東北大学研究者紹介

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サクライ　ミカ

櫻井　美佳

Mika Sakurai

所属

東北メディカル・メガバンク機構　人材育成部門

職名

准教授

学位

博士（医学）（東京大学）
修士（工学）（東京理科大学）

researchmap

https://researchmap.jp/7000007016

J-GLOBAL ID

201401034116152908

e-Rad 研究者番号

80508359

経歴 8

2018年3月～継続中

東北大学　東北メディカル・メガバンク機構　准教授
2017年4月～ 2018年2月

東北大学　東北メディカル・メガバンク機構　講師
2015年4月～ 2017年3月

日本医療研究開発機構　主幹
2013年9月～ 2015年3月

東北大学　東北メディカル・メガバンク機構　助教
2007年11月～ 2013年8月

東京大学　医科学研究所　助教
2007年9月～ 2007年11月

東京大学　医科学研究所　学術研究支援員
2005年4月～ 2007年8月

キュリー研究所　ポストドクトラルフェロー
2003年4月～ 2005年3月

国立がんセンター研究所　リサーチレジデント

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学歴 3

東京大学　医学系研究科

1999年4月～ 2003年3月
東京理科大学　基礎工学研究科

1997年4月～ 1999年3月
東京理科大学　基礎工学部

1993年4月～ 1997年3月

所属学協会 3

日本人類遺伝学会
日本癌学会
日本分子生物学会

研究キーワード 5

ゲノム医療
細胞接着
細胞浸潤
細胞外マトリックス
分子細胞生物学

研究分野 3

ライフサイエンス / 分子生物学 /
ライフサイエンス / 細胞生物学 /
ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

論文 48

The Health History of First-Degree Relatives’ Dyslipidemia Can Affect Preferences and Intentions following the Return of Genomic Results for Monogenic Familial Hypercholesterolemia 査読有り

Tomoharu Tokutomi, Akiko Yoshida, Akimune Fukushima, Kayono Yamamoto, Yasushi Ishigaki, HIROSHI KAWAME, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Yoichi Suzuki, Mika Sakurai-Yageta, Akira Uruno, Kichiya Suzuki, Kozo Tanno, Hideki Ohmomo, Atsushi Shimizu, Masayuki Yamamoto, Makoto Sasaki

Genes　2024年3月21日

DOI： 10.3390/genes15030384 　
Study Profile of the Tsuruoka Metabolomics Cohort Study (TMCS) 査読有り

Sei Harada, Miho Iida, Naoko Miyagawa, Aya Hirata, Kazuyo Kuwabara, Minako Matsumoto, Tomonori Okamura, Shun Edagawa, Yoko Kawada, Atsuko Miyake, Ryota Toki, Miki Akiyama, Atsuki Kawai, Daisuke Sugiyama, Yasunori Sato, Ryo Takemura, Kota Fukai, Yoshiki Ishibashi, Suzuka Kato, Ayako Kurihara, Mizuki Sata, Takuma Shibuki, Ayano Takeuchi, Shun Kohsaka, Mitsuaki Sawano, Satoshi Shoji, Yoshikane Izawa, Masahiro Katsumata, Koichi Oki, Shinichi Takahashi, Tsubasa Takizawa, Hiroshi Maruya, Yuji Nishiwaki, Ryo Kawasaki, Akiyoshi Hirayama, Takamasa Ishikawa, Rintaro Saito, Asako Sato, Tomoyoshi Soga, Masahiro Sugimoto, Masaru Tomita, Shohei Komaki, Hideki Ohmomo, Kanako Ono, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Atsushi Shimizu, Yoichi Sutoh, Atsushi Hozawa, Kengo Kinoshita, Seizo Koshiba, Kazuki Kumada, Soichi Ogishima, Mika Sakurai-Yageta, Gen Tamiya, Toru Takebayashi

Journal of Epidemiology　2024年1月
出版者・発行元： Japan Epidemiological Association
DOI： 10.2188/jea.je20230192 　

ISSN：0917-5040

eISSN：1349-9092
Design and Progress of Child Health Assessments at Community Support Centers in the Birth and Three-Generation Cohort Study of the Tohoku Medical Megabank Project.

Tomoko Kobayashi, Mika Kobayashi, Naoko Minegishi, Masahiro Kikuya, Taku Obara, Mami Ishikuro, Chizuru Yamanaka, Tomomi Onuma, Keiko Murakami, Fumihiko Ueno, Aoi Noda, Akira Uruno, Junichi Sugawara, Kichiya Suzuki, Eiichi N Kodama, Yohei Hamanaka, Naho Tsuchiya, Mana Kogure, Naoki Nakaya, Makiko Taira, Mika Sakurai-Yageta, Toru Tamahara, Junko Kawashima, Maki Goto, Akihito Otsuki, Ritsuko Shimizu, Soichi Ogishima, Hiroaki Hashizume, Fuji Nagami, Tomohiro Nakamura, Atsushi Hozawa, Tadao Kobayashi, Nobuo Fuse, Shinichi Kuriyama, Shigeo Kure, Masayuki Yamamoto

The Tohoku journal of experimental medicine　259　(2)　93-105　2023年1月20日

DOI： 10.1620/tjem.2022.J103 　

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The Tohoku Medical Megabank Project (TMM) has been conducting a birth and three-generation cohort study (the BirThree Cohort Study). We recruited 73,529 pregnant women and their family members for this cohort study, which included 23,143 newborns and 9,459 of their siblings. We designed and are in the process of conducting three-step health assessments for each newborn at approximately ages of 5, 10 and 16. These health assessments are administered at seven community support centers. Trained genome medical research coordinators conduct physical examinations of and collect biological specimens from each participant. The Sendai Children's Health Square has been established as the headquarters for these child health assessments and is utilized to accumulate knowledge that can facilitate the proper practice of child health assessments. We designed all the relevant health assessments facilities to allow parents and their children to participate in the health assessments concomitantly. Our centers serve as places where child participants and their parents can feel at ease as a result of the implementation of safety measures and child hospitality measures. The TMM BirThree Cohort Study is in the process of conducting strategically detailed health assessments and genome analysis, which can facilitate studies concerning the gene-environment interactions relevant to noncommunicable diseases. Through these operations, our study allows for a significant depth of data to be collected in terms of the number of biospecimens under study and the comprehensiveness of both basic and clinical data alongside relevant family information.
Trans-homophilic interaction of CADM1 promotes organ infiltration of T-cell lymphoma by adhesion to vascular endothelium. 国際誌

Yutaka Kasai, Siew Pey Gan, Toko Funaki, Yuki Ohashi-Kumagai, Mizuki Tominaga, Shu-Jen Shiu, Daisuke Suzuki, Daisuke Matsubara, Takeharu Sakamoto, Mika Sakurai-Yageta, Takeshi Ito, Yoshinori Murakami

Cancer science　113　(5)　1669-1678　2022年5月

DOI： 10.1111/cas.15307 　

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The initial step of organ infiltration of malignant cells is the interaction with host vascular endothelial cells, which is often mediated by specific combinations of cell adhesion molecules. Cell adhesion molecule 1 (CADM1) is overexpressed in adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL) and provides a cell-surface diagnostic marker. CADM1 promotes the adhesion of ATL cells to vascular endothelial cells and multiple organ infiltration in mice. However, its binding partner on host cells has not yet been identified. In this study, we show that CADM1 promotes transendothelial migration of ATL cells in addition to the adhesion to vascular endothelial cells. Moreover, CADM1 enhances liver infiltration of mouse T-cell lymphoma cells, EL4, after tail vein injection, whereas a CADM1 mutant lacking adhesive activity did not. Among the known CADM1-binding proteins expressed in primary endothelial cells, only CADM1 and CADM4 could induce morphological extension of ATL cells when plated onto glass coated with these proteins. Furthermore, CADM1-mediated liver infiltration of EL4 cells was canceled in conventional and vascular endothelium-specific Cadm1 knockout mice, whereas it was not canceled in Cadm4 knockout mice. These results suggest that CADM1 on host vascular endothelial cells is required for organ infiltration of ATL and other T-cell lymphomas expressing CADM1.
A Pilot Study for Return of Individual Pharmacogenomic Results to Population-Based Cohort Study Participants.

