研究者詳細

顔写真

ヒビ　ゲンキ
日比　玄紀
Genki Hibi
所属
大学院薬学研究科　分子薬科学専攻　分子解析学講座（医薬資源化学分野）
職名
特任研究員
学位

  • 博士(農学) （東京大学）

e-Rad 研究者番号
31017338

経歴 2

  • 2024年8月 ～ 継続中
    東北大学　大学院薬学研究科　特任研究員

  • 2024年4月 ～ 2024年7月
    東京大学　大学院農学生命科学研究科　特任研究員

学歴 4

  • 東京大学　大学院農学生命科学研究科　応用生命工学専攻

    2021年4月 ～ 2024年3月

  • 東京大学　大学院農学生命科学研究科　応用生命工学専攻

    2019年4月 ～ 2021年3月

  • 東京大学　農学部　生命化学・工学専修

    2017年4月 ～ 2019年3月

  • 東京大学　教養学部　理科II類

    2015年4月 ～ 2017年3月

研究キーワード 1

  • 生合成

受賞 4

  1. 2024年度 最優秀ポスター賞

    2024年9月　2024年度 日本放線菌学会大会　放線菌が生産する炭素五員環骨格含有天然化合物の探索

  2. 令和5年度農学生命科学研究科 研究科長賞

    2024年3月　東京大学大学院 農学生命科学研究科

  3. 優秀発表賞

    2022年8月　日本農芸化学会関東支部　特殊アミノ酸シスペンタシンの生産とその生合成機構の解析

  4. トピックス賞

    2022年4月　日本農芸化学会　アミプリマイシンに含まれる特殊アミノ酸の生合成機構の解析

論文 2

  1. Identification of the biosynthetic gene cluster for PF1451A: Implications for untapped peptide biosynthetic pathways widely distributed in fungi

    Genki Hibi, Taro Ozaki, Riku Sugimoto, Yohei Morishita, Teigo Asai

    Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry　2026年5月21日

    DOI： 10.1093/bbb/zbag074 　

  2. Discovery of type II polyketide synthase-like enzymes for the biosynthesis of cispentacin. 国際誌

    Genki Hibi, Taro Shiraishi, Tatsuki Umemura, Kenji Nemoto, Yusuke Ogura, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama

    Nature communications　14　(1)　8065-8065　2023年12月6日

    DOI： 10.1038/s41467-023-43731-z 　

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    Type II polyketide synthases (PKSs) normally synthesize polycyclic aromatic compounds in nature, and the potential to elaborate further diverse skeletons was recently revealed by the discovery of a polyene subgroup. Here, we show a type II PKS machinery for the biosynthesis of a five-membered nonaromatic skeleton contained in the nonproteinogenic amino acid cispentacin and the plant toxin coronatine. We successfully produce cispentacin in a heterologous host and reconstruct its biosynthesis using seven recombinant proteins in vitro. Biochemical analyses of each protein reveal the unique enzymatic reactions, indicating that a heterodimer of type II PKS-like enzymes (AmcF-AmcG) catalyzes a single C2 elongation as well as a subsequent cyclization on the acyl carrier protein (AmcB) to form a key intermediate with a five-membered ring. The subsequent reactions, which are catalyzed by a collection of type II PKS-like enzymes, are also peculiar. This work further expands the definition of type II PKS and illuminates an unexplored genetic resource for natural products.

MISC 1

  1. 炭素五員環骨格を形成する新規Ⅱ型ポリケチド合成酵素の発見

    日比玄紀, 葛山智久

    バイオサイエンスとインダストリー(B&I）　82　(5)　492-493　2024年9月

共同研究・競争的資金等の研究課題 1

  1. 真菌特有ペプチド骨格形成マシナリーの試験管内再構成

    日比 玄紀

    2025年7月31日 ～ 2027年3月31日