)

菅原智史, 川原田泰之, 松本貴嗣, 志波優, 吉川博文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　66-66　2010年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
根粒超着生ダイズからのMethylobacterium属及びAurantimonas属細菌の分離

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集　40th　39　2010年
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集:Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH(Fluorescence in situ hybridization)解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集　40th　42　2010年
8-22 根粒着生変異と窒素施肥レベルに応答したダイズ葉の細菌群集構造変化(8.共生,2010年度北海道大会)

池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 佐々木和浩, 佐藤雅志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　56　(0)　51-51　2010年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.56.0_51_1 　

ISSN： 0288-5840
8-23 窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集の構造変化 : 低窒素区の根圏における窒素固定細菌とメタン酸化細菌の増加(8.共生,2010年度北海道大会)

佐々木和浩, 大久保卓, 池田成志, 北野愛奈, 飯田隆之, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　56　(0)　51-51　2010年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.56.0_51_2 　

ISSN： 0288-5840
「第１回植物微生物共生と窒素固定に関するアジア国際会議」を開催して

南澤究

日本土壌肥料学雑誌　81　(6)　619-620　2010年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.81.6_619 　

ISSN： 0029-0610
1A-13 ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化(口頭発表)

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志摩, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　7-7　2009年11月21日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
1B-16 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養(口頭発表)

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 池田成志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　16-16　2009年11月21日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
23-2 ダイズ老化根粒におけるN_2O発生メカニズムの解明 : 根粒菌脱窒と硝化過程の関与(23.地球環境,2009年度京都大会)

稲葉尚子, 菊池真和, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　185-185　2009年9月15日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
22 ダイズ根粒根圏からのN_2O発生における根粒菌の寄与(東北支部講演会,2008年度各支部会)

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　263-263　2009年9月15日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-7 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育(6.土壌生物,2009年度京都大会)

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　40-40　2009年9月15日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-5 変異型dnaQプラスミドによる高N_2O還元酵素活性を示すダイズ根粒菌変異株の取得(6.土壌生物,2009年度京都大会)

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　39-39　2009年9月15日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
S6-15 非培養法による植物共生微生物の多様性解析 : 非培養法によるダイズ共生微生物の群集構造に対する根粒共生系及び窒素施肥の影響評価(S6.分子生態学的解析手法を研究室のルーチンワークに!パート2それによって見えるもの、見たいもの,6.土壌生物,2009年度京都大会)

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志摩, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　42-42　2009年9月15日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
耕地土壌におけるキチナーゼの多様性および環境因子との関連性

寺原猛, 池田成志, 則武ちあき, 南澤究, 安藤勝彦, 常田聡, 原山重明

日本農芸化学会大会講演要旨集　2009　340　2009年3月5日
異なる根粒形成表現型ダイズにおける細菌エンドファイトの多様性解析

大久保卓, 池田成志, 佐藤修正, 金子貴一, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　(JA)51,(EN)52　2009年3月

ISSN： 1341-0652
異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

池田成志, RALLOS Lynn, Esther E, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　(JA)53-54,(EN)54,53　2009年3月

ISSN： 1341-0652
バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510ゲノムの全塩基配列決定と解析

金子貴一, 南澤究, 佐藤修正, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　2009年

ISSN： 1341-0652
1B-15 超純水中におけるBradyrhizobium属細菌の生存と適応(口頭発表)

菅原千晶, 増田幸子, 板倉学, 川原田泰之, 三井久幸, 江田志摩, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　16-16　2009年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

池田成志, RALLOS Lynn, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　24th　(24)　136-136　2008年11月25日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
10-183 細胞濃縮法を用いたダイズ茎関連細菌の群集構造解析(群集構造解析,研究発表)

大久保卓, 池田成志, 金子貴一, Rallos Lynn, 江田志磨, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(24)　150-150　2008年11月25日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
8-23 Novel metallochaperone in the assembly of cytochrome c oxidase of soybean nodule bacteroids

Arunothayanan Hatthaya, Dao Tan Van, Hamaguchi Rie, Noda Ayaka, Itakura Manabu, Minamisawa Kiwamu, Nomura Mika, Tajima Shigeyuki

日本土壌肥料学会講演要旨集　(54)　64-64　2008年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-19 セイヨウミヤコグサ根分泌物のnod gene誘導活性を阻害する根粒菌培養培地の特性について(8.共生,2008年度愛知大会)

小島克洋, 横山正, 板倉学, 南澤究, 有馬泰紘

日本土壌肥料学会講演要旨集　(54)　63-63　2008年9月9日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
イネ内生細菌ゲノムの遺伝子構成比較解析

金子貴一, 南澤究, 中村保一, 渡辺安希子, 小野章子, 山田学, 小原光代, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志摩, SUDTACHAT Nirinya, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　17th　2008年

ISSN： 1341-0652
06-101 ダイズ根粒菌変異型dnaQプラスミドを用いた高N_2O還元酵素活性変異株の取得(方法論,研究発表)

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(24)　109-109　2008年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
08-149 ダイズ根粒菌におけるチオ硫酸酸化を担うsox遺伝子群の解析(生理/代謝/増殖,研究発表)

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(24)　133-133　2008年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
09-164 老化ダイズ根粒からのN_2O発生における根粒菌の寄与(物質循環,研究発表)

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(24)　140-140　2008年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
ゲノム情報に基づいた植物共生細菌の環境応答と物質循環機能の解明

南澤究, 増田幸子, 板倉学, 池田成志

土と微生物　62　(2)　89-92　2008年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.62.2_89 　

ISSN： 0912-2184

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ダイズ根粒菌(Bradyrhizobium japonicum)USDA110株のゲノム情報から推定されたチオ硫酸酸化,芳香族分解系の遺伝子の新規機能を明らかにした。いずれの場合も低濃度の基質が電子供与体となり,重複遺伝子群の一部が機能していた。これらの結果は,ダイズ根粒菌の低栄養環境細菌としての振る舞いを示したものであると考えられた。ダイズ根粒菌の菌株比較より,共生窒素固定能を高めるゲノム領域を同定した。B. japonicumに見いだされたこれらの遺伝子群はBradyrhizobiaceae科やProteobacteriaにも分布しているので,土壌細菌としての隠れた性質を明らかにする一助になると考えられた。また,エンドファイトなどの植物関連細菌の研究において微生物濃縮法の意義を議論した。
PA-30 ダイズ根粒根圏のN_2O発生に関わる微生物の解明(農耕地生態系,ポスターセッションA,ポスター発表)

菊池真和, 田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　91-91　2007年9月15日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
RISA法による微生物多様性評価

齋藤朝美, 池田成志, 則武ちあき, 赤坂真理子, 藤城圭輔, 安藤勝彦, 南澤究

日本微生物生態学会誌　22　(2)　59-71　2007年9月
出版者・発行元：日本微生物生態学会
DOI： 10.20709/jsmeja.22.2_59 　
8-11 Proteome analysis of Bradyrhizobium japonicum USDA110 bacteroid differentiation during soybean nodule development

Dao Van Tan, Lee Phuong Hoa, Nomura Mika, Saeki Kazuhiro, Minamisawa Kiwamu, Kaneko Takakazu, Tabata Satoshi, Tajima Shigeyuki

日本土壌肥料学会講演要旨集　(53)　55-55　2007年8月22日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-10 共生窒素固定に関与するダイズ根粒菌バクテロイドタンパク質の検索(8.共生,2007年度東京大会)

野村美加, Dao Van Tan, 濱口理恵, 加藤賢祐, 板倉学, 南澤究, 田島茂行

日本土壌肥料学会講演要旨集　(53)　55-55　2007年8月22日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-4 野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析(8.共生,2007年度東京大会)

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

日本土壌肥料学会講演要旨集　(53)　53-53　2007年8月22日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
植物共生細菌の微生物資源とゲノム解析

南澤究

Microbiology and Culture Collections : official publication of the Japan Society for Culture Collections : 日本微生物資源学会誌　23　(1)　55-55　2007年6月1日

ISSN： 1342-4041
かずさDNA研における有用植物(トマト,ユーカリ)およびバクテリアエンドファイトのゲノム配列解析プロジェクトの現状

金子貴一, 浅水恵理香, 中村保一, 佐藤修正, 福岡浩之, 南澤究, 笹本茂美, 渡邊安希子, 小野章子, 田畑哲之

日本植物生理学会年会要旨集　48th　2007年
イネエンドファイトのゲノムシークエンスプロジェクト

金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 南澤究, 小野章子, 岸田佳恵, 中崎直美, 加藤みどり, 川島久美子, 清水好美, 南千春, 高橋千佳, 林恭子, 山田学, 田畑哲之

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　16th　2007年

ISSN： 1341-0652
植物内生細菌エンドファイトのゲノム解析

金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 南澤究, 田畑哲之

日本植物学会大会研究発表記録　71st　2007年
イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム比較解析

金子貴一, 中村保一, 南澤究, 渡邉安希子, 田畑哲之

生化学　2007年

ISSN： 0037-1017
PB-51 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおけるN_2O還元酵素高発現株の作成(物質環境,ポスターセッションB,ポスター発表)

植竹佑輔, 千葉芳里, 平山潤太, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　140-140　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
S1-1 微生物生態学における環境ゲノミクス(シンポジウムI:微生物生態学における環境ゲノミクス,第23回大会シンポジウム)

南澤究, 鎌形洋一

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　171-171　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
アセチレン還元と逆転写PCRに基づいた植物内生クロストリジウム属細菌の窒素固定能の評価(日本微生物生態学会2007年度論文賞受賞講演)

齋藤朝美, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　169-169　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PB-44 Analysis of metabolic features of naturally-occurring aromatic compounds in Bradyrhizobium japonicum based on array and gene disruption(Metabolism/Chemical activity,Poster presentation B) :

Sudtachat Nirinya, Ito Naofumi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　136-136　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
1-10 Community structures of endophytes in soybeans with different nodulation genotypes(Agricultural ecosystem,Oral presentaion) :

Rallos Lynn Esther E., Ikeda Seishi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　41-41　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
3-06 根粒菌Mesorhizobium lotiの環状グルカンの細胞内含有量に影響を与えるcep遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染において必須の役割を有する(共生・相互作用,口頭発表)

三井久幸, 川原田泰之, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　65-65　2007年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
Current status of genome sequencing projects of plants and endophytic bacteria at KDRI

Takakazu Kaneko, Erika Asamizu, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Hiroyuki Fukuoka, Kiwamu Minamisawa, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Akiko Ono, Satoshi Tabata

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　48　S254-S254　2007年

ISSN： 0032-0781
A milestone for endophyte biotechnology

Kiwamu Minamisawa

NATURE BIOTECHNOLOGY　24　(11)　1357-1358　2006年11月

DOI： 10.1038/nbt1106-1357 　

ISSN： 1087-0156
A-18 ダイズ根粒圏におけるN_2O発生と微生物群集(農耕地生態系,(2)口頭発表会,研究発表会)

南澤究, 田邉謙二, 平山潤太, 菊池真和, 植竹佑輔, 池田成志, 江田志磨

日本微生物生態学会講演要旨集　(22)　218-218　2006年10月27日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
ダイズ根粒根圏のN_2O発生と生物群集構造解析(2006年度大会一般講演要旨)

田邉謙二, 平山潤太, 金榮厚, 池田成志, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　60　(2)　121-121　2006年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_121_1 　

ISSN： 0912-2184
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの芳香族化合物分解系およびエネルギー獲得系の解析(2006年度大会一般講演要旨)

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　60　(2)　2006年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
8-12 ダイズ根粒シンビオソーム溶液を処理した単生ダイズ根粒菌に誘導される新規遺伝子応答の網羅的解析(8. 共生, 2006年度秋田大会講演要旨)

横山正, 大石真子, 有馬泰紘, 大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 佐伯和彦, 田島茂行, 内海俊樹, 阿部美紀子

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　44-44　2006年9月5日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-8 ダイズ根粒菌のゲノムの構造比較と共生窒素固定能(6. 土壌生物, 2006年度秋田大会講演要旨)

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　32-32　2006年9月5日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
12 窒素固定エンドファイトへのGFP (緑色蛍光タンパク質) 遺伝子の導入法の検討(九州支部春季講演会, 2005年度各支部会講演要旨)

田中和憲, 清水友, 佐伯雄一, 山川武夫, 南沢究, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　299-299　2006年9月5日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-9 ダイズ根粒根圏のN2O発生と生物群集構造解析(6. 土壌生物, 2006年度秋田大会講演要旨)

田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　32-32　2006年9月5日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
PA-64 ダイズ根粒菌超反復配列保有(HRS)株と通常(non-HRS)株のゲノム構造比較(その他,ポスターセッションA,(1)ポスター発表会,研究発表会)

板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(22)　118-118　2006年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
A-19 土壌抽出基質と硝酸呼吸条件下におけるダイズ根粒菌の増殖・生残遺伝子のSTMによる探索(農耕地生態系,(2)口頭発表会,研究発表会)

上松瀬裕子, 板倉学, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(22)　219-219　2006年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
B-13 ダイズ根粒菌のsox相同遺伝子によるチオ硫酸酸化(代謝活性/化学活性解析,(2)口頭発表会,研究発表会)

増田幸子, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(22)　245-245　2006年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
農耕地からの地球温暖化ガスN2O発生とその抑制

南澤究, 犬伏和之

水環境学会誌　29　(2)　67-71　2006年
根粒菌からみた共生システム

南澤究, 佐伯和彦, 佐藤修正, 下田宜司

蛋白質・核酸・酵素　51　2006年
Clean analytical methodology for the determination of lead with Arsenazo III by cyclic flow-injection analysis

M Zenki, K Minamisawa, T Yokoyama

TALANTA　68　(2)　281-286　2005年12月

DOI： 10.1016/j.talanta.2005.07.059 　

ISSN： 0039-9140
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析(2005年度大会一般講演要旨)

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　59　(2)　132-132　2005年10月1日
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.59.2_132_2 　

ISSN： 0912-2184
微生物と植物の共生相互作用の科学特集：微生物バイオテクノロジー

南澤究

学術月報　58　(10)　747-751　2005年10月
出版者・発行元：日本学術振興会
ISSN： 0387-2440
S6-7 ダイズ根粒菌のゲノム構造とチオ硫酸酸化系の解析(S6.窒素循環に関わる土壌微生物研究の新展開,6.土壌生物,日本土壌肥料学会 2005年度大会講演要旨集)

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(51)　36-36　2005年9月6日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
P8-5 Mesorhizobium lotiのnod遺伝子発現を誘導する物質の特性(ポスター紹介,8.共生,日本土壌肥料学会 2005年度大会講演要旨集)

小島克洋, 横山正, 板倉学, 南澤究, 有馬泰紘

日本土壌肥料学会講演要旨集　(51)　56-56　2005年9月6日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
A-20 野生イネにおけるHerbaspirillumエンドファイトのnifH発現 : 明暗サイクルによるリズム(遺伝子解析,口頭発表)

游牧, 西口友広, 齋藤朝美, 伊沢剛, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(21)　216-216　2005年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
C-14 ダイズ根粒における亜酸化窒素の吸収と発生(代謝活性/化学活性解析,口頭発表)

平山潤太, 田邉謙二, 千葉芳里, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(21)　258-258　2005年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
C-08 STM法の構築によるミヤコグサ根粒菌の炭素源飢餓応答に関連する遺伝子の探索(生理/増殖,口頭発表)

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(21)　252-252　2005年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PB-11 Clostridium属エンドファイトの分布(群集構造解析,ポスターセッションB,ポスター発表)

齋藤朝美, 河原誠, 西口友広, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(21)　131-131　2005年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
Genome-wide view of Mesorhizobium and Bradyrhizobium, expression island clustard on symbiosis island and genome diversity

T Uchiumi, T Ohwada, T Kaneko, T Yokoyama, K Saeki, M Hayashi, S Tajima, K Minamisawa

Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment　41　139-139　2005年
Rhizobitoxine biosynthesis in Bradyrhizorium elkanii and transfer of rtx genes to non-producing rhizobia

M Sugawara, S Okazaki, S Nonaka, H Ezura, K Minamisawa

Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment　41　332-332　2005年
土壌微生物学におけるポストゲノム研究の現状と将来

福井学, 南澤究, 笠原康裕, 町田雅之, 早津雅仁, 妹尾啓史

日本土壌肥料学雑誌　76　(4)　523-529　2005年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.76.4_523 　

ISSN： 0029-0610
共生細菌におけるポストゲノム研究の展開 : 根粒菌のトランスクリプトミクス(I 土壌微生物学におけるポストゲノム研究の現状と将来, 2004年度シンポジウムならびに受賞記念講演講演要旨集)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　202-202　2004年9月14日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
イネから分離された内生窒素固定細菌 Herbaspirillum spp. のサトウキビへの感染について(九州支部春季講演会, 日本土壌肥料学会支部講演会講演要旨集2004年度)

豊里学, 久綱泰代, 佐伯雄一, 南澤究, 中西康博, 明石良, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　319-319　2004年9月14日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
遺伝子型の異なるダイズから単離したベトナム土着根粒菌の系統分類(8. 共生, 2004年度大会講演要旨集)

佐伯雄一, 金子愛, 鈴木高太郎, Nguyen Thi Minh, 鮫島玲子, 南澤究, 長友由隆, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　59-59　2004年9月14日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
Mesorhizobium loti のin-situ モニタリング法による nod 遺伝子の発現解析 : Mesorhizobium loti の nod 遺伝子発現誘導物質の探索その1(8. 共生, 2004年度大会講演要旨集)

小島克洋, 横山正, 板倉学, 南澤究, 有馬泰紘

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　61-61　2004年9月14日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較(6. 土壌生物, 2004年度大会講演要旨集)

南澤究, 板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　40-40　2004年9月14日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
土壌圏の進化と微生物(5) 土壌生態圏はいかに窒素を獲得したか：共生窒素固定系の進化

鮫島玲子, 南澤究

化学と生物　42　(5)　346-351　2004年5月
出版者・発行元： Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu1962.42.346 　

ISSN： 0453-073X
A-12 マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較 : Bradyrhizobium属細菌のゲノム進化と多様性(分類・系統解析,口頭発表)

板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　134-134　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
B-08 マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析(遺伝子伝播,口頭発表)

原圭乃, 板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　170-170　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
B-18 直接核酸抽出法によるClostridium属エンドファイトの分布と機能の解析(群集構造解析,口頭発表)

河原誠, 宮本拓也, 斉藤朝美, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　180-180　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-002 ベトナムのアルカリ土壌に生息するダイズ根粒菌の分類(農耕地生態系,ポスター発表)

佐伯雄一, 原俊昭, 鈴木高太郎, 鮫島玲子, 南澤究, 長友由隆, 赤尾勝一郎

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　24-24　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-048 ダイズ根粒菌における外来性因子trn elementの構造解析(遺伝子解析,ポスター発表)

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　70-70　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-075 ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索 : リン酸トランスポーター遺伝子の解析(共生・相互作用,ポスター発表)

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　97-97　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-050 ^<15>N-N_2O投与によるダイズ根粒菌のN_2O吸収・N_2発生機構の解明(代謝活性/化学活性解析,ポスター発表)

平山潤太, 千葉芳里, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　72-72　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-029 炭素源飢餓条件下で高発現するミヤコグサ根粒菌遺伝子破壊株の増殖特性(生理・増殖,ポスター発表)

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　51-51　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-076 Clostridium属エンドファイトの植物体内における窒素固定のnifH転写産物による検出(共生・相互作用,ポスター発表)

斉藤朝美, 游牧, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　98-98　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
P-079 根粒菌のマメ科植物との共生成立に必須な転写因子の解析(共生・相互作用,ポスター発表)

三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　101-101　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
2E15-3 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA110株由来ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjAの構造と基質特異性に関する解析(環境浄化・修復・保全技術,一般講演)

佐藤優花里, 池田和香子, 大坪嘉之, 永田裕二, DAMBORSKY JIRI, 南澤究, 津田雅孝

日本生物工学会大会講演要旨集　16　171-171　2004年
出版者・発行元：日本生物工学会
土壌微生物のモデルとしての根粒菌ポストゲノム研究の可能性

南澤究

土と微生物　58　(2)　69-77　2004年
出版者・発行元：土壌微生物研究会
DOI： 10.18946/jssm.58.2_69 　

ISSN： 0912-2184

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根粒菌による共生窒素固定は,分子状窒素のアンモニアへの還元という地球規模の物質循環や農業の上で重要な役割を果たしているだけでなく,土壌細菌として単独で生活するという二つのライフサイクルを持っている。我が国で全ゲノム塩基配列が決定されたミヤコグサ根粒菌およびダイズ根粒菌を対象として,全ゲノム情報やゲノムプロジェクトで生み出されたクローンを利用した網羅的な発現解析や菌株ゲノム比較,整列化コスミッドライブラリーによる機能解析などの端緒的な研究成果を紹介した。特に,根粒菌の栄養飢餓条件下における耐性機構や根粒菌のゲノム進化について興味深い事実か明らかになりつつあり,それらの土壌微生物研究のモデルとしての可能性について議論を行った。
微生物学と地球科学のわかちがたい関係

遠藤一桂, 南澤究, 掛川武, 犬伏和之

岩波科学　74　166-169　2004年
Repetitive determination of copper(II) and regeneration of a chromogenic reagent using a cation-exchange column in a circulatory flow-injection system

M Zenki, K Minamisawa, T Yokoyama

BUNSEKI KAGAKU　52　(12)　1131-1136　2003年12月

DOI： 10.2116/bunsekikagaku.52.1131 　

ISSN： 0525-1931
22 ダイズ根粒菌の脱窒の多様性とN_2O呼吸による増殖特性(東北支部講演会)

鮫島玲子, 宮地良昭, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　253-253　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-4 GFPを用いたサトウキビ内生菌の感染経路の調査と内生窒素固定細菌の資化性について(8.共生)

豊里学, 清水友, Constancio A Asis Jr., 久綱泰代, 伊志嶺正人, 中西康博, 佐伯雄一, 長友由隆, 南澤究, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　56-56　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-5 植物体内の嫌気窒素固定コンソーシアムを構成するClostridium属細菌のT-RFLP法による群集構造解析(8.共生)

宮本拓也, 斉藤朝美, 河原誠, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　56-56　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-10 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの脱窒により発生する^<15>N標識窒素ガスのTCDガスクロマトグラフィーを用いた定量法(6.土壌生物)

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　39-39　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-9 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成と宿主植物との相互作用(8.共生)

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　57-57　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-10 Rhizobial determinants for nodulation and nitrogen fixation with bred soybean

Teamtisong Kamonluck, Teaumroong Neung, Okazaki Shin, Saeki Kazuhiko, Kaneko Takakazu, Tabata Satoshi, Minamisawa Kiwamu

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　58-58　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-17 共生・微好気・炭素飢餓条件におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析(8.共生)

大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宣司, 塩谷幸樹

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　60-60　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
学-3 共生窒素固定細菌の遺伝生態に関する研究(日本土壌肥料学会賞)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　224-224　2003年8月20日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのゲノム構造解析

金子貴一, 中村保一, 佐藤修正, 南沢究, 内海俊樹, 田畑哲之

日本農芸化学会大会講演要旨集　2003　2003年
28-C-09 嫌気窒素固定コンソーシアムの宿主親和性(共生・相互作用,一般講演)

斉藤朝美, 葉繽, 游牧, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　115-115　2003年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
28-C-10 根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成遺伝子rtxACの機能解析(共生・相互作用,一般講演)

菅原雅之, 岡崎伸, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　116-116　2003年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
27-C-21 炭素源飢餓条件下で発現誘導されるミヤコグサ根粒菌の遺伝子(生理・増殖,一般講演)

板倉学, 大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　79-79　2003年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
2J10-2 植物共生細菌由来ハロアルカン脱ハロゲン酵素の解析

佐藤優花里, 池田和香子, 永田裕二, 南澤究, 津田雅孝

日本生物工学会大会講演要旨集　15　201-201　2003年
出版者・発行元：日本生物工学会
Analysis of gene expression of mesorhizobium loti by genomic macro-array

T Ohwada, K Minamisawa, P Dawady, H Mitsui, M Itakura, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Ohmori, Y Murooka, M Hayashi, S Tajima, M Nomura, K Shimomura, M Abe, A Suzuki, Y Shimoda, T Uchiumi

