Details of the Researcher

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Fumi Nagatsugi
Section
Institute of Multidisciplinary Research for Advanced Materials
Job title
Professor
Degree
  • 博士(薬学)(九州大学)

Research History 3

  • 2003 - Present
    Kyushu University School of Pharmaceutical Sciences

  • 1989 - 2002
    Kyushu University School of Pharmaceutical Sciences

  • 1988 - 1989
    Josai University Faculty of Pharmaceutical Sciences

Education 4

  • Kyushu University Graduate School, Division of Pharmaceutical Sciences

    - 1988

  • Kyushu University

    - 1988

  • Kyushu University School of Pharmaceutical Sciences

    - 1986

  • Kyushu University Faculty of Pharmaceutical Science

    - 1986

Committee Memberships 5

  • 日本化学会 生体機能関連化学部会 部会役員

    2019/03 - Present

  • 日本学術会議 連携委員

    2015/10 - Present

  • 有機機合成化学協会 東北支部幹事

    2010/04 - Present

  • 生体機能関連化学部会 部会長

    2023/03 - 2025/02

  • 日本核酸医薬学会 広報担当主幹事

    2015/04 - 2021/03

Professional Memberships 5

  • 核酸化学学会

  • 核酸医薬学会

  • THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN

  • THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN

  • THE SOCIETY OF SYNTHETIC ORGANIC CHEMISTRY, JAPAN

Research Interests 5

  • 架橋反応性核酸

  • 中分子

  • 核酸高次構造

  • オリゴヌクレオチド

  • 遺伝子発現の選択的制御

Research Areas 1

  • Life sciences / Bioorganic chemistry / Nucleic acids chemistry, chemical biology

Awards 2

  1. 日本薬学会 薬学研究ビジョン部会賞

    2007/01 日本薬学会 薬学研究ビジョン部会 「機能性人工核酸を用いた遺伝子発現制御による新しい創薬手法の開発」

  2. 有機合成化学研究企画賞

    1998/12 有機合成化学協会 「遺伝子発現の人工的制御を目指した新しい機能性分子の研究~塩基配列特異的な反応を行う分子の設計と評価」

Papers 95

  1. Generation of abasic sites in DNA by singlet oxygen produced from a photocatalytic reaction

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Okan Altan, Madoka Sasaki, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    2024/12/12

    DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-7m8fx  

  2. Crystallographic analysis of G-clamp–RNA complex assisted by large scale RNA-binding profile Peer-reviewed

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Karen Kawamura, Kosuke Tsuzuki, Hirotaka Murase, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Jiro Kondo, Fumi Nagatsugi

    Chemical Communications 61 1120-1123 2024/12

    DOI: 10.1039/D4CC04677C  

  3. One-pot synthesis of non-canonical ribonucleosides and their precursors from aldehydes and ammonia under prebiotic Earth conditions

    Yuta Hirakawa, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi, Takeshi Kakegawa, Yoshihiro Furukawa

    Geochimica et Cosmochimica Acta 2024/11

    Publisher: Elsevier BV

    DOI: 10.1016/j.gca.2024.11.006  

    ISSN: 0016-7037

  4. Photocatalytic proximity labeling for the identification of G-quadruplex DNA-interacting proteins

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Shinichi Sato, Tatsuki Masuzawa, Keishi Deguchi, Keita Nakane, Zhengyi Liu, Kazuki Kuwahara, Fumi Nagatsugi, Takanori Oyoshi, Kazumitsu Onizuka

    2024/09/03

    DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-909gq  

  5. Michael addition-activated alkylation of G-quadruplex DNA with methylamine-protected vinyl-quinazolinone derivatives. International-journal

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Fumi Nagatsugi

    Bioorganic & medicinal chemistry letters 109 129855-129855 2024/09/01

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2024.129855  

    More details Close

    The role of G-quadruplex (G4) in cellular processes can be investigated by the covalent modification of G4-DNA using alkylating reagents. Controllable alkylating reagents activated by external stimuli can react elegantly and selectively. Herein, we report a chemical activation system that can significantly boost the reaction rate of methylamine-protected vinyl-quinazolinone (VQ) derivative for the alkylation of G4-DNA. The two screened activators can transform low-reactive VQ-NHR' to highly reactive intermediates following the Michael addition mechanism. This approach expands the toolbox of activable G4 alkylating reagents.

  6. Reversible Control of Gene Expression by Guest-Modified Adenosines in a Cell-Free System via Host–Guest Interaction

    Hidenori Okamura, Takeyuki Yao, Fumi Nagatsugi

    Journal of the American Chemical Society 2024/06/28

    Publisher: American Chemical Society (ACS)

    DOI: 10.1021/jacs.4c04262  

    ISSN: 0002-7863

    eISSN: 1520-5126

  7. Uracil‐selective Cross‐linking in RNA and Inhibition of miRNA Function by 2‐Amino‐6‐vinyl‐7‐deazapurine Deoxynucleosides

    Fumi Nagatsugi, Nadya Soemawisastra, Hidenori Okamura, Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Mamiko Ozawa

    ChemBioChem 2024/06/24

    Publisher: Wiley

    DOI: 10.1002/cbic.202400417  

    ISSN: 1439-4227

    eISSN: 1439-7633

    More details Close

    MicroRNAs (miRNAs) regulate gene expression through RNA interference. Consequently, miRNA inhibitors, such as anti‐miRNA oligonucleotides (AMOs), have attracted attention for treating miRNA overexpression. To achieve efficient inhibition, we developed 2‐amino‐6‐vinylpurine (AVP) nucleosides that form covalent bonds with uridine counterparts in RNA. We demonstrated that mRNA cross‐linked with AVP‐conjugated antisense oligonucleotides with AVP were protected from gene silencing by exogenous miRNA. However, endogenous miRNA function could not be inhibited in cells, probably because of slow cross‐linking kinetics. We recently developed ADpVP, an AVP derivative bearing a 7‐propynyl group—which boasts faster reaction rate than the original AVP. Here, we synthesized dADpVP—a deoxy analog of ADpVP—through a simplified synthesis protocol. Evaluation of the cross‐linking reaction revealed that the reaction kinetics of dADpVP were comparable to those of ADpVP. In addition, structural analysis of the cross‐linked adduct discovered N3 linkage against uridine. Incorporating dADpVP into two types of miRNA inhibitors revealed a marginal impact on AMO efficacy yet improved the performance of target site blockers. These results indicate the potential of cross‐linking nucleosides for indirect miRNA function inhibition.

  8. Large-scale analysis of small molecule-RNA interactions using multiplexed RNA structure libraries

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirotaka Murase, Kanna Ojima, Shunya Ishikawa, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    Communications Chemistry 7 (1) 2024/05/01

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI: 10.1038/s42004-024-01181-8  

    eISSN: 2399-3669

    More details Close

    Abstract The large-scale analysis of small-molecule binding to diverse RNA structures is key to understanding the required interaction properties and selectivity for developing RNA-binding molecules toward RNA-targeted therapies. Here, we report a new system for performing the large-scale analysis of small molecule–RNA interactions using a multiplexed pull-down assay with RNA structure libraries. The system profiled the RNA-binding landscapes of G-clamp and thiazole orange derivatives, which recognizes an unpaired guanine base and are good probes for fluorescent indicator displacement (FID) assays, respectively. We discuss the binding preferences of these molecules based on their large-scale affinity profiles. In addition, we selected combinations of fluorescent indicators and different ranks of RNA based on the information and screened for RNA-binding molecules using FID. RNAs with high- and intermediate-rank RNA provided reliable results. Our system provides fundamental information about small molecule–RNA interactions and facilitates the discovery of novel RNA-binding molecules.

