研究者詳細

顔写真

オマ　ユカコ
尾間　由佳子
Yukako Oma
所属
大学院農学研究科　教員共通
職名
助教
学位

  • 博士（農学） （東北大学）

経歴 1

  • 2025年10月 ～ 継続中
    東北大学　大学院農学研究科　助教

研究分野 3

  • ライフサイエンス / 応用分子細胞生物学 /

  • ライフサイエンス / 応用生物化学 /

  • ライフサイエンス / 分子生物学 /

論文 27

  1. Lipids Contribute to Heterochromatin Condensation Revealed by Quantitative Raman–Brillouin Microscopy 国際誌

    Masato Machida, Shinji Kajimoto, Ren Shibuya, Mayu Isono, Mai Watabe, Yukako Oma, Kayo Hibino, Kentaro Fujii, Masaki Okumura, Masahiko Harata, Atsushi Shibata, Takakazu Nakabayashi

    JACS Au　6　(5)　2798-2809　2026年4月24日

    出版者・発行元： American Chemical Society (ACS)

    DOI： 10.1021/jacsau.6c00082 　

    ISSN：2691-3704

    eISSN：2691-3704

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    Chromatin is a dynamic, higher-order structure that compacts genomic DNA within the nucleus and regulates genome organization and accessibility. Chromatin is broadly classified into transcriptionally inert heterochromatin and active euchromatin based on their condensation states; however, the molecular basis underlying this condensation difference remains unresolved. In this study, we show that phosphatidylcholine-type lipid molecules are associated with heterochromatin in living cells and contribute to its physical condensation. Using label-free Raman-Brillouin microscopy, we simultaneously mapped molecular concentrations and high-frequency viscoelastic properties in a living cell at subcellular resolution. Raman imaging revealed that lipid molecules are selectively enriched in heterochromatin, and their local concentrations are correlated with the mechanical response of heterochromatin. These lipids were absent from mitotic chromosomes and reappeared in DNA-rich regions during the early G1 phase, indicating that lipid incorporation is a regulated step in the formation of heterochromatin. These results expand the molecular view of chromatin and demonstrate how simultaneous Raman-Brillouin imaging can link chemical constituents with the mechanical properties of a cell.

  2. Application of the auxin-inducible degron 2 (AID2) system to analyze stage-specific roles of the histone variant H2A.Z during development of C. elegans. 国際誌

    Natsumi Horii, Saho Kitagawa, Yukako Oma, Nami Haruta, Asako Sugimoto, Masato Kanemaki, Masahiko Harata

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry　90　(3)　378-383　2025年12月31日

    DOI： 10.1093/bbb/zbaf200 　

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    Multiple roles of the evolutionarily conserved histone variant H2A.Z in development have been proposed. However, conventional H2A.Z knockouts cause embryonic lethality. Here, we developed a transient depletion system for H2A.Z in Caenorhabditis elegans using an auxin-inducible degron and demonstrated its contribution to germline differentiation at early developmental stages. This system can be applied to investigate temporal protein functions during development.

  3. Common and distinct roles of the isoforms of histone variant H2A.Z in transcriptional regulation

    Daisuke Takahashi, Noboru Ogihara, Ma-Sayuki Kusakabe, Saho Kitagawa, Yukako Oma, Masahiko Harata

    Biopolymers and Cell　35　(3)　197　2019年

    出版者・発行元： National Academy of Sciences of Ukraine

    DOI： 10.7124/bc.0009CE 　

    ISSN：1993-6842 0233-7657

  4. Distinct roles of ATM and ATR in the regulation of ARP8 phosphorylation to prevent chromosome translocations 国際誌 査読有り

    Sun Jiying, Shi Lin, Kinomura Aiko, Fukuto Atsuhiko, Horikoshi Yasunori, Oma Yukako, Harata Masahiko, Ikura Masae, Ikura Tsuyoshi, Kanaar Roland, Tashiro Satoshi

    ELIFE　7　2018年5月8日

    DOI： 10.7554/eLife.32222 　

    ISSN：2050-084X

  5. Actin Family Proteins in the Human IN080 Chromatin Remodeling Complex Exhibit Functional Roles in the Induction of Heme Oxygenase-1 with Hemin 国際誌 査読有り

    Yuichiro Takahashi, Hirokazu Murakami, Yusuke Akiyama, Yasutake Katoh, Yukako Oma, Hitoshi Nishijima, Kei-ichi Shibahara, Kazuhiko Igarashi, Masahiko Harata