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　44　S210-S210　2003年

ISSN： 0032-0781
共生窒素固定細菌の遺伝生態に関する研究

南澤究

日本土壌肥料学雑誌　74　(5)　589-592　2003年
出版者・発行元：日本土壌肥料學會
DOI： 10.20710/dojo.74.5_589 　

ISSN： 0029-0610
イネ科植物の窒素固定エンドファイト（ミニレビュー）

南澤究

日本農芸化学会誌　77　126-129　2003年

DOI： 10.1271/nogeikagaku1924.77.126 　
共生窒素固定研究の最新情報

三井久幸, 南澤究

農業技術　58　(5)　223-228　2003年
出版者・発行元：農業技術協会
ISSN： 0388-8479
B-06 炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的な遺伝子発現解析(生理・増殖2,口頭発表)

板倉学, 大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 鈴木章弘, 下田宜司, 内海俊樹

日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　74-74　2002年11月15日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
35 窒素固定エンドファイテッィクバクテリア Herbaspirillum sp.B501の内生細菌数にみられる野生イネおよび栽培イネ系統間差異

安部匡, 南沢究, 東谷篤志, 石井尊生, 佐藤雅志

日本作物學會紀事　71　(2)　70-71　2002年8月25日
出版者・発行元：日本作物学会
ISSN： 0011-1848
6-29 Bradyrhizobium属ダイズ根粒菌の系統による脱窒能の多様性(6.土壌生物)

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　34-34　2002年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-19 Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成系におけるrtxC遺伝子の機能解析(8.共生)

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　43-43　2002年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-15 ススキ等の植物体内における偏性嫌気性窒素固定細菌の単離と分子系統解析(8.共生)

宮本拓也, 西岡きよ, 游牧, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　41-41　2002年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-21 全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析(6.土壌生物)

大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　31-31　2002年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
B-31 ダイズ根粒菌リゾビトキシン生合成遺伝子の機能(共生・相互作用,口頭発表)

南澤究, 岡崎伸, 菅原雅之, 三井久幸

日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　99-99　2002年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
A-01 根粒菌の共生窒素固定能とシグマ因子RpoH(遺伝子解析・水圏生態系1,口頭発表)

三井久幸, 佐藤善克, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　19-19　2002年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
814 根粒菌Bradyrhizobium japonicum由来のハロアルカン脱ハロゲン酵素の解析(環境浄化・修復・保全技術,一般講演)

佐藤優花里, 永田裕二, 南澤究, 津田雅孝

日本生物工学会大会講演要旨集　14　146-146　2002年
出版者・発行元：日本生物工学会
Global analysis of gene expression of Mesorhizobium loti MAFF303099

T Uchiumi, T Ohwada, Y Orikasa, K Minamisawa, H Mitsui, M Itakura, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Omori, Y Murooka, M Hayashi, S Tajima, M Nomura, K Shimomura, M Abe, A Suzuki, Y Shimoda

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　43　S73-S73　2002年

ISSN： 0032-0781
B-6 根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子(遺伝子解析,B会場,口頭発表)

三井久幸, 伊藤尚文, 佐藤俊文, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　56-56　2001年11月9日
出版者・発行元：日本微生物生態学会
8-17 リゾビトキシンの根粒形成促進効果は根粒着生過程の途中から現れる(8.共生)

岡崎伸, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　56-56　2001年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-16 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン遺伝子及び生合成系の解明(8.共生)

安田剛, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　55-55　2001年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
I-4 イネ科植物の窒素固定エンドファイトのポテンシャル(I 共生窒素固定研究の展開と持続的食糧生産)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　240-240　2001年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-23 多コピーの挿入配列を保有するダイズ根粒菌HRS株の分子系統解析と嫌気条件暴露後の増殖特性(6.土壌生物)

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　42-42　2001年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
A-10 野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの分子系解析(共生・相互作用,A会場,口頭発表)

游牧, 宮本拓也, 西岡きよ, 宮木太郎, 遊橋健一, 佐藤雅志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　24-24　2001年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
C-31 野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着(共生・相互作用,C会場,ポスター発表)

南澤究, 葉繽, 西岡きよ, 佐藤雅志

日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　113-113　2001年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
ミャンマー, カンボジアで収集した野生イネからのエンドフィテック窒素固定細菌の検出

佐藤雅志, 西岡きよ, 東海林比呂子, 南澤究, 中村郁郎, 福田善通, 石井樽生, 佐藤洋一郎

育種学研究 = Breeding research　2　(1)　232-232　2000年4月

ISSN： 1344-7629
A lipochito-oligosaccharide, Nod factor, induces transient calcium influx in soybean suspension-cultured cells

T Yokoyama, N Kobayashi, H Kouchi, K Minamisawa, H Kaku, K Tsuchiya

PLANT JOURNAL　22　(1)　71-78　2000年4月

DOI： 10.1046/j.1365-313X.2000.00713.x 　

ISSN： 0960-7412
土壌微生物ゲノム研究の現状と将来

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　46　239-239　2000年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-25 野生イネ及び栽培イネ在来品種の地上部に内生する窒素固定細菌(8.共生)

鈴木永, 宮木太郎, Adel Elbeltagy, 西岡きよ, 東海林比呂子, 佐藤雅志, 佐藤洋一郎, 浜田徹, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　65-65　2000年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-28 挿入配列によるダイズ根粒菌のゲノム再編成と環境適応(6.土壌生物)

鮫島玲子, 伊沢剛, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　46-46　2000年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-15 マメ科植物のエチレン感受性と根粒形成(8.共生)

貫井憲之, 江面浩, 遊橋健一, 安田剛, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　60-60　2000年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-14 根粒菌Bradyrhizobium elkaniiの生産するリゾビトキシンの根粒形成における役割と生合成遺伝子の解明(8.共生)

安田剛, 遊橋健一, 貫井憲之, 江面浩, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　59-59　2000年3月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
C-132 ミヤコグサ根粒菌はVBNC(viable but nonculturable)状態になるか(共生・相互作用-1,ポスター発表)

板倉学, 葉繽, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　124-124　2000年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
C-133 野生イネ科植物から分離される窒素固定嫌気共生系(共生・相互作用-1,ポスター発表)

南澤究, 西岡きよ, 宮木太郎, 遊橋健一, 佐藤雅志

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　125-125　2000年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
A-07 根粒菌の共生窒素固定に関与するrpoH遺伝子の発現と機能(遺伝子解析など-2,口頭発表)

三井久幸, 佐藤俊文, 南沢究

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　23-23　2000年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
A-35 野生イネから分離されたHerbaspirillum属窒素固定細菌のコロナイズと窒素固定活性(共生・相互作用-2,口頭発表)

鈴木永, Elbeltagy Adel, 西岡きよ, 葉繽, 佐藤雅志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　51-51　2000年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
土壌細菌の遺伝生態研究の現状-ダイズ根粒菌の実例をまじえて-

南澤究

土と微生物　54　(2)　121-127　2000年
出版者・発行元：日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.54.2_121 　

ISSN： 0912-2184

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土壌細菌は地球レベルの物質循環や植物生育の上で大変重要な役割を果たしており,地球生態系の恒常性の維持に貢献している。本稿では,土着ダイズ根粒菌のDNAフィンガープリントを用いて,遺伝的多様性・風土性・ゲノムがシャッフルされたHRS株の遺伝生態研究について紹介を行った。土着ダイズ根粒菌も含めた土壌中の細菌の生活について細菌遺伝学やゲノム研究の最近の知見を踏まえて,(1)ゲノムの複製系と転写系の衝突,(2)オペロンの乱雑度と挿入配列,(3)非増殖条件による変異の誘発などについて考察を行った。今後,土壌微生物の分野でもゲノム研究,遺伝学分野,環境科学分野と連携し,総合性をもった研究が必要ではないだろうか。
ゲノム科学と２1世紀の植物栄養学の展望

柴田大輔, 間藤徹, 菊池尚志, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　71　(5)　751-754　2000年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.71.5_751 　

ISSN： 0029-0610
6-29 ダイズ根粒菌HRS株と通常株の共生領域の比較(6.土壌生物)

伊沢剛, 鮫島玲子, 板倉学, 三井久幸, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(45)　61-61　1999年7月25日
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
Rhizobitoxine inhibition of ACC synthase and biosynthetic pathway of rhizobitoxine

YASUTA Tsuyoshi, SATOH Shigeru, YUHASHI Ken-ichi, EZURA Hiroshi, ICHIKAWA Norikazu, NUKUI Noriyuki, MINAMISAWA Kiwamu

Plant and cell physiology　40　s134-s134　1999年3月

ISSN： 0032-0781
Rhizobitoxine produced by Bradyrhizobium elkanii regulates nodule-formation inhibitory mechanisum on Macroptilium atropurpureum

ICHIKAWA Norikazu, YUHASHI Ken-Ichi, EZURA Hiroshi, YASUTA Tsuyoshi, NUKUI Noriyuki, MINAMISAWA Kiwamu

Plant and cell physiology　40　s134-s134　1999年3月

ISSN： 0032-0781
DNA REARRANGEMENTS IN Bradyrhizobium japonicum FIELD ISOLATES AND HORIZONTAL GENE TRANSFER OF SYMBIOTIC GENES.

ISAWA Tsuyoshi, SAMESHIMA Reiko, ITAKURA Manabu, MITSUI Hisayuki, MINAMISAWA Kiwamu

Plant and cell physiology　40　s133-s133　1999年3月

ISSN： 0032-0781
Identification of trigonelline, a Nod gene-inducing signal compound, in rice (Oryza sativa L.) seed

Constancio A. Asis Jr., Masatsugu Kubota, Kiwamu Minamisawa, Shoichiro Akao

Plant Production Science　2　(1)　10-11　1999年
出版者・発行元： Crop Science Society of Japan
DOI： 10.1626/pps.2.10 　

ISSN： 1343-943X
根粒形成遺伝子(nod gene)の発現を誘導するシグナル物質のダイズ根粒形成変異体およびイネ品種間差異

ASIS Constancio A. Jr., 久保田正亜, 南澤究, 赤尾勝一郎

日本作物學會紀事　67　158-159　1998年4月2日
出版者・発行元：日本作物学会
ISSN： 0011-1848
20 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiにおけるインドール-3-酢酸の生合成に関与する遺伝子の単離と解析

松本卓, 山根久和, 野尻秀昭, 南澤究, 大森俊雄

植物化学調節学会研究発表記録集　(32)　45-45　1997年11月28日
出版者・発行元：植物化学調節学会
ISSN： 0919-1887
根粒菌の生産するリポキチンオリゴサッカライドの波紋

南沢究, 遊橋健一

化学と生物　34　(5)　345-348　1996年5月25日
出版者・発行元：学会出版センタ-
ISSN： 0453-073X
71 2,4-D誘導根粒の形成過程と根粒菌の感染様式

赤尾勝一郎, 皆川康雄, 南沢究

日本作物學會紀事　64　(1)　142-143　1995年4月3日
出版者・発行元：日本作物学会
ISSN： 0011-1848

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合成ホルモン2,4-Dの添加は根粒非着生ダイズT 201に窒素固定根粒を誘導する. この根粒誘導過程を調べるとともに, レポーター遺伝子導入菌株を用い, 菌の感染経路を推定した.
日本化学工業株式会社小松川工場跡地周辺の土壌等のクロム汚染

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究, 土橋幸司

人間と環境　21　(1)　15--18　1995年
窒素固定の遺伝生態

南沢究

IGEシリーズ　19　65-65　1994年
出版者・発行元：東北大学遺伝生態研究センター
カドミウム等重金属汚染水田土壌のヒ素含有率,-市川流域-

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究, 富岡直樹

人間と環境　20　(3)　190-193　1994年
アンチモン製錬工場周辺の道路わき粉じんおよび土壌のアンチモン等重金属による汚染

久保田正亜, 浅見輝男, 松木正浩, 樫村亮, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　63　(6)　719-722　1992年
出版者・発行元：一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.63.6_719 　

ISSN： 0029-0610
室蘭市の道路わき粉じんと土壌の重金属分布

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究

人間と環境　18　1　1992年
安中市末復元水田土壌のカドミウム,アンチモン,ビスマスなど有害金属元素含有率

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究, 松木正浩

人間と環境　14　2-10　1988年
ダイズ根粒のセリノ-ル--Uptake hydrogenase系の誘導を抑えるリゾビトキシンの前駆体か?(今日の話題)

南沢究

化学と生物　25　(9)　p563-565　1987年9月
出版者・発行元：学会出版センタ-
ISSN： 0453-073X
RAPID TURNOVER OF ASPARTIC-ACID IN SOYBEAN NODULES FORMED WITH H-2-UPTAKE POSITIVE RHIZOBIUM-JAPONICUM STRAINS

K MINAMISAWA, Y ARIMA, K KUMAZAWA

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　27　(3)　387-391　1981年

ISSN： 0038-0768

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書籍等出版物 18

東北大学教養教育院叢書大学と教養 7 環境と人間

南澤究

東北大学出版会　2024年2月

ISBN: 9784861633959
最先端の研究者に聞く日本一わかりやすい2050の未来技術

中村尚樹

プレジデント社　2023年3月16日

ISBN: 4833424886
カーボンニュートラル2050アウトルック

山地, 憲治, 西村, 陽

日本電気協会新聞部　2022年3月

ISBN: 9784905217992
エッセンシャル土壌微生物学 : 作物生産のための基礎

南沢, 究, 妹尾, 啓史, 青山, 正和, 齋藤, 明広, 齋藤, 雅典

講談社　2021年4月

ISBN: 9784065223987
肥料科学第38号

南澤究

肥料科学研究所　2017年2月20日
メタゲノム解析実験プロトコール

池田成志, 大久保卓, 鶴丸博人, 南澤究

羊土社　2016年12月
共生微生物生物と密接に関わるミクロな生命体

南澤究

化学同人　2016年10月30日

ISBN: 9784759817287
難培養微生物研究の最新技術Ⅲ―微生物の生き様に迫り課題解決へ―

按田瑞恵, 南澤究

シーエムシー出版　2015年8月7日

ISBN: 9784781310817
シリーズ21世紀の農学ここまで進んだ！飛躍する農学

南澤究

養賢堂　2015年4月

ISBN: 9784842505343
環境と微生物の事典

日本微生物生態学会

朝倉書店　2014年7月

ISBN: 9784254171587
植物共生微生物の群集構造解析メタゲノム解析技術の最前線

池田成志, 南澤究

シーエムシー出版　2010年
微生物の世界（宮道慎二他監修）

南澤究, 葉鬢, 貫井憲之

筑波出版会（筑波）　2006年
難培養微生物研究の最新技術ー未利用微生物資源へのアプローチー（工藤俊章／大熊盛他監修）

南澤究

シーエムシー出版（東京）　2004年8月
In Biotechnology in Agriculture and Forestry Vol. 52 (Eds. T. Nagata and S Tabata)

Kaneko, T, K. Saeki, K. Minamisawa

Springer-Verlag, Heidelberg　2003年
くらしの中の化学と生物８「人に役立つ微生物の話」 (日本農芸化学会編)

南澤究

学会出版センター（東京）　2002年
微生物の資材化：研究の最前線（鈴井孝仁・他編）

南澤究, 遊橋健一

ソフトサイエンス社　2002年
ビジュアル科学講座、地球の生命６、食う食われる生物たち

南澤究

三友社出版　2000年
Soil biochemistry (vol. 10). In: Bollag J-M, Stotzky G (eds)

Minamisawa K, Mitsui H

Marcel Dekker Inc.,（ N.Y.）　2000年

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講演・口頭発表等 515

⽇本⼟壌の微⽣物分布データベース「TUKUYOMI」の開発

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2024年度大会　2024年6月15日
土壌に接種した根粒菌の長期生存が土壌マイクロバイオームに及ぼす影響の評価

加藤広海, 板倉学, 番場大, 和穎朗太, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2024年度大会　2024年6月15日
「植物と微生物の生きるちから」～巧みな仕組みから地球環境まで～招待有り

南澤究

第18回公開シンポジウム西高フォーラム　2024年6月1日
微生物による温室効果ガスの削減と市民科学招待有り

南澤究

第10回日本微生物学連盟フォーラム「微生物は地球の救世主になれるか？」　2024年2月10日
The denitrification pathway of Bradyrhizobium ottawaense and its potential application in N2O mitigation

鈴木淳夫, 板倉学, 原沙和, 下田宜司, 南澤究

2024年1月9日
Cool earth via nitrogen-fixing bacteria: Methanotrophs and Bradyrhizobium 招待有り

南澤究

2024年1月8日
自然界の窒素循環と微生物によるN₂O排出抑制招待有り

南澤究

新化学技術推進協会（JACI）先端化学・材料技術部会高選択性反応分科会講演会　2023年12月20日
シチズンサイエンスによるN₂O消去土壌微生物の探索

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 菊地美穂, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会シンポジウム – 微生物に着目した温室効果ガスN₂O削減研究の最前線 –　2023年11月30日
植物共生細菌の多様性と物質循環機能招待有り

南澤究

日本微生物生態学会第36回大会第1回日本微生物生態学会学会賞受賞講演　2023年11月30日
主要な農地土壌に接種した根粒菌の生残性と土着菌叢への影響

加藤広海, 青木裕一, 板倉学, 番場大, 和穎朗太, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023年11月29日
日本の土着ダイズ根粒菌叢とnosZ保有新規ダイズ根粒菌の探索

板倉学, 柿崎芳里, 酒井朋子, Fernandes Siqueira Arthur, 原沙和, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023年11月29日
Mitigation of nitrous oxide (N₂O) emissions by soybean Bradyrhizobium

日本微生物生態学会第36回大会　2023年11月28日
黒ボク土壌から分離したN₂O消去微生物

大久保智司, 板倉学, Arthur Fernandes Siqueira, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023年11月28日
市民科学由来データを用いた日本土壌の微生物生態の把握

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023年11月28日
ムーンショット型研究と市民科学

南澤究

日本科学振興協会（JAAS）年次大会2023
市民科学によるN₂Oを消去する土壌微生物と根粒菌の探索

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

植物微生物研究会第32回研究交流会
日本のBradyrhizobium属ダイズ根粒菌叢とnosZ保有根粒菌の探索

板倉学, 柿崎芳里, 酒井朋子, Fernandes Siqueira Arthur, 原沙和, 南澤究

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
市民科学よるN2O消去能をもつ土壌微生物の探索2

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
市民科学で得られた「日本土壌の環境・微生物データ」の可視化・利活用の基盤整備

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
Soil-in-a-Bottle: Citizen science-based construction of the comprehensive soil map for microbiome and greenhouse gases in Japan

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

ISMB/ECCB2023　2023年7月19日
土壌環境の細菌叢は移植できるのか？

加藤広海, 南澤究, 永田裕二

日本土壌微生物学会2023年度大会
市民科学由来土壌微生物ビッグデータの評価と利活用基盤の整備

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2023年度大会
市民科学で明らかになった土壌の一酸化二窒素 (N₂O) 動態と微生物叢

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2023年度大会
微生物による地球冷却：農地由来の温室効果ガスの排出削減招待有り

南澤究

第96回日本細菌学会総会　2023年3月18日
はじめに招待有り

南澤究

第64回日本植物生理学会年会シンポジウム：植物×土壌×微生物の人工デザインで地球温暖化を止める　2023年3月15日
土壌微生物で温室効果ガスを削減する「クールアース」とは？招待有り

南澤究

宮田満のバイオ・アメイジング～緊急対談：バイオのあの話題はこれからどうなる？！　2023年3月10日
微生物による農地由来温室効果ガスN₂Oの排出削減招待有り

南澤究

日本セラミックス協会2023年年会窒素循環社会研究会　2023年3月8日
土壌由来の温室効果ガス削減をめざす市民科学プロジェクト：地球冷却微生物を探せ

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本生態学会第70回全国大会　2023年3月
資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減招待有り

南澤究

令和４年度農業・工業材料生産と光技術研究会「農業の脱炭素化を目指した土壌機能の解明と光技術の応用」　2022年10月4日
大規模ゲノム比較による根粒菌の共生形質関連因子の同定と生物地理学

板倉学, 柿崎芳里, 渡辺剛, 増田幸子, 柴田ありさ, 白須賢, 金子貴一, 南澤究

日本微生物生態学会第35回大会　2022年10月
A novel description for N₂O reduction potential from Bradyrhizobium liaoningense

Arthur Fernandes Siqueira, Manabu Itakura, Sachiko Masuda, Atsushi Matsumura, Arisa Shibata, Ken Shirasu, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第35回大会　2022年10月
市民科学が切り拓く土の微生物生態学

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第35回大会　2022年10月
資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減招待有り

南澤究

第60回生物物理学会年会　2022年9月30日
安定同位体を用いた農地由来の温室効果ガス削減の研究招待有り

南澤究

SI自然科学利用研究会　2022年9月13日
土壌のN2O発生削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司、青木裕一、戸田聡一郎、加藤広海、菊地美穂、佐藤修正、南澤究

日本土壌肥料学会2022年度東京大会　2022年9月
水稲根における窒素固定メタン酸化細菌細胞の13C/15N同位体顕微鏡観察

南澤究,原新太郎,和田直久,Sliver Sung-Yun Hsiao,Meng Zhang,Zhihua Bao,Yoshiyuki Iizuka,Der-Chuen Lee,佐藤修正,Tang Sen-Lin

日本土壌肥料学会2022年度東京大会　2022年9月
Bradyrhizobium ottawaense株における温室効果ガスN2Oの還元能

原沙和, Arthur Fernandes Siqueira, 菅原雅之, 板倉学, 三井久幸, Cristina, Sanchez Gomes, 佐藤修正, 下田宜司, 今泉(安楽)温子, 南澤究

日本土壌肥料学会2022年度東京大会　2022年9月
分子生物学的知見を駆使した地球温暖化防止研究の紹介招待有り

南澤究

龍谷大学分子生物学・植物分子生物学セミナー　2022年7月22日
農業からの温室効果ガス排出削減招待有り

南澤究

日本畜産技術士会　2022年6月11日
ダイズ根粒菌ゲノムの比較による共生窒素固定能を上昇させる領域の特定

板倉学,柿崎芳里,増田幸子,柴田ありさ,白須賢,金子貴一,南澤究

日本土壌微生物学会2022年度大会　2022年6月
温室効果ガスの削減に向けた市民参加型研究ー地球冷却微生物を探せー

青木裕一, 大久保智司, 戸田総一郎, 南澤究

日本科学振興協会第1回総会・キックオフミーティング　2022年6月
農地土壌に接種した根粒菌の生残性ならびに土着菌叢への影響評価

加藤広海,青木裕一,板倉学,三岡周子,番場大,和穎朗太,佐藤修正,南澤究

日本土壌微生物学会2022年度大会　2022年6月
植物共生微生物による窒素循環招待有り

南澤究

2021年度新資源生物変換研究会・植物バイオ研究会シンポジウム「微生物と植物が駆動する新しい物質循環像とバイオ分野への展開」（日本農芸化学会2022年度大会【BBB連携シンポジウム】　2022年3月16日
食料と環境を支える植物共生微生物：根粒菌とメタン酸化窒素固定菌招待有り

南澤究

理研バイオリソース研究センター設立20周年記念シンポジウム「バイオリソースが駆動する生命科学とイノベーション」　2021年10月20日
Visualization of N2-fixing methanotrophic cells in paddy rice roots by stable isotopes

Shintaro Hara, Naohisa Wada, Sliver Sung-Yun Hsiao, Meng Zhang, Zhihua Bao, Yoshiyuki Iizuka, Dear-Chuen Lee, Syusei Sato, Sen-Lin Tang, Kiwamu Minamisawa

The 7th International Conference on Nitrification and Related Processes (ICoN7)　2021年7月18日
農学賞受賞特別講演_窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究招待有り

南澤究

日本土壌微生物学会2021年度大会　2021年6月18日
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究招待有り

南澤究

日本農学会第92回日本農学大会 2020年度受賞者講演　2021年4月6日
ムーンショット研究開発プロジェクト『資源循環の最適化による農地由の温室効果ガスの排出削減』の紹介招待有り

グリーンエネルギーファーム産学共創パートナーシップ(GEFP) 令和2年度第4回研究会　2021年3月30日
根粒菌とマメ科植物の攻防とゲノム進化招待有り

南澤究

第36回資源植物科学シンポジウム及び第12回植物ストレス科学研究シンポジウム　2021年3月5日
Mitigation of greenhouse gas emissions from agricultural lands by optimizing nitrogen and carbon cycles. 招待有り

Kiwamu Minamisawa

The First International Symposium on "Cool Earth via Microbes in Agriculture"　2021年3月1日
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究招待有り

