TOHOKU UNIVERSITY Researchers - Kiwamu Minamisawa

Details of the Researcher

Home

日本語 English

Kiwamu Minamisawa

Section

Graduate School of Life Sciences

Job title

Specially Appointed Professor(Research)

Degree

農学博士（東京大学）

researchmap

https://researchmap.jp/read0052233

J-GLOBAL ID

200901009124178482

Research History 6

2020/04 - Present

Tohoku University
2001/04 - 2020/03

Tohoku Univ.　Graduate School of Life Sciences　Professor
1996/07 - 2001/03

Tohoku University
1990/05 - 1996/06

Ibaraki University　College of Agriculture
1993/04 - 1993/09

テネシー大学　微生物学科　客員研究員
1983/10 - 1990/04

Asistant Professor, Dept. of Agriculture, Ibaraki Univ

Show all Show first 5

Education 3

The University of Tokyo　Graduate School, Division of Agricultural Science　農芸化学

- 1983/09/30
The University of Tokyo　Faculty of Agriculture　Agricultural Chemistry

- 1979/03/30
東京大学　農学博士

1986/06 -

Committee Memberships 45

International Congress on Nitrogen Fixation　International Program Committee

2013/01 - Present
Asian Conference of Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　International Advisory Committee

2013/01 - Present
Microbes and Environments　編集委員

2011/01 - Present
農林水産省農林水産技術会議事務局、環境省自然環境局　農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業研究課題評価分科会委員

2015/10 - 2018/03
European Nitrogen Fixation Congresses　International Advisory Committee

2013/01 - 2017/12
ISME Journal (国際微生物生態学会)　Senior Editor (主席編集委員)

2011/01 - 2017/12
Applied and Environmental Microbiology (米国微生物学会)　Editorial Board Member (編集委員)

2000/01 - 2017/12
農林水産省農林水産技術会議事務局、環境省自然環境局　生物多様性影響評価検討会委員

2010/06 - 2017/03
農林水産省農林水産技術会議事務局　拡散防止措置確認会議会委員

2010/06 - 2017/03
国立大学法人宮崎大学フロンティア科学実験総合センター　NBRP ミヤコグサ・ダイズ運営委員会委員

2010/06 - 2017/03
日本微生物生態学会　会長

2013/01 - 2016/12
International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-legumes　International Scientific Committee

2013/01 - 2016/12
国立大学法人東京大学大学院農学生命科学研究科　平成27年度新たな指標細菌による畜産物汚染検出法開発事業事業推進委員

2015/05 - 2016/03
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構北海道農業研究センター　外部委員(アドバイザー) 「施用効果の安定性に優れ、低コスト省力型栽培を可能にする新規微生物資材の開発」

2014/07 - 2016/03
(公社)農林水産・食品産業技術振興協会　農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業 1次(書面)審査専門評価委員

2013/04 - 2016/03
山口大学農学部、山口大学共同獣医学部　中高温微生物研究センター評価委員会委員

2014/10 - 2015/03
Plant and Cell Physiology　Associate Editor

2013/01 - 2015/03
Plant and Cell Physiology　編集委員

2013/01 - 2015/03
Molecular Plant-Microbe Interactions　Associate Editor

2012/01 - 2013/12
Molecular Plant-Microbe Interactions　編集委員

2012/01 - 2013/12
Molecular Plant-Microbe Interactions (米国植物病理学会)　Associate Editor (編集委員)

2011/01 - 2013/12
18th International Congress on Nitrogen Fixation　Chair

2012/01 - 2013/10
18th International Congress on Nitrogen Fixation　開催責任者

2012/01 - 2013/10
独立行政法人日本学術振興会　特別研究員等審査会専門委員および国際事業委員会書面審査員

2010/08 - 2011/07
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構生物系特定産業技術研究支援センター　「イノベーション創出基礎的研究推進事業」書類審査専門委員

2010/03 - 2011/03
独立行政法人農業生物資源研究所　農林水産省交付金プロジェクト研究「共生系の解明による生物制御基盤技術の開発(植物分野)」評価委員

2009/02 - 2010/02
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構生物系特定産業技術研究支援センター　「新技術・新分野創出のための基礎研究推進事業」平成２０年度終了課題の事後評価専門委員

2009/01 - 2009/03
日本学術会議研究連絡委員　微生物学研究連絡委員

2003/10 - 2006/09
農林水産省生物多様性影響評価委員会　生物多様性影響評価委員会委員

2004/02 - 2006/02
環境省　生物多様性影響評価委員

2004/04 - 2005/03
日本土壌肥料学会　欧文誌Soil Sci. Plant Nutr.編集委員

1999/04 - 2002/03
日本土壌肥料学会　土壌生物部門長

1999/04 - 2001/03
（独）農業・食品産業技術総合研究機構中央農業総合研究センター　「生物機能を活用した環境負荷低減技術の開発」外部委員

2009/01 -
日本微生物生態学会編集委員長　Editor-In-Chief of Microbes and Environments

2007/01 -
日本微生物生態学会編集委員長　Microbes and Environments雑誌編集委員長

2007/01 -
微生物生態学会学際シンポ「土壌における原生生物の多様性と微生物との相互作用」　オーガナイザー

2006/11 -
独立行政法人農業生物資源研究所評価委員　共生系プロジェクト外部評価委員

2005/05 -
独立行政法人農業生物資源研究所評価委員　共生系プロジェクト外部評価委員

2005/05 -
農業・生物系特定産業技術機構　生物機能プロジェクト外部評価委員

2004/05 -
日本微生物生態学会　代表幹事

2001/01 -
日本土壌微生物学会　代表評議員

2000/04 -
日本学術会議　微生物研究連絡委員会委員

1999/10 -
国際窒素固定会議　国際助言委員会委員

1999/06 -
日本微生物生態学会　評議員

1999/04 -
日本土壌微生物学会　評議員

1998/04 -

Show all ︎Show first 5

Professional Memberships 11

日本微生物生態学会

- Present
The Japanese Society of Plant Physiologists
Japanese Society for Bacteriology
Society of Genome Microbiology, Japan
国際窒素固定会議
植物微生物研究会
米国植物病理学会
米国微生物学会
日本農芸化学会
日本土壌微生物学会
日本土壌肥料学会

︎Show all ︎Show first 5

Research Interests 5

ゲノム
根粒菌
植物内生菌
植物微生物相互作用
symbiosis:plant-microbe interactions:endophyte:rhizobia:genome

Research Areas 4

Environmental science/Agricultural science / Landscape science /
Environmental science/Agricultural science / Environmental agriculture /
Life sciences / Applied biochemistry /
Life sciences / Plant nutrition, soil science / Soil Microbiology

Awards 13

Japan Prize of Agricultural Science

2020/04　Association of Japanese Agricultural Scientific Societies
第28回研究交流会学生優秀発表者ポスター賞

2018/09　植物微生物研究会　メドハギとダイズの根粒菌ゲノム比較と共生アイランド進化
第27回研究交流会学生優秀発表者新人賞

2017/09　植物微生物研究会　共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌共生アイランドの実験室進化
優秀ポスター賞

2017/08　環境微生物系学会合同大会2017　共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌ゲノムの実験室進化：共生アイランドの大規模欠失
第26回研究交流会学生優秀発表賞

2016/09　植物微生物研究会
2015年度日本微生物生態学会 M&E論文賞

2015/10　日本微生物生態学会　Low nitrogen fertilization adapts rice root microbiome to low nutrient environment by changing biogeochemical functions
生命医薬情報連合大会2015 ポスター賞

2015/10　日本バイオインフォマティクス学会　Metagenome-mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia
日本微生物生態学会ポスター賞

2013/11　日本微生物生態学会　アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N2O発生の特定
日本土壌肥料学会ポスター賞

2013/09　日本土壌肥料学会　ダイズ根粒菌におけるN2O還元酵素活性を制御している遺伝子の同定とN2O削減への利用
第22回研究交流会学生優秀発表賞

2012/09　植物微生物研究会　Aurantimonas 属細菌 AU20 株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する
21世紀発明奨励賞

2011/06/20　社団法人発明協会　遺伝子導入用スーパーアグロバクテリウムの発明
日本土壌肥料学会賞

2003/04/01　日本土壌肥料学会　共生窒素固定細菌の遺伝生態に関する研究
日本土壌肥料学会奨励賞

1987/04/01　日本土壌肥料学会　優良ダイズ根粒菌に関する研究

Show all ︎Show 5

Papers 276

Mitigating nitrous oxide emission by an ultra-fast bioprocess enabling the removal of high concentration N₂O

Ryota Maeda, Mikiko Sato, Kiwamu Minamisawa, Kengo Kubota

2024/10/08
Publisher: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI： 10.1101/2024.10.08.615939 　

More details Close

Abstract Nitrous oxide (N₂O) is known as a greenhouse gas as well as an ozone-depleting substance. Wastewater treatment process is one of the sources of N₂O emission, and the high concentrations of N₂O in off-gas were reported from an anaerobic ammonium oxidation process. This study developed a novel N₂O removal process using a down-flow hanging sponge reactor to remove high concentrations of N₂O. More than 96% removal efficiencies were achieved for up to 300 ppm N₂O with 3 min gas retention time (GRT), and more than 99% removal efficiency was obtained for 2,000 ppm N₂O with 18 min GRT. A maximum removal rate of 161 ± 26 mg-N/L-reactor/day was achieved, that was over 10 times faster than the pioneering process. Kinetic analysis indicated that the N₂O dissolution rate is a crucial factor in determining the N₂O removal rate in the reactor. Various N₂O reducers belonging to both clade I and II were detected in reactors, andAzonexuswas thought to play a key role.
P3-1-25 ダイズ根粒菌接種は土壌細菌叢を変化させるか？ -土地利用の影響との比較-（3-1 土壌生物の生態と機能 2024年度福岡大会）

原新太郎, 柿崎芳里, 番場大, 板倉学, 菅原雅之, 鈴木淳夫, 佐々木勇麻, 武田真憲, 多胡香奈子, 大林翼, 青野俊裕, 島田紘明, 新宮原諒, 増田幸子, 柴田ありさ, 白須賢, 和穎朗太, 秋山博子, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　70　36-36　2024/08/26
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.70.0_36_3 　

ISSN： 0288-5840

eISSN： 2424-0575
P8-2-21 Bradyrhizobium ottawaense SG09接種によるダイズ根粒由来N₂O削減効果のポットスケール検証（8-2 地球環境 2024年度福岡大会）

坪倉美紗, 原新太郎, 武田真憲, 佐々木勇麻, 南澤究, 秋山博子

日本土壌肥料学会講演要旨集　70　162-162　2024/08/26
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.70.0_162_3 　

ISSN： 0288-5840

eISSN： 2424-0575
Dynamics of N2O production and reduction processes in a soybean field revealed by isotopocule analyses Peer-reviewed

Sakae Toyoda, Fadwa Damak, Shohei Hattori, Masanori Takeda, Hiroko Akiyama, Yuma Sasaki, Kiwamu Minamisawa

Soil Biology and Biochemistry　191　109358-109358　2024/04
Publisher: Elsevier BV
DOI： 10.1016/j.soilbio.2024.109358 　

ISSN： 0038-0717
Does Rhizobial Inoculation Change the Microbial Community in Field Soils? A‍ ‍Comparison with Agricultural Land-use Changes

Shintaro Hara, Kaori Kakizaki, Masaru Bamba, Manabu Itakura, Masayuki Sugawara, Atsuo Suzuki, Yuma Sasaki, Masanori Takeda, Kanako Tago, Tsubasa Ohbayashi, Toshihiro Aono, Luciano Nobuhiro Aoyagi, Hiroaki Shimada, Ryo Shingubara, Sachiko Masuda, Arisa Shibata, Ken Shirasu, Rota Wagai, Hiroko Akiyama, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　39　(3)　n/a-n/a　2024
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.me24006 　

ISSN： 1342-6311

eISSN： 1347-4405
Bradyrhizobium ottawaense efficiently reduces nitrous oxide through high nosZ gene expression Peer-reviewed

Sawa Wasai-Hara, Manabu Itakura, Arthur Fernandes Siqueira, Daisaku Takemoto, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Noritoshi Inagaki, Toshimasa Yamazaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Yoshikazu Shimoda, Kiwamu Minamisawa

Scientific Reports　13　(1)　2023/11/01
Publisher: Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41598-023-46019-w 　

eISSN： 2045-2322

More details Close

Abstract N₂O is an important greenhouse gas influencing global warming, and agricultural land is the predominant (anthropogenic) source of N₂O emissions. Here, we report the high N₂O-reducing activity of Bradyrhizobium ottawaense, suggesting the potential for efficiently mitigating N₂O emission from agricultural lands. Among the 15 B. ottawaense isolates examined, the N₂O-reducing activities of most (13) strains were approximately five-fold higher than that of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110^T under anaerobic conditions. This robust N₂O-reducing activity of B. ottawaense was confirmed by N₂O reductase (NosZ) protein levels and by mitigation of N₂O emitted by nodule decomposition in laboratory system. While the NosZ of B. ottawaense and B. diazoefficiens showed high homology, nosZ gene expression in B. ottawaense was over 150-fold higher than that in B. diazoefficiens USDA110^T, suggesting the high N₂O-reducing activity of B. ottawaense is achieved by high nos expression. Furthermore, we examined the nos operon transcription start sites and found that, unlike B. diazoefficiens, B. ottawaense has two transcription start sites under N₂O-respiring conditions, which may contribute to the high nosZ expression. Our study indicates the potential of B. ottawaense for effective N₂O reduction and unique regulation of nos gene expression towards the high performance of N₂O mitigation in the soil.
Synergistic N2-fixation and salt stress mitigation in soybean through dual inoculation of ACC deaminase-producing Pseudomonas and Bradyrhizobium Peer-reviewed

Khin Thuzar Win, Sawa Wasai-Hara, Fukuyo Tanaka, Aung Zaw Oo, Kiwamu Minamisawa, Yoshikazu Shimoda, Haruko Imaizumi-Anraku

Scientific Reports　13　(1)　2023/10/10
Publisher: Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41598-023-43891-4 　

eISSN： 2045-2322

More details Close

Abstract We investigated the potential dual application of two Bradyrhizobium strains (B. diazoefficiens USDA110 and B. ottawaense SG09) and plant growth-promoting bacteria, PGPB (Pseudomonas spp.: OFT2 and OFT5), to improve nodulation and N₂-fixation in soybean plants. The growth-promoting effects of dual inoculation were observed on plant growth, physiology, and nodulation of soybean under normal conditions compared with plants individually inoculated with either USDA110 or SG09. Both OFT2 and OFT5 promoted N₂-fixation by 11% and 56%, respectively, when dual inoculation with USDA110 and by 76% and 81%, respectively, when dual inoculation with SG09. Salinity stress significantly reduces soybean growth, physiology, nutrient uptake, nodulation, and N₂-fixation. However, these adverse effects were attenuated by the dual inoculation of PGPB and rhizobia depending on the combination of inoculants. In particular, dual inoculation of PGPB with SG09 was more effective in enhancing the salt tolerance of soybean by reducing salt-induced ethylene production and improving nutrient uptake. However, no such effect was observed with the combined inoculation of USDA110 and OFT5. An effective symbiotic association between SG09 and two Pseudomonas bacteria can be considered a beneficial approach to improving the symbiotic efficiency of nodulation and mitigating salinity stress in soybeans.
Seasonal Shifts in Bacterial Community Structures in the Lateral Root of Sugar Beet Grown in an Andosol Field in Japan Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Kazuyuki Okazaki, Hiroyuki Takahashi, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　38　(1)　n/a-n/a　2023/02
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.me22071 　

ISSN： 1342-6311

eISSN： 1347-4405
Emission of N₂O from soybean field and its production processes

Sakae Toyoda, Fadwa Damak, Masanori Takeda, Hiroko Akiyama, Yuma Sasaki, Kiwamu Minamisawa

Abstracts of Annual Meeting of the Geochemical Society of Japan　70　141　2023
Publisher: GEOCHEMICAL SOCIETY OF JAPAN
DOI： 10.14862/geochemproc.70.0_141 　
Mitigation of greenhouse gas emission by nitrogen-fixing bacteria. Peer-reviewed

Kiwamu Minamisawa

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry　87(1):　7-12　2022/12

DOI： 10.1093/bbb/zbac177. 　
Strains of Bradyrhizobium barranii sp. nov associated with legumes native to Canada are symbionts of soybeans and belong to different subspecies (subsp. barranii subsp. nov. and subsp. apii subsp. nov) and symbiovars (sv. glycinearum and sv. septentrionale) Peer-reviewed

Eden S, P. Bromfield, Cloutier S, Wasai-Hara S, Minamisawa K

Int J Syst Evol Microbiol　72(10)　2022/10

DOI： 10.1099/ijsem.0.005549 　
In Vivo Evidence of Single ¹³ C and ¹⁵ N Isotope–Labeled Methanotrophic Nitrogen-Fixing Bacterial Cells in Rice Roots

Shintaro Hara, Naohisa Wada, Sliver Sung-Yun Hsiao, Meng Zhang, Zhihua Bao, Yoshiyuki Iizuka, Der-Chuen Lee, Shusei Sato, Sen-Lin Tang, Kiwamu Minamisawa

mBio　13　(3)　2022/06/28
Publisher: American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/mbio.01255-22 　

eISSN： 2150-7511

More details Close

Atmospheric methane concentrations have been continually increasing, causing methane to become a considerable environmental concern. Methanotrophy may be the key to regulating methane fluxes.
Evolution of rhizobial symbiosis islands through insertion sequence-mediated deletion and duplication Peer-reviewed

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Ryota Noda, Kaori Kakizaki, Satoshi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

The ISME Journal　16　(1)　112-121　2022/01
Publisher: Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41396-021-01035-4 　

ISSN： 1751-7362

eISSN： 1751-7370

More details Close

<title>Abstract</title>Symbiosis between organisms influences their evolution via adaptive changes in genome architectures. Immunity of soybean carrying the <italic>Rj2</italic> allele is triggered by NopP (type III secretion system [T3SS]-dependent effector), encoded by symbiosis island A (SymA) in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA122. This immunity was overcome by many mutants with large SymA deletions that encompassed T3SS (<italic>rhc</italic>) and N₂ fixation (<italic>nif</italic>) genes and were bounded by insertion sequence (IS) copies in direct orientation, indicating homologous recombination between ISs. Similar deletion events were observed in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA110 and <italic>B. japonicum</italic> J5. When we cultured a USDA122 strain with a marker gene <italic>sacB</italic> inserted into the <italic>rhc</italic> gene cluster, most sucrose-resistant mutants had deletions in <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters, similar to the mutants above. Some deletion mutants were unique to the <italic>sacB</italic> system and showed lower competitive nodulation capability, indicating that IS-mediated deletions occurred during free-living growth and the host plants selected the mutants. Among 63 natural bradyrhizobial isolates, 2 possessed long duplications (261–357 kb) harboring <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters between IS copies in direct orientation via homologous recombination. Therefore, the structures of symbiosis islands are in a state of flux via IS-mediated duplications and deletions during rhizobial saprophytic growth, and host plants select mutualistic variants from the resultant pools of rhizobial populations. Our results demonstrate that homologous recombination between direct IS copies provides a natural mechanism generating deletions and duplications on symbiosis islands.
Community analysis-based screening of plant growth-promoting bacteria for sugar beet Peer-reviewed

Kazuyuki Okazaki, Hirohito Tsurumaru, Megumi Hashimoto, Hiroyuki Takahashi, Takashi Okubo, Takuji Ohwada, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

Microbes and Environments　36　(2)　ME20137　2021/04

DOI： 10.1264/jsme2.ME20137 　

More details Close

Clone libraries of bacterial 16S rRNA genes (a total of 1,980 clones) were constructed from the leaf blades, petioles, taproots, and lateral roots of sugar beet (Beta vulgaris L.) grown under different fertilization conditions. A principal coordinate analysis revealed that the structures of bacterial communities in above- and underground tissues were largely separated by PC1 (44.5%). The bacterial communities of above-ground tissues (leaf blades and petioles) were more tightly clustered regardless of differences in the tissue types and fertilization conditions than those of below-ground tissues (taproots and lateral roots). The bacterial communities of below-ground tissues were largely separated by PC2 (26.0%). To survey plant growth-promoting bacteria (PGPBs), isolate collections (a total of 665 isolates) were constructed from the lateral roots. As candidate PGPBs, 44 isolates were selected via clustering analyses with the combined 16S rRNA gene sequence data of clone libraries and isolate collections. The results of inoculation tests using sugar beet seedlings showed that eight isolates exhibited growth-promoting effects on the seedlings. Among them, seven isolates belonging to seven genera (Asticcacaulis, Mesorhizobium, Nocardioides, Sphingobium, Sphingomonas, Sphingopyxis, and Polaromonas) were newly identified as PGPBs for sugar beet at the genus level, and two isolates belonging to two genera (Asticcacaulis and Polaromonas) were revealed to exert growth-promoting effects on the plant at the genus level for the first time. These results suggest that a community analysis-based selection strategy will facilitate the isolation of novel PGPBs and extend the potential for the development of novel biofertilizers.
Strains of Bradyrhizobium cosmicum sp. nov., isolated from contrasting habitats in Japan and Canada possess photosynthesis gene clusters with the hallmark of genomic islands

Sawa Wasai-Hara, Kiwamu Minamisawa, Sylvie Cloutier, Eden S. P. Bromfield

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology　70　(9)　5063-5074　2020/09/01
Publisher: Microbiology Society
DOI： 10.1099/ijsem.0.004380 　

ISSN： 1466-5026

eISSN： 1466-5034

More details Close

The taxonomic status of two previously characterized <italic> <named-content content-type="genus"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.1459" xlink:type="simple">Bradyrhizobium</ext-link> </named-content> </italic> strains (58S1^T and S23321) isolated from contrasting habitats in Canada and Japan was verified by genomic and phenotypic analyses. Phylogenetic analyses of five and 27 concatenated protein-encoding core gene sequences placed both strains in a highly supported lineage distinct from named species in the genus <italic> <named-content content-type="genus"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.1459" xlink:type="simple">Bradyrhizobium</ext-link> </named-content> </italic> with <italic> <named-content content-type="species"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.8517" xlink:type="simple">Bradyrhizobium betae</ext-link> </named-content> </italic> as the closest relative. Average nucleotide identity values of genome sequences between the test and reference strains were between 84.5 and 94.2 %, which is below the threshold value for bacterial species circumscription. The complete genomes of strains 58S1^T and S23321 consist of single chromosomes of 7.30 and 7.23 Mbp, respectively, and do not have symbiosis islands. The genomes of both strains have a G+C content of 64.3 mol%. Present in the genome of these strains is a photosynthesis gene cluster (PGC) containing key photosynthesis genes. A tRNA gene and its partial tandem duplication were found at the boundaries of the PGC region in both strains, which is likely the hallmark of genomic island insertion. Key nitrogen-fixation genes were detected in the genomes of both strains, but nodulation and type III secretion system genes were not found. Sequence analysis of the nitrogen fixation gene, <italic>nifH</italic>, placed 58S1^T and S23321 in a novel lineage distinct from described <italic> <named-content content-type="genus"> <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="http://doi.org/10.1601/nm.1459" xlink:type="simple">Bradyrhizobium</ext-link> </named-content> </italic> species. Data for phenotypic tests, including growth characteristics and carbon source utilization, supported the sequence-based analyses. Based on the data presented here, a novel species with the name <italic>Bradyrhizobium cosmicum</italic> sp. nov. is proposed with 58S1^T (=LMG 31545^T=HAMBI 3725^T) as the type strain.
Levels of Periplasmic Nitrate Reductase during Denitrification are Lower in Bradyrhizobium japonicum than in Bradyrhizobium diazoefficiens Peer-reviewed

Arthur Fernandes Siqueira, Masayuki Sugawara, Haruka Arashida, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

Microbes and Environments　35　(3)　n/a-n/a　2020/06
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.me19129 　

ISSN： 1342-6311

eISSN： 1347-4405
Diversity of Bradyrhizobium in Non-Leguminous Sorghum Plants: B. ottawaense Isolates Unique in Genes for N2O Reductase and Lack of the Type VI Secretion System Peer-reviewed

Sawa Wasai-Hara, Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Masayuki Sugawara, Hideto Takami, Junich Yoneda, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　35　(1)　2020/01

DOI： 10.1264/jsme2.ME19102 　

ISSN： 1342-6311
Growth Stage-dependent Bacterial Communities in Soybean Plant Tissues: Methylorubrum Transiently Dominated in the Flowering Stage of the Soybean Shoot.

Shintaro Hara, Masatoshi Matsuda, Kiwamu Minamisawa

Microbes and environments　34　(4)　446-450　2019/12/27

DOI： 10.1264/jsme2.ME19067 　

More details Close

Plant-associated bacteria are critical for plant growth and health. However, the effects of plant growth stages on the bacterial community remain unclear. Analyses of the microbiome associated with field-grown soybean revealed a marked shift in the bacterial community during the growth stages. The relative abundance of Methylorubrum in the leaf and stem increased from 0.2% to more than 45%, but decreased to approximately 15%, with a peak at the flowering stage at which nitrogen metabolism changed in the soybean plant. These results suggest the significance of a time-series analysis for understanding the relationship between the microbial community and host plant physiology.
Molecular analyses of the distribution and function of diazotrophic rhizobia and methanotrophs in the tissues and rhizosphere of non-Leguminous plants. Peer-reviewed

Yoneyama T, Terakado-Tonooka J, Bao Z, and Minamisawa K.

Plants (Basel)　8　(10)　408　2019/10
Nitrogen cycling in soybean rhizosphere: Sources and sinks of nitrous oxide (N2O). Peer-reviewed

Cristina Sánchez, and Kiwamu Minamisawa.

Frontiers in Microbiology　10　1943　2019/08
Growth stage-dependent bacterial communities in soybean plant tissues: Methylorubrum transiently dominated in the flowering stage of soybean shoot. Peer-reviewed

Shintaro Hara, Masatoshi Matsuda, and Kiwamu Minamisawa.

Microbes and Environments　34　(4)　446-450　2019/08
Identification of genes regulated by the antitermination factor NasT during denitrification in Bradyrhizobium diazoefficiens. Peer-reviewed

Cristina Sánchez, Arthur Fernandes Siqueira, Hisayuki Mitsui, and Kiwamu Minamisawa.

Microbes Environ.　34　(3)　260-267　2019/06
Identification of nitrogen-fixing Bradyrhizobium associated with roots of field-grown sorghum by metagenome and proteome analyses Peer-reviewed

Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Sawa Wasai, Yasuhiro Kasahara, Taichi Koshiba, Kiyoshi Yamazaki, Toru Fujiwara, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

Frontiers in Microbiology　10　(407)　2019/03

DOI： 10.3389/fmicb.2019.00407 　
Symbiotic incompatibility between soybean and Bradyrhizobium arises from one amino acid determinant in soybean Rj2 protein. International-journal Peer-reviewed

Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

PloS one　14　(9)　e0222469　2019

DOI： 10.1371/journal.pone.0222469 　

More details Close

Cultivated soybean (Glycine max) carrying the Rj2 allele restricts nodulation with specific Bradyrhizobium strains via host immunity, mediated by rhizobial type III secretory protein NopP and the host resistance protein Rj2. Here we found that the single isoleucine residue I490 in Rj2 is required for induction of symbiotic incompatibility. Furthermore, we investigated the geographical distribution of the Rj2-genotype soybean in a large set of germplasm by single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping using a SNP marker for I490. By allelic comparison of 79 accessions in the Japanese soybean mini-core collection, we suggest substitution of a single amino acid residue (R490 to I490) in Rj2 induces symbiotic incompatibility with Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122. The importance of I490 was verified by complementation of rj2-soybean by the dominant allele encoding the Rj2 protein containing I490 residue. The Rj2 allele was also found in Glycine soja, the wild progenitor of G. max, and their single amino acid polymorphisms were associated with the Rj2-nodulation phenotype. By SNP genotyping against 1583 soybean accessions, we detected the Rj2-genotype in 5.4% of G. max and 7.7% of G. soja accessions. Distribution of the Rj2-genotype soybean plants was relatively concentrated in the temperate Asian region. These results provide important information about the mechanism of host genotype-specific symbiotic incompatibility mediated by host immunity and suggest that the Rj2 gene has been maintained by environmental conditions during the process of soybean domestication.
CH4 oxidation-dependent 15N2 fixation in rice roots in a low-nitrogen paddy field and in Methylosinus sp. strain 3S-1 isolated from the roots Peer-reviewed

Ryo Shinoda, Zhihua Bao, Kiwamu Minamisawa

Soil Biology and Biochemistry　132　40-46　2019/01

DOI： 10.1016/j.soilbio.2019.01.021 　
Publisher Correction: Core microbiomes for sustainable agroecosystems. International-journal

Hirokazu Toju, Kabir G Peay, Masato Yamamichi, Kazuhiko Narisawa, Kei Hiruma, Ken Naito, Shinji Fukuda, Masayuki Ushio, Shinji Nakaoka, Yusuke Onoda, Kentaro Yoshida, Klaus Schlaeppi, Yang Bai, Ryo Sugiura, Yasunori Ichihashi, Kiwamu Minamisawa, E Toby Kiers

Nature plants　4　(9)　733-733　2018/09

DOI： 10.1038/s41477-018-0245-3 　

More details Close

Owing to a technical error, this Perspective was originally published without its received and accepted dates; the dates "Received: 31 December 2017; Accepted: 23 March 2018" have now been included in all versions.
Variation in bradyrhizobial NopP effector determines symbiotic incompatibility with Rj2-soybeans via effector-triggered immunity International-journal Peer-reviewed

Masayuki Sugawara, Satoko Takahashi, Yosuke Umehara, Hiroya Iwano, Hirohito Tsurumaru, Haruka Odake, Yuta Suzuki, Hitoshi Kondo, Yuki Konno, Takeo Yamakawa, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Nature Communications　9　(1)　3139-3139　2018/08

DOI： 10.1038/s41467-018-05663-x 　

More details Close

Genotype-specific incompatibility in legume-rhizobium symbiosis has been suggested to be controlled by effector-triggered immunity underlying pathogenic host-bacteria interactions. However, the rhizobial determinant interacting with the host resistance protein (e.g., Rj2) and the molecular mechanism of symbiotic incompatibility remain unclear. Using natural mutants of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, we identified a type III-secretory protein NopP as the determinant of symbiotic incompatibility with Rj2-soybean. The analysis of nopP mutations and variants in a culture collection reveal that three amino acid residues (R60, R67, and H173) in NopP are required for Rj2-mediated incompatibility. Complementation of rj2-soybean by the Rj2 allele confers the incompatibility induced by USDA 122-type NopP. In response to incompatible strains, Rj2-soybean plants activate defense marker gene PR-2 and suppress infection thread number at 2 days after inoculation. These results suggest that Rj2-soybeans monitor the specific variants of NopP and reject bradyrhizobial infection via effector-triggered immunity mediated by Rj2 protein.
Mapping of quantitative trait loci related to primary rice root growth as a response to inoculation with Azospirillum sp. strain B510 International-journal Peer-reviewed

Sachiko Masuda, Kazuhiro Sasaki, Yuri Kazama, Chiharu Kisara, Shoko Takeda, Eiko Hanzawa, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Sato

Commun Integr Biol.　11　(3)　1-6　2018/07

DOI： 10.1080/19420889.2018.1502586. 　

More details Close

Azospirillum sp. strain B510 has been known as the plant growth-promoting endophyte; however, the growth-promotion effect is dependent on the plant genotype. Here, we aimed to identify quantitative trait loci (QTL) related to primary root length in rice at the seedling stage as a response to inoculation with B510. The primary root length of "Nipponbare" was significantly reduced by inoculation with B510, whereas that of "Kasalath" was not affected. Thus, we examined 98 backcrossed inbred lines and four chromosome segment substitution lines (CSSL) derived from a cross between Nipponbare and Kasalath. The primary root length was measured as a response to inoculation with B510, and the relative root length (RRL) was calculated based on the response to non-inoculation. Three QTL alleles, qRLI-6 and qRLC-6 on Chromosome (Chr.) 6 and qRRL-7 on Chr. 7 derived from Kasalath increased primary root length with inoculation (RLI), without inoculation, (RLC) and RRL and explained 20.2%, 21.3%, and 11.9% of the phenotypic variation, respectively. CSSL33, in which substitution occurred in the vicinity region of qRRL-7, showed a completely different response to inoculation with B510 compared with Nipponbare. Therefore, we suggest that qRRL-7 might strongly control root growth in response to inoculation with Azospirillum sp. strain B510.
Core microbiomes for sustainable agroecosystems. Peer-reviewed

Hirokazu Toju, Kabir G. Peay, Masato Yamamichi, Kazuhiko Narisawa, Kei Hiruma, Ken Naito, Shinji Fukuda, Masayuki Ushio, Shinji Nakaoka, Yusuke Onoda, Kentaro Yoshida, Klaus Schlaeppi, Yang Bai, Ryo Sugiura, Yasunori Ichihashi, Kiwamu Minamisawa, E. Toby Kiers

Nat Plants.　4　(5)　247-257　2018/04

DOI： 10.1038/s41477-018-0139-4. 　
Plant-associated microbes: From rhizobia to plant microbiomes Peer-reviewed

Sawa Wasai, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　33　(1)　1-3　2018
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.1264/jsme2.ME3301rh 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Involvement of ethylene signaling in Azospirillum sp B510-induced disease resistance in rice Peer-reviewed

Miyuki Kusajima, Shuhei Shima, Moeka Fujita, Kiwamu Minamisawa, Fang-Sik Che, Hiromoto Yamakawa, Hideo Nakashita

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　82　(9)　1522-1526　2018

DOI： 10.1080/09168451.2018.1480350 　

ISSN： 0916-8451

eISSN： 1347-6947
Redundant roles of Bradyrhizobium oligotrophicum Cu-type (NirK) and cd1-type (NirS) nitrite reductase genes under denitrifying conditions Peer-reviewed

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

FEMS Microbiol Lett.　365　(5)　2018/01

DOI： 10.1093/femsle/fny015. 　
Anaerobic Reduction of Nitrate to Nitrous Oxide Is Lower in Bradyrhizobium japonicum than in Bradyrhizobium diazoefficiens Peer-reviewed

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sanchez

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　398-401　2017/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME17081 　

ISSN： 1342-6311
Nitrate Supply-Dependent Shifts in Communities of Root-Associated Bacteria in Arabidopsis Peer-reviewed

Noriyuki Konishi, Takashi Okubo, Tomoyuki Yamaya, Toshihiko Hayakawa, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　314-323　2017/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME17031 　

ISSN： 1342-6311
Expression of Two RpoH Sigma Factors in Sinorhizobium meliloti upon Heat Shock Peer-reviewed

Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　394-397　2017/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME17087 　

ISSN： 1342-6311
Assessment of bacterial communities of black soybean grown in fields Peer-reviewed

Akifumi Sugiyama, Yusuke Unno, Ui Ono, Emon Yoshikawa, Hideyuki Suzuki, Kiwamu Minamisawa, Kazufumi Yazaki

Communicative and Integrative Biology　10　(5-6)　e1378290　2017/11/02
Publisher: Taylor and Francis Inc.
DOI： 10.1080/19420889.2017.1378290 　

ISSN： 1942-0889

eISSN： 1942-0889
Exploration of bacterial N2-fixation systems in association with soil-grown sugarcane, sweet potato, and paddy rice: a review and synthesis Peer-reviewed

Tadakatsu Yoneyama, Junko Terakado-Tonooka, Kiwamu Minamisawa

Soil Science and Plant Nutrition　63　(6)　578-590　2017/11/02
Publisher: Taylor and Francis Ltd.
DOI： 10.1080/00380768.2017.1407625 　

ISSN： 1747-0765 0038-0768
Regulation of nitrous oxide reductase genes by NasT-mediated transcription antitermination in Bradyrhizobium diazoefficiens Peer-reviewed

Cristina Sanchez, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS　9　(4)　389-396　2017/08

DOI： 10.1111/1758-2229.12543 　

ISSN： 1758-2229
Effect of Flooding and the nosZ Gene in Bradyrhizobia on Bradyrhizobial Community Structure in the Soil Peer-reviewed

Yuichi Saeki, Misato Nakamura, Maria Luisa T. Mason, Tsubasa Yano, Sokichi Shiro, Reiko Sameshima-Saito, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Akihiro Yamamoto

MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(2)　154-163　2017/06

DOI： 10.1264/jsme2.ME16132 　

ISSN： 1342-6311
Complete genome sequence of Bradyrhizobium japonicum J5, isolated from a soybean nodule in Hokkaido, Japan Peer-reviewed

Kazuma Kanehara, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　5　(6)　e01619-16　2017
Publisher: American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.01619-16 　

ISSN： 2169-8287
Complete genome sequence of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, a nitrogen-fixing soybean symbiont Peer-reviewed

Masayuki Sugawara, Takahiro Tsukui, Takakazu Kaneko, Yoshiyuki Ohtsubo, Shusei Sato, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　5　(9)　e01743-16　2017
Publisher: American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.01743-16 　

ISSN： 2169-8287
Effects of colonization of a bacterial endophyte, Azospirillum sp B510, on disease resistance in tomato Peer-reviewed

Moeka Fujita, Miyuki Kusajima, Yasuko Okumura, Masami Nakajima, Kiwamu Minamisawa, Hideo Nakashita

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　81　(8)　1657-1662　2017

DOI： 10.1080/09168451.2017.1329621 　

ISSN： 0916-8451

eISSN： 1347-6947
Mitigation of soil N2O emission by inoculation with a mixed culture of indigenous Bradyrhizobium diazoefficiens Peer-reviewed

Hiroko Akiyama, Yuko Takada Hoshino, Manabu Itakura, Yumi Shimomura, Yong Wang, Akinori Yamamoto, Kanako Tago, Yasuhiro Nakajima, Kiwamu Minamisawa, Masahito Hayatsu

SCIENTIFIC REPORTS　6　32869　2016/09

DOI： 10.1038/srep32869 　

ISSN： 2045-2322
A Sinorhizobium meliloti RpoH-Regulated Gene Is Involved in Iron-Sulfur Protein Metabolism and Effective Plant Symbiosis under Intrinsic Iron Limitation Peer-reviewed

Shohei Sasaki, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

JOURNAL OF BACTERIOLOGY　198　(17)　2297-2306　2016/09

DOI： 10.1128/JB.00287-16 　

ISSN： 0021-9193

eISSN： 1098-5530
Origin and Evolution of Nitrogen Fixation Genes on Symbiosis Islands and Plasmid in Bradyrhizobium Peer-reviewed

Takashi Okubo, Pongdet Piromyou, Panlada Tittabutr, Neung Teaumroong, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　260-267　2016/09

DOI： 10.1264/jsme2.ME15159 　

ISSN： 1342-6311
Metagenomic Analysis Revealed Methylamine and Ureide Utilization of Soybean-Associated Methylobacterium Peer-reviewed

Tomoyuki Minami, Misue Anda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　268-278　2016/09

DOI： 10.1264/jsme2.ME16035 　

ISSN： 1342-6311
Growth Rate of and Gene Expression in Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110 due to a Mutation in blr7984, a TetR Family Transcriptional Regulator Gene Peer-reviewed

Naoko Ohkama-Ohtsu, Haruna Honma, Mariko Nakagome, Maki Nagata, Hiroko Yamaya-Ito, Yoshiaki Sano, Norina Hiraoka, Takaaki Ikemi, Akihiro Suzuki, Shin Okazaki, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Yokoyama

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　249-259　2016/09

DOI： 10.1264/jsme2.ME16056 　

ISSN： 1342-6311
Nitrogen fixation and nifH diversity in human gut microbiota Peer-reviewed

Katsura Igai, Manabu Itakura, Suguru Nishijima, Hirohito Tsurumaru, Wataru Suda, Takumi Tsutaya, Eriko Tomitsuka, Kiyoshi Tadokoro, Jun Baba, Shingo Odani, Kazumi Natsuhara, Ayako Morita, Minoru Yoneda, Andrew R. Greenhill, Paul F. Horwood, Jun-ichi Inoue, Moriya Ohkuma, Yuichi Hongoh, Taro Yamamoto, Peter M. Siba, Masahira Hattori, Kiwamu Minamisawa, Masahiro Umezaki

SCIENTIFIC REPORTS　6　31942　2016/08

DOI： 10.1038/srep31942 　

ISSN： 2045-2322
Identification of the Hydrogen Uptake Gene Cluster for Chemolithoautotrophic Growth and Symbiosis Hydrogen Uptake in Bradyrhizobium Diazoefficiens Peer-reviewed

Sachiko Masuda, Masaki Saito, Chiaki Sugawara, Manabu Itakura, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　76-78　2016/03

DOI： 10.1264/jsme2.ME15182 　

ISSN： 1342-6311
Sulfur Fertilization Changes the Community Structure of Rice Root-, and Soil-Associated Bacteria Peer-reviewed

Sachiko Masuda, Zhihua Bao, Takashi Okubo, Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Ryo Shinoda, Mizue Anda, Ryuji Kondo, Yumi Mori, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　70-75　2016/03

DOI： 10.1264/jsme2.ME15170 　

ISSN： 1342-6311
Are Symbiotic Methanotrophs Key Microbes for N Acquisition in Paddy Rice Root? Peer-reviewed

Kiwamu Minamisawa, Haruko Imaizumi-Anraku, Zhihua Bao, Ryo Shinoda, Takashi Okubo, Seishi Ikeda

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　4-10　2016/03

DOI： 10.1264/jsme2.ME15180 　

ISSN： 1342-6311
Visualization of NO3-/NO2- Dynamics in Living Cells by Fluorescence Resonance Energy Transfer ( FRET) Imaging Employing a Rhizobial Two-component Regulatory System Peer-reviewed

Masafumi Hidaka, Aina Gotoh, Taiki Shimizu, Kiwamu Minamisawa, Hiromi Imamura, Takafumi Uchida

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY　291　(5)　2260-2269　2016/01

DOI： 10.1074/jbc.M115.687632 　

ISSN： 0021-9258

eISSN： 1083-351X
Complete genome sequence of Methylobacterium sp. strain AMS5, an isolate from a soybean stem Peer-reviewed

Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　4　(2)　e00144-16　2016
Publisher: American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.00144-16 　

ISSN： 2169-8287
Draft genome sequence of Methylosinus sp. strain 3S-1, an isolate from rice root in a low-nitrogen paddy field Peer-reviewed

Zhihua Bao, Ryo Shinoda, Kiwamu Minamisawa

Genome Announcements　4　(5)　e00932-16　2016
Publisher: American Society for Microbiology
DOI： 10.1128/genomeA.00932-16 　

ISSN： 2169-8287
The Type III Secretion System (T3SS) is a Determinant for Rice-Endophyte Colonization by Non-Photosynthetic Bradyrhizobium Peer-reviewed

Pongdet Piromyou, Pongpan Songwattana, Teerana Greetatorn, Takashi Okubo, Kaori Chiba Kakizaki, Janpen Prakamhang, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Neung Teaumroong, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　30　(4)　291-300　2015/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME15080 　

ISSN： 1342-6311
Possible Role of 1-Aminocyclopropane-1-Carboxylate (ACC) Deaminase Activity of Sinorhizobium sp BL3 on Symbiosis with Mung Bean and Determinate Nodule Senescence Peer-reviewed

Panlada Tittabutr, Sudarat Sripakdi, Nantakorn Boonkerd, Waraporn Tanthanuch, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

MICROBES AND ENVIRONMENTS　30　(4)　310-320　2015/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME15120 　

ISSN： 1342-6311
Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome Peer-reviewed

Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA　112　(46)　14343-14347　2015/11

DOI： 10.1073/pnas.1514326112 　

ISSN： 0027-8424
Symbiosis Island Shuffling with Abundant Insertion Sequences in the Genomes of Extra-Slow-Growing Strains of Soybean Bradyrhizobia Peer-reviewed

Takayuki Iida, Manabu Itakura, Mizue Anda, Masayuki Sugawara, Tsuyoshi Isawa, Takashi Okubo, Shusei Sato, Kaori Chiba-Kakizaki, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　81　(12)　4143-4154　2015/06

DOI： 10.1128/AEM.00741-15 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Peribacteroid solution of soybean root nodules partly induces genomic loci for differentiation into bacteroids of free-living Bradyrhizobium japonicum cells Peer-reviewed

Naoko Ohkama-Ohtsu, Sachiko Ichida, Hiroko Yamaya, Takuji Ohwada, Manabu Itakura, Yoshino Hara, Hisayuki Mitsui, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kouhei Tejima, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Makoto Hayashi, Takaki Maekawa, Yoshikatsu Murooka, Shigeyuki Tajima, Kenshiro Simomura, Mika Nomura, Toshiki Uchiumi, Akihiro Suzuki, Yoshikazu Shimoda, Mikiko Abe, Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima, Tadashi Yokoyama

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　61　(3)　461-470　2015/05

DOI： 10.1080/00380768.2014.994470 　

ISSN： 0038-0768

eISSN： 1747-0765
Preferential Association of Endophytic Bradyrhizobia with Different Rice Cultivars and Its Implications for Rice Endophyte Evolution Peer-reviewed