    FRONTIERS IN GENETICS　8　17-17　2017年2月

    DOI： 10.3389/fgene.2017.00017 　

    ISSN：1664-8021

  6. Quantitative regulation of histone variant H2A.Z during cell cycle by ubiquitin proteasome system and SUMO-targeted ubiquitin ligases 国際誌 査読有り

    Daisuke Takahashi, Yuki Orihara, Saho Kitagawa, Masayuki Kusakabe, Takahiro Shintani, Yukako Oma, Masahiko Harata

    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY　81　(8)　1557-1560　2017年

    DOI： 10.1080/09168451.2017.1326087 　

    ISSN：0916-8451

    eISSN：1347-6947

  7. Involvement of the perinuclear anchorage of DNA double-strand break in damage-induced sister chromatid cohesion 査読有り

    Yukako Oma, Yuki Orihara, Tatsunori Konishi, Chihiro Horigome, Susan M. Gasser, Masahiko Harata

    GENES & GENETIC SYSTEMS　90　(6)　402-402　2015年12月

    ISSN：1341-7568

    eISSN：1880-5779

  8. DNA Binding Properties of the Actin-Related Protein Arp8 and Its Role in DNA Repair 国際誌 査読有り

    Akihisa Osakabe, Yuichiro Takahashi, Hirokazu Murakami, Kenji Otawa, Hiroaki Tachiwana, Yukako Oma, Hitoshi Nishijima, Kei-ich Shibahara, Hitoshi Kurumizaka, Masahiko Harata

    PLOS ONE　9　(10)　e108354　2014年10月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0108354 　

    ISSN：1932-6203

  9. SWR1 and INO80 Chromatin Remodelers Contribute to DNA Double-Strand Break Perinuclear Anchorage Site Choice 国際誌 査読有り

    Chihiro Horigome, Yukako Oma, Tatsunori Konishi, Roger Schmid, Isabella Marcomini, Michael H. Hauer, Vincent Dion, Masahiko Harata, Susan M. Gasser

    MOLECULAR CELL　55　(4)　626-639　2014年8月

    DOI： 10.1016/j.molcel.2014.06.027 　

    ISSN：1097-2765

    eISSN：1097-4164

  10. Roles of actin-related proteins in chromatin function and nuclear organization 査読有り

    Oma Y, Yamazaki S, Hozak P, Harata M

    Molecular Biology of the Cell　24　2013年

  11. Actin-related proteins localized in the nucleus From discovery to novel roles in nuclear organization 国際誌 査読有り

    Yukako Oma, Masahiko Harata

    NUCLEUS-AUSTIN　2　(1)　38-46　2011年1月

    DOI： 10.4161/nucl.2.1.14510 　

    ISSN：1949-1034

  12. 染色体転座形成におけるDSBs修復関連タンパク質の役割 国際誌 査読有り

    孫 継英, 尾間 由佳子, 原田 昌彦, 河野 一輝, 島 弘季, 木野村 愛子, 井倉 毅, 鈴木 秀和, 水谷 修紀, Kanaar Roland, 田代 聡

    日本放射線影響学会大会講演要旨集　5　(10)　e13554-218　2010年10月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0013554 　

    ISSN：1932-6203

  13. Actin-Related Protein Arp6 Influences H2A.Z-Dependent and -Independent Gene Expression and Links Ribosomal Protein Genes to Nuclear Pores 国際誌 査読有り

    Takahito Yoshida, Kenji Shimada, Yukako Oma, Veronique Kalck, Kazumi Akimura, Angela Taddei, Hitoshi Iwahashi, Kazuto Kugou, Kunihiro Ohta, Susan M. Gasser, Masahiko Harata

    PLOS GENETICS　6　(4)　e1000910　2010年4月

    DOI： 10.1371/journal.pgen.1000910 　

    ISSN：1553-7404

  14. The human actin-related protein hArp5: Nucleo-cytoplasmic shuttling and involvement in DNA repair 国際誌 査読有り

    Kumiko Kitayama, Mariko Kamo, Yukako Oma, Ryo Matsuda, Takafumi Uchida, Tsuyoshi Ikura, Satoshi Tashiro, Takashi Ohyama, Barbara Winsor, Masahiko Harata