Kinuko Ohneda, Masahiro Hiratsuka, Hiroshi Kawame, Fuji Nagami, Yoichi Suzuki, Kichiya Suzuki, Akira Uruno, Mika Sakurai-Yageta, Yohei Hamanaka, Makiko Taira, Soichi Ogishima, Shinichi Kuriyama, Atsushi Hozawa, Hiroaki Tomita, Naoko Minegishi, Junichi Sugawara, Inaho Danjoh, Tomohiro Nakamura, Tomoko Kobayashi, Yumi Yamaguchi-Kabata, Shu Tadaka, Taku Obara, Eiji Hishimuma, Nariyasu Mano, Masaki Matsuura, Yuji Sato, Masateru Nakasone, Yohei Honkura, Jun Suzuki, Yukio Katori, Yoichi Kakuta, Atsushi Masamune, Yoko Aoki, Masaharu Nakayama, Shigeo Kure, Kengo Kinoshita, Nobuo Fuse, Masayuki Yamamoto

JMA journal　5　(2)　177-189　2022年4月15日

DOI： 10.31662/jmaj.2021-0156 　

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Introduction: Pharmacogenomic (PGx) testing results provide valuable information on drug selection and appropriate dosing, maximization of efficacy, and minimization of adverse effects. Although the number of large-scale, next-generation-sequencing-based PGx studies has recently increased, little is known about the risks and benefits of returning PGx results to ostensibly healthy individuals in research settings. Methods: Single-nucleotide variants of three actionable PGx genes, namely, MT-RNR1, CYP2C19, and NUDT15, were returned to 161 participants in a population-based Tohoku Medical Megabank project. Informed consent was obtained from the participants after a seminar on the outline of this study. The results were sent by mail alongside sealed information letter intended for clinicians. As an exception, genetic counseling was performed for the MT-RNR1 m.1555A > G variant carriers by a medical geneticist, and consultation with an otolaryngologist was encouraged. Questionnaire surveys (QSs) were conducted five times to evaluate the participants' understanding of the topic, psychological impact, and attitude toward the study. Results: Whereas the majority of participants were unfamiliar with the term PGx, and none had undergone PGx testing before the study, more than 80% of the participants felt that they could acquire basic PGx knowledge sufficient to understand their genomic results and were satisfied with their potential benefit and use in future prescriptions. On the other hand, some felt that the PGx concepts or terminology was difficult to fully understand and suggested that in-person return of the results was desirable. Conclusions: These results collectively suggest possible benefits of returning preemptive PGx information to ostensibly healthy cohort participants in a research setting.
dbTMM: an integrated database of large-scale cohort, genome and clinical data for the Tohoku Medical Megabank Project. 国際誌

Soichi Ogishima, Satoshi Nagaie, Satoshi Mizuno, Ryosuke Ishiwata, Keita Iida, Kazuro Shimokawa, Takako Takai-Igarashi, Naoki Nakamura, Sachiko Nagase, Tomohiro Nakamura, Naho Tsuchiya, Naoki Nakaya, Keiko Murakami, Fumihiko Ueno, Tomomi Onuma, Mami Ishikuro, Taku Obara, Shunji Mugikura, Hiroaki Tomita, Akira Uruno, Tomoko Kobayashi, Akito Tsuboi, Shu Tadaka, Fumiki Katsuoka, Akira Narita, Mika Sakurai, Satoshi Makino, Gen Tamiya, Yuichi Aoki, Ritsuko Shimizu, Ikuko N Motoike, Seizo Koshiba, Naoko Minegishi, Kazuki Kumada, Takahiro Nobukuni, Kichiya Suzuki, Inaho Danjoh, Fuji Nagami, Kozo Tanno, Hideki Ohmomo, Koichi Asahi, Atsushi Shimizu, Atsushi Hozawa, Shinichi Kuriyama, Nobuo Fuse, Teiji Tominaga, Shigeo Kure, Nobuo Yaegashi, Kengo Kinoshita, Makoto Sasaki, Hiroshi Tanaka, Masayuki Yamamoto

Human genome variation　8　(1)　44-44　2021年12月10日

DOI： 10.1038/s41439-021-00175-5 　

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To reveal gene-environment interactions underlying common diseases and estimate the risk for common diseases, the Tohoku Medical Megabank (TMM) project has conducted prospective cohort studies and genomic and multiomics analyses. To establish an integrated biobank, we developed an integrated database called "dbTMM" that incorporates both the individual cohort/clinical data and the genome/multiomics data of 157,191 participants in the Tohoku Medical Megabank project. To our knowledge, dbTMM is the first database to store individual whole-genome data on a variant-by-variant basis as well as cohort/clinical data for over one hundred thousand participants in a prospective cohort study. dbTMM enables us to stratify our cohort by both genome-wide genetic factors and environmental factors, and it provides a research and development platform that enables prospective analysis of large-scale data from genome cohorts.
Construction and integration of three de novo Japanese human genome assemblies toward a population-specific reference

Jun Takayama, Shu Tadaka, Kenji Yano, Fumiki Katsuoka, Chinatsu Gocho, Takamitsu Funayama, Satoshi Makino, Yasunobu Okamura, Atsuo Kikuchi, Sachiyo Sugimoto, Junko Kawashima, Akihito Otsuki, Mika Sakurai-Yageta, Jun Yasuda, Shigeo Kure, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Gen Tamiya

Nature Communications　12　(1)　2021年12月
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41467-020-20146-8 　

eISSN：2041-1723

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<title>Abstract</title>The complete human genome sequence is used as a reference for next-generation sequencing analyses. However, some ethnic ancestries are under-represented in the reference genome (e.g., GRCh37) due to its bias toward European and African ancestries. Here, we perform de novo assembly of three Japanese male genomes using > 100× Pacific Biosciences long reads and Bionano Genomics optical maps per sample. We integrate the genomes using the major allele for consensus and anchor the scaffolds using genetic and radiation hybrid maps to reconstruct each chromosome. The resulting genome sequence, JG1, is contiguous, accurate, and carries the Japanese major allele at most loci. We adopt JG1 as the reference for confirmatory exome re-analyses of seven rare-disease Japanese families and find that re-analysis using JG1 reduces total candidate variant calls versus GRCh37 while retaining disease-causing variants. These results suggest that integrating multiple genomes from a single population can aid genome analyses of that population.
Association between Serum Biotin Levels and Cedar Pollinosis in Japanese Schoolchildren

Mika SAKURAI-YAGETA, Yoichi MASHIMO, Toshinobu KUROISHI, Rino ISHIHARA, Naoki SHIMOJO, Yoichi KOHNO, Yoshitaka OKAMOTO, Akira HATA, Yoichi SUZUKI

Journal of Nutritional Science and Vitaminology　67　(4)　211-216　2021年8月31日
出版者・発行元： Center for Academic Publications Japan
DOI： 10.3177/jnsv.67.211 　

ISSN：0301-4800

eISSN：1881-7742
The return of individual genomic results to research participants: design and pilot study of Tohoku Medical Megabank Project. 国際誌

Hiroshi Kawame, Akimune Fukushima, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Yoichi Suzuki, Mika Sakurai-Yageta, Jun Yasuda, Yumi Yamaguchi-Kabata, Kengo Kinoshita, Soichi Ogishima, Takako Takai, Shinichi Kuriyama, Atsushi Hozawa, Naoki Nakaya, Tomohiro Nakamura, Naoko Minegishi, Junichi Sugawara, Kichiya Suzuki, Hiroaki Tomita, Akira Uruno, Tomoko Kobayashi, Yayoi Aizawa, Tomoharu Tokutomi, Kayono Yamamoto, Kinuko Ohneda, Shigeo Kure, Yoko Aoki, Hideki Katagiri, Yasushi Ishigaki, Shojiro Sawada, Makoto Sasaki, Masayuki Yamamoto