  9. Guanidine modification improves functions of natural RNA-targeting alkaloids

    Tamaki Endoh, Sagar Satpathi, Yutong Chen, Saki Matsumoto, Tatsuya Ohyama, Peter Podbevšek, Janez Plavec, Kazumitsu Onizuka, Fumi Nagatsugi, Naoki Sugimoto

    New Journal of Chemistry 48 (19) 8529-8533 2024

    Publisher: Royal Society of Chemistry (RSC)

    DOI: 10.1039/d3nj05833f  

    ISSN: 1144-0546

    eISSN: 1369-9261

    More details Close

    Guanidine modification on berberine improved RNA binding affinity and enhanced suppression of protein expression.

  10. Water‐Dispersible Carbon Nano‐Test Tubes as a Container for Concentrated DNA Molecules

    Yasuto Hoshikawa, Yasuyuki Kanno, Hanako Tawata, Takuya Sagae, Takafumi Ishii, Shuhei Imoto, Shinya Hagihara, Takehiko Wada, Fumi Nagatsugi, Alex Aziz, Hirotomo Nishihara, Takashi Kyotani, Tetsuji Itoh

    Chemistry – A European Journal 29 (53) 2023/08/02

    Publisher: Wiley

    DOI: 10.1002/chem.202301422  

    ISSN: 0947-6539

    eISSN: 1521-3765

    More details Close

    Abstract Water‐dispersible carbon nano‐test tubes (CNTTs) with an inner and outer diameter of about 25 and 35 nm, respectively, were prepared by the template technique and then their inner carbon surface was selectively oxidized to introduce carboxy groups. The adsorption behavior of DNA molecules on the oxidized CNTTs (Ox‐CNTTs) was examined in the presence of Ca2+ cations. Many DNA molecules are attracted to the inner space of Ox‐CNTTs based on the Ca2+‐mediated electrostatic interaction between DNA phosphate groups and carboxylate anions on the inner carbon surface. Moreover, the total net charge of the DNA adsorbed was found to be equal to the total charge of the carboxylate anions. This selective adsorption into the interior of Ox‐CNTTs can be explained from the fact that the electrostatic interaction onto the inner concave surface is much stronger than that on the outer convex surface. On the other hand, the desorption of DNA easily occurs whenever Ca2+ cations are removed by washing with deionized water. Thus, each of Ox‐CNTTs works well as a nano‐container for a large amount of DNA molecules, thereby resulting in the occurrence of DNA enrichment in the nanospace.

  11. Formation of Direction-Controllable Pseudorotaxane and Catenane Using Chemically Cyclized Oligodeoxynucleotides and Their Noncovalent RNA Labeling

    Kazuki Kuwahara, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi, Kazumitsu Onizuka

    Bioconjugate Chemistry 2023/03/17

    Publisher: American Chemical Society (ACS)

    DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.3c00031  

    ISSN: 1043-1802

    eISSN: 1520-4812

  12. Synthesis of 6-Alkynylated Purine-Containing DNA via On-Column Sonogashira Coupling and Investigation of Their Base-Pairing Properties Invited Peer-reviewed

    Hidenori Okamura, Giang Hoang Trinh, Zhuoxin Dong, Wenjue Fan, Fumi Nagatsugi

    Molecules 2023/02/13

    DOI: 10.3390/molecules28041766  

  13. o-Nitrobenzyl oxime ethers enable photo-induced cyclization reac-tion to provide phenanthridines under aqueous conditions

    Hidenori Okamura, Momoka Iida, Yui Kaneyama, Fumi Nagatsugi

    2022/11/24

    Publisher: American Chemical Society (ACS)

    DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-gjn1v  

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    In this paper, we describe a novel N–O photolysis of o-nitrobenzyl oxime ethers that enables the synthesis of phenanthridines via intramolecular cyclization reactions. Without the use of additional photocatalysts or photosensitizers, the process proceeds with an efficiency of up to 96% when exposed to near-visible light (405 nm) under aqueous circumstances. Through the photoinduced production of a fluorescent phenanthridine derivative in HeLa cells, biocompatibility of the reaction was demonstrated. This photoinduced cyclization reaction could be used as a different photochemical instrument to control biological processes by inducing the production of bioactive molecules.

  14. Reactivity Modulation of Reactive OFF–ON Type G-Quadruplex Alkylating Agents

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Fumi Nagatsugi

    Bioconjugate Chemistry 33 (11) 2097-2102 2022/11/16

    Publisher: American Chemical Society (ACS)

    DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00458  

    ISSN: 1043-1802

    eISSN: 1520-4812

  15. Photochemical Labeling of Nucleic Acid by Photocatalyst Tethered DNA Probe

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Madoka Sasaki, Shinichi Sato, Fumi Nagatsugi

    Chemistry Letters 51 (12) 1121-1124 2022/10/21

    Publisher: The Chemical Society of Japan

    DOI: 10.1246/cl.220397  

    ISSN: 0366-7022

    eISSN: 1348-0715

  16. Selective Chemical Modification to the Higher-Order Structures of Nucleic Acids. International-journal

    Fumi Nagatsugi, Kazumitsu Onizuka

    Chemical record (New York, N.Y.) e202200194 2022/09/16

    DOI: 10.1002/tcr.202200194  

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    DNA and RNA can adopt a variety of stable higher-order structural motifs, including G-quadruplex (G4 s), mismatches, and bulges. Many of these secondary structures are closely related to the regulation of gene expression. Therefore, the higher-order structure of nucleic acids is one of the candidate therapeutic targets, and the development of binding molecules targeting the higher-order structure of nucleic acids has been pursued vigorously. Furthermore, as one of the methodologies for detecting the higher-order structures of these nucleic acids, developing techniques for the selective chemical modification of the higher-order structures of nucleic acids is also underway. In this personal account, we focus on the following higher-order structures of nucleic acids, double-stranded DNA containing the abasic site, T-T/U-U mismatch structure, and G-quadruplex structure, and describe the development of molecules that bind to and chemically modify these structures.

  17. Selective and stable base pairing by alkynylated nucleosides featuring a spatially-separated recognition interface International-journal

    Hidenori Okamura, Giang Hoang Trinh, Zhuoxin Dong, Yoshiaki Masaki, Kohji Seio, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Research 50 (6) 3042-3055 2022/04/08

    Publisher: Oxford University Press (OUP)

    DOI: 10.1093/nar/gkac140  

    ISSN: 0305-1048

    eISSN: 1362-4962

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    Abstract Unnatural base pairs (UBPs) which exhibit a selectivity against pairing with canonical nucleobases provide a powerful tool for the development of nucleic acid-based technologies. As an alternative strategy to the conventional UBP designs, which involve utility of different recognition modes at the Watson–Crick interface, we now report that the exclusive base pairing can be achieved through the spatial separation of recognition units. The design concept was demonstrated with the alkynylated purine (NPu, OPu) and pyridazine (NPz, OPz) nucleosides endowed with nucleobase-like 2-aminopyrimidine or 2-pyridone (‘pseudo-nucleobases’) on their major groove side. These alkynylated purines and pyridazines exhibited exclusive and stable pairing properties by the formation of complementary hydrogen bonds between the pseudo-nucleobases in the DNA major groove as revealed by comprehensive Tm measurements, 2D-NMR analyses, and MD simulations. Moreover, the alkynylated purine-pyridazine pairs enabled dramatic stabilization of the DNA duplex upon consecutive incorporation while maintaining a high sequence-specificity. The present study showcases the separation of the recognition interface as a promising strategy for developing new types of UBPs.