南澤究

2020年度日本土壌肥料学会東北支部大会(宮城大会)　2020年12月4日
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究招待有り

南澤究

2020年植物微生物研究会オンラインシンポジウム　2020年9月12日
ダイズ根粒およびソルガム根の Bradyrhizobium 属細菌の rpoB 群集構造解析

原新太郎, 和才(原) 沙和, 徳永毅, 南澤究

日本土壌肥料学会2020年度岡山大会　2020年9月8日
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究招待有り

南澤究

日本土壌肥料学会2020年度岡山大会　2020年9月9日
Symbiotic interactions with bacteria and plants-their biogeochemical functions and evolutionary processes- 招待有り

Kiwamu Minamisawa

Symposium of Biodiversity Research Center, Academia Sinica　2019年11月7日
Symbiotic incompatibility bertween Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 110 and the tribe Desmodieae including Lespedeza cuneata via Type III secretion system (T3SS) 国際会議

Iori Imamura, Yuki Konno, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

21st International Congress on Nitrogen Fixation　2019年10月11日
Hidden adaptation mechanisms of symbiotic systems to the environments 国際会議招待有り

Kiwamu Minamisawa

21st International Congress on Nitrogen Fixation　2019年10月14日
Identification of the host specificity determinant of bradyrhizobia based on genomic comparison 国際会議

Masayuki Sugawara, Yuki Konno, Yoshiyuki Ohtsubo, Masaya Kajiwara, Tomoyuki Nemoto, Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

21st International Congress on Nitrogen Fixation　2019年10月12日
根粒菌の窒素固定遺伝子を含むゲノム欠失と土壌環境適応

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第33回大会　2019年9月12日
ソルガム由来 Bradyrhizobium属細菌株の窒素固定とタンパク質分泌系の多様性

原沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 森川峻志, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

日本微生物生態学会第33回大会　2019年9月12日
環境に優しいダイズ根粒菌資材

南澤究, 野田涼太, 菅原雅之, Cristina Sanchez, 柿崎芳里, 三口雅人

日本土壌肥料学会2019年度静岡大会　2019年9月4日
イネ科植物ソルガムから分離したBradyrhizobium属細菌のゲノム解析：窒素固定能とタンパク質分泌系の多様性

原沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 森川峻志, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

第13回細菌学若手コロッセウム　2019年8月18日
根粒菌共生アイランドの実験室進化： nif / T3SS遺伝子の大規模欠失

南澤究, 嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之

第13回細菌学若手コロッセウム　2019年8月18日
根粒菌の生活史をゲノムで読む：植物が土壌微生物を育む？招待有り

南澤究

微生物ウィーク2019　2019年7月23日
根粒菌共生アイランドの大規模欠失と土壌環境適応

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019年6月15日
窒素固定能を有する脱窒細菌によるN2O固定

鈴木里俊, 早川智恵, 増田曜子, 西澤智康, 菅原雅之, 南澤究, 磯部一夫, 妹尾啓史

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019年6月15日
ダイズ根粒菌とメドハギ根粒菌のゲノム比較と宿主特異性：Bradyrhizobium 属根粒菌の共進化

今野勇希, 菅原雅之, 大坪嘉行, 梶原聖也, 根本智行, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019年6月16日
ダイズ生育ステージによる細菌叢の変動：地上部Methylorubrum属細菌の一過的優占性

原新太郎, 松田雅敏, 南澤究

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019年6月16日
A survey of plant growth-promoting bacteria derived from lateral roots of sugar beet based on a community analysis 国際会議

Kazuyuki Okazaki, Hirohito Tsurumaru, Megumi Hashimoto, Hiroyuki Takahashi, Takuji Ohwada, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月16日
The RpoH-regulated gene sufT is involved in iron-sulfur protein metabolism and effective plant symbiosis in Sinorhizobium meliloti 国際会議

Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月15日
Investigation of genomic diversity and nitrogen fixation capability in indigenous Bradyrhizobium diazoefficiens strains 国際会議

Manabu Itakura, Kosuke Mitsuya, Takakazu Kaneko, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月16日
Experimental genome deletion via insertion sequences on bradyrhizobial symbiosis island by sacB system 国際会議

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月15日
Bradyrhizobium from sorghum roots suggests T3SS/T4SS/T6SS diversity and symbiosis island exchange in non-diazotrophic and rhizobial members of B.ottawaense 国際会議

Sawa Hara, Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Masayuki Sugawara, Junichi Yoneda, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月16日
Metagenome and proteome analyses revealed nitrogen fixation by Bradyrhizobium in roots of field-grown sorghum 国際会議

Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Sawa Wasai, Yasuhiro Kasahara, Taichi Koshiba, Kiyoshi Yamazaki, Toru Fujiwara, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月16日
Symbiotic incompatibility via effector-triggered immunity between soybean Rj2-genotype and bradyrhizobial NopP: Rj2 allele distribution in soybean resources 国際会議

Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Satoko Takahashi, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月15日
Experimental genome reduction of bradyrhizobia by plant immunity 国際会議

Haruka Odake, Haruka Arashida, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019年5月15日
Bradyrhizobium属根粒菌の共生アイランドにおけるIS介在型欠失

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019年3月7日
ソルガム由来Bradyrhizobiumの窒素固定とゲノム情報に基づく機能解析

原沙和, 原新太郎, 森川峻志, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019年3月7日
根粒菌の共生不和合性システムと環境に優しい根粒菌集団の育種招待有り

南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019年3月7日
ゲノム比較によるBradyrhizobium属根粒菌の宿主特異性決定機構の解明

今野勇希, 菅原雅之, 大坪嘉行, 根本智行, 三井久幸, 南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019年3月6日
Symbiotic incompatibility via effector-triggered immunity between soybean Rj2-genotype and bradyrhizobial NopP 国際会議招待有り

南澤究

International Plant & Animal Genome XXVII　2019年1月12日
環境調和型農業生物資材コンソーシアム

南澤究

アグリビジネス創出フェア2018　2018年11月20日
植物共生細菌の進化機構と育種戦略：根粒菌からマイクロバイオーム農業へ招待有り

南澤究

日本育種学会第134回講演会　2018年9月22日
根粒菌 NopPエフェクターによる共生不和合性を誘導する分子機構の解明

今村伊織, 菅原雅之, 今道仁, 松崎元紀, 金村進吾, 稲葉謙次, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
根粒菌の鉄硫黄タンパク質生合成関連遺伝子の機能解析

佐々木祥平, 南澤究, 三井久幸

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
Methylobacterium sp. AMS5株接種によるダイズ地上部の細菌叢シフト

原新太郎, 松田雅敏, 原沙和, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
ソルガム根における Bradyrhizobium 属細菌分離株の nif 遺伝子群と窒素固定能

原沙和, 森川峻志, 原新太郎, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
ソルガム根からの Bradyrhizobium 属窒素固定細菌の分離と特性解析

森川峻志, 原新太郎, 原沙和, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110 系統の土壌環境適応

野田涼太, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
土壌接種による Bradyrhizobium 属根粒菌共生アイランドの実験室進化

大竹遥, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
選択マーカー法による Bradyrhizobium 属根粒菌ゲノムの IS 介在型欠失の解明

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月20日
Rj2ダイズとBradyrhizobium属根粒菌における共生不和合性の決定機構

菅原雅之, 梅原洋佐, 高橋智子, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月19日
Denitrification is lower in Bradyrhizobium japonicum than in B. diazoefficiens due to impaired nitrate

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年9月19日
Experimental evolution of bradyrhizobial symbiosis island by symbiotic incompatibility 国際会議招待有り

南澤究

7th International Legume Conference (7ILC)　2018年8月30日
メドハギとダイズの根粒菌共生アイランドとゲノムコアの比較：宿主植物により共生アイランドは進化するか？

今野勇希, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会2018年度大会　2018年8月29日
オーミック解析に基づくソルガム根窒素固定細菌の特定

原新太郎, 松田雅敏, 新井沙和, 南澤究

日本土壌肥料学会2018年度大会　2018年8月29日
Rj2ダイズと根粒菌の共生不和合性決定機構

菅原雅之, 梅原洋佐, 高橋智子, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2018年度大会　2018年8月29日
メドハギとダイズの根粒菌ゲノム比較と共生アイランド進化

今野勇希, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018年8月20日
Denitrification is lower in Bradyrhizobium japonicum than in B. deazoefficiens due to impaired nitrate reductase activity

日本微生物学会第32回大会　2018年7月12日
植物マイクロバイオーム研究〜ホロビオームから鍵となる新規相互作用や微生物を見出せるか〜

南澤究

日本微生物学会第32回大会　2018年7月12日
植物組織からの細菌細胞濃縮法の改良:ダイズ組織別の細菌叢解析

原新太郎, 松田雅敏, 新井沙和, 南澤究

日本土壌微生物学会2018年度大会　2018年6月17日
根粒菌ニトロゲナーゼの水素発生による土壌細菌叢変化と根粒共生の低温適応

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌微生物学会2018年度大会　2018年6月17日
“Environmental dynamics of plant-associated bacteria: From rhizobia towards plant microbiomes” 国際会議招待有り

南澤究

RIKEN International Symposium “Frontiers in Integrated Symbiology”　2018年6月4日
Bradyrhizobium 属根粒菌共生アイランドの実験室進化

大竹遥, 菅原雅之, 高橋智子, 南澤究

第12回日本ゲノム微生物学会年会　2018年3月6日
環境オミックス解析によるソルガム根の窒素固定 Bradyrhizobium 属細菌の同定

原新太郎, 森川峻志, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

第12回日本ゲノム微生物学会年会　2018年3月6日
Plant-associated bacteria mitigate greenhouse gas emission 国際会議

Kiwamu Minamisawa

2nd Global Soil Biodiversity Conference (GSBC2)　2017年10月15日
農耕地からのN2Oガス発生を削減し作物生産性を向上する微生物資材の開発コンソーシアム

南澤究

アグリビジネス創出フェア　2017年10月3日
Redundant roles of Bradyrhizobium oligotrophicum Cu-type and cd1-type nitrite reductase genes under denitrifying conditions 国際会議

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

22nd EUROPEAN NITROGEN CYCLE MEETING (ENC2017)　2017年9月24日
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌のOmic解析による同定

南澤究, 原新太郎, 森川峻志, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
根粒菌エフェクター NopPの変異がRj2ダイズとの共生不和合性を決定する

菅原雅之, 高橋智子, 梅原洋佐, 今道仁, 今野勇希, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
共生不和合成誘導根粒菌T3SSエフェクターとダイズ病原抵抗性タンパク質の相互作用解析

今道仁, 菅原雅之, 岩野裕也, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌共生アイランドの実験室進化

大竹遥, 菅原雅之, 高橋智子, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
ハギ根粒菌とダイズ根粒菌の共生アイランドとゲノムコアの比較：宿主マメ科植物は根粒菌の共生アイランドを選択するか？

今野勇希, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
メタゲノム解析に基づくソルガム根の窒素固定細菌の分離

森川峻志, 原新太郎, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
ダイズ由来Methylobacterium属細菌のゲノムから推定されたウレイド分解および炭素代謝のポテンシャル

新井沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017年9月20日
Redundant roles of Bradyrhizobium oligotrophicum Cu-type and cd1-type nitrite reductase genes under denitrifying conditions 国際会議

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017年9月3日
Bradyrhizobium japonicum and B. diazoefficiens differ in anaerobic nitrate reduction 国際会議

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017年9月3日
Metagenomic identification of nitrogen-fixing bacteria associated with roots of field-grown sorghum 国際会議

Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Yasuhiro Kasahara, Taichi Koshiba, Kiyoshi Yamazaki, Toru Fujiwara, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017年9月3日
A rhizobial effector protein inducing the symbiotic incompatibility between Bradyrhizobium diazoefficiens and soybean plants 国際会議

Masayuki Sugawara, Satoko Takahashi, Yosuke Umehara, Hiroya Iwano, Hitoshi Kondo, Yuki Konno, Haruka Odake, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017年9月3日
温室効果ガスを削減する植物圏の微生物

南澤究

市民公開講座アジア環境微生物フォーラム　2017年9月1日
水稲根由来Methylosinus属細菌のメタン酸化依存的窒素固定

南澤究, 篠田亮, 包智華

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
根粒菌の鉄・硫黄クラスター生合成関連因子SufTが植物共生を含む複雑な生活スタイルに果たす役割

佐々木祥平, 南澤究, 三井久幸

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
ダイズとの共生不和合性を引き起こす根粒菌3型分泌エフェクターの機能解析

菅原雅之, 高橋智子, 梅原洋佐, 岩野裕也, 今道仁, 今野勇希, 大竹遥, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
連作ダイズ莢組織内のMethylobacterium属細菌の動態:組織内分布と分離株の系統・ウレイド代謝

原新太郎, Hafidah Siti Nur, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
Characterization of Bradyrhizobium oligotrophicum nirK and nirS genes under denitrifying

Cristina Sanchez Gomez, Kiwamu Minamisawa

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
Bradyrhizobium japonicum and B. diazoefficiens differ in anaerobic nitrate reduction

Arthur Fernandes Siqueira, Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
共生不和合性誘導根粒菌T3SSエフェクターとダイズ病原抵抗性タンパク質の相互作用解析

今道仁, 菅原雅之, 岩野裕也, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
ダイズ根粒菌3型分泌エフェクター遺伝子の多様性

高橋智子, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
根粒菌hupSL1変異によるダイズ根圏のH2代謝と細菌群集構造の変動

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 高橋智子, 三屋公佑, 菅原雅之, 板倉学, 金子貴一, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
接種実験系によるMethylobacterium属細菌のダイズ器官および組織内の局在性

岩崎還帰, Hafidah Nur Siti, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌ゲノムの実験室進化：共生アイランドの大規模欠失

大竹遥, 菅原雅之, 高橋智子, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
Bradyrhizobium属根粒菌のnop遺伝子の多様性と宿主防御応答

今野勇希, 高橋智子, 今道仁, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌の探索

森川峻志, 原新太郎, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
イネの根の生育を指標としたAzospirillum sp. strain B510接種に応答するQTLの検出

佐々木和浩, 増田幸子, 風間ゆり, 木皿千春, 竹田晶子, 半澤栄子, 南澤究, 佐藤雅志

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
ダイズ根粒菌USDA110系統のゲノム多様性と吸収型ヒドロゲナーゼゲノミックアイランド構造変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017年8月29日
ダイズとBradyrhizobium diazoefficiensとの共生不和合性を誘導する根粒菌3型分泌エフェクター

菅原雅之, 岩野裕也, 今道仁, 高橋智子, 佐藤修正, 梅原洋佐, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会2017年度大会　2017年3月17日
土着ダイズ根粒菌USDA110系統株におけるゲノム多様性とゲノミックアイランド構造の変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

第11回日本ゲノム微生物学会年会　2017年3月2日
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌接種株の追跡

金原一真, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

第11回日本ゲノム微生物学会年会　2017年3月2日
ダイズ根粒菌3型分泌エフェクター遺伝子の多様性

高橋智子, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

第11回日本ゲノム微生物学会年会　2017年3月2日
温室効果ガスを減らす植物共生細菌

日本生物工学会東日本支部賀詞交歓会　2017年1月27日
イネとダイズの共生微生物による窒素代謝

肥料科学研究所平成28年度第２回研究会　2016年11月15日
Frontiers of plant-associated bacteria 国際会議

4th Asian Conference Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation．(4th APMNF)　2016年10月16日
Differences in the denitrification pathway between Bradyrhizobium diazoefficiens and B. japonicum under strictly anaerobic conditions．国際会議

Arthur Fernandes Siqueira, Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

4th Asian Conference Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation．(4th APMNF)　2016年10月16日
Rhizobial effector protein inducing the symbiotic incompatibility between Bradyrhizobium diazoefficiens and soybean plants 国際会議

Masayuki Sugawara, Hiroya Iwano, Hitoshi Kondo, Satoko Takahashi, Shohei Kusakabe, Shusei Sato, Yosuke Umehara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

4th Asian Conference Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation．(4th APMNF)　2016年10月16日
ダイズとBradyrhizobium diazoefficiensとの共生不和合性を誘導する根粒菌エフェクター

菅原雅之, 岩野裕也, 今道仁, 高橋智子, 日下部翔平, 佐藤修正, 梅原洋佐, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
共生不和合性を誘導する根粒菌エフェクターのダイズによる認識と応答／Recognition and response of soybean plants to rhizobial effector proteins for symbiotic incompatibility

今道仁, 菅原雅之, 岩野裕也, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
連作によるダイズ地上部の細菌叢変化／Continuous cropping changed bacterial communities in soybean shoot

原新太郎, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種判定および土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別／Metagenome mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia in soil

金原一真, 板倉学, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, 王勇, 鶴丸博人, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
ダイズ根粒菌３型分泌エフェクター遺伝子の多様性／Diversity of type III effectors in soybean bradyrhizobia

高橋智子, 鈴木悠太, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
Enrichment of nasS mutant of Bradyrhizobium diazoefficiens with higher N2O reductase activity to recover naturally-rare nosZ++ strains

Arthur F. Siqueira, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
低窒素圃場イネ根由来Methylosinus属細菌のメタン酸化依存的窒素固定／Methane oxidation-dependent 15N2 fixation by Methylosinus sp. isolated from rice root in a low N paddy field

篠田亮, 包智華, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
ダイズ根粒菌Bradyhrozbium diazoefficiens USDA110型菌株における吸収型ヒドロゲナーゼの多様性／Diversity in uptake hydrogenase within group USDA110 of Bradyrhizobium diazoefficiens

渡辺剛, 板倉学, 三屋公佑, 原新太郎, 金原一真, 菅原雅之, 按田瑞恵, 篠田亮, 金子貴一, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
Functional characterization of Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Cu-type and cd1-type nitrite reductase genes

○Cristina Sanchez, Kiwamu Minamisawa

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016年9月7日
Plant-associated Aureimonas with the sole rRNA operon on a tiny plasmid 国際会議

16th International Symposium on Microbial Ecology　2016年8月21日
メタゲノム解析によるダイズ Methylobacterium 属細菌のメチルアミン・ウレイド代謝の発見

南智之, 按田瑞恵, 三井久幸, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会2016年度大会　2016年6月11日
Differences in the denitrification pathway between Bradyrhizobium diazoefficiens and Bradyrhizobium japonicum under strictly anaerobic conditions

Arthur F. Siqueira, Cristina Sánchez・Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

日本土壌微生物学会2016年度大会　2016年6月11日
日本のダイズリソースにおけるRj2遺伝型の分布

菅原雅之, 梅原洋佐, 柿崎芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

日本農芸化学会2016年度札幌大会　2016年3月27日
根粒菌Bradyrhizobium diazoefficiens の種内比較ゲノム解析

三屋公佑, 金原一真, 菅原雅之, 南澤究, 金子貴一, 板倉学

第10回日本ゲノム微生物学会年会　2016年3月4日
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種の判定と接種菌群の追跡

金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, 南澤究

第10回日本ゲノム微生物学会年会　2016年3月4日
植物共生細菌Methylobactrium 属内のメタゲノム解析

南智之, 按田瑞恵, 池田成志, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

第10回日本ゲノム微生物学会年会　2016年3月4日
植物共生微生物の役割と農業

南澤究

拠点共同研究ワークショップ「微小生態系の構成原理~Wet/Dry双方からのアプローチによる理解と制御の試み」　2016年2月15日
植物共生微生物の役割と農業

南澤究

2016年マルタ全国大会　2016年2月12日
ダイズと根粒菌の共生と窒素利用

南澤究

科学技術振興機構（JST）研究開発戦略センター（CRDS）グリーンバイオ分野ワークショップ「微生物、生物多様性、共生を理解する技術基盤の最前線と利用技術への展開」　2015年11月7日
食料生産•環境分野における微生物ゲノミクスの可能性と課題

南澤究

生命医薬情報学連合大会 2015 年大会（日本バイオインフォマティクス学会 2015 年年会）　2015年10月29日
Metagenome-mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia in agricultural soil

Kazuma Kanehara, Manabu Itakura, Hirohito Tsurumaru, Yuko Hoshino, Yong Wang, Hiroko Akiyama, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

生命医薬情報学連合大会 2015 年大会（日本バイオインフォマティクス学会 2015 年年会）　2015年10月29日
Rhizosphere is a textbook for microbial N cycle 国際会議

Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
Regulation of N2O reductase genes by the two-component system NasST in Bradyrhizobium diazoefficiens 国際会議

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
Metagenomic analysis of bacteria associated with soybean nodules in continuous cropping field

Hirohito Tsurumaru, Manabu Itakura, Noriyuki Asanome, Kaori Kakizaki, Kazuma Kanehara, Noriyuki Konishi, Shinji Ishikawa, Hiroki Aida, Takuji Ohyama, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
N2O emission from soybean rhizosphere and its mitigation by Bradyrhizobium diazoefficiens inoculation 国際会議

Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
Nitrogen fixation depends on the methane oxidation by Methylosinus sp. isolated from paddy rice roots.