Journal of human genetics　67　(1)　9-17　2021年7月8日

DOI： 10.1038/s10038-021-00952-8 　

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Certain large genome cohort studies attempt to return the individual genomic results to the participants; however, the implementation process and psychosocial impacts remain largely unknown. The Tohoku Medical Megabank Project has conducted large genome cohort studies of general residents. To implement the disclosure of individual genomic results, we extracted the potential challenges and obstacles. Major challenges include the determination of genes/disorders based on the current medical system in Japan, the storage of results, prevention of misunderstanding, and collaboration of medical professionals. To overcome these challenges, we plan to conduct multilayer pilot studies, which deal with different disorders/genes. We finally chose familial hypercholesterolemia (FH) as a target disease for the first pilot study. Of the 665 eligible candidates, 33.5% were interested in the pilot study and provided consent after an educational "genetics workshop" on the basic genetics and medical facts of FH. The genetics professionals disclosed the results to the participants. All positive participants were referred to medical care, and a serial questionnaire revealed no significant psychosocial distress after the disclosure. Return of genomic results to research participants was implemented using a well-prepared protocol. To further elucidate the impact of different disorders, we will perform multilayer pilot studies with different disorders, including actionable pharmacogenomics and hereditary tumor syndromes.
Japonica Array NEO with increased genome-wide coverage and abundant disease risk SNPs

Mika Sakurai-Yageta, Kazuki Kumada, Chinatsu Gocho, Satoshi Makino, Akira Uruno, Shu Tadaka, Ikuko N Motoike, Masae Kimura, Shin Ito, Akihito Otsuki, Akira Narita, Hisaaki Kudo, Yuichi Aoki, Inaho Danjoh, Jun Yasuda, Hiroshi Kawame, Naoko Minegishi, Seizo Koshiba, Nobuo Fuse, Gen Tamiya, Masayuki Yamamoto, Kengo Kinoshita

The Journal of Biochemistry　2021年5月13日
出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)
DOI： 10.1093/jb/mvab060 　

ISSN：0021-924X

eISSN：1756-2651

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<title>Abstract</title> Ethnic-specific SNP arrays are becoming more important to increase the power of genome-wide association studies in diverse population. In the Tohoku Medical Megabank Project, we have been developing a series of Japonica Arrays (JPA) for genotyping participants based on reference panels constructed from whole-genome sequence data of the Japanese population. Here, we designed a novel version of the SNP array for the Japanese population, called Japonica Array NEO (JPA NEO), comprising a total of 666,883 markers. Among them, 654,246 tag SNPs of autosomes and X chromosome were selected from an expanded reference panel of 3,552 Japanese, 3.5KJPNv2, using pairwise r2 of linkage disequilibrium measures. Additionally, 28,298 markers were included for the evaluation of previously identified disease risk markers from the literature and databases, and those present in the Japanese population were extracted using the reference panel. Through genotyping 286 Japanese samples, we found that the imputation quality r2 and INFO score in the minor allele frequency bin &gt;2.5–5% were &gt;0.9 and &gt;0.8, respectively, and &gt;12 million markers were imputed with an INFO score &gt;0.8. From these results, JPA NEO is a promising tool for genotyping the Japanese population with genome-wide coverage, contributing to the development of genetic risk scores.
Design and Progress of Oral Health Examinations in the Tohoku Medical Megabank Project

Akito Tsuboi, Hiroyuki Matsui, Naru Shiraishi, Takahisa Murakami, Akihito Otsuki, Junko Kawashima, Tomomi Kiyama, Toru Tamahara, Maki Goto, Shihoko Koyama, Junichi Sugawara, Eiichi N. Kodama, Hirohito Metoki, Atsushi Hozawa, Shinichi Kuriyama, Hiroaki Tomita, Masahiro Kikuya, Naoko Minegishi, Kichiya Suzuki, Seizo Koshiba, Gen Tamiya, Nobuo Fuse, Yuichi Aoki, Takako Takai-Igarashi, Soichi Ogishima, Tomohiro Nakamura, Mika Sakurai-Yageta, Fuji Nagami, Kengo Kinoshita, Shigeo Kure, Ritsuko Shimizu, Keiichi Sasaki, Masayuki Yamamoto

The Tohoku Journal of Experimental Medicine　251　(2)　97-115　2020年

DOI： 10.1620/tjem.251.97 　

ISSN：0040-8727

eISSN：1349-3329
Identification of two novel breast cancer loci through large-scale genome-wide association study in the Japanese population. 国際誌査読有り

Low SK, Chin YM, Ito H, Matsuo K, Tanikawa C, Matsuda K, Saito H, Sakurai-Yageta M, Nakaya N, Shimizu A, Nishizuka SS, Yamaji T, Sawada N, Iwasaki M, Tsugane S, Takezaki T, Suzuki S, Naito M, Wakai K, Kamatani Y, Momozawa Y, Murakami Y, Inazawa J, Nakamura Y, Kubo M, Katagiri T, Miki Y

Scientific reports　9　(1)　17332-17332　2019年11月

DOI： 10.1038/s41598-019-53654-9 　
Establishment of Integrated Biobank for Precision Medicine and Personalized Healthcare: The Tohoku Medical Megabank Project. 査読有り

Fuse N, Sakurai-YagetaM, Katsuoka F, Danjoh I, Shimizu R, Tamiya G, Nagami F, Kawame H, Higuchi S, Kinoshita K, Kure S, Yamamoto M

JMA Journal　2　(2)　113-122　2019年9月

DOI： 10.31662/jmaj.2019-0014. 　
Cohort Profile: Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study (TMM BirThree Cohort Study): Rationale, Progress and Perspective. 国際誌査読有り

Kuriyama S, Metoki H, Kikuya M, Obara T, Ishikuro M, Yamanaka C, Nagai M, Matsubara H, Kobayashi T, Sugawara J, Tamiya G, Hozawa A, Nakaya N, Tsuchiya N, Nakamura T, Narita A, Kogure M, Hirata T, Tsuji I, Nagami F, Fuse N, Arai T, Kawaguchi Y, Higuchi S, Sakaida M, Suzuki Y, Osumi N, Nakayama K, Ito K, Egawa S, Chida K, Kodama E, Kiyomoto H, Ishii T, Tsuboi A, Tomita H, Taki Y, Kawame H, Suzuki K, Ishii N, Ogishima S, Mizuno S, Takai-Igarashi T, Minegishi N, Yasuda J, Igarashi K, Shimizu R, Nagasaki M, Tanabe O, Koshiba S, Hashizume H, Motohashi H, Tominaga T, Ito S, Tanno K, Sakata K, Shimizu A, Hitomi J, Sasaki M, Kinoshita K, Tanaka H, Kobayashi T, Kure S, Yaegashi N, Yamamoto M, Tohoku Medical Megabank Project, Study Group

International journal of epidemiology　2019年8月25日

DOI： 10.1093/ije/dyz169 　

ISSN：0300-5771
A training and education program for genome medical research coordinators in the genome cohort study of the Tohoku Medical Megabank Organization. 査読有り

M Sakurai-Yageta, Hiroshi Kawame, Shinichi Kuriyama, Atsushi Hozawa, Naoki Nakaya, Fuji Nagami, Naoko Minegishi, Soichi Ogishima, Takako Takai-Igarashi, Inaho Danjoh, Taku Obara, Mami Ishikuro, Tomoko Kobayashi, Yayoi Aizawa, Rino Ishihara, Masayuki Yamamoto, Yoichi Suzuki

BMC Medical Education　19　(1)　297　2019年8月

DOI： 10.1186/s12909-019-1725-5. 　