    EXPERIMENTAL CELL RESEARCH　315　(2)　206-217　2009年1月

    DOI： 10.1016/j.yexcr.2008.10.028 　

    ISSN：0014-4827

  15. Ino80 chromatin remodeling complex promotes recovery of stalled replication forks 国際誌 査読有り

    Kenji Shimada, Yukako Oma, Thomas Schleker, Kazuto Kugou, Kunihiro Ohta, Masahiko Harata, Susan M. Gasser

    CURRENT BIOLOGY　18　(8)　566-575　2008年4月

    DOI： 10.1016/j.cub.2008.03.049 　

    ISSN：0960-9822

  16. [Nuclear structure: its molecular basis and dynamics]. 査読有り

    Harata M, Kitayama K, Oma Y

    Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme　51　(6 Suppl)　591-599　2006年5月

    ISSN：0039-9450

  17. Vertebrate Arp6, a novel nuclear actin-related protein, interacts with heterochromatin protein 1 国際誌 査読有り

    Eri Ohfuchi, Megumi Kato, Mitsuho Sasaki, Kenji Sugimoto, Yukako Oma, Masahiko Harata

    EUROPEAN JOURNAL OF CELL BIOLOGY　85　(5)　411-421　2006年5月

    DOI： 10.1016/j.ejcb.2005.12.006 　

    ISSN：0171-9335

  18. Nuclear actin-related proteins involved in the organization of euchromatin and heterochromatin 査読有り

    Masahiko Harata, Eri Ohfuchi, Yukako Oma

    DNA Structure, Chromatin and Gene Expression, 2006　181-191　2006年

  19. Sequence and comparative genomic analysis of actin-related proteins

    J Muller, Y Oma, L Vallar, E Friederich, O Poch, B Winsor

    MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL　16　(12)　5736-5748　2005年12月

    DOI： 10.1091/mbc.E05-06-0508 　

    ISSN：1059-1524

    eISSN：1939-4586

  20. Sequence and comparative genomic analysis of actin-related proteins 国際誌 査読有り

    J Muller, Y Oma, L Vallar, E Friederich, O Poch, B Winsor

    MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL　16　(12)　5736-5748　2005年12月

    DOI： 10.1091/mbc.E05-06-0508 　

    ISSN：1059-1524

    eISSN：1939-4586

  21. The nuclear actin-related protein Act3p/Arp4p is involved in the dynamics of chromalin-modulating complexes 国際誌 査読有り

    R Sunada, Gorzer, I, Y Oma, T Yoshida, N Suka, U Wintersberger, M Harata

    YEAST　22　(10)　753-768　2005年7月

    DOI： 10.1002/yea.1239 　

    ISSN：0749-503X

  22. Functions of the actin-related protein Arp4 of Sacchaomyces cerevisiae in the nucleus: its ATP and histone binding ability 査読有り

    OMasahiko Harata, Yukako Oma, Rie Sunada

    CELL STRUCTURE AND FUNCTION　29　71-71　2004年5月

    ISSN：0386-7196

    eISSN：1347-3700

  23. The brain-specific actin-related protein ArpN alpha interacts with the transcriptional co-repressor CtBP 国際誌 査読有り

    Y Oma, K Nishimori, M Harata

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS　301　(2)　521-528　2003年2月

    DOI： 10.1016/S0006-291X(02)03073-5 　

    ISSN：0006-291X

  24. Brain-specific expression of the nuclear actin-related protein ArpN alpha and its involvement in mammalian SWI/SNF chromatin remodeling complex 国際誌 査読有り

    Y Kuroda, Y Oma, K Nishimori, T Ohta, M Harata

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS　299　(2)　328-334　2002年11月

    DOI： 10.1016/S0006-291X(02)02637-2 　

    ISSN：0006-291X

  25. Correlation between chromatin association and transcriptional regulation for the Act3p/Arp4 nuclear actin-related protein of Saccharomyces cerevisiae 国際誌 査読有り

    M Harata, Y Zhang, DJ Stillman, D Matsui, Y Oma, K Nishimori, R Mochizuki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH　30　(8)　1743-1750　2002年4月

    DOI： 10.1093/nar/30.8.1743 　

    ISSN：0305-1048

    eISSN：1362-4962

  26. Multiple actin-related proteins of Saccharomyces cerevisiae are present in the nucleus

    Masahiko Harata, Yukako Oma, Teruko Tabuchi, Yan Zhang, David J. Stillman, Shigeki Mizuno