Ryo Shinoda, Bao Zhihua, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
Differential efficiency of nitrate respiration between Bradyrhizbium diazoefficiens and Bradyrhizobium japonicum 国際会議

Arthur F. Siqueira, Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
Metagenome-mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia in agricultural soil

Kazuma Kanehara, Manabu Itakura, Hirohito Tsurumaru, Yuko Takada-Hoshino, Hiroko Akiyama, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
N2O reductase gene and activity in bradyrhizobia nodulating Aeschynomene indica

Tomohiro Kumei, Masayuki Sugawara, Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
水稲根メタン酸化細菌の窒素固定能のメタプロテオーム解析、組織局在性と分離まで国際会議

包智華, 篠田亮, 大久保卓, 久保田健吾, 笠原康裕, 池田成志, 浅川晋, 南澤究

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015年10月17日
N2O emission from soybean rhizosphere mediated by fungal denitrification 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Makoto Moriuchi, Keiichi Kuzunuki, Fumio Ikenishi, Reiko Sameshima, Akira Nakagiri, Sakae Toyoda, Chie Katsuyama, Naohiro Yoshida, Yuichi Suwa

20th European Nitrogen Cycle Meeting　2015年9月28日
Regulation of nitrous oxide reductase genes by the NasST system in Bradyrhizobium diazoefficiens 国際会議

Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Takashi Okubo, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Aina Gotoh, Masafumi Hidaka, Takafumi Uchida, Kiwamu Minamisawa

20th European Nitrogen Cycle Meeting　2015年9月28日
メタゲノム‐マッピング法による土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別

南澤究, 金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野(高田)裕子, 王勇, 秋山博子, 早津雅仁

第25回植物微生物研究交流会　2015年9月14日
日本のダイズリソースにおける Rj2 遺伝型の分布

菅原雅之, 梅原洋佐, 千葉(柿崎)芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

第25回植物微生物研究交流会　2015年9月14日
硝酸供給に応じたシロイヌナズナ根共生細菌群集の変化

小西範幸, 早川俊彦, 山谷知行, 南澤究

第25回植物微生物研究交流会　2015年9月14日
微生物生態からみた植物の栄養ー水稲根のメタン酸化窒素固定ー

第1回「植物の栄養研究会」　2015年9月4日
植物共生微生物の多様性と機能を探る —根粒菌とマメ科植物の共生窒素固定から植物生育促進微生物まで—

花王生物科学研究所講演会　2015年8月4日
地球環境に優しい持続的農業のブランド化

農業微生物研究シンポジウム「共生微生物の有用機能を活用した持続的農業の探求」　2015年7月9日
地球惑星科学と微生物生態学の接点.軽希土類元素と細菌C1代謝：Bradyrhizobium属細菌のメタノールデヒドロゲナーゼ

南澤究, 関謙二郎, 包智华, 菅原雅之, 篠田亮, 谷明生, 増田幸子, 三井亮司

日本地球惑星科学連合2015年大会　2015年5月24日
大量の挿入配列を保有するダイズ根粒菌のゲノム解析:根粒菌の生成と消滅を示唆する共生アイランド爆発

飯田隆之, 板倉学, 按田瑞恵, 菅原雅之, 伊沢剛, 大久保卓, 佐藤修正, 千葉, 柿崎, 芳里, 南澤究

日本土壌微生物学会2015年度大会　2015年5月22日
日本のダイズ根粒菌とダイズのRj2共生不和合性

菅原雅之, 鈴木悠太, 板倉学, 千葉(柿崎, 芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

日本土壌微生物学会2015年度大会　2015年5月22日
根粒菌共生アイラントのマトリョーシカ型進化

南澤究

第88回日本細菌学会総会　2015年3月26日
rRNA遺伝子オペロンが9-10 kbレプリコンのみに存在するゲノム構造をもつ細菌の系統分布

按田瑞恵, 大坪嘉行, 三井久幸, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

第９回日本ゲノム微生物学会年会　2015年3月6日
植物マイクロビオームメタゲノム配列のマッピングによるMethylobacterium属細菌集団の植物種依存性の解析

南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 金子貴一, 田畑哲之, 津田雅孝, 南澤究

第９回日本ゲノム微生物学会年会　2015年3月6日
日本ダイズコアコレクションにおける共生不和合性Rj2遺伝型の分布

菅原雅之, 南澤究

第８回ダイズ研究会　2015年3月6日
N2-fixing methanotroph as non-leguminous rhizobia in paddy rice roots. 14th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes 国際会議

Kiwamu Minasamiwa, Zhihua Bao, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Haruko Imaizumi-Anraku, Kengo Kubota, Yasuhiro Kasahara, Dongyan Liu, Susumu Asakawa

14th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes　2014年10月30日
Preference of endophytic bradyrhizobia in different rice cultivars and the symbiotic mechanism of cultivated rice endophytic bradyrhizobia 国際会議

Pouigdet Piromyou, Teerana Greetatorn, Kamonluck Teamtisong, Takashi Okubo, Ryo Shinoda, Achara Nuntakij, Panlada Tittabutr, nantakorn Boonkerd, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

14th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes　2014年10月30日
N2O emission from soybean rhizosphere and its mitigation based on N-cycle biology 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez, Makoto Moriuchi, Shoko Inaba, Manabu Itakura

3rd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2014年10月28日
テンサイ主根に共生細菌のメタゲノム解析

鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 橋本萌, 柿崎芳里, 半澤栄子, 高橋宙之, 浅野目謙之, 田中福代, 関山恭代, 池田成志, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014年10月21日
アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N2O発生の特定

森内真人, 葛貫桂一, 池西史生, 板倉学, 包智華, 豊田栄, 吉田尚弘, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014年10月21日
rRNA遺伝子オペロンが9.4 kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見

按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 三井久幸, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014年10月21日
共生不和合性を誘導するダイズ根粒菌のタイプIII型エフェクターの探索

岩野裕也, 鈴木悠太, 柿崎芳里, 菅原雅之, 佐藤修正, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014年10月21日
微生物ゲノム情報を圃場で活かす — 作物根圏からの温室効果ガス発生を制御するために —

南澤究

平成26年度日本農学会シンポジウム　2014年10月4日
水稲根メタン酸化細菌は非マメ科植物の根粒菌か？

南澤究, 包智華, 池田成志, 大久保卓, 今泉(安楽)温子, 常田岳志, 久保田健吾, 笠原康裕, 劉冬艶, 浅川晋

第24回植物微生物研究交流会　2014年9月19日
生窒素固定を促進するダイズ根粒菌III型分泌系エフェクター

鈴木悠太, Cristina Sánchez, 柿崎芳里, 菅原雅之, 佐藤修正, 金子貴一, 南澤究

第24回植物微生物研究交流会　2014年9月19日
水稲根における窒素固定メタン酸化細菌のメタプロテオーム同定と組織局在性

包智華, 大久保卓, 久保田健吾, 笠原康裕, 鶴丸博人, 按田瑞恵, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学会2014年度東京大会　2014年9月9日
窒素追肥と栽植方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 南澤究

日本土壌肥料学会2014年度東京大会　2014年9月9日
共生窒素固定を促進するダイズ根粒菌III型分泌系エフェクター

鈴木悠太, Cristina Sánchez, 柿崎芳里, 佐藤修正, 金子貴一, 南澤究

日本土壌肥料学会2014年度東京大会　2014年9月9日
安定同位体15N/13Cによる植物根圏窒素サイクルの解明

南澤究

第32回「重窒素圃場利用研究会」討論会　2014年9月9日
Genomic ecology of Methylobacterium species in legume plants 国際会議

Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Okubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa

The 6th Korea-Japan-Taiwan International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
No nitrogen fertilization changes rice root microbiome abundant in diazotrophic methanotrophs through a plant symbiosis gene 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda, Zhihua Bao, Takashi Okubo, Aya Watanabe, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Takeshi Tokida, Kengo Kubota, Yasuhiro Kasahara, Dongyan Liu, Takeshi Watanabe, Jun Murase, Susumu Asakawa, Mizue Anda, Hirohito Tsurumaru, Ryo Shinoda, Tadashi Sato

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
Metagenome analysis-assisted isolation of Bradyrhizobium species dominated in rice roots in a paddy field of low N environments 国際会議

Ryo Shinoda, Takashi Okubo, Shouhei Fukushima, Mizue Anda, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
N2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species 国際会議

Makoto Moriuchi, Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Reiko Sameshima, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
The nitrate-sensing NasST system regulates nitrous oxide reductase in Bradyrhizobium japonicum 国際会議

Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Takashi Okubo, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Aina Gotoh, Masafumi Hidaka, Takafumi Uchida, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
Effect of autoregulation of nodulation on plant colonization of Methylobacterium sp. AMS5 isolated from hypernodulated soybean 国際会議

Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Okubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
Genomic micro-variation of Bradyrhizobum diazoefficiens strains indigenous to various soils in Japan 国際会議

Kosuke Mitsuya, Manabu Itakura, Mizue Anda, Ryo Shinoda, Yuko Takada-Hoshino, Hiroko Akiyama, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014年8月24日
窒素追肥と栽培方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 南澤究

土壌肥料学会東北支部会平成２６年度仙台大会　2014年7月7日
連作したダイズの収量と根共生細菌の多様性

鶴丸博人, 板倉学, 大久保卓, 柿崎芳里, 浅野目謙之, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 池田成志, 南澤究

土壌肥料学会東北支部会平成２６年度仙台大会　2014年7月7日
Microbial Nitrogen Transformation in the Legume Rhizosphere 国際会議

Kiwamu Minamisawa

20th World Congress of Soil Science　2014年6月8日
植物根圏は温室効果ガス代謝のホットスポット

南澤究

日本地球惑星科学連合2014年大会　2014年4月28日
根粒菌シグマ因子RpoH1の制御を受ける機能未知遺伝子の鉄硫黄タンパク質生合成への関与

佐々木祥平, 門屋亨介, 笠原康裕, 南澤究, 三井久幸

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014年3月7日
ダイズ根粒菌高N2O還元活性株のゲノム解析による脱窒遺伝子の新規転写制御因子の発見

板倉学, Cristina Sánchez, 松本貴嗣, 吉川博文, 後藤愛那, 日高将文, 内田隆史, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014年3月7日
共生アイランド獲得は根粒菌ゲノムの品質低下の危険を招く

飯田隆之, 板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 大久保卓, 三井久幸, 柿崎芳里, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014年3月7日
根粒超着生ダイズから分離されたMethylobacterium sp. AMS5のゲノム解析

南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014年3月7日
低窒素環境のイネ根で優占する細菌のメタゲノム解析に基づいた分離：Bradyrhizobium属とBurkholderia属分離株の機能解析

篠田亮, 大久保卓, 按田瑞恵, 鶴丸博人, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014年3月7日
根圏に生息する微生物とその役割：窒素レベルは微生物相とその役割を変化させるのか？

南澤究, 板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文

第14回日本有機農業学会大会・総会　2013年12月7日
植物共生微生物の多様性と生態機能を探る：Bradyrhizobium属細菌の共生進化と温室効果ガスを操る根圏微生物

南澤究

第33回日本微生物系統分類研究会　2013年11月14日
温室効果ガス N2O 発生削減の根粒菌ゲノミックス:N2O 還元酵素遺伝子の新規制御系の発見

南澤究, 板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文

第29回日本微生物生態学会　2013年11月14日
光合成 Bradyrhizobium 属細菌のメタノール依存的な生育に及ぼす希土類元素の影響

関謙二郎, 包智華, 三井亮司, 谷明生, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

第29回日本微生物生態学会　2013年11月14日
N2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species

Moriuchi Makoto, Inaba Shoko, Ikenishi Fumio, Itakura Manabu, Kikuchi Masakazu, Eda Shima、Chiba Naohiko, Katsuyama Chie, Suwa Yuichi, Sameshima-Saito Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

第29回日本微生物生態学会　2013年11月14日
Rice methanotrophic diazotrophs as non-leguminous rhizobia 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Zhihua Bao, Kenji Seki, Dongyan Liu, Susumu Asakawa, Haruko Imaizumi-Anraku, Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Akio Tani, Sachiko Masuda, Ryoji Mitsui, Takashi Okubo

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Search for a key target of RpoH1, the sigma factor essential for an effective symbiosis, in Sinorhizobium meliloti 国際会議

Shohei Sasaki, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Reduction of nitrous oxide emission from soybean rhizosphere by Bradyrhizobium japonicum inoculation. 国際会議

Manabu Itakura, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Yoshitaka Uchida, Hiroko Akiyama, Yuko Takada Hoshino, Yumi Shimomura, Sho Morimoto, Kanako Tago, Yong Wang, Chihiro Hayakawa, Yusuke Uetake, Cristina Sánchez, Shima Eda, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Survey of nitrogen fixation by sugar beet-associated bacteria 国際会議

Hirohito Tsurumaru, Takashi Okubo, Kazuyuki Okazaki, Megumi Hashimoto, Noriyuki Asanome, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
A novel regulation system for transcription of nos and nap genes in Bradyrhizobium japonicum. 国際会議

Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Genome analysis suggests that the soil oligotrophic bacterium Agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of Aeschynomene indica. 国際会議

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Manabu Itakura, Kenshiro Oshima, Aphakorn Longtonglang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Suppression of the colonization of Aureimonas sp. residing on leaf bundle sheath of Lotus japonicus by autoregulation of nodulation 国際会議

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Genome analysis of Methylobacterium sp. AMS5 from hypernodulated soybean stems 国際会議

Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Okubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
Analysis of symbiotic phenotypes of an effector gene unique to Bradyrhizobium japonicum USDA122 国際会議

Yuta Suzuki, Cristina Sánchez, Kaori Kakizaki-Chiba, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Takahiro Tsukui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
N2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification of Fusarium species 国際会議

Makoto Moriuchi, Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Reiko Sameshima-Saito, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
The symbiotic mechanism of cultivated rice endophytic bradyrhizobia and their potential for field application 国際会議

Pongdet Piromyou, Rujirek Noisa-ngium, Kamonluck Teamthisong, Teerana Greetatorn, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013年10月14日
N2O paradox of legume rhizosphere and its mitigation

飯田隆之, 柿崎芳里, 板倉学, 南澤究

2013年度東京大学生物生産工学研究センターシンポジウム　2013年9月27日
ダイズ根粒菌におけるN2O還元酵素活性を制御している遺伝子の同定とN2O削減への利用

板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文, 南澤究

日本土壌肥料学会 2013年度名古屋大会　2013年9月11日
ダイズ根粒菌のゲノムバリエーション：マッピングによる挿入配列コピー数の推定

飯田隆之, 柿崎芳里, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会 2013年度名古屋大会　2013年9月11日
A novel regulation system for transcription of nos genes in Bradyrhizobium japonicum

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

植物微生物研究会第23回研究交流会　2013年9月7日
新規植物共生細菌 Aureimonas sp. AU20 のゲノム解析

按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 三井久幸, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

植物微生物研究会第23回研究交流会　2013年9月7日
根粒超着生ダイズから分離された Methylobacterium sp.AMS5 のゲノム解析とミヤコグサにおける着生パターン

南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

植物微生物研究会第23回研究交流会　2013年9月7日
N2O emission during nitrogen transformation in soybean rhizosphere 国際会議

Kiwamu Minamisawa

3rd International Conference on Nitrification(ICoN3) 第3回国際硝化会議　2013年9月2日
A novel regulation system for transcription of nos and nap genes in Bradyrhizobium japonicum 国際会議

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

3rd International Conference on Nitrification(ICoN3) 第3回国際硝化会議　2013年9月2日
Soybean symbiosis with Bradyrhizobium japonicum: Evolution and global warming. 国際会議

Kiwamu Minamisawa

The 22th North American Conference on Symbiotic Nitrogen Fixation 北米窒素固定会議　2013年7月14日
農業微生物のゲノム研究:温室効果ガス削減と作物共生微生物の活性化

南澤究

農業微生物研究シンポジウム「微生物機能を活用した自然共生型農業への探求」　2013年7月4日
作物根圏における窒素と微生物の相互作用

南澤究

日本土壌微生物学会2013年度大会　2013年6月19日
テンサイ共生微生物の多様性と窒素固定能の探索

鶴丸博人, 岡崎和之, 大久保卓, 橋本萌, 浅野目謙之, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会2013年度大会　2013年6月19日
「ダイズ根圏のN2O発生機構と根粒菌による削減」、シンポジウム「微生物で植物と動物を操る環境バイオテクノロジー」

南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2013年度大会　2013年5月30日
ダイズ根粒菌の N2O 還元酵素によるダイズ根圏からの N2O 発生削減

板倉学, 内田義崇, 秋山博子, 星野(高田)裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, 王勇, 早川千尋, 植竹佑輔, SANCHEZ Cristina, 江田志磨, 早津雅仁, 南澤究

日本農芸化学会2013年度大会　2013年3月24日
Regulation of N2O reduction in Bradyrhizobium japonicum mutants with increased N2O reductase activity

Cristina Sanchez Gomez, Manabu Itakura, Yusuke Uetake, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

日本農芸化学会2013年度大会　2013年3月24日
Nitrogen and plant－associated microbes 国際会議

Kiwamu Minamisawa

The 2nd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2012年10月28日
Soil oligotrophic bacterium, Agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is nitrogen-fixing symbiont of Aeschynomene indica as suggested by genome analysis 国際会議

Takashi Okubo, Shohei Fukusima, Manabu Itakura, Kenshiro Ohshima, Aphakorn Longtonlang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

The 2nd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2012年10月28日
Colonization of phyosynthetic Bradyshiobium and Burkholderia kururiensis in rice plant. 国際会議

Shohei Fukusima, Takashi Okubo, Ryo Shinoda, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

The 2nd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2012年10月28日
Regulation of N2O reduction in Bradyrhizobium japonicum mutants with increased N2O reductase activity 国際会議

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Yusuke Uetake, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

17th European Nitrogen Cycle Meeting　2012年9月26日
Aurantimonas 属細菌AU20 株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012年9月25日
光合成Bradyrhizobium とBurkholderia kururiensis のイネへの接種効果と組織局在性

福島翔平, 大久保卓, 篠田亮, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012年9月25日
ダイズ根粒菌Type III 分泌系によるRj2 ダイズ共生不和合性の誘導

津久井隆裕, 江田志磨, 金子貴一, 佐藤修正, 岡崎伸, 柿崎(千葉)芳里, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012年9月25日
根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoH1 レギュロン中の鍵となる遺伝子の探索

佐々木祥平, 南澤究, 三井久幸

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012年9月25日
Metagenome and microscopic analyses for plant-associated microbes towards sustainable agriculture

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Mizue Anda, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

第28回微生物生態学会　2012年9月19日
Effects of rice genotype on methane flux and root-associated methanotrophs in paddy rice

Zhihua Bao, Aya Watanabe, Takashi Okubo, Dongyan Liu, Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Susumu Asagawa, Tadashi Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

第28回微生物生態学会　2012年9月19日
ダイズ根圏のN2O発生機構：根粒菌と土壌生物による根粒窒素由来のN2O発生

南澤究, 稲葉尚子, 池西史生, 板倉学, 菊池真和, 江田志磨, 千葉直彦, 勝山千恵, 諏訪裕一, 星野(高田, 裕子, 早津雅仁, 三井久幸

日本土壌肥料学会2012年鳥取大会　2012年9月4日
N2O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の作出とモデル系によるN2O発生削減

板倉学, 植竹祐輔, Sanchez Cristina, 江田志磨, 田畑和文, 松本貴嗣, 吉川博文, 椎名陽子, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会2012年鳥取大会　2012年9月4日
N2O emission from soybean rhizosphere depends on denitrification by Bradyrhizobium japonicum and other soil microbes 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Yoko Shiina, Shim Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Hisayuki Mitsui

14th International Symposium on Microbial Ecology　2012年8月19日
Isolation and characterization of Aurantimonas species responded to legume nodulation genonotypes 国際会議

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

14th International Symposium on Microbial Ecology　2012年8月19日
What does community analysis of plant-associated microbes tell us? 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Mizue Anda, Kazuhiro Sasaki, Zhihua Bao, Tadashi Sato, Haruko Imaizumi-Anraku

XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions　2012年7月29日
N2O発生ダイズ根粒根圏から分離したFusariumの脱窒能

南澤究, 池西史生, 板倉学

日本土壌微生物学会2012年度大会　2012年6月23日
イネエンドファイトAzospirillum sp. B510のインドール酢酸生合成に関する研究

南智之, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2012年度大会　2012年6月23日
水稲のメタン発生に及ぼすイネ共生遺伝型の影響

包智華, 大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽)温子, 浅川晋, 劉冬艶, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌微生物学会2012年度大会　2012年6月23日
土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophica S58Tのゲノム解析

大久保卓, 大島健志朗, 三井久幸, 服部勉, 服部正平, 南澤究

第6回日本ゲノム微生物学会年会　2012年3月10日
「植物共生微生物の多様性と機能」根粒菌とエンドファイトによる物質循環と宿主相互作用

南澤究

（株）コンポン研究所植物技術講演会　2012年1月17日
植物共生微生物の多様性と機能-根粒菌とエンドファイトによる物質循環と宿主相互作用-

南澤究

鹿児島大学インテンシブ理数教育特別プログラム先端科学講演会　2012年1月10日
マメ科植物根圏のN2O発生機構と抑制技術シーズ

南澤究

農業環境技術研究所公開セミナー「微生物ゲノム情報の活用による温室効果ガス研究の新展開」　2011年12月6日
Mechanism of N2O emission from soybean nodule rhizosphere and its mitigation 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Shoko Inaba, Yoko Shiina

17th International Congress on Nitrogen Fixation　2011年11月27日
N2O emission from degraded soybean nodules by denitrification of Bradyrhizobim japonicum and other soil microorganisms 国際会議

Fumio Ikenishi, Shoko Inaba, Manabu Itakura, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

17th International Congress on Nitrogen Fixation　2011年11月27日
土着ダイズ根粒菌の亜酸化窒素還元酵素遺伝子（nosZ）の分布と亜酸化窒素還元能を利用したN2O削減

板倉学, 椎名陽子, Hyunseok Choi, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土壌微生物学会2011年度大会　2011年11月25日
シンポジウム植物共生微生物の多様性研究とその社会貢献

南澤究

第27回日本微生物生態学会大会　2011年10月8日
異なる土壌型におけるnosZ保有・非保有Bradyrhizobium japonicum の出現頻度と系統分布

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第27回日本微生物生態学会大会　2011年10月8日
OsCCaMKは水稲根と陸稲根の細菌群集構造を変化させる

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 武田直也, 馬場まり, 今泉(安楽)温子, 福田善通, 藤原信介, 大脇良成, 佐々木和浩, 佐藤雅志, 包智华

植物微生物研究会第21回研究交流会　2011年9月20日
農耕地生態系における微生物群集構造の変動法則の理解から作物生産への貢献を目指して

南澤究

日本学術会議と土壌肥料学会共同シンポジウム「作物生産に対する土壌微生物の貢献」　2011年8月8日
ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構と根粒菌を利用した低減化

板倉学, 稲葉尚子, 池西史生, 椎名陽子, Hyunseok Choi, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2011つくば大会　2011年8月8日
マメ科モデル植物ミヤコグサ根圏土壌を対象とした比較メタゲノム解析

海野佑介, 寺沢公宏, 山下明史, 南澤究, 信濃卓郎

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
アルファルファ根粒菌の根粒形成における多剤排出ポンプの役割

江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
イネ地上部最近群集のメタゲノム解析

大久保卓, 佐々木和浩, 金子貴一, 山下明史, 大島健志朗, 佐藤修正, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤雅志, 田畑哲之, 服部正平, 池田成志, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
水稲根窒素固定細菌群集構造に及ぼす窒素施肥の影響

北野愛奈, 池田成志, 佐々木和浩, 山下明史, 寺沢公宏, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集のメタゲノム解析

佐々木和浩, 大久保卓, 池田成志, 山下明史, 北野愛奈, 江田志磨, 三井久幸, 佐藤雅志, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
ミヤコグサ根粒菌の宿主植物への侵入に重要なcep遺伝子の機能解析

菅原智史, 川原田泰之, 松本貴嗣, 志波優, 吉川博文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
宿主遺伝子特異的な共生不和合性をもつダイズ根粒菌のゲノム解析

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 山下明史, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
メタゲノム配列から目的の遺伝子を効率よく探す方法

山下明史, 北野愛奈, 佐々木和浩, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011年3月14日
植物共生微生物コミュニティー：土壌－植物系における物質循環と宿主相互作用の再考

南澤究

公開シンポジウム持続農業と温暖化防止に貢献する植物・土壌科学　2010年12月4日
イネ根の窒素固定菌の群集構造解

北野愛奈, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010年11月24日
ミヤコグサ根粒菌の宿主植物への侵入に重要なcep遺伝子の機能解析

菅原智史, 川原田泰之, 松本貴嗣, 志波優, 吉川博文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010年11月24日
STMによって同定されたダイズ根粒菌遺伝子の根粒形成と競合能力に関わる機能の解析

古川啓介, 大久保卓, 江田志摩, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010年11月24日
「土壌－植物圏における窒素動態と微生物生態－異分野融合による新展開を目指して－」根粒根圏のN2O発生機構とその低減化

南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010年11月24日
根圏に生息する微生物とその役割

南澤究

有機農業研究者会議2010　2010年11月4日
Bacterial isolation from stems of hypernodulated soybean for Methylobacterium sp. and Aurantimonas sp. sensitive to nodulation phenotypes and field nitrogen levels 国際会議

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Takashi Okubo, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

1st Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation International Symposium on Microbial Ecology　2010年9月20日
Metagenomic survey for characteristics of plant-associated bacteria 国際会議

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Kenshiro Oshima, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Masashi Sato, Eda Shima, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Kiwamu Minamisawa

1st Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation International Symposium on Microbial Ecology　2010年9月20日
根粒着生変異と窒素施肥レベルに応答したダイズ葉の細菌群集構造変化

池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 佐々木和浩, 佐藤雅志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010年9月7日
ダイズ根粒菌のN2O還元能による根粒根圏モデル系からのN2O発生低減化

板倉学, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 植竹佑輔, 江田志磨, 松本貴嗣, 吉川博文, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010年9月7日
窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集の構造変化－低窒素区の根圏における窒素固定細菌とメタン酸化細菌の増加－

佐々木和浩, 大久保卓, 池田成志, 北野愛奈, 飯田隆之, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010年9月7日
異なる土壌型におけるダイズ根粒菌 nosZ 保有株の出現頻度出現頻度の高い沖積土と低い黒ボク土の主成分解析

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010年9月7日
岡田要之助先生とWinogradsky 彼らが現代の土壌微生物研究をみたら？

南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010年9月7日
Thiosulfate-dependent chemolithoautotrophic growth of Bradyrhizobium japonicum 国際会議

Sachiko Masuda, Shima Eda, Seishi Ikeda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

13th International Symposium on Microbial Ecology　2010年8月22日
Community shifts in soybean-associated microbes by host nodulation genotypes and nitrogen applications 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Shoko Inaba, Mizue Anda, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Seishi Ikeda

13th International Symposium on Microbial Ecology　2010年8月22日
根粒超着生ダイズからのMethylobacterium属及びAurantimonas属細菌の分離

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010年6月21日
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集：Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH（Fluorescence in situ hybridization）解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010年6月21日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumUSDA122株とUSDA110株のゲノム比較

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 山下明史, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010年6月21日
ダイズ根粒菌の変異dnaQプラスミドによる高N2O還元酵素活性変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 植竹祐輔, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010年6月21日
根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析

按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010年5月21日
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集：Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH（Fluorescence in situ hybridization）解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010年5月21日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumUSDA122株とUSDA110株のゲノム比較：USDA122株特異的遺伝子の探索

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010年5月21日
ダイズ老化根粒からの亜酸化窒素発生に関与する土壌生物