ISSN：1472-6920
Genome analyses for the Tohoku Medical Megabank Project towards establishment of personalized healthcare. 国際誌査読有り

Jun Yasuda, Kengo Kinoshita, Fumiki Katsuoka, Inaho Danjoh, Mika Sakurai-Yageta, Ikuko N Motoike, Yoko Kuroki, Sakae Saito, Kaname Kojima, Matsuyuki Shirota, Daisuke Saigusa, Akihito Otsuki, Junko Kawashima, Yumi Yamaguchi-Kabata, Shu Tadaka, Yuichi Aoki, Takahiro Mimori, Kazuki Kumada, Jin Inoue, Satoshi Makino, Miho Kuriki, Nobuo Fuse, Seizo Koshiba, Osamu Tanabe, Masao Nagasaki, Gen Tamiya, Ritsuko Shimizu, Takako Takai-Igarashi, Soichi Ogishima, Atsushi Hozawa, Shinichi Kuriyama, Junichi Sugawara, Akito Tsuboi, Hideyasu Kiyomoto, Tadashi Ishii, Hiroaki Tomita, Naoko Minegishi, Yoichi Suzuki, Kichiya Suzuki, Hiroshi Kawame, Hiroshi Tanaka, Yasuyuki Taki, Nobuo Yaegashi, Shigeo Kure, Fuji Nagami, Kenjiro Kosaki, Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Atsushi Shimizu, Makoto Sasaki, Masayuki Yamamoto

Journal of biochemistry　165　(2)　139-158　2019年2月1日

DOI： 10.1093/jb/mvy096 　

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Personalized healthcare (PHC) based on an individual's genetic make-up is one of the most advanced, yet feasible, forms of medical care. The Tohoku Medical Megabank (TMM) Project aims to combine population genomics, medical genetics and prospective cohort studies to develop a critical infrastructure for the establishment of PHC. To date, a TMM CommCohort (adult general population) and a TMM BirThree Cohort (birth+three-generation families) have conducted recruitments and baseline surveys. Genome analyses as part of the TMM Project will aid in the development of a high-fidelity whole-genome Japanese reference panel, in designing custom single-nucleotide polymorphism (SNP) arrays specific to Japanese, and in estimation of the biological significance of genetic variations through linked investigations of the cohorts. Whole-genome sequencing from >3,500 unrelated Japanese and establishment of a Japanese reference genome sequence from long-read data have been done. We next aim to obtain genotype data for all TMM cohort participants (>150,000) using our custom SNP arrays. These data will help identify disease-associated genomic signatures in the Japanese population, while genomic data from TMM BirThree Cohort participants will be used to improve the reference genome panel. Follow-up of the cohort participants will allow us to test the genetic markers and, consequently, contribute to the realization of PHC.
3.5KJPNv2: an allele frequency panel of 3552 Japanese individuals including the X chromosome. 国際誌査読有り

Shu Tadaka, Fumiki Katsuoka, Masao Ueki, Kaname Kojima, Satoshi Makino, Sakae Saito, Akihito Otsuki, Chinatsu Gocho, Mika Sakurai-Yageta, Inaho Danjoh, Ikuko N Motoike, Yumi Yamaguchi-Kabata, Matsuyuki Shirota, Seizo Koshiba, Masao Nagasaki, Naoko Minegishi, Atsushi Hozawa, Shinichi Kuriyama, Atsushi Shimizu, Jun Yasuda, Nobuo Fuse, Gen Tamiya, Masayuki Yamamoto, Kengo Kinoshita

Human genome variation　6　(28)　28-28　2019年

DOI： 10.1038/s41439-019-0059-5 　

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The first step towards realizing personalized healthcare is to catalog the genetic variations in a population. Since the dissemination of individual-level genomic information is strictly controlled, it will be useful to construct population-level allele frequency panels with easy-to-use interfaces. In the Tohoku Medical Megabank Project, we sequenced nearly 4000 individuals from a Japanese population and constructed an allele frequency panel of 3552 individuals after removing related samples. The panel is called the 3.5KJPNv2. It was constructed by using a standard pipeline including the 1KGP and gnomAD algorithms to reduce technical biases and to allow comparisons to other populations. Our database is the first large-scale panel providing the frequencies of variants present on the X chromosome and on the mitochondria in the Japanese population. All the data are available on our original database at https://jmorp.megabank.tohoku.ac.jp.
Biobank Establishment and Sample Management in the Tohoku Medical Megabank Project 査読有り

Naoko Minegishi, Ichiko Nishijima, Takahiro Nobukuni, Hisaaki Kudo, Noriko Ishida, Takahiro Terakawa, Kazuki Kumada, Riu Yamashita, Fumiki Katsuoka, Soichi Ogishima, Kichiya Suzuki, Makoto Sasaki, Mamoru Satoh, Tohoku Medical Megabank Project Study Group, Masayuki Yamamoto

The Tohoku Journal of Experimental Medicine　248　(1)　45-55　2019年
出版者・発行元： Tohoku University Medical Press
DOI： 10.1620/tjem.248.45 　

ISSN：0040-8727

eISSN：1349-3329
Regional genetic differences among Japanese populations and performance of genotype imputation using whole-genome reference panel of the Tohoku Medical Megabank Project. 国際誌査読有り

Jun Yasuda, Fumiki Katsuoka, Inaho Danjoh, Yosuke Kawai, Kaname Kojima, Masao Nagasaki, Sakae Saito, Yumi Yamaguchi-Kabata, Shu Tadaka, Ikuko N Motoike, Kazuki Kumada, Mika Sakurai-Yageta, Osamu Tanabe, Nobuo Fuse, Gen Tamiya, Koichiro Higasa, Fumihiko Matsuda, Nobufumi Yasuda, Motoki Iwasaki, Makoto Sasaki, Atsushi Shimizu, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto

BMC genomics　19　(1)　551-551　2018年7月24日

DOI： 10.1186/s12864-018-4942-0 　

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BACKGROUND: Genotype imputation from single-nucleotide polymorphism (SNP) genotype data using a haplotype reference panel consisting of thousands of unrelated individuals from populations of interest can help to identify strongly associated variants in genome-wide association studies. The Tohoku Medical Megabank (TMM) project was established to support the development of precision medicine, together with the whole-genome sequencing of 1070 human genomes from individuals in the Miyagi region (Northeast Japan) and the construction of the 1070 Japanese genome reference panel (1KJPN). Here, we investigated the performance of 1KJPN for genotype imputation of Japanese samples not included in the TMM project and compared it with other population reference panels. RESULTS: We found that the 1KJPN population was more similar to other Japanese populations, Nagahama (south-central Japan) and Aki (Shikoku Island), than to East Asian populations in the 1000 Genomes Project other than JPT, suggesting that the large-scale collection (more than 1000) of Japanese genomes from the Miyagi region covered many of the genetic variations of Japanese in mainland Japan. Moreover, 1KJPN outperformed the phase 3 reference panel of the 1000 Genomes Project (1KGPp3) for Japanese samples, and IKJPN showed similar imputation rates for the TMM and other Japanese samples for SNPs with minor allele frequencies (MAFs) higher than 1%. CONCLUSIONS: 1KJPN covered most of the variants found in the samples from areas of the Japanese mainland outside the Miyagi region, implying 1KJPN is representative of the Japanese population's genomes. 1KJPN and successive reference panels are useful genome reference panels for the mainland Japanese population. Importantly, the addition of whole genome sequences not included in the 1KJPN panel improved imputation efficiencies for SNPs with MAFs under 1% for samples from most regions of the Japanese archipelago.
The Tohoku Medical Megabank Project: Design and Mission 査読有り

Shinichi Kuriyama, Nobuo Yaegashi, Fuji Nagami, Tomohiko Arai, Yoshio Kawaguchi, Noriko Osumi, Masaki Sakaida, Yoichi Suzuki, Keiko Nakayama, Hiroaki Hashizume, Gen Tamiya, Hiroshi Kawame, Kichiya Suzuki, Atsushi Hozawa, Naoki Nakaya, Masahiro Kikuya, Hirohito Metoki, Ichiro Tsuji, Nobuo Fuse, Hideyasu Kiyomoto, Junichi Sugawara, Akito Tsuboi, Shinichi Egawa, Kiyoshi Ito, Koichi Chida, Tadashi Ishii, Hiroaki Tomita, Yasuyuki Taki, Naoko Minegishi, Naoto Ishii, Jun Yasuda, Kazuhiko Igarashi, Ritsuko Shimizu, Masao Nagasaki, Seizo Koshiba, Kengo Kinoshita, Soichi Ogishima, Takako Takai-Igarashi, Teiji Tominaga, Osamu Tanabe, Noriaki Ohuchi, Toru Shimosegawa, Shigeo Kure, Hiroshi Tanaka, Sadayoshi Ito, Jiro Hitomi, Kozo Tanno, Motoyuki Nakamura, Kuniaki Ogasawara, Seiichiro Kobayashi, Kiyomi Sakata, Mamoru Satoh, Atsushi Shimizu, Makoto Sasaki, Ryujin Endo, Kenji Sobue, Masayuki Yamamoto