  18. Synthesis of Crosslinked 2′‐OMe RNA Duplexes Using 2‐Amino‐6‐Vinylpurine and Their Application for Effective Inhibition of miRNA Function International-journal

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Yu Hirano, Kazumitsu Onizuka, Hidenori Okamura, Yasuo Komatsu, Fumi Nagatsugi

    Current Protocols 2 (3) e386 2022/03

    Publisher: Wiley

    DOI: 10.1002/cpz1.386  

    ISSN: 2691-1299

    eISSN: 2691-1299

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    Crosslinking reactions to nucleic acids are an effective way to prepare stable complexes formed by covalent bonding. We demonstrated that fully 2'-O-methylated (2'-OMe) RNAs having a 2-amino-6-vinylpurine (AVP) exhibited an efficient crosslinking to uracil in the target RNA. Recently, we reported the preparation of crosslinked 2'-OMe RNA duplexes using AVP and the anti-miRNA oligonucleotides (AMOs) containing crosslinked duplexes at the terminal positions. These AMOs exhibited efficient microRNA (miRNA) inhibition at very low concentrations. In this article, we describe the chemical synthesis of 2'-OMe oligonucleotides containing AVP and preparation of the AMOs bearing crosslinked 2'-OMe RNA duplexes using AVP. In addition, we describe in detail the miRNA inhibition assay using these AMOs. © 2022 Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: Synthesis of phosphoramidite of 2-amino-6-vinylguanosine derivative Basic Protocol 2: Synthesis of AVP-2'-OMe RNA Basic Protocol 3: Evaluation of the crosslink reactivity of CFO containing AVP to the 2'-OMe RNA and preparation of AMOs containing crosslinked duplex Basic Protocol 4: miRNA inhibition assays.

  19. Rapid Alkene–Alkene Photo-Cross-Linking on the Base-Flipping-Out Field in Duplex DNA Peer-reviewed

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Kei Ishida, Sayaka Yajima, Eriko Mano, Fumi Nagatsugi

    The Journal of Organic Chemistry 2022/01/02

    Publisher: American Chemical Society (ACS)

    DOI: 10.1021/acs.joc.1c01498  

    ISSN: 0022-3263

    eISSN: 1520-6904

  20. Hybridization-specific chemical reactions to create interstrand crosslinking and threaded structures of nucleic acids

    Kazumitsu Onizuka, Yuuhei Yamano, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    Organic & Biomolecular Chemistry 20 (23) 4699-4708 2022

    Publisher: Royal Society of Chemistry (RSC)

    DOI: 10.1039/d2ob00551d  

    ISSN: 1477-0520

    eISSN: 1477-0539

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    This review introduces the creation of interstrand crosslinking and threaded structures based on the hybridization-specific chemical reactions and their functions and perspectives in oligonucleotide therapeutics, chemical biology and nanotechnology.

  21. Development of a selective ligand for G–G mismatches of CGG repeat RNA inducing the RNA structural conversion from the G-quadruplex into a hairpin-like structure

    Hirotaka Murase, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    Organic & Biomolecular Chemistry 20 (16) 3375-3381 2022

    Publisher: Royal Society of Chemistry (RSC)

    DOI: 10.1039/d2ob00279e  

    ISSN: 1477-0520

    eISSN: 1477-0539

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    A small-molecular G-clamp ligand that converts the G-quadruplex of CGG repeats to a hairpin form has been developed.

  22. Synthesis of crosslinked 2 '-OMe RNA duplexes and their application for effective inhibition of miRNA function

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Yu Hirano, Kazumitsu Onizuka, Hidenori Okamura, Yasuo Komatsu, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 48 2021/09

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2021.128257  

    ISSN: 0960-894X

    eISSN: 1464-3405

  23. Selective alkylation of parallel G-quadruplex structure International-journal

    Kazumitsu Onizuka, Erchissaran Ganbold, Yue Ma, Shogo Sasaki, Madoka E. Hazemi, Yutong Chen, Norihiro Sato, Mamiko Ozawa, Kazuo Nagasawa, Fumi Nagatsugi

    Organic & Biomolecular Chemistry 2021

    Publisher: Royal Society of Chemistry (RSC)

    DOI: 10.1039/d0ob02365e  

    ISSN: 1477-0520

    eISSN: 1477-0539

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    <p>We achieve selective alkylation of parallel G-quadruplex DNA using a conjugate of a macrocyclic hexaoxazole and a sulfoxide precursor to a vinyl-quinazolinone.</p>

  24. Design of the Crosslinking Reactions for Nucleic Acids-Binding Protein and Evaluation of the Reactivity Peer-reviewed

    Kenta Odaira, Ken Yamada, Shogo Ishiyama, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    Applied Sciences 10 (21) 7709-7709 2020/10/30

    Publisher: MDPI AG

    DOI: 10.3390/app10217709  

    eISSN: 2076-3417

    More details Close

    Selective chemical reactions of biomolecules are some of the important tools for investigations by biological studies. We have developed the selective crosslinking reactions to form covalent bonds to DNA or RNA using crosslinking oligonucleotides (CFO) bearing reactive bases. In this study, we designed the cross-linkable 4-amino-6-oxo-2-vinyltriazine derivative with an acyclic linker (acyAOVT) to react with the nucleic acids-binding protein based on our previous results. We hypothesized that the acyAOVT base would form a stable base pair with guanine by three hydrogen bonds at the positions of the vinyl group in the duplex DNA major groove, and the vinyl group can react with the nucleophilic species in the proximity, for example, the cysteine or lysine residue in the nucleic acids-binding protein. The synthesized oligonucleotides bearing the acyAOVT derivative showed a higher reactivity than that of the corresponding pyrimidine derivative without one nitrogen. The duplex containing acyAOVT-guanine (G) formed complexes with Hha1 DNMT even in the presence of 2-mercaptoethanol. We expect that our system will provide a useful tool for the molecular study of nucleic acids-binding proteins.