Pongdet Piromyou, Teerana Greetatorn, Kamonluck Teamtisong, Takashi Okubo, Ryo Shinoda, Achara Nuntakij, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　81　(9)　3049-3061　2015/05

DOI： 10.1128/AEM.04253-14 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Genome Analysis of a Novel Bradyrhizobium sp DOA9 Carrying a Symbiotic Plasmid Peer-reviewed

Shin Okazaki, Rujirek Noisangiam, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Kamonluck Teamtisong, Pongpan Songwattana, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Kazuhiko Saeki, Shusei Sato, Toshiki Uchiumi, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

PLOS ONE　10　(2)　e0117392　2015/02

DOI： 10.1371/journal.pone.0117392 　

ISSN： 1932-6203
Bacterial community shifts associated with high abundance of Rhizobium spp. in potato roots under macronutrient-deficient conditions Peer-reviewed

Yusuke Unno, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY　80　232-236　2015/01

DOI： 10.1016/j.soilbio.2014.10.002 　

ISSN： 0038-0717
Elevated atmospheric CO2 levels affect community structure of rice root-associated bacteria Peer-reviewed

Okubo, Takashi, Liu, Dongyan, Tsurumaru, Hirohito, Ikeda, Seishi, Asakawa, Susumu, Tokida, Takeshi, Tago, Kanako, Hayatsu, Masahito, Aoki, Naohiro, Ishimaru, Ken, Ujiie, Kazuhiro, Usui, Yasuhiro, Nakamura, Hirofumi, Sakai, Hidemitsu, Hayashi, Kentaro, Hasegawa, Toshihiro, Minamisawa, Kiwamu

Frontiers in Microbiology　6　(136)　2015

DOI： 10.3389/fmicb.2015.00136 　
Characterization of Leaf Blade- and Leaf Sheath-Associated Bacterial Communities and Assessment of Their Responses to Environmental Changes in CO2, Temperature, and Nitrogen Levels under Field Conditions Peer-reviewed

Ikeda, Seishi, Tokida, Takeshi, Nakamura, Hirofumi, Sakai, Hidemitsu, Usui, Yasuhiro, Okubo, Takashi, Tago, Kanako, Hayashi, Kentaro, Sekiyama, Yasuyo, Ono, Hiroshi, Tomita, Satoru, Hayatsu, Masahito, Hasegawa, Toshihiro, Minamisawa, Kiwamu

Microbes and Environments　30　(1)　51-62　2015

DOI： 10.1264/jsme2.ME14117 　
Metagenomic Analysis of the Bacterial Community Associated with the Taproot of Sugar Beet Peer-reviewed

Hirohito Tsurumaru, Takashi Okubo, Kazuyuki Okazaki, Megumi Hashimoto, Kaori Kakizaki, Eiko Hanzawa, Hiroyuki Takahashi, Noriyuki Asanome, Fukuyo Tanaka, Yasuyo Sekiyama, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　30　(1)　63-69　2015

DOI： 10.1264/jsme2.ME14109 　

ISSN： 1342-6311
Divergent Nod-Containing Bradyrhizobium sp DOA9 with a Megaplasmid and its Host Range Peer-reviewed

Kamonluck Teamtisong, Pongpan Songwattana, Rujirek Noisangiam, Pongdet Piromyou, Nantakorn Boonkerd, Panlada Tittabutr, Kiwamu Minamisawa, Achara Nantagij, Shin Okazaki, Mikiko Abe, Toshiki Uchiumi, Neung Teaumroong

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(4)　370-376　2014/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME14065 　

ISSN： 1342-6311
Relationship Between Soil Type and N2O Reductase Genotype (nosZ) of Indigenous Soybean Bradyrhizobia: nosZ-minus Populations are Dominant in Andosols Peer-reviewed

Yoko Shiina, Manabu Itakura, Hyunseok Choi, Yuichi Saeki, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(4)　420-426　2014/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME14130 　

ISSN： 1342-6311
根粒菌の二成分制御システムを利用したNO3-/NO2-バイオセンサーの開発

後藤愛那, 日高將文, 清水泰希, 板倉学, クリスチーナ・サンチェス, 南澤究, 今村博臣, 内田隆史

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集　87回　[3T16p-09]　2014/10
Publisher: (公社)日本生化学会
The nitrate-sensing NasST system regulates nitrous oxide reductase and periplasmic nitrate reductase in Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Takashi Okubo, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Aina Gotoh, Masafumi Hidaka, Takafumi Uchida, Kiwamu Minamisawa

ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　16　(10)　3263-3274　2014/10

DOI： 10.1111/1462-2920.12546 　

ISSN： 1462-2912

eISSN： 1462-2920
Phylogeny and Functions of Bacterial Communities Associated with Field-Grown Rice Shoots Peer-reviewed

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Kenshiro Ohshima, Masahira Hattori, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(3)　329-332　2014/09

DOI： 10.1264/jsme2.ME14077 　

ISSN： 1342-6311
Metaproteomic Identification of Diazotrophic Methanotrophs and Their Localization in Root Tissues of Field-Grown Rice Plants Peer-reviewed

Zhihua Bao, Takashi Okubo, Kengo Kubota, Yasuhiro Kasahara, Hirohito Tsurumaru, Mizue Anda, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　80　(16)　5043-5052　2014/08

DOI： 10.1128/AEM.00969-14 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Low Nitrogen Fertilization Adapts Rice Root Microbiome to Low Nutrient Environment by Changing Biogeochemical Functions Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Takashi Okubo, Akifumu Yamashita, Kimihiro Terasawa, Zhihua Bao, Dongyan Liu, Takeshi Watanabe, Jun Murase, Susumu Asakawa, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(1)　50-59　2014/04

DOI： 10.1264/jsme2.ME13110 　

ISSN： 1342-6311
Effects of Elevated Carbon Dioxide, Elevated Temperature, and Rice Growth Stage on the Community Structure of Rice Root-Associated Bacteria Peer-reviewed

Okubo, Takashi, Tokida, Takeshi, Ikeda, Seishi, Bao, Zhihua, Tago, Kanako, Hayatsu, Masahito, Nakamura, Hirofumi, Sakai, Hidemitsu, Usui, Yasuhiro, Hayashi, Kentaro, Hasegawa, Toshihiro, Minamisawa, Kiwamu

Microbes and Environments　29　(2)　2014

DOI： 10.1264/jsme2.ME14011 　
An assessment of the diversity of culturable bacteria from main root of sugar beet. Peer-reviewed

Kazuyuki Okazaki, Takao Iino, Yosuke Kuroda, Kazunori Taguchi, Hiroyuki Takahashi, Takuji Ohwada, Hiroto Tsurumaru, Takashi Okubo, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

Microbes and environments　29　(2)　220-3　2014

DOI： 10.1264/jsme2.ME13182 　

eISSN： 1347-4405

More details Close

The partial sequences of the 16S rRNA genes of 531 bacteria isolated from the main root of the sugar beet (Beta vulgaris L.) were determined and subsequently grouped into 155 operational taxonomic units by clustering analysis (≥99% identity). The most abundant phylum was Proteobacteria (72.5-77.2%), followed by Actinobacteria (9.8-16.6%) and Bacteroidetes (4.3-15.4%). Alphaproteobacteria (46.7-64.8%) was the most dominant class within Proteobacteria. Four strains belonging to Verrucomicrobia were also isolated. Phylogenetic analysis revealed that the Verrucomicrobia bacterial strains were closely related to Haloferula or Verrucomicrobium.
A Rice Gene for Microbial Symbiosis, Oryza sativa CCaMK, Reduces CH4 Flux in a Paddy Field with Low Nitrogen Input Peer-reviewed

Bao, Zhihua, Watanabe, Aya, Sasaki, Kazuhiro, Okubo, Takashi, Tokida, Takeshi, Liu, Dongyan, Ikeda, Seishi, Imaizumi-Anraku, Haruko, Asakawa, Susumu, Sato, Tadashi, Mitsui, Hisayuki, Minamisawa, Kiwamu

Applied and Environmental Microbiology　80　(6)　1995-2003　2014

DOI： 10.1128/AEM.03646-13 　
Impact of Azospirillum sp B510 Inoculation on Rice-Associated Bacterial Communities in a Paddy Field Peer-reviewed

Zhihua Bao, Kazuhiro Sasaki, Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Mizue Anda, Eiko Hanzawa, Kaori Kakizaki, Tadashi Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　28　(4)　487-490　2013/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME13049 　

ISSN： 1342-6311
Involvement of a Novel Genistein-Inducible Multidrug Efflux Pump of Bradyrhizobium japonicum Early in the Interaction with Glycine max (L.) Merr Peer-reviewed

Keisuke Takeshima, Tatsuo Hidaka, Min Wei, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Mikiko Abe, Yoshihiko Tokuji, Takuji Ohwada

MICROBES AND ENVIRONMENTS　28　(4)　414-421　2013/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME13057 　

ISSN： 1342-6311
Linked Expressions of nap and nos Genes in a Bradyrhizobium japonicum Mutant with Increased N2O Reductase Activity Peer-reviewed

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　79　(13)　4178-4180　2013/07

DOI： 10.1128/AEM.00703-13 　

ISSN： 0099-2240
Genome analysis suggests that the soil oligotrophic bacterium agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of aeschynomene indica Peer-reviewed

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Manabu Itakura, Kenshiro Oshima, Aphakorn Longtonglang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

Applied and Environmental Microbiology　79　(8)　2542-2551　2013/04

DOI： 10.1128/AEM.00009-13 　

ISSN： 0099-2240 1098-5336
Mitigation of nitrous oxide emissions from soils by Bradyrhizobium japonicum inoculation Peer-reviewed

Manabu Itakura, Yoshitaka Uchida, Hiroko Akiyama, Yuko Takada Hoshino, Yumi Shimomura, Sho Morimoto, Kanako Tago, Yong Wang, Chihiro Hayakawa, Yusuke Uetake, Cristina Sánchez, Shima Eda, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

Nature Climate Change　3　(3)　208-212　2013/03

DOI： 10.1038/nclimate1734 　

ISSN： 1758-678X 1758-6798
The type III secretion system of Bradyrhizobium japonicum USDA122 mediates symbiotic incompatibility with Rj2 soybean plants Peer-reviewed

Takahiro Tsukui, Shima Eda, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Shin Okazaki, Kaori Kakizaki-Chiba, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Akifumi Yamashita, Kimihiro Terasawa, Kiwamu Minamisawa

Applied and Environmental Microbiology　79　(3)　1048-1051　2013/02

DOI： 10.1128/AEM.03297-12 　

ISSN： 0099-2240 1098-5336
Effects of plant genotype and nitrogen level on bacterial communities in rice shoots and roots Peer-reviewed

Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Takashi Ohkubo, Chiharu Kisara, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　28　(3)　391-395　2013

DOI： 10.1264/jsme2.ME12212 　

ISSN： 1342-6311

eISSN： 1347-4405
N2O Emission from Degraded Soybean Nodules Depends on Denitrification by Bradyrhizobium japonicum and Other Microbes in the Rhizosphere Peer-reviewed

Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(4)　470-476　2012/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME12100 　

ISSN： 1342-6311
Evolution of Bradyrhizobium-Aeschynomene Mutualism: Living Testimony of the Ancient World or Highly Evolved State? Peer-reviewed

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Kiwamu Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　53　(12)　2000-2007　2012/12

DOI： 10.1093/pcp/pcs150 　

ISSN： 0032-0781
Genetic diversity, symbiotic evolution, and proposed infection process of Bradyrhizobium strains isolated from root nodules of Aeschynomene americana L. in Thailand. Peer-reviewed

Noisangiam R, Teamtisong K, Tittabutr P, Boonkerd N, Toshiki U, Minamisawa K, Teaumroong N

Appl. Environ. Microbiol.　78　(17)　6236-6250　2012/06/29

DOI： 10.1128/AEM.00897-12. 　
Pyrosequence Read Length of 16S rRNA Gene Affects Phylogenetic Assignment of Plant-associated Bacteria Peer-reviewed

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Akifumi Yamashita, Kimihiro Terasawa, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(2)　204-208　2012/06

DOI： 10.1264/jsme2.ME11258 　

ISSN： 1342-6311
N_2O発生ダイズ根粒根圏から分離したFusariumの脱窒能(2012年度土壌微生物学会講演要旨)

南澤究, 池西史生, 板倉学

土と微生物　66　(2)　79-79　2012
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.2_79_2 　
イネエンドファイトAzospirillum sp. B510のインドール酢酸生合成に関する研究(2012年度土壌微生物学会講演要旨)

南智之, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　66　(2)　88-88　2012
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.2_88_1 　
Exploration of natural nod gene inducers for Mesorhizobium loti in seed and root exudates of Lotus corniculatus. Peer-reviewed

Katsuhiro Kojima, Tadashi Yokoyama(corresponding Author, Naoko Ohkama-Ohtsu, Suwat Saengkerdsub, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima

Soil Microorganisms　66　(1)　12-21　2012/01
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.66.1_12 　

ISSN： 0912-2184

More details Close

Tetronic acid is a candidate for an inducer of nodulation (nod) gene expression in Mesorhizobium loti. However, there is no evidence that tetronic acid is secreted from Lotus species, the host plants of M. loti. This suggests that Lotus plants may produce other genuine nod gene inducers that differ from tetronic acid. In this study, M. loti cells harboring a nodA-lacZ fusion were enclosed in dialysis tubing and immersed in L. corniculatus culture solution. Significant β-galactosidase activities were detected in the M. loti cells, indicating that nod gene inducers were present in the seed and root exudates. β-galactosidase activities in M. loti cells were also determined after cells were exposed to seed and root exudates or tetronic acid in vitro. Seed and root exudates induced greater β-galactosidase activity in M. loti cells in 1 mM CaSO_4 solution than in YEM medium. In contrast, tetronic acid induced greater β-galactosidase activity in M. loti cells in YEM medium than in 1 mM CaSO_4 solution. Further, β-galactosidase activities induced by seed and root exudates and tetronic acid tended to decrease as the pH of the medium became neutral. In an LC-MS analysis, we could not detect tetronic acid in the concentrated seed and root exudates. These findings indicate that Lotus plants release genuine nod gene inducers for M. loti that differ from tetronic acid. Finally, seed exudates of L. corniculatus were fractionated according to molecular size and polarity, and it was clarified that a putative nod gene inducer in the seed exudates was a low molecular weight and high polarity substance.
Complete genome sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: insights into symbiosis evolution in soil oligotrophs. Peer-reviewed

Takashi Okubo, Takahiro Tsukui, Hiroko Maita, Shinobu Okamoto, Kenshiro Oshima, Takatomo Fujisawa, Akihiro Saito, Hiroyuki Futamata, Reiko Hattori, Yumi Shimomura, Shin Haruta, Sho Morimoto, Yong Wang, Yoriko Sakai, Masahira Hattori, Shin-Ichi Aizawa, Kenji V P Nagashima, Sachiko Masuda, Tsutomu Hattori, Akifumi Yamashita, Zhihua Bao, Masahito Hayatsu, Hiromi Kajiya-Kanegae, Ikuo Yoshinaga, Kazunori Sakamoto, Koki Toyota, Mitsuteru Nakao, Mitsuyo Kohara, Mizue Anda, Rieko Niwa, Park Jung-Hwan, Reiko Sameshima-Saito, Shin-Ichi Tokuda, Sumiko Yamamoto, Syuji Yamamoto, Tadashi Yokoyama, Tomoko Akutsu, Yasukazu Nakamura, Yuka Nakahira-Yanaka, Yuko Takada Hoshino, Hideki Hirakawa, Hisayuki Mitsui, Kimihiro Terasawa, Manabu Itakura, Shusei Sato, Wakako Ikeda-Ohtsubo, Natsuko Sakakura, Eli Kaminuma, Kiwamu Minamisawa

Microbes and environments　27　(3)　306-15　2012

DOI： 10.1264/jsme2.ME11321 　

eISSN： 1347-4405

More details Close

Bradyrhizobium sp. S23321 is an oligotrophic bacterium isolated from paddy field soil. Although S23321 is phylogenetically close to Bradyrhizobium japonicum USDA110, a legume symbiont, it is unable to induce root nodules in siratro, a legume often used for testing Nod factor-dependent nodulation. The genome of S23321 is a single circular chromosome, 7,231,841 bp in length, with an average GC content of 64.3%. The genome contains 6,898 potential protein-encoding genes, one set of rRNA genes, and 45 tRNA genes. Comparison of the genome structure between S23321 and USDA110 showed strong colinearity; however, the symbiosis islands present in USDA110 were absent in S23321, whose genome lacked a chaperonin gene cluster (groELS3) for symbiosis regulation found in USDA110. A comparison of sequences around the tRNA-Val gene strongly suggested that S23321 contains an ancestral-type genome that precedes the acquisition of a symbiosis island by horizontal gene transfer. Although S23321 contains a nif (nitrogen fixation) gene cluster, the organization, homology, and phylogeny of the genes in this cluster were more similar to those of photosynthetic bradyrhizobia ORS278 and BTAi1 than to those on the symbiosis island of USDA110. In addition, we found genes encoding a complete photosynthetic system, many ABC transporters for amino acids and oligopeptides, two types (polar and lateral) of flagella, multiple respiratory chains, and a system for lignin monomer catabolism in the S23321 genome. These features suggest that S23321 is able to adapt to a wide range of environments, probably including low-nutrient conditions, with multiple survival strategies in soil and rhizosphere.
Complete Genome Sequence of the Soybean Symbiont Bradyrhizobium japonicum Strain USDA6(T)

Takakazu Kaneko, Hiroko Maita, Hideki Hirakawa, Nobukazu Uchiike, Kiwamu Minamisawa, Akiko Watanabe, Shusei Sato

GENES　2　(4)　763-787　2011/12

DOI： 10.3390/genes2040763 　

ISSN： 2073-4425
Nitrogen Cycling in Rice Paddy Environments: Past Achievements and Future Challenges Peer-reviewed

Satoshi Ishii, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa, Keishi Senoo

MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(4)　282-292　2011/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME11293 　

ISSN： 1342-6311
Nitrate-Dependent N2O Emission from Intact Soybean Nodules via Denitrification by Bradyrhizobium japonicum Bacteroids Peer-reviewed

Junta Hirayama, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(24)　8787-8790　2011/12

DOI： 10.1128/AEM.06262-11 　

ISSN： 0099-2240
The Genotype of the Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Gene (CCaMK) Determines Bacterial Community Diversity in Rice Roots under Paddy and Upland Field Conditions Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Naoya Takeda, Mari Banba, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Shinsuke Fujihara, Yoshinari Ohwaki, Kenshiro Ohshima, Yoshimichi Fukuta, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Tadashi Sato, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(13)　4399-4405　2011/07

DOI： 10.1128/AEM.00315-11 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Programmed induction of endoreduplication by DNA double-strand breaks in Arabidopsis Peer-reviewed

Sumiko Adachi, Kazunori Minamisawa, Yoko Okushima, Soichi Inagaki, Kaoru Yoshiyama, Youichi Kondou, Eli Kaminuma, Mika Kawashima, Tetsuro Toyoda, Minami Matsui, Daisuke Kurihara, Sachihiro Matsunaga, Masaaki Umeda

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America　108　(24)　10004-10009　2011/06/14

DOI： 10.1073/pnas.1103584108 　

ISSN： 0027-8424 1091-6490

eISSN： 1091-6490
Identification of Mesorhizobium loti Genes Relevant to Symbiosis by Using Signature-Tagged Mutants Peer-reviewed

Naoganchaolu Borjigin, Keisuke Furukawa, Yoshikazu Shimoda, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(2)　165-171　2011/06

DOI： 10.1264/jsme2.ME10213 　

ISSN： 1342-6311
Isolation and Genetic Characterization of Aurantimonas and Methylobacterium Strains from Stems of Hypernodulated Soybeans Peer-reviewed

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Takashi Okubo, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(2)　172-180　2011/06

DOI： 10.1264/jsme2.ME10203 　

ISSN： 1342-6311
Involvement of the SmeAB Multidrug Efflux Pump in Resistance to Plant Antimicrobials and Contribution to Nodulation Competitiveness in Sinorhizobium meliloti Peer-reviewed

Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(9)　2855-2862　2011/05

DOI： 10.1128/AEM.02858-10 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Autoregulation of Nodulation Interferes with Impacts of Nitrogen Fertilization Levels on the Leaf-Associated Bacterial Community in Soybeans Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Mizue Anda, Shoko Inaba, Shima Eda, Shusei Sato, Kazuhiro Sasaki, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(6)　1973-1980　2011/03

DOI： 10.1128/AEM.02567-10 　

ISSN： 0099-2240
土着ダイズ根粒菌の亜酸化窒素還元酵素遺伝子(nosZ)の分布と亜酸化窒素還元能を利用したN_2O削減(2011年度大会一般講演要旨)

板倉学, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　65　(2)　154-154　2011
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.65.2_154_1 　
A Great Leap forward in Microbial Ecology Peer-reviewed

Satoshi Okabe, Mamoru Oshiki, Yoichi Kamagata, Nobuyasu Yamaguchi, Masanori Toyofuku, Yutaka Yawata, Yosuke Tashiro, Nobuhiko Nomura, Hiroyuki Ohta, Moriya Ohkuma, Akira Hiraishi, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(4)　230-240　2010/12

DOI： 10.1264/jsme2.ME10178 　

ISSN： 1342-6311
The cbbL Gene is Required for Thiosulfate-Dependent Autotrophic Growth of Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

Sachiko Masuda, Shima Eda, Chiaki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(3)　220-223　2010/09

DOI： 10.1264/jsme2.ME10124 　

ISSN： 1342-6311
Plant-Microbe Communications for Symbiosis Peer-reviewed

Masayoshi Kawaguchi, Kiwamu Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(9)　1377-1380　2010/09

DOI： 10.1093/pcp/pcq125 　

ISSN： 0032-0781
Community- and Genome-Based Views of Plant-Associated Bacteria: Plant-Bacterial Interactions in Soybean and Rice Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Mizue Anda, Hideo Nakashita, Michiko Yasuda, Shusei Sato, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shima Eda, Ayumi Momiyama, Kimihiro Terasawa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(9)　1398-1410　2010/09

DOI： 10.1093/pcp/pcq119 　

ISSN： 0032-0781

eISSN： 1471-9053
Impact of plant genotype and nitrogen level on rice growth response to inoculation with Azospirillum sp. strain B510 under paddy field conditions Peer-reviewed

Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Eiko Hanzawa, Chiharu Kisara, Yuri Kazama, Atsuhiko Kushida, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Sato

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　56　(4)　636-644　2010/08

DOI： 10.1111/j.1747-0765.2010.00499.x 　

ISSN： 0038-0768
Copper Metallochaperones are Required for the Assembly of Bacteroid Cytochrome c Oxidase Which is Functioning for Nitrogen Fixation in Soybean Nodules Peer-reviewed

Hatthaya Arunothayanan, Mika Nomura, Rie Hamaguchi, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Shigeyuki Tajima

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(7)　1242-1246　2010/07

DOI： 10.1093/pcp/pcq079 　

ISSN： 0032-0781

eISSN： 1471-9053
Temperature-Dependent Expression of Type III Secretion System Genes and Its Regulation in Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

Min Wei, Keisuke Takeshima, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Mikiko Abe, Satoshi Ishii, Takuji Ohwada

MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS　23　(5)　628-637　2010/05

DOI： 10.1094/MPMI-23-5-0628 　

ISSN： 0894-0282
Thiosulfate-Dependent Chemolithoautotrophic Growth of Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

Sachiko Masuda, Shima Eda, Seishi Ikeda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　76　(8)　2402-2409　2010/04

DOI： 10.1128/AEM.02783-09 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Community shifts of soybean stem-associated bacteria responding to different nodulation phenotypes and N levels Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Shoko Inaba, Tomiya Maekawa, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ISME JOURNAL　4　(3)　315-326　2010/03

DOI： 10.1038/ismej.2009.119 　

ISSN： 1751-7362
Complete genomic structure of the cultivated rice endophyte Azospirillum sp. B510. International-journal Peer-reviewed

Takakazu Kaneko, Kiwamu Minamisawa, Tsuyoshi Isawa, Hiroki Nakatsukasa, Hisayuki Mitsui, Yasuyuki Kawaharada, Yasukazu Nakamura, Akiko Watanabe, Kumiko Kawashima, Akiko Ono, Yoshimi Shimizu, Chika Takahashi, Chiharu Minami, Tsunakazu Fujishiro, Mitsuyo Kohara, Midori Katoh, Naomi Nakazaki, Shinobu Nakayama, Manabu Yamada, Satoshi Tabata, Shusei Sato

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes　17　(1)　37-50　2010/02

DOI： 10.1093/dnares/dsp026 　

More details Close

We determined the nucleotide sequence of the entire genome of a diazotrophic endophyte, Azospirillum sp. B510. Strain B510 is an endophytic bacterium isolated from stems of rice plants (Oryza sativa cv. Nipponbare). The genome of B510 consisted of a single chromosome (3,311,395 bp) and six plasmids, designated as pAB510a (1,455,109 bp), pAB510b (723,779 bp), pAB510c (681,723 bp), pAB510d (628,837 bp), pAB510e (537,299 bp), and pAB510f (261,596 bp). The chromosome bears 2893 potential protein-encoding genes, two sets of rRNA gene clusters (rrns), and 45 tRNA genes representing 37 tRNA species. The genomes of the six plasmids contained a total of 3416 protein-encoding genes, seven sets of rrns, and 34 tRNAs representing 19 tRNA species. Eight genes for plasmid-specific tRNA species are located on either pAB510a or pAB510d. Two out of eight genomic islands are inserted in the plasmids, pAB510b and pAB510e, and one of the islands is inserted into trnfM-CAU in the rrn located on pAB510e. Genes other than the nif gene cluster that are involved in N(2) fixation and are homologues of Bradyrhizobium japonicum USDA110 include fixABCX, fixNOQP, fixHIS, fixG, and fixLJK. Three putative plant hormone-related genes encoding tryptophan 2-monooxytenase (iaaM) and indole-3-acetaldehyde hydrolase (iaaH), which are involved in IAA biosynthesis, and ACC deaminase (acdS), which reduces ethylene levels, were identified. Multiple gene-clusters for tripartite ATP-independent periplasmic-transport systems and a diverse set of malic enzymes were identified, suggesting that B510 utilizes C(4)-dicarboxylate during its symbiotic relationship with the host plant.
Azospirillum sp Strain B510 Enhances Rice Growth and Yield Peer-reviewed

Tsuyoshi Isawa, Michiko Yasuda, Hirotoshi Awazaki, Kiwamu Minamisawa, Satoshi Shinozaki, Hideo Nakashita

MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(1)　58-61　2010/02

DOI： 10.1264/jsme2.ME09174 　

ISSN： 1342-6311
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較 : USDA122株特異的遺伝子の探索(2010年度大会一般講演要旨)

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　64　(2)　142-142　2010
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_142_2 　
ダイズ老化根粒からの亜酸化窒素発生に関与する土壌生物(2010年度大会一般講演要旨)

南澤究, 稲葉尚子, 早津雅仁, 星野(高田) 裕子, 岡田浩明, 江田志磨, 三井久幸

土と微生物　64　(2)　137-137　2010
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_137_3 　
Identification of the Mesorhizobium loti gene responsible for glycerophosphorylation of periplasmic cyclic beta-1,2-glucans Peer-reviewed

Yasuyuki Kawaharada, Hiromasa Kiyota, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

FEMS MICROBIOLOGY LETTERS　302　(2)　131-137　2010/01

DOI： 10.1111/j.1574-6968.2009.01843.x 　

ISSN： 0378-1097
Effects of Colonization of a Bacterial Endophyte, Azospirillum sp B510, on Disease Resistance in Rice Peer-reviewed

Michiko Yasuda, Tsuyoshi Isawa, Satoshi Shinozaki, Kiwamu Minamisawa, Hideo Nakashita

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　73　(12)　2595-2599　2009/12

DOI： 10.1271/bbb.90402 　

ISSN： 0916-8451

eISSN： 1347-6947
Development of a bacterial cell enrichment method and its application to the community analysis in soybean stems. International-journal Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn E E Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

Microbial ecology　58　(4)　703-14　2009/11

DOI： 10.1007/s00248-009-9566-0 　

More details Close

A method was developed for enriching bacterial cells from soybean stems which was recalcitrant for a culture-independent analysis of bacterial community due to the interference with plant DNA. Stem homogenates were fractionated by a series of differential centrifugations followed by a Nycodenz density gradient centrifugation. The efficiency of bacterial cell enrichment was assessed by ribosomal intergenic spacer analysis (RISA). The intensity and the number of bacterial amplicons of RISA were markedly increased in the DNA extracted from the enriched bacterial cells compared to that in the DNA directly extracted from soybean stems. The phylogenetic diversity of the enriched bacterial cells was evaluated by analyzing a clone library of 16S rRNA gene in comparison with those of the culturable fractions of the enriched and non-enriched stem-associated bacteria, endophytic bacteria, and epiphytic bacteria. The results indicated that the method was able to enrich both endophytic and epiphytic bacteria from soybean stems, and was useful to assess the bacterial diversity based on a 16S rRNA gene clone library. When the sequence data from all clones (1,332 sequences) were combined, 72 operational taxonomic units were affiliated with Proteobacteria (Alpha-, Beta-, and Gammaproteobacteria), Actinobacteria, Firmicutes, and Bacteroidetes, which also provided the most comprehensive set of data on the bacterial diversity in the aerial parts of soybeans.
SUMO E3 ligase HIGH PLOIDY2 regulates endocycle onset and meristem maintenance in Arabidopsis. International-journal Peer-reviewed

Ishida T, Fujiwara S, Miura K, Stacey N, Yoshimura M, Schneider K, Adachi S, Minamisawa K, Umeda M, Sugimoto K

The Plant cell　21　(8)　2284-2297　2009/08

DOI： 10.1105/tpc.109.068072 　

ISSN： 1040-4651

More details Close

Endoreduplication involves a doubling of chromosomal DNA without corresponding cell division. In plants, many cell types transit from the mitotic cycle to the endoreduplication cycle or endocycle, and this transition is often coupled with the initiation of cell expansion and differentiation. Although a number of cell cycle regulators implicated in endocycle onset have been identified, it is still largely unknown how this transition is developmentally regulated at the whole organ level. Here, we report that a nuclear-localized SUMO E3 ligase, HIGH PLOIDY2 (HPY2), functions as a repressor of endocycle onset in Arabidopsis thaliana meristems. Loss of HPY2 results in a premature transition from the mitotic cycle to the endocycle, leading to severe dwarfism with defective meristems. HPY2 possesses an SP-RING domain characteristic of MMS21-type SUMO E3 ligases, and we show that the conserved residues within this domain are required for the in vivo and in vitro function of HPY2. HPY2 is predominantly expressed in proliferating cells of root meristems and it functions downstream of meristem patterning transcription factors PLETHORA1 (PLT1) and PLT2. These results establish that HPY2-mediated sumoylation modulates the cell cycle progression and meristem development in the PLT-dependent signaling pathway.
Aerobic Vanillate Degradation and C-1 Compound Metabolism in Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

Nirinya Sudtachat, Naofumi Ito, Manabu Itakura, Sachiko Masuda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Yasuyuki Kawaharada, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　75　(15)　5012-5017　2009/08

DOI： 10.1128/AEM.00755-09 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
The communities of endophytic diazotrophic bacteria in cultivated rice (Oryza sativa L.) Peer-reviewed

Janpen Prakamhang, Kiwamu Minamisawa, Kamonluck Teamtaisong, Nantakorn Boonkerd, Neung Teaumroong

APPLIED SOIL ECOLOGY　42　(2)　141-149　2009/06

DOI： 10.1016/j.apsoil.2009.02.008 　

ISSN： 0929-1393
Molecular diversity of bacterial chitinases in arable soils and the effects of environmental factors on the chitinolytic bacterial community Peer-reviewed

Takeshi Terahara, Seishi Ikeda, Chiaki Noritake, Kiwamu Minamisawa, Katsuhiko Ando, Satoshi Tsuneda, Shigeaki Harayama

SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY　41　(3)　473-480　2009/03

DOI： 10.1016/j.soilbio.2008.11.024 　

ISSN： 0038-0717

eISSN： 1879-3428
Genomic comparison of Bradyrhizobium japonicum strains with different symbiotic nitrogen-fixing capabilities and other Bradyrhizobiaceae members Peer-reviewed

Manabu Itakura, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Keina Honnma, Konosuke Fujita, Hiroyoshi Iwata, Yuichi Saeki, Yoshino Hara, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ISME JOURNAL　3　(3)　326-339　2009/03

DOI： 10.1038/ismej.2008.88 　

ISSN： 1751-7362

eISSN： 1751-7370
Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成と競合能に関わる遺伝子の探索(2009年度大会一般講演要旨)

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　63　(2)　115-115　2009
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.63.2_115_4 　
Nitrous Oxide Emission and Microbial Community in the Rhizosphere of Nodulated Soybeans during the Late Growth Period Peer-reviewed

Shoko Inaba, Kenji Tanabe, Shima Eda, Seishi Ikeda, Atsushi Higashitani, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　24　(1)　64-67　2009

DOI： 10.1264/jsme2.ME08544 　

ISSN： 1342-6311
Nodulation-Dependent Communities of Culturable Bacterial Endophytes from Stems of Field-Grown Soybeans Peer-reviewed

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　24　(3)　253-258　2009

DOI： 10.1264/jsme2.ME09125 　

ISSN： 1342-6311
Generation of Bradyrhizobium japonicum Mutants with Increased N2O Reductase Activity by Selection after Introduction of a Mutated dnaQ Gene Peer-reviewed

Manabu Itakura, Kazufumi Tabata, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiriko Murakami, Junichi Yasuda, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(23)　7258-7264　2008/12

DOI： 10.1128/AEM.01850-08 　

ISSN： 0099-2240

eISSN： 1098-5336
Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics. International-journal Peer-reviewed

Yoshikazu Shimoda, Hisayuki Mitsui, Hiroko Kamimatsuse, Kiwamu Minamisawa, Eri Nishiyama, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Sayaka Shinpo, Akiko Watanabe, Mitsuyo Kohara, Manabu Yamada, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Shusei Sato

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes　15　(5)　297-308　2008/10

DOI： 10.1093/dnares/dsn017 　

More details Close

Rhizobia are nitrogen-fixing soil bacteria that establish endosymbiosis with some leguminous plants. The completion of several rhizobial genome sequences provides opportunities for genome-wide functional studies of the physiological roles of many rhizobial genes. In order to carry out genome-wide phenotypic screenings, we have constructed a large mutant library of the nitrogen-fixing symbiotic bacterium, Mesorhizobium loti, by transposon mutagenesis. Transposon insertion mutants were generated using the signature-tagged mutagenesis (STM) technique and a total of 29,330 independent mutants were obtained. Along with the collection of transposon mutants, we have determined the transposon insertion sites for 7892 clones, and confirmed insertions in 3680 non-redundant M. loti genes (50.5% of the total number of M. loti genes). Transposon insertions were randomly distributed throughout the M. loti genome without any bias toward G+C contents of insertion target sites and transposon plasmids used for the mutagenesis. We also show the utility of STM mutants by examining the specificity of signature tags and test screenings for growth- and nodulation-deficient mutants. This defined mutant library allows for genome-wide forward- and reverse-genetic functional studies of M. loti and will serve as an invaluable resource for researchers to further our understanding of rhizobial biology.
Microbial community analysis of field-grown soybeans with different nodulation phenotypes Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Lynn Esther E. Rallos, Takashi Okubo, Shima Eda, Shoko Inaba, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(18)　5704-5709　2008/09

DOI： 10.1128/AEM.00833-08 　

ISSN： 0099-2240
Structural characterization of neutral and anionic glucans from Mesorhizobium loti Peer-reviewed

Yasuyuki Kawaharada, Hiromasa Kiyota, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

CARBOHYDRATE RESEARCH　343　(14)　2422-2427　2008/09

DOI： 10.1016/j.carres.2008.07.007 　

ISSN： 0008-6215
Soybean Seed Extracts Preferentially Express Genomic Loci of Bradyrhizobium japonicum in the Initial Interaction with Soybean, Glycine max (L.) Merr Peer-reviewed

Min Wei, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchium, Mlkiko Abe, Takuji Ohwada

DNA RESEARCH　15　(4)　201-214　2008/08

DOI： 10.1093/dnares/dsn012 　

ISSN： 1340-2838
Ethylene production in plants during transformation suppresses vir gene expression in Agrobacterium tumefaciens Peer-reviewed

Satoko Nonaka, Ken-Ichi Yuhashi, Keita Takada, Masayuki Sugaware, Kiwamu Minamisawa, Hiroshi Ezura

NEW PHYTOLOGIST　178　(3)　647-656　2008/05

DOI： 10.1111/j.1469-8137.2008.02400.x 　

ISSN： 0028-646X
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase enhances Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer into plant cells Peer-reviewed

Satoko Nonaka, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(8)　2526-2528　2008/04

DOI： 10.1128/A-EM.02253-07 　

ISSN： 0099-2240
SEARCH FOR NODULATION GENE INDUCER FOR MESORHIZOBIUM LOTI SECRETED FROM ROOTS OF LOTUS CORNICULATUS Peer-reviewed

K. Kojima, T. Yokoyama, M. Itakura, K. Minamisawa, Y. Arima

BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION: TOWARDS POVERTY ALLEVIATION THROUGH SUSTAINABLE AGRICULTURE　42　263-263　2008

ISSN： 0924-1949
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-producing Agrobacterium confers higher ability for gene transfer into plant cells. Peer-reviewed

Nonaka, S, Sugawara, M, Minamisawa, K, Yuhashi, KI, Ezura, H

Applied and Environmental Microbiology　74　(8)　2526-2528　2008/01
Broad distribution and phylogeny of anaerobic endophytes of cluster XIVa clostridia in plant species including crops Peer-reviewed

Asami Saito, Makoto Kawahara, Seishi Ikeda, Masato Ishimine, Shoichiro Akao, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　23　(1)　73-80　2008

DOI： 10.1264/jsme2.23.73 　

ISSN： 1342-6311
NAD-Malic Enzyme Affects Nitrogen Fixing Activity of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 Bacteroids in Soybean Nodules Peer-reviewed

Tan Van Dao, Mika Nomura, Ril Hamaguchi, Kensuke Kato, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Suphawat Sinsuwongwat, Hoa Thi-Phuong Le, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shigeyuki Tajima

MICROBES AND ENVIRONMENTS　23　(3)　215-220　2008

DOI： 10.1264/jsme2.23.215 　

ISSN： 1342-6311
A Mesorhizobium loti mutant with reduced glucan content shows defective invasion of its host plant Lotus japonicus Peer-reviewed

Yasuyuki Kawaharada, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

MICROBIOLOGY-SGM　153　(12)　3983-3993　2007/12

DOI： 10.1099/mic.0.2007/008631-0 　

ISSN： 1350-0872
(306) Analysis of Microbial Diversity in Milled Rice using Culture-Independent Methods(Abstracts of the Papers Presented at the Annual Meeting of the Society)

Ikeda,S, Fuji,S, Sato,T, Furuya,H, Naito,H, Ytow,N, Ezura,H, Minamisawa,K, Fujimura,T

Annals of the Phytopathological Society of Japan　73　(3)　257　2007/08
Publisher: The Phytopathological Society of Japan (PSJ)
ISSN： 0031-9473
Rhizobitoxine-induced chlorosis occurs in coincidence with methionine deficiency in soybeans Peer-reviewed

Shin Okazaki, Masayuki Sugawara, Ken-Ichi Yuhashi, Kiwamu Minamisawa

ANNALS OF BOTANY　100　(1)　55-59　2007/07

DOI： 10.1093/aob/mcm087 　

ISSN： 0305-7364
Rhizobitoxine production in Agrobacterium tumefaciens C58 by Bradyrhizobium elkanii rtxACDEFG genes Peer-reviewed

Masayuki Sugawara, Ryota Haramaki, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shin Okazaki, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

FEMS MICROBIOLOGY LETTERS　269　(1)　29-35　2007/04

DOI： 10.1111/j.1574-6968.2006.00590.x 　

ISSN： 0378-1097
土壌における原生生物の多様性と微生物との相互作用 : 陸圏と水圏,相互の生態系の比較を通して土壌微生物生態を見つめ直す(学際シンポジウム報告)

南澤究, 島野智之

日本微生物生態学会誌　22　(2)　79-80　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
DOI： 10.20709/jsmeja.22.2_79 　
野生イネ,栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析(2007年度大会一般講演要旨)

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

土と微生物　61　(2)　154-154　2007
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.61.2_154_1 　
Analysis of molecular diversity of bacterial Chitinase genes in the maize rhizosphere using culture-independent methods Peer-reviewed

Seishi Ikedai, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Kiyotaka Miyashita, Tatsuhito Fujimura

MICROBES AND ENVIRONMENTS　22　(1)　71-77　2007

DOI： 10.1264/jsme2.22.71 　

ISSN： 1342-6311
Microbial diversity in milled rice as revealed by riosomal intergenic spacer analysis Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Shin-ichi Fuji, Toshiro Sato, Hiromitsu Furuya, Hideki Naito, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

MICROBES AND ENVIRONMENTS　22　(2)　165-174　2007

DOI： 10.1264/jsme2.22.165 　

ISSN： 1342-6311
Microbial community analysis of the phytosphere using culture-independent methodologies Peer-reviewed

Asami Saito, Seishi Ikeda, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

MICROBES AND ENVIRONMENTS　22　(2)　93-105　2007

DOI： 10.1264/jsme2.22.93 　

ISSN： 1342-6311
Rhizobial networks for symbiosis with legumes

Kiwamu Minamisawa, Kazuhiko Saeki, Shusei Sato, Yoshikazu Shimoda

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme.　51　(9)　1044-1050　2006/08/01

ISSN： 0039-9450
Rhizobitoxine modulates plant-microbe interactions by ethylene inhibition Peer-reviewed

M Sugawara, S Okazaki, N Nukui, H Ezura, H Mitsui, K Minamisawa

BIOTECHNOLOGY ADVANCES　24　(4)　382-388　2006/07

DOI： 10.1016/j.biotechadv.2006.01.004 　

ISSN： 0734-9750
Expression of the 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase gene requires symbiotic nitrogen-fixing regulator gene nifA2 in Mesorhizobium loti MAFF303099 Peer-reviewed

Noriyuki Nukui, Kiwamu Minamisawa, Shin-Ichi Ayabe, Toshio Aoki

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　72　(7)　4964-4969　2006/07

DOI： 10.1080/AEM.02745-05 　

ISSN： 0099-2240
Discrimination of the commercial seeds of forage crops using ribosomal intergenic spacer analysis Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

BREEDING SCIENCE　56　(2)　185-188　2006/06

DOI： 10.1270/jsbbs.56.185 　

ISSN： 1344-7610

eISSN： 1347-3735
Symbiotic Bradyrhizobium japonicum reduces N2O surrounding the soybean root system via nitrous oxide reductase Peer-reviewed

R Sameshima-Saito, K Chiba, J Hirayama, M Itakura, H Mitsui, S Eda, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　72　(4)　2526-2532　2006/04

DOI： 10.1128/AEM.72.4.2526-2532.2006 　

ISSN： 0099-2240
Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる根粒形成、非根粒形成Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム比較(2006年度大会一般講演要旨)

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　60　(2)　144-144　2006
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_144_2 　
ミヤコグサ根粒菌の共生状態における1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase遺伝子(acdS)の転写解析(2006年度大会一般講演要旨)

貫井憲之, 南澤究, 綾部真一, 青木俊夫

土と微生物　60　(2)　145-145　2006
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_145_1 　
ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける新規共生能欠損変異株の解析(2006年度大会一般講演要旨)

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　60　(2)　145-145　2006
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_145_2 　
嫌気窒素固定コンソーシアムの窒素固定に影響する因子の解析(2006年度大会一般講演要旨)

齋藤朝美, 南澤究

土と微生物　60　(2)　143-143　2006
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_143_2 　
Soil microbial community analysis in the environmental risk assessment of transgenic plants Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

Plant Biotechnology　23　(1)　137-151　2006
Publisher: Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology
DOI： 10.5511/plantbiotechnology.23.137 　

ISSN： 1347-6114 1342-4580
サトウキビに接種した窒素固定エンドファイトHerbaspirillumの動態追跡のための緑色蛍光タンパク質の利用 Peer-reviewed

清水友, 豊里学, 久綱泰代, 佐伯雄一, 南澤究, 中西康博, Njoloma Joyce Prica, 明石良, 赤尾勝一郎

土と微生物　60　(1)　3-9　2006
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.60.1_3 　