JOURNAL OF EPIDEMIOLOGY　26　(9)　493-511　2016年9月

DOI： 10.2188/jea.JE20150268 　

ISSN：0917-5040
Erratum to: Induction of the Matrix Metalloproteinase 13 Gene in Bronchial Epithelial Cells by Interferon and Identification of its Novel Functional Polymorphism. 査読有り

Mashimo Y, Sakurai-Yageta M, Watanabe M, Arima T, Morita Y, Inoue Y, Sato K, Nishimuta T, Suzuki S, Watanabe H, Hoshioka A, Tomiita M, Yamaide A, Kohno Y, Okamoto Y, Shimojo N, Hata A, Suzuki Y

Inflammation　39　(3)　963　2016年6月

DOI： 10.1007/s10753-016-0334-2 　

ISSN：0360-3997
Induction of the Matrix Metalloproteinase 13 Gene in Bronchial Epithelial Cells by Interferon and Identification of its Novel Functional Polymorphism (vol 39, pg 949, 2016) 査読有り

Yoichi Mashimo, Mika Sakurai-Yageta, Misa Watanabe, Takayasu Arima, Yoshinori Morita, Yuzaburo Inoue, Kazuki Sato, Toshiyuki Nishimuta, Shuichi Suzuki, Hiroko Watanabe, Akira Hoshioka, Minako Tomiita, Akiko Yamaide, Yoichi Kohno, Yoshitaka Okamoto, Naoki Shimojo, Akira Hata, Yoichi Suzuki

INFLAMMATION　39　(3)　963-963　2016年6月

DOI： 10.1007/s10753-016-0334-2 　

ISSN：0360-3997

eISSN：1573-2576
Xanthohumol inhibits STAT3 activation pathway leading to growth suppression and apoptosis induction in human cholangiocarcinoma cells 査読有り

Hasaya Dokduang, Puangrat Yongvanit, Nisana Namwat, Chawalit Pairojkul, Sakkarn Sangkhamanon, Mika Sakurai Yageta, Yoshinori Murakami, Watcharin Loilome

ONCOLOGY REPORTS　35　(4)　2065-2072　2016年4月

DOI： 10.3892/or.2016.4584 　

ISSN：1021-335X

eISSN：1791-2431
Dynamic Regulation of a Cell Adhesion Protein Complex Including CADM1 by Combinatorial Analysis of FRAP with Exponential Curve-Fitting 査読有り

Mika Sakurai-Yageta, Tomoko Maruyama, Takashi Suzuki, Kazuhisa Ichikawa, Yoshinori Murakami

PLOS ONE　10　(3)　e0116637　2015年3月

DOI： 10.1371/journal.pone.0116637 　

ISSN：1932-6203
Genomic and transcriptional alterations of cholangiocarcinoma 査読有り

Takeshi Ito, Mika Sakurai-Yageta, Akiteru Goto, Chawalit Pairojkul, Puangrat Yongvanit, Yoshinori Murakami

JOURNAL OF HEPATO-BILIARY-PANCREATIC SCIENCES　21　(6)　380-387　2014年6月

DOI： 10.1002/jhbp.67 　

ISSN：1868-6974

eISSN：1868-6982
Trans-Homophilic Interaction of CADM1 Activates PI3K by Forming a Complex with MAGuK-Family Proteins MPP3 and Dlg 査読有り

Shigefumi Murakami, Mika Sakurai-Yageta, Tomoko Maruyama, Yoshinori Murakami

PLOS ONE　9　(2)　e110062　2014年2月

DOI： 10.1371/journal.pone.0082894 　

ISSN：1932-6203
Involvement of miR-214 and miR-375 in malignant features of Non-small-cell lung cancer by down-regulating CADM1 査読有り

Ishimura M, Sakurai-Yageta M, Maruyama T, Ando T, Fukayama M, Goto A, Murakami Y

Journal of Cancer Therapy　3　(4A)　379-387　2012年9月

DOI： 10.4236/jct.2012.324050 　
Aberrant expression of tumor suppressors CADM1 and 4.1B in invasive lesions of primary breast cancer 査読有り

Yuka Takahashi, Miwako Iwai, Taketo Kawai, Atsushi Arakawa, Takeshi Ito, Mika Sakurai-Yageta, Akihiko Ito, Akiteru Goto, Mitsue Saito, Fujio Kasumi, Yoshinori Murakami

BREAST CANCER　19　(3)　242-252　2012年7月

DOI： 10.1007/s12282-011-0272-7 　

ISSN：1340-6868
Expression of a splicing variant of the CADM1 specific to small cell lung cancer 査読有り

Shinji Kikuchi, Miwako Iwai, Mika Sakurai-Yageta, Yumi Tsuboi, Takeshi Ito, Tomoko Maruyama, Hitoshi Tsuda, Yae Kanai, Masataka Onizuka, Yukio Sato, Yoshinori Murakami

CANCER SCIENCE　103　(6)　1051-1057　2012年6月

DOI： 10.1111/j.1349-7006.2012.02277.x 　

ISSN：1347-9032
Aberrations of a cell adhesion molecule CADM4 in renal clear cell carcinoma 査読有り

Masayoshi Nagata, Mika Sakurai-Yageta, Daisuke Yamada, Akiteru Goto, Akihiko Ito, Hiroshi Fukuhara, Haruki Kume, Teppei Morikawa, Masashi Fukayama, Yukio Homma, Yoshinori Murakami

INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER　130　(6)　1329-1337　2012年3月

DOI： 10.1002/ijc.26160 　

ISSN：0020-7136
Transcriptional regulation of the CADM1 gene by retinoic acid during the neural differentiation of murine embryonal carcinoma P19 cells 査読有り

Takeshi Ito, Yuko Williams-Nate, Miwako Iwai, Yumi Tsuboi, Man Hagiyama, Akihiko Ito, Mika Sakurai-Yageta, Yoshinori Murakami

GENES TO CELLS　16　(7)　791-802　2011年7月

DOI： 10.1111/j.1365-2443.2011.01525.x 　

ISSN：1356-9597
Tumor suppressor CADM1 is involved in epithelial cell structure 査読有り

Mika Sakurai-Yageta, Mari Masuda, Yumi Tsuboi, Akihiko Ito, Yoshinori Murakami

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS　390　(3)　977-982　2009年12月

DOI： 10.1016/j.bbrc.2009.10.088 　

ISSN：0006-291X
The interaction of IQGAP1 with the exocyst complex is required for tumor cell invasion downstream of Cdc42 and RhoA 査読有り

Mika Sakurai-Yageta, Chiara Recchi, Gaelle Le Dez, Jean-Baptiste Sibarita, Laurent Daviet, Jacques Camonis, Crislyn D'Souza-Schorey, Philippe Chavrier

JOURNAL OF CELL BIOLOGY　181　(6)　985-998　2008年6月

DOI： 10.1083/jcb.200709076 　

ISSN：0021-9525
Cell adhesion and prostate tumor-suppressor activity of TSLL2/IGSF4C, an immunoglobulin superfamily molecule homologous to TSLC1/IGSF4 査読有り

YN Williams, M Masuda, M Sakurai-Yageta, T Maruyama, M Shibuya, Y Murakami

ONCOGENE　25　(10)　1446-1453　2006年3月

DOI： 10.1038/sj.onc.1209192 　

ISSN：0950-9232
Promoter hypermethylation of the potential tumor suppressor DAL-1/4.1B gene in renal clear cell carcinoma 査読有り

D Yamada, S Kikuchi, YN Williams, M Sakurai-Yageta, M Masuda, T Maruyama, K Tomita, DH Gutmann, T Kakizoe, T Kitamura, Y Kanai, Y Murakami

INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER　118　(4)　916-923　2006年2月

DOI： 10.1002/ijc.21450 　

ISSN：0020-7136
Tumor suppressor in lung cancer (TSLC)1 suppresses epithelial cell scattering and tubulogenesis 査読有り