  25. Functional G-Quadruplex Binding Molecules Invited Peer-reviewed

    Fumi Nagatsugi, Kazumitsu Onizuka

    Chemistry Letters 49 (7) 771-780 2020/07/05

    Publisher: The Chemical Society of Japan

    DOI: 10.1246/cl.200214  

    ISSN: 0366-7022

    eISSN: 1348-0715

  26. Liquid-like droplet formation by tumor suppressor p53 induced by multivalent electrostatic interactions between two disordered domains Peer-reviewed

    Kamagata K, Kanbayashi S, Honda M, Itoh Y, Takahashi H, Kameda T, Nagatsugi F, Takahashi S

    Scientific Reports 10 (1) 580 2020/01

    DOI: 10.1038/s41598-020-57521-w  

    ISSN: 2045-2322

  27. Synthesis of RNA Crosslinking Oligonucleotides Modified with 2-Amino-7-Deaza-7-Propynyl-6-Vinylpurine. Peer-reviewed

    Yamada, K, Abe, Y, Nagatsugi, F

    76 e79-e79 2019/06

  28. Development of the binding molecules for the RNA higher-order structures based on the guaninerecognition by the G-clamp Peer-reviewed

    Murase Hirotaka, Nagatsugi Fumi

    Bioorg.Med. Chem. Lett. 29 (11) 1320-1324 2019/06

  29. Reactive OFF-ON type alkylating agents for higher-ordered structures of nucleic acids Peer-reviewed

    Kazumitsu Onizuka, Madoka E Hazemi, Norihiro Sato, Gen-ichiro Tsuji, Shunya Ishikawa, Mamiko Ozawa, Kousuke Tanno, Ken Yamada, Fumi Nagatsug

    Nucleic Acids Research 47 (26) 6578-6589 2019/05

  30. Alkyne-Alkyne Photo-cross-linking on the Flipping-out Field Peer-reviewed

    Onizuka Kazumitsu, Ishida Kei, Mano Eriko, Nagatsugi Fumi

    Organic Letters 21 (8) 2833-2827 2019/04

  31. Synthesis and Properties of 2'-OMe-RNAs Modified with Cross-Linkable 7-Deazaguanosine Derivatives. Peer-reviewed

    Yamada K, Abe Y, Murase H, Ida Y, Hagihara S, Nagatsugi F

    The Journal of organic chemistry 83 (16) 8851-8862 2018/08

    DOI: 10.1021/acs.joc.8b01002  

    ISSN: 0022-3263

  32. Structural optimization of pseudorotaxane-forming oligonucleotides for efficient and stable complex formation Peer-reviewed

    Onizuka K, Miyashita T, Chikuni, T, Ozawa, M, Abe, H, Nagatsugi, F

    Nucleic Acid Research 46 (17) 8710-8719 2018/08

  33. Vinyldiaminotriazine-acridine conjugate as G-quadruplex alkylating agent Peer-reviewed

    Madoka E. Hazemi, Kazumitsu Onizuka, Tomohito Kobayashi, Akira Usami, Norihiro Sato, Fumi Nagatsugi

    Bioorganic and Medicinal Chemistry 26 (12) 3551-3558 2018/07/23

    Publisher: Elsevier Ltd

    DOI: 10.1016/j.bmc.2018.05.030  

    ISSN: 1464-3391 0968-0896

  34. Thermal E/ Z Isomerization in First Generation Molecular Motors. International-journal Peer-reviewed

    Shunsuke Kuwahara, Yuri Suzuki, Naoya Sugita, Mari Ikeda, Fumi Nagatsugi, Nobuyuki Harada, Yoichi Habata

    The Journal of organic chemistry 83 (8) 4800-4804 2018/04/20

    DOI: 10.1021/acs.joc.7b03264  

    ISSN: 0022-3263

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    Determination of a thermal E/ Z isomerization barrier of first generation molecular motors is reported. Stable ( E)-1a directly converts to stable ( Z)-1c without photochemical E/ Z isomerization. The activation Gibbs energy of the isomerization was determined to be 123 kJ mol-1 by circular dichroism spectral changes. Density functional theory calculations show that ( Z)-1c is ∼11.4 kJ mol-1 more stable than ( E)-1a.

  35. Alkylating probes for the G-quadruplex structure and evaluation of the properties of the alkylated G-quadruplex DNA. International-journal Peer-reviewed

    Norihiro Sato, Shuntaro Takahashi, Hisae Tateishi-Karimata, Madoka E Hazemi, Tomoko Chikuni, Kazumitsu Onizuka, Naoki Sugimoto, Fumi Nagatsugi

    Organic & biomolecular chemistry 16 (9) 1436-1441 2018/02/28

    DOI: 10.1039/c7ob03179c  

    ISSN: 1477-0520

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    The G-quadruplex structure has been found in biologically significant regions of the genomic DNA, including the telomere and promoter regions, and is known to play an important role in a number of biological processes. In this paper, we report the development of alkylating probes for the G-quadruplex structure and evaluation of the properties of the modified G-quadruplex structure.

  36. Selective alkylation of T-T mismatched DNA using vinyldiaminotriazine-acridine conjugate Peer-reviewed

    Kazumitsu Onizuka, Akira Usami, Yudai Yamaoki, Tomohito Kobayashi, Madoka E. Hazemi, Tomoko Chikuni, Norihiro Sato, Kaname Sasaki, Masato Katahira, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Research 46 (3) 1059-1068 2018/02/16

    Publisher: Oxford University Press

    DOI: 10.1093/nar/gkx1278  

    ISSN: 1362-4962 0305-1048

  37. Pseudorotaxane formation via the slippage process with chemically cyclized oligonucleotides Peer-reviewed

    Kazumitsu Onizuka, Tomoko Chikuni, Takuya Amemiya, Takuya Miyashita, Kyoko Onizuka, Hiroshi Abe, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Research 45 (9) 5036-5047 2017/05/19

    Publisher: Oxford University Press

    DOI: 10.1093/nar/gkx265  

    ISSN: 1362-4962 0305-1048

  38. Synthesis of native-like crosslinked duplex RNA and study of its properties Peer-reviewed

    Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Justin M. Thomas, Leanna R. Monteleone, Ken Yamada, Shuhei Imoto, Peter A. Beal, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 25 (7) 2191-2199 2017/04

    DOI: 10.1016/j.bmc.2017.02.034  

    ISSN: 0968-0896

    eISSN: 1464-3391

  39. Synthesis and properties of cross-linkable DNA duplex using 4-amino-2-oxo-6-vinyl-1,3,5-triazine Peer-reviewed

    Ken Yamada, Shogo Ishiyama, Kazumitsu Onizuka, Fumi Nagatsugi

    TETRAHEDRON 73 (11) 1424-1435 2017/03

    DOI: 10.1016/j.tet.2017.01.043  

    ISSN: 0040-4020

  40. Synthesis of Water-Soluble Triazinophanes and Evaluation of Their Molecular Recognition Properties Peer-reviewed

    Shuhei Kusano, Sae Konishi, Ryuta Ishikawa, Norihiro Sato, Satoshi Kawata, Fumi Nagatsugi, Osamu Hayashida

    EUROPEAN JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY (12) 1618-1623 2017/03

    DOI: 10.1002/ejoc.201601663  

    ISSN: 1434-193X

    eISSN: 1099-0690

  41. Synthesis of of peptide nucleic acids (PNA) with a crosslinking agent to RNA and effective inhibition of dicer Peer-reviewed

    Takuya Akisawa, Ken Yamada, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 26 (24) 5902-5906 2016/12

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2016.11.002  

    ISSN: 0960-894X

    eISSN: 1464-3405

  42. Synthesis and Thermal Responses of Polygonal Poly(ethylene glycol) Analogues Peer-reviewed

    Shunichi Kawasaki, Takahiro Muraoka, Tsutomu Hamada, Kazuki Shigyou, Fumi Nagatsugi, Kazushi Kinbara

    Chemistry - An Asian Journal 11 (7) 1028-1035 2016/04/05

    Publisher: John Wiley and Sons Ltd

    DOI: 10.1002/asia.201501381  

    ISSN: 1861-471X 1861-4728

  43. Stabilization of the i-motif structure by the intra-strand cross-link formation Peer-reviewed

    Kikuta Kenji, Piao Haishun, Brazier John, Taniguchi Yosuke, Onizuka Kazumitsu, Nagatsugi Fumi, Sasaki Shigeki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 25 (16) 3307-3310 2015/08/15