南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010年5月21日
イネ共生細菌の群集構造解析

池田成志, 佐々木和浩, 大久保卓, 北野愛奈, 大島健志朗, 服部正平, 佐藤雅志, 今泉(安楽)温子, 飯田隆之, 按田瑞恵, 江田志磨, 三井久幸

第４回ゲノム微生物学会　2010年3月7日
作物に共生する微生物群集について

総合技術会議科学技術連携施策群食料・生物生産研究連携群シンポジウム「生物機能を活用した食料生産・物質生産への新たな光」　2010年3月2日
Community Shifts in Legume-Associated Microbes by Host Symbiotic System and Nitrogen. 国際会議

Seishi Ikeda, Takashi Ohkubo, Takakazu Kaneko, Manabu Itakura, Mizue Anda, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui

The Evolution of Symbiotic Systems, 7th Okazaki Biology Conference　2010年1月14日
作物に共生する微生物群集の包括的な理解と農業利用

南澤究

平成２１年度北海道農業研究センター研究会「根圏域研究が農業現場において果たすべき役割」　2009年12月22日
ダイズ根粒菌からの温室効果ガス発生：土壌生物のランチタイム

南澤究

北海道農業研究センター根圏域研究セミナー　2009年12月21日
植物共生微生物と温室効果ガス：根圏土壌生物のランチタイム

南澤究

2009年度東京大学生物生産工学研究センターシンポジウム　2009年12月11日
食料生産と環境保全を目指した植物共生菌の多様性と機能の解明

南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009年11月21日
ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009年11月21日
超純水中におけるBradyrhizobium属細菌の生存と適応

菅原千晶, 増田幸子, 板倉学, 川原田泰之, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009年11月21日
低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 池田成志, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009年11月21日
Signature-tagged mutagenesisに基づくミヤコグサ根粒菌の共生および競合に関与する遺伝子の網羅的探索

包日吉金, 閙干朝魯, 下田宜司, 田畑哲之, 佐藤修正, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009年11月21日
植物共生微生物の多様性とその利用

南澤究

中高温微生物センター開所記念シンポジウム「地球温暖化に向けた新たな微生物学の展開を」　2009年11月19日
作物に共生する微生物群集の包括的な理解に向けて：根粒着生変異と窒素施肥によるダイズ共生微生物群変化国際会議

南澤究

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009年10月6日
Development of a Bacterial Cell Enrichment Method and its Application to the Microbial Community Analysis in Phytosphere toward to the Metagenomics of Microbial Symbionts in Plants 国際会議

Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn E. E. Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009年10月6日
Microbial Diversity in Rice Phytosphere Assessed by Clone Library Analysis of 16S rRNA and nifH Genes in Conjunction with a Bacterial Cell Enrichment Method 国際会議

Seishi Ikeda, Aina Kitano, Kenshiro Oshima, Kazuhiro Sasaki, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Masahira Hattori, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009年10月6日
Genomic Comparison of Bradyrhizobium Japonicum Strains with Different Symbiotic N2-fixing Capabilities: A QTL Approach for N2-fixing Efficiency in Rhizobia 国際会議

Manabu Itakura, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Keina Honma, Konosuke Fujita, Hiroyoshi Iwata, Yuichi Saeki, Yoshino Hara, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009年10月6日
Unever Distribution of nosZGenotype in Bradyrhizobium Japonicum Populations Indigenous to Field soils in Japan 国際会議

Manabu Itakura, Choi Hyunseok, Shoko Inaba, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009年10月6日
変異型dnaQプラスミドによる高N2O還元酵素活性を示すダイズ根粒菌変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009年9月14日
低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009年9月14日
非培養法による植物共生微生物の多様性解析非培養法によるダイズ共生微生物の群集構造に対する根粒共生系及び窒素施肥の影響評価

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009年9月14日
ダイズ老化根粒におけるN2O発生メカニズムの解明：根粒菌脱窒と硝化過程の関与

稲葉尚子, 菊池真和, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009年9月14日
ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志摩, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第19回研究交流会　2009年9月8日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較

津久井隆裕, 金子貴一, 板倉学, 山田学, 佐藤修正, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

植物微生物研究会第19回研究交流会　2009年9月8日
エンドファイトAzospirillum sp. B510 株接種がイネ幼苗の生育・形態・遺伝子発現に及ぼす影響

樅山歩美, 江田志磨, 安田美智子, 仲下英雄, 佐藤雅志, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第19回研究交流会　2009年9月8日
植物共生微生物の多様性と相互作用

第27回日本植物細胞分子生物学会　2009年7月30日
Diversity in soybean-associated microbes and its regulation by host plants with different nodulation phenotypes and nitrogen applications 国際会議

Kiwamu Minamisawa

The 16th International congress on nitrogen fixation　2009年6月14日
Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成と競合能に関わる遺伝子の探索

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2009年度大会　2009年6月12日
変異型dnaQプラスミドを用いたBradyrhizobium japonicum高N2O還元酵素活性変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本農芸化学会2009年度大会　2009年3月27日
根粒菌の環状グルカンに存在する酸性置換基が共生窒素固定に果たす役割

川原田泰之, 清田洋正, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会2009年度大会　2009年3月27日
植物共生細菌の宿主相互作用とゲノム進化

南澤究

日本農芸化学会2009年度大会　2009年3月27日
耕地土壌におけるキチナーゼの多様性および環境因子との関連性

寺原猛, 池田成志, 則武ちあき, 南澤究, 安藤勝彦, 常田聡, 原山重明

日本農芸化学会2009年度大会　2009年3月27日
植物生息微生物の群集構造に対する根粒共生系の影響

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 金子貴一, ynn Ester E. Rallos, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之

第３回日本ゲノム微生物学会　2009年3月5日
植物内生細菌Azospirillum sp. B510のゲノム構造解析

金子貴一, 南澤究, 佐藤修正, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之

第３回日本ゲノム微生物学会　2009年3月5日
植物生息微生物の群集構造に対する根粒共生系の影響

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 金子貴一, ynn Ester E. Rallos, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之

第３回日本ゲノム微生物学会　2009年3月5日
Bacterial cell enrichment represents higher diversity of culturable and unculturable communities associated with soybean stems 国際会議

Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn Esther E. Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

Plant and Animal Genome XVII Conference　2009年1月10日
老化ダイズ根粒からのN2O発生における根粒菌の寄与

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008年11月25日
細胞濃縮法を用いたダイズ茎関連細菌の群集構造解析

大久保卓, 池田成志, 金子貴一, Lynn Esther E. Rallos, 江田志磨, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008年11月25日
Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum: A functional genomic approach for geobiochemistry

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008年11月25日
ダイズ根粒菌変異型dnaQプラスミドを用いた高N2O還元酵素活性変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008年11月25日
異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

池田成志, Lynn Rallos, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008年11月25日
Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum: A functional genomic approach for geobiochemistry 国際会議

Sachiko Masuda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

7th International Symposium for Subsurface Microbiology　2008年11月16日
Geochemical aspects of soil bacteria deduced from their genome: thiosulfate oxidation and C1 metabolism of Bradyrhizobium japonicum 国際会議

Kiwamu Minamisawa

7th International Symposium for Subsurface Microbiology　2008年11月16日
菌体外多糖合成におけるアルファルファ根粒菌外膜蛋白質TolCの機能解析

森有季子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008年9月17日
Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成に関わる因子の探索

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008年9月17日
Signature-tagged Mutagenesisによるミヤコグサ根粒菌の競合的根粒形成能の解析

包日吉金閙干朝魯, 下田宜司, 三井久幸, 江田志磨, 田畑哲之, 佐藤修正, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008年9月17日
ミヤコグサに内生するバクテリアエンドファイトの解析

川原田泰之, 板倉学, 金子貴一, 江田志磨, 三井久幸, 田畑哲之, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008年9月17日
異なる根粒形成表現型ダイズにおける細菌エンドファイトの多様性解析

大久保卓, 池田成志, 佐藤修正, 金子貴一, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008年9月17日
Ethylene-mediated interactions between plants and bacteria: Rhizobitoxine production and ACC deaminase 国際会議

Minamisawa, K, M. Sugawara, S. Okazaki, N. Nukui, H. Ezura, S. Eda, H. Mitsui

8th European Nitorogen Fixation Conference　2008年8月30日
Genomic comparison of Bradyrhizobium japonicum strains with different symbiotic N2-fixing capabilities: A QTL approach for N2-fixing efficiency in rhizobia 国際会議

Itakura, M, K. Saeki, H. Omori, T. Yokoyama, T. Kaneko, S. Tabata, T. Ohwada, S. Tajima, T. Uchiumi, K. Honnma, K. Fujita, H. Iwata, Y. Saeki, Y. Hara, S. Ikeda, S. Eda, H. Mitsui, K. Minamisawa

8th European Nitrogen Fixation Conference　2008年8月30日
ダイズ根粒根圏からのN2O発生における根粒菌の寄与

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会東北支部会宮城大会　2008年7月2日
ゲノム情報に基づいた植物共生細菌の環境応答と物質循環機能の解明

南澤究

日本土壌微生物学会2008年度大会　2008年6月13日
Genomic ecology of plant-associated bacteria: rhizobia and endophytes 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Masayuki Sugawara, Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shima Eda, Hisayuki Mitsui

International Conference between Tohoku University and Lyon group in France　2007年12月12日
ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける環状グルカンの構造決定とその構造変化が及ぼす共生過程への影響

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会　2007年12月11日
ミヤコグサ細菌エンドファイトの分離

川原田泰之, 板倉学, 金子貴一, 江田志磨, 三井久幸, 田畑哲之, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007年9月19日
ミヤコグサ根粒菌におけるグルカン修飾基転移酵素遺伝子の同定と共生過程での役割

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007年9月19日
リゾビトキシン生産Agrobacterium tumefaciensを用いた植物の形質転換

原槙良太, 菅原雅之, 野中聡子, 江面浩, 江田志麿, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007年9月19日
STM(signature-tagged mutagenesis)法によるダイズ根粒菌の競合的根粒形成を決定してしている遺伝子の探索

大久保卓, 三井久幸, 江田志麿, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007年9月19日
根粒形成過程におけるアルファルファ根粒菌TolC蛋白質の役割

森有季子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007年9月19日
根粒菌 Mesorhizobium loti の環状グルカンの細胞含有量に影響を与える cep 遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染に必須の役割を有する

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
Community structures of endophytes in soybeans with different nodulation genotypes

Lynn Esther E. Rallos, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
Analysis of metabolic features of naturally-occurring aromatic compounds in Bradyrhizobium japonicum based on array and gene disruption

Nirinya Sudtachat, Naofumi Ito, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおけるN2O還元酵素高発現株の作成

植竹佑輔, 千葉芳里, 平山潤太, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
ダイズ根粒根圏のN2O発生に関わる微生物の解明

菊池真和, 田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
根粒菌Mesorhizobium lotiの環状グルカンの細胞内含有量に影響を与えるcep遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染において必須の役割を有する．

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
微生物生態学における環境ゲノミクス

南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007年9月15日
Ethylene-mediated interactions between plants and bacteria by rhizobitoxine and 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Masayuki Sugawara, Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shima Eda, Hisayuki Mitsui

International Conference Rhizosphere-2　2007年8月26日
野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

日本土壌肥料学会2007年度大会　2007年8月22日
植物共生細菌の微生物資源とゲノム解析

南澤究

日本微生物資源学会第14回大会　2007年6月25日
野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

日本土壌微生物学会2007年度大会　2007年6月7日
アルファルファ根粒菌の２つのRpoHが熱ショック反応に果たす役割

三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会　2007年3月24日
ミヤコグサ根粒菌の新規共生必須遺伝しsagは環状グルカンにおける酸性修飾基の付加に関与する

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会　2007年3月24日
農業におけるゲノム情報の利用

豊橋技術科学大学・農業環境技術研究所共催公開シンポジウム　2007年3月12日
野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志摩, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

第１回日本ゲノム微生物学会　2007年3月1日
ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiのペリプラズムグルカン合成に関与する遺伝子の同定と宿主植物との共生能における役割

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第１回日本ゲノム微生物学会　2007年3月1日
ダイズ根粒菌超反復配列保有株(HRS)株と通常株(non-HRS)株のゲノム構造比較

板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

第１回日本ゲノム微生物学会　2007年3月1日
根粒菌の共生システム

国際高等研フォーラム細胞内共生ー生物界における共生と支配ー　2006年12月9日
根粒菌とエンドファイトのゲノムからみた相互作用と生態機能

インターゲノミックス研究会　2006年11月1日
ダイズ根粒菌のsox相同遺伝子によるチオ硫酸酸化

増田幸子, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第22回大会　2006年10月27日
土壌抽出基質と硝酸呼吸条件下におけるダイズ根粒菌の増殖・生残遺伝子のSTMによる探索

上松瀬裕子, 板倉学, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第22回大会　2006年10月27日
ダイズ根粒菌超反復配列保有（HRS）株と通常（non-HRS）株のゲノム構造比較

板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第22回大会　2006年10月27日
ミヤコグサ根粒菌の新規共生必須遺伝子は、酸性サイクリックグルカンの合成に関与する

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006年9月20日
リゾビトキシン生産アグロバクテリウムの構築と遺伝子導入への影響

菅原雅之, 原槙良太, 野中聡子, 江面浩, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006年9月20日
芳香族化合物を基質としたダイズ根粒菌培養細胞の網羅的遺伝子発現解析芳香族化合物を基質としたダイズ根粒菌培養細胞の網羅的遺伝子発現解析

伊藤尚文, 板倉学, 江田志磨, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂之, 内海俊樹, 三井久幸, 政井英司, 津田雅孝, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006年9月20日
ダイズ根粒菌株の可変ゲノム領域と共生窒素固定能の相関解析

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢治, 田島茂之, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 江田志摩, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006年9月20日
Genomic autoecoloy of bradyrhizobia associated with plants and soil microbial community 国際会議

4th Okazaki Biology Conference: "Terra Microbiology 2"　2006年9月10日
ダイズ根粒菌のゲノムの構造比較と共生窒素固定能

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2006年度大会　2006年9月5日
ダイズ根粒根圏のN2O発生と生物群集構造解析

田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会2006年度大会　2006年9月5日
GENOMIC MICROEVOLUTION AND METABOLIC VERSATILITY OF BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM AND CLOSE RELATIVES IN BRADYRHIZOBIACEAE 国際会議

K MINAMISAWA, M ITAKURA, S EDA, K SAEKI, H OOMORI, T YOKOYAMA, T KANEKO, S TABATA, T OOWADA, S TAJIMA, T UCHIUMI, H MITSUI, R SAMESHIMA-SAITO

11th International Symposium on Microbial Ecology　2006年8月20日
A novel symbiotic gene is required for the synthesis of anionic cyclic beta-glucans in Mesorhizboum loti 国際会議

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本学術振興会欧米・大洋州諸国との共同研究・セミナー（持続的農業のための植物微生物共生ゲノムサイエンス）　2006年8月15日
嫌気窒素固定コンソーシアムの窒素固定に影響する因子の解析

齋藤朝美, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006年6月10日
ミヤコグサ根粒菌 Mesorhizobium loti における新規共生能欠損変異株の解析

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006年6月10日
Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる根粒形成、非根粒形成Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム比較

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006年6月10日
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの芳香族化合物分解系およびエネルギー獲得系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006年6月10日
根粒圏の微生物・微小動物

南澤究, 田邉謙二, 池田成志, 東谷篤志, 江田志磨

土壌微生物学会サテライトミーティング「植物根圏の微生物・微小動物の機能と相互作用」　2006年6月9日
ダイズ根粒菌マクロアレイによる芳香属化合物分解系の解析

伊藤尚文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土壌微生物学会サテライトミーティング「植物根圏の微生物・微小動物の機能と相互作用」　2006年6月9日
Genome Plasticity of Symbiotic and Non-symbiotic members of Bradyrhzobiaceae: Dynamics of Symbiosis Island. 国際会議

Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Oowada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Hisayuki Mitsui, Reiko Sameshima

International Symposium on the Comparative Biology of the Alphaproteobacteria　2006年4月26日
Genome Plasticity of Symbiotic and Non-symbiotic members of Bradyrhzobiaceae: Dynamics of Symbiosis Island 国際会議

Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Oowada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Hisayuki Mitsui, Reiko Sameshima

International Symposium on the Comparative Biology of the Alphaproteobacteria　2006年4月26日
ダイズ根粒菌のゲノム生態学

第二回「ダイズのバイオリソースとゲノミクスの進展」国立遺伝学研究所研究集会　2006年3月16日
ダイズ根粒菌のゲノム比較と環境中の機能ゲノミクス

南澤究, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 伊藤尚文, 増田幸子, 原圭乃, 江田志磨, 板倉学

第８回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンテイア」　2006年3月4日
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌の芳香族化合物分解系およびチオ硫酸酸化系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

第８回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンテイア」　2006年3月4日
ダイズ根粒における亜酸化窒素の吸収と発生

平山潤太, 田邊謙二, 千葉芳里, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会第21回大会　2005年10月30日
STM法の構築によるミヤコグサ根粒菌の炭素源飢餓応答に関連する遺伝子の探索

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第21回大会　2005年10月30日
Clostridium属エンドファイトの分布

齋藤朝美, 河原誠, 西口友広, 南澤究

日本微生物生態学会第21回大会　2005年10月30日
Bradyrhizobium japonicum DNA マクロアレイによる共生、非共生Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム可塑性

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005年9月10日
リゾビトキシン前駆物質としてのグルタミンの役割

菅原雅之, 三井久幸, 江面浩, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005年9月10日
ミヤコグサ根粒菌におけるリン酸トランスポーターの解析

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005年9月10日
Rj2遺伝型ダイズに対するBradyrhizobium japonicum USDA122の共生不和合性

津久井隆裕, 菅原雅之, 川原田泰之, 鈴木理, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005年9月10日
HerbaspirillumエンドファイトのnifH発現の光誘導性

西口友広, 游牧, 斉藤朝美, 伊沢剛, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005年9月10日
根粒菌のRNAポリメラーゼシグマ因子の発現調節

三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005年9月10日
ダイズ根粒菌のゲノム構造とチオ硫酸酸化系の解析

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会 2005年度島根大会　2005年9月6日
Bradyrhizobiaceae科細菌における共生アイランドとゲノムの可塑性

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

第7回日本進化学会大会　2005年8月26日
ダイズ根粒菌のN2Oパラドックス．

南澤究, 千葉芳里, 平山潤太, 鮫島玲子

日本土壌微生物学会 2005年度大会　2005年6月11日
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会 2005年度大会　2005年6月11日
根粒菌の環境ストレス耐性と共生能の両方に重要な転写因子RpoH1の機能解析

三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会 2005年度大会　2005年6月11日
ミヤコグサ根粒菌の共生窒素固定でのリン酸トランスポーター遺伝子pstSの役割

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会 2005年度大会　2005年3月28日
マメ科植物との共生成立における根粒菌シグマ因子RpoH1のレギュロンの機能

三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会 2005年度大会　2005年3月28日
Bradyrhizobium属細菌ゲノムにおける共生窒素固定と光合成

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

特定領域研究「総合ゲノム」主催第7回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2005年3月5日
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌 Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

特定領域研究「総合ゲノム」主催第7回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2005年3月5日
炭素源飢餓条件下で高発現するミヤコグサ根粒菌遺伝子破壊株の増殖特性

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
ダイズ根粒菌ゲノムにおける外来性因子trn element の構造解析

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
¹⁵N-N₂O投与よるダイズ根粒菌のN2O吸収・N2発生機構の解明

平山潤太, 千葉芳香, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索-リン酸トランスポーター遺伝子の解析

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
Clostridium属エンドファイトの植物体内における窒素固定のnifH転写産物による検出

齋藤朝美, 游牧, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
根粒菌のマメ科植物との共生成立に必須な転写因子の解析

三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
リゾビトキシン生合成遺伝子の機能解析と非生産菌への導入

菅原雅之, 岡崎伸, 野中聡子, 江面浩, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析

原圭乃, 板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較 -Bradyrhizobium属細菌のゲノム進化と多様性

板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
直接核酸抽出法によるClostridium属エンドファイトの分布と機能の解析

河原誠, 宮本拓也, 齋藤朝美, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
ダイズ根粒菌における脱窒遺伝子の分布とN2O還元活性

千葉芳香, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004年11月21日
Diazotrophic endophytes in Grasses: Herbaspirillum sp. and Anaerobic Nitrogen-fixing consortium. 国際会議

You M, Abe T, Ye B, Saito A, Kawahara M, Sato T

14th International congress on nitrogen fixation　2004年10月27日

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基調講演
Expression island and islet in rhizobial genome during symbiosis and microaerobic environment 国際会議

Uchiumi T, Oowada T, Itakura M, Mitsui H, Nukui N, Dawadi P, Kaneko T, Tabata S, Yokoyama T, Tejima K, Saeki K, Oomori H, Hayashi M, Maekawa T, Murooka Y, Tajima S, Shimomura K, Nomura M, Suzuki A, Shimoda Y, Sioya K, Abe M, Minamisawa K

14th International congress on nitrogen fixation　2004年10月27日
Rhizobitoxine biosynthesis in bradyrhizobium elkanii and transfer of rtx genes to non-producing rhizobia 国際会議

Sugawara M, Okazaki S, Nonaka S, Ezura H, Minamisawa K

14th International congress on nitrogen fixation　2004年10月27日
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較

日本土壌肥料学会　2004年9月14日
共生細菌におけるポストゲノム研究の展開：根粒菌のトランスクリプトミクス（シンポジウム）

日本土壌肥料学会　2004年9月14日

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招待講演
マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析

原圭乃, 板倉学, 三井久幸, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 内海俊樹, 大和田琢二, 金子貴一, 田畑哲之, 田島茂行, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較

南澤究, 板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
ミヤコグサ根粒菌ACC deaminaseの根粒形成における効果

貫井憲之, 南澤究, 青木俊夫, 綾部真一

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索—リン酸トランスポーター遺伝子の解析

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
リゾビトキシン生合成遺伝子の機能解析と非生産菌への導入

菅原雅之, 岡崎伸, 野中聡子, 江面浩, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
根粒菌の遺伝子発現制御と細胞内共生過程

三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
細菌エンドファイト定着イネの病虫害抵抗性

伊沢剛, 比留間直也, 今田隆弘, 金まどか, 河野晋治, 篠崎聡, 南澤究, 佐藤雅志

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004年9月6日
Dynamics of rhyzobial life in plant and soil. 国際会議

21世紀COEプログラム国際シンポジウム環境と共生する微生物　2004年9月2日

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招待講演
Expression islands clustered on symbiosis island of Mesorhizobium loti genome: Rhizobial transcriptome analysis under symbiosis, microaerobiosis and starvation 国際会議

Uchiumi T, Oowada T, Itakura M, Mitsui H, Nukui N, Dawadi P, Kaneko T, Tabata S, Yokoyama T, Minamisawa K

10th International Symposium on Microbial Ecology　2004年8月22日
Haloalkane dehalogenase activities in rhizobia and related species 国際会議

Ikeda Wakako, Sato Yukari, Kiwamu Minamisawa, Masataka Tsuda, Yuji Nagata

10th International Symposium on Microbial Ecology　2004年8月22日
Nitrous oxide reduction by Bradyrhizobium japonicum USDA110 in soybean nodule 国際会議

Sameshima-Saito R, Minamisawa K

16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003年9月1日
Rhizobia selected leguminous plant cells for their habitat during earth's history 国際会議

Mitsui H, Minamisawa K

16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003年9月1日
What are phenotypes of indigenous bacteria relevant to biogeochemical process? - Bradyrhizobium group, a promising target to integrate genomics into geomicrobiology as ubiquitous oligotrophs in the environments - 国際会議

16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003年9月1日
共生・微好気・炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司, 塩屋幸樹

日本土壌肥料学会　2003年8月20日
植物体内の嫌気窒素固定コンソーシアムを構成するClostridium属細菌のT-RFLP法による群集構造解析

宮本拓也, 斉藤朝美, 河原誠, 南澤究

日本土壌肥料学会　2003年8月20日
Rhizobial determinants for nodulation and nitrogen fixation with bred soybean

Teamtisong, k, Teaumroong, N, Okazaki, S, Saeki, K, Kaneko, T, Tabata, S, Minamisawa, K

日本土壌肥料学会　2003年8月20日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkanii のリゾビトキシン生合成と宿主植物との相互作用

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会　2003年8月20日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum の脱窒により発生する15N標識窒素ガスのTCDガスクロマトグラフィーを用いた定量法

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会　2003年8月20日
共生から見る微生物窒素循環を担う植物の共生細菌たち