ISSN： 0912-2184

More details Close

The behavior of N_2-fixing endophytic bacteria inoculated on the roots of micropropagated sugarcane cv.RK86-129 was studied by using Herbaspirillum sp. B501 gfp1 tagged with the gfp gene. At 1 hour after inoculation, the inoculated bacteria were observed slightly on the root surface. However, at 1 day after inoculation their colonization was observed on the root surface and the intercellular spaces of epidermis cells. The bacterial colonization within the opening aperture arisen from lateral root formation and vascular tissues systems was observed at 7 days and 1 month after inoculation, respectively. These findings suggest that the use of gfp gene provides a useful means to trace the endophytic bacteria inoculated onto sugarcane roots.
Evaluation of the Nitrogen-fixing Ability of Endophytic Clostridia based on Acetylene Reduction and Reverse Transcription-PCR Targeting the nifH Transcript and Ribosomal RNA Peer-reviewed

Asami Saito, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　21　(1)　23-35　2006

DOI： 10.1264/jsme2.21.23 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Community Analysis of Seed-Associated Microbes in Forage Crops using Culture-Independent Methods Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Shin-Ichi Fuji, Toshiro Sato, Nozomi Ytow, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa, Tatsuhito Fujimura

Microbes and Environments　21　(2)　112-121　2006

DOI： 10.1264/jsme2.21.112 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Incorporation of a DNA Sequence Encoding Green Fluorescent Protein (GFP) into Endophytic Diazotroph from Sugarcane and Sweet Potato and the Colonizing Ability of these Bacteria in Brassica oleracea Peer-reviewed

Kazunori Tanaka, Tasuku Shimizu, Muhammad Zakria, Joyce Njoloma, Yuichi Saeki, Masao Sakai, Takeo Yamakawa, Kiwamu Minamisawa, Shoichiro Akao

Microbes and Environments　21　(2)　122-128　2006

DOI： 10.1264/jsme2.21.122 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311

eISSN： 1347-4405
Correlation of Denitrifying Capability with the Existence of nap, nir, nor and nos Genes in Diverse Strains of Soybean Bradyrhizobia Peer-reviewed

Reiko Sameshima-Saito, Kaori Chiba, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　21　(3)　174-184　2006

DOI： 10.1264/jsme2.21.174 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Global Gene Expression in Bradyrhizobium japonicum Cultured with Vanillin, Vanillate, 4-Hydroxybenzoate and Protocatechuate Peer-reviewed

Naofumi Ito, Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Eiji Masai, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　21　(4)　240-250　2006

DOI： 10.1264/jsme2.21.240 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Microbial Community Analysis in the Rhizosphere of a Transgenic Tomato that Overexpresses 3-Hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme a Reductase Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Toshikazu Omura, Nozomi Ytow, Hisayuki Komaki, Kiwamu Minamisawa, Hiroshi Ezura, Tatsuhito Fujimura

Microbes and Environments　21　(4)　261-271　2006

DOI： 10.1264/jsme2.21.261 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Expression of the nifH gene of a Herbaspirillum endophyte in wild rice species: Daily rhythm during the light-dark cycle Peer-reviewed

M You, T Nishiguchi, A Saito, T Isawa, H Mitsui, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　71　(12)　8183-8190　2005/12

DOI： 10.1128/AEM.71.12.8183-8190.2005 　

ISSN： 0099-2240
Expression of a mutated melon ethylene receptor gene Cm-ETR1/H69A affects stamen development in Nicotiana tabacum Peer-reviewed

K Takada, K Ishimaru, K Minamisawa, H Kamada, H Ezura

PLANT SCIENCE　169　(5)　935-942　2005/11

DOI： 10.1016/j.plantsci.2005.06.012 　

ISSN： 0168-9452
Two rhizobial strains, Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum, USDA110, encode haloalkane dehalogenases with novel structures and substrate specificities Peer-reviewed

Y Sato, M Monincova, R Chaloupkova, Z Prokop, Y Ohtsubo, K Minamisawa, M Tsuda, J Damborsky, Y Nagata

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　71　(8)　4372-4379　2005/08

DOI： 10.1128/AEM.71.8.4372-4379.2005 　

ISSN： 0099-2240
Effect of inoculation with anaerobic nitrogen-fixing consortium on salt tolerance of Miscanthus sinensis Peer-reviewed

B Ye, A Saito, K Minamisawa

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　51　(2)　243-249　2005/04

DOI： 10.1111/j.1747-0765.2005.tb00028.x 　

ISSN： 0038-0768
根粒菌の環境ストレス耐性と共生能の両方に重要な転写因子RpoH_1の機能解析(2005年度大会一般講演要旨)

三井久幸, 南澤究

土と微生物　59　(2)　132-132　2005
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.59.2_132_1 　
ダイズ根粒菌のN_2Oパラドックス(2005年度大会一般講演要旨)

南澤究, 千葉芳里, 平山潤太, 鮫島玲子

土と微生物　59　(2)　131-131　2005
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.59.2_131_2 　
Diazotrophic endophytes in rice: Colonization and nitrogen fixation of herbaspirillum and clostridium species Peer-reviewed

K Minamisawa, M You, T Abe, B Ye, A Saito, M Kawahara, T Sato

Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment　41　339-343　2005
A-03 リゾビトキシン生合成遺伝子の機能解析と非生産菌への導入(共生・相互作用,口頭発表)

菅原,雅之, 岡崎,伸, 野中,聡子, 江面,浩, 南澤,究

日本微生物生態学会講演要旨集　0　(20)　125-125　2004/11
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
Novel endophytic nitrogen-fixing clostridia from the grass Miscanthus sinensis as revealed by terminal restriction fragment length polymorphism analysis Peer-reviewed

T Miyamoto, M Kawahara, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(11)　6580-6586　2004/11

DOI： 10.1128/AEM.70.11.6580-6586.2004 　

ISSN： 0099-2240
Cyclic flow-injection analysis for Fe(II)-1,10-phenanthroline using polyurethane foam Peer-reviewed

K Minamisawa, T Yokoyama, M Zenki

BUNSEKI KAGAKU　53　(9)　1021-1024　2004/09

ISSN： 0525-1931
Anaerobic nitrogen-fixing consortia consisting of clostridia isolated from gramineous plants Peer-reviewed

K Minamisawa, K Nishioka, T Miyaki, B Ye, T Miyamoto, M You, A Saito, M Saito, WL Barraquio, N Teaumroong, T Sein, T Sato

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(5)　3096-3102　2004/05

DOI： 10.1128/AEM.70.5.3096-3102.2004 　

ISSN： 0099-2240
New method of denitrification analysis of Bradyrhizobium field isolates by gas chromatographic determination of N-15-labeled N-2 Peer-reviewed

R Sameshima-Saito, K Chiba, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(5)　2886-2891　2004/05

DOI： 10.1128/AEM.70.5.2886-2891.2004 　

ISSN： 0099-2240
Sinorhizobium meliloti RpoH(1) is required for effective nitrogen-fixing symbiosis with alfalfa Peer-reviewed

H Mitsui, T Sato, Y Sato, N Ito, K Minamisawa

MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS　271　(4)　416-425　2004/05

DOI： 10.1007/s00438-004-0992-x 　

ISSN： 1617-4615

eISSN： 1617-4623
Expression islands clustered on the symbiosis island of the Mesorhizobium loti genome Peer-reviewed

T Uchiumi, T Ohwada, M Itakura, H Mitsui, N Nukui, P Dawadi, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Omori, M Hayashi, T Maekawa, R Sriprang, Y Murooka, S Tajima, K Simomura, M Nomura, A Suzuki, Y Shimoda, K Sioya, M Abe, K Minamisawa

JOURNAL OF BACTERIOLOGY　186　(8)　2439-2448　2004/04

DOI： 10.1128/JB.186.8.2439-2448.2004 　

ISSN： 0021-9193
Bradyrhizobium elkanii rtxC gene is required for expression of symbiotic phenotypes in the final step of rhizobitoxine biosynthesis Peer-reviewed

S Okazaki, M Sugawara, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　70　(1)　535-541　2004/01

DOI： 10.1128/AEM.70.1.535-541.2004 　

ISSN： 0099-2240
Transgenic Lotus japonicus with an ethylene receptor gene Cm-ERS1/H70A enhances formation of infection threads and nodule primordia Peer-reviewed

N Nukui, H Ezura, K Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　45　(4)　427-435　2004

DOI： 10.1093/pcp/pch046 　

ISSN： 0032-0781
Rhizobial Strategies to Enhance Symbiotic Interactions: Rhizobitoxine and 1-Aminocyclopropane-1-Carboxylate Deaminase Peer-reviewed

Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa

Microbes and Environments　19　(2)　99-111　2004

DOI： 10.1264/jsme2.19.99 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Evaluation of Soil DNA from Arable Land in Japan Using a Modified Direct-extraction Method Peer-reviewed

Seishi Ikeda, Kazuo N. Watanabe, Kiwamu Minamisawa, Nozomi Ytow

Microbes and Environments　19　(4)　301-309　2004

DOI： 10.1264/jsme2.19.301 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Quantitative and time-course evaluation of nodulation competitiveness of rhizobitoxine-producing Bradyrhizobium elkanii Peer-reviewed

S Okazaki, KI Yuhashi, K Minamisawa

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　45　(2)　155-160　2003/07

DOI： 10.1016/S0168-6496(03)00132-6 　

ISSN： 0168-6496
Phylogeny and distribution of extra-slow-growing Bradyrhizobium japonicum harboring high copy numbers of RS alpha, RS beta and IS1631 Peer-reviewed

R Sameshima, T Isawa, MJ Sadowsky, T Hamada, H Kasai, A Shutsrirung, H Mitsui, K Minamisawa

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　44　(2)　191-202　2003/05

DOI： 10.1016/S0168-6496(03)00009-6 　

ISSN： 0168-6496
Two Distinct Flagella of Bradyrhizobium japonicum and Its Motility

Yagasaki J., Minamisawa K., Aizawa S.

Seibutsu Butsuri　43　S150　2003
Publisher: The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association
DOI： 10.2142/biophys.43.S150_3 　
Analysis of the flagellar structure and secreted proteins of Bradyrhizobium japonicum DJ2

Hirano T., Minamisawa K., Aizawa S.

Seibutsu Butsuri　43　S150　2003
Publisher: The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association
DOI： 10.2142/biophys.43.S150_1 　
Nitrogen-fixing endophyte in gramineous plant Peer-reviewed

K Minamisawa

NIPPON NOGEIKAGAKU KAISHI-JOURNAL OF THE JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND AGROCHEMISTRY　77　(2)　126-129　2003

ISSN： 0002-1407
Genetic diversity of native Bradyrhizobium population in soybean-growing areas of Northern Thailand. Peer-reviewed

Shutsrirung A, Yokoyama T, Senoo K, Tajima S, Minamisawa K, Sameshima R, Bhromsiri A, Hisamatsu M

Soil Science and Plant Nutrition　49　(2)　255-265　2003/01
Researchon Biological Nitrogen Fixation and Sustainable Agriculture

Akao Shoichiro, Tajima Shigeyuki, Ohyama Takuji, Ando Shotaro, Minamisawa Kiwamu

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　73　(1)　73-78　2002
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.73.1_73 　

ISSN： 0029-0610
Herbaspirillum属エンドファイトのイネへの定着と窒素固定(2002年度大会一般講演要旨)

南澤究, 伊沢剛, 佐藤雅志

土と微生物　56　(2)　148-148　2002
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.56.2_148_1 　
嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着(2002年度大会一般講演要旨)

葉繽, 西岡きよ, 佐藤雅志, 南澤究

土と微生物　56　(2)　135-135　2002
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.56.2_135_2 　
Horizontal Transfer of Nodulation Genes in soils and Microcosms from Bradyrhizobium japonicum to B. elkanii Peer-reviewed

Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Masako Suzuki, Kazunori Ichige, Tsuyoshiisawa, Ken-Ichi Yuhashi, Hisayuki Mitsui

Microbes and Environments　17　(2)　82-90　2002

DOI： 10.1264/jsme2.2002.82 　

ISSN： 1347-4405 1342-6311
Complete genomic sequence of nitrogen-fixing symbiotic bacterium Bradyrhizobium japonicum USDA110 (supplement) Peer-reviewed

Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa, Toshiki Uchiumi, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Kumi Idesawa, Mayumi Iriguchi, Kumiko Kawashima, Mitsuyo Kohara, Midori Matsumoto, Sayaka Shimpo, Hisae Tsuruoka, Tsuyuko Wada, Manabu Yamada, Satoshi Tabata

DNA Research　9　(6)　225-256　2002

DOI： 10.1093/dnares/9.6.225 　

ISSN： 1340-2838
DNA sequence and mutational analysis of rhizobitoxine biosynthesis genes in Bradyrhizobium elkanii Peer-reviewed

T Yasuta, S Okazaki, H Mitsui, KI Yuhashi, H Ezura, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　67　(11)　4999-5009　2001/11

DOI： 10.1128/AEM.67.11.4999-5009.2001 　

ISSN： 0099-2240
Endophytic colonization and in planta nitrogen fixation by a Herbaspirillum sp isolated from wild rice species Peer-reviewed

A Elbeltagy, K Nishioka, T Sato, H Suzuki, B Ye, T Hamada, T Isawa, H Mitsui, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　67　(11)　5285-5293　2001/11

DOI： 10.1128/AEM.67.11.5285-5293.2001 　

ISSN： 0099-2240
フィリピン・ピナツボ火山泥流地帯の植生回復過程における共生微生物の役割(2001年度大会一般講演要旨)

斎藤雅典, 大場広輔, 米山忠克, 宮木太郎, 南澤究, Barraquio W. L.

土と微生物　55　(2)　133-133　2001
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.55.2_133_2 　
Two RpoH homologs responsible for the expression of heat shock protein genes in Sinorhizobium meliloti Peer-reviewed

Y. Ono, H. Mitsui, T. Sato, K. Minamisawa

Molecular and General Genetics　264　(6)　902-912　2001

DOI： 10.1007/s004380000380 　

ISSN： 0026-8925
Effects of ethylene precursor and inhibitors for ethylene biosynthesis and perception on nodulation in Lotus japonicus and Macroptilium atropurpureum Peer-reviewed

N Nukui, H Ezura, KI Yuhashi, T Yasuta, K Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　41　(7)　893-897　2000/07

DOI： 10.1093/pcp/pcd011 　

ISSN： 0032-0781
Rhizobitoxine production by Bradyrhizobium elkanii enhances nodulation and competitiveness on Macroptilium atropurpureum Peer-reviewed

KI Yuhashi, N Ichikawa, H Ezura, S Akao, Y Minakawa, N Nukui, T Yasuta, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　66　(6)　2658-2663　2000/06

DOI： 10.1128/AEM.66.6.2658-2663.2000 　

ISSN： 0099-2240
Biogeochemical Cycling and Microorganisms

Tokuyama Tatsuaki, Takeda Kiyoshi, Yokoyama Kazuhira, Wakao Norio, Sakai Masao, Ohta Hiroyuki, Minamisawa Kiwamu

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　71　(4)　586-592　2000
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.71.4_586 　

ISSN： 0029-0610
Analysis of the Bradyrhizobium nod gene-inducers from soybean super/hypernodulating mutants

Asis Jr. Constancio A., Kubota Masatsugu, Minamisawa Kiwamu, Akao Shoichiro

Soil Microorganisms　54　(1)　81-86　2000
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.54.1_81 　

ISSN： 0912-2184

More details Close

In the soybean-Bradyrhizobium symbiosis, the initial stage of nodule formation is triggered by the release of the bacterial nod gene-inducing isoflavonoids from soybean plant. Analysis of the isoflavonoid contents in the seeds and root extracts of 12-day-old uninoculated soybean cultivars and their super/hypernodulating mutant using HPLC revealed that isoflavonoids daidzein, genistein, and coumestrol were present in the roots but only daidzein and genistein could be detected in the seeds. Moreover, all the super/hypernodulating soybean mutants showed lower isoflavonoid contents in the seeds and roots than their parent cultivars. These results suggest that in all the parent cultivars the genes which are probably responsible for controlling the isoflavonoid production are both affected during mutation despite the differences in the mutagen used and background of the seed materials.
Endophytic colonization in rice by diazotrophic Herbaspirillum sp. isolated from wild rice(The Annual Meeting of the Society in 2000)

Elbeltagy Adel, Nishioka Kiyo, Suzuki Hisa, Miyaki Taro, Yuhashi Ken-Ichi, Sato Tadashi, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

Soil Microorganisms　54　(2)　172-172　2000
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.54.2_172_1 　
Isolation and characterization of low-indole-3-acetic acid-producing mutants from bradyrhizobium elkanii Peer-reviewed

Ken Yagi, Taku Matsumoto, Tetsuya Chujo, Hideaki Nojiri, Toshio Omori, Kiwamu Minamisawa, Makoto Nishiyama, Hisakazu Yamane

Bioscience, Biotechnology and Biochemistry　64　(7)　1359-1364　2000

DOI： 10.1271/bbb.64.1359 　

ISSN： 1347-6947 0916-8451
Isolation and characterization of endophytic bacteria from wild and traditionally cultivated rice varieties Peer-reviewed

Adel Elbeltagy, Kiyo Nishioka, Hisa Suzuki, Tadashi Sato, Yo-Ichiro Sato, Hisao Morisaki, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

Soil Science and Plant Nutrition　46　(3)　617-629　2000

DOI： 10.1080/00380768.2000.10409127 　

ISSN： 1747-0765 0038-0768
Effect of ethylene on Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer to melon. Peer-reviewed

Ezura, H, Yuhashi, K, Yasuta, T, Minamisawa, K

Plant Breeding　119　75-79-79　2000/01
In vitro plant regeneration in Macroptilium atropurpureum, a legume with a broad symbiont range for nodulation. Peer-reviewed

Ezura, H, Nukui, T, Yuhashi, K-I, Minamisawa, K

Plant Science.　159　21-27　2000/01
IS1631 occurrence in Bradyrhizobium japonicum highly reiterated sequence-possessing strains with high copy numbers of repeated sequences RS alpha and RS beta Peer-reviewed

T Isawa, R Sameshima, M Mitsui, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　65　(8)　3493-3501　1999/08

ISSN： 0099-2240
Diversity and field site variation of indigenous populations of soybean bradyrhizobia in Japan by fingerprints with repeated sequences RS alpha and RS beta Peer-reviewed

K Minamisawa, Y Nakatsuka, T Isawa

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　29　(2)　171-178　1999/06

DOI： 10.1016/S0168-6496(99)00009-4 　

ISSN： 0168-6496
Use of lacZ and gusA reporter genes to trace the infection process of nitrogen-fixing bacteria Peer-reviewed

S Akao, Y Minakawa, H Taki, MK Khan, K Yuhashi, Y Nakayama, CA Asis, Chebotar, V, UG Kang, K Minamisawa, RW Ridge

JARQ-JAPAN AGRICULTURAL RESEARCH QUARTERLY　33　(2)　77-84　1999/04

ISSN： 0021-3551
New assay for rhizobitoxine based on inhibition of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase Peer-reviewed

T Yasuta, S Satoh, K Minamisawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　65　(2)　849-852　1999/02

ISSN： 0099-2240
第8回微生物生態国際シンポジウム雑感(こんなことが,いま)

南澤究

土と微生物　53　(1)　63-64　1999
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.53.1_63 　

ISSN： 0912-2184
New Bradyrhizobium japonicum strains that possess high copy numbers of the repeated sequence RS alpha Peer-reviewed

K Minamisawa, T Isawa, Y Nakatsuka, M Ichikawa

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　64　(5)　1845-1851　1998/05

ISSN： 0099-2240
Slow-growing and oligotrophic soil bacteria phylogenetically close to Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

A Saito, H Mitsui, R Hattori, K Minamisawa, T Hattori

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　25　(3)　277-286　1998/03

DOI： 10.1016/S0168-6496(98)00009-9 　

ISSN： 0168-6496
8-12 野生イネおよび栽培イネ在来品種のエンドファイトの検索(8.共生)

西岡キヨ, 佐藤雅志, 篠崎聡, 中村郁郎, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　58-58　1998
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_58_2 　

ISSN： 0288-5840
6-21 ダイズ根粒菌HRS株からの根粒形成遺伝子の水平伝達(6.土壌生物)

板倉学, 伊沢剛, 三井久幸, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　45-45　1998
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_45_1 　

ISSN： 0288-5840
8-17 根粒菌のリゾビトキシン生産と宿主植物のエチレン生成(8.共生)

市川徳一, 遊橋健一, 江面浩, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　61-61　1998
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_61_1 　

ISSN： 0288-5840
6-20 ダイズ根粒菌HRS株の分布とその生態的意義(6.土壌生物)

伊沢剛, 板倉学, 市川徳一, 西岡キヨ, 三井久幸, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　44　44-44　1998
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_44_2 　

ISSN： 0288-5840
Preferential nodulation of Glycine max, Glycine soja and Macroptilium atropurpureum by two Bradyrhizobium species japonicum and elkanii Peer-reviewed

K Minamisawa, S Onodera, Y Tanimura, N Kobayashi, KI Yuhashi, M Kubota

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　24　(1)　49-56　1997/09

DOI： 10.1016/S0168-6496(97)00043-3 　

ISSN： 0168-6496
根粒菌の進化と共生の機構にせまる共生プラスミドの全構造

南沢究

化学と生物　35　(8)　578-579　1997/08/25
Publisher: Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu1962.35.578 　

ISSN： 0453-073X
Nodulation and competitiveness of gusA-marked Bradyrhizobium japonicum A1017 in soybean Peer-reviewed

KI Yuhashi, K Minamisawa, Y Minakawa, DJ Tobias, M Kubota, S Akao

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　43　(2)　473-478　1997/06

ISSN： 0038-0768
Estimation of gus Marked Bradyrhizobial Number by Phenol Extraction of GUS Metabolite

MINAGAWA Ritsuko, ISODA Kaori, OHTAKE Norikuni, YAMADA Shinya, IKARASHI Taro, MINAMISAWA Kiwamu, OHYAMA Takuji

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　68　(2)　148-155　1997
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.68.2_148 　

ISSN： 0029-0610

More details Close

Bradyrhizobium japonicum strain 61 A 124 a, in which Escherichia coli gus A gene was introduced to Bradyrhizobium japonicum, absorbs and hydrolyzes GUS-substrate (X-Gluc), and precipitates an indigo pigment. We attempted to use the absorbance of the accumulated GUS-metabolite as an indicator of the rhizobial number in soil. The accumulated indigo blue metabolite in rhizobia were extracted by phenol-water after they are incubated with X-Gluc (20 μL of 1% X-Gluc solution in N,N-dimethylformamide was added to 1 mL of culture solution) for 4 d. The absorbance of the extracted blue pigment in the phenol layer was measured at 645 nm. The initial number of rhizobia and the absorbance of the GUS-metabolite was positively correlated either in cultured 61 A 124 a or in the various types of soil inoculated with 61 A 124 a strain. In the presence of soil, the absorbance per rhizobial number was low compared with the pure culture. Therefore, a standard curve between rhizobial number of 61 A 124 a and the absorbance should be made for every soil sample. During incubation with X-Gluc, rhizobia did not proliferate because of the depression effect on cell growth of N,N-dimethylformamide and the accumulation of indigo pigment. The proliferation and mobility of inoculated 61 A 124 a strain was examined in a rhizobox containing various soil types into which soybeans were planted. The distribution and movement of the marked strain depended on the soil type. In the absence or very low density of indigenous Bradyrhizobium japonicum, the nodule was exclusively formed by the strain 61 A 124 a. On the other hand, the major part of nodules were formed by indigenous strains in the soil types containing a high population of indigenous bradyrhizobia, although the inoculated strain proliferated very well.
26 Comparative Analysis of Isoflavonoid in the Seed of Nodulation-Mutant Soybean and Its Effect on Nodulation Control

Asis Jr., Sato N., Isobe K., Kubota M., Minamisawa K., Akao S.

Abstracts of the Annual Meetings, Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition　43　336-336　1997
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dohikouen.43.0_336_2 　

ISSN： 0288-5840
8-8 ダイズ根粒菌のゲノム再編成と根粒形成遺伝子の水平伝達(8.共生)

南沢究, 伊沢剛, 遊橋健一, 市毛秀則, 鈴木雅子, 三上朋子, 板倉学

日本土壌肥料学会講演要旨集　43　63-63　1997
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.43.0_63_2 　

ISSN： 0288-5840
Hydrogenase activity of soybean nodules doubly infected with Bradyrhizobium japonicum and B-elkanii Peer-reviewed

K Minamisawa, K Ebihara

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　42　(4)　917-920　1996/12

ISSN： 0038-0768
Indolepyruvate pathway for indole-3-acetic acid biosynthesis in Bradyrhizobium elkanii Peer-reviewed

K Minamisawa, K Ogawa, H Fukuhara, J Koga

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　37　(4)　449-453　1996/06

ISSN： 0032-0781
8-4 ダイズ根粒菌超反復配列保有株におけるDNA再編成と遺伝子水平伝播 : (第2報)挿入配列の特徴と分布(8.共生)

伊沢剛, 三上朋子, 坂井満, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　52-52　1996
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_52_2 　

ISSN： 0288-5840
8-3 ダイズ根粒菌超反復配列保有株におけるDNA再編成と遺伝子水平伝播 : (第1報)超反復配列保有株の特徴とDNA再編成の証拠(8.共生)

南沢究, 伊沢剛, 三上朋子, 坂井満, 市毛秀則

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　52-52　1996
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_52_1 　

ISSN： 0288-5840
8-15 Bradyrhizobium japonicumのNod factorにより誘導されるダイズ細胞の生化学的応答(8.共生)

横山正, 小林直紀, 河内宏, 南沢究, 加来久敏

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　58-58　1996
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_58_1 　

ISSN： 0288-5840
8-7 gus-代謝産物のフェノール抽出測定法によるgus-根粒菌株の挙動の解析(8.共生)

皆川律子, 磯田香保里, 大竹憲邦, 南澤究, 五十嵐太郎, 大山卓爾

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　54-54　1996
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_54_1 　

ISSN： 0288-5840
8-17 ダイズおよびサイラトロに対するBradyrhizobium japonicumとB.elkaniiの根粒形成速度(8.共生)

遊橋健一, 赤尾勝一郎, 久保田正亜, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　59-59　1996
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_59_1 　

ISSN： 0288-5840
8-16 ダイズ根粒菌におけるインドール酢酸生産と根粒形成(8.共生)

福原英之, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　42　58-58　1996
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.42.0_58_2 　

ISSN： 0288-5840
Bradyrhizobium elkanii induces outer cortical root swelling in soybean Peer-reviewed

KI Yuhashi, S Akao, H Fukuhara, E Tateno, JY Chun, G Stacey, H Hara, M Kubota, T Asami, K Minamisawa

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　36　(8)　1571-1577　1995/12

ISSN： 0032-0781
6-24 Heteroduplex形成法による土壌細菌逆方向反復配列の検索(6.土壌生物)

伊沢剛, 南沢究, 服部勉

日本土壌肥料学会講演要旨集　41　48-48　1995
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.41.0_48_2 　

ISSN： 0288-5840
8-1 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのインドールピルビン酸デカルボキシラーゼ(8.共生)

福原英之, 下山由紀子, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　41　62-62　1995
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.41.0_62_1 　

ISSN： 0288-5840
THE INVOLVEMENT OF INDOLE-3-ACETIC-ACID PRODUCED BY BRADYRHIZOBIUM-ELKANII IN NODULE FORMATION Peer-reviewed

H FUKUHARA, Y MINAKAWA, S AKAO, K MINAMISAWA

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　35　(8)　1261-1265　1994/12

ISSN： 0032-0781
6-8 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのインドール酢酸生合成系 : インドールピルビン酸デカルボキシラーゼの活性の検出とそのクローニング(6.植物の代謝および代謝成分)

舘野栄司, 小川健一郎, 福原英之, 朝山宗彦, 古賀仁一郎, 足立尭, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　40　98-98　1994
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.40.0_98_2 　

ISSN： 0288-5840
4-42 ダイズ根粒菌超反復配列保有株の生理的性質(4. 土壌生物)

南沢究, 中塚陽子

日本土壌肥料学会講演要旨集　39　51-51　1993
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.39.0_51_2 　

ISSN： 0288-5840
45 Bradyrhizobium層根粒菌におけるインドール酢酸の代謝(関東支部講演会要旨)

小川健一郎, 飯生宏志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　39　299-299　1993
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.39.0_299_1 　

ISSN： 0288-5840
Genetic Ecology of Rhizobium and Bradyrhizobium Peer-reviewed

Kiwamu Minamisawa

Nippon Nogeikagaku Kaishi　67　(7)　1070-1072　1993

DOI： 10.1271/nogeikagaku1924.67.1070 　

ISSN： 0002-1407
Distribution of Rhizobia in Leguminous Plants Surveyed by Phylogenetic Identification Peer-reviewed

Satoshi Matsumoto, Kiwamu Minamisawa, Takuma Gamou, Hiroshi Oyaizu

The Journal of General and Applied Microbiology　39　(4)　339-354　1993

DOI： 10.2323/jgam.39.339 　

ISSN： 1349-8037 0022-1260
GENETIC RELATEDNESS OF BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM FIELD ISOLATES AS REVEALED BY REPEATED SEQUENCES AND VARIOUS OTHER CHARACTERISTICS Peer-reviewed

K MINAMISAWA, T SEKI, S ONODERA, M KUBOTA, T ASAMI

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　58　(9)　2832-2839　1992/09

ISSN： 0099-2240
Oligofructans in the Shoot, Seed Yacon, and Tuber of Yacon

ASAMI Teruo, MINAMISAWA Kiwamu, TSUCHIYA Tetsuro, KANO Kayoko, HORI Ikutaro, OHYAMA Takuji, KUBOTA Masatsugu, TSUKIHASHI Teruo

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　63　(1)　72-74　1992
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.63.1_72 　

ISSN： 0029-0610
6-21 DNAハイブリダイゼーション法による土着ダイズ根粒菌の系統と多様性 : (第1報)新潟農試中沢圃場の根粒菌相の解析(6. 植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 関孝幸, 小野寺新吾, 浅見輝男

日本土壌肥料学会講演要旨集　38　101-101　1992
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.38.0_101_1 　

ISSN： 0288-5840
6-22 DNAハイブリダイゼーション法による土着ダイズ根粒菌の系統と多様性 : (第2報)各地土壌の根粒菌相の解析(6. 植物の代謝および代謝成分)

中塚陽子, 関孝幸, 南沢究, 浅見輝男

日本土壌肥料学会講演要旨集　38　101-101　1992
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.38.0_101_2 　

ISSN： 0288-5840
Determination of Genotype Group of Bradyrhizobium japonicum by Indole-3-Acetic Acid Production

MINAMISAWA Kiwamu, IINO Hiroshi, SAITO Naeo, ONODERA Shingo, NAKATSUKA Yoko, NAKAZIMA Saeko, KUBOTA Masatsugu, ASAMI Teruo

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　63　(4)　459-462　1992
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.63.4_459 　

ISSN： 0029-0610
Phylogeny and ecology of Bradyrhizobium japonicum

MINAMISAWA Kiwamu

Soil Microorganisms　40　37-46　1992
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.40.0_37 　
Fluctuation of Oligofructan Contents in Tubers of Yacon (Polymia sonchifolia) during Growth and Storage

ASAMI Teruo, MINAMISAWA Kiwamu, TSUCHIYA Tetsuro, KANO Kayoko, HORI Ikutaro, OHYAMA Takuji, KUBOTA Masatsugu, TSUKIHASHI Teruo

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　62　(6)　621-627　1991
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.62.6_621 　

ISSN： 0029-0610

More details Close

Tubers of yacon (Polymnia sonchifolia or P. edulis), a crop native to the Andean Highlands, contain a large amount of oligofructans. We investigated fluctuation of fructose, glucose, sucrose and oligofructan (GF_2-GF_9) contents during growth and storage by using an HPLC. The average degree of polymerization (DP) of these sugars in the tubers increased during growth. The DP reached to 4.3 at harvest, and decreased again during storage. Glucose, sucrose and GF_2 decreased, whereas the oligofructans larger than GF_4 increased during growth. At harvest, total oligofructan content reached to 67% of dry matter, and the ratio of GF_2-GF_5 accounted for about 70% in the total sugars. Inulin and starch contents in the tubers were only less than 0.23% and 0.04% of dry matter, respectively. The tubers were stored in 3 ways : a soil pit in field, at 5℃ and 25℃. After 2 weeks, total oligofructan content decreased 21% in the soil pit, 33% at 5℃ storage and 41% at 25℃ storage. Oligofructan contents decreased gradually and fructose, glucose and sucrose contents increased during each storage. To efficiently obtain oligofructans from yacon tubers, it will be necessary to prepare them from the tubers just after harvest. For eating yacon tubers, it will be suitable to store them for several weeks.
6-22 ダイズ根粒菌の進化系統とインドール酢酸の生成(6. 植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 深井克彦, 狩野佳弥子, 飯生宏志, 斉藤苗緒

日本土壌肥料学会講演要旨集　37　94-94　1991
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.37.0_94_2 　

ISSN： 0288-5840
PRODUCTION OF INDOLE-3-ACETIC-ACID BY BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM - A CORRELATION WITH GENOTYPE GROUPING AND RHIZOBITOXINE PRODUCTION Peer-reviewed

K MINAMISAWA, K FUKAI

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　32　(1)　1-9　1991/01

ISSN： 0032-0781
Polyamines in Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium and Argobacterium Peer-reviewed

Koei Hamana, Kiwamu Minamisawa, Shigeru Matsuzaki

FEMS Microbiology Letters　71　(1-2)　71-76　1990/09/01

DOI： 10.1016/0378-1097(90)90034-N 　

ISSN： 1574-6968 0378-1097
RHIZOBITOXINE INHIBITION OF HYDROGENASE SYNTHESIS IN FREE-LIVING BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM Peer-reviewed

K MINAMISAWA, K FUKAI, T ASAMI

JOURNAL OF BACTERIOLOGY　172　(8)　4505-4509　1990/08

ISSN： 0021-9193
III-2(1) 農業分野における利用の現状 : (1)生物的窒素固定におけるバイオテクノロジー(III. 土壌微生物分野におけるバイオテクノロジーの利用 : その可能性の問題点)

南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　36　17-18　1990
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.36.0_17 　

ISSN： 0288-5840
Composition of storage carbohydrate in tubers of yacon (polymnia sonchifolia) Peer-reviewed

Takuji Ohyama, Osamu Ito, Sawako Yasuyoshi, Taro Ikarashi, Kiwamu Minamisawa, Masatsugu Kubota, Teruo Tsukihashi, Osamu Ito, Kiwamu Minamisawa, Masatsugu Kubota, Teruo Tsukihashi, Teruo Asami

Soil Science and Plant Nutrition　36　(1)　167-171　1990

DOI： 10.1080/00380768.1990.10415724 　

ISSN： 1747-0765 0038-0768
Stimulation of hydrogenase synthesis in free-living Bradyrhizobium japonicum by addition of nitrate and ammonium Peer-reviewed

Katsuhiko Fukai, Kiwamu Minamisawa, Teruo Asami

Soil Science and Plant Nutrition　36　(2)　345-347　1990

DOI： 10.1080/00380768.1990.10415001 　

ISSN： 1747-0765 0038-0768
DIVISION OF RHIZOBITOXINE-PRODUCING AND HYDROGEN-UPTAKE POSITIVE STRAINS OF BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM BY NIFDKE SEQUENCE DIVERGENCE Peer-reviewed

K MINAMISAWA

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　31　(1)　81-89　1990/01

ISSN： 0032-0781
COMPARISON OF EXTRACELLULAR POLYSACCHARIDE COMPOSITION, RHIZOBITOXINE PRODUCTION, AND HYDROGENASE PHENOTYPE AMONG VARIOUS STRAINS OF BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM Peer-reviewed

K MINAMISAWA

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　30　(6)　877-884　1989/09

ISSN： 0032-0781
Yacon strawberry, Polymnia sonchifolia, a new root vegetable.

KAGAKU TO SEIBUTSU　27　(12)　813-815　1989
Publisher: Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu1962.27.813 　

ISSN： 0453-073X
Chemical Composition of Yacon, a New Root Crop from the Andean Highlands

ASAMI Teruo, KUBOTA Masatsugu, MINAMISAWA Kiwamu, TSUKIHASHI Teruo

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　60　(2)　122-126　1989
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.60.2_122 　

ISSN： 0029-0610

More details Close

Yacon (Polymnia sonchifolia or P. edulis), a root crop native to the Andean Highlands, was introduced into Japan via New Zealand in 1985. the chemical compositions of yacon were determined and the following results were obtained. 1) Compared with the tubers such as potato, taro, Jerusalem artichoke, and Japanese yam, yacon has high moisture, low nitrogen, phosphorus and intermediate iron, and high calcium contents. 2) Free sugars in yacon were only fructose, glucose, and sucrose. These three sugars amounted to 29% of the total dry weight. 3) Twenty-one free nitrogenous compounds (amino acids, and amides) were detected. The nitrogen content of asparagine, glutamine, proline, proline, and arginine accounted for 87% of the nitrogen in the 21free nitrogenous compounds. Nitrogen derived from the 21 free nitrogenous compounds reached about 65% of total nitrogen. 4) The hydrolysate of the polysaccharide fraction contained nearly the same mole of glucose and fructose, suggesting that polysaccharides other than inulin should exist in yacon.
52 土着ダイズ根粒菌における生理的性質の多様性について(関東支部講演会要旨)

南沢究, 山野稔, 〓原くに子

日本土壌肥料学会講演要旨集　35　290-290　1989
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.35.0_290_2 　

ISSN： 0288-5840
6-7 nifDH遺伝子および生理的諸性質によるダイズ根粒菌のグルーピング(6.植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 鶴田恭子

日本土壌肥料学会講演要旨集　35　91-91　1989
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.35.0_91_1 　

ISSN： 0288-5840
ISOLATION AND ENZYMOLOGICAL CHARACTERIZATION OF INFECTED AND UNINFECTED CELL PROTOPLASTS FROM ROOT-NODULES OF GLYCINE-MAX Peer-reviewed

H KOUCHI, K FUKAI, H KATAGIRI, K MINAMISAWA, S TAJIMA

PHYSIOLOGIA PLANTARUM　73　(3)　327-334　1988/07

ISSN： 0031-9317
Natural Abundance of Cadmium. Antimony, Bismuth and Some Other Heavy Metals In Japanese Soils

ASAMI Teruo, KUBOTA Masatsugu, MINAMISAWA Kiwamu

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　59　(2)　197-199　1988
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.59.2_197 　

ISSN： 0029-0610
Determination of Hup Phenotype of Bradyrhizobium japonicum by Amperometric Technique

MINAMISAWA K, NIN K, YAMANO M

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　59　(2)　200-202　1988
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.59.2_200 　

ISSN： 0029-0610
6-11 ダイズ根粒感染細胞・非感染細胞の分離とその酵素活性(6.植物の代謝および代謝成分)

河内宏, 深井克彦, 片桐弘樹, 南沢究, 田島茂行

日本土壌肥料学会講演要旨集　34　90-90　1988
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.34.0_90_1 　

ISSN： 0288-5840
4-45 Hup型・リゾビトキシン生産能・菌体外多糖などによるダイズ根粒菌の分類(4.土壌生物)

南沢究, 山野稔, 任清美

日本土壌肥料学会講演要旨集　34　49-49　1988
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.34.0_49_1 　

ISSN： 0288-5840
61 安中重金属汚染水田土壌のアンチモン,ビスマス含有率(関東支部講演会要旨)

久保田正亜, 南澤究, 松木正浩, 保田睦, 浅見輝男

日本土壌肥料学会講演要旨集　34　276-276　1988
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.34.0_276_1 　

ISSN： 0288-5840
第7回国際窒素固定会議に出席して(こんなことが,いま)

南沢究

土と微生物　32　52-52　1988
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.32.0_52_1 　
Studies on Superior Bradyrhizobium japonicum Strains

MINAMISAWA K.

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　58　(3)　291-292　1987
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.58.3_291 　

ISSN： 0029-0610
11-17 日本における土壌中有害金属元素の自然界値(11.環境保全)

浅見輝男, 久保田正亜, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　33　175-175　1987
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.33.0_175_1 　

ISSN： 0288-5840
Assimilation and transport of fixed nitrogen in soybean nodule as revealed with 15N Peer-reviewed

Kikuo Kumazawa, Yasuhiro Arima, Takuji Ohyama, Kiwamu Minamisawa

Proceedings of the Japan Academy Series B: Physical and Biological Sciences　63　(6)　223-226　1987

DOI： 10.2183/pjab.63.223 　

ISSN： 1349-2896 0386-2208
Determination of Rhizobitoxine and Dihydrorhizobitoxine in Soybean Plants by Amino Acid Analyzer Peer-reviewed

Kiwamu Minamisawa, Norifumi Kume

Soil Science and Plant Nutrition　33　(4)　645-649　1987

DOI： 10.1080/00380768.1987.10557613 　

ISSN： 1747-0765 0038-0768
SERINOL (2-AMINO-1,3-PROPANEDIOL) AND 3-AMINO-1,2-PROPANEDIOL IN SOYBEAN NODULES Peer-reviewed

K MINAMISAWA, H WATANABE

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　27　(6)　1109-1116　1986/09

ISSN： 0032-0781
Characteristics of asparagine pool in soybean nodules in comparison with ureide pool Peer-reviewed

Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima, Kikuo Kumazawa

Soil Science and Plant Nutrition　32　(1)　1-14　1986

DOI： 10.1080/00380768.1986.10557476 　

ISSN： 1747-0765 0038-0768
Inoculation Effect of Rhizobium japonicum Possessing Hydrogen-Recycling System on Nitrogen Fixation by Modulated Soybeans and Nitrogen Distribution to Their Organs

MINAMISAWA Kiwamu, ARIMA Yasuhiro, TANAKA Hiroyuki, KUMAZAWA Kikuo

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　56　(4)　292-299　1985
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.56.4_292 　

ISSN： 0029-0610
22 水素回収系を持つダイズ根粒菌の接種効果(関東支部講演会要旨)

南沢究, 有馬泰紘, 田中裕之, 熊沢喜久雄

日本土壌肥料学会講演要旨集　31　253-253　1985
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.31.0_253_2 　

ISSN： 0288-5840
UNIDENTIFIED COMPOUND SPECIFICALLY ACCUMULATED IN SOYBEAN NODULES FORMED WITH H2-UPTAKE NEGATIVE RHIZOBIUM-JAPONICUM STRAINS Peer-reviewed

K MINAMISAWA, Y ARIMA, K KUMAZAWA

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　30　(3)　435-444　1984

ISSN： 0038-0768
TRANSPORT OF FIXED NITROGEN FROM SOYBEAN NODULES INOCULATED WITH H-2-LABELED UPTAKE POSITIVE AND NEGATIVE RHIZOBIUM-JAPONICUM STRAINS Peer-reviewed

K MINAMISAWA, Y ARIMA, K KUMAZAWA

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　29　(1)　85-92　1983

ISSN： 0038-0768
6-7 水素発生,非発生ダイズ根粒による固定窒素の同化(合同部会生物的窒素固定)(6.植物の代謝および代謝成分)

南沢究, 有馬泰紘, 熊沢喜久雄

日本土壌肥料学会講演要旨集　28　88-88　1982
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.28.0_88_1 　

ISSN： 0288-5840
Screening of Rhizobium japonicum Forming the Soybean Nodules Having No Hydrogen Evolution Air

ARIMA Yasuhiro, MINAMISAWA Kiwamu, KUMAZAWA Kikuo

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　52　(2)　114-118　1981
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.52.2_114 　

ISSN： 0029-0610

Show all ︎Show first 5

Misc. 290

Citizen science project “Explore Global-Cooling Microbes“ aims to reduce soil greenhouse gas emission

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023
温室効果ガス削減と土壌微生物学

76(2)　36-42　2022/10
非マメ科作物の窒素固定エンドファイト

南澤究

協会誌「作物生産と土づくり」　10・11月号　21-25　2022/10
窒素循環を担う植物共生微生物

南澤究

日本農学賞受賞論文学会誌「土と微生物」　76(1)　4-11　2022/04

DOI： 10.18946/jssm.76.1_4 　
Bradyrhizobium ottawaense株における温室効果ガスN₂Oの還元能

原沙和, 原沙和, SIQUEIRA Arthur Fernandes, 菅原雅之, 板倉学, 三井久幸, GOMES Cristina Sanchez, 佐藤修正, 下田宜司, 今泉(安楽)温子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022

ISSN： 2424-0575
土壌から発生するN₂O削減をめざす市民科学プロジェクト~地球冷却微生物を探せ~

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 菊地美穂, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022

ISSN： 2424-0575
土壌のN₂O発生削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 加藤広海, 菊地美穂, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022

ISSN： 2424-0575
役に立つ農業微生物の知識（連載8）水稲根のメタン酸化窒素固定

南澤究

ニューカントリー 11月号　(788)　2019/11
役に立つ農業微生物の知識（連載7）地球環境を守る根粒菌

南澤究

ニューカントリー 10月号　(787)　46-47　2019/10
Editorial: Metabolic adjustments and gene expression reprogramming for symbiotic nitrogen fixation in legume nodules. Peer-reviewed

Brett James Ferguson, Kiwamu Minamisawa, Nacira Belen Muñoz, Hon-Ming Lam.