    Journal of Biochemistry　128　(4)　665-671　2000年

    DOI： 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022799 　

    ISSN：0021-924X

  27. The nuclear actin-related protein of Saccharomyces cerevisiae, Act3p/Arp4, interacts with core histones

    Masahiko Harata, Yukako Oma, Shigeki Mizuno, Yi Wei Jiang, David J. Stillman, Ulrike Wintersberger

    Molecular Biology of the Cell　10　(8)　2595-2605　1999年

    出版者・発行元： American Society for Cell Biology

    DOI： 10.1091/mbc.10.8.2595 　

    ISSN：1059-1524

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MISC 16

  1. 発生初期でのヒストンバリアントH2A.Z可逆的ノックダウンによる生殖腺および形態形成への影響解析

    堀井菜摘, 北川紗帆, 尾間由佳子, 春田奈美, 鐘巻将人, 原田昌彦

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　48th　2025年

  2. 線虫C.elegansにおけるH2A.Z欠損体の表現型解析:放射光X線イメージングによる可視化

    尾間由佳子, 尾間由佳子, 堀井菜摘, 原田昌彦, 原田昌彦, 原田昌彦, 高山裕貴, 高山裕貴, 高山裕貴

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　48th　2025年

  3. フッ素系不活性溶媒による大腸菌の鉄取込み亢進と増殖促進

    細木亮輔, 井澤克秋, 山重貴久, 川田晃士, 日高將文, 尾間由佳子, 菊池正二郎, 瀬戸山寛之, 廣沢一郎, 原田昌彦

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2024　2024年

    ISSN： 2186-7976

  4. 鉄に着目した,フッ素系不活性溶媒添加による微生物増殖促進メカニズムの解析

    井澤克秋, 細木亮輔, 山重貴久, 川田晃士, 日高將文, 尾間由佳子, 菊池正二郎, 小川雄一, 瀬戸山寛之, 廣沢一郎, 原田昌彦

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　47th　2024年

  5. フッ素系不活性溶媒添加による微生物・細胞増殖促進メカニズム解析

    井澤克秋, 細木亮輔, 山重貴久, 川田晃士, 日高將文, 尾間由佳子, 菊池正二郎, 小川雄一, 瀬戸山寛之, 廣沢一郎, 原田昌彦

    日本農芸化学会東北支部大会プログラム・講演要旨集　158th (CD-ROM)　2023年

  6. DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与

    堀籠智洋, 折原行希, 高橋大輔, 小西辰紀, 尾間由佳子, 島田健士, GASSER Susan M., 原田昌彦

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2021　2021年

    ISSN： 2186-7976

  7. DNA損傷誘導性姉妹染色分体間接着には損傷部位と核膜孔との結合が必要である

    岡田大和, 折原行希, 高橋大輔, 小西辰紀, 尾間由佳子, 島田健士, GASSER Susan M., 原田昌彦, 堀籠智洋

    日本農芸化学会東北支部大会プログラム・講演要旨集　156th (CD-ROM)　2021年

  8. DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着には核膜孔との結合が必要である

    岡田大和, 折原行希, 高橋大輔, 小西辰紀, 尾間由佳子, 原田昌彦, 堀籠智洋

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　44th　2021年

  9. 姉妹染色分体間接着はDNA損傷部位-核膜孔複合体間相互作用により促進される

    尾間由佳子, 折原行希, 高橋大輔, 高橋大輔, 小西辰紀, 原田昌彦

    日本生化学会大会(Web)　93rd　[P-448]　2020年

    出版者・発行元： (公社)日本生化学会

  10. 損傷DNA-核膜孔複合体間相互作用による姉妹染色分体間接着の促進

    尾間由佳子, 尾間由佳子, 折原行希, 高橋大輔, 高橋大輔, 小西辰紀, 原田昌彦

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2020　2020年

    ISSN： 2186-7976

  11. ヒストンバリアントH2A.Zのゲノム導入部位決定機構解析

    高橋大輔, 北川紗帆, 小田有沙, 仮屋園遼, 尾間由佳子, 太田邦史, 原田昌彦

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　43rd　2020年

  12. ヒストンバリアントH2A.Zのクロマチン導入部位決定機構解析

    高橋大輔, 北川紗帆, 小田有沙, 仮屋園遼, 尾間由佳子, 太田邦史, 原田昌彦

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　42nd　2019年

  13. 細胞骨格、核膜と核機能の連係 アクチン関連タンパク質Arp6の核膜との機能的相互作用およびクロマチン核内配置への関与(Interactions of nuclear functions with nuclear envelopes and cytoskeltons Functional association of the actin-related protein Arp6 with the nuclear envelope and contribution to spatial arrangement of chromatin)