M Masuda, S Kikuchi, T Maruyama, M Sakurai-Yageta, YN Williams, HP Ghosh, Y Murakami

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY　280　(51)　42164-42171　2005年12月

DOI： 10.1074/jbc.M507136200 　

ISSN：0021-9258
Promoter methylation of DAL-1/4.1B predicts poor prognosis in non-small cell lung cancer 査読有り

S Kikuchi, D Yamada, T Fukami, M Masuda, M Sakurai-Yageta, YN Williams, T Maruyama, H Asamura, Y Matsuno, M Onizuka, Y Murakami

CLINICAL CANCER RESEARCH　11　(8)　2954-2961　2005年4月

DOI： 10.1158/1078-0432.CCR-04-2206 　 10.1158/1078-0432.ccr-04-2206 　

ISSN：1078-0432
Detection of allelic imbalance in the gene expression of hMSH2 or RB1 in lymphocytes from pedigrees of hereditary, nonpolyposis, colorectal cancer and retinoblastoma by an RNA difference plot 査読有り

Yoshinori Murakami, Kana Isogai, Hiroyuki Tomita, Mika Sakurai-Yageta, Tomoko Maruyama, Akio Hidaka, Kiyoshi Nose, Kokichi Sugano, Akihiro Kaneko

Journal of Human Genetics　49　(11)　635-641　2004年11月

DOI： 10.1007/s10038-004-0201-0 　

ISSN：1434-5161
Detection of allelic imbalance in the gene expression of hMSH2 or RB1 in lymphocytes from pedigrees of hereditary, nonpolyposis, colorectal cancer and retinoblastoma by an RNA difference plot 査読有り

Y Murakami, K Isogai, H Tomita, M Sakurai-Yageta, T Maruyama, A Hidaka, K Nose, K Sugano, A Kaneko

JOURNAL OF HUMAN GENETICS　49　(11)　635-641　2004年11月

DOI： 10.1007/s10038-004-0201-0 　

ISSN：1435-232X
Isolation of the mouse Tsll1 and Tsll2 genes, orthologues of the human TSLC1-like genes 1 and 2 (TSLL1 and TSLL2) 査読有り

T Fukami, H Satoh, YN Williams, M Masuda, H Fukuhara, T Maruyama, M Yageta, M Kuramochi, S Takamoto, Y Murakami

GENE　323　11-18　2003年12月

DOI： 10.1016/j.gene.2003.09.018 　

ISSN：0378-1119
Association of a lung tumor suppressor TSLC1 with MPP3, a human homologue of Drosophila tumor suppressor Dlg 査読有り

H Fukuhara, M Masvuda, M Yageta, T Fukami, M Kuramochi, T Maruyama, T Kitamura, Y Murakami

ONCOGENE　22　(40)　6160-6165　2003年9月

DOI： 10.1038/sj.onc.1206744 　

ISSN：0950-9232
Direct association of TSLC1 and DAL-1, two distinct tumor suppressor proteins in lung cancer 査読有り

M Yageta, M Kuramochi, M Masuda, T Fukami, H Fukuhara, T Maruyama, M Shibuya, Y Murakami

CANCER RESEARCH　62　(18)　5129-5133　2002年9月

ISSN：0008-5472
The tumor suppressor protein TSLC1 is involved in cell-cell adhesion 査読有り

M Masuda, M Yageta, H Fukuhara, M Kuramochi, T Maruyama, A Nomoto, Y Murakami

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY　277　(34)　31014-31019　2002年8月

DOI： 10.1074/jbc.M203620200 　

ISSN：0021-9258
Cdc6 requires anchorage for its expression 査読有り

S Jinno, M Yageta, A Nagata, H Okayama

ONCOGENE　21　(11)　1777-1784　2002年3月

DOI： 10.1038/sj/onc/1205249 　

ISSN：0950-9232
Oncogenic cell cycle start control 査読有り

S Jinno, J Lin, M Yageta, H Okayama

MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS　477　(1-2)　23-29　2001年6月

DOI： 10.1016/S0027-5107(01)00092-6 　 10.1016/s0027-5107(01)00092-6 　

ISSN：0027-5107
The adenovirus E1A domains required for induction of DNA rereplication in G(2)/M arrested cells coincide with those required for apoptosis 査読有り

M Yageta, H Tsunoda, T Yamanaka, T Nakajima, Y Tomooka, N Tsuchida, K Oda

ONCOGENE　18　(34)　4767-4776　1999年8月

DOI： 10.1038/sj.onc.1203063 　

ISSN：0950-9232
Effects of wild-type and mutated p53 and Id proteins on the induction of apoptosis by adenovirus E1A, c-Myc, Bax, and Nip3 in p53 null mouse cerebellum cells 査読有り

H Tsunoda, T Terasawa, M Yageta, T Nakajima, Y Tomooka, N Tsuchida, K Oda

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS　255　(3)　722-730　1999年2月

DOI： 10.1006/bbrc.1999.0143 　

ISSN：0006-291X
Suppression of adenovirus E1A-induced apoptosis by mutated p53 is overcome by coexpression with Id proteins 査読有り

T Nakajima, M Yageta, K Shiotsu, K Morita, M Suzuki, Y Tomooka, K Oda

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA　95　(18)　10590-10595　1998年9月

DOI： 10.1073/pnas.95.18.10590 　

ISSN：0027-8424

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MISC 26

東北メディカル・メガバンク計画における遺伝情報返却の課題

濱中洋平, 濱中洋平, 大根田絹子, 布施昇男, 川目裕, 川目裕, 長神風二, 鈴木吉也, 鈴木洋一, 鈴木洋一, 佐藤政文, 平塚真弘, 櫻井美佳, 宇留野晃, 山口由美, 平良摩紀子, 山本雅之, 濱中洋平, 濱中洋平

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集　65th (CD-ROM)　2020年
ゲノムコホート調査参加者に対するゲノム薬理学(PGx)遺伝情報の返却(回付)-PGxの知識・理解に関する調査票解析

大根田絹子, 布施昇男, 川目裕, 川目裕, 長神風二, 鈴木吉也, 鈴木洋一, 鈴木洋一, 佐藤政文, 櫻井美佳, 宇留野晃, 濱中洋平, 平良摩紀子, 平塚真弘, 山本雅之, 山本雅之

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集　65th (CD-ROM)　2020年
AMEDにおけるゲノム医療実現に向けた新たなアプローチ -データシェアリングポリシーの策定とその舞台裏-

三成寿作, 加藤治, 櫻井美佳, 齋藤あき

遺伝子医学MOOK 33号　2018年4月
ゲノムコホート研究に基づく腎臓病学

櫻井美佳, 清元秀泰

腎臓内科・泌尿器科　7　(2)　115-120　2018年2月

ISSN： 2188-9147
細胞接着分子CADM1複合体の動態解明―指数関数あてはめを用いたFRAPデータの解析

伊東剛, 櫻井(八下田, 美佳, 村上善則

35　(5)　2017年3月
「遺伝の仕組み」と「多様性」を学ぶための小児を対象とした遺伝教育ツール開発の取り組み

小林朋子, 小林朋子, 菅原美智子, 石原利乃, 本郷一夫, 相澤弥生, 山口由美, 齋藤さかえ, 田中由佳里, 栗木美穂, 長神風二, 安田純, 櫻井美佳, 栗山進一, 川目裕, 鈴木吉也, 山本雅之, 鈴木洋一, 鈴木洋一

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集　62nd　324　2017年
東北メディカル・メガバンク計画とゲノム研究の展望

櫻井美佳, 清元秀泰

腎臓内科・泌尿器科　5　(1)　87-93　2017年1月

ISSN： 2188-9147
肺腺がん細胞の実験的転移系を用いた転移関連分子の同定と機能解析

熊谷友紀, 伊東剛, 永田政義, 川合剛人, 丸山智子, 櫻井美佳, 八下田, 後藤明輝, 松原大祐, 村上善則

日本癌学会総会記事　74回　J-1269　2015年10月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
Analysis of the role of CADM1 in suppression of lung cancer using Cadm1-deficient mice

Takeshi Ito, Masayoshi Nagata, Taketo Kawai, Mika Sakurai-Yageta, Akihiko Ito, Akiteru Goto, Daisuke Matsubara, Yoshinori Murakami