Frontiers in Plant Science　10　898　2019/07
ソルガム由来Bradyrhizobiumの窒素固定とゲノム情報に基づく機能解析

原沙和, 原新太郎, 森川峻志, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　13th　89　2019/03/06
窒素固定遺伝子を有する脱窒細菌によるN₂O固定の検証

鈴木里俊, 早川智恵, 早川智恵, 増田曜子, 西澤智康, 菅原雅之, 嵐田遥, 南澤究, 磯部一夫, 妹尾啓史, 妹尾啓史

日本微生物生態学会大会(Web)　33rd　2019
Methylobacterium sp.AMS5株接種によるダイズ地上部の細菌叢シフト

原新太郎, 松田雅敏, 原沙和, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　28th　61(JA),62(EN)　2018/11

ISSN： 1341-0652
ソルガム根におけるBradyrhizobium属細菌分離株のnif遺伝子群と窒素固定能

原沙和, 森川峻志, 原新太郎, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　28th　53(JA),54(EN)　2018/11

ISSN： 1341-0652
ソルガム根からのBradyrhizobium属窒素固定細菌の分離と特性解析

森川峻志, 原新太郎, 原沙和, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　28th　51(JA),52(EN)　2018/11

ISSN： 1341-0652
オーミック解析に基づくソルガム根窒素固定細菌の特

原新太郎, 森川峻志, 和才沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　64　26　2018/08/29

ISSN： 0288-5840
環境オミックス解析によるソルガム根の窒素固定Bradyrhizobium属細菌の同定

原新太郎, 森川峻志, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　12th　62　2018/03/05
植物組織からの細菌細胞濃縮法の改良:ダイズ組織別の細菌叢解析

原新太郎, 松田雅敏, 新井沙和, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2018　17　2018
根粒菌ニトロゲナーゼの水素発生による土壌細菌叢変化と根粒共生の低温適応

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2018　18　2018
ダイズ由来Methylobacterium属細菌のゲノムから推定されたウレイド分解および炭素代謝のポテンシャル

新井沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　105 (JA),106 (EN)　2017/12

ISSN： 1341-0652
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌のOmic解析による同定

南澤究, 原新太郎, 森川峻志, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　23 (JA),24 (EN)　2017/12

ISSN： 1341-0652
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌の探索

森川峻志, 原新太郎, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　103 (JA),104 (EN)　2017/12

ISSN： 1341-0652
Greenhouse gas emission from the soybean rhizosphere is mitigated by promoting nitrous oxide reductase activity in bradyrhizobia

南澤究

植物の生長調節　52　(2)　127-131　2017/12
Publisher: 植物化学調節学会誌
根粒菌による根圏温室効果ガス発生削減

南澤究

アグリバイオ　1　(10)　40-43　2017/09/20
Publisher: (株)北隆館
土壌団粒化資材による超団粒土壌の微生物叢変化

南澤究, 原新太郎, 田ノ上明宏, 林利夫, 遠藤圭二

日本土壌肥料学会講演要旨集　63　21　2017/09/05

ISSN： 0288-5840
ダイズ根粒菌USDA110系統のゲノム多様性と吸収型ヒドロゲナーゼゲノミックアイランド構造変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐315 (WEB ONLY)　2017
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌接種株の追跡

金原一真, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　11th　63　2017
土着ダイズ根粒菌USDA110系統株におけるゲノム多様性とゲノミックアイランド構造の変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　11th　60　2017
接種実験系によるMethylobacterium属細菌のダイズ器官および組織内の局在性

岩崎還帰, SITI Hafidah Nur, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐302 (WEB ONLY)　2017
根粒菌hupSL1変異によるダイズ根圏のH₂代謝と細菌群集構造の変動

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 高橋智子, 三屋公佑, 菅原雅之, 板倉学, 金子貴一, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐317 (WEB ONLY)　2017
連作ダイズ莢組織内のMethylobacterium属細菌の動態:組織内分布と分離株の系統・ウレイド代謝

原新太郎, NUR Hafidah Siti, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.O‐073 (WEB ONLY)　2017
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌の探索

森川峻志, 原新太郎, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　2017　ROMBUNNO.P‐323 (WEB ONLY)　2017
ダイズ根粒菌Bradyhrozbium diazoefficiens USDA110型菌株における吸収型ヒドロゲナーゼの多様性

渡辺剛, 板倉学, 三屋公佑, 原新太郎, 金原一真, 菅原雅之, 按田瑞恵, 篠田亮, 金子貴一, 金子貴一, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　76 (JA),77 (EN)　2016/12

ISSN： 1341-0652
連作によるダイズ地上部の細菌叢変化

原新太郎, 鶴丸博人, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　21 (JA),22 (EN)　2016/12

ISSN： 1341-0652
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種判定および土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別

金原一真, 板倉学, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, WANG Yong, 鶴丸博人, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　62 (JA),63 (EN)　2016/12

ISSN： 1341-0652
土壌微生物が創る共生の世界−その先端的研究事例と農業への応用的研究展開

南澤究

日本土壌肥料学雑誌　87　(5)　383-387　2016/10/05
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.87.5_383 　
土着ダイズ根粒菌混合菌株の接種によるダイズ圃場からのN2O発生削減

秋山博子, 星野(高田)裕子, 板倉学, 板倉学, 下村有美, 下村有美, 王勇, 山本昭範, 山本昭範, 多胡香奈子, 中島泰弘, 南澤究, 早津雅仁

日本土壌肥料学会講演要旨集　62　166-166　2016/09/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.62.0_166_2 　

ISSN： 0288-5840
メタゲノム解析によるダイズMethylobacterium属細菌のメチルアミン・ウレイド代謝の発見

南智之, 按田瑞恵, 三井久幸, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 佐藤修正, 池田成志, 原新太郎, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2016　17　2016/06/06
Sustainable agriculture by the regulation of plant-associated microbial community

大久保卓, 池田成志, 南澤究

土と微生物 = Soil microorganisms　70　(1)　10-16　2016/04
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.70.1_10 　

ISSN： 0912-2184
Are Symbiotic Methanotrophs Key Microbes for N Acquisition in Paddy Rice Root?

Kiwamu Minamisawa, Haruko Imaizumi-Anraku, Zhihua Bao, Ryo Shinoda, Takashi Okubo, Seishi Ikeda

MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(1)　4-10　2016/03

DOI： 10.1264/jsme2.ME15180 　

ISSN： 1342-6311
硝酸供給に応答したシロイヌナズナ根の共生細菌群集の変化

小西範幸, 小西範幸, 大久保卓, 早川俊彦, 山谷知行, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　26th　2016

ISSN： 1341-0652
微生物環境応答システムの速度論的解析と応用開発

日高將文, 後藤愛那, 清水泰希, 南澤究, 今村博臣, 内田隆史

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2016　2016

ISSN： 2186-7976
イネとダイズの共生微生物による窒素代謝

南澤究

肥料科学　(38)　79-108　2016
Publisher: 肥料科学研究所
ISSN： 0387-2718
土着の根粒菌を用いたダイズ畑でのN2O発生の削減

秋山博子, 星野(高田)裕子, 板倉学, 板倉学, 下村有美, 王勇, 山本昭範, 多胡香奈子, 中島泰弘, 南澤究, 早津雅仁

農研機構農業環境変動研究センター成果情報(Web)　2016　2016
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種の判定と接種菌群の追跡

金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　10th　73　2016
ダイズ圃場からの収穫期前後におけるN₂O発生源の特定と土着ダイズ根粒菌混合菌株利用によるN₂O発生削減

星野裕子, 秋山博子, 板倉学, 板倉学, 下村有美, 下村有美, 王勇, 山本昭範, 山本昭範, 多胡香奈子, 中島泰弘, 南澤究, 早津雅仁

日本微生物生態学会大会(Web)　31st　212 (WEB ONLY)　2016
Bacterial Glade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome

Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

GENES & GENETIC SYSTEMS　90　(6)　376-376　2015/12

ISSN： 1341-7568

eISSN： 1880-5779
日本のダイズリソースにおけるRj2遺伝型の分布

菅原雅之, 梅原洋佐, 千葉(柿崎)芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　25th　39 (JA),40 (EN)　2015/12

ISSN： 1341-0652
メタゲノム‐マッピング法による土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別

南澤究, 金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野(高田)裕子, WANG Yong, 秋山博子, 早津雅仁

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　25th　29 (JA),30 (EN)　2015/12

ISSN： 1341-0652
大量の挿入配列を保有するダイズ根粒菌のゲノム解析 : 根粒菌の生成と消滅を示唆する共生アイランド爆発(2015年度大会講演要旨)

飯田隆之, 板倉学, 按田瑞恵, 菅原雅之, 伊沢剛, 大久保卓, 佐藤修正, 千葉(柿崎) 芳里, 南澤究

土と微生物　69　(2)　111-111　2015/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
日本のダイズ根粒菌とダイズのRj2共生不和合性

菅原雅之, 鈴木悠太, 板倉学, 千葉(柿崎)芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

土と微生物　69　(2)　124-124　2015/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
10 連作したダイズの収量と根共生細菌の多様性(東北支部講演会,2014年度各支部会)

鶴丸博人, 板倉学, 大久保卓, 柿崎芳里, 浅野目謙之, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　249-249　2015/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
9 窒素追肥と栽植方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響(東北支部講演会,2014年度各支部会)

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　248-248　2015/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
14 根粒根圏土壌微生物相の群集構造解析によるマメ科作物の連作障害の発生機構の解明(北海道支部講演会,2014年度各支部会)

池田成志, 臼木一英, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　241-241　2015/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
S3-2-13 テンサイ共生系をモデルとした群集構造解析の活用による植物生育促進細菌の効率的な選抜と単離(ミニシンポジウムS3-2 土壌微生物研究を農業にどう役立てるか-基礎研究から実用化への展開,3-2 土壌生物の応用と制御,2015年度京都大会)

池田成志, 鶴丸博人, 岡崎和之, 橋本萌, 高橋宙之, 大和田琢二, 南澤究, 関口博之, 森一幸, 富濱毅

日本土壌肥料学会講演要旨集　(61)　46-46　2015/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
テンサイ共生系をモデルとした群集構造解析の活用による植物生育促進細菌の効率的な選抜と単離

池田成志, 鶴丸博人, 岡崎和之, 橋本萌, 高橋宙之, 大和田琢二, 南澤究, 関口博之, 森一幸, 富濱毅

日本土壌肥料学会講演要旨集　61　(61)　46-46　2015/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
京都府黒ダイズ圃場でのダイズ生育と根圏微生物叢の解析

杉山暁史, 海野佑介, 小野愛, 吉川正巳, 鈴木秀幸, 南澤究, 矢崎一史

第25回植物微生物研究交流会　2015/09
テンサイからの生育促進細菌の選抜

岡崎和之, 鶴丸博人, 大和田琢二, 高橋宙之, 田口和憲, 黒田洋輔, 上田重文, 南澤究, 池田成志

てん菜研究会報　(55)　25-26　2015/02

ISSN： 0912-1048
硝酸供給に応じたシロイヌナズナ根の共生細菌群集の変化

小西範幸, 小西範幸, 早川俊彦, 山谷知行, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　25th　2015

ISSN： 1341-0652
水稲根メタン酸化細菌の窒素固定能のメタプロテオーム解析,組織局在性と分離まで

包智華, 篠田亮, 大久保卓, 久保田健吾, 笠原康裕, 池田成志, 浅川晋, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　30th　JS5-3 (WEB ONLY)　2015
共生微生物の多様性情報を活用したテンサイからの有用細菌の効率的な選抜

岡崎和之, 鶴丸博人, 大和田琢二, 高橋宙之, 南澤究, 池田成志

日本微生物生態学会大会(Web)　30th　JS13-1 (WEB ONLY)　2015
圃場における土着ダイズ根粒菌のnirK遺伝子発現とN₂O発生

星野(高田)裕子, 板倉学, 秋山博子, 中島泰弘, 山本昭範, 山本昭範, 下村有美, 下村有美, 王勇, 早津雅仁, 南澤究

日本微生物生態学会大会(Web)　30th　PB‐036 (WEB ONLY)　2015
Diversity Analysis of Rhizobia in Soybean Continuous Cropping Field

ASANOME Noriyuki, TSURUMARU Hirohito, ITAKURA Manabu, TAZAWA Junko, MINAMISAWA Kiwamu

Tohoku Journal of Crop Science　(57)　55-56　2014/12
Publisher: The Crop Science Society of Japan
ISSN： 0911-7067
水稲根メタン酸化細菌は非マメ科植物の根粒菌か?

南澤究, BAO Zhihua, 池田成志, 大久保卓, 今泉(安楽)温子, 常田岳志, 久保田健吾, 笠原康裕, LIU Dongyan, 浅川晋

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　24th　(JA)6,(EN)7　2014/12

ISSN： 1341-0652
テンサイ主根に共生する細菌のメタゲノム解析

鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 橋本萌, 柿崎芳里, 半澤栄子, 高橋宙之, 浅野目謙之, 田中福代, 関山恭代, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2014　112-112　2014/10/16
Publisher: 日本微生物生態学会
O29-05 ダイズのRj遺伝子型が共生細菌群集に与える影響の評価(口頭発表)

海野佑介, 城惣吉, 信濃卓郎, 南澤究, 佐伯雄一, 池田成志

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　112-112　2014/10/16
Publisher: 日本微生物生態学会
土壌微生物研究の「宝の山」 : 現場とメタゲノムデータ(会員からの声-「こんなことが,これから」,<特集>日本土壌微生物学会60周年記念)

南澤究

土と微生物　68　(2)　59-60　2014/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
Commission Symposium 2.3 - Soil Biology : Modern Soil Biology for N and C Transformation: From Genes to Ecosystems(Current Topics)

68　(2)　92-93　2014/10/01
Publisher: the Japanese Society of Soil Microbiology
ISSN： 0912-2184
テンサイ主根に共生する細菌のメタゲノム解析(共生/寄生/相互作用(symbiosis/paraticism/communication),一般講演,環境微生物系学会合同大会2014講演要旨)

鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 橋本萌, 柿崎芳里, 半澤栄子, 高橋宙之, 浅野目謙之, 田中福代, 関山恭代, 池田成志, 南澤究

土と微生物　68　(2)　109-109　2014/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
P3-1-11 土壌の湛水条件が根粒菌群集構造におよぼす影響(ポスター,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

中村美里, 城惣吉, 板倉学, 南澤究, 山本昭洋, 佐伯雄一

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　39-39　2014/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
P3-1-12 共生窒素固定を促進するダイズ根粒菌III型分泌系エフェクター(ポスター,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

鈴木悠太, Sanchez Cristina, 柿崎芳里, 佐藤修正, 金子貴一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　40-40　2014/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
3-2-3 窒素追肥と栽植方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響(3-2 土壌生物の応用と制御,2014年度東京大会)

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　42-42　2014/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
S3-1-21 水稲根における窒素固定メタン酸化細菌のメタプロテオーム同定と組織局在性(ミニシンポジウム S3-1,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

包智華, 大久保卓, 窪田健吾, 笠原康裕, 鶴丸博人, 按田瑞恵, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　35-35　2014/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
接種したN₂O還元酵素保有根粒菌の圃場における機能発現

星野(高田)裕子, 板倉学, 秋山博子, 中島泰弘, 山本昭範, 下村有美, 王勇, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　60　(60)　38-38　2014/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
圃場条件下でのダイズ根粒菌の多様性に対するRj遺伝子型の影響評価

池田成志, 海野佑介, 城惣吉, 信濃卓郎, 南澤究, 佐伯雄一

日本土壌肥料学会講演要旨集　60　34　2014/09/09

ISSN： 0288-5840
S3-1-17 ジャガイモ根圏では主要な施肥成分の制限によりRhizobium属細菌が寡占化する(ミニシンポジウム S3-1,3-1 土壌生物の生態と機能,2014年度東京大会)

海野佑介, 信濃卓郎, 南澤究, 池田成志

日本土壌肥料学会講演要旨集　(60)　34-34　2014/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
1S-Cp04 New waves of plant symbiosis science and paradigm shift in agricultural science

Ikeda Seishi, Minamisawa Kiwamu

日本生物工学会大会講演要旨集　66　11-11　2014/08/05
Publisher: The Society for Biotechnology, Japan
山形県におけるダイズ連作による収量低下と根粒に内生する非共生土壌細菌感染率(2013年度大会一般講演要旨)

田澤純子, 浅野目謙之, 大脇良成, 南澤究, 横山正, 吉川正巳

土と微生物　68　(1)　47-47　2014/04/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
テンサイ共生微生物の多様性と窒素固定能の探索(2013年度大会一般講演要旨)

鶴丸博人, 岡崎和之, 大久保卓, 橋本萌, 浅野目謙之, 池田成志, 南澤究

土と微生物　68　(1)　36-36　2014/04/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
根粒菌シグマ因子RpoH1の制御を受ける機能未知遺伝子の鉄硫黄タンパク質生合成への関与

佐々木祥平, 門屋亨介, 笠原康裕, 南澤究, 三井久幸

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　8th　2014
ダイズ根粒菌高N₂O還元活性株のゲノム解析による脱窒遺伝子の新規転写制御因子の発見

板倉学, SANCHEZ Cristina, 松本貴嗣, 吉川博文, 後藤愛那, 日高将文, 内田隆史, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　8th　2014
FRETを用いた硝酸センサータンパク質の開発

後藤愛那, 日高將文, 岡部恵美子, 金井研太, 小坂啓太, 板倉学, CRISTINA Sanchez, 南澤究, 内田隆史

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2014　2014

ISSN： 2186-7976
O33-02 rRNA遺伝子オペロンが9.4kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見(口頭発表)

按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 三井久幸, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　120-120　2014
Publisher: 日本微生物生態学会
P25-41 共生不和合性を誘導するダイズ根粒菌のタイプIII型エフェクターの探索(ポスター発表)

岩野裕也, 鈴木悠太, 柿崎芳里, 菅原雅之, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　259-259　2014
Publisher: 日本微生物生態学会
P23-4 アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N_2O発生の特定(ポスター発表)

森内真人, 葛貫桂一, 池西史生, 板倉学, 包智華, 豊田栄, 吉田尚弘, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　2014　229-229　2014
Publisher: 日本微生物生態学会
P25-6 Phylogeny and Functions of Bacterial Communities Associated with Field-Grown Rice Shoots :

2014　241-241　2014
Publisher: 日本微生物生態学会
3-1-7 ダイズ根粒菌のゲノムバリエーション : マッピングによる挿入配列コピー数の推定(3-1 土壌生物の生態と機能,2013年度名古屋大会)

飯田隆之, 柿崎芳里, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(59)　36-36　2013/09/11
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
P3-2-3 ダイズ根粒菌におけるN_2O還元酵素活性を制御している遺伝子の同定とN_2O削減への利用(3-2 土壌生物の応用と制御)

板倉学, Sanchez Cristina, 松本貴嗣, 吉川博文, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(59)　52-52　2013/09/11
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
N2O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の高効率接種法の確立と圃場における追跡

星野裕子, 下村有美, 板倉学, 多胡香奈子, 秋山博子, 内田義崇, 森本晶, 王勇, 早川千嘉, 吉川博文, 松本貴嗣, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　59　(59)　51-51　2013/09/11
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
物質循環のミッシングリンクを解く微生物研究

南澤究

遺伝　67　(5)　544-546　2013/09
Publisher: エヌ・ティー・エス
ISSN： 0387-0022
マメ科植物根圏のN2Oパラドックス

南澤究, 森内真人

遺伝　67　(5)　552-556　2013/09
Publisher: エヌ・ティー・エス
ISSN： 0387-0022
水稲根圏のメタン酸化

包智華, 南澤究

遺伝　67　(5)　596-600　2013/09
Publisher: エヌ・ティー・エス
ISSN： 0387-0022
テンサイ共生微生物の多様性と窒素固定能の探索

鶴丸博人, 岡崎和之, 大久保卓, 橋本萌, 浅野目謙之, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2013　22　2013/06/19
Aurantimonas属細菌AU20株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　22nd　(JA)49,(EN)50,49　2013/05

ISSN： 1341-0652
Bradyrhizobium japonicum Is‐34のRj₄‐gsn遺伝子の探索

橋元祥吾, 鶴丸博人, 山川武夫, 南澤究, 池田成志

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　22nd　(JA)62,(EN)63　2013/05

ISSN： 1341-0652
世界で初めての微生物を用いた温室効果ガス・N₂Oの削減法を野外で実証

秋山博子, 内田義崇, 早津雅仁, 星野(高田)裕子, 多胡香奈子, 下村有美, 王勇, 森本晶, 南澤究, 板倉学

農業環境技術研究所研究成果情報　29　16-17　2013/03/31

ISSN： 1882-076X
ダイズ根粒菌のN₂O還元酵素によるダイズ根圏からのN₂O発生削減

板倉学, 内田義崇, 秋山博子, 星野(高田)裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, WANG Yong, 早川千尋, 植竹佑輔, SANCHEZ Cristina, 江田志磨, 早津雅仁, 南澤究

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2013　3C32P10 (WEB ONLY)　2013/03/05

ISSN： 2186-7976
PG-016 光合成Bradyrhizobium属細菌のメタノール依存的な生育に及ぼす希土類元素の影響(生理・代謝・増殖,ポスター発表)

関謙二郎, 包智華, 三井亮司, 谷明生, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　128-128　2013
Publisher: 日本微生物生態学会
OJ-002 温室効果ガスN_2O発生削減の根粒菌ゲノミックス : N_2O還元酵素遺伝子の新規制御系の発見(ゲノミクス・メタゲノミクス,口頭発表)

南澤究, 板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文

日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　92-92　2013
Publisher: 日本微生物生態学会
PB-001 N_2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species :

Moriuchi Makoto, Inaba Shoko, Ikenishi Fumio, Itakura Manabu, Kikuchi Masakazu, Eda Shima, Chiba Naohiko, Katsuyama Chie, Suwa Yuichi, Sameshima-Saito Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(29)　105-105　2013
Publisher: 日本微生物生態学会
ダイズ根圏の N2O 発生機構と根粒菌による削減

板倉学, Sanchez Cristina, 森内真人, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会誌　13　(2)　1-4　2013
作物根圏における窒素と微生物の相互作用

南澤究, 包智華, 板倉学

土と微生物　67　(2)　49-53　2013
Publisher: the Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.67.2_49 　

ISSN： 0912-2184
植物生育促進細菌の研究動向

鶴丸博人, 橋本萌, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　84　(5)　418-423　2013
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.84.5_418 　

ISSN： 0029-0610
植物共生科学の新展開と農学研究におけるパラダイムシフト

池田成志, 鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 南澤究

化学と生物　51　(7)　462-470　2013
Publisher: Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.51.462 　

ISSN： 0453-073X
S01-3 Metagenome and microscopic analyses for plant-associated microbes towards sustainable agriculture(Session 1 Microbes and sustainable agriculture,Symposium session)

Okubo Takashi, Fukushima Shohei, Anda Mizue, Ikeda Seishi, Minamisawa Kiwamu

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　73-73　2012/09/19
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
23-10 ダイズ根圏のN_2O発生機構 : 根粒菌と土壌生物による根粒窒素由来のN_2O発生(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

南澤究, 稲葉尚子, 池西史生, 板倉学, 江田志磨, 千葉直彦, 勝山千恵, 諏訪裕一, 星野(高田) 裕子, 早津雅仁

日本土壌肥料学会講演要旨集　(58)　180-180　2012/09/04
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
23-11 N_2O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の作出とモデル系によるN_2O発生削減(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

板倉学, 植竹佑輔, Sanchez Cristina, 江田志磨, 田畑和文, 松本貴嗣, 吉川博文, 椎名陽子, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(58)　180-180　2012/09/04
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
N₂O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の利用に向けた培養・接種・検出方法の確立

星野裕子, 板倉学, 多胡香奈子, 秋山博子, 下村有美, 内田義崇, 森本晶, 荒木千尋, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　58　(58)　180-180　2012/09/04
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
Recent trends and future development of academic field based on Soil Science : Part I Soil science as a fundamental tool for crop production

SAIGUSA Masahiko, OHTA Takeshi, SHINANO Takuro, MINAMISAWA Kiwamu, INAMURA Tatuya

Journal of the science of soil and manure, Japan　83　(4)　483-486　2012/08/05
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dojo.83.4_483 　

ISSN： 0029-0610

More details Close

地球環境や人間活動を支える土壌は,第1次生産者としての植物の生育を大きく左右するのみならず,その後の食物連鎖により,動物ひいては人間の生長,健康維持にも大きく影響する。「作物生産基盤としての土壌科学」について,1)作物生産におけるペドロジーの役割,2)土壌に根ざした作物栄養学の展開,3)作物生産に対する土壌微生物の貢献,4)作物学から土壌科学へ望むことの4課題に関し,それぞれペドロジー,作物栄養学,土壌微生物学,作物学の原点に遡って討議し,あらためてこの分野の学術の動向と今後の展開を考える。
水稲のメタン発生に及ぼすイネ共生遺伝型の影響

包智華, 大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽)温子, 浅川晋, 劉冬艶, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2012　55　2012/06/10
OsCCaMKは水稲根と陸稲根の細菌群集構造を変化させる

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 武田直也, 馬場まり, 今泉(安楽, 温子, 福田善通, 藤原信介, 大脇良成, 佐々木和浩, 佐藤雅志, BAO Zhihua

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　21st　(JA)69,(EN)69-70　2012/03

ISSN： 1341-0652
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum strain USDA6^Tのゲノム構造解析

金子貴一, 眞板寛子, 内池伸和, 渡辺安希子, 山田学, 平川英樹, 南澤究, 佐藤修正

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　21st　2012

ISSN： 1341-0652
PB-22 Effects of rice genotype on methane flux and root- associated methanotrophs in paddy rice

Bao Zhihua, Watanabe Aya, Okubo Takashi, Liu Dongyan, Ikeda Seishi, Sasaki Kazuhiro, Imaizumi-Anraku Haruko, Asagawa Susumu, Sato Tadashi, Minamisawa Kiwamu

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　145-145　2012
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
水稲のメタン発生に及ぼすイネ共生遺伝型の影響(2012年度土壌微生物学会講演要旨)

包智華, 大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽) 温子, 浅川晋, 劉冬艶, 佐藤雅志, 南澤究

土と微生物　66　(2)　90-90　2012
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.66.2_90_3 　

ISSN： 0912-2184
23-13 N_2O還元酵素活性を強化した根粒菌接種によるダイズ畑から発生するN_2Oの削減1 : 異なる土壌におけるnosZ強化株接種の効果(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

秋山博子, 早津雅仁, 南澤究, 内田義崇, 星野(高田) 裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, 王勇, 早川千尋, 板倉学

日本土壌肥料学会講演要旨集　58　(0)　181-181　2012
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
23-14 N_2O還元酵素活性を強化した根粒菌接種によるダイズ畑から発生するN_2Oの削減2 : 黒ボク土畑におけるnosZ+およびnosZ強化株接種の効果(23.地球環境,2012年度鳥取大会)

内田義崇, 南澤究, 秋山博子, 星野(高田) 裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, 王勇, 板倉学, 早津雅仁

日本土壌肥料学会講演要旨集　58　(0)　181-181　2012
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophica S58^Tのゲノム解析

大久保卓, 大島健志朗, 三井久幸, 服部勉, 服部正平, 南澤究

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　6th　64　2012
PCRを用いた接種ダイズ根粒菌の簡易検定法の確立と育苗時接種法における接種効率の評価

荒木千嘉, 星野(高田)裕子, 森本晶, 下村有美, 内田義崇, 王勇, 早津雅仁, 秋山博子, 板倉学, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　27th　(27)　70-70　2011/10/08
Publisher: 日本微生物生態学会
圃場栽培ダイズ根粒根圏におけるアンモニア酸化細菌及びアンモニア酸化古細菌の動態解析

星野裕子, 荒木千尋, 森本晶, 下村有美, 内田義崇, 王勇, 早津雅仁, 秋山博子, 稲葉尚子, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　27th　(27)　71-71　2011/10/08
Publisher: 日本微生物生態学会
6-23 ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構と根粒菌を利用した低減化(6.土壌生物)

板倉学, 稲葉尚子, 池西史生, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(57)　42-42　2011/08/08
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
IX-4 作物生産に対する土壌微生物の貢献 : 農耕地生態系における微生物群集構造の変動法則の理解から作物生産への貢献を目指して(IX 土壌科学を基盤とする学術の動向と展開Part 1作物の生産基盤として土壌科学,2011年度つくば大会講演要旨)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(57)　241-241　2011/08/08
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
SA-3 植物共生微生物の多様性研究とその社会貢献(SA 微生物多様性研究の現状と可能性,シンポジウム)

南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(27)　38-38　2011
Publisher: 日本微生物生態学会
202a-2 異なる土壌型におけるnosZ保有・非保有Bradyrhizobium japonicumの出現頻度と系統分布(202a 土壌生態系,口頭発表)

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(27)　62-62　2011
Publisher: 日本微生物生態学会
ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構とその低減化

板倉学, 稲葉尚子, 池西史生, 南澤究

化学と生物　49　(8)　560-565　2011
Publisher: Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.49.560 　

ISSN： 0453-073X
P-81 Community analysis of nitrogen-fixing bacteria in rice roots grown in paddy field(Poster Session)

KITANO AINA, IKEDA SEISHI, EDA SHIMA, MITSUI HISAYUKI, MINAMISAWA KIWAMU

日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　135-135　2010/11/23
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集 : Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH (Fluorescence in situ hybridization)解析(2010年度大会一般講演要旨)

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　64　(2)　146-146　2010/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_146_4 　

ISSN： 0912-2184
根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析(2010年度大会一般講演要旨)

按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　64　(2)　147-147　2010/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.64.2_147_3 　

ISSN： 0912-2184
S25-8 岡田要之助先生とWinogradsky : 彼らが現代の土壌微生物研究を見たら?(S25.過去との対話と交流、土壌微生物通信探訪,2010年度北海道大会)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　196-196　2010/09/07
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-16 異なる土壌型におけるダイズ根粒菌nosZ保有株の出現頻度 : 出現頻度の高い沖積土と低い黒ボク土の主成分解析(8.共生,2010年度北海道大会)

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　49-49　2010/09/07
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-17 ダイズ根粒菌のN_2O還元能による根粒根圏モデル系からのN_2O発生低減化(8.共生,2010年度北海道大会)

板倉学, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 植竹佑輔, 江田志磨, 松本貴嗣, 吉川博文, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　49-49　2010/09/07
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集:Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH(Fluorescence in situ hybridization)解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2010　45　2010/05/21
根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析

按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会講演要旨集　2010　48　2010/05/21
イネ共生細菌の群集構造解析

南澤究, 池田成志, 佐々木和浩, 大久保卓, 北野愛奈, 大島健志朗, 服部正平, 佐藤雅志, 今泉(安楽)温子, 飯田隆之, 按田瑞恵, 江田志磨, 三井久幸

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　4th　53　2010/03/04
バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510のゲノム構造解析

金子貴一, 南澤究, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之, 佐藤修正

日本ゲノム微生物学会年会要旨集　4th　2010
バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510のゲノム構造解析

金子貴一, 南澤究, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之, 佐藤修正

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　19th　2010

ISSN： 1341-0652
SB-2 Mechanism and reduction of N_2O emission from nodulated soybean rhizosphere(Nitrogen dynamics and microbial ecology in soil-plant ecosystem : Towards mitigation of N2O emission from soil environments,Symposium B)

MINAMIZAWA KIWAMU

(26)　50-50　2010
Publisher: 日本微生物生態学会
1C-1 Functional analysis of Bradyrhizobium japonicum genes identified by signature-tagged mutagenesis(Oral Session)

FURUKAWA KEISUKE, OKUBO TAKASHI, MITSUI HISAYUKI, EDA SHIMA, MINAMISAWA KIWAMU

(26)　76-76　2010
Publisher: 日本微生物生態学会
1A-12 The cep gene is necessary for invasion of leguminous hosts by Mesorhizobium loti(Oral Session)

SUGAWARA SATOSHI, KAWAHARADA YASUYUKI, MATSUMOTO TAKASHI, SHIWA YUU, YOSHIKAWA HIROHUMI, EDA SHIMA, MITSUI HISAYUKI, MINAMISAWA KIWAMU

(26)　66-66　2010
Publisher: 日本微生物生態学会
根粒超着生ダイズからのMethylobacterium属及びAurantimonas属細菌の分離

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集　40th　39　2010
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集:Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH(Fluorescence in situ hybridization)解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集　40th　42　2010
8-22 根粒着生変異と窒素施肥レベルに応答したダイズ葉の細菌群集構造変化(8.共生,2010年度北海道大会)

池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 佐々木和浩, 佐藤雅志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　56　(0)　51-51　2010
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.56.0_51_1 　

ISSN： 0288-5840
8-23 窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集の構造変化 : 低窒素区の根圏における窒素固定細菌とメタン酸化細菌の増加(8.共生,2010年度北海道大会)

佐々木和浩, 大久保卓, 池田成志, 北野愛奈, 飯田隆之, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　56　(0)　51-51　2010
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
DOI： 10.20710/dohikouen.56.0_51_2 　

ISSN： 0288-5840
「第１回植物微生物共生と窒素固定に関するアジア国際会議」を開催して

南澤究

日本土壌肥料学雑誌　81　(6)　619-620　2010
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.81.6_619 　

ISSN： 0029-0610
1A-13 ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化(口頭発表)

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志摩, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　7-7　2009/11/21
Publisher: 日本微生物生態学会
1B-16 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養(口頭発表)

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 池田成志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　16-16　2009/11/21
Publisher: 日本微生物生態学会
23-2 ダイズ老化根粒におけるN_2O発生メカニズムの解明 : 根粒菌脱窒と硝化過程の関与(23.地球環境,2009年度京都大会)

稲葉尚子, 菊池真和, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　185-185　2009/09/15
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
22 ダイズ根粒根圏からのN_2O発生における根粒菌の寄与(東北支部講演会,2008年度各支部会)

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　263-263　2009/09/15
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-7 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育(6.土壌生物,2009年度京都大会)

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　40-40　2009/09/15
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-5 変異型dnaQプラスミドによる高N_2O還元酵素活性を示すダイズ根粒菌変異株の取得(6.土壌生物,2009年度京都大会)

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　39-39　2009/09/15
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
S6-15 非培養法による植物共生微生物の多様性解析 : 非培養法によるダイズ共生微生物の群集構造に対する根粒共生系及び窒素施肥の影響評価(S6.分子生態学的解析手法を研究室のルーチンワークに!パート2それによって見えるもの、見たいもの,6.土壌生物,2009年度京都大会)

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志摩, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　42-42　2009/09/15
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
耕地土壌におけるキチナーゼの多様性および環境因子との関連性

寺原猛, 池田成志, 則武ちあき, 南澤究, 安藤勝彦, 常田聡, 原山重明

日本農芸化学会大会講演要旨集　2009　340　2009/03/05
異なる根粒形成表現型ダイズにおける細菌エンドファイトの多様性解析

大久保卓, 池田成志, 佐藤修正, 金子貴一, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　(JA)51,(EN)52　2009/03

ISSN： 1341-0652
異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

池田成志, RALLOS Lynn, Esther E, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　(JA)53-54,(EN)54,53　2009/03

ISSN： 1341-0652
バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510ゲノムの全塩基配列決定と解析

金子貴一, 南澤究, 佐藤修正, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　2009

ISSN： 1341-0652
1B-15 超純水中におけるBradyrhizobium属細菌の生存と適応(口頭発表)

菅原千晶, 増田幸子, 板倉学, 川原田泰之, 三井久幸, 江田志摩, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　16-16　2009
Publisher: 日本微生物生態学会
異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

池田成志, RALLOS Lynn, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　24th　(24)　136-136　2008/11/25
Publisher: 日本微生物生態学会
10-183 Microbial community analysis of soybean stems by bacterial cell enrichment(Microbial community analysis)

Ookubo Takashi, Ikeda Seishi, Kaneko Takakazu, Rallos Lynn, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Satou Syuusei, Nakamura Yasukazu, Tabata Satoshi, Minamisawa Kiwamu

日本微生物生態学会講演要旨集　(24)　150-150　2008/11/25
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
8-23 Novel metallochaperone in the assembly of cytochrome c oxidase of soybean nodule bacteroids

Arunothayanan Hatthaya, Dao Tan Van, Hamaguchi Rie, Noda Ayaka, Itakura Manabu, Minamisawa Kiwamu, Nomura Mika, Tajima Shigeyuki

Abstracts of the meeting, the Society of the Science of Soil and Manure　(54)　64-64　2008/09/09
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
ISSN： 0288-5840
8-19 セイヨウミヤコグサ根分泌物のnod gene誘導活性を阻害する根粒菌培養培地の特性について(8.共生,2008年度愛知大会)

小島克洋, 横山正, 板倉学, 南澤究, 有馬泰紘

日本土壌肥料学会講演要旨集　(54)　63-63　2008/09/09
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
イネ内生細菌ゲノムの遺伝子構成比較解析

金子貴一, 南澤究, 中村保一, 渡辺安希子, 小野章子, 山田学, 小原光代, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志摩, SUDTACHAT Nirinya, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　17th　2008

ISSN： 1341-0652
06-101 Bradyrhizobium japonicum mutants with higher activity of nitrous oxide reductase by a plasmid carrying mutated dnaQ gene(Methodology)

Itakura Manabu, Tabata Kazufumi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Murakami Kiriko, Yasuda Junichi, Minamisawa Kiwamu

(24)　109-109　2008
Publisher: 日本微生物生態学会
08-149 Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum(Physiology/Growth)

Masuda Sachiko, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(24)　133-133　2008
Publisher: 日本微生物生態学会
09-164 Bradyrhizobium play a key role in N_2O emission from degraded soybean nodules(Biogeochemical cycles)

Inaba Shoko, Tanabe Kenji, Kikuchi Masakazu, Eda Shima, Minamisawa Kiwamu

(24)　140-140　2008
Publisher: 日本微生物生態学会
ゲノム情報に基づいた植物共生細菌の環境応答と物質循環機能の解明

南澤究, 増田幸子, 板倉学, 池田成志

土と微生物　62　(2)　89-92　2008
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.62.2_89 　

ISSN： 0912-2184
PA-30 ダイズ根粒根圏のN_2O発生に関わる微生物の解明(農耕地生態系,ポスターセッションA,ポスター発表)

菊池真和, 田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　91-91　2007/09/15
Publisher: 日本微生物生態学会
Evaluation of microbial diversity using ribosomal intergenic spacer analysis

齋藤朝美, 池田成志, 則武ちあき, 赤坂真理子, 藤城圭輔, 安藤勝彦, 南澤究

日本微生物生態学会誌　22　(2)　59-71　2007/09
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
DOI： 10.20709/jsmeja.22.2_59 　
8-11 Proteome analysis of Bradyrhizobium japonicum USDA110 bacteroid differentiation during soybean nodule development

Dao Van Tan, Lee Phuong Hoa, Nomura Mika, Saeki Kazuhiro, Minamisawa Kiwamu, Kaneko Takakazu, Tabata Satoshi, Tajima Shigeyuki

Abstracts of the meeting, the Society of the Science of Soil and Manure　(53)　55-55　2007/08/22
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
ISSN： 0288-5840
8-10 共生窒素固定に関与するダイズ根粒菌バクテロイドタンパク質の検索(8.共生,2007年度東京大会)

野村美加, Dao Van Tan, 濱口理恵, 加藤賢祐, 板倉学, 南澤究, 田島茂行

日本土壌肥料学会講演要旨集　(53)　55-55　2007/08/22
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-4 野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析(8.共生,2007年度東京大会)

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

日本土壌肥料学会講演要旨集　(53)　53-53　2007/08/22
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
植物共生細菌の微生物資源とゲノム解析

南澤究

Microbiology and Culture Collections : official publication of the Japan Society for Culture Collections : 日本微生物資源学会誌　23　(1)　55-55　2007/06/01

ISSN： 1342-4041
かずさDNA研における有用植物(トマト,ユーカリ)およびバクテリアエンドファイトのゲノム配列解析プロジェクトの現状

金子貴一, 浅水恵理香, 中村保一, 佐藤修正, 福岡浩之, 南澤究, 笹本茂美, 渡邊安希子, 小野章子, 田畑哲之

日本植物生理学会年会要旨集　48th　2007
イネエンドファイトのゲノムシークエンスプロジェクト

金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 南澤究, 小野章子, 岸田佳恵, 中崎直美, 加藤みどり, 川島久美子, 清水好美, 南千春, 高橋千佳, 林恭子, 山田学, 田畑哲之

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　16th　2007

ISSN： 1341-0652
植物内生細菌エンドファイトのゲノム解析

金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 南澤究, 田畑哲之

日本植物学会大会研究発表記録　71st　2007
イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム比較解析

金子貴一, 中村保一, 南澤究, 渡邉安希子, 田畑哲之

生化学　2007

ISSN： 0037-1017
PB-51 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおけるN_2O還元酵素高発現株の作成(物質環境,ポスターセッションB,ポスター発表)

植竹佑輔, 千葉芳里, 平山潤太, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　140-140　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
S1-1 Environmental Genomics in Microbial Ecology(Symposium I Environmental Genomics in Microbial Ecology)

Minamisawa Kiwamu, Kamagata Yoichi

(23)　171-171　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
Evaluation of the nitrogen-fixing ability of endophytic clostridia based on acetylene reduction and reverse transcription-PCR targeting the nifH transcript and ribosomal RNA(Award presentation,Lecture of JSME award in 2007)

SAITO Asami, MINAMISAWA Kiwamu

(23)　169-169　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
PB-44 Analysis of metabolic features of naturally-occurring aromatic compounds in Bradyrhizobium japonicum based on array and gene disruption(Metabolism/Chemical activity,Poster presentation B) :

Sudtachat Nirinya, Ito Naofumi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(23)　136-136　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
1-10 Community structures of endophytes in soybeans with different nodulation genotypes(Agricultural ecosystem,Oral presentaion) :

Rallos Lynn Esther E., Ikeda Seishi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(23)　41-41　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
3-06 根粒菌Mesorhizobium lotiの環状グルカンの細胞内含有量に影響を与えるcep遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染において必須の役割を有する(共生・相互作用,口頭発表)

三井久幸, 川原田泰之, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　65-65　2007
Publisher: 日本微生物生態学会
Current status of genome sequencing projects of plants and endophytic bacteria at KDRI

Takakazu Kaneko, Erika Asamizu, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Hiroyuki Fukuoka, Kiwamu Minamisawa, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Akiko Ono, Satoshi Tabata

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　48　S254-S254　2007

ISSN： 0032-0781
A milestone for endophyte biotechnology

Kiwamu Minamisawa

NATURE BIOTECHNOLOGY　24　(11)　1357-1358　2006/11

DOI： 10.1038/nbt1106-1357 　

ISSN： 1087-0156
A-18 N_2O emission and microbial community in rhizosphere of soybean nodule(Agricultural soil ecosystem,(2)Oral presentation)

Minamisawa Kiwamu, Tanabe Kenji, Hiyarama Zyunta, Kikuchi Masakazu, Uetake Yusuke, Ikeda Seishi, Eda Shima

日本微生物生態学会講演要旨集　(22)　218-218　2006/10/27
Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology
ダイズ根粒根圏のN_2O発生と生物群集構造解析(2006年度大会一般講演要旨)

田邉謙二, 平山潤太, 金榮厚, 池田成志, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　60　(2)　121-121　2006/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.60.2_121_1 　

ISSN： 0912-2184
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの芳香族化合物分解系およびエネルギー獲得系の解析(2006年度大会一般講演要旨)

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

土と微生物　60　(2)　2006/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
ISSN： 0912-2184
8-12 ダイズ根粒シンビオソーム溶液を処理した単生ダイズ根粒菌に誘導される新規遺伝子応答の網羅的解析(8. 共生, 2006年度秋田大会講演要旨)

横山正, 大石真子, 有馬泰紘, 大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 佐伯和彦, 田島茂行, 内海俊樹, 阿部美紀子

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　44-44　2006/09/05
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-8 ダイズ根粒菌のゲノムの構造比較と共生窒素固定能(6. 土壌生物, 2006年度秋田大会講演要旨)

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　32-32　2006/09/05
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
12 窒素固定エンドファイトへのGFP (緑色蛍光タンパク質) 遺伝子の導入法の検討(九州支部春季講演会, 2005年度各支部会講演要旨)

田中和憲, 清水友, 佐伯雄一, 山川武夫, 南沢究, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　299-299　2006/09/05
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-9 ダイズ根粒根圏のN2O発生と生物群集構造解析(6. 土壌生物, 2006年度秋田大会講演要旨)

田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　32-32　2006/09/05
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
PA-64 Comparison of genome structures bewteen Bradyrhizobium joponicum highly reiterated sequence-possessing (HRS) strains and non-HRS strains(Other section,Session A,(1)Poster Presentation)

Itakura Manabu, Isawa Tsuyoshi, Sameshima Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(22)　118-118　2006
Publisher: 日本微生物生態学会
A-19 Screening of Bradyrhizobium japonicum genes relevant to growth and survival under nitrate respiration using soil extract as a substrate by signature-tagged mutagenesis(Agricultural soil ecosystem,(2)Oral presentation)