日本学術会議シンポジウム「ゲノム・環境・共生から微生物を見る」　2003年1月7日

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招待講演
根粒菌の細胞内CtrAレベルの変化と共生能

伊藤尚文, 齋藤明広, 三井久幸, 南澤究

第25回日本分子生物学会　2002年12月11日
根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoHの機能

佐藤善克, 三井久幸, 南澤究

第25回日本分子生物学会　2002年12月11日
Diazotrophic microbial consortium in plant 国際会議

International Workshop Microbial Function in Revegetation Process of Degraded Terrestrial Environments; From Gene through to Ecosystem　2002年11月29日

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招待講演
Detection of nifH expression in Herbaspirillum sp. B501gfp1 by RT-PCR 国際会議

You, M, Isawa, T, Minamisawa, K

International Workshop Microbial Function in Revegetation Process of Degraded Terrestrial Environments; From Gene through to Ecosystem　2002年11月29日
土と植物をめぐる窒素固定微生物コミュニティ

第18回日本微生物生態学会　2002年11月15日

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招待講演
ダイズ根粒菌リゾビトキシン生合成遺伝子の機能

南澤究, 岡崎伸, 菅原雅之, 三井久幸

第18回日本微生物生態学会　2002年11月15日
根粒菌の共生窒素固定能とシグマ因子RpoH

三井久幸, 佐藤善克, 南澤究

第18回日本微生物生態学会　2002年11月15日
ダイズ根粒菌の脱窒の多様性とN2O呼吸による増殖特性

鮫島玲子, 宮地良昭, 南澤究

第18回日本微生物生態学会　2002年11月15日
炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的な遺伝子発現解析

板倉学, 大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 鈴木章弘, 下田宜司, 内海俊樹

第18回日本微生物生態学会　2002年11月15日
ススキへの定着性の高い嫌気窒素固定コンソーシアムの選抜

斉藤朝美, 葉繽, 宮本拓也, 游牧, 南澤究

第18回日本微生物生態学会　2002年11月15日
ミヤコグサ根粒菌の共生および飢餓条件下における網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, プラモッド・ダワデイ, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002年10月11日
根粒菌のシグマ因子RpoHの機能

三井久幸, 佐藤善克, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002年10月11日
異種エチレンレセプター導入ミヤコグサの根粒形成

貫井憲之, 江面浩, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002年10月11日
Bradyrhizobium elkanii のリゾビトキシン生合成遺伝子rtxAの機能と制御

菅原雅之, 岡崎伸, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002年10月11日
ダイズ根粒菌B. japonicumのType III分泌系の構造と機能

西澤博, 相沢慎一, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002年10月11日
ダイズ根粒菌の脱窒の多様性とN2O呼吸による増殖特性

鮫島玲子, 宮地良昭, 南澤究

日本土壌肥料学会東北支部大会　2002年9月2日
Significance of symbitic microorganisms in re-vegetation process in lahar area of Mt. Pinatsubo. Transaction 国際会議

Saito, M, Minamisawa, K, Barraquio, W

17th World Congress of Soil Science　2002年8月14日
Herbaspirillum属エンドファイトの定着と窒素固定

南澤究, 伊沢剛, 佐藤雅志

土壌微生物学会　2002年6月5日
嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着

葉繽, 西岡きよ, 佐藤雅志, 南澤究

土壌微生物学会　2002年6月5日
全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本土壌肥料学会　2002年4月2日
Bradyrhizobium 属ダイズ根粒菌の系統による脱窒能の多様性

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会　2002年4月2日
Bradyrhizobium elkanni のリゾビトキシン生合成系におけるrtxC 遺伝子の機能解析

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会　2002年4月2日
ススキ等の植物体内における偏性嫌気性窒素固定細菌の単離と分子系統解析

宮本拓也, 西岡きよ, 游牧, 南澤究

日本土壌肥料学会　2002年4月2日
自然界における生物共生の意義と研究動向

日本農芸化学会シンポジウム「共生生物のバイオフロンティア」　2002年3月24日

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招待講演
全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本農芸化学会　2002年3月24日
根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoH

三井久幸, 伊藤尚文, 南澤究

日本農芸化学会　2002年3月24日
共生・微好気・炭素飢餓条件におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

南澤究, 大和田琢二, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司, 塩屋幸樹

第5回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2002年3月12日
根粒菌のシグマ因子RpoHの解析

三井久幸, 伊藤尚文, 佐藤俊文, 南澤究

第24回日本分子生物学会　2001年12月9日
野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着

南澤究, 葉嬪, 西岡きよ, 佐藤雅志

第17回日本微生物生態学会　2001年11月9日
野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの分子系統解析

游牧, 宮本拓也, 西岡きよ, 宮木太郎, 遊橋健一, 佐藤雅志, 南澤究

第17回日本微生物生態学会　2001年11月9日
根粒菌のゲノム構造の比較

志田和人, 南澤究

かずさDNA研究所シンポジウム　2001年10月30日
ミヤコグサ根粒菌のゲノム比較と根粒形成遺伝子誘導物質の同定に向けて

南澤究, 志田和人, 板倉学, Suwat Saengkerdsub, 三井久幸南澤, 究, 志田和人, 板倉学, Suwat Saengkerdsub, 三井久幸

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001年10月11日
野生イネにおける窒素固定コンソーシアム

葉繽, 宮木太郎, 西岡きよ, 佐藤雅志, 南澤究

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001年10月11日
イネより単離された窒素固定菌のイネ組織内定着性と窒素固定

伊沢剛, Adel Elbeltagy, 西岡きよ, 佐藤雅志, 葉繽, 比留間直也, 今田隆弘, 野田宗弘, 栗原庸輔, 金まどか, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001年10月11日
根粒菌のシグマ因子RpoHの機能

三井久幸, 伊藤尚文, 佐藤俊文, 南澤究

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001年10月11日
異種エチレンレセプターを導入したミヤコグサの根粒形成

貫井憲之, 江面浩, 南澤究

日本植物学会第65会大会シンポジウム「ミヤコグサ根粒形成の分子機構」　2001年9月25日
Geographic and phylogenetic distribution of soybean bradyrhizobia harboring high copy numbers of RS-α, RS-βand IS 1631 国際会議

Reiko Samesima, Tsuyoshi Isawa, Michael. J. Sadowsky, Toru Hamada, Arawan Shutsrirung, Kiwamu Minamisawa

9th International Symposium on Microbial Ecology　2001年8月26日
Endophytic colonization and N2 fixation by diazotrophs isolated from wild gramineous plants 国際会議

NSF/JSPS Seminar, Symbiosis Between Plants and Microorganisms for Sustainable Agriculture and Bioremediation　2001年8月8日
Effect of rhizobitoxine production on nodulation competitiveness by Bradyrhizobium elkanii 国際会議

NSF/JSPS Seminar, Symbiosis Between Plants and Microorganisms for Sustainable Agriculture and Bioremediation　2001年8月8日
Rhizobitoxine biosynthetic genes in Bradyrhizobium elkanii 国際会議

Tsuyoshi Yasuta, Shin Okazaki, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

13th International Congress on Nitrogen Fixation　2001年7月2日
Endophytic colonization and in planta-nitrogen fixation by Herbaspirillum sp. isolated from wild rice 国際会議

Adel Elbeltagy, Kiyo Nishioka, Tadashi Sato, Hisa Suzuki, Bin Ye, Toru Hamada, Tsuyoshi Isawa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

13th International Congress on Nitrogen Fixation　2001年7月2日
The delay effect of rhizobitoxine production on nodulation competitiveness of Bradyrhizobium elkanii USDA94 in siratro 国際会議

Shin Okazaki, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

13th International Congress on Nitrogen Fixation　2001年7月2日
フィリピン・ピナツボ火山泥流地帯の植生回復過程における共生微生物の役割

斎藤雅典, 大場広輔, 米山忠克, 宮木太郎, 南澤究, W. L. Barraquio

日本土壌微生物学会　2001年5月24日
イネ科植物の窒素固定エンドファイトのポテンシャル

日本土壌肥料学会シンポジウム「共生窒素固定研究の展開と持続的食料生産」　2001年4月2日

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招待講演
多コピーの挿入配列を保有するダイズ根粒菌HRS株の分子系統解析と嫌気条件暴露後の増殖特性

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会　2001年4月2日
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkanni のリゾビトキシン遺伝子及び生合成系の解明

安田剛, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会　2001年4月2日
リゾビトキシンの根粒形成促進効果は根粒着生過程の途中から現れる

岡崎伸, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会　2001年4月2日
根粒菌とマメ科植物の攻防とゲノム進化：共生系における根粒菌３型分泌系エフェクターの不思議招待有り

南澤究

大阪大学微生物病研究所アドバンストセミナー　2022年1月12日
土壌から発生するN2O削減をめざす市民科学プロジェクト〜地球冷却微生物を探せ〜

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 菊地美穂, 南澤究

2021年度日本土壌肥料学会東北支部大会　2021年12月1日
微生物による地球冷却ー農地からの温室効果ガス削減を目指してー招待有り

南澤究

植物科学シンポジウム2021「植物科学からグリーンイノベーションへ」　2021年11月30日
窒素循環を担う環境微生物ネットワークと温室効果ガス削減招待有り

南澤究

産総研シンポジウム「窒素循環における課題とその解決にむけて」　2021年11月8日

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産業財産権 5

植物へ遺伝子を導入する効率が向上したアグロバクテリウム菌およびその作製方法

江面浩, 南澤究, 野中聡子, 菅原雅之

特許第4534034号

産業財産権の種類: 特許権
リゾビトキシン生産遺伝子rtxC

南澤究, 安田剛

産業財産権の種類: 特許権
微生物資材および植物の栽培方法、並びに、細菌株

南澤究、原沙和

産業財産権の種類: 特許権
植物の生育促進剤

岡崎和之, 池田成志, 高橋宙之, 田口和憲, 黒田洋輔, 関口博之, 南澤究, 鶴丸博人, 橋本萌, 大和田琢二

産業財産権の種類: 特許権
Ｎ２Ｏ還元能が強化された根粒菌及びＮ２Ｏの除去方法

南澤究, 板倉学, クリスティーナ, サンチェスゴメス, 吉川博文

産業財産権の種類: 特許権

共同研究・競争的資金等の研究課題 58

地球環境再生に向けた持続可能な資源循を実現／資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減

南澤究

2020年8月～ 2025年3月
農業生態系を構築する植物個体と群落を橋渡しする分子機構の解明による環境調和型農業

渡辺正夫, 南澤究, 牧野知之, 武田和哉

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

研究機関：Tohoku University

2019年6月28日～ 2022年3月31日

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単位面積当たり、播種する種子数を疎から密へ八段階で変化させた。一個体当たりの乾物重は最も疎である条件の生長がよいわけではなく、それよりも２段階程度密度が高い方が生育がよかった。この効果を「お友達効果」と名付けた。この「お友達効果」の原因・結果として、土壌中の金属イオン、根圏微生物、植物で発現する遺伝子について調査を行った。発現遺伝子、金属イオンでは栽培密度に連動した特徴的な変化はなかった。一方、根圏微生物叢は変化があることから、根圏微生物叢変化をさらに詳細に検討することが重要であると判断した。また、歴史史料などから類似の研究を調査したが、該当する結果は得られなかった。
ブラディリゾビウム属細菌と植物の共進化：根粒菌とエンドファイトの実験室進化

南澤究, 三井久幸, 菅原雅之

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

2018年4月～ 2022年3月

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(i)Bradyrhizobium属根粒菌の共生アイランドの動的進化の解明前年度sacB選抜とRj2ダイズ選抜の欠失パターンが異なっていた。sacB特異的な欠失株をRj2ダイズに接種を行ったところ、（競合的）根粒形成能が明らかに低下していた。したがって、Bradyrhizobium属根粒菌の共生アイランドは自由生活（培養過程）で確率的に挿入配列(IS)介在型欠失が生成しており、Rj2ダイズ選抜ではその一部が選択されていることが判明した。さらに、根粒菌コレクションから共生アイランド内のIS間が重複している獲得型株が見出された。以上の結果は、根粒菌の共生アイランドが挿入配列(IS)を介して欠失と重複を起こす動的な存在であることを実験室内で証明したものとして、高く評価できる。 (ii) Bradyrhizobium属の窒素固定エンドファイトと根粒菌の共有進化ダイズ根粒から分離したBradyrhizobium属根粒菌を、レニーの半流動培地に接種し、アセチレン還元活性を測定したところ、自由生活で窒素固定能を発現する非共生型Bradyrhizobium属細菌と同じレベルでアセチレン還元活性を示す株は得られなかった。したがって、本アプローチからは共生アイランドとゲノムコアの両方にnif遺伝子群を持つハイブリッド型のBradyrhizobium属細菌は見出されなかった。ソルガム根由来のBradyrhizobium属細菌は「根粒菌型」、「自由生活窒素固定型」、「非窒素固定型」３つの窒素固定様式に分類された。それらの詳細な系統解析とゲノム解析により、ある系統において「根粒菌型」と「非窒素固定型」の両方のタイプが共存し、Bradyrhizobium属細菌において、共生アイランドの水平伝達が起りやすい系統の存在が示唆された。
農耕地からの一酸化二窒素ガス発生を削減し作物の増収・減農薬を実現する革新的微生物資材の開発

2018年6月～ 2021年3月
GRAS-Di技術を活用した根粒菌の識別マーカーの開発

2019年8月～ 2020年3月
低エネルギー生産を目指した根圏における植物と微生物の共生解析

2012年9月～ 2020年3月
土壌団粒化剤等による東北大学圃場土の性状及びダイズ生育等に対する影響の解析研究

2016年8月～ 2019年5月
栽培履歴の異なる圃場におけるダイズ微生物相の解析

2017年6月～ 2019年3月
地圏共生遺伝生態研究助成金

2016年8月～ 2019年3月
ソルガムの窒素固定と共生微生物

2016年5月～ 2019年3月
農耕地からの一酸化二窒素ガス発生を削減し作物生産性を向上する微生物資材の開発

2015年7月～ 2018年3月
メタノールをメディエータとした微生物と植物間の新しい相互作用モデルの確立

三井亮司, 田中三男, 中川智行, 谷明生, 南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

研究機関：Okayama University of Science

2014年4月～ 2017年3月

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植物の生育に伴い放出されるメタノールが葉上・根圏の微生物群にとって重要な役割を持つことを明らかにしてきた。本研究課題では軽ランタノイド(ランタン・セリウム・プラセオジム・ネオジム）が土壌に広範に分布し、メタノール資化性細菌の初発酵素メタノールデヒドロゲナーゼの補欠因子となっていることに着目した。植物葉上優占種Methylobacterium属細菌や窒素固定マメ化植物根粒形成菌がランタノイドの存在下で植物から放出されるメタノールをメディエータとして利用し、植物との共生関係を構築していることを示唆する結果が得られた。
ダイズ根粒菌の共生進化ダイナミズムと温室効果ガス削減の分子機構

南澤究, 佐藤修正, 内田隆史

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究機関：Tohoku University

2014年4月～ 2017年3月

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根粒菌と宿主の共進化とN2O還元酵素遺伝子発現制御機構の解明を目的とした。Rj2ダイズに共生不和合性を起こすUSDA122株のタイプ３型エフェクター遺伝子を同定した。共生和合性を示すUSDA110株にも当該遺伝子があり、４アミノ酸残基の置換が存在した。これは、当該nop遺伝子産物と宿主Rタンパク質による根粒菌の共進化の科学的根拠を与える。nasSTは硝酸異化系の制御にも関わっており、硝酸センサーNasSとそのレギュレータNasTのアンチターミネーション制御によるnosR発現までの一連の制御カスケード系が明らかとなった。この知見はN2O還元酵素活性の高い根粒菌作出の基盤となると考えられた。
ダイズ根圏フザリウムの脱窒様式とN2O発生への寄与

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

研究機関：Tohoku University

2014年4月～ 2016年3月

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N2Oは温室効果ガスであり、マメ科作物根圏はN2Oの主要な発生源である。本研究では、根粒根圏の糸状菌N2O生成について、下記の成果を得た。亜硝酸を利用するカビ脱窒が当該根粒根圏で生じていた。根粒根圏から12株のフザリウム分離株を得た。N2O発生圃場のダイズ根粒根圏における糸状菌群集構造解析の結果、分離フザリウム株が圃場およびポットでも優勢であった。大部分のフザリウム単離株が亜硝酸からN2Oの顕著なカビ脱窒反応を触媒し、主に二分子の亜硝酸から一分子のN2Oが生成していた。以上の結果より、ダイズ根粒根圏では亜硝酸利用型のカビ脱窒によりN2O発生が実質的に起きていると結論された。
ダイズの共生微生物相と共生系制御システムの解明による持続的生産技術の開発

2013年6月～ 2015年3月
植物共生微生物の有用機能に関する生化学的・分子生物学的な機能解析

2011年6月～ 2014年3月
植物共生微生物のメタゲノム解析による物質循環機能の解明

南澤究, 信濃卓郎, 山下明史

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究機関：Tohoku University

2011年4月～ 2014年3月

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植物根圏の物質循環における植物共生菌の役割を知るために、メタゲノム解析によりそれらの物質代謝機能を明らかにすることを目的とした。窒素条件の異なる水田に栽培したイネ根に生息している細菌群集のメタゲノム解析の結果、メタン酸化遺伝子の相対存在比が低窒素環境で上昇していた。日本晴とイネ共生遺伝子CCaMK変異体は、低窒素区においてメタンフラックスが約２倍上昇した。種々の解析の結果、イネCCaMK遺伝子が低窒素環境でメタン酸化窒素固定細菌を受容し、水田環境に豊富なメタンをエネルギー源としてイネ根で窒素固定を行っていた。その他の環境変動に対してもイネ共生細菌群集や土壌RNAが敏感に応答していた。
温室効果ガス低減を目指したダイズ根粒菌N20還元過程遺伝子群の制御機構の解明

南澤究, SANCHEZGOMEZ Cristina

2012年～ 2014年

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N2Oは強力な温室効果ガスであると共に、オゾン層破壊の原因物質でもある。植物根圏はN2O発生源の一つであり、私たちのグループはDNA校正機能を低下させたダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumから、突然変異によりN2O還元酵素(N2OR)活性の上昇したNos強化株を作出し、N2O削減効果を実証してきた。しかし、Nos強化株におけるN2OR活性上昇の原因は不明であったため、本研究ではその原因解明を行ってきた。昨年度まで、(1)bll4572(nasS)遺伝子の変異がNos強化株におけるN2OR活性上昇の原因であること、(2)本遺伝子はB. japonicumの脱窒系においてnosZだけでなくnapAの転写制御に関与している新規転写制御因子であること、(3)NasTタンパク質による根粒菌脱窒の遺伝子発現促進をnasS産物が負に制御することが明らかとなった。本年度は、まずnasST介在nosZ遺伝子発現誘導の硝酸濃度プロファイル解析を行った。種々の濃度の硝酸および亜硝酸添加条件下のnosZおよびnapEの遺伝子発現の比較を行ったところ、細胞レベルのNasSTシステムの硝酸感受の臨界濃度は、50uM付近であり、ダイズ根圏における硝酸濃度より高いことが分かった。したがって、植物根圏において、NasS変異によりN2O還元酵素活性を上昇させられる科学的根拠が明らかとなった。また、次世代シーケンサーを用いたnasST変異体の網羅的な遺伝子発現解析の準備を行った。具体的には、野生株およびnasS変異株を好気条件で培養した細胞からRNAを抽出後、cDNAを作成し、次世代シーケンサーのRNA-seqによる発現解析系を確立した。
微生物を利用した農耕地からの一酸化二窒素ガス発生削減技術の開発

2012年～ 2014年
エンドファイト−イネの共生相互作用の解明

2008年4月～ 2013年3月
超近縁菌比較ゲノムによるブラディリゾビウム属細菌の植物共生システムの解明

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

研究機関：Tohoku University

2011年～ 2013年

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ダイズ根粒菌に近縁な細菌の中で、植物共生表現型が異なる「超近縁菌」のゲノム比較により、新規な共生機構を解明した。土壌低栄養細菌S23321株は共生アイランドが転移する前の祖先型ゲノムであった。一方、土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophicaは共生アイランドを持たないが、クサネムに根粒と茎粒を形成する共生窒素固定細菌であった。ダイズ根粒菌USDA122株はタンパク質分泌系によりRj2ダイズに共生不和合性を起こすことが分かり、マメ科植物と根粒菌の進化上のせめぎ合いが明らかとなった。以上のように、微生物―植物相互作用の解明ために「超近縁菌比較ゲノム」の戦略が大変有効であった。
メタン酸化窒素固定細菌による水田メタン発生の低減化

2011年10月～ 2012年9月
比較メタゲノミクスによる土壌微生物性解析の基盤構築

妹尾啓史, 太田寛行, 服部正平, 信濃卓郎, 南澤究, 大塚重人, 橋本知義, 楊宗興

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究機関：The University of Tokyo

2010年～ 2012年

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新しいDNA塩基配列解読技術を用いて、土壌生態系にどのような微生物が存在してどのような役割を果たしているのかを明らかにすることを試みた。水田土壌の解析では土壌の還元反応や窒素循環に関わる新たな微生物群が見出された。三宅島の2000年噴火被災土壌の解析では、火山災害に対する土壌微生物生態系の「回復力」が明らかにされ、液状きゅう肥連用畑地の解析では、家畜糞尿の農地還元が及ぼす土壌の窒素負荷に対する微生物遺伝子の詳細な応答性が明らかにされた。
ダイズ共生窒素固定系に関わる遺伝因子解明に向けた根粒菌多様性の比較ゲノム研究

金子貴一, 佐藤修正, 南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Kyoto Sangyo University

2009年～ 2012年

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ダイズ根粒菌ゲノムと共生形質・共生効率の関連性に関する情報を得ることを目的とし、ダイズ根粒菌4菌株について遺伝子構成の多様性に関する基盤情報と研究リソースを整備した。基盤情報に基づき、ゲノム構造、特に外来性 DNA 挿入因子に着目した比較をおこない、異系統間での挿入因子の塩基配列レベルでの高度な一致と、因子の多様性の存在を示した。
東南アジアの微生物共生系による持続的バイオマス生産と生物変換に関する調査研究

室岡義勝, 南澤究, 阿部美紀子, 久松真, 山田隆, 山下光雄

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Hiroshima Institute of Technology

2008年～ 2011年

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日本、タイ、マレーシア、インドネシア、フイリッピンおよびベトナムの科学者が、東南アジア各地域の植物と共生する窒素固定細菌・微細藻類および菌根菌を採取して、持続的バイオマス生産への効果を調査・研究した。共生微生物をバイオコンポストとして用いた結果、イネやマメ科作物などの食糧生産、デンプンやセルロース資源バイオマスの生育促進およびヤシ油・ジャトロファ油の増産を促した。共生微生物によって、エコシステムが構築され化学肥料の削減をもたらした。ここに、持続的食料およびバイオマス資源生産に共生微生物を積極的に利用することを提言する。
機能微生物ゲノミクスによる農耕地からの亜酸化窒素ガス低減化

2007年～ 2011年
植物・微生物間共生におけるゲノム相互作用

2007年～ 2010年3月
環境修復・環境生態に関する先導的ゲノム研究

津田雅孝, 福田雅夫, 藤井毅, 南澤究, 小川直人, 宮崎健太郎

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

研究機関：Tohoku University

2005年～ 2009年

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様々な汚染物質も含む各種難分解性化合物分解能を有する土壌環境細菌が本来の土壌生態系で示す生きざまの解明をめざし、全ゲノム配列を解読した細菌において、当該環境での生存に極めて重要な遺伝子と本環境で特異的に発現する多数の遺伝子座を同定した。また、環境修復細菌群と土壌環境との相互作用の解明をめざし、汚染物質添加土壌における菌叢や汚染物質分解酵素遺伝子を含む遺伝子プールの経時的変動様式をメタゲノム的手法も用いて提示した。
植物微生物相互作用の包括的解析

田畑哲之, 川口正代司, 佐伯和彦, 南澤究, 中村保一

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

研究機関：Kazusa DNA Research Institute

2005年～ 2009年

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マメ科植物と根粒菌の相互作用による共生窒素固定に着目し、分子遺伝学的およびゲノム科学的手法を駆使して関連遺伝子の同定、機能解析を行った。その結果、共生の成立、根粒の形成およびその制御、窒素固定に関与する多数の遺伝子が明らかになった。
耕地土壌における脱窒のエコ・ゲノミックス-根粒菌共生系のN_2Oパラドックスの解明と土壌微生物集団ゲノム科学の基盤構築-