CANCER RESEARCH　75　2015年8月

DOI： 10.1158/1538-7445.AM2015-2302 　

ISSN： 0008-5472

eISSN： 1538-7445
Trans-Homophilic Interaction of CADM1 Activates PI3K by Forming a Complex with MAGuK-Family Proteins MPP3 and Dlg (vol 9, e82894, 2014)

S. Murakami, M. Sakurai-Yageta, T. Maruyama, Y. Murakami

PLOS ONE　9　(9)　2014年9月

DOI： 10.1371/journal.pone.0110062 　

ISSN： 1932-6203
遺伝子欠損マウスを用いたCADM1の肺腫瘍抑制における役割の解明(Analysis of the role of CADM1 in suppression of lung cancer using Cadm1-deficient mice)

伊東剛, 永田政義, 川合剛人, 丸山智子, 櫻井美佳, 八下田, 伊藤彰彦, 後藤明輝, 松原大祐, 村上善則

日本癌学会総会記事　73回　P-2021　2014年9月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
肺腺がん細胞株の実験的肺転移における遺伝子発現変動を指標として抽出される転移関連因子の探索(Screening of metastasis-related genes by microarray analysis of lung cancer cells using experimental lung metastasis)

熊谷友紀, 伊東剛, 永田政義, 川合剛人, 丸山智子, 櫻井美佳, 八下田, 後藤明輝, 松原大祐, 村上善則

日本癌学会総会記事　73回　P-3133　2014年9月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
EXPRESSION OF A SPLICING VARIANT OF THE CADM1 SPECIFIC TO SMALL CELL LUNG CANCER

Shinji Kikuchi, Miwako Iwai, Mika Sakurai-Yageta, Yumi Tsuboi, Takeshi Ito, Tomoko Maruyama, Hitoshi Tsuda, Yae Kanai, Yukinobu Goto, Mitsuaki Sakai, Masataka Onizuka, Yukio Sato, Yoshinori Murakami

JOURNAL OF THORACIC ONCOLOGY　8　S754-S754　2013年11月

ISSN： 1556-0864

eISSN： 1556-1380
遺伝子欠損マウスを用いたCADM1の肺腫瘍抑制における役割の解明(Analysis of the role of CADM1 in suppression of lung cancer development using Cadm1-deficient mice)

伊東剛, 永田政義, 川合剛人, 丸山智子, 櫻井美佳, 八下田, 伊藤彰彦, 後藤明輝, 松原大祐, 村上善則

日本癌学会総会記事　71回　246-246　2012年8月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
肺腺がんのEGFR-TK阻害剤に対する耐性獲得における細胞接着分子CADM1の役割(Possible involvement of a cell adhesion molecule, CADM1 in acquired resistance of lung adenocarcinoma to EGFR-TKIs)

桑野秀規, 岩井美和子, 川合剛人, 伊東剛, 桜井美佳, 八下田, 後藤明輝, 小泉史明, 中島淳, 田村研治, 村上善則

日本癌学会総会記事　71回　442-442　2012年8月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
がん研究への病理学の新しい関わり方分子病理学的解析が示す細胞接着分子CADM1のヒト肺癌における抑制、促進両面の役割(Concurrent integration of pathology and cancer research Dual roles of a cell adhesion molecule, CADM1, in lung oncogenesis based on the molecular pathological analyses)

村上善則, 桜井美佳, 伊東剛, 桑野秀規, 松原大祐, 後藤明輝

日本癌学会総会記事　71回　450-450　2012年8月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
肺腺がん細胞株の実験的肺転移における遺伝子発現変動を指標として抽出される転移関連因子の探索(Screening of metastasis-related genes by microarray analysis of lung cancer cells using experimental lung metastasis)

熊谷友紀, 伊東剛, 永田政義, 川合剛人, 丸山智子, 櫻井美佳, 八下田, 後藤明輝, 村上善則

日本癌学会総会記事　71回　487-487　2012年8月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
肝吸虫関連および非関連肝内胆管癌におけるCADM1の発現日本及びタイ症例の比較研究(Loss of CADM1 expression in cholangiocarcinoma related and unrelated to liver fluke infection)

後藤明輝, 櫻井美佳, 八下田, Pairojkul Chawalit, Yongvanit Puangrat, 柴原純二, 深山正久, 村上善則

日本癌学会総会記事　70回　303-303　2011年9月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
乳がんの進展、再発に関わる細胞接着分子CADM1、並びに新規分子標的の解析(Identification of molecular targets involved in the progression and recurrence of breast cancer)

村上善則, 高橋由佳, 岩井美和子, 荒川敦, 伊東剛, 櫻井美佳, 八下田, 伊藤彰彦, 後藤明輝, 伊東紀子, 江見充, 齋藤光江, 霞富士雄

日本癌学会総会記事　70回　215-215　2011年9月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
miR-375およびmiR-214/199aによるCADM1の発現抑制とそのがん化への関与(Suppression of CADM1 expression by miR-375 and miR-214/199a and its role in tumorigenesis)

石村恵, 櫻井美佳, 八下田, 後藤明輝, 村上善則

日本癌学会総会記事　70回　269-269　2011年9月
出版者・発行元：日本癌学会
ISSN： 0546-0476
Spontaneous development of lung adenocarcinoma in the CADM1 gene-deficient mice. 査読有り

Nagata M, Sakurai-Yageta M, Yamada D, Kawai T, Tsuboi Y, Ito T, Ito A, Yoshida M, Murakami Y

BMC Proceedings　2010年9月

DOI： 10.1186/1753-6561-4-s2-o18 　
DISRUPTION OF CDM4-4.1B CASCADE OF CELL ADHESION IN RENAL CLEAR CELL CARCINOMA

Masayoshi Nagata, Mika Sakurai-Yageta, Daisuke Yamada, Akihiko Ito, Haruki Kume, Teppei Morikawa, Yoshinori Murakami, Yukio Homma

JOURNAL OF UROLOGY　183　(4)　E141-E142　2010年4月

DOI： 10.1016/j.juro.2010.02.424 　

ISSN： 0022-5347

eISSN： 1527-3792
Spontaeous development of lung adenocarcinoma in mice lacking the tumor suppressor gene, CADM1/TSLC1

Yoshinori Murakami, Masayoshi Nagata, Daisuke Yamada, Mika Sakurai-Yageta, Miwako Iwai, Takashi Obana, Taketo Kawai, Mari Masuda, Yumi Tsuboi, Hiromi Ichihara, Tomoko Maruyama, Akihiko Ito

CANCER RESEARCH　69　2009年5月

ISSN： 0008-5472

eISSN： 1538-7445
Promoter methylation of the DAL-1/4.1B predicts poor prognosis in non-small cell lung cancer

S Kikuchi, D Yamada, M Masuda, M Sakurai-Yageta, YN Williams, T Maruyama, H Asamura, Y Matsuno, M Onizuka, Y Murakami

LUNG CANCER　49　S130-S130　2005年7月

ISSN： 0169-5002
TSLC1 affects HGF-induced cell motility of epithelial cells

Mari Masuda, Mika Sakurai-Yageta, Yuko N. Williams, Tomoko Maruyama, O. Yoshinori Murakami

CELL STRUCTURE AND FUNCTION　29　28-28　2004年5月

ISSN： 0386-7196

eISSN： 1347-3700
Association of a lung tumor suppressor TSLC1 with MPP3, a human homologue of Drosophila tumor suppressor Dlg (vol 22, pg 6160, 2003)

H Fukuhara, M Masuda, M Yageta, T Fukami, M Kuramochi, T Maruyama, T Kitamura, Y Murakami