Kamimatsuse Hiroko, Itakura Manabu, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(22)　219-219　2006
Publisher: 日本微生物生態学会
B-13 Thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum : Identification of the gene cluster responsible for thiosulfate-oxdizing ability(Metabolic activity/Chemical activity analysis,(2)Oral presentation)

Masuda Sachiko, Eda Shima, Minamisawa Kiwamu

(22)　245-245　2006
Publisher: 日本微生物生態学会
農耕地からの地球温暖化ガスN2O発生とその抑制

南澤究, 犬伏和之

journal of Japan Society on Water Environment　29　(2)　67-71　2006
根粒菌からみた共生システム

南澤究, 佐伯和彦, 佐藤修正, 下田宜司

蛋白質・核酸・酵素　51　2006
Clean analytical methodology for the determination of lead with Arsenazo III by cyclic flow-injection analysis

M Zenki, K Minamisawa, T Yokoyama

TALANTA　68　(2)　281-286　2005/12

DOI： 10.1016/j.talanta.2005.07.059 　

ISSN： 0039-9140
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析(2005年度大会一般講演要旨)

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

土と微生物　59　(2)　132-132　2005/10/01
Publisher: 日本土壌微生物学会
DOI： 10.18946/jssm.59.2_132_2 　

ISSN： 0912-2184
微生物と植物の共生相互作用の科学特集：微生物バイオテクノロジー

南澤究

学術月報　58　(10)　747-751　2005/10
Publisher: 日本学術振興会
ISSN： 0387-2440
S6-7 ダイズ根粒菌のゲノム構造とチオ硫酸酸化系の解析(S6.窒素循環に関わる土壌微生物研究の新展開,6.土壌生物,日本土壌肥料学会 2005年度大会講演要旨集)

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(51)　36-36　2005/09/06
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
P8-5 Mesorhizobium lotiのnod遺伝子発現を誘導する物質の特性(ポスター紹介,8.共生,日本土壌肥料学会 2005年度大会講演要旨集)

小島克洋, 横山正, 板倉学, 南澤究, 有馬泰紘

日本土壌肥料学会講演要旨集　(51)　56-56　2005/09/06
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
A-20 Expression of nifH gene of a Herbaspirillum endophytes in wild rice species : Daily rhythm during the light-dark cycle(GENETIC ANALYSIS,(2) Oral presentation)

You Mu, Nishiguchi Tomohiro, Saito Asami, Isawa Tsuyoshi, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(21)　216-216　2005
Publisher: 日本微生物生態学会
C-14 Nitrous oxide uptake and evolution in soybean nodules formed with Bradyrhizobium japonicum(METABOLIC ACTIVITY,(2) Oral presentation)

Hirayama Junta, Tanabe Kenji, Chiba Kaori, Sameshima Reiko, Minamisawa Kiwamu

(21)　258-258　2005
Publisher: 日本微生物生態学会
C-08 Exploration of genes relevant to carbon-starvation response in Mesorhizobium loti by signature-tagged mutagenesis(PHYSIOLOGY/GROWTH,(2) Oral presentation)

Kashiwabara Daisuke, Itakura Manabu, Mitui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

(21)　252-252　2005
Publisher: 日本微生物生態学会
PB-11 Distribution of Clostridial endophyte in plants(MICROBL COMMUNITY ANALYSIS,Session B,(1) Poster presentations)

saito Asami, kawahara Makoto, Nishiguchi Tomohiro, minamisawa Kiwamu

(21)　131-131　2005
Publisher: 日本微生物生態学会
Genome-wide view of Mesorhizobium and Bradyrhizobium, expression island clustard on symbiosis island and genome diversity

T Uchiumi, T Ohwada, T Kaneko, T Yokoyama, K Saeki, M Hayashi, S Tajima, K Minamisawa

Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment　41　139-139　2005
Rhizobitoxine biosynthesis in Bradyrhizorium elkanii and transfer of rtx genes to non-producing rhizobia

M Sugawara, S Okazaki, S Nonaka, H Ezura, K Minamisawa

Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment　41　332-332　2005
土壌微生物学におけるポストゲノム研究の現状と将来

福井学, 南澤究, 笠原康裕, 町田雅之, 早津雅仁, 妹尾啓史

日本土壌肥料学雑誌　76　(4)　523-529　2005
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.76.4_523 　

ISSN： 0029-0610
共生細菌におけるポストゲノム研究の展開 : 根粒菌のトランスクリプトミクス(I 土壌微生物学におけるポストゲノム研究の現状と将来, 2004年度シンポジウムならびに受賞記念講演講演要旨集)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　202-202　2004/09/14
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
イネから分離された内生窒素固定細菌 Herbaspirillum spp. のサトウキビへの感染について(九州支部春季講演会, 日本土壌肥料学会支部講演会講演要旨集2004年度)

豊里学, 久綱泰代, 佐伯雄一, 南澤究, 中西康博, 明石良, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　319-319　2004/09/14
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
遺伝子型の異なるダイズから単離したベトナム土着根粒菌の系統分類(8. 共生, 2004年度大会講演要旨集)

佐伯雄一, 金子愛, 鈴木高太郎, Nguyen Thi Minh, 鮫島玲子, 南澤究, 長友由隆, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　59-59　2004/09/14
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
Mesorhizobium loti のin-situ モニタリング法による nod 遺伝子の発現解析 : Mesorhizobium loti の nod 遺伝子発現誘導物質の探索その1(8. 共生, 2004年度大会講演要旨集)

小島克洋, 横山正, 板倉学, 南澤究, 有馬泰紘

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　61-61　2004/09/14
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較(6. 土壌生物, 2004年度大会講演要旨集)

南澤究, 板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹

日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　40-40　2004/09/14
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
土壌圏の進化と微生物(5) 土壌生態圏はいかに窒素を獲得したか：共生窒素固定系の進化

鮫島玲子, 南澤究

化学と生物　42　(5)　346-351　2004/05
Publisher: Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu1962.42.346 　

ISSN： 0453-073X
A-12 マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較 : Bradyrhizobium属細菌のゲノム進化と多様性(分類・系統解析,口頭発表)

板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　134-134　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
B-08 マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析(遺伝子伝播,口頭発表)

原圭乃, 板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　170-170　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
B-18 直接核酸抽出法によるClostridium属エンドファイトの分布と機能の解析(群集構造解析,口頭発表)

河原誠, 宮本拓也, 斉藤朝美, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　180-180　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-002 ベトナムのアルカリ土壌に生息するダイズ根粒菌の分類(農耕地生態系,ポスター発表)

佐伯雄一, 原俊昭, 鈴木高太郎, 鮫島玲子, 南澤究, 長友由隆, 赤尾勝一郎

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　24-24　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-048 ダイズ根粒菌における外来性因子trn elementの構造解析(遺伝子解析,ポスター発表)

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　70-70　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-075 ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索 : リン酸トランスポーター遺伝子の解析(共生・相互作用,ポスター発表)

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　97-97　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-050 ^<15>N-N_2O投与によるダイズ根粒菌のN_2O吸収・N_2発生機構の解明(代謝活性/化学活性解析,ポスター発表)

平山潤太, 千葉芳里, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　72-72　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-029 炭素源飢餓条件下で高発現するミヤコグサ根粒菌遺伝子破壊株の増殖特性(生理・増殖,ポスター発表)

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　51-51　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-076 Clostridium属エンドファイトの植物体内における窒素固定のnifH転写産物による検出(共生・相互作用,ポスター発表)

斉藤朝美, 游牧, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　98-98　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
P-079 根粒菌のマメ科植物との共生成立に必須な転写因子の解析(共生・相互作用,ポスター発表)

三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　101-101　2004
Publisher: 日本微生物生態学会
2E15-3 Structure-function relationship of haloalkane dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110

SATO Yukari, IKEDA Wakako, OHTSUBO Yoshiyuki, NAGATA Yuji, DAMBORSKY JIRI, MINAMISAWA Kiwamu, TSUDA Masataka

16　171-171　2004
Publisher: 日本生物工学会
土壌微生物のモデルとしての根粒菌ポストゲノム研究の可能性

南澤究

土と微生物　58　(2)　69-77　2004
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.58.2_69 　

ISSN： 0912-2184
微生物学と地球科学のわかちがたい関係

遠藤一桂, 南澤究, 掛川武, 犬伏和之

岩波科学　74　166-169　2004
Repetitive determination of copper(II) and regeneration of a chromogenic reagent using a cation-exchange column in a circulatory flow-injection system

M Zenki, K Minamisawa, T Yokoyama

BUNSEKI KAGAKU　52　(12)　1131-1136　2003/12

DOI： 10.2116/bunsekikagaku.52.1131 　

ISSN： 0525-1931
22 ダイズ根粒菌の脱窒の多様性とN_2O呼吸による増殖特性(東北支部講演会)

鮫島玲子, 宮地良昭, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　253-253　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-4 GFPを用いたサトウキビ内生菌の感染経路の調査と内生窒素固定細菌の資化性について(8.共生)

豊里学, 清水友, Constancio A Asis Jr., 久綱泰代, 伊志嶺正人, 中西康博, 佐伯雄一, 長友由隆, 南澤究, 赤尾勝一郎

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　56-56　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-5 植物体内の嫌気窒素固定コンソーシアムを構成するClostridium属細菌のT-RFLP法による群集構造解析(8.共生)

宮本拓也, 斉藤朝美, 河原誠, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　56-56　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-10 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの脱窒により発生する^<15>N標識窒素ガスのTCDガスクロマトグラフィーを用いた定量法(6.土壌生物)

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　39-39　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-9 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成と宿主植物との相互作用(8.共生)

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　57-57　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-10 Rhizobial determinants for nodulation and nitrogen fixation with bred soybean

Teamtisong Kamonluck, Teaumroong Neung, Okazaki Shin, Saeki Kazuhiko, Kaneko Takakazu, Tabata Satoshi, Minamisawa Kiwamu

Abstracts of the meeting, the Society of the Science of Soil and Manure　(49)　58-58　2003/08/20
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
ISSN： 0288-5840
8-17 共生・微好気・炭素飢餓条件におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析(8.共生)

大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宣司, 塩谷幸樹

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　60-60　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
学-3 共生窒素固定細菌の遺伝生態に関する研究(日本土壌肥料学会賞)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　224-224　2003/08/20
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのゲノム構造解析

金子貴一, 中村保一, 佐藤修正, 南沢究, 内海俊樹, 田畑哲之

日本農芸化学会大会講演要旨集　2003　2003
28-C-09 嫌気窒素固定コンソーシアムの宿主親和性(共生・相互作用,一般講演)

斉藤朝美, 葉繽, 游牧, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　115-115　2003
Publisher: 日本微生物生態学会
28-C-10 根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成遺伝子rtxACの機能解析(共生・相互作用,一般講演)

菅原雅之, 岡崎伸, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　116-116　2003
Publisher: 日本微生物生態学会
27-C-21 炭素源飢餓条件下で発現誘導されるミヤコグサ根粒菌の遺伝子(生理・増殖,一般講演)

板倉学, 大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　79-79　2003
Publisher: 日本微生物生態学会
Characterization of haloalkane dehalogenase from Rhizobia

Sato Yukari, Ikeda Wakako, Nagata Yuji, Minamisawa Kiwamu, Tsuda Masataka

15　201-201　2003
Publisher: 日本生物工学会
Analysis of gene expression of mesorhizobium loti by genomic macro-array

T Ohwada, K Minamisawa, P Dawady, H Mitsui, M Itakura, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Ohmori, Y Murooka, M Hayashi, S Tajima, M Nomura, K Shimomura, M Abe, A Suzuki, Y Shimoda, T Uchiumi

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　44　S210-S210　2003

ISSN： 0032-0781
共生窒素固定細菌の遺伝生態に関する研究

南澤究

日本土壌肥料学雑誌　74　(5)　589-592　2003
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.74.5_589 　

ISSN： 0029-0610
イネ科植物の窒素固定エンドファイト（ミニレビュー）

南澤究

日本農芸化学会誌　77　126-129　2003

DOI： 10.1271/nogeikagaku1924.77.126 　
共生窒素固定研究の最新情報

三井久幸, 南澤究

農業技術　58　(5)　223-228　2003
Publisher: 農業技術協会
ISSN： 0388-8479
B-06 炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的な遺伝子発現解析(生理・増殖2,口頭発表)

板倉学, 大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 鈴木章弘, 下田宜司, 内海俊樹

日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　74-74　2002/11/15
Publisher: 日本微生物生態学会
Differences in endophytic colonization of nitrogen fixation bacteria Herbaspirillum sp. B501 in wild and cultivated rice.

Abe T., Minamisawa K., Higashitani A., Ishii T., Sato T.

Japanese Journal of Crop Science　71　(2)　70-71　2002/08/25
Publisher: The Crop Science Society of Japan
ISSN： 0011-1848
6-29 Bradyrhizobium属ダイズ根粒菌の系統による脱窒能の多様性(6.土壌生物)

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　34-34　2002/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-19 Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成系におけるrtxC遺伝子の機能解析(8.共生)

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　43-43　2002/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-15 ススキ等の植物体内における偏性嫌気性窒素固定細菌の単離と分子系統解析(8.共生)

宮本拓也, 西岡きよ, 游牧, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　41-41　2002/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-21 全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析(6.土壌生物)

大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　31-31　2002/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
B-31 ダイズ根粒菌リゾビトキシン生合成遺伝子の機能(共生・相互作用,口頭発表)

南澤究, 岡崎伸, 菅原雅之, 三井久幸

日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　99-99　2002
Publisher: 日本微生物生態学会
A-01 根粒菌の共生窒素固定能とシグマ因子RpoH(遺伝子解析・水圏生態系1,口頭発表)

三井久幸, 佐藤善克, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　19-19　2002
Publisher: 日本微生物生態学会
814 Characterization of a haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium japonicum

Sato Yukari, Nagata Yuji, Minamisawa Kiwamu, Tsuda Masataka

14　146-146　2002
Publisher: 日本生物工学会
Global analysis of gene expression of Mesorhizobium loti MAFF303099

T Uchiumi, T Ohwada, Y Orikasa, K Minamisawa, H Mitsui, M Itakura, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Omori, Y Murooka, M Hayashi, S Tajima, M Nomura, K Shimomura, M Abe, A Suzuki, Y Shimoda

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　43　S73-S73　2002

ISSN： 0032-0781
B-6 根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子(遺伝子解析,B会場,口頭発表)

三井久幸, 伊藤尚文, 佐藤俊文, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　56-56　2001/11/09
Publisher: 日本微生物生態学会
8-17 リゾビトキシンの根粒形成促進効果は根粒着生過程の途中から現れる(8.共生)

岡崎伸, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　56-56　2001/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-16 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン遺伝子及び生合成系の解明(8.共生)

安田剛, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　55-55　2001/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
I-4 イネ科植物の窒素固定エンドファイトのポテンシャル(I 共生窒素固定研究の展開と持続的食糧生産)

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　240-240　2001/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-23 多コピーの挿入配列を保有するダイズ根粒菌HRS株の分子系統解析と嫌気条件暴露後の増殖特性(6.土壌生物)

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(47)　42-42　2001/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
A-10 野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの分子系解析(共生・相互作用,A会場,口頭発表)

游牧, 宮本拓也, 西岡きよ, 宮木太郎, 遊橋健一, 佐藤雅志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　24-24　2001
Publisher: 日本微生物生態学会
C-31 野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着(共生・相互作用,C会場,ポスター発表)

南澤究, 葉繽, 西岡きよ, 佐藤雅志

日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　113-113　2001
Publisher: 日本微生物生態学会
Detection of endophytic nitrogen-fixing bacteria in wild rice collected in Myanmar and Cambodia.

SATO T., NISHIOKA Kiyo, SYOUJI H., MINAMISAWA K., NAKAMURA I., FUKUTA Y., ISHII T., SATO Y. I.

2　(1)　232-232　2000/04

ISSN： 1344-7629
A lipochito-oligosaccharide, Nod factor, induces transient calcium influx in soybean suspension-cultured cells

T Yokoyama, N Kobayashi, H Kouchi, K Minamisawa, H Kaku, K Tsuchiya

PLANT JOURNAL　22　(1)　71-78　2000/04

DOI： 10.1046/j.1365-313X.2000.00713.x 　

ISSN： 0960-7412
土壌微生物ゲノム研究の現状と将来

南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　46　239-239　2000/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-25 野生イネ及び栽培イネ在来品種の地上部に内生する窒素固定細菌(8.共生)

鈴木永, 宮木太郎, Adel Elbeltagy, 西岡きよ, 東海林比呂子, 佐藤雅志, 佐藤洋一郎, 浜田徹, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　65-65　2000/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
6-28 挿入配列によるダイズ根粒菌のゲノム再編成と環境適応(6.土壌生物)

鮫島玲子, 伊沢剛, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　46-46　2000/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-15 マメ科植物のエチレン感受性と根粒形成(8.共生)

貫井憲之, 江面浩, 遊橋健一, 安田剛, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　60-60　2000/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
8-14 根粒菌Bradyrhizobium elkaniiの生産するリゾビトキシンの根粒形成における役割と生合成遺伝子の解明(8.共生)

安田剛, 遊橋健一, 貫井憲之, 江面浩, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　59-59　2000/03/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
C-132 ミヤコグサ根粒菌はVBNC(viable but nonculturable)状態になるか(共生・相互作用-1,ポスター発表)

板倉学, 葉繽, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　124-124　2000
Publisher: 日本微生物生態学会
C-133 野生イネ科植物から分離される窒素固定嫌気共生系(共生・相互作用-1,ポスター発表)

南澤究, 西岡きよ, 宮木太郎, 遊橋健一, 佐藤雅志

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　125-125　2000
Publisher: 日本微生物生態学会
A-07 根粒菌の共生窒素固定に関与するrpoH遺伝子の発現と機能(遺伝子解析など-2,口頭発表)

三井久幸, 佐藤俊文, 南沢究

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　23-23　2000
Publisher: 日本微生物生態学会
A-35 野生イネから分離されたHerbaspirillum属窒素固定細菌のコロナイズと窒素固定活性(共生・相互作用-2,口頭発表)

鈴木永, Elbeltagy Adel, 西岡きよ, 葉繽, 佐藤雅志, 南澤究

日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　51-51　2000
Publisher: 日本微生物生態学会
土壌細菌の遺伝生態研究の現状-ダイズ根粒菌の実例をまじえて-

南澤究

土と微生物　54　(2)　121-127　2000
Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology
DOI： 10.18946/jssm.54.2_121 　

ISSN： 0912-2184
ゲノム科学と２1世紀の植物栄養学の展望

柴田大輔, 間藤徹, 菊池尚志, 南澤究

日本土壌肥料学雑誌　71　(5)　751-754　2000
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.71.5_751 　

ISSN： 0029-0610
6-29 ダイズ根粒菌HRS株と通常株の共生領域の比較(6.土壌生物)

伊沢剛, 鮫島玲子, 板倉学, 三井久幸, 南沢究

日本土壌肥料学会講演要旨集　(45)　61-61　1999/07/25
Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会
ISSN： 0288-5840
Rhizobitoxine inhibition of ACC synthase and biosynthetic pathway of rhizobitoxine

YASUTA Tsuyoshi, SATOH Shigeru, YUHASHI Ken-ichi, EZURA Hiroshi, ICHIKAWA Norikazu, NUKUI Noriyuki, MINAMISAWA Kiwamu

40　s134-s134　1999/03

ISSN： 0032-0781
Rhizobitoxine produced by Bradyrhizobium elkanii regulates nodule-formation inhibitory mechanisum on Macroptilium atropurpureum

ICHIKAWA Norikazu, YUHASHI Ken-Ichi, EZURA Hiroshi, YASUTA Tsuyoshi, NUKUI Noriyuki, MINAMISAWA Kiwamu

40　s134-s134　1999/03

ISSN： 0032-0781
DNA REARRANGEMENTS IN Bradyrhizobium japonicum FIELD ISOLATES AND HORIZONTAL GENE TRANSFER OF SYMBIOTIC GENES.

ISAWA Tsuyoshi, SAMESHIMA Reiko, ITAKURA Manabu, MITSUI Hisayuki, MINAMISAWA Kiwamu

40　s133-s133　1999/03

ISSN： 0032-0781
Identification of trigonelline, a Nod gene-inducing signal compound, in rice (Oryza sativa L.) seed

Constancio A. Asis Jr., Masatsugu Kubota, Kiwamu Minamisawa, Shoichiro Akao

Plant Production Science　2　(1)　10-11　1999
Publisher: Crop Science Society of Japan
DOI： 10.1626/pps.2.10 　

ISSN： 1343-943X
Comparative studies of the nod gene inducing signal compounds from soybean nodulation mutants and rice cultivars

ASIS Constancio A. Jr., KUBOTA Masatsugu, MINAMISAWA Kiwamu, AKAO Shoichiro

Japanese Journal of Crop Science　67　158-159　1998/04/02
Publisher: The Crop Science Society of Japan
ISSN： 0011-1848
20 Cloning and characterization of genes involved in biosynthesis of indole-3-acetic acid in Bradyrhizobium elkanii.

Matsumoto Taku, Yamane Hisakazu, Nojiri Hideaki, Minamisawa Kiwamu, Omori Toshio

(32)　45-45　1997/11/28
Publisher: The Japanese Society for Chemical Regulation of Plants
ISSN： 0919-1887
根粒菌の生産するリポキチンオリゴサッカライドの波紋

南沢究, 遊橋健一

化学と生物　34　(5)　345-348　1996/05/25
Publisher: 学会出版センタ-
ISSN： 0453-073X
71 Process of Formation of 2,4-D-Induced Nodule and Infection Mode of Rhizobia

AKAO Shoichiro, MINAKAWA Yasuo, MINAMISAWA Kiwamu

Japanese Journal of Crop Science　64　(1)　142-143　1995/04/03
Publisher: The Crop Science Society of Japan
ISSN： 0011-1848
日本化学工業株式会社小松川工場跡地周辺の土壌等のクロム汚染

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究, 土橋幸司

人間と環境　21　(1)　15--18　1995
窒素固定の遺伝生態

南沢究

IGEシリーズ　19　65-65　1994
Publisher: 東北大学遺伝生態研究センター
カドミウム等重金属汚染水田土壌のヒ素含有率,-市川流域-

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究, 富岡直樹

人間と環境　20　(3)　190-193　1994
Pollution of Street Dusts and Soils by Antimony and the Related Heavy Metals Discharged from an Antimony Smelter

KUBOTA Masatsugu, ASAMI Teruo, MATSUKI Masahiro, KASHIMURA Akira, MINAMISAWA Kiwamu

Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition　63　(6)　719-722　1992
Publisher: Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
DOI： 10.20710/dojo.63.6_719 　

ISSN： 0029-0610
室蘭市の道路わき粉じんと土壌の重金属分布

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究

人間と環境　18　1　1992
安中市末復元水田土壌のカドミウム,アンチモン,ビスマスなど有害金属元素含有率

久保田正亜, 浅見輝男, 南澤究, 松木正浩

人間と環境　14　2-10　1988
ダイズ根粒のセリノ-ル--Uptake hydrogenase系の誘導を抑えるリゾビトキシンの前駆体か?(今日の話題)

南沢究

化学と生物　25　(9)　p563-565　1987/09
Publisher: 学会出版センタ-
ISSN： 0453-073X
RAPID TURNOVER OF ASPARTIC-ACID IN SOYBEAN NODULES FORMED WITH H-2-UPTAKE POSITIVE RHIZOBIUM-JAPONICUM STRAINS

K MINAMISAWA, Y ARIMA, K KUMAZAWA

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　27　(3)　387-391　1981

ISSN： 0038-0768

Show all ︎Show first 5

Books and Other Publications 18

東北大学教養教育院叢書大学と教養 7 環境と人間

南澤究

東北大学出版会　2024/02

ISBN: 9784861633959
最先端の研究者に聞く日本一わかりやすい2050の未来技術

中村尚樹

プレジデント社　2023/03/16

ISBN: 4833424886
カーボンニュートラル2050アウトルック

山地, 憲治, 西村, 陽

日本電気協会新聞部　2022/03

ISBN: 9784905217992
エッセンシャル土壌微生物学 : 作物生産のための基礎

南沢, 究, 妹尾, 啓史, 青山, 正和, 齋藤, 明広, 齋藤, 雅典

講談社　2021/04

ISBN: 9784065223987
肥料科学第38号

南澤究

肥料科学研究所　2017/02/20
メタゲノム解析実験プロトコール

池田成志, 大久保卓, 鶴丸博人, 南澤究

羊土社　2016/12
共生微生物生物と密接に関わるミクロな生命体

南澤究

化学同人　2016/10/30

ISBN: 9784759817287
難培養微生物研究の最新技術Ⅲ―微生物の生き様に迫り課題解決へ―

按田瑞恵, 南澤究

シーエムシー出版　2015/08/07

ISBN: 9784781310817
シリーズ21世紀の農学ここまで進んだ！飛躍する農学

南澤究

養賢堂　2015/04

ISBN: 9784842505343
環境と微生物の事典

日本微生物生態学会

朝倉書店　2014/07

ISBN: 9784254171587
植物共生微生物の群集構造解析メタゲノム解析技術の最前線

池田成志, 南澤究

シーエムシー出版　2010
微生物の世界（宮道慎二他監修）

南澤究, 葉鬢, 貫井憲之

筑波出版会（筑波）　2006
難培養微生物研究の最新技術ー未利用微生物資源へのアプローチー（工藤俊章／大熊盛他監修）

Kiwamu Minamisawa

シーエムシー出版（東京）　2004/08
In Biotechnology in Agriculture and Forestry Vol. 52 (Eds. T. Nagata and S Tabata)

Kaneko, T, K. Saeki, K. Minamisawa

Springer-Verlag, Heidelberg　2003
くらしの中の化学と生物８「人に役立つ微生物の話」 (日本農芸化学会編)

南澤究

学会出版センター（東京）　2002
微生物の資材化：研究の最前線（鈴井孝仁・他編）

南澤究, 遊橋健一

ソフトサイエンス社　2002
ビジュアル科学講座、地球の生命６、食う食われる生物たち

南澤究

三友社出版　2000
Soil biochemistry (vol. 10). In: Bollag J-M, Stotzky G (eds)

Minamisawa K, Mitsui H

Marcel Dekker Inc.,（ N.Y.）　2000

Show all Show first 5

Presentations 515

⽇本⼟壌の微⽣物分布データベース「TUKUYOMI」の開発

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2024年度大会　2024/06/15
土壌に接種した根粒菌の長期生存が土壌マイクロバイオームに及ぼす影響の評価

加藤広海, 板倉学, 番場大, 和穎朗太, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2024年度大会　2024/06/15
「植物と微生物の生きるちから」～巧みな仕組みから地球環境まで～ Invited

南澤究

第18回公開シンポジウム西高フォーラム　2024/06/01
微生物による温室効果ガスの削減と市民科学 Invited

南澤究

第10回日本微生物学連盟フォーラム「微生物は地球の救世主になれるか？」　2024/02/10
The denitrification pathway of Bradyrhizobium ottawaense and its potential application in N2O mitigation

The 6th Asian Conference on Plant-Microbe Symbosis and Nitrogen Fixation （6th APMNF）　2024/01/09
Cool earth via nitrogen-fixing bacteria: Methanotrophs and Bradyrhizobium Invited

Kiwamu Minamisawa

The 6th Asian Conference on Plant-Microbe Symbosis and Nitrogen Fixation （6th APMNF）　2024/01/08
自然界の窒素循環と微生物によるN₂O排出抑制 Invited

南澤究

新化学技術推進協会（JACI）先端化学・材料技術部会高選択性反応分科会講演会　2023/12/20
シチズンサイエンスによるN₂O消去土壌微生物の探索

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 菊地美穂, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会シンポジウム – 微生物に着目した温室効果ガスN₂O削減研究の最前線 –　2023/11/30
植物共生細菌の多様性と物質循環機能 Invited

南澤究

日本微生物生態学会第36回大会第1回日本微生物生態学会学会賞受賞講演　2023/11/30
主要な農地土壌に接種した根粒菌の生残性と土着菌叢への影響

加藤広海, 青木裕一, 板倉学, 番場大, 和穎朗太, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023/11/29
日本の土着ダイズ根粒菌叢とnosZ保有新規ダイズ根粒菌の探索

板倉学, 柿崎芳里, 酒井朋子, Fernandes Siqueira Arthur, 原沙和, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023/11/29
Mitigation of nitrous oxide (N₂O) emissions by soybean Bradyrhizobium

Fernandes Siqueira Arthur, Manabu Itakura, Kaori Kakizaki, Tomoko Sakai, Kiwamu Minamisawa

2023/11/28
黒ボク土壌から分離したN₂O消去微生物

大久保智司, 板倉学, Arthur Fernandes Siqueira, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023/11/28
市民科学由来データを用いた日本土壌の微生物生態の把握

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第36回大会　2023/11/28
ムーンショット型研究と市民科学

南澤究

日本科学振興協会（JAAS）年次大会2023
市民科学によるN₂Oを消去する土壌微生物と根粒菌の探索

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

植物微生物研究会第32回研究交流会
日本のBradyrhizobium属ダイズ根粒菌叢とnosZ保有根粒菌の探索

板倉学, 柿崎芳里, 酒井朋子, Fernandes Siqueira Arthur, 原沙和, 南澤究

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
市民科学よるN2O消去能をもつ土壌微生物の探索2

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
市民科学で得られた「日本土壌の環境・微生物データ」の可視化・利活用の基盤整備

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
Soil-in-a-Bottle: Citizen science-based construction of the comprehensive soil map for microbiome and greenhouse gases in Japan

2023/07/19
土壌環境の細菌叢は移植できるのか？

加藤広海, 南澤究, 永田裕二

日本土壌微生物学会2023年度大会
市民科学由来土壌微生物ビッグデータの評価と利活用基盤の整備

青木裕一, 大久保智司, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2023年度大会
市民科学で明らかになった土壌の一酸化二窒素 (N₂O) 動態と微生物叢

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 番場大, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌微生物学会2023年度大会
微生物による地球冷却：農地由来の温室効果ガスの排出削減 Invited

南澤究

第96回日本細菌学会総会　2023/03/18
はじめに Invited

南澤究

第64回日本植物生理学会年会シンポジウム：植物×土壌×微生物の人工デザインで地球温暖化を止める　2023/03/15
土壌微生物で温室効果ガスを削減する「クールアース」とは？ Invited

南澤究

宮田満のバイオ・アメイジング～緊急対談：バイオのあの話題はこれからどうなる？！　2023/03/10
微生物による農地由来温室効果ガスN₂Oの排出削減 Invited

南澤究

日本セラミックス協会2023年年会窒素循環社会研究会　2023/03/08
土壌由来の温室効果ガス削減をめざす市民科学プロジェクト：地球冷却微生物を探せ

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本生態学会第70回全国大会　2023/03
資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減 Invited

南澤究

令和４年度農業・工業材料生産と光技術研究会「農業の脱炭素化を目指した土壌機能の解明と光技術の応用」　2022/10/04
大規模ゲノム比較による根粒菌の共生形質関連因子の同定と生物地理学

板倉学, 柿崎芳里, 渡辺剛, 増田幸子, 柴田ありさ, 白須賢, 金子貴一, 南澤究

日本微生物生態学会第35回大会　2022/10
A novel description for N₂O reduction potential from Bradyrhizobium liaoningense

Arthur Fernandes Siqueira, Manabu Itakura, Sachiko Masuda, Atsushi Matsumura, Arisa Shibata, Ken Shirasu, Kiwamu Minamisawa

2022/10
市民科学が切り拓く土の微生物生態学

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本微生物生態学会第35回大会　2022/10
資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減 Invited

南澤究

第60回生物物理学会年会　2022/09/30
安定同位体を用いた農地由来の温室効果ガス削減の研究 Invited

南澤究

SI自然科学利用研究会　2022/09/13
土壌のN2O発生削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司、青木裕一、戸田聡一郎、加藤広海、菊地美穂、佐藤修正、南澤究

日本土壌肥料学会2022年度東京大会　2022/09
水稲根における窒素固定メタン酸化細菌細胞の13C/15N同位体顕微鏡観察

南澤究,原新太郎,和田直久,Sliver Sung-Yun Hsiao,Meng Zhang,Zhihua Bao,Yoshiyuki Iizuka,Der-Chuen Lee,佐藤修正,Tang Sen-Lin

日本土壌肥料学会2022年度東京大会　2022/09
Bradyrhizobium ottawaense株における温室効果ガスN2Oの還元能

原沙和, Arthur Fernandes Siqueira, 菅原雅之, 板倉学, 三井久幸, Cristina, Sanchez Gomes, 佐藤修正, 下田宜司, 今泉(安楽)温子, 南澤究

日本土壌肥料学会2022年度東京大会　2022/09
分子生物学的知見を駆使した地球温暖化防止研究の紹介 Invited

南澤究

龍谷大学分子生物学・植物分子生物学セミナー　2022/07/22
農業からの温室効果ガス排出削減 Invited

南澤究

日本畜産技術士会　2022/06/11
ダイズ根粒菌ゲノムの比較による共生窒素固定能を上昇させる領域の特定

板倉学,柿崎芳里,増田幸子,柴田ありさ,白須賢,金子貴一,南澤究

日本土壌微生物学会2022年度大会　2022/06
温室効果ガスの削減に向けた市民参加型研究ー地球冷却微生物を探せー

青木裕一, 大久保智司, 戸田総一郎, 南澤究

日本科学振興協会第1回総会・キックオフミーティング　2022/06
農地土壌に接種した根粒菌の生残性ならびに土着菌叢への影響評価

加藤広海,青木裕一,板倉学,三岡周子,番場大,和穎朗太,佐藤修正,南澤究

日本土壌微生物学会2022年度大会　2022/06
植物共生微生物による窒素循環 Invited

南澤究

2021年度新資源生物変換研究会・植物バイオ研究会シンポジウム「微生物と植物が駆動する新しい物質循環像とバイオ分野への展開」（日本農芸化学会2022年度大会【BBB連携シンポジウム】　2022/03/16
食料と環境を支える植物共生微生物：根粒菌とメタン酸化窒素固定菌 Invited

南澤究

理研バイオリソース研究センター設立20周年記念シンポジウム「バイオリソースが駆動する生命科学とイノベーション」　2021/10/20
Visualization of N2-fixing methanotrophic cells in paddy rice roots by stable isotopes

Shintaro Hara, Naohisa Wada, Sliver Sung-Yun Hsiao, Meng Zhang, Zhihua Bao, Yoshiyuki Iizuka, Dear-Chuen Lee, Syusei Sato, Sen-Lin Tang, Kiwamu Minamisawa

The 7th International Conference on Nitrification and Related Processes (ICoN7)　2021/07/18
農学賞受賞特別講演_窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究 Invited

南澤究

日本土壌微生物学会2021年度大会　2021/06/18
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究 Invited

南澤究

日本農学会第92回日本農学大会 2020年度受賞者講演　2021/04/06
ムーンショット研究開発プロジェクト『資源循環の最適化による農地由の温室効果ガスの排出削減』の紹介 Invited

グリーンエネルギーファーム産学共創パートナーシップ(GEFP) 令和2年度第4回研究会　2021/03/30
根粒菌とマメ科植物の攻防とゲノム進化 Invited

南澤究

第36回資源植物科学シンポジウム及び第12回植物ストレス科学研究シンポジウム　2021/03/05
Mitigation of greenhouse gas emissions from agricultural lands by optimizing nitrogen and carbon cycles. Invited

Kiwamu Minamisawa

The First International Symposium on "Cool Earth via Microbes in Agriculture"　2021/03/01
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究 Invited

南澤究

2020年度日本土壌肥料学会東北支部大会(宮城大会)　2020/12/04
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究 Invited

南澤究

2020年植物微生物研究会オンラインシンポジウム　2020/09/12
ダイズ根粒およびソルガム根の Bradyrhizobium 属細菌の rpoB 群集構造解析

原新太郎, 和才(原) 沙和, 徳永毅, 南澤究

日本土壌肥料学会2020年度岡山大会　2020/09/08
窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究 Invited

南澤究

日本土壌肥料学会2020年度岡山大会　2020/09/09
Symbiotic interactions with bacteria and plants-their biogeochemical functions and evolutionary processes- Invited

Kiwamu Minamisawa

Symposium of Biodiversity Research Center, Academia Sinica　2019/11/07
Symbiotic incompatibility bertween Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 110 and the tribe Desmodieae including Lespedeza cuneata via Type III secretion system (T3SS) International-presentation

Iori Imamura, Yuki Konno, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

21st International Congress on Nitrogen Fixation　2019/10/11
Hidden adaptation mechanisms of symbiotic systems to the environments International-presentation Invited

Kiwamu Minamisawa

21st International Congress on Nitrogen Fixation　2019/10/14
Identification of the host specificity determinant of bradyrhizobia based on genomic comparison International-presentation

Masayuki Sugawara, Yuki Konno, Yoshiyuki Ohtsubo, Masaya Kajiwara, Tomoyuki Nemoto, Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

21st International Congress on Nitrogen Fixation　2019/10/12
根粒菌の窒素固定遺伝子を含むゲノム欠失と土壌環境適応

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第33回大会　2019/09/12
ソルガム由来 Bradyrhizobium属細菌株の窒素固定とタンパク質分泌系の多様性

原沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 森川峻志, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

日本微生物生態学会第33回大会　2019/09/12
環境に優しいダイズ根粒菌資材

南澤究, 野田涼太, 菅原雅之, Cristina Sanchez, 柿崎芳里, 三口雅人

日本土壌肥料学会2019年度静岡大会　2019/09/04
イネ科植物ソルガムから分離したBradyrhizobium属細菌のゲノム解析：窒素固定能とタンパク質分泌系の多様性

原沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 森川峻志, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

第13回細菌学若手コロッセウム　2019/08/18
根粒菌共生アイランドの実験室進化： nif / T3SS遺伝子の大規模欠失

南澤究, 嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之

第13回細菌学若手コロッセウム　2019/08/18
根粒菌の生活史をゲノムで読む：植物が土壌微生物を育む？ Invited

南澤究

微生物ウィーク2019　2019/07/23
根粒菌共生アイランドの大規模欠失と土壌環境適応

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019/06/15
窒素固定能を有する脱窒細菌によるN2O固定

鈴木里俊, 早川智恵, 増田曜子, 西澤智康, 菅原雅之, 南澤究, 磯部一夫, 妹尾啓史

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019/06/15
ダイズ根粒菌とメドハギ根粒菌のゲノム比較と宿主特異性：Bradyrhizobium 属根粒菌の共進化

今野勇希, 菅原雅之, 大坪嘉行, 梶原聖也, 根本智行, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019/06/16
ダイズ生育ステージによる細菌叢の変動：地上部Methylorubrum属細菌の一過的優占性

原新太郎, 松田雅敏, 南澤究

日本土壌微生物学会2019年度大会　2019/06/16
A survey of plant growth-promoting bacteria derived from lateral roots of sugar beet based on a community analysis International-presentation

Kazuyuki Okazaki, Hirohito Tsurumaru, Megumi Hashimoto, Hiroyuki Takahashi, Takuji Ohwada, Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/16
The RpoH-regulated gene sufT is involved in iron-sulfur protein metabolism and effective plant symbiosis in Sinorhizobium meliloti International-presentation

Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/15
Investigation of genomic diversity and nitrogen fixation capability in indigenous Bradyrhizobium diazoefficiens strains International-presentation

Manabu Itakura, Kosuke Mitsuya, Takakazu Kaneko, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/16
Experimental genome deletion via insertion sequences on bradyrhizobial symbiosis island by sacB system International-presentation

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/15
Bradyrhizobium from sorghum roots suggests T3SS/T4SS/T6SS diversity and symbiosis island exchange in non-diazotrophic and rhizobial members of B.ottawaense International-presentation

Sawa Hara, Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Masayuki Sugawara, Junichi Yoneda, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/16
Metagenome and proteome analyses revealed nitrogen fixation by Bradyrhizobium in roots of field-grown sorghum International-presentation

Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Sawa Wasai, Yasuhiro Kasahara, Taichi Koshiba, Kiyoshi Yamazaki, Toru Fujiwara, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/16
Symbiotic incompatibility via effector-triggered immunity between soybean Rj2-genotype and bradyrhizobial NopP: Rj2 allele distribution in soybean resources International-presentation

Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Satoko Takahashi, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsu, Kiwamu Minamisawa, Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Satoko Takahashi, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/15
Experimental genome reduction of bradyrhizobia by plant immunity International-presentation

Haruka Odake, Haruka Arashida, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2019/05/15
Bradyrhizobium属根粒菌の共生アイランドにおけるIS介在型欠失

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019/03/07
ソルガム由来Bradyrhizobiumの窒素固定とゲノム情報に基づく機能解析

原沙和, 原新太郎, 森川峻志, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019/03/07
根粒菌の共生不和合性システムと環境に優しい根粒菌集団の育種 Invited

南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019/03/07
ゲノム比較によるBradyrhizobium属根粒菌の宿主特異性決定機構の解明

今野勇希, 菅原雅之, 大坪嘉行, 根本智行, 三井久幸, 南澤究

第13回日本ゲノム微生物学会年会　2019/03/06
Symbiotic incompatibility via effector-triggered immunity between soybean Rj2-genotype and bradyrhizobial NopP International-presentation Invited

Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Satoko Takahashi, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

International Plant & Animal Genome XXVII　2019/01/12
環境調和型農業生物資材コンソーシアム

南澤究

アグリビジネス創出フェア2018　2018/11/20
植物共生細菌の進化機構と育種戦略：根粒菌からマイクロバイオーム農業へ Invited

南澤究

日本育種学会第134回講演会　2018/09/22
根粒菌 NopPエフェクターによる共生不和合性を誘導する分子機構の解明

今村伊織, 菅原雅之, 今道仁, 松崎元紀, 金村進吾, 稲葉謙次, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
根粒菌の鉄硫黄タンパク質生合成関連遺伝子の機能解析

佐々木祥平, 南澤究, 三井久幸

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
Methylobacterium sp. AMS5株接種によるダイズ地上部の細菌叢シフト

原新太郎, 松田雅敏, 原沙和, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
ソルガム根における Bradyrhizobium 属細菌分離株の nif 遺伝子群と窒素固定能

原沙和, 森川峻志, 原新太郎, 菅原雅之, 米田淳一, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
ソルガム根からの Bradyrhizobium 属窒素固定細菌の分離と特性解析

森川峻志, 原新太郎, 原沙和, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110 系統の土壌環境適応

野田涼太, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
土壌接種による Bradyrhizobium 属根粒菌共生アイランドの実験室進化

大竹遥, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
選択マーカー法による Bradyrhizobium 属根粒菌ゲノムの IS 介在型欠失の解明

嵐田遥, 大竹遥, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/20
Rj2ダイズとBradyrhizobium属根粒菌における共生不和合性の決定機構

菅原雅之, 梅原洋佐, 高橋智子, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/09/19
Denitrification is lower in Bradyrhizobium japonicum than in B. diazoefficiens due to impaired nitrate

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

2018/09/19
“Environmental dynamics of plant-associated bacteria: From rhizobia towards plant microbiomes” International-presentation Invited

MINAMISAWA Kiwamu

7th International Legume Conference (7ILC)　2018/08/30
メドハギとダイズの根粒菌共生アイランドとゲノムコアの比較：宿主植物により共生アイランドは進化するか？

今野勇希, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会2018年度大会　2018/08/29
オーミック解析に基づくソルガム根窒素固定細菌の特定

原新太郎, 松田雅敏, 新井沙和, 南澤究

日本土壌肥料学会2018年度大会　2018/08/29
Rj2ダイズと根粒菌の共生不和合性決定機構

菅原雅之, 梅原洋佐, 高橋智子, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2018年度大会　2018/08/29
メドハギとダイズの根粒菌ゲノム比較と共生アイランド進化

今野勇希, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第28回研究交流会　2018/08/20
Denitrification is lower in Bradyrhizobium japonicum than in B. deazoefficiens due to impaired nitrate reductase activity

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

2018/07/12
植物マイクロバイオーム研究〜ホロビオームから鍵となる新規相互作用や微生物を見出せるか〜

南澤究

日本微生物学会第32回大会　2018/07/12
植物組織からの細菌細胞濃縮法の改良:ダイズ組織別の細菌叢解析

原新太郎, 松田雅敏, 新井沙和, 南澤究

日本土壌微生物学会2018年度大会　2018/06/17
根粒菌ニトロゲナーゼの水素発生による土壌細菌叢変化と根粒共生の低温適応

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌微生物学会2018年度大会　2018/06/17
“Environmental dynamics of plant-associated bacteria: From rhizobia towards plant microbiomes” International-presentation Invited

MINAMISAWA Kiwamu

RIKEN International Symposium “Frontiers in Integrated Symbiology”　2018/06/04
Bradyrhizobium 属根粒菌共生アイランドの実験室進化