    吉田 貴人, 島田 健士, 尾間 由佳子, 秋村 和美, 岩橋 均, 久郷 和人, 太田 邦史, Gasser Susan, 原田 昌彦

    日本細胞生物学会大会講演要旨集　61回　114-114　2009年5月

    出版者・発行元： (一社)日本細胞生物学会

  14. Evolutionarily conserved function of the nuclear actin-related protein Arp5 in the INO80 chromatin remodeling complex

    Y. Oma, K. Kitayama, M. Harata

    FEBS JOURNAL　274　76-76　2007年7月

    ISSN： 1742-464X

  15. A nuclear actin-related protein of Saccharomyces cerevisiae, Act3p/Arp4, is involved in transcriptional regulation.

    Y Oma, R Mochizuki, U Wintersberger, M Harata

    YEAST　18　S77-S77　2001年8月

    ISSN： 0749-503X

  16. Actin-Related Proteins in the Nucleus and Their Involvement in the Function of Chromatin

    Masahiko HARATA, Yukako OMA, Ryo MOCHIZUKI, Shigeki MIZUNO, Laboratory of Molecular Biology Department of Molecular and Cell Biology Division of Life Science Graduate School of Agricultural Science Tohoku University, Laboratory of Molecular Biology Department of Molecular and Cell Biology Division of Life Science Graduate School of Agricultural Science Tohoku University, Laboratory of Molecular Biology Department of Molecular and Cell Biology Division of Life Science Graduate School of Agricultural Science Tohoku University, Laboratory of Molecular Biology Department of Molecular and Cell Biology Division of Life Science Graduate School of Agricultural Science Tohoku University

    Tohoku journal of agricultural research　51　(1)　29-38　2000年9月30日

    ISSN： 0040-8719

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講演・口頭発表等 25

  1. 放射光X線イメージングによる線虫C. elegansヒストンバリアント欠損体の表現型解析

    尾間由佳子, 堀井菜摘, 原田昌彦, 高山裕貴

    日本顕微鏡学会第82回学術講演会　2026年5月26日

  2. 線虫C. elegansにおけるH2A.Z欠損体の表現型解析：放射光X線イメージングによる可視化

    尾間 由佳子1,2、堀井 菜摘1、原田 昌彦1,2,3、高山 裕貴3,1,2 (1. 東北大・院農、2. 東北大・ A-Sync、3. 東北大・ SRIS)

    第48回 日本分子生物学会年会　2025年12月4日

  3. 細胞内アクチンネットワークの三次元 X 線イメージングのための X 線造影ラベルの開発

    葛西 悠太, 尾間 由佳子, 原田 昌彦, 高山 裕貴

    日本顕微鏡学会 第82回学術講演会　2026年5月25日

  4. Development of X-ray fluorescence microscope toward non-destructive nanoscale investigation of phase-separated structures in cell nucleus

    Yosuke Tomioka, Yukako Oma, Masahiko Harata, Yuki Takayama

    The 63rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan　2025年9月25日

  5. Towards the utilization of the new Japanese synchrotron NanoTerasu at Tohoku University for food and agricultural products

    Masahiko Harata, Yuki Takayama, Atsushi Muramatsu, Masafumi Hidaka, Yukako Oma

    PALSA 2025, Advancing Sustainable Agriculture and Food Research　2025年8月22日

  6. Visualization of Spatially Hierarchical Structures in Food and Cells via Coherent X-ray Diffraction Imaging

    Yuki Takayama, Masafumi Hidaka, Yukako Oma, Atsushi Muramatsu, Masahiko Harata

    PALSA 2025, Advancing Sustainable Agriculture and Food Research　2025年8月20日

  7. Synchrotron Radiation-Based Characterization of Food and Agricultural Materials by A-Sync in Tohoku University

    Masafumi Hidaka, Yuki Takayama, Yukako Oma, Atsushi Muramatsu, Masahiko Harata

    PALSA 2025, Advancing Sustainable Agriculture and Food Research　2025年8月20日

  8. Cryogenic X-ray Ptychographic Imaging of Cltured Cells toward Visualization of Hierarchical Structures of Chromatin

    Yuta Kinami, Kurumi Nishimagi, Kosei Harada, Masayoshi Nakasako, Yukako Oma, Masahiko Harata, Yuki Takayama