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2015.05.064  

    ISSN: 0960-894X

  44. Synthesis of peptide nucleic acids containing a crosslinking agent and evaluation of their reactivities Peer-reviewed

    Takuya Akisawa, Yuki Ishizawa, Fumi Nagatsugi

    Molecules 20 (3) 4708-4719 2015/03/01

    Publisher: MDPI AG

    DOI: 10.3390/molecules20034708  

    ISSN: 1420-3049

  45. A new strategy for site-specific alkylation of DNA using oligonucleotides containing an abasic site and alkylating probes Peer-reviewed

    Sato Norihiro, Tsuji Genichiro, Sasaki Yoshihiro, Usami Akira, Moki Takuma, Onizuka Kazumitsu, Yamada Ken, Nagatsugi Fumi

    CHEMICAL COMMUNICATIONS 51 (80) 14885-14888 2015

    DOI: 10.1039/C5CC03915K  

    ISSN: 1359-7345

  46. Crosslink Reactions with 4-Amino-6-oxo-2-vinylpyrimidine (AOVP) to Guanine Derivatives and Structural Analysis of the Adducts Peer-reviewed

    Kusano, S, Ishiyama, S, Lam, S. L, Mashima, T, Katahira, M, Miyamoto, K, Aida, M, Nagatsugi, F

    Nucleic Acids Res., 43 (16) 7717-7730 2015

    DOI: 10.1093/nar/gkv797  

    ISSN: 1362-4962 0305-1048

  47. Automatic Pseudorotaxane Formation Targeting on Nucleic Acids Using a Pair of Reactive Oligodeoxynucleotides Peer-reviewed

    Kazumitsu Onizuka, Fumi Nagatsugi, Yoshihiro Ito, Hiroshi Abe

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 136 (20) 7201-7204 2014/05

    DOI: 10.1021/ja5018283  

    ISSN: 0002-7863

  48. Development of the crosslinking reactions to RNA triggered by oxidation Peer-reviewed

    Shuhei Kusano, Takuya Haruyama, Shogo Ishiyama, Shinya Hagihara, Fumi Nagatsugi

    CHEMICAL COMMUNICATIONS 50 (30) 3951-3954 2014

    DOI: 10.1039/c3cc49463b  

    ISSN: 1359-7345

    eISSN: 1364-548X

  49. The crosslink formation of 2'-OMe oligonucleotide containing 2-amino-6-vinylpurine protects mRNA from miRNA-mediated silencing Peer-reviewed

    Shinya Hagihara, Wei-Chen Lin, Shuhei Kusano, Xiao-guang Chao, Tsuneaki Hori, Shuhei Imoto, Fumi Nagatsugi

    ChemBioChem 14 (12) 1427-1429 2013/08

    DOI: 10.1002/cbic.201300382  

    ISSN: 1439-4227 1439-7633

    eISSN: 1439-7633

  50. 4-vinyl-substituted pyrimidine nucleosides exhibit the efficient and selective formation of interstrand cross-links with RNA and duplex DNA Peer-reviewed

    Atsushi Nishimoto, Daichi Jitsuzaki, Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH 41 (13) 6774-6781 2013/07

    DOI: 10.1093/nar/gkt197  

    ISSN: 0305-1048

    eISSN: 1362-4962

  51. Synthesis of peptide-conjugated light-driven molecular motors and evaluation of their DNA-binding properties Peer-reviewed

    Fumi Nagatsugi, Yusuke Takahashi, Maiko Kobayashi, Shunsuke Kuwahara, Shuhei Kusano, Tomoko Chikuni, Shinya Hagihara, Nobuyuki Harada

    Molecular BioSystems 9 (5) 969-973 2013/05

    DOI: 10.1039/c2mb25520k  

    ISSN: 1742-206X 1742-2051

  52. Synthesis of 6-amino-2-vinylpurine derivatives for cross-linking and evaluation of the reactivity Peer-reviewed

    Shuhei Kusano, Tomoya Sakuraba, Shinya Hagihara, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 22 (22) 6957-6961 2012/11

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2012.08.122  

    ISSN: 0960-894X

  53. Production of truncated protein by the crosslink formation of mRNA with 2 '-OMe oligoribonucleotide containing 2-amino-6-vinylpurine Peer-reviewed

    Shinya Hagihara, Shuhei Kusano, Wei-Chen Lin, Xiao-guang Chao, Tsuneaki Hori, Shuhei Imoto, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 22 (12) 3870-3872 2012/06

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2012.04.123  

    ISSN: 0960-894X

  54. FAST DNA INTERSTRAND CROSS-LINKING REACTION BY 6-VINYLPURINE Peer-reviewed

    Shuhei Imoto, Tomoko Chikuni, Hisao Kansui, Takehisa Kunieda, Fumi Nagatsugi

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 31 (10) 752-762 2012

    DOI: 10.1080/15257770.2012.726756  

    ISSN: 1525-7770

    eISSN: 1532-2335

  55. Alteration of cross-linking selectivity with the 2 &apos;-OMe analogue of 2-amino-6-vinylpurine and evaluation of antisense effects Peer-reviewed

    Shuhei Imoto, Tsuneaki Hori, Shinya Hagihara, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 20 (20) 6121-6124 2010/10

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2010.08.027  

    ISSN: 0960-894X

    eISSN: 1464-3405

  56. The alkyl-connected 2-amino-6-vinylpurine (AVP) crosslinking agent for improved selectivity to the cytosine base in RNA Peer-reviewed

    Yosuke Taniguchi, Yusuke Kurose, Takamasa Nishioka, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 18 (8) 2894-2901 2010/04

    DOI: 10.1016/j.bmc.2010.03.008  

    ISSN: 0968-0896

    eISSN: 1464-3391

  57. Design and Synthesis of the Novel cross-linking Agent

    S. Kusano, K.Hattori, S. Imoto, F. Nagatsugi

    Nucleic Acids Symp. Ser. 53 (53) 169-170 2009/09/29

    DOI: 10.1093/nass/nrp085  

    eISSN: 1746-8272

  58. Evaluation of the antisense effect of PEGylated oligodeoxynucleotides containing intelligent nucleoside analogues

    Y. Taniguchi, Y. Kurose, T, Nishioka, F. Nagatsugi, S. Sasaki

    Nucleic Acids Symp. Ser., 53 167-168 2009/09/29

  59. Incorporation of an inducible nucleotide analog into DNA by DNA polymerases Peer-reviewed

    Md. Monsur Ali, Shuhei Imoto, Yingfu Li, Shigeki Sasaki, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 17 (7) 2859-2863 2009/04

    DOI: 10.1016/j.bmc.2009.02.024  

    ISSN: 0968-0896

  60. Formation of highly selective and efficient interstrand cross-linking to thymine without photo-irradiation Peer-reviewed

    Keiichi Hattori, Tomoya Hirohama, Shuhei Imoto, Shuhei Kusano, Fumi Nagatsugi

    CHEMICAL COMMUNICATIONS 42 (42) 6463-6465 2009

    DOI: 10.1039/b915381k  

    ISSN: 1359-7345

  61. Design and synthesis of the novel cross-linking agent

    Shuhei Kusano, Keiichi Hattori, Shuhei Imoto, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Symposium Series 53 (53) 169-170 2009