大竹遥, 菅原雅之, 高橋智子, 南澤究

第12回日本ゲノム微生物学会年会　2018/03/06
環境オミックス解析によるソルガム根の窒素固定 Bradyrhizobium 属細菌の同定

原新太郎, 森川峻志, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

第12回日本ゲノム微生物学会年会　2018/03/06
Plant-associated bacteria mitigate greenhouse gas emission International-presentation

Kiwamu Minamisawa

2nd Global Soil Biodiversity Conference (GSBC2)　2017/10/15
農耕地からのN2Oガス発生を削減し作物生産性を向上する微生物資材の開発コンソーシアム

南澤究

アグリビジネス創出フェア　2017/10/03
Redundant roles of Bradyrhizobium oligotrophicum Cu-type and cd1-type nitrite reductase genes under denitrifying conditions International-presentation

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

22nd EUROPEAN NITROGEN CYCLE MEETING (ENC2017)　2017/09/24
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌のOmic解析による同定

南澤究, 原新太郎, 森川峻志, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
根粒菌エフェクター NopPの変異がRj2ダイズとの共生不和合性を決定する

菅原雅之, 高橋智子, 梅原洋佐, 今道仁, 今野勇希, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
共生不和合成誘導根粒菌T3SSエフェクターとダイズ病原抵抗性タンパク質の相互作用解析

今道仁, 菅原雅之, 岩野裕也, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌共生アイランドの実験室進化

大竹遥, 菅原雅之, 高橋智子, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
ハギ根粒菌とダイズ根粒菌の共生アイランドとゲノムコアの比較：宿主マメ科植物は根粒菌の共生アイランドを選択するか？

今野勇希, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
メタゲノム解析に基づくソルガム根の窒素固定細菌の分離

森川峻志, 原新太郎, 新井沙和, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
ダイズ由来Methylobacterium属細菌のゲノムから推定されたウレイド分解および炭素代謝のポテンシャル

新井沙和, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

植物微生物研究会第27回研究交流会　2017/09/20
Redundant roles of Bradyrhizobium oligotrophicum Cu-type and cd1-type nitrite reductase genes under denitrifying conditions International-presentation

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017/09/03
Bradyrhizobium japonicum and B. diazoefficiens differ in anaerobic nitrate reduction International-presentation

Arthur Fernandes Siqueira, Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017/09/03
Metagenomic identification of nitrogen-fixing bacteria associated with roots of field-grown sorghum International-presentation

Shintaro Hara, Takashi Morikawa, Yasuhiro Kasahara, Taichi Koshiba, Kiyoshi Yamazaki, Toru Fujiwara, Tsuyoshi Tokunaga, Kiwamu Minamisawa

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017/09/03
A rhizobial effector protein inducing the symbiotic incompatibility between Bradyrhizobium diazoefficiens and soybean plants International-presentation

Masayuki Sugawara, Satoko Takahashi, Yosuke Umehara, Hiroya Iwano, Hitoshi Kondo, Yuki Konno, Haruka Odake, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

20th International Congress on Nitrogen Fixation　2017/09/03
温室効果ガスを削減する植物圏の微生物

南澤究

市民公開講座アジア環境微生物フォーラム　2017/09/01
水稲根由来Methylosinus属細菌のメタン酸化依存的窒素固定

南澤究, 篠田亮, 包智華

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
根粒菌の鉄・硫黄クラスター生合成関連因子SufTが植物共生を含む複雑な生活スタイルに果たす役割

佐々木祥平, 南澤究, 三井久幸

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
ダイズとの共生不和合性を引き起こす根粒菌3型分泌エフェクターの機能解析

菅原雅之, 高橋智子, 梅原洋佐, 岩野裕也, 今道仁, 今野勇希, 大竹遥, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
連作ダイズ莢組織内のMethylobacterium属細菌の動態:組織内分布と分離株の系統・ウレイド代謝

原新太郎, Hafidah Siti Nur, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
Characterization of Bradyrhizobium oligotrophicum nirK and nirS genes under denitrifying

Cristina Sanchez Gomez, Kiwamu Minamisawa

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
Bradyrhizobium japonicum and B. diazoefficiens differ in anaerobic nitrate reduction

Arthur Fernandes Siqueira, Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
共生不和合性誘導根粒菌T3SSエフェクターとダイズ病原抵抗性タンパク質の相互作用解析

今道仁, 菅原雅之, 岩野裕也, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
ダイズ根粒菌3型分泌エフェクター遺伝子の多様性

高橋智子, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
根粒菌hupSL1変異によるダイズ根圏のH2代謝と細菌群集構造の変動

渡辺剛, 原新太郎, 新井沙和, 高橋智子, 三屋公佑, 菅原雅之, 板倉学, 金子貴一, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
接種実験系によるMethylobacterium属細菌のダイズ器官および組織内の局在性

岩崎還帰, Hafidah Nur Siti, 原新太郎, 新井沙和, 菅原雅之, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
共生不和合性を利用したBradyrhizobium属根粒菌ゲノムの実験室進化：共生アイランドの大規模欠失

大竹遥, 菅原雅之, 高橋智子, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
Bradyrhizobium属根粒菌のnop遺伝子の多様性と宿主防御応答

今野勇希, 高橋智子, 今道仁, 梶原聖也, 根本智行, 菅原雅之, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
ソルガム根の窒素固定活性とその原因窒素固定細菌の探索

森川峻志, 原新太郎, 笠原康裕, 小柴太一, 山崎清志, 藤原徹, 徳永毅, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
イネの根の生育を指標としたAzospirillum sp. strain B510接種に応答するQTLの検出

佐々木和浩, 増田幸子, 風間ゆり, 木皿千春, 竹田晶子, 半澤栄子, 南澤究, 佐藤雅志

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
ダイズ根粒菌USDA110系統のゲノム多様性と吸収型ヒドロゲナーゼゲノミックアイランド構造変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2017　2017/08/29
ダイズとBradyrhizobium diazoefficiensとの共生不和合性を誘導する根粒菌3型分泌エフェクター

菅原雅之, 岩野裕也, 今道仁, 高橋智子, 佐藤修正, 梅原洋佐, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会2017年度大会　2017/03/17
土着ダイズ根粒菌USDA110系統株におけるゲノム多様性とゲノミックアイランド構造の変化

板倉学, 三屋公佑, 金原一真, 原新太郎, 渡辺剛, 菅原雅之, 金子貴一, 南澤究

第11回日本ゲノム微生物学会年会　2017/03/02
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌接種株の追跡

金原一真, 原新太郎, 菅原雅之, 南澤究

第11回日本ゲノム微生物学会年会　2017/03/02
ダイズ根粒菌3型分泌エフェクター遺伝子の多様性

高橋智子, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

第11回日本ゲノム微生物学会年会　2017/03/02
温室効果ガスを減らす植物共生細菌

日本生物工学会東日本支部賀詞交歓会　2017/01/27
イネとダイズの共生微生物による窒素代謝

肥料科学研究所平成28年度第２回研究会　2016/11/15
Frontiers of plant-associated bacteria International-presentation

4th Asian Conference Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation．(4th APMNF)　2016/10/16
Differences in the denitrification pathway between Bradyrhizobium diazoefficiens and B. japonicum under strictly anaerobic conditions． International-presentation

Arthur Fernandes Siqueira, Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

4th Asian Conference Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation．(4th APMNF)　2016/10/16
Rhizobial effector protein inducing the symbiotic incompatibility between Bradyrhizobium diazoefficiens and soybean plants International-presentation

Masayuki Sugawara, Hiroya Iwano, Hitoshi Kondo, Satoko Takahashi, Shohei Kusakabe, Shusei Sato, Yosuke Umehara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

4th Asian Conference Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation．(4th APMNF)　2016/10/16
ダイズとBradyrhizobium diazoefficiensとの共生不和合性を誘導する根粒菌エフェクター

菅原雅之, 岩野裕也, 今道仁, 高橋智子, 日下部翔平, 佐藤修正, 梅原洋佐, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
共生不和合性を誘導する根粒菌エフェクターのダイズによる認識と応答／Recognition and response of soybean plants to rhizobial effector proteins for symbiotic incompatibility

今道仁, 菅原雅之, 岩野裕也, 佐藤修正, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
連作によるダイズ地上部の細菌叢変化／Continuous cropping changed bacterial communities in soybean shoot

原新太郎, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種判定および土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別／Metagenome mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia in soil

金原一真, 板倉学, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, 王勇, 鶴丸博人, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
ダイズ根粒菌３型分泌エフェクター遺伝子の多様性／Diversity of type III effectors in soybean bradyrhizobia

高橋智子, 鈴木悠太, 菅原雅之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
Enrichment of nasS mutant of Bradyrhizobium diazoefficiens with higher N2O reductase activity to recover naturally-rare nosZ++ strains

Arthur F. Siqueira, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
低窒素圃場イネ根由来Methylosinus属細菌のメタン酸化依存的窒素固定／Methane oxidation-dependent 15N2 fixation by Methylosinus sp. isolated from rice root in a low N paddy field

篠田亮, 包智華, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
ダイズ根粒菌Bradyhrozbium diazoefficiens USDA110型菌株における吸収型ヒドロゲナーゼの多様性／Diversity in uptake hydrogenase within group USDA110 of Bradyrhizobium diazoefficiens

渡辺剛, 板倉学, 三屋公佑, 原新太郎, 金原一真, 菅原雅之, 按田瑞恵, 篠田亮, 金子貴一, 南澤究

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
Functional characterization of Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Cu-type and cd1-type nitrite reductase genes

○Cristina Sanchez, Kiwamu Minamisawa

植物微生物研究会第26回研究交流会　2016/09/07
Plant-associated Aureimonas with the sole rRNA operon on a tiny plasmid International-presentation

16th International Symposium on Microbial Ecology　2016/08/21
メタゲノム解析によるダイズ Methylobacterium 属細菌のメチルアミン・ウレイド代謝の発見

南智之, 按田瑞恵, 三井久幸, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会2016年度大会　2016/06/11
Differences in the denitrification pathway between Bradyrhizobium diazoefficiens and Bradyrhizobium japonicum under strictly anaerobic conditions

Arthur F. Siqueira, Cristina Sánchez・Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

日本土壌微生物学会2016年度大会　2016/06/11
日本のダイズリソースにおけるRj2遺伝型の分布

菅原雅之, 梅原洋佐, 柿崎芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

日本農芸化学会2016年度札幌大会　2016/03/27
根粒菌Bradyrhizobium diazoefficiens の種内比較ゲノム解析

三屋公佑, 金原一真, 菅原雅之, 南澤究, 金子貴一, 板倉学

第10回日本ゲノム微生物学会年会　2016/03/04
ゲノムマッピングによるダイズ根粒菌の種の判定と接種菌群の追跡

金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野裕子, 秋山博子, 早津雅仁, 南澤究

第10回日本ゲノム微生物学会年会　2016/03/04
植物共生細菌Methylobactrium 属内のメタゲノム解析

南智之, 按田瑞恵, 池田成志, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

第10回日本ゲノム微生物学会年会　2016/03/04
植物共生微生物の役割と農業

南澤究

拠点共同研究ワークショップ「微小生態系の構成原理~Wet/Dry双方からのアプローチによる理解と制御の試み」　2016/02/15
植物共生微生物の役割と農業

南澤究

2016年マルタ全国大会　2016/02/12
ダイズと根粒菌の共生と窒素利用

南澤究

科学技術振興機構（JST）研究開発戦略センター（CRDS）グリーンバイオ分野ワークショップ「微生物、生物多様性、共生を理解する技術基盤の最前線と利用技術への展開」　2015/11/07
食料生産•環境分野における微生物ゲノミクスの可能性と課題

南澤究

生命医薬情報学連合大会 2015 年大会（日本バイオインフォマティクス学会 2015 年年会）　2015/10/29
Metagenome-mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia in agricultural soil

Kazuma Kanehara, Manabu Itakura, Hirohito Tsurumaru, Yuko Hoshino, Yong Wang, Hiroko Akiyama, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

生命医薬情報学連合大会 2015 年大会（日本バイオインフォマティクス学会 2015 年年会）　2015/10/29
Rhizosphere is a textbook for microbial N cycle International-presentation

Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
Regulation of N2O reductase genes by the two-component system NasST in Bradyrhizobium diazoefficiens International-presentation

Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
Metagenomic analysis of bacteria associated with soybean nodules in continuous cropping field

Hirohito Tsurumaru, Manabu Itakura, Noriyuki Asanome, Kaori Kakizaki, Kazuma Kanehara, Noriyuki Konishi, Shinji Ishikawa, Hiroki Aida, Takuji Ohyama, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
N2O emission from soybean rhizosphere and its mitigation by Bradyrhizobium diazoefficiens inoculation International-presentation

Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
Nitrogen fixation depends on the methane oxidation by Methylosinus sp. isolated from paddy rice roots.

Ryo Shinoda, Bao Zhihua, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
Differential efficiency of nitrate respiration between Bradyrhizbium diazoefficiens and Bradyrhizobium japonicum International-presentation

Arthur F. Siqueira, Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
Metagenome-mapping method discriminates native and inoculant populations of soybean bradyrhizobia in agricultural soil

Kazuma Kanehara, Manabu Itakura, Hirohito Tsurumaru, Yuko Takada-Hoshino, Hiroko Akiyama, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
N2O reductase gene and activity in bradyrhizobia nodulating Aeschynomene indica

Tomohiro Kumei, Masayuki Sugawara, Cristina Sánchez, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
水稲根メタン酸化細菌の窒素固定能のメタプロテオーム解析、組織局在性と分離まで International-presentation

包智華, 篠田亮, 大久保卓, 久保田健吾, 笠原康裕, 池田成志, 浅川晋, 南澤究

日本微生物生態学会第30回大会 2015 JSME annual meeting & 7th JTK symposium　2015/10/17
N2O emission from soybean rhizosphere mediated by fungal denitrification International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Makoto Moriuchi, Keiichi Kuzunuki, Fumio Ikenishi, Reiko Sameshima, Akira Nakagiri, Sakae Toyoda, Chie Katsuyama, Naohiro Yoshida, Yuichi Suwa

20th European Nitrogen Cycle Meeting　2015/09/28
Regulation of nitrous oxide reductase genes by the NasST system in Bradyrhizobium diazoefficiens International-presentation

Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Takashi Okubo, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Aina Gotoh, Masafumi Hidaka, Takafumi Uchida, Kiwamu Minamisawa

20th European Nitrogen Cycle Meeting　2015/09/28
メタゲノム‐マッピング法による土着ダイズ根粒菌群と接種菌群の識別

南澤究, 金原一真, 板倉学, 鶴丸博人, 星野(高田)裕子, 王勇, 秋山博子, 早津雅仁

第25回植物微生物研究交流会　2015/09/14
日本のダイズリソースにおける Rj2 遺伝型の分布

菅原雅之, 梅原洋佐, 千葉(柿崎)芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

第25回植物微生物研究交流会　2015/09/14
硝酸供給に応じたシロイヌナズナ根共生細菌群集の変化

小西範幸, 早川俊彦, 山谷知行, 南澤究

第25回植物微生物研究交流会　2015/09/14
微生物生態からみた植物の栄養ー水稲根のメタン酸化窒素固定ー

第1回「植物の栄養研究会」　2015/09/04
植物共生微生物の多様性と機能を探る —根粒菌とマメ科植物の共生窒素固定から植物生育促進微生物まで—

花王生物科学研究所講演会　2015/08/04
地球環境に優しい持続的農業のブランド化

農業微生物研究シンポジウム「共生微生物の有用機能を活用した持続的農業の探求」　2015/07/09
地球惑星科学と微生物生態学の接点.軽希土類元素と細菌C1代謝：Bradyrhizobium属細菌のメタノールデヒドロゲナーゼ

南澤究, 関謙二郎, 包智华, 菅原雅之, 篠田亮, 谷明生, 増田幸子, 三井亮司

日本地球惑星科学連合2015年大会　2015/05/24
大量の挿入配列を保有するダイズ根粒菌のゲノム解析:根粒菌の生成と消滅を示唆する共生アイランド爆発

飯田隆之, 板倉学, 按田瑞恵, 菅原雅之, 伊沢剛, 大久保卓, 佐藤修正, 千葉, 柿崎, 芳里, 南澤究

日本土壌微生物学会2015年度大会　2015/05/22
日本のダイズ根粒菌とダイズのRj2共生不和合性

菅原雅之, 鈴木悠太, 板倉学, 千葉(柿崎, 芳里, 佐藤修正, 加賀秋人, 石本政男, 南澤究

日本土壌微生物学会2015年度大会　2015/05/22
根粒菌共生アイラントのマトリョーシカ型進化

南澤究

第88回日本細菌学会総会　2015/03/26
rRNA遺伝子オペロンが9-10 kbレプリコンのみに存在するゲノム構造をもつ細菌の系統分布

按田瑞恵, 大坪嘉行, 三井久幸, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

第９回日本ゲノム微生物学会年会　2015/03/06
植物マイクロビオームメタゲノム配列のマッピングによるMethylobacterium属細菌集団の植物種依存性の解析

南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 金子貴一, 田畑哲之, 津田雅孝, 南澤究

第９回日本ゲノム微生物学会年会　2015/03/06
日本ダイズコアコレクションにおける共生不和合性Rj2遺伝型の分布

菅原雅之, 南澤究

第８回ダイズ研究会　2015/03/06
N2-fixing methanotroph as non-leguminous rhizobia in paddy rice roots. 14th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes International-presentation

Kiwamu Minasamiwa, Zhihua Bao, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Haruko Imaizumi-Anraku, Kengo Kubota, Yasuhiro Kasahara, Dongyan Liu, Susumu Asakawa

14th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes　2014/10/30
Preference of endophytic bradyrhizobia in different rice cultivars and the symbiotic mechanism of cultivated rice endophytic bradyrhizobia International-presentation

Pouigdet Piromyou, Teerana Greetatorn, Kamonluck Teamtisong, Takashi Okubo, Ryo Shinoda, Achara Nuntakij, Panlada Tittabutr, nantakorn Boonkerd, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

14th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes　2014/10/30
N2O emission from soybean rhizosphere and its mitigation based on N-cycle biology International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Cristina Sánchez, Makoto Moriuchi, Shoko Inaba, Manabu Itakura

3rd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2014/10/28
テンサイ主根に共生細菌のメタゲノム解析

鶴丸博人, 大久保卓, 岡崎和之, 橋本萌, 柿崎芳里, 半澤栄子, 高橋宙之, 浅野目謙之, 田中福代, 関山恭代, 池田成志, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014/10/21
アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N2O発生の特定

森内真人, 葛貫桂一, 池西史生, 板倉学, 包智華, 豊田栄, 吉田尚弘, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014/10/21
rRNA遺伝子オペロンが9.4 kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見

按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 三井久幸, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014/10/21
共生不和合性を誘導するダイズ根粒菌のタイプIII型エフェクターの探索

岩野裕也, 鈴木悠太, 柿崎芳里, 菅原雅之, 佐藤修正, 南澤究

環境微生物系学会合同大会2014　2014/10/21
微生物ゲノム情報を圃場で活かす — 作物根圏からの温室効果ガス発生を制御するために —

南澤究

平成26年度日本農学会シンポジウム　2014/10/04
水稲根メタン酸化細菌は非マメ科植物の根粒菌か？

南澤究, 包智華, 池田成志, 大久保卓, 今泉(安楽)温子, 常田岳志, 久保田健吾, 笠原康裕, 劉冬艶, 浅川晋

第24回植物微生物研究交流会　2014/09/19
生窒素固定を促進するダイズ根粒菌III型分泌系エフェクター

鈴木悠太, Cristina Sánchez, 柿崎芳里, 菅原雅之, 佐藤修正, 金子貴一, 南澤究

第24回植物微生物研究交流会　2014/09/19
水稲根における窒素固定メタン酸化細菌のメタプロテオーム同定と組織局在性

包智華, 大久保卓, 久保田健吾, 笠原康裕, 鶴丸博人, 按田瑞恵, 池田成志, 南澤究

日本土壌肥料学会2014年度東京大会　2014/09/09
窒素追肥と栽植方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 南澤究

日本土壌肥料学会2014年度東京大会　2014/09/09
共生窒素固定を促進するダイズ根粒菌III型分泌系エフェクター

鈴木悠太, Cristina Sánchez, 柿崎芳里, 佐藤修正, 金子貴一, 南澤究

日本土壌肥料学会2014年度東京大会　2014/09/09
安定同位体15N/13Cによる植物根圏窒素サイクルの解明

南澤究

第32回「重窒素圃場利用研究会」討論会　2014/09/09
Genomic ecology of Methylobacterium species in legume plants International-presentation

Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Okubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa

The 6th Korea-Japan-Taiwan International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
No nitrogen fertilization changes rice root microbiome abundant in diazotrophic methanotrophs through a plant symbiosis gene International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda, Zhihua Bao, Takashi Okubo, Aya Watanabe, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Takeshi Tokida, Kengo Kubota, Yasuhiro Kasahara, Dongyan Liu, Takeshi Watanabe, Jun Murase, Susumu Asakawa, Mizue Anda, Hirohito Tsurumaru, Ryo Shinoda, Tadashi Sato

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
Metagenome analysis-assisted isolation of Bradyrhizobium species dominated in rice roots in a paddy field of low N environments International-presentation

Ryo Shinoda, Takashi Okubo, Shouhei Fukushima, Mizue Anda, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
N2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species International-presentation

Makoto Moriuchi, Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Reiko Sameshima, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
The nitrate-sensing NasST system regulates nitrous oxide reductase in Bradyrhizobium japonicum International-presentation

Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Takashi Okubo, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Aina Gotoh, Masafumi Hidaka, Takafumi Uchida, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
Effect of autoregulation of nodulation on plant colonization of Methylobacterium sp. AMS5 isolated from hypernodulated soybean International-presentation

Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Okubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
Genomic micro-variation of Bradyrhizobum diazoefficiens strains indigenous to various soils in Japan International-presentation

Kosuke Mitsuya, Manabu Itakura, Mizue Anda, Ryo Shinoda, Yuko Takada-Hoshino, Hiroko Akiyama, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

15th International Symposium on Microbial Ecology　2014/08/24
窒素追肥と栽培方向がダイズの共生窒素固定および収量に及ぼす影響

板倉学, 鶴丸博人, 浅野目謙之, 池田成志, 河原誠, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 南澤究

土壌肥料学会東北支部会平成２６年度仙台大会　2014/07/07
連作したダイズの収量と根共生細菌の多様性

鶴丸博人, 板倉学, 大久保卓, 柿崎芳里, 浅野目謙之, 石川伸二, 會田浩基, 大山卓爾, 池田成志, 南澤究

土壌肥料学会東北支部会平成２６年度仙台大会　2014/07/07
Microbial Nitrogen Transformation in the Legume Rhizosphere International-presentation

Kiwamu Minamisawa

20th World Congress of Soil Science　2014/06/08
植物根圏は温室効果ガス代謝のホットスポット

南澤究

日本地球惑星科学連合2014年大会　2014/04/28
根粒菌シグマ因子RpoH1の制御を受ける機能未知遺伝子の鉄硫黄タンパク質生合成への関与

佐々木祥平, 門屋亨介, 笠原康裕, 南澤究, 三井久幸

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014/03/07
ダイズ根粒菌高N2O還元活性株のゲノム解析による脱窒遺伝子の新規転写制御因子の発見

板倉学, Cristina Sánchez, 松本貴嗣, 吉川博文, 後藤愛那, 日高将文, 内田隆史, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014/03/07
共生アイランド獲得は根粒菌ゲノムの品質低下の危険を招く

飯田隆之, 板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 大久保卓, 三井久幸, 柿崎芳里, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014/03/07
根粒超着生ダイズから分離されたMethylobacterium sp. AMS5のゲノム解析

南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014/03/07
低窒素環境のイネ根で優占する細菌のメタゲノム解析に基づいた分離：Bradyrhizobium属とBurkholderia属分離株の機能解析

篠田亮, 大久保卓, 按田瑞恵, 鶴丸博人, 南澤究

第8回日本ゲノム微生物学会年会　2014/03/07
根圏に生息する微生物とその役割：窒素レベルは微生物相とその役割を変化させるのか？

南澤究, 板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文

第14回日本有機農業学会大会・総会　2013/12/07
植物共生微生物の多様性と生態機能を探る：Bradyrhizobium属細菌の共生進化と温室効果ガスを操る根圏微生物

南澤究

第33回日本微生物系統分類研究会　2013/11/14
温室効果ガス N2O 発生削減の根粒菌ゲノミックス:N2O 還元酵素遺伝子の新規制御系の発見

南澤究, 板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文

第29回日本微生物生態学会　2013/11/14
光合成 Bradyrhizobium 属細菌のメタノール依存的な生育に及ぼす希土類元素の影響

関謙二郎, 包智華, 三井亮司, 谷明生, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

第29回日本微生物生態学会　2013/11/14
N2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species

Moriuchi Makoto, Inaba Shoko, Ikenishi Fumio, Itakura Manabu, Kikuchi Masakazu, Eda Shima、Chiba Naohiko, Katsuyama Chie, Suwa Yuichi, Sameshima-Saito Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

第29回日本微生物生態学会　2013/11/14
Rice methanotrophic diazotrophs as non-leguminous rhizobia International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Zhihua Bao, Kenji Seki, Dongyan Liu, Susumu Asakawa, Haruko Imaizumi-Anraku, Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Akio Tani, Sachiko Masuda, Ryoji Mitsui, Takashi Okubo

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Search for a key target of RpoH1, the sigma factor essential for an effective symbiosis, in Sinorhizobium meliloti International-presentation

Shohei Sasaki, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Reduction of nitrous oxide emission from soybean rhizosphere by Bradyrhizobium japonicum inoculation. International-presentation

Manabu Itakura, Takashi Matsumoto, Hirofumi Yoshikawa, Yoshitaka Uchida, Hiroko Akiyama, Yuko Takada Hoshino, Yumi Shimomura, Sho Morimoto, Kanako Tago, Yong Wang, Chihiro Hayakawa, Yusuke Uetake, Cristina Sánchez, Shima Eda, Masahito Hayatsu, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Survey of nitrogen fixation by sugar beet-associated bacteria International-presentation

Hirohito Tsurumaru, Takashi Okubo, Kazuyuki Okazaki, Megumi Hashimoto, Noriyuki Asanome, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
A novel regulation system for transcription of nos and nap genes in Bradyrhizobium japonicum. International-presentation

Cristina Sánchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Genome analysis suggests that the soil oligotrophic bacterium Agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of Aeschynomene indica. International-presentation

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Manabu Itakura, Kenshiro Oshima, Aphakorn Longtonglang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Suppression of the colonization of Aureimonas sp. residing on leaf bundle sheath of Lotus japonicus by autoregulation of nodulation International-presentation

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Genome analysis of Methylobacterium sp. AMS5 from hypernodulated soybean stems International-presentation

Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Okubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
Analysis of symbiotic phenotypes of an effector gene unique to Bradyrhizobium japonicum USDA122 International-presentation

Yuta Suzuki, Cristina Sánchez, Kaori Kakizaki-Chiba, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Takahiro Tsukui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
N2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification of Fusarium species International-presentation

Makoto Moriuchi, Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Reiko Sameshima-Saito, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
The symbiotic mechanism of cultivated rice endophytic bradyrhizobia and their potential for field application International-presentation

Pongdet Piromyou, Rujirek Noisa-ngium, Kamonluck Teamthisong, Teerana Greetatorn, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Kiwamu Minamisawa, Neung Teaumroong

18th International Congress on Nitrogen Fixation in Miyazaki, Japan 第18回国際窒素固定会議　2013/10/14
N2O paradox of legume rhizosphere and its mitigation

飯田隆之, 柿崎芳里, 板倉学, 南澤究

2013年度東京大学生物生産工学研究センターシンポジウム　2013/09/27
ダイズ根粒菌におけるN2O還元酵素活性を制御している遺伝子の同定とN2O削減への利用

板倉学, Cristina Sanchez, 松本貴嗣, 吉川博文, 南澤究

日本土壌肥料学会 2013年度名古屋大会　2013/09/11
ダイズ根粒菌のゲノムバリエーション：マッピングによる挿入配列コピー数の推定

飯田隆之, 柿崎芳里, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会 2013年度名古屋大会　2013/09/11
A novel regulation system for transcription of nos genes in Bradyrhizobium japonicum

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

植物微生物研究会第23回研究交流会　2013/09/07
新規植物共生細菌 Aureimonas sp. AU20 のゲノム解析

按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 三井久幸, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

植物微生物研究会第23回研究交流会　2013/09/07
根粒超着生ダイズから分離された Methylobacterium sp.AMS5 のゲノム解析とミヤコグサにおける着生パターン

南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究

植物微生物研究会第23回研究交流会　2013/09/07
N2O emission during nitrogen transformation in soybean rhizosphere International-presentation

Kiwamu Minamisawa

3rd International Conference on Nitrification(ICoN3) 第3回国際硝化会議　2013/09/02
A novel regulation system for transcription of nos and nap genes in Bradyrhizobium japonicum International-presentation

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

3rd International Conference on Nitrification(ICoN3) 第3回国際硝化会議　2013/09/02
Soybean symbiosis with Bradyrhizobium japonicum: Evolution and global warming. International-presentation

Kiwamu Minamisawa

The 22th North American Conference on Symbiotic Nitrogen Fixation 北米窒素固定会議　2013/07/14
農業微生物のゲノム研究:温室効果ガス削減と作物共生微生物の活性化

南澤究

農業微生物研究シンポジウム「微生物機能を活用した自然共生型農業への探求」　2013/07/04
作物根圏における窒素と微生物の相互作用

南澤究

日本土壌微生物学会2013年度大会　2013/06/19
テンサイ共生微生物の多様性と窒素固定能の探索

鶴丸博人, 岡崎和之, 大久保卓, 橋本萌, 浅野目謙之, 池田成志, 南澤究

日本土壌微生物学会2013年度大会　2013/06/19
「ダイズ根圏のN2O発生機構と根粒菌による削減」、シンポジウム「微生物で植物と動物を操る環境バイオテクノロジー」

南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2013年度大会　2013/05/30
ダイズ根粒菌の N2O 還元酵素によるダイズ根圏からの N2O 発生削減

板倉学, 内田義崇, 秋山博子, 星野(高田)裕子, 下村有美, 森本晶, 多胡香奈子, 王勇, 早川千尋, 植竹佑輔, SANCHEZ Cristina, 江田志磨, 早津雅仁, 南澤究

日本農芸化学会2013年度大会　2013/03/24
Regulation of N2O reduction in Bradyrhizobium japonicum mutants with increased N2O reductase activity

Cristina Sanchez Gomez, Manabu Itakura, Yusuke Uetake, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

日本農芸化学会2013年度大会　2013/03/24
Nitrogen and plant－associated microbes International-presentation

Kiwamu Minamisawa

The 2nd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2012/10/28
Soil oligotrophic bacterium, Agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is nitrogen-fixing symbiont of Aeschynomene indica as suggested by genome analysis International-presentation

Takashi Okubo, Shohei Fukusima, Manabu Itakura, Kenshiro Ohshima, Aphakorn Longtonlang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

The 2nd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2012/10/28
Colonization of phyosynthetic Bradyshiobium and Burkholderia kururiensis in rice plant. International-presentation

Shohei Fukusima, Takashi Okubo, Ryo Shinoda, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

The 2nd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation　2012/10/28
Regulation of N2O reduction in Bradyrhizobium japonicum mutants with increased N2O reductase activity International-presentation

Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Yusuke Uetake, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

17th European Nitrogen Cycle Meeting　2012/09/26
Aurantimonas 属細菌AU20 株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012/09/25
光合成Bradyrhizobium とBurkholderia kururiensis のイネへの接種効果と組織局在性

福島翔平, 大久保卓, 篠田亮, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012/09/25
ダイズ根粒菌Type III 分泌系によるRj2 ダイズ共生不和合性の誘導

津久井隆裕, 江田志磨, 金子貴一, 佐藤修正, 岡崎伸, 柿崎(千葉)芳里, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012/09/25
根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoH1 レギュロン中の鍵となる遺伝子の探索

佐々木祥平, 南澤究, 三井久幸

植物微生物研究会第22回研究交流会　2012/09/25
Metagenome and microscopic analyses for plant-associated microbes towards sustainable agriculture

Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Mizue Anda, Seishi Ikeda, Kiwamu Minamisawa

第28回微生物生態学会　2012/09/19
Effects of rice genotype on methane flux and root-associated methanotrophs in paddy rice

Zhihua Bao, Aya Watanabe, Takashi Okubo, Dongyan Liu, Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Susumu Asagawa, Tadashi Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

第28回微生物生態学会　2012/09/19
ダイズ根圏のN2O発生機構：根粒菌と土壌生物による根粒窒素由来のN2O発生

南澤究, 稲葉尚子, 池西史生, 板倉学, 菊池真和, 江田志磨, 千葉直彦, 勝山千恵, 諏訪裕一, 星野(高田, 裕子, 早津雅仁, 三井久幸

日本土壌肥料学会2012年鳥取大会　2012/09/04
N2O還元酵素活性を強化したダイズ根粒菌の作出とモデル系によるN2O発生削減

板倉学, 植竹祐輔, Sanchez Cristina, 江田志磨, 田畑和文, 松本貴嗣, 吉川博文, 椎名陽子, 早津雅仁, 南澤究

日本土壌肥料学会2012年鳥取大会　2012/09/04
N2O emission from soybean rhizosphere depends on denitrification by Bradyrhizobium japonicum and other soil microbes International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Yoko Shiina, Shim Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Hisayuki Mitsui

14th International Symposium on Microbial Ecology　2012/08/19
Isolation and characterization of Aurantimonas species responded to legume nodulation genonotypes International-presentation

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

14th International Symposium on Microbial Ecology　2012/08/19
What does community analysis of plant-associated microbes tell us? International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Mizue Anda, Kazuhiro Sasaki, Zhihua Bao, Tadashi Sato, Haruko Imaizumi-Anraku

XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions　2012/07/29
N2O発生ダイズ根粒根圏から分離したFusariumの脱窒能

南澤究, 池西史生, 板倉学

日本土壌微生物学会2012年度大会　2012/06/23
イネエンドファイトAzospirillum sp. B510のインドール酢酸生合成に関する研究

南智之, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2012年度大会　2012/06/23
水稲のメタン発生に及ぼすイネ共生遺伝型の影響

包智華, 大久保卓, 池田成志, 佐々木和浩, 今泉(安楽)温子, 浅川晋, 劉冬艶, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌微生物学会2012年度大会　2012/06/23
土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophica S58Tのゲノム解析

大久保卓, 大島健志朗, 三井久幸, 服部勉, 服部正平, 南澤究

第6回日本ゲノム微生物学会年会　2012/03/10
「植物共生微生物の多様性と機能」根粒菌とエンドファイトによる物質循環と宿主相互作用

南澤究

（株）コンポン研究所植物技術講演会　2012/01/17
植物共生微生物の多様性と機能-根粒菌とエンドファイトによる物質循環と宿主相互作用-

南澤究

鹿児島大学インテンシブ理数教育特別プログラム先端科学講演会　2012/01/10
マメ科植物根圏のN2O発生機構と抑制技術シーズ

南澤究

農業環境技術研究所公開セミナー「微生物ゲノム情報の活用による温室効果ガス研究の新展開」　2011/12/06
Mechanism of N2O emission from soybean nodule rhizosphere and its mitigation International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Shoko Inaba, Yoko Shiina

17th International Congress on Nitrogen Fixation　2011/11/27
N2O emission from degraded soybean nodules by denitrification of Bradyrhizobim japonicum and other soil microorganisms International-presentation

Fumio Ikenishi, Shoko Inaba, Manabu Itakura, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

17th International Congress on Nitrogen Fixation　2011/11/27
土着ダイズ根粒菌の亜酸化窒素還元酵素遺伝子（nosZ）の分布と亜酸化窒素還元能を利用したN2O削減

板倉学, 椎名陽子, Hyunseok Choi, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土壌微生物学会2011年度大会　2011/11/25
シンポジウム植物共生微生物の多様性研究とその社会貢献

南澤究

第27回日本微生物生態学会大会　2011/10/08
異なる土壌型におけるnosZ保有・非保有Bradyrhizobium japonicum の出現頻度と系統分布

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第27回日本微生物生態学会大会　2011/10/08
OsCCaMKは水稲根と陸稲根の細菌群集構造を変化させる

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 武田直也, 馬場まり, 今泉(安楽)温子, 福田善通, 藤原信介, 大脇良成, 佐々木和浩, 佐藤雅志, 包智华

植物微生物研究会第21回研究交流会　2011/09/20
農耕地生態系における微生物群集構造の変動法則の理解から作物生産への貢献を目指して

南澤究

日本学術会議と土壌肥料学会共同シンポジウム「作物生産に対する土壌微生物の貢献」　2011/08/08
ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構と根粒菌を利用した低減化

板倉学, 稲葉尚子, 池西史生, 椎名陽子, Hyunseok Choi, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2011つくば大会　2011/08/08
マメ科モデル植物ミヤコグサ根圏土壌を対象とした比較メタゲノム解析

海野佑介, 寺沢公宏, 山下明史, 南澤究, 信濃卓郎

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
アルファルファ根粒菌の根粒形成における多剤排出ポンプの役割

江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
イネ地上部最近群集のメタゲノム解析

大久保卓, 佐々木和浩, 金子貴一, 山下明史, 大島健志朗, 佐藤修正, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤雅志, 田畑哲之, 服部正平, 池田成志, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
水稲根窒素固定細菌群集構造に及ぼす窒素施肥の影響

北野愛奈, 池田成志, 佐々木和浩, 山下明史, 寺沢公宏, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集のメタゲノム解析

佐々木和浩, 大久保卓, 池田成志, 山下明史, 北野愛奈, 江田志磨, 三井久幸, 佐藤雅志, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
ミヤコグサ根粒菌の宿主植物への侵入に重要なcep遺伝子の機能解析

菅原智史, 川原田泰之, 松本貴嗣, 志波優, 吉川博文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
宿主遺伝子特異的な共生不和合性をもつダイズ根粒菌のゲノム解析

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 山下明史, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
メタゲノム配列から目的の遺伝子を効率よく探す方法

山下明史, 北野愛奈, 佐々木和浩, 南澤究

第5回日本ゲノム微生物学会年会　2011/03/14
植物共生微生物コミュニティー：土壌－植物系における物質循環と宿主相互作用の再考

南澤究

公開シンポジウム持続農業と温暖化防止に貢献する植物・土壌科学　2010/12/04
イネ根の窒素固定菌の群集構造解

北野愛奈, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010/11/24
ミヤコグサ根粒菌の宿主植物への侵入に重要なcep遺伝子の機能解析

菅原智史, 川原田泰之, 松本貴嗣, 志波優, 吉川博文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010/11/24
STMによって同定されたダイズ根粒菌遺伝子の根粒形成と競合能力に関わる機能の解析

古川啓介, 大久保卓, 江田志摩, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010/11/24
「土壌－植物圏における窒素動態と微生物生態－異分野融合による新展開を目指して－」根粒根圏のN2O発生機構とその低減化

南澤究

日本微生物生態学会第26回大会　2010/11/24
根圏に生息する微生物とその役割

南澤究

有機農業研究者会議2010　2010/11/04
Bacterial isolation from stems of hypernodulated soybean for Methylobacterium sp. and Aurantimonas sp. sensitive to nodulation phenotypes and field nitrogen levels International-presentation

Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Takashi Okubo, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

1st Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation International Symposium on Microbial Ecology　2010/09/20
Metagenomic survey for characteristics of plant-associated bacteria International-presentation

Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Kenshiro Oshima, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Masashi Sato, Eda Shima, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Kiwamu Minamisawa

1st Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation International Symposium on Microbial Ecology　2010/09/20
根粒着生変異と窒素施肥レベルに応答したダイズ葉の細菌群集構造変化

池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 佐々木和浩, 佐藤雅志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010/09/07
ダイズ根粒菌のN2O還元能による根粒根圏モデル系からのN2O発生低減化

板倉学, 椎名陽子, Choi Hyunseok, 植竹佑輔, 江田志磨, 松本貴嗣, 吉川博文, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010/09/07
窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集の構造変化－低窒素区の根圏における窒素固定細菌とメタン酸化細菌の増加－

佐々木和浩, 大久保卓, 池田成志, 北野愛奈, 飯田隆之, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤雅志, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010/09/07
異なる土壌型におけるダイズ根粒菌 nosZ 保有株の出現頻度出現頻度の高い沖積土と低い黒ボク土の主成分解析

椎名陽子, 板倉学, 大久保卓, Choi Hyunseok, 稲葉尚子, 佐伯雄一, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010/09/07
岡田要之助先生とWinogradsky 彼らが現代の土壌微生物研究をみたら？

南澤究

日本土壌肥料学会2010年度北海道大会　2010/09/07
Thiosulfate-dependent chemolithoautotrophic growth of Bradyrhizobium japonicum International-presentation

Sachiko Masuda, Shima Eda, Seishi Ikeda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

13th International Symposium on Microbial Ecology　2010/08/22
Community shifts in soybean-associated microbes by host nodulation genotypes and nitrogen applications International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Shoko Inaba, Mizue Anda, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Seishi Ikeda

13th International Symposium on Microbial Ecology　2010/08/22
根粒超着生ダイズからのMethylobacterium属及びAurantimonas属細菌の分離

按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010/06/21
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集：Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH（Fluorescence in situ hybridization）解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010/06/21
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumUSDA122株とUSDA110株のゲノム比較

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 山下明史, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010/06/21
ダイズ根粒菌の変異dnaQプラスミドによる高N2O還元酵素活性変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 植竹祐輔, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

環境バイオテクノロジー学会 2010年度大会　2010/06/21
根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析

按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010/05/21
ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集：Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH（Fluorescence in situ hybridization）解析

飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010/05/21
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumUSDA122株とUSDA110株のゲノム比較：USDA122株特異的遺伝子の探索

津久井隆裕, 金子貴一, 佐藤修正, 山田学, 板倉学, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010/05/21
ダイズ老化根粒からの亜酸化窒素発生に関与する土壌生物

南澤究

日本土壌微生物学会2010年度大会　2010/05/21
イネ共生細菌の群集構造解析

池田成志, 佐々木和浩, 大久保卓, 北野愛奈, 大島健志朗, 服部正平, 佐藤雅志, 今泉(安楽)温子, 飯田隆之, 按田瑞恵, 江田志磨, 三井久幸

第４回ゲノム微生物学会　2010/03/07
作物に共生する微生物群集について

総合技術会議科学技術連携施策群食料・生物生産研究連携群シンポジウム「生物機能を活用した食料生産・物質生産への新たな光」　2010/03/02
Community Shifts in Legume-Associated Microbes by Host Symbiotic System and Nitrogen. International-presentation

Seishi Ikeda, Takashi Ohkubo, Takakazu Kaneko, Manabu Itakura, Mizue Anda, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui

The Evolution of Symbiotic Systems, 7th Okazaki Biology Conference　2010/01/14
作物に共生する微生物群集の包括的な理解と農業利用

南澤究

平成２１年度北海道農業研究センター研究会「根圏域研究が農業現場において果たすべき役割」　2009/12/22
ダイズ根粒菌からの温室効果ガス発生：土壌生物のランチタイム

南澤究

北海道農業研究センター根圏域研究セミナー　2009/12/21
植物共生微生物と温室効果ガス：根圏土壌生物のランチタイム

南澤究

2009年度東京大学生物生産工学研究センターシンポジウム　2009/12/11
食料生産と環境保全を目指した植物共生菌の多様性と機能の解明

南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009/11/21
ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009/11/21
超純水中におけるBradyrhizobium属細菌の生存と適応

菅原千晶, 増田幸子, 板倉学, 川原田泰之, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009/11/21
低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 池田成志, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009/11/21
Signature-tagged mutagenesisに基づくミヤコグサ根粒菌の共生および競合に関与する遺伝子の網羅的探索

包日吉金, 閙干朝魯, 下田宜司, 田畑哲之, 佐藤修正, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第25回大会　2009/11/21
植物共生微生物の多様性とその利用

南澤究

中高温微生物センター開所記念シンポジウム「地球温暖化に向けた新たな微生物学の展開を」　2009/11/19
作物に共生する微生物群集の包括的な理解に向けて：根粒着生変異と窒素施肥によるダイズ共生微生物群変化 International-presentation

南澤究

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009/10/06
Development of a Bacterial Cell Enrichment Method and its Application to the Microbial Community Analysis in Phytosphere toward to the Metagenomics of Microbial Symbionts in Plants International-presentation

Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn E. E. Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009/10/06
Microbial Diversity in Rice Phytosphere Assessed by Clone Library Analysis of 16S rRNA and nifH Genes in Conjunction with a Bacterial Cell Enrichment Method International-presentation

Seishi Ikeda, Aina Kitano, Kenshiro Oshima, Kazuhiro Sasaki, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Masahira Hattori, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009/10/06
Genomic Comparison of Bradyrhizobium Japonicum Strains with Different Symbiotic N2-fixing Capabilities: A QTL Approach for N2-fixing Efficiency in Rhizobia International-presentation