    21st IUPAB and 62nd BSJ joint congress 2024　2024年6月26日

  9. DNA損傷損傷部位-核膜孔複合体間相互作用の損傷誘導的コヒージョンへの関与

    尾間 由佳子, 折原 行希, 高橋 大輔, 小西 辰紀, 原田 昌彦

    酵母遺伝学フォーラム第52回研究報告会　2019年9月5日

  10. DNA 損傷により誘導される姉妹染色分体間接着へのコヒーシンSUMO化と核膜孔複合体の関与

    尾間 由佳子, 折原 行希, 高橋 大輔, 小西 辰紀, 原田 昌彦

    第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会　2019年6月24日

  11. ヒストンバリアントH2A.Zアイソフォーム間の転写制御における機能の相違 国際会議

    2019年5月23日

  12. ヒストンバリアントH2A.Z のクロマチン導入部位決定機構解析

    高橋大輔, 北川紗帆, 小田有沙, 仮屋園遼, 尾間由佳子, 太田邦史, 原田昌彦

    第36回 染色体ワークショップ / 第17回 核ダイナミクス研究会　2019年1月24日

  13. アクチンファミリータンパク質の細胞核構築への寄与

    2018年12月7日

  14. ヒストンバリアントH2A.Zにおけるがん関連変異の遺伝子破壊細胞を用いた解析

    高橋 大輔, 日下部 将之, 折原 行希, 尾間 由佳子, 原田 昌彦

    第41回日本分子生物学会年会　2018年11月29日

  15. DNA二本鎖切断領域の核膜孔複合体への移行は損傷誘導的姉妹染色分体間接着に寄与する 国際会議

    2018年11月15日

  16. DNA double-strand break relocation to nuclear pore complex contributes to DNA damage-induced sister chromatid cohesion 国際会議

    尾間 由佳子, 折原行希, 高橋大輔, 小西辰紀, 原田昌彦

    The 11th 3R+3C Symposium, Kanazawa, Japan　2018年11月12日

  17. がん細胞で検出されるヒストンバリアントH2A.Z変異体の解析

    成宮 巧, 日下部 将之, 折原 行希, 尾間 由佳子, 原田 昌彦?

    日本農芸化学会東北支部第153回大会　2018年9月23日

  18. DNA損傷修復における細胞核構造の役割：出芽酵母をモデル系とした解析

    尾間由佳子, 折原行希, 高橋大輔, 小西辰紀, 原田昌彦

    農芸化学会 東北・北海道合同支部大会（東北支部第153回大会）　2018年9月22日

  19. DNA損傷誘導的コヒージョンにおけるコヒーシンSUMO化と核膜孔複合体の関与

    尾間由佳子, 折原行希, 高橋大輔, 小西辰紀, 原田昌彦

    酵母遺伝学フォーラム第51回研究報告会　2018年9月10日

  20. ヒストンバリアントH2A.Zの染色体分配への機能：H2A.Zノックアウト細胞における遺伝的相補系の解析 国際会議

    2018年9月5日

  21. コヒーシンSUMO化促進を介した損傷誘導的姉妹染色分体間接着への核膜孔複合体の寄与

    第70回日本細胞生物学会第51回日本発生生物学会合同大会/The Joint Annual Meeting of 51st JSDB and 70th JSCB　2018年6月7日

  22. Contribution of nuclear pore complex to DNA damage-induced sister chromatid cohesion through promoting SUMOylation of cohesin