    DOI: 10.1093/nass/nrp085  

    eISSN: 1746-8272

  62. DNA-templated click chemistry for creation of novel DNA binding molecules Peer-reviewed

    Shuhei Imoto, Tomoya Hirohama, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 18 (20) 5660-5663 2008/10

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2008.08.074  

    ISSN: 0960-894X

  63. Development of New DNA Binding Ligand Based on duplex DNA Templated Click Chemistry

    Imoto S, Hirohama T, Nagatsugi F

    Nucleic Acids Symp. Ser. 52 (52) 381-382 2008/09/08

    eISSN: 1746-8272

  64. Synthesis of the new nucleoside analogue connecting 2-amino-6-vinylpurine to the 2''-deoxyribose skeleton via the methylene linker

    Kurose Y, Taniguchi Y, Nagatsugi F, Sasaki S

    Nucleic Acids Symp. Ser., 52, 391-392 (2008) 52 43-44 2008/09/08

  65. Synthesis of the Peptide Nucleic Acid (PNA) Incorporating 2-Amino-6-vinylpurine Derivative and Evaluation of the Reactivity

    Imoto S, Shimotazawa A, Goto M, Hirohama T, Nagatsugi F

    Nucleic Acids Symp. Ser.52, 391-392 52 (52) 391-392 2008/09/08

    eISSN: 1746-8272

  66. Synthesis and evaluation of the luciferase-oligodeoxynucleotide for the sequence-selective detection of nucleic acids Peer-reviewed

    Fumi Nagatsugi, Ryusuke Nakahara, Kaori Inoue, Shigeki Sasaki

    ARCHIV DER PHARMAZIE 341 (9) 562-567 2008/09

    DOI: 10.1002/ardp.200800031  

    ISSN: 0365-6233

  67. Preparation and electrochemical and optical properties of unsymmetrically substituted phthalocyanines with one or two trithiole rings and related symmetric derivatives Peer-reviewed

    Takeshi Kimura, Nagisa Kanota, Kenji Matsui, Ichiro Tanaka, Takaaki Tsuboi, Yutaka Takaguchi, Akinori Yomogita, Takatsugu Wakahara, Shunsuke Kuwahara, Fumi Nagatsugi, Takeshi Akasaka

    Inorganic Chemistry 47 (9) 3577-3583 2008/05/05

    DOI: 10.1021/ic701841j  

    ISSN: 0020-1669

  68. New Methodology to Search for DNA Binding Ligands Based on Duplex DNA-Templated Click Chemistry

    Shuhei Imoto, Tomoya Hirohama, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Symposium Series 52 (52) 381-382 2008

    eISSN: 1746-8272

  69. Synthesis of the Peptide Nucleic Acid (PNA) Incorporating 2-Amino-6-vinylpurine Derivative and Evaluation of the Reactivity

    Shuhei Imoto, Azusa Shimotazawa, Tomoya Hirohama, Makoto Goto, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Symposium Series 52 (52) 391-392 2008

    eISSN: 1746-8272

  70. Synthesis and evaluation of the peptide nucleic acids (PNAs) incorporating the 2-amino-6-vinylpurine derivative

    Shuhei Imoto, Makoto Goto, Tomoya Hirohama, Fumi Nagatsugi

    CHEMISTRY OF NUCLEIC ACID COMPONENTS 10 414-416 2008

  71. Efficient synthesis of 6-substituted purine derivatives using Pd-catalyzed cross-coupling reactions with 2 '-deoxyguanosine O-6-tosylate Peer-reviewed

    Furni Nagatsugi, Yuki Ogata, Shuhei Imoto, Shigeki Sasaki

    HETEROCYCLES 73 (1) 493-+ 2007/12

    DOI: 10.3987/COM-07-S(U)24  

    ISSN: 0385-5414

  72. Enzymatic Incorporation of 2-Amino-6-Vinyl Purine Derivative

    Shuhei Imoto, Md. Monsur Ali, Yingfu Li, Shigeki Sasaki, Fumi Nagatsugi

    Nucleic Acids Symposium Series 51 (51) 357-358 2007

    DOI: 10.1093/nass/nrm179  

    eISSN: 1746-8272

  73. Development of the novel drug releasing system triggered by hybridization with target sequence Peer-reviewed

    F. Nagatsugi, Shizuka Nakayama, Shigeki Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 26 (6-7) 799-803 2007

    DOI: 10.1080/15257770701503597  

    ISSN: 1525-7770

  74. Application of unnatural oligonucleotides to chemical modification of gene expression Peer-reviewed

    Shigeki Sasaki, Fumi Nagatsugi

    CURRENT OPINION IN CHEMICAL BIOLOGY 10 (6) 615-621 2006/12

    DOI: 10.1016/j.cbpa.2006.10.006  

    ISSN: 1367-5931

  75. Novel drug releasing system triggered by hybridization with target sequence Peer-reviewed

    S. Nakayama, F. Nagatsugi, S. Sasaki

    Nucleic Acids Symposium Series 50 143-144 2006/11

  76. P-76 Selective Reaction to the Target Gene Using the Inducible Alkylating System of the Oligonucleotides in the Cell

    Nagatsugi Fumi, Monsur Ali Md., Nakayama Shizuka, Sasaki Shigeki

    International Symposium on the Chemistry of Natural Products 2006 "P-76" 2006/07/23

    Publisher: Symposium on the chemistry of natural products

    DOI: 10.24496/intnaturalprod.2006.0__P-76_  

  77. Effects of halogenated WNA derivatives on sequence dependency for expansion of recognition sequences in non-natural-type triplexes Peer-reviewed

    Y Taniguchi, A Nakamura, Y Senko, F Nagatsugi, S Sasaki

    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 71 (5) 2115-2122 2006/03

    DOI: 10.1021/jo052413u  

    ISSN: 0022-3263

  78. Intracellular inducible alkylation system that exhibits antisense effects with greater potency and selectivity than the natural oligonucleotide Peer-reviewed

    Md. Monsur Ali, Motoi Oishi, Fumi Nagatsugi, Kenya Mori, Yukio Nagasaki, Kazunori Kataoka, Shigeki Sasaki

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION 45 (19) 3136-3140 2006

    DOI: 10.1002/anie.200504441  

    ISSN: 1433-7851

  79. Application of 2-amino-6-vinylpurine as an efficient agent for conjugation of oligonucleotides Peer-reviewed

    M Ali, F Nagatsugi, S Sasaki, R Nakahara, M Maeda

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 25 (2) 159-169 2006/01

    DOI: 10.1080/15257770500446873  

    ISSN: 1525-7770

  80. Development of efficient packaging method of oligodeoxynucleotides by a condensed nano particle in lipid envelope structure Peer-reviewed

    Yuma Yamada, Kentaro Kogure, Yoshio Nakamura, Kaori Inoue, Hidetaka Akita, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki, Tetsuya Suhara, Hideyoshi Harashima

    Biological and Pharmaceutical Bulletin 28 (10) 1939-1942 2005/10

    DOI: 10.1248/bpb.28.1939  

    ISSN: 0918-6158 1347-5215

  81. Supramolecular assemblies for the cytoplasmic delivery of antisense oligodeoxynucleotide: Polyion complex (PIC) micelles based on poly(ethylene glycol)-SS-oligodeoxynucleotide conjugate Peer-reviewed