Manabu Itakura, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Keina Honma, Konosuke Fujita, Hiroyoshi Iwata, Yuichi Saeki, Yoshino Hara, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009/10/06
Unever Distribution of nosZGenotype in Bradyrhizobium Japonicum Populations Indigenous to Field soils in Japan International-presentation

Manabu Itakura, Choi Hyunseok, Shoko Inaba, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

ＭＡＲＣＯシンポジウム2009　2009/10/06
変異型dnaQプラスミドによる高N2O還元酵素活性を示すダイズ根粒菌変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14
低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14
非培養法による植物共生微生物の多様性解析非培養法によるダイズ共生微生物の群集構造に対する根粒共生系及び窒素施肥の影響評価

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14
ダイズ老化根粒におけるN2O発生メカニズムの解明：根粒菌脱窒と硝化過程の関与

稲葉尚子, 菊池真和, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14
ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化

池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志摩, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第19回研究交流会　2009/09/08
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較

津久井隆裕, 金子貴一, 板倉学, 山田学, 佐藤修正, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

植物微生物研究会第19回研究交流会　2009/09/08
エンドファイトAzospirillum sp. B510 株接種がイネ幼苗の生育・形態・遺伝子発現に及ぼす影響

樅山歩美, 江田志磨, 安田美智子, 仲下英雄, 佐藤雅志, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第19回研究交流会　2009/09/08
植物共生微生物の多様性と相互作用

第27回日本植物細胞分子生物学会　2009/07/30
Diversity in soybean-associated microbes and its regulation by host plants with different nodulation phenotypes and nitrogen applications International-presentation

Kiwamu Minamisawa

The 16th International congress on nitrogen fixation　2009/06/14
Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成と競合能に関わる遺伝子の探索

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2009年度大会　2009/06/12
変異型dnaQプラスミドを用いたBradyrhizobium japonicum高N2O還元酵素活性変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本農芸化学会2009年度大会　2009/03/27
根粒菌の環状グルカンに存在する酸性置換基が共生窒素固定に果たす役割

川原田泰之, 清田洋正, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会2009年度大会　2009/03/27
植物共生細菌の宿主相互作用とゲノム進化

南澤究

日本農芸化学会2009年度大会　2009/03/27
耕地土壌におけるキチナーゼの多様性および環境因子との関連性

寺原猛, 池田成志, 則武ちあき, 南澤究, 安藤勝彦, 常田聡, 原山重明

日本農芸化学会2009年度大会　2009/03/27
植物生息微生物の群集構造に対する根粒共生系の影響

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 金子貴一, ynn Ester E. Rallos, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之

第３回日本ゲノム微生物学会　2009/03/05
植物内生細菌Azospirillum sp. B510のゲノム構造解析

金子貴一, 南澤究, 佐藤修正, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之

第３回日本ゲノム微生物学会　2009/03/05
植物生息微生物の群集構造に対する根粒共生系の影響

南澤究, 池田成志, 大久保卓, 金子貴一, ynn Ester E. Rallos, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之

第３回日本ゲノム微生物学会　2009/03/05
Bacterial cell enrichment represents higher diversity of culturable and unculturable communities associated with soybean stems International-presentation

Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn Esther E. Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

Plant and Animal Genome XVII Conference　2009/01/10
老化ダイズ根粒からのN2O発生における根粒菌の寄与

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25
細胞濃縮法を用いたダイズ茎関連細菌の群集構造解析

大久保卓, 池田成志, 金子貴一, Lynn Esther E. Rallos, 江田志磨, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25
Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum: A functional genomic approach for geobiochemistry

増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25
ダイズ根粒菌変異型dnaQプラスミドを用いた高N2O還元酵素活性変異株の取得

板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25
異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

池田成志, Lynn Rallos, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25
Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum: A functional genomic approach for geobiochemistry International-presentation

Sachiko Masuda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

7th International Symposium for Subsurface Microbiology　2008/11/16
Geochemical aspects of soil bacteria deduced from their genome: thiosulfate oxidation and C1 metabolism of Bradyrhizobium japonicum International-presentation

Kiwamu Minamisawa

7th International Symposium for Subsurface Microbiology　2008/11/16
菌体外多糖合成におけるアルファルファ根粒菌外膜蛋白質TolCの機能解析

森有季子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17
Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成に関わる因子の探索

古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17
Signature-tagged Mutagenesisによるミヤコグサ根粒菌の競合的根粒形成能の解析

包日吉金閙干朝魯, 下田宜司, 三井久幸, 江田志磨, 田畑哲之, 佐藤修正, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17
ミヤコグサに内生するバクテリアエンドファイトの解析

川原田泰之, 板倉学, 金子貴一, 江田志磨, 三井久幸, 田畑哲之, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17
異なる根粒形成表現型ダイズにおける細菌エンドファイトの多様性解析

大久保卓, 池田成志, 佐藤修正, 金子貴一, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17
Ethylene-mediated interactions between plants and bacteria: Rhizobitoxine production and ACC deaminase International-presentation

Minamisawa, K, M. Sugawara, S. Okazaki, N. Nukui, H. Ezura, S. Eda, H. Mitsui

8th European Nitorogen Fixation Conference　2008/08/30
Genomic comparison of Bradyrhizobium japonicum strains with different symbiotic N2-fixing capabilities: A QTL approach for N2-fixing efficiency in rhizobia International-presentation

Itakura, M, K. Saeki, H. Omori, T. Yokoyama, T. Kaneko, S. Tabata, T. Ohwada, S. Tajima, T. Uchiumi, K. Honnma, K. Fujita, H. Iwata, Y. Saeki, Y. Hara, S. Ikeda, S. Eda, H. Mitsui, K. Minamisawa

8th European Nitrogen Fixation Conference　2008/08/30
ダイズ根粒根圏からのN2O発生における根粒菌の寄与

稲葉尚子, 田邉謙二, 菊池真和, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会東北支部会宮城大会　2008/07/02
ゲノム情報に基づいた植物共生細菌の環境応答と物質循環機能の解明

南澤究

日本土壌微生物学会2008年度大会　2008/06/13
Genomic ecology of plant-associated bacteria: rhizobia and endophytes International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Masayuki Sugawara, Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shima Eda, Hisayuki Mitsui

International Conference between Tohoku University and Lyon group in France　2007/12/12
ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける環状グルカンの構造決定とその構造変化が及ぼす共生過程への影響

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会　2007/12/11
ミヤコグサ細菌エンドファイトの分離

川原田泰之, 板倉学, 金子貴一, 江田志磨, 三井久幸, 田畑哲之, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19
ミヤコグサ根粒菌におけるグルカン修飾基転移酵素遺伝子の同定と共生過程での役割

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19
リゾビトキシン生産Agrobacterium tumefaciensを用いた植物の形質転換

原槙良太, 菅原雅之, 野中聡子, 江面浩, 江田志麿, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19
STM(signature-tagged mutagenesis)法によるダイズ根粒菌の競合的根粒形成を決定してしている遺伝子の探索

大久保卓, 三井久幸, 江田志麿, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19
根粒形成過程におけるアルファルファ根粒菌TolC蛋白質の役割

森有季子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19
根粒菌 Mesorhizobium loti の環状グルカンの細胞含有量に影響を与える cep 遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染に必須の役割を有する

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
Community structures of endophytes in soybeans with different nodulation genotypes

Lynn Esther E. Rallos, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
Analysis of metabolic features of naturally-occurring aromatic compounds in Bradyrhizobium japonicum based on array and gene disruption

Nirinya Sudtachat, Naofumi Ito, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおけるN2O還元酵素高発現株の作成

植竹佑輔, 千葉芳里, 平山潤太, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
ダイズ根粒根圏のN2O発生に関わる微生物の解明

菊池真和, 田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
根粒菌Mesorhizobium lotiの環状グルカンの細胞内含有量に影響を与えるcep遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染において必須の役割を有する．

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
微生物生態学における環境ゲノミクス

南澤究

日本微生物生態学会第23回大会　2007/09/15
Ethylene-mediated interactions between plants and bacteria by rhizobitoxine and 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Masayuki Sugawara, Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shima Eda, Hisayuki Mitsui

International Conference Rhizosphere-2　2007/08/26
野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

日本土壌肥料学会2007年度大会　2007/08/22
植物共生細菌の微生物資源とゲノム解析

南澤究

日本微生物資源学会第14回大会　2007/06/25
野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

日本土壌微生物学会2007年度大会　2007/06/07
アルファルファ根粒菌の２つのRpoHが熱ショック反応に果たす役割

三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会　2007/03/24
ミヤコグサ根粒菌の新規共生必須遺伝しsagは環状グルカンにおける酸性修飾基の付加に関与する

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会　2007/03/24
農業におけるゲノム情報の利用

豊橋技術科学大学・農業環境技術研究所共催公開シンポジウム　2007/03/12
野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志摩, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

第１回日本ゲノム微生物学会　2007/03/01
ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiのペリプラズムグルカン合成に関与する遺伝子の同定と宿主植物との共生能における役割

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

第１回日本ゲノム微生物学会　2007/03/01
ダイズ根粒菌超反復配列保有株(HRS)株と通常株(non-HRS)株のゲノム構造比較

板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

第１回日本ゲノム微生物学会　2007/03/01
根粒菌の共生システム

国際高等研フォーラム細胞内共生ー生物界における共生と支配ー　2006/12/09
根粒菌とエンドファイトのゲノムからみた相互作用と生態機能

インターゲノミックス研究会　2006/11/01
ダイズ根粒菌のsox相同遺伝子によるチオ硫酸酸化

増田幸子, 江田志磨, 南澤究

日本微生物生態学会第22回大会　2006/10/27
土壌抽出基質と硝酸呼吸条件下におけるダイズ根粒菌の増殖・生残遺伝子のSTMによる探索

上松瀬裕子, 板倉学, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第22回大会　2006/10/27
ダイズ根粒菌超反復配列保有（HRS）株と通常（non-HRS）株のゲノム構造比較

板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第22回大会　2006/10/27
ミヤコグサ根粒菌の新規共生必須遺伝子は、酸性サイクリックグルカンの合成に関与する

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20
リゾビトキシン生産アグロバクテリウムの構築と遺伝子導入への影響

菅原雅之, 原槙良太, 野中聡子, 江面浩, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20
芳香族化合物を基質としたダイズ根粒菌培養細胞の網羅的遺伝子発現解析芳香族化合物を基質としたダイズ根粒菌培養細胞の網羅的遺伝子発現解析

伊藤尚文, 板倉学, 江田志磨, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂之, 内海俊樹, 三井久幸, 政井英司, 津田雅孝, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20
ダイズ根粒菌株の可変ゲノム領域と共生窒素固定能の相関解析

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢治, 田島茂之, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 江田志摩, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20
Genomic autoecoloy of bradyrhizobia associated with plants and soil microbial community International-presentation

4th Okazaki Biology Conference: "Terra Microbiology 2"　2006/09/10
ダイズ根粒菌のゲノムの構造比較と共生窒素固定能

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌肥料学会2006年度大会　2006/09/05
ダイズ根粒根圏のN2O発生と生物群集構造解析

田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 南澤究

日本土壌肥料学会2006年度大会　2006/09/05
GENOMIC MICROEVOLUTION AND METABOLIC VERSATILITY OF BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM AND CLOSE RELATIVES IN BRADYRHIZOBIACEAE International-presentation

K MINAMISAWA, M ITAKURA, S EDA, K SAEKI, H OOMORI, T YOKOYAMA, T KANEKO, S TABATA, T OOWADA, S TAJIMA, T UCHIUMI, H MITSUI, R SAMESHIMA-SAITO

11th International Symposium on Microbial Ecology　2006/08/20
A novel symbiotic gene is required for the synthesis of anionic cyclic beta-glucans in Mesorhizboum loti International-presentation

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本学術振興会欧米・大洋州諸国との共同研究・セミナー（持続的農業のための植物微生物共生ゲノムサイエンス）　2006/08/15
嫌気窒素固定コンソーシアムの窒素固定に影響する因子の解析

齋藤朝美, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10
ミヤコグサ根粒菌 Mesorhizobium loti における新規共生能欠損変異株の解析

川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10
Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる根粒形成、非根粒形成Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム比較

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの芳香族化合物分解系およびエネルギー獲得系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10
根粒圏の微生物・微小動物

南澤究, 田邉謙二, 池田成志, 東谷篤志, 江田志磨

土壌微生物学会サテライトミーティング「植物根圏の微生物・微小動物の機能と相互作用」　2006/06/09
ダイズ根粒菌マクロアレイによる芳香属化合物分解系の解析

伊藤尚文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

土壌微生物学会サテライトミーティング「植物根圏の微生物・微小動物の機能と相互作用」　2006/06/09
Genome Plasticity of Symbiotic and Non-symbiotic members of Bradyrhzobiaceae: Dynamics of Symbiosis Island. International-presentation

Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Oowada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Hisayuki Mitsui, Reiko Sameshima

International Symposium on the Comparative Biology of the Alphaproteobacteria　2006/04/26
Genome Plasticity of Symbiotic and Non-symbiotic members of Bradyrhzobiaceae: Dynamics of Symbiosis Island International-presentation

Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Oowada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Hisayuki Mitsui, Reiko Sameshima

International Symposium on the Comparative Biology of the Alphaproteobacteria　2006/04/26
ダイズ根粒菌のゲノム生態学

第二回「ダイズのバイオリソースとゲノミクスの進展」国立遺伝学研究所研究集会　2006/03/16
ダイズ根粒菌のゲノム比較と環境中の機能ゲノミクス

南澤究, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 伊藤尚文, 増田幸子, 原圭乃, 江田志磨, 板倉学

第８回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンテイア」　2006/03/04
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌の芳香族化合物分解系およびチオ硫酸酸化系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

第８回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンテイア」　2006/03/04
ダイズ根粒における亜酸化窒素の吸収と発生

平山潤太, 田邊謙二, 千葉芳里, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会第21回大会　2005/10/30
STM法の構築によるミヤコグサ根粒菌の炭素源飢餓応答に関連する遺伝子の探索

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第21回大会　2005/10/30
Clostridium属エンドファイトの分布

齋藤朝美, 河原誠, 西口友広, 南澤究

日本微生物生態学会第21回大会　2005/10/30
Bradyrhizobium japonicum DNA マクロアレイによる共生、非共生Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム可塑性

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10
リゾビトキシン前駆物質としてのグルタミンの役割

菅原雅之, 三井久幸, 江面浩, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10
ミヤコグサ根粒菌におけるリン酸トランスポーターの解析

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10
Rj2遺伝型ダイズに対するBradyrhizobium japonicum USDA122の共生不和合性

津久井隆裕, 菅原雅之, 川原田泰之, 鈴木理, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10
HerbaspirillumエンドファイトのnifH発現の光誘導性

西口友広, 游牧, 斉藤朝美, 伊沢剛, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10
根粒菌のRNAポリメラーゼシグマ因子の発現調節

三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10
ダイズ根粒菌のゲノム構造とチオ硫酸酸化系の解析

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本土壌肥料学会 2005年度島根大会　2005/09/06
Bradyrhizobiaceae科細菌における共生アイランドとゲノムの可塑性

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

第7回日本進化学会大会　2005/08/26
ダイズ根粒菌のN2Oパラドックス．

南澤究, 千葉芳里, 平山潤太, 鮫島玲子

日本土壌微生物学会 2005年度大会　2005/06/11
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会 2005年度大会　2005/06/11
根粒菌の環境ストレス耐性と共生能の両方に重要な転写因子RpoH1の機能解析

三井久幸, 南澤究

日本土壌微生物学会 2005年度大会　2005/06/11
ミヤコグサ根粒菌の共生窒素固定でのリン酸トランスポーター遺伝子pstSの役割

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会 2005年度大会　2005/03/28
マメ科植物との共生成立における根粒菌シグマ因子RpoH1のレギュロンの機能

三井久幸, 南澤究

日本農芸化学会 2005年度大会　2005/03/28
Bradyrhizobium属細菌ゲノムにおける共生窒素固定と光合成

板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

特定領域研究「総合ゲノム」主催第7回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2005/03/05
全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌 Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析

伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

特定領域研究「総合ゲノム」主催第7回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2005/03/05
炭素源飢餓条件下で高発現するミヤコグサ根粒菌遺伝子破壊株の増殖特性

柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
ダイズ根粒菌ゲノムにおける外来性因子trn element の構造解析

増田幸子, 板倉学, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
¹⁵N-N₂O投与よるダイズ根粒菌のN2O吸収・N2発生機構の解明

平山潤太, 千葉芳香, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索-リン酸トランスポーター遺伝子の解析

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
Clostridium属エンドファイトの植物体内における窒素固定のnifH転写産物による検出

齋藤朝美, 游牧, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
根粒菌のマメ科植物との共生成立に必須な転写因子の解析

三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
リゾビトキシン生合成遺伝子の機能解析と非生産菌への導入

菅原雅之, 岡崎伸, 野中聡子, 江面浩, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析

原圭乃, 板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 三井久幸, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較 -Bradyrhizobium属細菌のゲノム進化と多様性

板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
直接核酸抽出法によるClostridium属エンドファイトの分布と機能の解析

河原誠, 宮本拓也, 齋藤朝美, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
ダイズ根粒菌における脱窒遺伝子の分布とN2O還元活性

千葉芳香, 鮫島玲子, 南澤究

日本微生物生態学会第20回大会　2004/11/21
Diazotrophic endophytes in Grasses: Herbaspirillum sp. and Anaerobic Nitrogen-fixing consortium. International-presentation

You M, Abe T, Ye B, Saito A, Kawahara M, Sato T

14th International congress on nitrogen fixation　2004/10/27

More details Close

基調講演
Expression island and islet in rhizobial genome during symbiosis and microaerobic environment International-presentation

Uchiumi T, Oowada T, Itakura M, Mitsui H, Nukui N, Dawadi P, Kaneko T, Tabata S, Yokoyama T, Tejima K, Saeki K, Oomori H, Hayashi M, Maekawa T, Murooka Y, Tajima S, Shimomura K, Nomura M, Suzuki A, Shimoda Y, Sioya K, Abe M, Minamisawa K

14th International congress on nitrogen fixation　2004/10/27
Rhizobitoxine biosynthesis in bradyrhizobium elkanii and transfer of rtx genes to non-producing rhizobia International-presentation

Sugawara M, Okazaki S, Nonaka S, Ezura H, Minamisawa K

14th International congress on nitrogen fixation　2004/10/27
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較

日本土壌肥料学会　2004/09/14
共生細菌におけるポストゲノム研究の展開：根粒菌のトランスクリプトミクス（シンポジウム）

日本土壌肥料学会　2004/09/14

More details Close

招待講演
マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析

原圭乃, 板倉学, 三井久幸, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 内海俊樹, 大和田琢二, 金子貴一, 田畑哲之, 田島茂行, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
マクロアレイによるダイズ根粒菌株のゲノム比較

南澤究, 板倉学, 増田幸子, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
ミヤコグサ根粒菌ACC deaminaseの根粒形成における効果

貫井憲之, 南澤究, 青木俊夫, 綾部真一

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索—リン酸トランスポーター遺伝子の解析

川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
リゾビトキシン生合成遺伝子の機能解析と非生産菌への導入

菅原雅之, 岡崎伸, 野中聡子, 江面浩, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
根粒菌の遺伝子発現制御と細胞内共生過程

三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
細菌エンドファイト定着イネの病虫害抵抗性

伊沢剛, 比留間直也, 今田隆弘, 金まどか, 河野晋治, 篠崎聡, 南澤究, 佐藤雅志

植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06
Dynamics of rhyzobial life in plant and soil. International-presentation

21世紀COEプログラム国際シンポジウム環境と共生する微生物　2004/09/02

More details Close

招待講演
Expression islands clustered on symbiosis island of Mesorhizobium loti genome: Rhizobial transcriptome analysis under symbiosis, microaerobiosis and starvation International-presentation

Uchiumi T, Oowada T, Itakura M, Mitsui H, Nukui N, Dawadi P, Kaneko T, Tabata S, Yokoyama T, Minamisawa K

10th International Symposium on Microbial Ecology　2004/08/22
Haloalkane dehalogenase activities in rhizobia and related species International-presentation

Ikeda Wakako, Sato Yukari, Kiwamu Minamisawa, Masataka Tsuda, Yuji Nagata

10th International Symposium on Microbial Ecology　2004/08/22
Nitrous oxide reduction by Bradyrhizobium japonicum USDA110 in soybean nodule International-presentation

Sameshima-Saito R, Minamisawa K

16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003/09/01
Rhizobia selected leguminous plant cells for their habitat during earth's history International-presentation

Mitsui H, Minamisawa K

16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003/09/01
What are phenotypes of indigenous bacteria relevant to biogeochemical process? - Bradyrhizobium group, a promising target to integrate genomics into geomicrobiology as ubiquitous oligotrophs in the environments - International-presentation

16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003/09/01
共生・微好気・炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司, 塩屋幸樹

日本土壌肥料学会　2003/08/20
植物体内の嫌気窒素固定コンソーシアムを構成するClostridium属細菌のT-RFLP法による群集構造解析

宮本拓也, 斉藤朝美, 河原誠, 南澤究

日本土壌肥料学会　2003/08/20
Rhizobial determinants for nodulation and nitrogen fixation with bred soybean

Teamtisong, k, Teaumroong, N, Okazaki, S, Saeki, K, Kaneko, T, Tabata, S, Minamisawa, K

日本土壌肥料学会　2003/08/20
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkanii のリゾビトキシン生合成と宿主植物との相互作用

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会　2003/08/20
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum の脱窒により発生する15N標識窒素ガスのTCDガスクロマトグラフィーを用いた定量法

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会　2003/08/20
共生から見る微生物窒素循環を担う植物の共生細菌たち

日本学術会議シンポジウム「ゲノム・環境・共生から微生物を見る」　2003/01/07

More details Close

招待講演
根粒菌の細胞内CtrAレベルの変化と共生能

伊藤尚文, 齋藤明広, 三井久幸, 南澤究

第25回日本分子生物学会　2002/12/11
根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoHの機能

佐藤善克, 三井久幸, 南澤究

第25回日本分子生物学会　2002/12/11
Diazotrophic microbial consortium in plant International-presentation

International Workshop Microbial Function in Revegetation Process of Degraded Terrestrial Environments; From Gene through to Ecosystem　2002/11/29

More details Close

招待講演
Detection of nifH expression in Herbaspirillum sp. B501gfp1 by RT-PCR International-presentation

You, M, Isawa, T, Minamisawa, K

International Workshop Microbial Function in Revegetation Process of Degraded Terrestrial Environments; From Gene through to Ecosystem　2002/11/29
土と植物をめぐる窒素固定微生物コミュニティ

第18回日本微生物生態学会　2002/11/15

More details Close

招待講演
ダイズ根粒菌リゾビトキシン生合成遺伝子の機能

南澤究, 岡崎伸, 菅原雅之, 三井久幸

第18回日本微生物生態学会　2002/11/15
根粒菌の共生窒素固定能とシグマ因子RpoH

三井久幸, 佐藤善克, 南澤究

第18回日本微生物生態学会　2002/11/15
ダイズ根粒菌の脱窒の多様性とN2O呼吸による増殖特性

鮫島玲子, 宮地良昭, 南澤究

第18回日本微生物生態学会　2002/11/15
炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的な遺伝子発現解析

板倉学, 大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 鈴木章弘, 下田宜司, 内海俊樹

第18回日本微生物生態学会　2002/11/15
ススキへの定着性の高い嫌気窒素固定コンソーシアムの選抜

斉藤朝美, 葉繽, 宮本拓也, 游牧, 南澤究

第18回日本微生物生態学会　2002/11/15
ミヤコグサ根粒菌の共生および飢餓条件下における網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, プラモッド・ダワデイ, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11
根粒菌のシグマ因子RpoHの機能

三井久幸, 佐藤善克, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11
異種エチレンレセプター導入ミヤコグサの根粒形成

貫井憲之, 江面浩, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11
Bradyrhizobium elkanii のリゾビトキシン生合成遺伝子rtxAの機能と制御

菅原雅之, 岡崎伸, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11
ダイズ根粒菌B. japonicumのType III分泌系の構造と機能

西澤博, 相沢慎一, 南澤究

植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11
ダイズ根粒菌の脱窒の多様性とN2O呼吸による増殖特性

鮫島玲子, 宮地良昭, 南澤究

日本土壌肥料学会東北支部大会　2002/09/02
Significance of symbitic microorganisms in re-vegetation process in lahar area of Mt. Pinatsubo. Transaction International-presentation

Saito, M, Minamisawa, K, Barraquio, W

17th World Congress of Soil Science　2002/08/14
Herbaspirillum属エンドファイトの定着と窒素固定

南澤究, 伊沢剛, 佐藤雅志

土壌微生物学会　2002/06/05
嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着

葉繽, 西岡きよ, 佐藤雅志, 南澤究

土壌微生物学会　2002/06/05
全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本土壌肥料学会　2002/04/02
Bradyrhizobium 属ダイズ根粒菌の系統による脱窒能の多様性

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会　2002/04/02
Bradyrhizobium elkanni のリゾビトキシン生合成系におけるrtxC 遺伝子の機能解析

岡崎伸, 菅原雅之, 南澤究

日本土壌肥料学会　2002/04/02
ススキ等の植物体内における偏性嫌気性窒素固定細菌の単離と分子系統解析

宮本拓也, 西岡きよ, 游牧, 南澤究

日本土壌肥料学会　2002/04/02
自然界における生物共生の意義と研究動向

日本農芸化学会シンポジウム「共生生物のバイオフロンティア」　2002/03/24

More details Close

招待講演
全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

日本農芸化学会　2002/03/24
根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoH

三井久幸, 伊藤尚文, 南澤究

日本農芸化学会　2002/03/24
共生・微好気・炭素飢餓条件におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

南澤究, 大和田琢二, 三井久幸, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司, 塩屋幸樹

第5回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2002/03/12
根粒菌のシグマ因子RpoHの解析

三井久幸, 伊藤尚文, 佐藤俊文, 南澤究

第24回日本分子生物学会　2001/12/09
野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの植物組織内定着

南澤究, 葉嬪, 西岡きよ, 佐藤雅志

第17回日本微生物生態学会　2001/11/09
野生イネ科植物から分離された嫌気窒素固定コンソーシアムの分子系統解析

游牧, 宮本拓也, 西岡きよ, 宮木太郎, 遊橋健一, 佐藤雅志, 南澤究

第17回日本微生物生態学会　2001/11/09
根粒菌のゲノム構造の比較

志田和人, 南澤究

かずさDNA研究所シンポジウム　2001/10/30
ミヤコグサ根粒菌のゲノム比較と根粒形成遺伝子誘導物質の同定に向けて

南澤究, 志田和人, 板倉学, Suwat Saengkerdsub, 三井久幸南澤, 究, 志田和人, 板倉学, Suwat Saengkerdsub, 三井久幸

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001/10/11
野生イネにおける窒素固定コンソーシアム

葉繽, 宮木太郎, 西岡きよ, 佐藤雅志, 南澤究

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001/10/11
イネより単離された窒素固定菌のイネ組織内定着性と窒素固定

伊沢剛, Adel Elbeltagy, 西岡きよ, 佐藤雅志, 葉繽, 比留間直也, 今田隆弘, 野田宗弘, 栗原庸輔, 金まどか, 三井久幸, 南澤究

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001/10/11
根粒菌のシグマ因子RpoHの機能

三井久幸, 伊藤尚文, 佐藤俊文, 南澤究

植物微生物研究会第11回研究交流会　2001/10/11
異種エチレンレセプターを導入したミヤコグサの根粒形成

貫井憲之, 江面浩, 南澤究

日本植物学会第65会大会シンポジウム「ミヤコグサ根粒形成の分子機構」　2001/09/25
Geographic and phylogenetic distribution of soybean bradyrhizobia harboring high copy numbers of RS-α, RS-βand IS 1631 International-presentation

Reiko Samesima, Tsuyoshi Isawa, Michael. J. Sadowsky, Toru Hamada, Arawan Shutsrirung, Kiwamu Minamisawa

9th International Symposium on Microbial Ecology　2001/08/26
Endophytic colonization and N2 fixation by diazotrophs isolated from wild gramineous plants International-presentation

NSF/JSPS Seminar, Symbiosis Between Plants and Microorganisms for Sustainable Agriculture and Bioremediation　2001/08/08
Effect of rhizobitoxine production on nodulation competitiveness by Bradyrhizobium elkanii International-presentation

NSF/JSPS Seminar, Symbiosis Between Plants and Microorganisms for Sustainable Agriculture and Bioremediation　2001/08/08
Rhizobitoxine biosynthetic genes in Bradyrhizobium elkanii International-presentation

Tsuyoshi Yasuta, Shin Okazaki, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

13th International Congress on Nitrogen Fixation　2001/07/02
Endophytic colonization and in planta-nitrogen fixation by Herbaspirillum sp. isolated from wild rice International-presentation

Adel Elbeltagy, Kiyo Nishioka, Tadashi Sato, Hisa Suzuki, Bin Ye, Toru Hamada, Tsuyoshi Isawa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

13th International Congress on Nitrogen Fixation　2001/07/02
The delay effect of rhizobitoxine production on nodulation competitiveness of Bradyrhizobium elkanii USDA94 in siratro International-presentation

Shin Okazaki, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

13th International Congress on Nitrogen Fixation　2001/07/02
フィリピン・ピナツボ火山泥流地帯の植生回復過程における共生微生物の役割

斎藤雅典, 大場広輔, 米山忠克, 宮木太郎, 南澤究, W. L. Barraquio

日本土壌微生物学会　2001/05/24
イネ科植物の窒素固定エンドファイトのポテンシャル

日本土壌肥料学会シンポジウム「共生窒素固定研究の展開と持続的食料生産」　2001/04/02

More details Close

招待講演
多コピーの挿入配列を保有するダイズ根粒菌HRS株の分子系統解析と嫌気条件暴露後の増殖特性

鮫島玲子, 南澤究

日本土壌肥料学会　2001/04/02
ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkanni のリゾビトキシン遺伝子及び生合成系の解明

安田剛, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会　2001/04/02
リゾビトキシンの根粒形成促進効果は根粒着生過程の途中から現れる

岡崎伸, 江面浩, 遊橋健一, 南澤究

日本土壌肥料学会　2001/04/02
Conflict and genome evolution between rhizobia and legumes: Mysterious roles of rhizobial T3SS effectors in symbiosis Invited

2022/01/12
土壌から発生するN2O削減をめざす市民科学プロジェクト〜地球冷却微生物を探せ〜

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 菊地美穂, 南澤究

2021年度日本土壌肥料学会東北支部大会　2021/12/01
微生物による地球冷却ー農地からの温室効果ガス削減を目指してー Invited

南澤究

植物科学シンポジウム2021「植物科学からグリーンイノベーションへ」　2021/11/30
窒素循環を担う環境微生物ネットワークと温室効果ガス削減 Invited

南澤究

産総研シンポジウム「窒素循環における課題とその解決にむけて」　2021/11/08

Show all Show first 5

Industrial Property Rights 5

植物へ遺伝子を導入する効率が向上したアグロバクテリウム菌およびその作製方法

江面浩, 南澤究, 野中聡子, 菅原雅之

特許第4534034号

Property Type: Patent
リゾビトキシン生産遺伝子rtxC

南澤究, 安田剛

Property Type: Patent
微生物資材および植物の栽培方法、並びに、細菌株

南澤究、原沙和

Property Type: Patent
植物の生育促進剤

岡崎和之, 池田成志, 高橋宙之, 田口和憲, 黒田洋輔, 関口博之, 南澤究, 鶴丸博人, 橋本萌, 大和田琢二

Property Type: Patent
Ｎ２Ｏ還元能が強化された根粒菌及びＮ２Ｏの除去方法

南澤究, 板倉学, クリスティーナ, サンチェスゴメス, 吉川博文

Property Type: Patent

Research Projects 58

地球環境再生に向けた持続可能な資源循を実現／資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減

南澤究

Offer Organization: 国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構

System: ムーンショット型研究開発事業

2020/08 - 2025/03
Environmentally sustainable agriculture by elucidating the molecular mechanisms bridging plants and communities that build agroecosystems

Watanabe Masao

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Institution: Tohoku University

2019/06/28 - 2022/03/31

More details Close

The number of seeds sown per unit area was varied in eight steps from sparse to dense. The growth was not better under the sparsest dry matter weight per seedling, but was better when the density was about two levels higher than other conditions. This effect was named the "friend effect." As causes and consequences of this "friend effect," we investigated metal ions in the soil, rhizosphere microorganisms, and genes expressed in plants. There were no characteristic changes in expressed genes and metal ions linked to the cultivation density. On the other hand, there were changes in rhizosphere microflora, and we determined that it was important to examine rhizosphere microflora changes in more detail. Similar studies were also investigated from historical documents and other sources. However, no pertinent results were obtained.
Co-evolution between bradyrhizobia and plants: Experimental evolution of rhizobia and endophytes

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2018/04 - 2022/03
農耕地からの一酸化二窒素ガス発生を削減し作物の増収・減農薬を実現する革新的微生物資材の開発

Offer Organization: 農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構／NARO) 生物系特定産業技術研究支援センター(BRAIN)

System: イノベーション創出強化研究推進事業応用研究ステージ

Institution: 東北大学

2018/06 - 2021/03
GRAS-Di技術を活用した根粒菌の識別マーカーの開発

Offer Organization: トヨタ自動車株式会社アグリバイオ事業部

System: 共同研究

Institution: 東北大学

2019/08 - 2020/03
低エネルギー生産を目指した根圏における植物と微生物の共生解析

Offer Organization: コンポン研究所

System: 共同研究

Institution: 東北大学

2012/09 - 2020/03
土壌団粒化剤等による東北大学圃場土の性状及びダイズ生育等に対する影響の解析研究

Offer Organization: 花王株式会社

System: 共同研究

Institution: 東北大学

2016/08 - 2019/05
栽培履歴の異なる圃場におけるダイズ微生物相の解析

Offer Organization: トヨタ自動車株式会社アグリバイオ事業部

System: 共同研究

Institution: 東北大学

2017/06 - 2019/03
地圏共生遺伝生態研究助成金

Offer Organization: 十勝農業協同組合連合会

2016/08 - 2019/03
ソルガムの窒素固定と共生微生物

Offer Organization: アースノート

System: 共同研究

Institution: 東北大学

2016/05 - 2019/03
農耕地からの一酸化二窒素ガス発生を削減し作物生産性を向上する微生物資材の開発

Offer Organization: 農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業

System: 実用技術開発ステージ現場ニーズ対応型Ａタイプ

2015/07 - 2018/03
Study of lanthanides-dependent methylotrophic growth of microbe-plant symbiosis in phyllosphere and rhizosphere.

Mitsui Ryoji, TANAKA Mitsuo, NAKAGAWA Tomoyuki, TANI Akio, MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Institution: Okayama University of Science

2014/04 - 2017/03

More details Close

This study, which focused on the large quantity of methanol produced by the demethylation of plant pectin present in the primary cell wall, showed that methanol is emitted as one of the plant root exudates. This methanol may contribute to the formation of specialized microbial communities in the phyllosphere and rhizosphere. Methylotrophic bacterium Methylobacterium spp, which were detected at high frequencies on leaves , and nodule formation and nitrogen fixation bacterium, Bradyrhizobium spp., possess lantanoides-dependent methanol dehydrogenase. The results in this study suggested that lantanide-dependent methanol dehydrogenase contributed not only to methylotorophic growth but to recognition of habitant environment for microbe-plant symbiosis.
Mechanisms of symbiotic evolution and N2O mitigation of soybean bradyrhizobia

Minamisawa Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: Tohoku University

2014/04 - 2017/03

More details Close

Rj2 restricts nodulation by specific rhizobial strains including Bradyrhizobium diazoefficiens USDA122. We identified a T3SS effector gene that induces the incompatibility to Rj2-soybeans. These results suggested that hosts monitor the rhizobial T3SS effector during infection and reject nodulation via host R protein. B. diazoefficiens is able to scavenge the greenhouse gas N2O through the N2O reductase. Comparative analysis of Nos(++) mutant genomes showed that nasS mutation of resulted in Nos(++) phenotype. nasS mutation induced nosZ via NasT. NO3(-) addition dissociated the NasS-NasT complex in vitro, suggesting the release of the activator NasT. Disruption of nasT led to a marked decrease in nosZ transcription. Thus NasST regulates the NO3(-) -mediated response of nosZ gene. EMSA analysis suggested that nos expression is subjected to antitermination on both H1 and H2 hairpins upstream of nosR.
N2O emission from rhizosphere by fungi

Minamisawa Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Institution: Tohoku University

2014/04 - 2016/03

More details Close

Nitrous oxide (N2O) is a key atmospheric greenhouse gas that affects global warming and the destruction of stratospheric ozone. Legume field is one of major sources of N2O emission from degraded root nodules. However, soil microorganisms emitting N2O other than bradyrhiozbial endosymbionts in the rhizosphere remain unknown. N2O isotopomer analysis is useful tool to discriminate fungal and bacterial N2O emissions. Generally, the site preference values of N2O (N2O-SP) produced by fungal denitrification are higher than those of bacterial denitrification. The addition of nitrite instead of nitrate to soybean nodulated roots significantly increased N2O-SP. Moreover, the mutation of nirK gene (encoding dissimilatory nitrite reductase) in symbiotic bradyrhizobia significantly increased N2O-SP in the presence of nitrite. These results indicate that nitrite-utilizing N2O emission via fungal denitrification occurred in the rhizosphere.
ダイズの共生微生物相と共生系制御システムの解明による持続的生産技術の開発

Offer Organization: 農林水産省農林水産技術会議事務局

System: 「次世代ゲノム基盤プロジェクト」大豆及び畑作物の有用遺伝子の同定とＤＮＡマーカーの開発

Institution: 東北大学

2013/06 - 2015/03
植物共生微生物の有用機能に関する生化学的・分子生物学的な機能解析

Offer Organization: 農林水産省

System: 委託プロジェクト研究「気候変動に対応した循環型食料生産等の確立のための技術開発」

2011/06 - 2014/03
Material cycling in plant-associated bacteria by metagenome analysis

MINAMISAWA Kiwamu, SHINANO Takuro, IKEDA Seishi, YAMASHITA Akifumi

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: Tohoku University

2011/04 - 2014/03

More details Close

We investigated bacterial communities in paddy rice with low (LN), standard (SN) levels of N fertilizer application. Metagenome analysis suggested shifts of bacterial communities between LN and SN root microbiomes. The abundances of functional genes for methane oxidation were significantly increased in LN root microbiome. Plants have mutualistic symbiotic relationships with microorganisms by CCaMK. We examined the effect of an OsCCaMK mutant (NE1115). The CH4 flux of NE1115 in the LN field was significantly higher than that of WT, although no difference was observed in the SN field. qPCR and 13C/15N isotopic determinations suggested that CH4 oxidation and N2 fixation were simultaneously activated in the root of WT rice in the LN field, and both processes are likely controlled by OsCCaMK. Metaproteome and CARD-FISH analyses demonstrated that both processes are mediated by type II methanotrophs inhabiting the vascular bundles and epidermal cells of the rice roots.
温室効果ガス低減を目指したダイズ根粒菌N20還元過程遺伝子群の制御機構の解明

南澤究, SANCHEZGOMEZ Cristina

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業

Category: 特別研究員奨励費

Institution: 東北大学

2012 - 2014

More details Close

N2Oは強力な温室効果ガスであると共に、オゾン層破壊の原因物質でもある。植物根圏はN2O発生源の一つであり、私たちのグループはDNA校正機能を低下させたダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumから、突然変異によりN2O還元酵素(N2OR)活性の上昇したNos強化株を作出し、N2O削減効果を実証してきた。しかし、Nos強化株におけるN2OR活性上昇の原因は不明であったため、本研究ではその原因解明を行ってきた。昨年度まで、(1)bll4572(nasS)遺伝子の変異がNos強化株におけるN2OR活性上昇の原因であること、(2)本遺伝子はB. japonicumの脱窒系においてnosZだけでなくnapAの転写制御に関与している新規転写制御因子であること、(3)NasTタンパク質による根粒菌脱窒の遺伝子発現促進をnasS産物が負に制御することが明らかとなった。本年度は、まずnasST介在nosZ遺伝子発現誘導の硝酸濃度プロファイル解析を行った。種々の濃度の硝酸および亜硝酸添加条件下のnosZおよびnapEの遺伝子発現の比較を行ったところ、細胞レベルのNasSTシステムの硝酸感受の臨界濃度は、50uM付近であり、ダイズ根圏における硝酸濃度より高いことが分かった。したがって、植物根圏において、NasS変異によりN2O還元酵素活性を上昇させられる科学的根拠が明らかとなった。また、次世代シーケンサーを用いたnasST変異体の網羅的な遺伝子発現解析の準備を行った。具体的には、野生株およびnasS変異株を好気条件で培養した細胞からRNAを抽出後、cDNAを作成し、次世代シーケンサーのRNA-seqによる発現解析系を確立した。
微生物を利用した農耕地からの一酸化二窒素ガス発生削減技術の開発

Offer Organization: 農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構／NARO) 生物系特定産業技術研究支援センター(BRAIN)

System: イノベーション創出基礎的研究推進事業発展型研究一般枠Aタイプ

Institution: 東北大学

2012 - 2014
エンドファイト−イネの共生相互作用の解明

Offer Organization: 農林水産省農林水産技術会議事務局

System: ｢新農業展開ゲノムプロジェクト」イネと微生物の遺伝子ネットワークの解明

Institution: 東北大学

2008/04 - 2013/03
Global systems of symbiotic nitrogen-fixing bradyrhizobia by comparative genomics of phylogenetic super-neighbors

MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Institution: Tohoku University

2011 - 2013

More details Close

Global systems of symbiotic nitrogen-fixing bradyrhizobia were conducted by comparative genomics of phylogenetic super-neighbors of the bacteria. Soil-dwelling Bradyrhizobium sp. strain S23321 lacked symbiosis island with high genomic co-linearity with B. japonicum USDA110, suggesting an ancestral-type genome of symbiotic bradyrhizobia. On the other hand, the genome analysis suggested soil-dwelling Agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of Aechynomeny indica. Indeed, all texted strains of A. oligotrophica are able to nodulate A. indica with symbiotic nitrogen fixation. In addition, the rhcJ and ttsI mutants of B. japonicum for the type III protein secretion system (T3SS) gained the ability to nodulate Rj2 soybean, suggesting the effectors secreted via T3SS trigger incompatibility between these two partners.
メタン酸化窒素固定細菌による水田メタン発生の低減化

Offer Organization: JST(科学技術振興機構)戦略的創造研究推進事業)

System: 先端的低炭素化技術開発(ALCA) 探索ステージ

Institution: 東北大学

2011/10 - 2012/09
Development of comparative metagenomics for soil microbiome analysis

SENOO Keishi, OHTA Hiroyuki, HATTORI Masahira, SHINANO Takuro, MINAMISAWA Kiwamu, OTSUKA Shigeto, HASHIMOTO Tomoyoshi, YOH Muneoki

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: The University of Tokyo

2010 - 2012

More details Close

We tried to uncover the structure and function of microbial communities in soil ecosystem through soil metagenomics using the new DNA-sequencing technology. Novel microbial communities responsible for reduction reaction and nitrogen transformation in rice paddy soil were revealed. The resilience of soil microbial community to the volcanic eruption impact was revealed and the detailed picture of soil microbial genetic response to the long-term application of livestock liquid manure was obtained.
Comparative genomics of Bradyrhizobia toward uncovering relationshipbetween the genetic elements and the biological effects in soybean symbiosis

KANEKO Takakazu, SATO Shusei, MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Kyoto Sangyo University

2009 - 2012

More details Close

The nucleotide sequences of the genomes of four Bradyrhizobial strains were determined.Comparison of their genome structures, especially constitution of the genomic islands,was explored based on the genomic information. A significantly high level of sequenceconservation was detected in symbiosis islands on USDA110 and USDA6 genomes. Diversityof the symbiosis islands of B.japonicum and B.elkanii represented some differentsymbiotic aspects between them.
Sustainable biomass production by microbial symbiosis and its bioco nversion in Southeast Asia

MUROOKA Yoshikatsu, MINAMISAWA Kiwamu, ABE Mikiko, HISAMATSU Makoto, YAMADA Takashi, YAMASHITA Mitsuo, NANTAKORN Boonkerd, NEUNG Teaumroong, NAZALAN Najimudin, NGUEN Huuhiep, HARUMASTINI Sukiman, BAYANIM Espiritsu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Hiroshima Institute of Technology

2008 - 2011

More details Close

In Southeast Asia, many species of microorganisms co-grow with plants by symbiotic system. W e selected such excellent microbes and applied to use in cultivation of plants and crops by collaboratio n with scientists from Japan, Thai land, Malaysia, Indonesia, Philippine s and Vietnam. These microbial symbioses resulted in increasing the sustainable productions of food s, cellulosic biomass resource and P al m/Jatropha oils with minimal use of chemical fe rtilizer. Here, we propose that peoples facilitate to use such symbiotic microbes in sustainable production of foods and biomass resources.
機能微生物ゲノミクスによる農耕地からの亜酸化窒素ガス低減化

Offer Organization: 農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構／NARO) 生物系特定産業技術研究支援センター(BRAIN)

System: 新技術・新分野創出のための基礎研究推進事業一般型

Institution: 東北大学

2007 - 2011
植物・微生物間共生におけるゲノム相互作用

Offer Organization: JST科学技術戦略推進費（旧：科学技術振興調整費）

System: 科学技術連携施策群の効果的・効率的な推進食料・生物生産研究

Institution: 東北大学

2007 - 2010/03
Innovative genomics and metagenomics of environmental bacteria able to degrade organic pollutants

TSUDA Masataka, FUKUDA Masao, FUJII Takeshi, MINAMISAWA Kiwamu, OGAWA Naoto, MIYAZAKI Kentaro

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Institution: Tohoku University

2005 - 2009

More details Close

Environmental bacteria able to degrade various recalcitrant and xenobiotic compounds play important roles in the removal of organic pollutants. To know the survival and proliferation strategies of such bacteria in their native niche, the genetic loci very important in the survival and specifically induced in the soil environment were identified at the genomic levels using two phylogentically distant strains. Metagenomic analysis was also conducted to clarify the mode how the bacterial population in the soil responded to the exposure of organic pollutants.
Comprehensive analysis of interactions between plants and microbes

TABATA Satoshi, KAWATUCHI Masayoshi, SAEKI Kazuhiko, MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Institution: Kazusa DNA Research Institute

2005 - 2009

More details Close

Molecular mechanisms of symbiotic nitrogen-fixation between legumes and rhizobia have been investigated by molecular-genetics and genomics approaches. Genes that are essential or related to the establishment of symbiosis, nodule formation and its regulation, and nitrogen fixation were isolated, and their functions were identified.
Eco-genomics of microbial denitrification in agricultural fields : N_2O paradox in rhizobial symbiosis with legumes and soil community genomics

MINAMISAWA Kiwamu, KEISHI Senoo

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2005 - 2008
嫌気窒素固定コンソーシアムの植物分布と機能発現-植物の窒素固定と塩ストレス耐性に寄与するエンドファイト共同体の解析-

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業萌芽研究

Category: 萌芽研究

Institution: 東北大学

2005 - 2007

More details Close

本研究は、申請者らが細菌エンドファイトの機能的なコミュニテイーとして発見した「嫌気窒素固定コンソーシアム」を対象として、その植物や作物への広がり、植物体内における機能、エンドファイト間の相互作用の解明などを目指した研究である。昨年度に実施した、多数の野生植物や作物由来のClostridium属細菌の系統解析をについてさらに情報学的な検討を加え論文発表を行った。特に、植物由来のcluster XIVaに属するClostridium属細菌と、その他の分離源由来のcluster XIVaに属するClostridium属細菌について、従来は分離株のみを対象としていた。本年度はさらに培養に依存しないデータベース中のDNA配列情報についても検索し、それらを加えて再解析を行った。その結果、植物由来のClostridium属分離株は、やはり系統学的に2ケ所(groupIおよびII)に集中し、高いbootstrap値で他の分離源(ルーメン、腸内、糞便、シロアリなど)のClostridium属分菌株と区別されることが証明された。また、圃場で栽培されているダイズの茎から微生物画分を濃縮し、細菌の16S rRNA遺伝子のユニバーサルプライマーを用いて、クローンライブラリー法で細菌群集構造の解析を行った。その結果、低頻度ではあるがダイズ茎にもClostridium属細菌の16S rRNA遺伝子が検出された。したがって、一見好気的環境であるダイズの茎にもClostridium属細菌が生息していることが明らかとなった。植物接種実験による窒素固定機能共同体としての実験も行ったが、植物個体への定着安定化が難しく、その解明は進まなかった。尚、2006年に本研究成果をまとめた「嫌気窒素固定コンソーシアム」の機能を明らかにした欧文誌の論文が日本微生物生態学会論文賞を平成19年度に受賞した。
Diversity and finction of endophytes in plants Competitive

System: Special Coordination Funds for Promoting Science and Technology

2006/04 -
Development of super-Agrobacterium for the efficient production of transgenic plants in Cucurbitacae

EZURA Hiroshi, MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: University of Tsukuba

2003 - 2006

More details Close

The objectives of the research were 1) to elucidate the plant-Agrobacterium interaction through ethylene signaling pathway and 2) to apply the knowledge on molecular breeding of Agrobacterium which shows higher ability of gene transfer to Cucurbitacae plants. The followings are the major results obtained. 1. We observed that ethylene itself did not inhibit Agrobacterium cell growth whereas plants responding to ethylene, that inhibiting the vir gene expression in Agrobacterium on the plant cells. It is likely that the inhibitory effect is caused by materials which are induced/depressed by ethylene in the plant cells. These results allow us to speculate that we can develop super-Agrobacterium which shows higher ability of gene transfer by providing the ability to inhibit ethylene biosynthesis in plant cells. 2. Rhizobitoxine is an ethylene biosynthesis inhibitor produced by soybean root nodule bacteria (Bradyrhizobium elkanii), and reduces ethylene production from the host plants. rtxACDEFG genes from B. elkanii and OAH synthase gene from Mesorhizobium loti were introduced to Agrobacterium tumefaciens C58 strain, and the genetically engineered Agrobaterium produced rhizobitoxine. ACC deaminase is an enzyme produced by symbiotic bacteria, and degrade ACC which results in inhibition of ethylene biosynthesis in plants. ACC deaminase gene from Pseudomonas strain was introduced to A. tumefaciens C58 strain, and the genetically engineered Agrobacterium showed ACC deaminase activity. 3. The genetically modified Agrobacterium producing either rhizobitoxineor ACC deaminase showed higher ability of gene transfer to melon. In addition, the Agrobacterium producing ACC deaminase also showed higher ability of gene transfer to Arabidopsis. In conclusion, we are succeeded in molecular breeding to production of so-called super-Agrobacterium which shows higher ability of gene transfer into plant cells without inhibition of vir gene expression.
Experimental study for the establishment of on-farm conservation system in wild rice resources.