南澤究, 妹尾啓史

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

2005年～ 2008年

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土壌のない実験室系では根粒はN_2Oを吸収か非発生であるが、圃場ダイズ根粒はN_2Oの発生源であった。圃場を模した土壌栽培系とダイズ根粒菌変異株の実験より、nosZを欠損株は硝酸からN_2O発生を起こし、その硝酸は硝化細菌により供給されていた。ゲノム比較等により農耕地土壌のBJ_2クラスターに属するダイズ根粒菌は、nosZを欠損し、最終産物としてN_2Oを生成した。以上の結果は、少なくともダイズ根粒菌のnosZ遺伝子型と硝化細菌の共同作用により圃場ダイズ根粒からN2_O発生が生ずることを示唆している。
嫌気窒素固定コンソーシアムの植物分布と機能発現-植物の窒素固定と塩ストレス耐性に寄与するエンドファイト共同体の解析-

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

研究種目：Grant-in-Aid for Exploratory Research

研究機関：Tohoku University

2005年～ 2007年

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本研究は、申請者らが細菌エンドファイトの機能的なコミュニテイーとして発見した「嫌気窒素固定コンソーシアム」を対象として、その植物や作物への広がり、植物体内における機能、エンドファイト間の相互作用の解明などを目指した研究である。昨年度に実施した、多数の野生植物や作物由来のClostridium属細菌の系統解析をについてさらに情報学的な検討を加え論文発表を行った。特に、植物由来のcluster XIVaに属するClostridium属細菌と、その他の分離源由来のcluster XIVaに属するClostridium属細菌について、従来は分離株のみを対象としていた。本年度はさらに培養に依存しないデータベース中のDNA配列情報についても検索し、それらを加えて再解析を行った。その結果、植物由来のClostridium属分離株は、やはり系統学的に2ケ所(groupIおよびII)に集中し、高いbootstrap値で他の分離源(ルーメン、腸内、糞便、シロアリなど)のClostridium属分菌株と区別されることが証明された。また、圃場で栽培されているダイズの茎から微生物画分を濃縮し、細菌の16S rRNA遺伝子のユニバーサルプライマーを用いて、クローンライブラリー法で細菌群集構造の解析を行った。その結果、低頻度ではあるがダイズ茎にもClostridium属細菌の16S rRNA遺伝子が検出された。したがって、一見好気的環境であるダイズの茎にもClostridium属細菌が生息していることが明らかとなった。植物接種実験による窒素固定機能共同体としての実験も行ったが、植物個体への定着安定化が難しく、その解明は進まなかった。尚、2006年に本研究成果をまとめた「嫌気窒素固定コンソーシアム」の機能を明らかにした欧文誌の論文が日本微生物生態学会論文賞を平成19年度に受賞した。
植物内生菌（エンドファイト）の多様性と機能の解明競争的資金

制度名：Special Coordination Funds for Promoting Science and Technology

2006年4月～
ウリ科作物の効率的な組換え体創出のためのスーパーアグロバクテリウムの開発

江面浩, 南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：University of Tsukuba

2003年～ 2006年

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本研究では、エチレンが介する植物-アグロバクテリウム相互作用を解明し、その知見を利用したウリ科作物への遺伝子導入効率の良いスーパーアグロバクテリウムを分子育種することに取組んだ。その結果、以下の成果が得られた。 1.エチレンはアグロバクテリム菌自体の生育を抑制するのではなく、エチレン反応を示す植物がアグロバクテリウムのvir遺伝子群の発現を抑制すること、この抑制効果はエチレン処理により植物細胞内で蓄積もしくは消失する物質よることを明らかにした。この結果より、アグロバクテリムに植物のエチレン生合成を抑制する能力を付与することで、遺伝子導入能力が向上するものと考えられた。 2.リゾビトキシンは、ダイズ根粒菌が生産するエチレン生合成阻害剤であり、宿主植物のエチレン発生を低下させる。本研究では、ダイズ根粒菌USDA94株のrtxACDEFG遺伝子及びミヤコグサ根粒菌のOAH合成遺伝子をアグロバクテリウムC58株に導入し、リゾビトキシンを生産させることに成功した。ACCデアミナーゼは、各種共生細菌が生産する酵素で、エチレン前駆体であるACCを分解し、植物のエチレン生合成を抑制すると考えられている。本研究では、シュードモナス由来のACCデアミナーゼ遺伝子をアグロバクテリウムC58株に導入し、ACCデアミナーゼ酵素活性を付与することに成功した。 3.リゾビトキシンもしくはACCデアミナーゼを生産するアグロバクテリムC58株(以降、スーパーアグロバクテリム)のメロンへの遺伝子導入能力を検討した。その結果、両株ともメロンの形質転換効率を有意に上昇させた。ACCデアミナーゼ生産C58株について、シロイヌナズナへの遺伝子導入効率も向上することを示した。以上のように、本研究では植物への遺伝子導入能力を向上したスーパーアグロバクテリウムの分子育種に成功した。
野生イネ遺伝資源のオンファーム保存システム構築のための実証的調査

佐藤雅志, 南澤究, 石川隆二, 中村郁郎, 佐藤洋一郎, 石井尊生

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

2003年～ 2005年

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以下に示すように野生イネの自生地および周辺の栽培イネの栽培地を調査した。平成15年11月4目から12日まで、ラオス国、タイ国およびミャンマー国の18地点を調査(秋本正博、佐藤雅志、、中村郁郎、石井尊生) 平成15年11月13日から27日まで、ミャンマー国北部の19地点を調査(石川隆二、中村郁郎) 平成15年11月13日から27日まで、ミャンマー国南部の42地点を調査(秋本正博、佐藤雅志、石井尊生) 平成16年2月10日から16日まで、ラオス国の野生イネオンファーム保存地を調査(佐藤洋一郎) 平成16年2月29日から3月7日まで、ラオス国の野生イネオンファーム保存地およびタイ、バンコクの3地点を調査(佐藤雅志) 平成16年11月10日から23日まで、ミャンマー国南部の7野生イネ自生地を調査(秋本正博、宍戸理恵子、石井尊生) 平成16年11月23日から12月6日まで、インドネシア国カリマンタン島の7野生イネ自生地を調査(石川隆二、中村郁郎、佐藤洋一郎、上埜喜八) 平成17年3月5日から16日まで、タイ、ラオス、カンボジアの12地点を調査(石川隆二、佐藤雅志、中村郁郎) 平成17年11月1日から11日まで、ミャンマー南部の6野生イネ自生地を調査(秋本正博、宍戸理恵子、石井尊生) 平成18年1月7日から18日まで、ラオス、カンボジア、インドネシアの21地点を調査(石川隆二、佐藤雅志、中村郁郎) これらの調査で得られた結果および継続して調査してきた結果を踏まえて、学会誌等に成果を発表した。主な報告は、以下に示す。
野生イネへの窒素固定エンドファイトの内生および窒素固定活性に関するQTL解析

佐藤雅志, 南澤究, 東谷篤志, 石井尊生

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

研究種目：Grant-in-Aid for Exploratory Research

研究機関：Tohoku University

2003年～ 2005年

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この研究の目的は、野生イネと栽培イネとの交雑後代自殖系統集団を用い、野生イネ組織内から単離された窒素固定能を持つエンドファイトの野生イネ組織内への感染、コロニー形成、窒素固定活性を支配している遺伝子の数および座位を、量的遺伝子座(QTL)解析法を用いて解明することである。佐藤は、窒素固定活性を支配するQTLの解析にそなえて最適の交雑自殖後代系統集団を選ぶために、野生イネ系統および栽培イネ系統に内生させたHerbaspirillum sp.B501の窒素固定酵素ニトロゲナーゼを構成する遺伝子nifHの発現およびアセチレン還元活性を再調査した。その結果、栽培イネ系統および野生イネ系統間にアセチレン還元活性の統計的な崔を再現することができなかった。南澤は、野生イネ系統に内生させたHerbaspirillum sp.B501のnifHの発現を調べ、明期に発現の上昇かあり暗期には発現の低下が認められることを見出した。このnifH発現の明暗サイクルについては国際誌に発表した。東谷は、栽培イネKasalathから単離された接種菌以外の細菌を16srRNAの塩基配列により同定した結果、イネのエンドファイトとしては初めて検出されたStenotrophomonas maltophiliaであることが見出された。石井は、これまでと同様に栽培イネと野生イネとの戻し交雑後代(O.sativa Nipponbare///O.rufupogon W630/Nipponbare//Nipponbare, O.sativa IR36///O.rufupogon W630/IR36//IR36, Nipponbare///O.meridionalis W1627/Nipponbare//Nipponbare, IR36///O.meridionalis W1627/IR36//IR36)BC2由来のQTL解析集団の作出を引き続きすすめた。作出された集団に関してはDNAマーカーを用いて遺伝子型データベースの構築をすすめた。
N_2O抑止型脱窒系構築のための根粒菌ゲノム生態学の開拓

南澤究, 鮫島玲子

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

2002年～ 2004年

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本研究は、ダイズ根粒菌の遺伝生態、脱窒の分子生物学、微生物ゲノム科学の成果を駆使して、共生細菌の特性を生かしたN_2O抑止型脱窒生態系構築の学術的な基盤を明らかにすることを目標として実施した。 TCDガスクロによる^<15>N/TCD定量法を開発し、Bradyrhizobium属根粒菌の脱窒の最終産物である^<15>N_2の測定が可能となった。本法により完全脱窒能を保持している株が優先している圃場と、N_2Oを発生するB.japonicumが優先している圃揚のあることが明らかとなった。系統的にはダイズ根粒菌B.japonicumは2つのcluster BJ1,BJ2に分かれ、それぞれN_2放出型、N_2O放出型で構成された。B.japonicumはnapAB, nirK, norCBを必ず保有し、さらにN_2放出型のBJ1株のみがN_2O還元酵素(N_2OR)遺伝子(nosZ)までの全脱窒遺伝子を保有していた。 B.japonicum USDA11Oの培養菌体は、嫌気条件下でN_2OR活性を示したが、nosZ破壊株では活性が消失した。nos遺伝子群を含むコスミドをnosZ破壊株に導入したところ、N_2OR活性が回復し、N_2OR活性はnos遺伝子群に依存していることが明らかとなった。B.japonicum USDA110およびnosZ破壊株を接種したダイズ根粒のN_2OR活性を^<15>N_2Oガスにより検討したところ、nosZ遺伝子に依存して根粒は^<15>N_2Oを取込みその98%以上を^<15>N_2として放出していることが明かとなった。さらに根粒根圏においても強力なN_2O除去能が観察された。以上の結果から、農耕地土壌にはnos遺伝子を保有していないBJ2株が多数生息しており、nos遺伝子群導入株やBJ1株を接種することにより、ダイズ圃場から放出されるN_2O fluxを低減できる可能性が示唆された。
東南アジアの窒素固定共生菌による持続的食糧増産と環境保全に関する研究調査

林誠, 室岡義勝, 南澤究, 山田隆, 阿部美紀子, 田島茂行, 山下光雄

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

研究機関：Osaka University

2001年～ 2004年

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広く東南アジア特有の窒素固定共生菌を探索し、それらの遺伝的多様性を遺伝子および化学的に分類し、系統的位置を明確にするとともに、土壌環境と遺伝的多様性を調査し、それぞれの地域に適した窒素固定菌を利用することによるダイズ等の食糧増産およびマメ科樹木の成長との関連性を解析することを目的として下記の調査研究を行なった。 1.タイ、マレーシア、フィリピン、インドネシアにおいて窒素固定菌を探索し、純粋分離した。および各国における窒素固定共生能の評価を行った。 2.マメ科植物と根粒菌によるファイトレメディエーションに関する研究を行なった。 3.調査、研究打ち合わせのため、下記のように、公開研究者会議を開催し、窒素固定共生菌に関する研究成果の発表および意見交換を行なった。平成13年度 8月米国において窒素固定共生菌に関するセミナーを出席し、調査研究を行なった。 11月タイ国において公開研究者会議を開催した。平成14年度 5月タイにおいて窒素固定共生菌に関する調査研究を行なった。 10月マレーシアにおいて公開研究者会議を開催した。また、マレーシアの土壌および植物根圏より熱帯性窒素固定細菌を探索した。 1月大阪大学でマメ科モデル植物のミヤコグサワークショップを外国人招待者を含め開催し、窒素固定共生菌に関する研究成果の発表および意見交換を行なった。平成15年度 10月ベトナムにおいてセミナーを開催し、ベトナム・メコンデルタ地帯の生物肥料の実施状況とその効果について調査を行なった。平成16年度 12月インドネシアにおいてミーティングを開催し、研究成果を発表し、調査研究の総括を行った。
全ゲノム塩基配列情報に基づく根粒菌の共生機構の解明

南澤究, 横山正, 田島茂行, 佐伯和彦, 永田裕二, 大和田琢二

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

研究機関：Tohoku University

2003年～ 2003年

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本調査の目的は、根粒菌とマメ科植物の共生機構および生態を根粒菌ポストゲノム解析により明らかにする総合的な戦略を練り、食糧生産および環境保全に資する共生科学を創成することにある。8月12-13日に仙台において、ワークショップ「根粒菌のポストゲノム研究の展開」を開催し、数回の打合せ行い、以下のような項目について調査を行った。 1)モデルマメ科植物分子遺伝解析に対応したミヤコグサ根粒菌の戦略の検討:根粒菌の遺伝子が宿主植物側の共生受容系や防御応答系とどのような相互作用を通じて共生成立に至るのかという点を、モデルマメ科植物ミヤコグサの分子遺伝解析タイアップしながら進行させる必要がある。既に共同研究として論文発表した網羅的な遺伝子発現解析・破壊株の共生特性の解析以外に、CalcofluorやTn-phoA変異などの根粒菌の細胞膜構造、分泌タンパク、多糖生産の変異株が、相互作用機構解明に適したアプローチ方法であると結論された。 2)ダイズ根粒菌のアレイ解析・ライブラリー構築利用の基本戦略の策定:ミヤコグサ根粒菌と同様に整列化コスミッドライブラリーが、品種特異的共生因子の同定に有効であると判断された。また、ミヤコグサ根粒菌で使用したマクロアレイ系のダイズ根粒菌への適用は、クローンの選択・RNA抽出方法などの改善が必要であると考えられた。 3)食糧生産および環境保全への応用:根粒菌ゲノム情報から難分解物質分解系遺伝子、脱窒遺伝子群は、根粒菌接種に環境保全への付加価値をつけ、また機能性遺伝子導入根粒菌による共生環境修復への発展性が期待された。また、グリシンベタインによる浸透圧(塩)耐性、乾燥耐性は、応用研究に有効であると考えられた。野外利用はセルフクローニング系が有望であった。 4)クローン管理およびデータベース構築:データベース構築・公開は大阪大学で、クローン管理は東北大学と東京農工大学で共同で行うこととした。
土壌中での難分解性化合物分解遺伝子群の動態と動態を利用した環境浄化細菌育種

津田雅孝, 南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

2000年～ 2003年

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土壌細菌の各種難分解性芳香族化合物分解遺伝子群は、プラスミドやトランスポゾン(Tn)上に担われ、これら可動遺伝因子の動的挙動が、分解遺伝子群の広範な細菌種への水平伝播と分解菌の新規分解能獲得に深く関与する。本研究では、当該遺伝子の動態を司る分子機構の解明とこの動態を利用した新たな環境浄化細菌分子育種の基盤確立をめざし、以下の成果を得た。 1.ハロ酢酸デハロゲナーゼ遺伝子dehH1とdehH2を担う広宿主域プラスミドpUO1上で、dehH2はIS1071複合型のTnHad1内に、TnHad1とdehH1はTn21群のTnHad2内に存在していた。後者Tnは転移酵素と解離酵素をコードしなかったが、Tn21群転移酵素共存下での転移に必須な末端塩基配列を示した。 2.トルエン分解遺伝子群を担うTn4651の転移反応過程の部位特異的解離に必要な領域res内での組換え部位を特定した。解離にはTnpSの関与が必須であり、TnpTは解離頻度を大幅に上昇させた。本解離系は部位特異的組込み活性も備えていたが、TnpTは組込みに不要だった。また、Tn4651型の部位特異的解離系は広範な環境細菌種に存在していた。 3.pWW53上のトルエン分解に関わるTn4656は、80kbのTn4657内で、pWW53の複製装置遺伝子を含む41kb領域で分断されていた。Tn4657内の2つのres間でのTnpRによる部位特異的逆位,がTn4656形成に関与していた。 4.ナフタレン分解に関わるTn4655は、祖先型への複数Tnの挿入とその再編成を経て形成されたことが判明した。本Tn部位特異的解離系のTnpRは部位特異的組込み能も有していた。 5.Tn4655からナフタレン分解初発酵素遺伝子を除去した誘導体をもつ細菌株を受容菌とし、原油汚染土壌と直接混合し、ナフタレン分解能獲得接合体株を得た。接合体は広宿主域伝達性でナフタレン分解遺伝子群を担うプラスミドを獲得していた。
共生微生物等を利用した荒廃土壌の修復技術の開発

1999年～ 2003年
イネ科植物の窒素固定エドファイトの機能解析競争的資金

2000年4月～ 2002年
リゾビトキシン生産能付与による微生物感染促進技術の開発

南澤究, 遊橋健一, 江面浩

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

1999年～ 2002年

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(1)リゾビトキシン生合成:リゾビトキシン生合成遺伝子のDNAシーケンスと遺伝子破壊による機能解析を行ったことろ、rtxA遺伝子のN末側がセリノール合成、rtxA遺伝子のC末側がジヒドロリゾビトキシン(DRT)合成、新規のrtxCはリゾビトキシン(RT)合成に関与することが推定された。特に、DRT desaturaseであると考えられた。中間体や前駆物質投与実験の結果、遺伝子破壊実験の結果からRT生合成系の推定を行い、RT合成には少なくとも、rtxAとrtxCが必須であることを明らかにした。 (2)エチレンがマメ科植物の根粒形成に及ぼす影響:有限型根粒を形成するマメ科植物のミヤコグサおよびサイラトロにおいても、内生エチレンが根粒形成抑制を起こすことを明らかにし、異種変異エチレンレセプターCm-ERS1/H70Aをマメ科モデル植物ミヤコグサに導入することによりエチレン低感受性ミヤコグサの作出を試みたところ、根粒形成に変化が表れた。 (3)根粒形成におけるリゾビトキシンの役割:リゾビトキシンは、エチレン合成系のACC合成酵素の強力な阻害剤であることを明らかにした。リゾビトキシン非生産変異株により、リゾビトキシンは宿主植物根のエチレン発生を抑えることにより、根粒形成および競合力を、共生成立後期に高めていることが判明した。 (4)リゾビトキシン生産能の付与による形質転換効率の改善:Agrobacteriumを用いた形質転換系において、リゾビトキシンのアナログを添加すると形質転換効率の上昇した。B.elknaiiのリゾビトキシン生合成遺伝子rtxACをダイズ根粒菌B.japonicumおよびA.tumefaciensに導入したが、今のところ、リゾビトキシン生産およびRtxAタンパク発現は観察されていない。今後、他のプロモーターの利用も視野に入れた発現系の検討を行う予定である。
土壌中におけるダイズ根粒菌のゲノム再編成機構とその生態的意義

南澤究, 津田雅孝, 三井久幸

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Tohoku University

1998年～ 2001年

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本研究は、土着ダイズ根粒菌の遺伝的多様性の解析過程で分かってきた多コピーの挿入配列を保有するダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum HRS株の生成機構と生態的な役割を明らかにするために、(1)HRS株の地理的分布と分子系統、(2)圃場生態系における種内競争因子、(3)ゲノム再編成、(4)遺伝子水平伝達について検討を行った。 (地理的分布と分子系統)アメリカ合衆国、中国および日本保存株からHRS株が検出され、RS-alpha, RS-betaのコピー数の増加の程度と、土壌環境(湛水土壌やアルカリ土壌)、分子系統樹(BJ1,Bj2)、血清型、増殖速度の間に関係が認められた。 (圃場生態系における種内競争因子)HRS株がわずかに生息する土壌を畑条件下と水田を想定した湛水条件で2ヶ月間保持し根粒形成を調べたところ、湛水条件下においてHRS株の出現頻度が有為に増加した。土壌環境に近い低栄養条件や栄養ストレス条件下にいおて、HRS株の増殖速度はnon-HRS株とほとんど変わりはなく、30日以上の定常期を経た細胞では、HRS株のコロニー形成率が高い傾向が観察された。したがって、HRS株は、栄養ストレス耐性が高いと考えられた。 (ゲノム再編成)HRS株NK6の窒素固定(nif)遺伝子領域約20kbの塩基配列および遺伝子重複を起こしているヒドロゲナーゼ(hup)遺伝子領域の部分配列を決定したところ、機能的に重要な構造遺伝子は保存されていたが、通常株では本来その領域に存在していない挿入配列による領域分断やシャフリングが観察された。 (遺伝子水平伝達)B.Jaonicum HRS株NK5からnod遺伝子欠損B.elkaniiへのnod遺伝子の水平伝達が、土壌およびマイクロコズムで観察され、その頻度は14日間のnon-growth conditionのmicrocosm実験において10^<-10>から10^<-11>の範囲であった。以上のように、本研究ではダイズ根粒菌HRS株の遺伝生態的な特徴を明らかにした。
根粒菌のゲノム生態に関する研究競争的資金

2000年4月～
種子伝達性窒素固定イネエンドファイトの探索

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

研究種目：Grant-in-Aid for Exploratory Research

研究機関：Tohoku University

1999年～ 2000年

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前年度、野生イネおよび栽培イネの種子および茎から、改変Rennie(RMR)培地を用いてアセチレン還元活性を示す窒素固定菌を多数単離し、16S rRNA遺伝子に基づく分子系統解析を行ったところ、Herbaspirillum属、Ideoonella属、Enterobacter属、Azospirillum属細菌の窒素固定菌が分離された。窒素固定エンドファイトとして報告のあるHerbaspirillum属が野生イネ種子および茎から分離されたので、Herbaspirillum属をGFP標識を行い、分離されたイネの組織定着性を検討した。幼植物段階では、いずれも10^7-10^9オーダーの接種菌が定着していた。電子顕微鏡や蛍光顕微鏡による観察でも、地上部の細胞間隙に接種菌がコロナイズしていた。Herbaspirillum菌を接種したイネ幼植物のアセチレン還元活性(窒素固定活性)は、菌株により異なっていた。種子から分離されたGFP標識Herbaspirillum属細菌を接種したイネを登熟期まで栽培し、組織内定着を経日的に追跡したところ、地上部に10^6-10^7のオーダーで約2ヶ月目まで存在していたが、4ヶ月目の登熟期の葉茎、登熟種子には検出されなかった。昨年度、野生イネ種子からのみHerbaspiriilum属窒素固定菌と推定される計数値が得られたことを考えあわせると、Herbaspiriilum属窒素固定エンドファイトが、種子を介して次世代のイネに伝達される現象は、常に起こる厳密なものではなく、環境条件により変動すると考えられた。野生イネは多年生の性質が強く、種子伝達というよりはむしろ栄養体で広がる可能性が高いと考えられた。前年度から種子や茎に窒素固定菌の高いMPN計数値が得られるにもかかわらず、窒素固定菌の分離で困難を極める場合があった。その理由は、複数の菌が存在する場合に窒素固定能が発現するためであることが分かり、本研究は当初予期していなかった方向への研究展開が始まりつつある。
東南アジアの窒素固定菌の遺伝的多様性と育種菌の多面評価

室岡義勝, BAYANI Espir, MADE Sri Pra, 小沢隆司, 南澤究, 東四郎, ESPIRITU Bay, SRIPRANA Mad

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for international Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for international Scientific Research