    Motoi Oishi, Tetsuya Hayama, Yoshitsugu Akiyama, Seiji Takae, Atsushi Harada, Yuichi Yamasaki, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki, Yukio Nagasaki, Kazunori Kataoka

    Biomacromolecules 6 (5) 2449-2454 2005/09

    DOI: 10.1021/bm050370l  

    ISSN: 1525-7797

  82. Smart polyion complex micelles for targeted intracellular delivery of PEGylated antisense oligonucleotides containing acid-labile linkages Peer-reviewed

    M Oishi, F Nagatsugi, S Sasaki, Y Nagasaki, K Kataoka

    CHEMBIOCHEM 6 (4) 718-725 2005/04

    DOI: 10.1002/cbic.200400334  

    ISSN: 1439-4227

  83. Substituent Effects on the In situ Activation of the Double Activated Cross-linking Reaction

    F. Nagatsugi, S. Mori, Md. Monsur Ali, Y. Ogata, S. Sasaki

    Nucleic Acids Symposium Series 49 175-176 2005/04

  84. Molecular design for DNA hybridization-promoted reactions with high efficiency and selectivity Peer-reviewed

    S Sasaki, F Nagatsugi, MM Ali, S Mori, S Nakayama

    Chemistry of Nucleic Acid Components 7 115-122 2005

  85. Smart Polyion Complex Micelles for Targeted Intracellular Delivery of PEGylated Antisense Oligonucleotide with Acid-Labile Linkage Peer-reviewed

    Motoi,Oishi, Fumi,Nagatsugi, Shigeki,Sasaki, Yukio,Nagasaki, and,Kazunori Kataoka

    ChemBioChem 6 718-725 2005/01

  86. Hybridization-promoted and cytidine-selective activation for cross-linking with the use of 2-amino-6-vinylpurine derivatives Peer-reviewed

    T Kawasaki, F Nagatsugi, MM Ali, M Maeda, K Sugiyama, K Hori, S Sasaki

    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 70 (1) 14-23 2005/01

    DOI: 10.1021/jo048298p  

    ISSN: 0022-3263

  87. Expansion of triplex recognition codes by the use of novel bicyclic nucleoside derivatives (WNA) Peer-reviewed

    Y Taniguchi, A Nakamura, Y Senko, K Kodama, F Nagatsugi, S Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 24 (5-7) 823-827 2005

    DOI: 10.1081/NCN-200060309  

    ISSN: 1525-7770

  88. Design of highly efficient and selective transfer reaction of nitrosyl group to dC and d(M)C resulting in specific deamination Peer-reviewed

    MM Ali, F Nagatsugi, S Nakayama

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 24 (5-7) 721-724 2005

    DOI: 10.1081/NCN-200060312  

    ISSN: 1525-7770

  89. Sequence- and base-specific delivery of nitric oxide to cytidine and 5-methylcytidine leading to efficient deamination Peer-reviewed

    M Ali, R Alam, T Kawasaki, S Nakayama, F Nagatsugi, S Sasaki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 126 (29) 8864-8865 2004/07

    DOI: 10.1021/ja0498888  

    ISSN: 0002-7863

  90. Chemical tools for targeted mutagenesis of DNA based on triple helix formation Invited Peer-reviewed

    F Nagatsugi, S Sasaki

    BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 27 (4) 463-467 2004/04

    DOI: 10.1248/bpb.27.463  

    ISSN: 0918-6158

  91. Selective Nitrosyl Group Transfer Reaction to Cytidine Using Oligonucleotides Bearing S-Nitrosothioguanosin

    Nagatsugi, F, Nakayama, S, Ali Md. Monsur, Sasaki, S

    Nucleic Acids Symposium Series 48 23-24 2004/04

  92. Efficient Antisense Effect Using the Functional Oligonucleotides Containing Cross-linking Agents Conjugated PEG

    Ali Md. Monsur, Nagatsugi, F, Ohishi, M, Nagasaki, Y, Kataoka, K, Sasaki, S

    Nucleic Acids Symposium Series 48 61-62 2004/04

  93. Synthesis and evaluation of the functional oligonucleotides-PEG conjugates.

    Ali Md Monsur, Fumi Nagatsugi, Motoi Oishi, Yukio Nagasaki, Kazunari Kataoka, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004) (48) 61-62 2004

    ISSN: 1746-8272

  94. Selective formation of stable triplexes including a TA or a CG interrupting site with new bicyclic nucleoside analogues (WNA) Peer-reviewed

    S Sasaki, Y Taniguchi, R Takahashi, Y Senko, K Kodama, F Nagatsugi, M Maeda

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 126 (2) 516-528 2004/01

    DOI: 10.1021/ja037211z  

    ISSN: 0002-7863

  95. Design and synthesis of the novel cross-linking reagents triggered by the triple helix formation.

    F. Nagatsugi, D. Usui, T. Kawasaki, M. Maeda, S. Sasaki

    Nucleic acids symposium series (44) 39-40 2000

    DOI: 10.1093/nass/44.1.39  

    ISSN: 0261-3166

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Misc. 157

  1. 含窒素芳香環を細胞内構築可能な光反応の開発 Invited Peer-reviewed

    岡村秀紀, 永次史

    化学 79 (9) 72-73 2024/09

  2. 含窒素芳香環を細胞内構築可能な光反応の開発

    岡村秀紀, 永次史

    光アライアンス 1-5 2023/09

  3. DNAの狙った構造だけを化学修飾する!ー標的と結合した時だけ活性化する新しいアルキル化剤 Invited Peer-reviewed

    永次 史, 鬼塚和光

    化学 75 (2) 52-56 2020/02

  4. 核酸の高次構造を選択的に化学修飾する新規プローブの開発

    永次 史, 鬼塚和光

    生命機能に迫る分子化学 30 86-94 2018/06

  5. Selective alkylation of T-T mismatched bases in DNA

    Onizuka K, Usami, A, Yamaoki, Y, KObayashi, T, Hazemi, M, Chikuni, T, Katahira, M, Nagatsugi, F

    The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2017/11

  6. Development of the strategy for chemical modifications to nucleic acids

    Fumi Nagatsugi

    Yuki Gosei Kagaku Kyokaishi/Journal of Synthetic Organic Chemistry 74 (5) 494-504 2016