    〇Yukako Oma, Yuki Orihara, Daisuke Takahashi, Tatsunori Konishi, Masahiko Harata

    第70回日本細胞生物学会第51回日本発生生物学会合同大会　2018年6月6日

  23. 細胞周期におけるヒストンバリアントH2A.Zの量的制御と染色体分配への関与

    高橋 大輔, 日下部 将之, 北川 紗帆, 尾間 由佳子, 原田 昌彦

    生命科学系学会合同年次大会　2017年12月6日

  24. DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着へのSUMO化の関与

    折原行希, 尾間由佳子, 小西辰紀, 堀籠智洋, Susan Gasser, 原田昌彦

    第39回日本分子生物学会年会　2017年11月30日

  25. DNA損傷誘導的な姉妹染色分体接着における核膜孔複合体の関与

    尾間由佳子, 折原行希, 小西辰紀, 堀籠智洋, Susan Gasse, 原田昌彦

    酵母遺伝学フォーラム第50回研究報告会　2017年9月11日

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共同研究・競争的資金等の研究課題 2

  1. DNA損傷修復における細胞核構造とクロマチンの相互作用：その機構解明と人為操作 競争的資金

    尾間 由佳子

    2018年4月 ～ 2021年3月

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    DNA二重鎖切断（DSB）は最も重篤なDNA損傷であり、ゲノム再編成や染色体転座を引き起こし、がんの原因となる。ショウジョウバエや哺乳類の細胞ではヘテロクロマチン領域に生じたDSBが核構造に係留され、相同組換え(HR)を促進することが報告されている。我々はこれまで、出芽酵母においてDSBが核膜近傍へ移行し、核膜孔複合体(NPC)へ係留されることを報告した。この移行に必要なクロマチン構造変換複合体は高等真核生物においても高く保存されていることから、真核生物におけるDSBの核構造への係留のメカニズムとその意義について出芽酵母をモデル系として解析を行った。 これまでに出芽酵母においてDNA損傷により姉妹染色分体間接着が誘導されること、これには接着因子コヒーシンがSUMO化修飾を受けることが必要であることが報告されていた。コヒーシンSUMO化酵素は間接的にNPCと相互作用することから、NPCに係留されたDSB領域のコヒーシンのSUMO化を促進する可能性を考え、その検証を行った。その結果、DSBのNPC移行欠損株ではコヒーシン蓄積量に変化はない一方、姉妹染色分体間接着の誘導低下とコヒーシンのSUMO化の低下が認められた。さらに、コヒーシンSUMO化酵素をDSB近傍へ人為的に結合したところ、姉妹染色分体間接着誘導が回復し、これは非SUMO化コヒーシンの過剰発現により喪失した。また、DSB領域に局在するSUMO化酵素を含む複合体とNPCとの相互作用を阻害した場合も、姉妹染色分体間接着の誘導低下が認められた。これらの結果から、DSBのNPCへの係留により、SUMO化酵素によるコヒーシンのSUMO化修飾が促進され、損傷誘導的コヒージョンの確立と正確なHRを進行させることが示唆された。本研究により、細胞核構造と損傷クロマチンの相互作用の意義の１つとして、細胞核構造がタンパク質の化学修飾の足場となりそれを制御することで、損傷修復の進行に寄与するというメカニズムの1つを提唱することができた。

  2. 核に局在するアクチン関連タンパク質ARP4が形成する複合体の機能とその調節機構

    尾間 由佳子

    2000年 ～ 2002年

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    アクチン関連タンパク質(Arp)はクロマチン構造変換に関わるATP依存的クロマチンリモデリング酵素(ADCR)複合体やヒストンアセチル化酵素(HAT)複合体に最も広く存在する構成因子の1つである。ヒトおよびマウスの細胞核に局在するArp4サブファミリーの2つのアイソフォームArpNα,βのうち、ArpNβは哺乳類SWI/SNFクロマチンリモデリング複合体、P-BAF ADCR複合体、Tip60 HAT複合体、p400 SWI/SNF様複合体、c-Mycコアクチベーター複合体の構成因子であることが報告されている。一方、ArpNαはArpNβと94%の相同性を示すが、ArpNβと異なり脳で特異的に発現が検出されている。ArpNαを含んだタンパク質複合体についてはこれまで報告がなかったが、我々は免疫沈降法によりArpNαもArpNβと同様、哺乳類SWI/SNF複合体の構成因子であることを明らかにした。ArpNαはN末端40-82アミノ酸領域でのみArpNβとの相同性が低いことから、この領域がArpNαに特異的な機能に寄与していると予想し、two-hybrid screeningによりこの領域と相互作用するタンパク質として転写コリプレッサーCtBP1を同定した。哺乳類SWI/SNF複合体はglucocorticoid receptor(GR)による転写活性化に必要であるが、細胞内で発現させたArpNαはCtBP1依存的にGRの転写活性化能を抑制した。一方、このような転写活性化能の抑制はArpNβを発現させた場合には観察されなかった。このことから、脳特異的なArpNαを含むSWI/SNF複合体がArpNβを含む複合体とは異なった遺伝子の発現制御を行うことで、神経細胞の分化や機能に関与している可能性が示唆された。