研究機関：Osaka University

1997年～ 1998年

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東南アジアの特異的な土壌が育んできた学術的に貴重かつ有用な窒素固定菌群に関して、その遺伝的多様性の系統的研究を行うことにより、永続的地力保持に基づく環境改善に寄与するとともに東南アジアの食糧、バイオマス生産に役立つことを目的とし、日本学術振興会の東南アジアのバイオテクノロジー大型プロジェクトと連動させながら、以下の研究を実施した。 1. タイ、インドネシア、フィリピン、マレーシアおよびヴェトナムの土壌および熱帯樹木を含む根粒植物根圏より、熱帯性窒素固定菌を探索し、土壌環境との関連を明かにし、その系統分類を行った。アカシアの根粒より分離した根粒菌はBradyrhizobium elkani種であることが分かった。 2. インドネシアで分離した酸性土壌に強い根粒菌株を各国で評価した結果、pH4.0の土壌中で生育できることが分かった。さらにタイ国で分離した菌はpH3.0でも生育できることが分かった。 3. 東南アジアの窒素固定菌研究者のネットワークの強化と共同研究推進のため、マレーシアおよびフィリピンにおいて、研究成果発表および今後の共同研究の方向についての打ち合わせ会議を行った。また、研究成果発表を行い、上記以外に各国でそれぞれの土壌に適した根粒菌を接種することにより、ダイズやピーナッツの収量の大幅な増加のデータが示された。
ダイズ根粒菌超反復配列保有株におけるゲノム再編成と生成要因の解析

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

1995年～ 1996年

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ダイズ根粒菌超反復配列保有株(HRS株)は、(1)RSαとRSβのコピー数が通常株よりはるかに多いこと、(2)nif/hupなどの共生遺伝子周辺でハイブリダイゼーションバンドの移動や重複が観察されること、(3)根粒形成・窒素固定・ヒドロゲナーゼ活性などの共生に関わる表現型は変化ないが、培地中での生育は通常株と比較して極めて遅いこと、(4)血清型は、HRS株・通常株にかかわらず、各圃場に特有のパターンを示すことより、HRS株は土着の通常株から挿入配列(IS)の介在するゲノム再編成によって圃場生態系の中で生じたのではないかと考えられ、その検討を行った。スナップバック分析により,HRS株から逆方向反復配列の検出と単離を行ったところ新たに6種類の挿入配列(IS)が超反復配列保有株から単離された。スナップバック分析の結果自体、これらの挿入配列はいずれも逆方向状態で存在しており、ゲノム再編成の結果生じたものと考えられるだけでなく、このような構造そのものが複合トランスポゾンの構造をしているのでさらなるゲノム再編成や遺伝子の水平伝達を引き起こす可能性が考えられた。実際、新潟タイプのHRS株NK6における共生遺伝子nif/hup/nod遺伝子周辺のマッピングを行ったところ、共生遺伝子周辺では、ISの挿入、欠失、遺伝子重複などの激しいゲノム再編成の痕跡が観察された。さらに、nif領域が逆方向状態のRSαで挟まれた複合トランスポゾンの構造が実際に存在することが明らかとなった。根粒形成遺伝子を欠失した別種のダイス根粒菌Bradyrhizobium elkanii USDA94ΔNODをHRS株と混合して、低温条件下で1週間放置したところ、根粒形成能を回復したB.elkanii受容菌が単離された。この株は、HRS株NK5からの根粒形成遺伝子の伝達と挿入配列FK1の増加が観察され、HRS株の遺伝子水平伝達のポテンシャルが示された。
ダイズ根粒菌産生インドール酢酸の根粒形成における役割

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

研究種目：Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

研究機関：Ibaraki University

1994年～ 1994年

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ダイズ根粒菌グループII(Bradyrhizobium elkanii)の宿主植物への感染において、根粒菌が生産するインドール酢酸(IAA)がどのように関わっているかを明らかにするために、各種のmutantを作製し、宿主植物に対する根粒形成や感染過程を観察し、以下のような結果を得た。 B.elkanii USDA 31株からIAA生産能を激減させたmutant Tn3株を単離し、形成根粒数を親株と比較したところ、明らかに減少していた。Tn3株接種時に、外部から IAAを投与したところ、根粒数は親株レベルまで回復した。したがって、B.elkaniiの生産するIAAが根粒形成に関わっているものと考えられた。宿主植物であるダイズ根の形態的観察より、IAAを通常レベル生産する B.elkanii野性株接種時のみに、ダイズ根の表面に局所的な隆起が認められた。この隆起は1-2層の肥大伸長した外皮層細胞から形成されており、外皮層隆起(Outer Cortex Swelling,以下OCS)と名付けた。OCS構造は、IAA低生産mutant Tn3株では観察されなかった。次に、最近注目されている Nod Factor(根粒菌から宿主植物へのアシル化キチンオリゴマーシグナル)との関わりを検討した。nodD_2D_1KABC遺伝子のみを欠損しNod Factorを生産しないmutantを構築して、ダイズに接種したところ、根粒は形成されなかったが、OCS構造は観察された。したがって、OCS形成に、B.elkaniiの生産するIAAが関わっている可能性は非常に高く、形成されたOCS構造は根粒菌のprimitiveな感染様式と深く関わっていると考えられた。 B.elkaniiのIAA生合成系のkey enzymeであるindolepyrvate decarboxylase(IPDC)のホモロジーに基づくクローニングは失敗したが、IPDCタンパクを精製し、N末端から30のアミノ酸残基を決定したので、これらの情報を基に再度クローニングを行い、遺伝的に特徴づけられたIAA生産のmutantを構築する。
クリーネストエネルギーとしての水素ガスの生産のための生物資源の開発戦略-窒素固定研究グループと水素発生研究グループの学際的共同研究-

渡辺巖, 南沢究, 宮本和久, 熊沢修造, 魚住武司, 小野寺一清

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Co-operative Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for Co-operative Research (B)

研究機関：Mie University

1993年～ 1993年

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水素ガスもっともクリーンなエネルギーとして将来が期待されている。いろいろな微生物を用いて水素ガスの生産をしようという計画も盛んにすすめられている。水素ガスは酵素ヒドロゲナーゼかニトロゲナーゼの働きによって生成される。従来ヒドロゲナーゼや水素発生の研究.開発を進めてきた研究者とニトロゲナーゼによる窒素固定の研究者の相互の交渉はほとんどなかった。そこで窒素固定研究グループと水素発生研究グループとが一堂に会して,相互の研究の発展を学び,ニトロゲナーゼ.ヒドロゲナーゼ系のそれぞれの長所を取った新技術の開発の戦略を討論することが急務であると考えてこのグループが組織された。この戦略の可能性及び研究の広がりへの期待をこのプロジェクトで討議し,より大きな国内的.国際的プロジェクト提案の足掛りとしようというのが目的である。第一回の会合(平成5年7月)で研究・討議の基本を決めた。この問題についての一般に公開されたワークショップを平成5年12月に東京都町田市玉川大学で開催した。メンバー以外に日本から水素ガス生産.利用の実際にたずさわっている技術者の三菱重工株式会社黒田健之助氏とアメリカのニトロゲナーゼの遺伝生化学の権威Virginia Polytec水素ガスnique InstituteのW.E.Newton氏とドイツのヒドロゲナーゼの遺伝生化学の権威Marburg UniversityのA.Klein氏を専門家としてお招きした。この講演会には大学、会社研究所から70名近い参加があった。このワークショップのあとメンバーの第二回会合をもった。このワークショップの発表内容は若干のメンバーの投稿を加えて英文を主とした報告集として刊行した。この報告が窒素固定と水素発生の研究者の学際的協力を促すのみならず、水素ガスの生産技術に関心を持っている技術者に重要な情報を提供するだろうと期待している。またメンバーの討論をもとに、ヒドロゲナーゼとニトロゲナーゼの遺伝工学.蛋白工学的改良、水素発生プロセスの生態工学的開発を中心にした次の研究プロジェクト(総合A)を平成7年度に提案する予定である。
ダイズ根粒菌超反復配列保有株の遺伝的解析

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

研究種目：Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

研究機関：IBARKI UNIVERSITY

1992年～ 1993年

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ダイズ根粒菌超反復配列保有株のゲノム当りのRSα・RSβ配列のコピー数をハイブリダイゼーション時の放射能強度から推定した。新潟農業試験場から多数単離された超反復配列保有株はいずれもRSα配列がゲノム当り80〜200コピーであり、通常株のRSα配列の1〜12コピーと比較して異常の多いことが明らかとなった。しかし、新潟農試の超反復配列保有株のRSβ配列は20コピー前後で通常株の数倍にすぎなかった。一方、十勝農業試験場の圃場に生息していた超反復配列保有株では、RSα・RSβ配列ともに通常株の数倍のコピー数であった。以上の結果より、超反復配列保有株の反復配列のコピー数は圃場によって異なっており、超反復配列保有株の生成されやすい環境が存在すると考えられた。次に、超反復配列保有株と正常株の共生状態の諸性質と単生状態の生育速度を比較検討した。両者は共生状態において同等の根粒形成能・窒素固定活性・ヒドロゲナーゼ活性を示した。しかし、YM液体培地における対数期の増殖速度は超反復配列保有株において明らかに遅くなっていた。ちなみに同じ土壌の通常株の世代時間が4〜6時間であるのに対し、RSαのコピー数の極端に多い新潟農試の超反復配列保有株の世代時間は5〜9時間となった。パルスフィールド電気泳動によってダイズ根粒菌超反復配列保有株と通常株におけるRSα・RSβ配列の分布の検討を行ったところ、ゲノム上におけるRSαとRSβの分布域は、通常株で17%(RSα)、8%(RSβ)であったが、超反復配列保有株では74%(RSα)、42%(RSβ)となっていた。また、超反復配列保有株のゲノムサイズは通常株より大きい傾向が観察された。hup・nif遺伝子をプローブとしたハイブリダイゼーションにおいて超反復配列保有株のバンド数および位置は正常株と明らかに異なっていた。以上の結果より、超反復配列保有株ゲノムでは、RSα・RSβ配列の転移とそれに伴うゲノムの再構成が起きている可能性が強く示唆された。
マメ科植物の共生窒素固定系の成立と窒素固定能発現の機構の解明

石塚潤爾, 東四郎, 山本幸男, 田島茂行, 藤田耕之輔, 有馬泰紘, 庄野邦彦, 南沢究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

研究機関：KYUSHU UNIVERSITY

1990年～ 1992年

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ダイズ根粒菌の宿主特異性とダイズの根粒菌株選択の機構につては、Rj_4ダイズ種子から親和性菌株Is-1を特異的に凝集し、その増殖を促進するフコースレクチンを分離し、Rj品種の菌株選択機構との関連性を推定した。栽培ダイズ、野生ダイズ、サイラトロから抽出した根粒菌のDNAが3種類のnodグリープに分けられ、各々3種の分離源宿主に対応すること、また、根粒形成過程で細胞壁の分解と感染糸形成の過程が宿主特異性の決定に大きく関与していることを明かにした。R.frediiにR.trifoliiのnod遺伝子を組み込んだプラスミッド、および、lacオペロンとTn5を挿入したプラスミッドを導入した変異株のダイズに対する根粒形成能の調査では、hetelogousな遺伝子産物がR.frediiのnod遺伝子の発現に干渉作用を及ぼすことが明らかになった。インゲンの根粒形成に対する種子と根の溢泌物の影響について調査し、数種のフラボノイド化合物を同定、その消長を明らかにした。根粒形成、窒素固定能発現に影響を及ぼす硝酸は速やかに茎葉部に移行し、吸収部位以外の根や根粒には移行しにくいこと、また、莢切除による窒素固定能の低下は根粒からの固定窒素の取り去り速度低下によることを明らかにした。根粒中の感染細胞にはキサンチン脱水素酵素、リンゴ酸脱水素酵素、非感染細胞にはウリカーゼ、アミノ酸合成酵素、CO_2暗固定酵素の活性が高く、両細胞間の分業が示唆された。共生特異的蛋白ノジュリン、とくに、ウリカーゼついて、その活性、精製酵素の性質、転写産物であるmRNAの同定、クローニングしたcDNAの塩基配列の解析等によって子葉にもウリカーゼが発現し、ゲノム中にウリカーゼ遺伝子は少なくとも2コピー存生することが示された。発育段階の異なる根粒から、substruction法によりノジュリン遺伝子のcDNAクローニングを試み、既知遺伝子の大部分と新たに9個の遺伝子を単離、その生理的意義を検討した。
土壌中におけるBradyrhiz0bium属根粒菌の生態

浅見輝男

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)

研究種目：Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)

研究機関：IBARAKI UNIVERSITY

1990年～ 1992年

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研究成果の概要は以下の通りである。 1)日本国内の6ヵ所の畑土壌から分離された単離株のゲノムDNAのサザンブロットに対してnifDK,hup,RSα・RSβをプローブとしてハイブリダイゼーションを行なった膨大なデータを解析したところ、土着ダイズ根粒菌の遺伝的変異の右向や集積速度は圃場によって非常に異なっていることが明らかとなった。このような変異には、共生細菌に特有な宿主植物の有無や種類が大きく影響していると推定された。 2)宿主親和性を検討した際得られた126単離株を対象として、nodDYAB遺伝子(根粒形成共通遺伝子)周辺の塩基置換度を調べたところ、8種類のnodRFLPグループに整理されたが、パターンの類似性から大きく3つのグループ(nod group A,B,C)に分けることができた。nod group Aはダイズから、nod group Bはダイズとサイラトロから、nod group Cはサイラトロのみからの単離株であった。宿主植物根への根粒形成シグナル物質である。Nod factor(リポオリゴサッカライド)の分析を行ったところ、nod group A,Bの単離株は、いずれもダイズに特異的なNodfactorであるNodBj-V(C_1:18Me-Fuc)を生産していたが、nod group Cは別のNod factorを生産していた。RSフィンガープリントでは多様にみえる土着ダイズ根粒菌群も宿主特異性に関わるnod遺伝子とNod factor生産でみると極めて単純であった。nod groupと系統の関係は、nod group Aが系統Iに、nod group B,Cが系統IIに対応していた。 3)Bradyrhizobium属根粒菌全体の中で、ダイズ根粒菌であるBradyrhizobiumの系統I、IIがどのような位置を占めるのかを調べるために、Bradyrhizobium spp.と系統I、IIの遺伝型および表現型を比較したところ、Bradyrhizobium japonicumの系統I、IIはBradyrhizobiumの中でも均一性の高い小さい集団であることが判明した。 4)3年間の結果より、土着Bradyrhizobium属根粒菌群の生態を系統I、IIに着目し、DNAハイブリダイゼーション法で調べる方法を確立した。DNAハイブリダイゼーションのためのプローブは、nifDK,nodDYAB,hup,RSα,RSβが最適であった。また、ダイズ根粒菌の系統の判定には、インドール酢酸の生成法が簡便で正確であった。
ダイス根粒菌インドール酢酸生産遺伝子のクローニング

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究機関：Ibaraki University

1991年～ 1991年
ダイズ根粒菌の生産する新規ファイトトキシンの同定と生態的役割

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究機関：Ibaraki University

1990年～ 1990年
根粒菌リゾビトキシン生産遺伝子のクローニング

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究機関：Ibaraki University

1989年～ 1989年
マメ科植物根粒におけるアミノプロパンジオール代謝と窒素固定

南澤究

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

研究機関：Ibaraki University

1987年～ 1987年
マメ科植物の共生的窒素固定および同化産物蓄積に関する研究

熊沢喜久雄, 堀口毅, 南沢究, 河合成直, 大山卓爾

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

研究種目：Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

研究機関：The University of Tokyo

1985年～ 1987年

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落花生の共生窒素固定と乾物集積, 化合態窒素吸収の関係が調べられ, 落花生においても, 化合態窒素の過剰施用が根粒の窒素固定能を抑制し, 個体全体の同化産物集積量は増加させるが子実収量の増加はもたらさないこと, 吸収窒素の大部分がアスパラギンの形態で地上部へ移行することなどが明らかになった(熊沢). また, 子房柄の地中への侵入後, 結実圏からも葵が直接養分を吸収するが, 葵の化合態窒素吸収は, 結実圏でのCaの存在によって促進され, 子実形成に利用されることが明らかになっか(堀口). ダイズ, インゲンにおける経根吸収窒素と根粒固定窒素の動態, 根粒窒素固定に対する化合態窒素と糖の影響が調べられた. ダイズのNO3-吸収は培地濃度10〜25ppmで飽和し, アンモニアに比べて根粒へは移行しにくいが, 根粒中のアラントイン・アスパラギン蓄積を誘起することが示された(大山). また, 根粒着生ダイズでは, 非着生のものに比べて根中サイクリトールが増加し, 逆にサイクリトール(ミオイルシトール)を経根的に供給すると, 根粒着生や個体当りARAを上昇させ, また, 生育後期の根粒崩壊やARA比活性低下を抑制することが示された(河合). インゲン根粒の窒素固定能はダイズのそれに比べて化合態窒素ストレスを受けやすく, 特に硝酸の影響を受ける. 経根吸収窒素の器官分配には特に大きな差はなく, 根粒1個当りの重量がダイズよりも著しく小さくなることとの関連が注目された(有馬). ダイズ優良根粒菌としてHup+株に着目した研究が進められ, Hup+株は, 根粒菌の細胞外多糖構成単糖によって分類された一群にしか存在せず, また, Hup-株のみに集積が認められのセリノールと同一の部分構造を持つルゾビトキシンは, Hupの誘導を強く阻害することが示された(南沢).
日本における土壌,底質および植物体中有害金属元素の自然界値

浅見輝男, 南澤究, 久保田正亜

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Environmental Science

研究種目：Grant-in-Aid for Environmental Science

研究機関：Ibaraki University

1986年～ 1986年

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本研究は特には汚染の孝えられない土壌(水田,畑,森林)、湖沼底質および植物(米)中の有害金属元素含有率を求め、いわゆる自然界値を明らかにすることを目的として行ない、以下の知見を得た。 1.土壌(水田,畑,森林)の有害金属元素の自然界値:各種土壌の表土についてCd,Zn,Pb,Cu,Ni,Cr,Co,Fe,Mn,V,Sb,Biの含有率を明らかにした。この値はBowenによる世界の土壌の「中央値」と比較するとCd,Co,Vがほぼ同程度、Biが高く、それ以外の金属含有率は低かった。Iimuraによる非汚染土壌の平均値と比べるといずれの金属の含有率も低かった。環境庁による重金属自然賦存量調査の値と比べるとCd,Zn,Pb,Mnが同程度、その他の金属含有率は低かった。なお日本の土壌におけるSb,Biの自然界値についての報告は今日までない。地目別にみると水田土壌〉畑土壌≧森林土壌の傾向がCd,Pb,Ni,Cr,Co,Fe,Biについて認められた。またMclaren & CrawfodによるCuの分画法を改良し、土壌におけるCd,Zn,Pb,Cuの存在形態を明らかにした。 2.湖沼底質における有害金属元素の自然界値:霞ケ浦底質の非汚染と考えられる部分と牛久沼底質を用い、有害金属元素の平均含有率を明らかにした。土壌に比べて湖沼底質の金属含有率はCu,Ni,Co,Feがかなり高く、Cd,Cr,Sb,Biはほぼ等しかった。 3.植物(米)のCdの自然界値:人為的汚染が特には考えられない奈良県生駒郡平群町久安寺の農家保有米を集め分析したところ、50±19μg/gのCdが検出された。この値はMasironiらによるブラジル,イラン,ガテマラ,アメリカ,ドミニカ,台湾,フィジー,ペルー産米のCd含有率より高く、日本産米は外国産米に比べCd含有率が高いとする見解と一致する結果が得られた。

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社会貢献活動 11

ムーンショット国際シンポジウム

ベルサール東京日本橋

2019年12月17日～ 2019年12月18日
第１回植物微生物共生と窒素固定に関するアジア国際会議

2010年9月20日～ 2010年9月24日
東北大学開放講座「生命と地球環境」

2004年1月20日～ 2004年2月17日

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生命の巧みな環境適応のしくみについて紹介し、生物の多様な生存戦略が地球環境と人間社会に果たす役割を考える
「窒素循環を担う根圏微生物:根粒菌と窒素固定エンドファイト」

2018年10月25日～
「植物共生細菌の進化機構と育種戦略：根粒菌からマイクロバイオーム農業へ」

2018年9月22日～
JST-CRDSライフサイエンス・臨床医学ユニット科学技術未来戦略ワークショップ(植物と微生物叢の相互作用の研究開発戦略―理解・制御・応用に向けて-)

2016年12月4日～
広島大学理学研究科セミナー「植物共生細菌のゲノム進化」

2016年9月14日～

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自然界における微生物の多様性と根粒菌•マメ科植物の共生システムを概説し、根粒菌の共生アイランドの進化と葉圏細菌の染色体上のリボソームRNA消失の発見、共生微生物コミュニテイー研究の現状と展望を紹介する。
作物に共生する微生物群集について

総合技術会議科学技術連携施策群食料・生物生産研究連携群シンポジウム「生物機能を活用した食料生産・物質生産への新たな光」　東京

2010年3月2日～
作物に共生する微生物群集の包括的な理解と農業利用

平成21年度北海道農業研究センター研究会「根圏域研究が農業現場において果たすべき役割」

2009年12月22日～
ダイズ根粒菌からの温室効果ガス発生：土壌生物のランチタイム

北海道農業研究センター根圏域研究セミナー

2009年12月21日～
東北大学生命科学研究科フォーラム第１回公開シンポジウム「環境変化と生命圏の未来」

2005年3月1日～

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生命科学の視点から「環境変化と生命圏の未来」の科学的ニーズに応える研究を紹介する

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メディア報道 8

地球を冷やす?あの病気にも!?土の実力発掘SP

NHK　サイエンスZERO

2022年5月

メディア報道種別: テレビ・ラジオ番組
地球を救え！ムーンショットNEDOプログラムー微生物で温室ガス削減

日刊工業新聞

2021年9月
温室効果ガス削減へ微生物活用執筆者本人

読売新聞

2020年3月14日

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２０２０年３月１４日の読売新聞朝刊に第５７回読売農学賞「窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究」の研究内容が、微生物を使う「マクロバイオーム農業」として掲載された。特に、ダイズ根圏の温室効果ガスN2Oを無害化する根粒菌の開発およびイネ根のCH4酸化菌について分かりやすく紹介された。
ダイズ畑のN2O土着微生物で減少執筆者本人

日本経済新聞

2016年10月31日
ダイズ畑の温暖化ガス、土着微生物で減少東北大など手法開発執筆者本人

日本経済新聞

2016年10月30日
東北大、染色体上からリボソームRNA遺伝子が消えた細菌を発見執筆者本人

日経プレスリリース

2015年11月5日
根粒菌による温室効果ガスの削減（生物による初めてのN2O発生削減）

2012年11月12日

メディア報道種別: 新聞・雑誌
ゲノム解析をベースに根粒菌の窒素固定システムを解明

2005年1月31日

メディア報道種別: その他

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その他 10

東京大学大学院農学生命科学研究科「環境土壌資源論」非常勤講師
新潟大学大学院自然科学研究科「応用生命・食品科学セミナーI」非常勤講師
千葉大学大学院園芸学研究科「農業生産化学特論」非常勤講師
大豆及び畑作物の有用遺伝子の同定とDNAマーカーの開発

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根粒内エンドファイトと根粒菌の多様性解析により、ダイズ栽培環境の指標を作る研究。
エンドファイト－イネの共生相互作用の解明

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イネの微生物共生に関わる可能性のあるイネ遺伝子のtos17mutantの微生物群集構造解析とAzospirillum sp. B510株の接種効果のメカニズムを解明するもの。
微生物を利用した農耕地からの一酸化二窒素ガス発生削減技術の開発

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ダイズ根粒菌のN2O還元酵素の高い株（nosZ＋＋株）を利用した技術開発。
メタン酸化窒素固定細菌による水田メタン発生の低減化

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水田生態系で起こっているC1代謝と窒素固定の関連に着目して、メタンガスを逆にエネルギー源および炭素源として窒素固定やバイオマス生産を貢献させながら水田生態系からのメタン発生を低減化することを目的とした。
植物・微生物間共生におけるゲノム相互作用

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ゲノム情報に基づいたダイズ共生微生物の多様性と共生機構の解析
根圏微生物コミュニティーのN2O発生メカニズムの解明とその低減化

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プロモーター導入法と不均衡進化法によりNos強化株の作成と解析を行う。圃場でN2Oを発生している根粒根圏野微生物群集構造を解析し、それに基づいたN2O発生微生物の分離法の検討と室内再構成モデル系の確率を行う。根粒根圏からのN2O発生の圃場環境特異性の基礎データを得る。
温室効果ガス削減へ微生物活用

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２０２０年３月１４日の読売新聞朝刊に第５７回読売農学賞「窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究」の研究内容が、微生物を使う「マクロバイオーム農業」として掲載された。特に、ダイズ根圏の温室効果ガスN2Oを無害化する根粒菌の開発およびイネ根のCH4酸化菌について分かりやすく紹介された。

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