SATO Tadashi, MINAMISAWA Kiwamu, ISHIKAWA Ryuji, NAKAMURA Ikuo, SATO Yoichiro, ISHII Takashige

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2003 - 2005

More details Close

Research travels concerning wild rice habitats and cultivated rice fields were made 10 times from 2003 to 2006, as follows. Akimoto M., Sato T., Nakamura and Ishii T. made wild rice survey on 18 sites in Laos and Cambodia from November 4 to 12, 2003. Ishikawa R. and Nakamura I. made wild rice survey on 19 sites in the northern Myanmar from November 13 to 27, 2003. Akimoto M., Sato T. and Ishii T. made the preliminary wild rice survey on 42 sites in southern Myanmar from November 13 to 27, 2003. Sato Y-I. made the survey on a on-farm conservation site of wild rice in Laos from February 10 to 16, 2004. Sato T. made the survey on a on-farm conservation site of wild rice in Laos from February 29 to March 7, 2004. Akimoto M., Shishido R. and Ishii T. made wild rice survey on 7 sites of in southern Myanmar from November 13 to 27, 2004. Ishikawa R., Nakamura I. Sato Y-I. and Ueno K. made the preliminary wild rice survey on 7 sites in Kalimantan, Indonesia from November 23 to December 6, 2004. Ishikawa R., Sato T. and Nakamura I. made wild rice survey on 12 sites in Laos, Cambodia and Thailand from March 5 to 16, 2005. Akimoto M., Shishido R. and Ishii T. made the wild rice survey on 6 sites in southern Myanmar from November 1 to 11, 2005. Ishikawa R., Sato T. and Nakamura I. made wild rice survey on 21 sites in Laos, Cambodia and Indonesia from January 7 to 18, 2006. The reports concerning these wild rice survey are shown as follows.
野生イネへの窒素固定エンドファイトの内生および窒素固定活性に関するQTL解析

佐藤雅志, 南澤究, 東谷篤志, 石井尊生

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業萌芽研究

Category: 萌芽研究

Institution: 東北大学

2003 - 2005

More details Close

この研究の目的は、野生イネと栽培イネとの交雑後代自殖系統集団を用い、野生イネ組織内から単離された窒素固定能を持つエンドファイトの野生イネ組織内への感染、コロニー形成、窒素固定活性を支配している遺伝子の数および座位を、量的遺伝子座(QTL)解析法を用いて解明することである。佐藤は、窒素固定活性を支配するQTLの解析にそなえて最適の交雑自殖後代系統集団を選ぶために、野生イネ系統および栽培イネ系統に内生させたHerbaspirillum sp.B501の窒素固定酵素ニトロゲナーゼを構成する遺伝子nifHの発現およびアセチレン還元活性を再調査した。その結果、栽培イネ系統および野生イネ系統間にアセチレン還元活性の統計的な崔を再現することができなかった。南澤は、野生イネ系統に内生させたHerbaspirillum sp.B501のnifHの発現を調べ、明期に発現の上昇かあり暗期には発現の低下が認められることを見出した。このnifH発現の明暗サイクルについては国際誌に発表した。東谷は、栽培イネKasalathから単離された接種菌以外の細菌を16srRNAの塩基配列により同定した結果、イネのエンドファイトとしては初めて検出されたStenotrophomonas maltophiliaであることが見出された。石井は、これまでと同様に栽培イネと野生イネとの戻し交雑後代(O.sativa Nipponbare///O.rufupogon W630/Nipponbare//Nipponbare, O.sativa IR36///O.rufupogon W630/IR36//IR36, Nipponbare///O.meridionalis W1627/Nipponbare//Nipponbare, IR36///O.meridionalis W1627/IR36//IR36)BC2由来のQTL解析集団の作出を引き続きすすめた。作出された集団に関してはDNAマーカーを用いて遺伝子型データベースの構築をすすめた。
Genomic ecology of bradyrhizobia for denitrification systems to repress N_2O evolution

MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2002 - 2004

More details Close

Denitrification is anaerobic respiration using nitrate (NO_3^-), nitrite (NO_2^-), nitric oxide (NO), and nitrous oxide (N_2O) as terminal electron acceptors. Nitrous oxide (N_2O) is a key atmospheric greenhouse gas that contributes to global climatic change through radiative warming and depletion of stratospheric ozone. Agricultural lands are one of major sources, and significantly contribute the net increase in atmospheric N_2O. We used N_2, which has a natural abundance of ^<15>N (0.366 atom%), as a carrier gas in a gas chromatograph with a thermal conductivity detector to detect ^<15>N-N_2 quantitatively. When Bradyrhizobium japonicum USDA110 was cultured anaerobically in medium containing ^<15>N-NO_3, ^<15>N-N_2 was detected stoichiometrically. Analysis of 63 bradyrhizobial isolates revealed that denitrification ability varied with field site. To examine whether nos gene cluster of Bradyrhizobium japonicum is responsible for N_2O reduction in symbiosis, we constructed a nosZ deletion mutant of B.japonicum USDA110. The activity of N_2O reductase was determined by N_2O uptake and conversion of ^<15>N_2O into ^<15>N_2. Free-living cells of USDA110 showed N_2O reductase activity, while nosZ mutant did not. Complementation of cosmids containing nos gene cluster of B.japonicum USDA 110 to the nosZ mutant restored the N_2O rductase activity, indicating nosZ-dependent N_2O reductase activity and validity of the mutant. When the detached soybean nodules formed with wild-type USDA110 was fed with ^<15>N_2O, the nodules rapidly emitted ^<15>N_2 outside at a ratio of approximately 98.5% of ^<15>N-N_2O uptake. On the other hand, nosZ mutant-inoculated nodules did not mediate the conversion of ^<15>N_2O to ^<15>N_2 at all. Moreover, substantial decrease of N_2O concentration was detected in the rhizosphere of intact soybean plant inoculated with wild-type USDA110. These results demonstrate that the conversion of N_2O to N_2 depends exclusively to the function of nos gene cluster, and soybeans nodulated with B.japonicum carrying nos cluster are able to remove N_2O gas in rhizosphere environments
Sustainable Food Production and Environmental Preservation by Nitrogen-Fixing Symbionts in Southeast Asia

HAYASHI Makoto, MINAMISAWA Kiwamu, YAMADA Takashi, OZAWA Takashi, ABE Mikiko, TAJIMA Shigeyuki

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: Osaka University

2001 - 2004

More details Close

For sustainable food production and environmental preservation in Southeast Asia, we surveyed/researched fields there, focusing on symbiotic systems of leguminous plants, their rhizobia, and mycorrhiza. We also conducted yearly project meetings, (Philippines/2001, Malaysia/2002, Vietnam/2003, and Indonesia/2004) with specialists from eight Japanese universities including Osaka U., Tohoku U., U. of Tokyo, Hiroshima U., Kagosima U., Kagawa U., Osaka Prefecture U., and Niigata U., and leading scientists from Thailand, Malaysia, Indonesia, the Philippines, and Vietnam ;. At each meeting, we presented our field and laboratory research data in seminars opened to scientists/students in Southeast Asian countries, with 35 to 70 persons in attendance. Our major findings for this 4 year project include : a)Acid-and salt-tolerant rhizobia isolated in Thailand, the Philippines, and Indonesian soils can be utilized for bean production in the acidic soils of Southeast Asia ; soybeans, peanuts, and snap beans. Inoculation of nitrogen-fixing rhizobia increased bean yield significantly. Now, inoculated rhizobia are sold at low cost and/or supplied free to farmers in the above countries. b)Microorganisms stimulating plant growth were isolated in Malaysia, the Philippines, and Vietnam soils. These microorganisms, including phosphate-solubilizing bacteria, nitrogen-fixing microorganisms, cyanobacteria, and Azospririllum, increased crop yields, fruit production, and the protein content in seeds. c)In Thailand, more than 10% deforestation occurred in the past 10 years ; a serious problem for other Southeast Asian countries too. For reforestation, nitrogen-fixing rhizobia and mycorrhiza were isolated in the rhizosphere. These isolates stimulated growth in leguminous/non-leguminous trees in nutrient poor soil, and are now being used at the nursery stage for forests in Indonesia and Thailand. d)A Japanese group isolated diazotrophic endophytes from gramineous plants and investigated their colonization and nitrogen fixation. These bacteria made significant contributions to the supply of nitrogen sources, allowing for rice production without chemical fertilizers.
全ゲノム塩基配列情報に基づく根粒菌の共生機構の解明

南澤究, 横山正, 田島茂行, 佐伯和彦, 永田裕二, 大和田琢二

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業基盤研究(C)

Category: 基盤研究(C)

Institution: 東北大学

2003 - 2003

More details Close

本調査の目的は、根粒菌とマメ科植物の共生機構および生態を根粒菌ポストゲノム解析により明らかにする総合的な戦略を練り、食糧生産および環境保全に資する共生科学を創成することにある。8月12-13日に仙台において、ワークショップ「根粒菌のポストゲノム研究の展開」を開催し、数回の打合せ行い、以下のような項目について調査を行った。 1)モデルマメ科植物分子遺伝解析に対応したミヤコグサ根粒菌の戦略の検討:根粒菌の遺伝子が宿主植物側の共生受容系や防御応答系とどのような相互作用を通じて共生成立に至るのかという点を、モデルマメ科植物ミヤコグサの分子遺伝解析タイアップしながら進行させる必要がある。既に共同研究として論文発表した網羅的な遺伝子発現解析・破壊株の共生特性の解析以外に、CalcofluorやTn-phoA変異などの根粒菌の細胞膜構造、分泌タンパク、多糖生産の変異株が、相互作用機構解明に適したアプローチ方法であると結論された。 2)ダイズ根粒菌のアレイ解析・ライブラリー構築利用の基本戦略の策定:ミヤコグサ根粒菌と同様に整列化コスミッドライブラリーが、品種特異的共生因子の同定に有効であると判断された。また、ミヤコグサ根粒菌で使用したマクロアレイ系のダイズ根粒菌への適用は、クローンの選択・RNA抽出方法などの改善が必要であると考えられた。 3)食糧生産および環境保全への応用:根粒菌ゲノム情報から難分解物質分解系遺伝子、脱窒遺伝子群は、根粒菌接種に環境保全への付加価値をつけ、また機能性遺伝子導入根粒菌による共生環境修復への発展性が期待された。また、グリシンベタインによる浸透圧(塩)耐性、乾燥耐性は、応用研究に有効であると考えられた。野外利用はセルフクローニング系が有望であった。 4)クローン管理およびデータベース構築:データベース構築・公開は大阪大学で、クローン管理は東北大学と東京農工大学で共同で行うこととした。
Identification and characterizatioon of mobile genetic elements carrying xenobiotics-degrading genes from soil bacteria

TSUDA Masataka, MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2000 - 2003

More details Close

ABSTRACT Various xenobiotics-degrading activities of soil bacteria are often encoded by mobile genetic elements such as plasmids and transposons, and this property allows the rapid dissemination and dynamic properties of the degradation genes in the environmental bacterial strains. The aim of this study is the identification and entrapment of such mobile elements and their detailed characterization. 1.A broad-host-range plasmid, pUO1, carries two haloacetate dehalogenase genes, dehH1, and dehH2. The latter gene was located in an IS1071-composite transposon, TnHad1, and dehH1 and TnHad1 transposon were located in a Tn21-type transposon, TnHad2. The terminal nucleotide sequences essential for the TnHad2 transposition was further clarified. 2.Transposition of toluene transposon Tn4651 requires the site-specific resolution between the duplicated copies of Tn4651 on the same molecule. This reaction was mediated at a defined res site in the presence of TnpS, and TnpT greatly enhanced the resolution frequency. TnpS also showed the site-specific integration activity without the involvement of TnpT. The Tn465l-type resolution systems were widely distributed among various soil bacterial strains. 3.The toluene-degrading gene cluster on plasmid pWW53 was located on an 80-kb transposon, Tn4657. A 41-kb region of Tn4657 containing the pWW53-specified replication genes was flanked by two copies of the res sites in an inverted configuration. The Tn4657 TnpR-mediated site-specific inversion between the two res sites generated another toluene transposon, Tn4656. 4.A naphthalene transposon Tn4655 carried several remnant segments of different transposons, suggesting that the present structure of Tn4655 was formed by repeated insertion of several transposons and their subsequent rearrangements. The Tn4655 TnpR protein also had the site-specific integration activity. 5.A soil bacterial strain was constructed that carried a chromosomal copy of the Tn4655 derivative defective in one gene for the naphthalene degradation. Use of this strain as a recipient in the conjugation experiments with soil samples gave rise to the transconjugants able to degrade naphthalene. The transconjugants contained broad-host-range plasmids that carried the genes for the degradation of naphthalene.
共生微生物等を利用した荒廃土壌の修復技術の開発

Offer Organization: 農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構／NARO) 生物系特定産業技術研究支援センター(BRAIN)

System: 新技術・新分野創出のための基礎研究推進事業一般型

Institution: 東北大学

1999 - 2003
Functional analysis of nitrogen-fixing endophytes in wild and gramineous plants Competitive

2000/04 - 2002
Enhancement technology of bacterial infection by rhizobitoxine

MINAMISAWA Kiwamu, YUHASI Ken-ichi, EZURA Hiroshi

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

1999 - 2002

More details Close

We have investigated rhizobitoxine biosynthetic pathway and the function in Bradyrhizobium elkanii. In addition, we examined whether the ability to produce rhizobitoxine may improve rhizobial symbiosis and Agrobacterium-mediated transformation. DNA sequence and mutational analysis of rhizobitoxine biosynthetic genes revealed that at least rtxA and rtxC are requiered for rhizobitoxine biosynthesis in Bradyrhizobium elkanii. Application of ethylene precursor and inhibitors for ethylene biosynthesis and perception suggested that an ethylene-mediated signaling pathway is involved in the nodulation process even in the determinate nodulators including Lotus japonicus and Macroptilium atropurpureum. Rhizobitoxine competitively inhibited 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase in ethylene biosynthetic pathway of host plants, and enhanced nodulation and competitiveness of B. elkanii on M. atropurpureum. Interestingly, Rhizobitoxine enhancement of competitive nodulation occurred at a late stage in the time-course of nodulation. We have been trying to confer the ability to produce rhizobitoxine of B. elkanii into other gram-negative bacteria by plasmids carrying rtxAC.
Genome rearrangements of indigenous soybean bradyrhizobia and their ecological significance

MINAMISAWA Kiwamu, TSUDA Masataka, MITSUI Hisayuki

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

1998 - 2001

More details Close

In order to understand the generation and ecological roles of Bradyrhizobium japonicum HRS strains possessing high copy numbers of insertion sequences (IS), we have investigated (1) geographical and phylogenetic distributions of HRS strains, (2) their excellent features in field ecosystem, (3) their genome rearrangements, and (4) horizontal transfer of nodulation (nod) gene from HRS strains. We found a correlation among the IS copy number, phylogenetic position, serogroup and growth rate of HRS strains, which are derived from USA, China and Japan. Nodule occupancy of HRS strains increased in a water-logged soil condition. Moreover, HRS strains showed stress resistance. The nif gene cluster of HRS strain were subjected to DNA rearrangement probably by IS elements. We have observed horizontal transfer of nod genes from B. japonicum HRS strain to B. elkanii USDA94 mutant lacking common nod genes as a recipient. In this project, we could show the ecological and genetic features of B. japonicum HRS strains.
Study on Genetic Ecology of Bradyrhizobium and Rhizobium Competitive

2000/04 -
種子伝達性窒素固定イネエンドファイトの探索

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業萌芽的研究

Category: 萌芽的研究

Institution: 東北大学

1999 - 2000

More details Close

前年度、野生イネおよび栽培イネの種子および茎から、改変Rennie(RMR)培地を用いてアセチレン還元活性を示す窒素固定菌を多数単離し、16S rRNA遺伝子に基づく分子系統解析を行ったところ、Herbaspirillum属、Ideoonella属、Enterobacter属、Azospirillum属細菌の窒素固定菌が分離された。窒素固定エンドファイトとして報告のあるHerbaspirillum属が野生イネ種子および茎から分離されたので、Herbaspirillum属をGFP標識を行い、分離されたイネの組織定着性を検討した。幼植物段階では、いずれも10^7-10^9オーダーの接種菌が定着していた。電子顕微鏡や蛍光顕微鏡による観察でも、地上部の細胞間隙に接種菌がコロナイズしていた。Herbaspirillum菌を接種したイネ幼植物のアセチレン還元活性(窒素固定活性)は、菌株により異なっていた。種子から分離されたGFP標識Herbaspirillum属細菌を接種したイネを登熟期まで栽培し、組織内定着を経日的に追跡したところ、地上部に10^6-10^7のオーダーで約2ヶ月目まで存在していたが、4ヶ月目の登熟期の葉茎、登熟種子には検出されなかった。昨年度、野生イネ種子からのみHerbaspiriilum属窒素固定菌と推定される計数値が得られたことを考えあわせると、Herbaspiriilum属窒素固定エンドファイトが、種子を介して次世代のイネに伝達される現象は、常に起こる厳密なものではなく、環境条件により変動すると考えられた。野生イネは多年生の性質が強く、種子伝達というよりはむしろ栄養体で広がる可能性が高いと考えられた。前年度から種子や茎に窒素固定菌の高いMPN計数値が得られるにもかかわらず、窒素固定菌の分離で困難を極める場合があった。その理由は、複数の菌が存在する場合に窒素固定能が発現するためであることが分かり、本研究は当初予期していなかった方向への研究展開が始まりつつある。
Evaluation of Nitrogen-Fixing Bacteria in Southeast Asia

MUROOKA Yoshikatsu, OZAWA Takashi, MINAMISAWA Kiwamu, HIGASHI Shiro, PRANA Made Sri, ESPIRITU Bayani

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for international Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for international Scientific Research

Institution: Osaka University

1997 - 1998

More details Close

1)Thai researchers isolated various kinds of rhizobia from nodules of soy bean in acidic soils in Thailand. These strains grow at pH 3.5 or at 4.0. By collaboration with Osaka University, three acid tolerant strains of Bradyrhizobium were succeeded in transformation to tagging with the Green Fluorescence Protein (GFP). These colonies on the plates showed green fluorescence under the UV exposure. 2)Indonesian researchers isolated nitrogen-fixing rhizobia from nodules of leguminous trees in Indonesia. These bacteria were classified by collaboration with Osaka University, Hiroshima University, and Kagoshima University. Bacterial strains isolated from root nodules on Acacia mangium at various locations in Indonesia were classified to Bradyrhizobium elkanji. Bacterial strains isolated from root nodules on Paraserianthes falcataria at various locations in Indonesia were classified into Bradyrhizobiwn elkanil, Rizizobiwn tropici and strains between these species. An acid tolerant strain, Bradyrhizobiwn sp. BTCC-B64 was evaluated as nitrogen fertilizer substitute. The infection of the strains were effective on the nitrogen fixation which performed by the total dried weight of plants, roots and nodules. 3)Free living nitrogen-fixing bacteria, Azotobacter sp. or cellulolytic fungi of Trichoderma sp. isolated in Philippines were used as inoculant in cattle manure-rice hull compost. The inoculation with nitrogen-fixing bacteria improved the degradation and nutrient content of the materials and enhance the inoculant load in the compost. 4)The niflHDKTY Peron from a nitrogen fixing gram positive bacterium, Paenibacillus azotofixans were cloned and characterized by Malaysian researchers. Azospirillun was found to be an effective bioenhancer for banana and oil palm seedings, and vegetatable soybean as well as a biofertilizer for banana. 5)Survivability of the inoculant of Bradyrhizobium japonicum in acid paddy soil in Vietnam was investigated.
Genome rearrangements in Bradyrhizobium japonicum field isolates.

MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

1995 - 1996

More details Close

Among Bradyrhizobium japonicum field isolates, I found abnormal isolates (HRS isolates) which possesses many copies of prokaryotic insertion sequences (IS), RS-alpha, RS-beta and others. We obtained physical evidence for genome rearrangements in B.japonicum HRS isolates. The symbiotic regions (nif, nod and hup) in a HRS genome were heavily subjected to insertion, deletion and other types of genome rearrangements. HRS isolates had a tandem repeat RS-alpha dimer, which may give rise to a burst of transpositional rearrangements. Because snapback analysis showed the presence of the pairs of ISs in an opposite direction, these structures correspond to type II transposon, a compound transposon. In order to examine whether the potential compound transposon may contribute to horizontal transfer of symbiotic genes, I developed to detect nod gene transfer on agar media from B.japonicum HRS isolates to B.elkanii USDA94deltaNOD,a mutant defective in nod genes. As a result, we could obtained B.elkanii cells which acquired the nod region of the HRS isolate and IS element, FK1. The B.elkanii cells restored nodulation phenotype to siratro and production of lipo-chitin nodulation signals.
ダイズ根粒菌産生インドール酢酸の根粒形成における役割

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業一般研究(C)

Category: 一般研究(C)

Institution: 茨城大学

1994 - 1994

More details Close

ダイズ根粒菌グループII(Bradyrhizobium elkanii)の宿主植物への感染において、根粒菌が生産するインドール酢酸(IAA)がどのように関わっているかを明らかにするために、各種のmutantを作製し、宿主植物に対する根粒形成や感染過程を観察し、以下のような結果を得た。 B.elkanii USDA 31株からIAA生産能を激減させたmutant Tn3株を単離し、形成根粒数を親株と比較したところ、明らかに減少していた。Tn3株接種時に、外部から IAAを投与したところ、根粒数は親株レベルまで回復した。したがって、B.elkaniiの生産するIAAが根粒形成に関わっているものと考えられた。宿主植物であるダイズ根の形態的観察より、IAAを通常レベル生産する B.elkanii野性株接種時のみに、ダイズ根の表面に局所的な隆起が認められた。この隆起は1-2層の肥大伸長した外皮層細胞から形成されており、外皮層隆起(Outer Cortex Swelling,以下OCS)と名付けた。OCS構造は、IAA低生産mutant Tn3株では観察されなかった。次に、最近注目されている Nod Factor(根粒菌から宿主植物へのアシル化キチンオリゴマーシグナル)との関わりを検討した。nodD_2D_1KABC遺伝子のみを欠損しNod Factorを生産しないmutantを構築して、ダイズに接種したところ、根粒は形成されなかったが、OCS構造は観察された。したがって、OCS形成に、B.elkaniiの生産するIAAが関わっている可能性は非常に高く、形成されたOCS構造は根粒菌のprimitiveな感染様式と深く関わっていると考えられた。 B.elkaniiのIAA生合成系のkey enzymeであるindolepyrvate decarboxylase(IPDC)のホモロジーに基づくクローニングは失敗したが、IPDCタンパクを精製し、N末端から30のアミノ酸残基を決定したので、これらの情報を基に再度クローニングを行い、遺伝的に特徴づけられたIAA生産のmutantを構築する。
クリーネストエネルギーとしての水素ガスの生産のための生物資源の開発戦略-窒素固定研究グループと水素発生研究グループの学際的共同研究-

渡辺巖, 南沢究, 宮本和久, 熊沢修造, 魚住武司, 小野寺一清

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業総合研究(B)

Category: 総合研究(B)

Institution: 三重大学

1993 - 1993

More details Close

水素ガスもっともクリーンなエネルギーとして将来が期待されている。いろいろな微生物を用いて水素ガスの生産をしようという計画も盛んにすすめられている。水素ガスは酵素ヒドロゲナーゼかニトロゲナーゼの働きによって生成される。従来ヒドロゲナーゼや水素発生の研究.開発を進めてきた研究者とニトロゲナーゼによる窒素固定の研究者の相互の交渉はほとんどなかった。そこで窒素固定研究グループと水素発生研究グループとが一堂に会して,相互の研究の発展を学び,ニトロゲナーゼ.ヒドロゲナーゼ系のそれぞれの長所を取った新技術の開発の戦略を討論することが急務であると考えてこのグループが組織された。この戦略の可能性及び研究の広がりへの期待をこのプロジェクトで討議し,より大きな国内的.国際的プロジェクト提案の足掛りとしようというのが目的である。第一回の会合(平成5年7月)で研究・討議の基本を決めた。この問題についての一般に公開されたワークショップを平成5年12月に東京都町田市玉川大学で開催した。メンバー以外に日本から水素ガス生産.利用の実際にたずさわっている技術者の三菱重工株式会社黒田健之助氏とアメリカのニトロゲナーゼの遺伝生化学の権威Virginia Polytec水素ガスnique InstituteのW.E.Newton氏とドイツのヒドロゲナーゼの遺伝生化学の権威Marburg UniversityのA.Klein氏を専門家としてお招きした。この講演会には大学、会社研究所から70名近い参加があった。このワークショップのあとメンバーの第二回会合をもった。このワークショップの発表内容は若干のメンバーの投稿を加えて英文を主とした報告集として刊行した。この報告が窒素固定と水素発生の研究者の学際的協力を促すのみならず、水素ガスの生産技術に関心を持っている技術者に重要な情報を提供するだろうと期待している。またメンバーの討論をもとに、ヒドロゲナーゼとニトロゲナーゼの遺伝工学.蛋白工学的改良、水素発生プロセスの生態工学的開発を中心にした次の研究プロジェクト(総合A)を平成7年度に提案する予定である。
Genetic analysis of Bradyrhizobium japonicum isolates possessing highly reiteratied DNA sequences

MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

Category: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

Institution: IBARKI UNIVERSITY

1992 - 1993

More details Close

During DNA fingerprinting of indigenous Bradyrhizobium japonicum by repeated sequence (RSalpha and RSbeta), we found many isolates possessing highly reiterated RSs (HRS isolates) from two fields in Japan. Some HRS isolates harbors approximately 200 copies of RSalpha on their genomes. Analysis of pulse field gel electrophoresis indicates that RSalpha copies are distributed to 74% region on HRS isolate genomes and to 17% region on normal isolate genomes. With respect to symbiotic features of HRS isolates, nodulation, nitrogenase activity and hydrogenase activity of HRS isolates were similar to that of normal isolates. However, HRS and normal isolates differed in growth rates in YM medium. Generation time of HRS isolates showed 5-9 h, While normal isolates showed 4-6 h of genaration time. These results strongly suggest that RSs transposition and genomic rearrangement occur on the genomes of B.japonicum HRS isolates.
ELUCIDATION OF MECHANISM ASSOCIATED WITH THE FORMATION OF SYMBIOTIC NITROGEN FIXING SYSTEMS AND DEVELOPMENT OF NITROGEN FIXING ACTIVITY IN LEGUMINOUS PLANT.

ISHIZUKA Junji, HIGASI Shirou, YAMAMOTO Yukio, TAJIMA Shigeyuki, FUJITA Kounosuke, ARIMA Yasuhiro

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

Category: Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

Institution: KYUSHU UNIVERSITY

1990 - 1992

More details Close

In relation to host specificity of soybean rhizobia and preferences of soybean for rhizobia, the lectin agglutinating and growth-stimulating the compatible bacterial strain with the Rj_2-cultivar was extracted from seeds of Rj_2 cultivar. The isolated rhizobia from wild and cultivated soybeans and sairatro were classified into 3 nod-groups which corresponded to each host plant. Host specific process was seemed to be the formation of infection thread and not the attachment of rhizobia. The plasmid which has a fragment containing nodulation genes from R. leguminosarum. lac operon and Tn5 were transferred into R. fredii. In the transconjugant CT24, common nod genes interfere with R. fredii nod genes, causing poor nodulation in soybean. Effects of exudates from seeds and roots of cowpea on nodulation for cowpea were examined, and flavonoid commpounds were identified. Nitrate nitrogen uptake in roots was transferred rapidly into the shoots, and hardly transaferred into nodules. The reduction of nitrogen fixing activity by removal of developing pods was due to reduction of removal of fixed nitrogen from nodules. Infected and uninfected cells shared nitrogen fixing process, xanthine oxidase and malate dehydrogenase were detected in the formers, and CO_2 fixing enzyme, uricase and amino acid synthesizing-enzyme were revealed mainly in the latters. One of nodulins, uricase in soybean nodule were examined for the characteristics, and cotyledons were shown to contain a uricase that cross-react with antibodies raised against the nodule uricase. Novel nodulin cDNAs representing genes expressed at early stages of soybean nodule development were isolated and chracterized.
Genetic Ecology of Bradyrhizobium japonicum in soils

ASAMI Teruo, MINAMISAWA Kiwamu

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)

Category: Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)

Institution: IBARAKI UNIVERSITY

1990 - 1992

More details Close

The isolates of Bradyrhizobium japonicum indigenous to six field in Japan were characterized by using four DNA hybridization probes from the species; nifDK, nodDYAB, hup, RS-alpha, and RS- beta. Diversity in RS-specific hybridization (RS-fingerprint) were observed. The RS-fingerprints were correlated with the nif and hup genotypes, and with the location of field including cropping history. According to nodDYAB hybridization, the field isolates were classified into three main group A, B and C. The group A and B produced similar nod metabolites including NodBj-V with methyl fucose. The group C isolates, which were separated only from siratro, were incompatible with soybeans,and produced different nod metabolites. As for nodulation, we constructed simple relationship. As a result, we established the method of genetic ecology for indigenous bradyrhizobia.
ダイス根粒菌インドール酢酸生産遺伝子のクローニング

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業奨励研究(A)

Category: 奨励研究(A)

Institution: 茨城大学

1991 - 1991
ダイズ根粒菌の生産する新規ファイトトキシンの同定と生態的役割

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業奨励研究(A)

Category: 奨励研究(A)

Institution: 茨城大学

1990 - 1990
根粒菌リゾビトキシン生産遺伝子のクローニング

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業奨励研究(A)

Category: 奨励研究(A)

Institution: 茨城大学

1989 - 1989
マメ科植物根粒におけるアミノプロパンジオール代謝と窒素固定

南澤究

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業奨励研究(A)

Category: 奨励研究(A)

Institution: 茨城大学

1987 - 1987
Symbiotic dinitrogen fixation and accumulation of assimilants by the leguminous plants.

KUMAZAWA Kikuo, HORIGUCHI Tsuyoshi, MINAMISAWA Kiwamu, KAWAI Shigenao, OHYAMA Takuji, ARIMA Yasuhiro

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

Category: Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)

Institution: The University of Tokyo

1985 - 1987

More details Close

Supply of nitrate nitrogen via roots to peanut plants increased dry matter accumulation and decreased seed yield and nitrogen fixed by nodules. Absorbed combined nitrogen was transported to the shoots mainly as asparagine. After intrusion of gynophore into soil, nitrate in fructification zone was directly absorbed by pods and utilized for seed formation. The direct absorption was enhanced by calcium coexistence. The rate of nitrate uptake by soybean plants was saturated at 10-25 ppm of medium nitrogen concentration. The nitrogen originated from nitrate was relatively hard to distribute in nodules as compared with nitrogen derived from ammonium, although asparagine and ureides were accumulated in nodules by the nitrate supply via roots. Higher content of cyclitol was obserbed in nodulated soybean plants than in unnodulated one, and, by the supply of myoinocitol via roots, nodule weight and ARA per plant were increased and nodule degradation and ARA decline after pod filling stage were delayed. Dinitrogen fixation by soybean was relatively insensitie to the combined nitrogen supply comparing to that by kidney bean, and reduction of mean nodule size was not so conspicuous as kidney bean, although distribution pattern of uptaken nitrogen among plant organs was almost same between two kinds of bean. Hup positive strains of rhizobium japonicum were belonged to only a group classified according to the type of extracellular polysaccharides. Rhizobiotoxin, which has serinol structure in it, strongly inhibited induction of uptake hydrogenase in the Hup positive strain.
日本における土壌,底質および植物体中有害金属元素の自然界値

浅見輝男, 南澤究, 久保田正亜

Offer Organization: 日本学術振興会

System: 科学研究費助成事業環境科学特別研究

Category: 環境科学特別研究

Institution: 茨城大学

1986 - 1986

More details Close

本研究は特には汚染の孝えられない土壌(水田,畑,森林)、湖沼底質および植物(米)中の有害金属元素含有率を求め、いわゆる自然界値を明らかにすることを目的として行ない、以下の知見を得た。 1.土壌(水田,畑,森林)の有害金属元素の自然界値:各種土壌の表土についてCd,Zn,Pb,Cu,Ni,Cr,Co,Fe,Mn,V,Sb,Biの含有率を明らかにした。この値はBowenによる世界の土壌の「中央値」と比較するとCd,Co,Vがほぼ同程度、Biが高く、それ以外の金属含有率は低かった。Iimuraによる非汚染土壌の平均値と比べるといずれの金属の含有率も低かった。環境庁による重金属自然賦存量調査の値と比べるとCd,Zn,Pb,Mnが同程度、その他の金属含有率は低かった。なお日本の土壌におけるSb,Biの自然界値についての報告は今日までない。地目別にみると水田土壌〉畑土壌≧森林土壌の傾向がCd,Pb,Ni,Cr,Co,Fe,Biについて認められた。またMclaren & CrawfodによるCuの分画法を改良し、土壌におけるCd,Zn,Pb,Cuの存在形態を明らかにした。 2.湖沼底質における有害金属元素の自然界値:霞ケ浦底質の非汚染と考えられる部分と牛久沼底質を用い、有害金属元素の平均含有率を明らかにした。土壌に比べて湖沼底質の金属含有率はCu,Ni,Co,Feがかなり高く、Cd,Cr,Sb,Biはほぼ等しかった。 3.植物(米)のCdの自然界値:人為的汚染が特には考えられない奈良県生駒郡平群町久安寺の農家保有米を集め分析したところ、50±19μg/gのCdが検出された。この値はMasironiらによるブラジル,イラン,ガテマラ,アメリカ,ドミニカ,台湾,フィジー,ペルー産米のCd含有率より高く、日本産米は外国産米に比べCd含有率が高いとする見解と一致する結果が得られた。

Show all Show first 5

Social Activities 11

ムーンショット国際シンポジウム

ベルサール東京日本橋

2019/12/17 - 2019/12/18
第１回植物微生物共生と窒素固定に関するアジア国際会議

2010/09/20 - 2010/09/24
東北大学開放講座「生命と地球環境」

2004/01/20 - 2004/02/17

More details Close

生命の巧みな環境適応のしくみについて紹介し、生物の多様な生存戦略が地球環境と人間社会に果たす役割を考える
「窒素循環を担う根圏微生物:根粒菌と窒素固定エンドファイト」

2018/10/25 -
「植物共生細菌の進化機構と育種戦略：根粒菌からマイクロバイオーム農業へ」

2018/09/22 -
JST-CRDSライフサイエンス・臨床医学ユニット科学技術未来戦略ワークショップ(植物と微生物叢の相互作用の研究開発戦略―理解・制御・応用に向けて-)

2016/12/04 -
広島大学理学研究科セミナー「植物共生細菌のゲノム進化」

2016/09/14 -

More details Close

自然界における微生物の多様性と根粒菌•マメ科植物の共生システムを概説し、根粒菌の共生アイランドの進化と葉圏細菌の染色体上のリボソームRNA消失の発見、共生微生物コミュニテイー研究の現状と展望を紹介する。
作物に共生する微生物群集について

総合技術会議科学技術連携施策群食料・生物生産研究連携群シンポジウム「生物機能を活用した食料生産・物質生産への新たな光」　東京

2010/03/02 -
作物に共生する微生物群集の包括的な理解と農業利用

平成21年度北海道農業研究センター研究会「根圏域研究が農業現場において果たすべき役割」

2009/12/22 -
ダイズ根粒菌からの温室効果ガス発生：土壌生物のランチタイム

北海道農業研究センター根圏域研究セミナー

2009/12/21 -
東北大学生命科学研究科フォーラム第１回公開シンポジウム「環境変化と生命圏の未来」

2005/03/01 -

More details Close

生命科学の視点から「環境変化と生命圏の未来」の科学的ニーズに応える研究を紹介する

Show all Show first 5

Media Coverage 8

地球を冷やす?あの病気にも!?土の実力発掘SP

NHK　サイエンスZERO

2022/05

Type: TV or radio program
地球を救え！ムーンショットNEDOプログラムー微生物で温室ガス削減

日刊工業新聞

2021/09
温室効果ガス削減へ微生物活用 Myself

読売新聞

2020/03/14

More details Close

２０２０年３月１４日の読売新聞朝刊に第５７回読売農学賞「窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究」の研究内容が、微生物を使う「マクロバイオーム農業」として掲載された。特に、ダイズ根圏の温室効果ガスN2Oを無害化する根粒菌の開発およびイネ根のCH4酸化菌について分かりやすく紹介された。
ダイズ畑のN2O土着微生物で減少 Myself

日本経済新聞

2016/10/31
ダイズ畑の温暖化ガス、土着微生物で減少東北大など手法開発 Myself

日本経済新聞

2016/10/30
東北大、染色体上からリボソームRNA遺伝子が消えた細菌を発見 Myself

日経プレスリリース

2015/11/05
根粒菌による温室効果ガスの削減（生物による初めてのN2O発生削減）

2012/11/12

Type: Newspaper, magazine
ゲノム解析をベースに根粒菌の窒素固定システムを解明

2005/01/31

Type: Other

Show all Show first 5

Other 10

東京大学大学院農学生命科学研究科「環境土壌資源論」非常勤講師
新潟大学大学院自然科学研究科「応用生命・食品科学セミナーI」非常勤講師
千葉大学大学院園芸学研究科「農業生産化学特論」非常勤講師
大豆及び畑作物の有用遺伝子の同定とDNAマーカーの開発

More details Close

根粒内エンドファイトと根粒菌の多様性解析により、ダイズ栽培環境の指標を作る研究。
エンドファイト－イネの共生相互作用の解明

More details Close

イネの微生物共生に関わる可能性のあるイネ遺伝子のtos17mutantの微生物群集構造解析とAzospirillum sp. B510株の接種効果のメカニズムを解明するもの。
微生物を利用した農耕地からの一酸化二窒素ガス発生削減技術の開発

More details Close

ダイズ根粒菌のN2O還元酵素の高い株（nosZ＋＋株）を利用した技術開発。
メタン酸化窒素固定細菌による水田メタン発生の低減化

More details Close

水田生態系で起こっているC1代謝と窒素固定の関連に着目して、メタンガスを逆にエネルギー源および炭素源として窒素固定やバイオマス生産を貢献させながら水田生態系からのメタン発生を低減化することを目的とした。
植物・微生物間共生におけるゲノム相互作用

More details Close

ゲノム情報に基づいたダイズ共生微生物の多様性と共生機構の解析
根圏微生物コミュニティーのN2O発生メカニズムの解明とその低減化

More details Close

プロモーター導入法と不均衡進化法によりNos強化株の作成と解析を行う。圃場でN2Oを発生している根粒根圏野微生物群集構造を解析し、それに基づいたN2O発生微生物の分離法の検討と室内再構成モデル系の確率を行う。根粒根圏からのN2O発生の圃場環境特異性の基礎データを得る。
温室効果ガス削減へ微生物活用

More details Close

２０２０年３月１４日の読売新聞朝刊に第５７回読売農学賞「窒素循環を担う植物共生微生物に関する研究」の研究内容が、微生物を使う「マクロバイオーム農業」として掲載された。特に、ダイズ根圏の温室効果ガスN2Oを無害化する根粒菌の開発およびイネ根のCH4酸化菌について分かりやすく紹介された。

Show all Show first 5