ONCOGENE　23　(2)　629-629　2004年1月

DOI： 10.1038/sj.onc.1207365 　

ISSN： 0950-9232

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共同研究・競争的資金等の研究課題 10

気道の炎症性疾患におけるビオチン輸送の役割

櫻井美佳

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

研究機関：Tohoku University

2023年4月1日～ 2026年3月31日

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申請者らはこれまで、ビオチンと気管支喘息やスギ花粉症を含む気道の炎症性疾患との関連を示してきた。また、ビオチンは、腸管上皮細胞の頂端膜面よりSMVT/SLC5A6輸送体を介して生体内に取り込まれるが、腸管特異的にこの輸送体の機能を欠如することにより、同部位での炎症誘発が報告されている。一方、取り込まれたビオチンを他の細胞・組織に輸送するのに必要な側基底膜面のビオチン輸送体は同定されておらず、ビオチンの気道への輸送制御およびそれが炎症に及ぼす影響は明らかになっていない。そこで本研究では、側基底膜面のビオチン輸送体を同定することにより全身へのビオチン輸送機構を明らかにし、さらに、その気道炎症における役割を解明することを目的とする。このため、ビオチン欠乏やSMVT発現抑制下での網羅的な遺伝子発現解析、およびSLC、ABC輸送体の中から候補遺伝子を選抜し、それらの発現を抑制した場合のビオチン輸送や細胞構造への影響から、側基底膜面のビオチン輸送体の同定を行う。本年度は、ビオチンの側基底膜面の輸送体を同定するため、種々の細胞をビオチン欠乏、また頂端膜面の輸送体であるSMVT発現抑制下で培養し、膜タンパク質をコードし、かつ発現量が変化する遺伝子の探索を試みた。数日間のビオチン欠乏培養やSMVTの抑制により細胞の増殖や形態に影響を及ぼす細胞株、またビオチン欠乏下でSMVT遺伝子の発現変化を示す細胞株を選定した。
分子疫学研究による胆のうがんリスク要因の解明

菊地正悟, 上野誠, 中杤昌弘, 笹平直樹, 米澤英雄, 櫻井美佳, 大崎敬子

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Aichi Medical University

2021年4月1日～ 2024年3月31日

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胆のうがんの発がん要因は何か、慢性感染症・生活習慣など環境要因や遺伝的要因は相互にどのように影響し合いながら胆のうの発がんに作用しているかを明らかにする研究である。 1. 遺伝子については、IL1-βなど炎症反応関連遺伝子、喫煙の影響に関連する遺伝子（CYP1A1、GSTなど）、アルコール代謝関連遺伝子（ADH, ALDH2）、肥満関連遺伝子 (FTO) などや、応募者らの研究で膵がんとの関連が明らかになったGP2遺伝子に加え、これまで他部位のがんリスクとの関連が明らかになっている遺伝子を中心に、炎症、解毒・代謝系に関わる遺伝子をリストアップを進めている。 2. GWASは、当初業者委託を予定していたが、データベースの利用などを考慮し、櫻井（分担研究者・東北大学東北メガバンク機構）に加わってもらって実施することとなった。2021年度胆嚢がん検体が155例、対照325例について、GWASの測定を行った。対照は、検出力を考え、余分に測定した。Imputation（測定されなかったSNPの補完）を含めたデータの解析は2022年度に行う計画である。 3. これまで開発したH. bilis とH. hepaticus 抗体で測定した結果を論文として公表した。これらの感染が発がんを促進していることを疑わせる結果であるが、確定的なものとはなっていない。このことから、抗体測定系にについて、改良が必要と考えられ、その方向で研究を進めることとなった。 4. 症例収集施設の倫理委員会等の承認を得て、症例収集を再開している。 5. 班会議をリモートで1回開催した。
GWASで同定した新規膵がん感受性遺伝子GP2に関する分子遺伝疫学研究

林櫻松, 中杤昌弘, 櫻井美佳

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Aichi Medical University

2021年4月1日～ 2024年3月31日

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① GP2 遺伝子多型と生活習慣の関連：愛知医大が主導で行っている多施設膵がん症例対照研究により収集した膵がん620例とコントロール400例を対象として、GP2の原因候補遺伝子多型であるrs78193826とBMI、糖尿病の関連を検討した。rs78193826多型がCC型の人のBMI平均値は22.9±3.3、CTまたはTT型の人の平均値は22.8±3.0と両者の間に統計学的有意差が認められなかった。一方で、CC型と比べて、CTまたはTT型を持つ人で糖尿病の割合が有意に高い(14.8% 対 22.8%)ことが明らかになった。 <BR> ② ファインマッピングでは、GP2領域の原因候補遺伝子多型を絞りこむために、アメリカNCI PanScan (膵がんコンソーシアム)及びPanc4 (膵がん症例対照研究コンソーシアム）と共同研究契約を締結し、膵がん症例約8000例、コントロール約10000人のサマリーデータを入手した。 <BR> <BR> ③ GP2領域のターゲットリシーケンシングについては、理研ジェネシスなど2社に見積もりを依頼したが、本研究課題の予算では実施困難と判明した。また、文部科学省「先進ゲノム支援」に申請したものの、採択に至らなかった。
左室駆出率が保持された心不全に対する個別化医療を目指した多分野融合研究

安斉俊久, 永井利幸, 小川貴弘, 横田勲, 清水厚志, 平田健司, 小柴生造, 櫻井美佳

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：Hokkaido University

2020年4月1日～ 2024年3月31日

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HFpEF計500症例を目標に以下の組み入れ基準・除外基準で北海道大学病院を含む全国24施設からElectronic Data Captureシステムを用いて詳細な臨床情報を含めて登録し、各種解析を並行して実施した。組み入れ基準：外来もしくは入院心不全症例：①20歳以上でフラミンガム心不全診断基準を満足する心不全症状/所見があり、②左室駆出率50％以上かつBNP値100pg/mLを超えるもしくはN末端proBNP値400 pg/mLを超える、③本人からの文書同意が可能。除外基準：①敗血症、②心筋炎、③閉塞型肥大型心筋症、④拘束型心筋症、⑤重度の弁膜症、⑥心臓移植後あるいは待機、⑦1か月以内の予定心臓手術各種解析：①心不全マルチバイオマーカー解析 ②アレイ（ゲノムワイド関連）解析 ③網羅的メタボローム解析 ④人工知能解析今年度は昨年度に引き続き、上記基準に該当する心不全症例の登録を開始してきた。令和4年3月末の時点で、目標症例数を超えるHFpEF664例の登録が得られ、バイオマーカー、アレイ、メタボローム解析も完了した。また、歩行動画の統一条件撮影に関しては昨年度特許申請に至った撮影アプリケーションを用いて現在歩行動画が回収できた192例に対し、歩行パターンの機械学習によるクラスター解析を行っており、教師なし学習で臨床医が判定した臨床フレイルスケールを高い弁別能で予測出来ることに加え、予後との関連も明らかになりつつある。
ビオチン代謝によるアレルギー性気道炎症の制御メカニズムの解明競争的資金

櫻井美佳

2016年4月～ 2019年3月
細胞コンテクスト依存的細胞接着分子機能の解析に基づく、固形がんの個性診断法の開発

村上善則, 松原大祐, 後藤明輝, 櫻井美佳

提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

研究機関：The University of Tokyo

2013年4月1日～ 2016年3月31日

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増殖因子HGFの受容体METは、様々ながんで遺伝子増幅、過剰発現等の活性化により、がん遺伝子として作用し、がん細胞の増殖や上皮間葉転換、薬剤抵抗性の獲得を促進する。申請者らは、細胞接着分子CADM1が細胞膜ラフト上でMETと複合体を形成し、そのシグナルを抑制することを見出した。さらに、CADM1は多くのがんで不活化していることから、METが活性化しCADM1が不活化したある種のがん細胞において、CADM1を実験的に導入、発現させることによりMETシグナルが抑制されることを見出した。CADM1は、がん細胞の悪性化を抑制する新たな分子標的と考えられる。
生体イメージングを用いた細胞接着分子CADM1のがん化における役割の解析競争的資金

櫻井美佳

2012年4月～ 2015年3月
細胞接着分子群の解析に基づく、がんの個性診断法の開発競争的資金

村上善則

2010年4月～ 2013年3月
Ig様接着分子CADM1による細胞間接着と浸潤における動態と下流分子経路の解明競争的資金

櫻井美佳

2009年4月～ 2012年3月
がん関連遺伝子の構造、発現、機能解析によるがんの分子診断と病態の解明競争的資金

村上善則

2005年4月～ 2010年3月

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