    Publisher: Society of Synthetic Organic Chemistry

    DOI: 10.5059/yukigoseikyokaishi.74.494  

    ISSN: 0037-9980

  7. グアニン四重鎖をターゲットとした共有結合性リガンドによるDNA複製,転写の制御

    高橋俊太郎, 建石寿枝, 佐藤憲大, 鬼塚和光, 永次史, 杉本直己, 杉本直己

    東北大学多元物質科学研究所研究発表会講演予稿集 16th 53 2016

  8. Development of the selective crosslinking reactions to 8-oxoguanine

    Nagatsugi, F, Kusano, S, Ishiyama, S, Lam, S. L, Mashima, T, Katahira, M

    The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2015/11

  9. グアニン四重鎖結合性小分子によるDNAの複製および転写反応制御

    高橋俊太郎, 建石寿枝, 佐藤憲大, 鬼塚和光, 永次史, 杉本直己

    東北大学多元物質科学研究所研究発表会講演予稿集 15th 25 2015

  10. プラスミドDNAとmRNAのカーボンナノ試験管への導入と遺伝子輸送への応用

    寒河江拓也, 干川康人, 萩原伸也, 和田健彦, 永次史, 京谷隆

    炭素材料学会年会要旨集 38th 79 2011/11/28

  11. DEPENDENCY OF THE CROSS-LINKING REACTIVITY WITH 2-AMINO-6-VINYLPURINE ON THE NEIGHBORING BASES

    Fumi Nagatsugi, Shinya Hagihara, Shuhei Kusano, Chao Xiao Guang

    NUCLEIC ACID THERAPEUTICS 21 (5) A37-A37 2011/10

    ISSN: 2159-3337

  12. 酸素あるいは窒素ドープしたカーボンナノ試験管へのDNA導入と放出

    干川康人, 寒河江拓也, PANNOPARD Panvika, SOMLAK Ittisanronnachai, 和田健彦, 永次史, 京谷隆

    コロイドおよび界面化学討論会講演要旨集 63rd 252 2011/08/22

  13. Development of the Self-Activated Intelligent Artificial Nucleosides

    Fumi Nagatsugi

    New Trend of Nucleic Acid Chemistry 06 48-62 2011/06

  14. Development of the novel artificial nucleosides for cross-linking to thymine with high selectivity

    62 (2) 137-142 2011/02

    Publisher: 化学工業社

    ISSN: 0451-2014

  15. Development of the Highly Selective Reactions to Target Gene for the Control of the Gene Expression in Cells

    Fumi Nagatsugi

    JOURNAL OF SYNTHETIC ORGANIC CHEMISTRY JAPAN 69 (2) 108-117 2011/02

    DOI: 10.5059/yukigoseikyokaishi.69.108  

    ISSN: 0037-9980

  16. Induced cross-linking reactions to target genes using modified oligonucleotides

    Fumi Nagatsugi, Shuhei Imoto

    ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY 9 (8) 2579-2585 2011

    DOI: 10.1039/c0ob00819b  

    ISSN: 1477-0520

  17. カーボンナノ試験管内へのDNA濃縮

    干川康人, 寒河江拓也, 菅野康之, 折笠広典, ITTISANRONNACHAI Somlak, 井本修平, 和田健彦, 永次史, 京谷隆

    炭素材料学会年会要旨集 37th 304-305 2010/11/30

  18. カーボンナノ試験管内へのDNA濃縮とその可逆的な放出

    干川康人, 菅野康之, 折笠広典, ITTISANRONNACHAI Somlak, 井本修平, 和田健彦, 永次史, 京谷隆

    化学系学協会東北大会プログラムおよび講演予稿集 2010 115 2010/09/25

  19. Synthesis of Reactive Oligonucleotides for Gene Targeting and Their Application to Gene Expression Regulation

    Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN 83 (7) 744-755 2010/07

    DOI: 10.1246/bcsj.20100010  

    ISSN: 0009-2673

    eISSN: 1348-0634

  20. カーボンナノ試験管へのDNA濃縮に対する金属カチオンの影響

    寒河江拓也, 干川康人, 菅野康之, ITTISANRONNACHAI Somlak, 井本修平, 和田健彦, 永次史, 京谷隆

    東北大学多元物質科学研究所研究発表会講演予稿集 10th 30 2010

  21. いまRNAが面白い-「RNAワールド」の新たなる裏づけ

    永次 史

    化学 64 (9) 66-67 2009/09

  22. DNA-templated click chemistry for creation of novel DNA binding molecules (vol 18, pg 5660, 2008)

    Shuhei Imoto, Tomoya Hirohama, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 19 (2) 555-555 2009/01

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2008.08.114  

    ISSN: 0960-894X

  23. 機能性人工核酸を用いた遺伝子発現制御による新しい創薬手法の開発

    永次 史

    Pharma VISION NEWS 9 2007

  24. 遺伝子発現の化学的な制御を目指した人工分子の開発

    永次 史

    ペプチド研究会レター 66 4-6 2007

  25. インテリジェント核酸を用いたケミカルバイオロジー

    永次 史

    化学工業 57 (9) 661-666 2006/04

  26. ゲノム標的化学で目指す新しい生物機能の創成

    永次 史, 佐々木茂貴

    化学と教育 53 (1) 8-11 2005/04

    Publisher: 公益社団法人 日本化学会

    DOI: 10.20665/kakyoshi.53.1_8  

    ISSN: 0386-2151

  27. 遺伝子発現の科学的制御を目指した機能性核酸の開発

    永次 史

    生物工学会誌 82 135-154 2004/04

  28. Site-specific mutagenesis by triple helix-forming oligonucleotides containing a reactive nucleoside analog

    F Nagatsugi, S Sasaki, PS Miller, MM Seidman

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH 31 (6) 2003/03

    DOI: 10.1093/nar/gng031  

    ISSN: 0305-1048

  29. Efficient cross-linking reactions by functional nucleobases capable of in situ activation under neutral conditions

    Nucleic Acids Res. Suppl. 3, 155-156 2003

  30. Efficient cross-linking reactions by functional nucleobases capable of in situ activation under neutral conditions

    Nucleic Acids Res. Suppl. 3, 155-156 2003

  31. Enhancement and inhibition by 2 '-O-hydroxyethyl residues of gene targeting mediated by triple helix forming oligonucleotides

    M Kundu, F Nagatsugi, A Majumdar, PS Miller, MM Seidman

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 22 (10) 1927-1938 2003

    DOI: 10.1081/NCN-120025240  

    ISSN: 1525-7770

  32. 遺伝子発現機構を標的とする核酸医薬品の新しい化学

    佐々木茂貴, 永次 史

    ファルマシア 39 (1) 39-43 2003/01

    Publisher: 公益社団法人日本薬学会

    ISSN: 0014-8601

  33. Selective cross-linking to the adenine of the TA interrupting site within the triple helix

    F Nagatsugi, Y Matsuyama, M Maeda, S Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 12 (3) 487-489 2002/02

    DOI: 10.1016/S0960-894X(01)00783-1  

    ISSN: 0960-894X

  34. Selective cross-linking to the adenine of the TA interrupting site within the triple helix

    F Nagatsugi, Y Matsuyama, M Maeda, S Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 12 (3) 487-489 2002/02

    DOI: 10.1016/S0960-894X(01)00783-1  

    ISSN: 0960-894X

  35. Site-Specific Mutagenesis by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing a Reactive Nucleoside Analogue. (共著)

    Nucleic Acids Res. in press 2002

  36. 2-Amino-6-Vinylpurine as a Tool of Post Synthetic Conjugation of Oligonucleotides with Radio-, Spin-, Fluorescence Label and Peptides(共著)

    Nucleic Acids Res. Supplement 2(), 31-32 2002

  37. Site-Specific Mutagenesis by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing a Reactive Nucleoside Analogue. (共著)

    Nucleic Acids Res. in press 2002

  38. A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions(共著)

    Nucleic Acids Res. Supplement 2(), 2577-2579 2002

  39. A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions(共著)

    Nucleic Acids Res. Supplement 2(), 2577-2579 2002

  40. 2-Amino-6-Vinylpurine as a Tool of Post Synthetic Conjugation of Oligonucleotides with Radio-, Spin-, Fluorescence Label and Peptides(共著)

    Nucleic Acids Res. Supplement 2(), 31-32 2002

  41. A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions

    F Nagatsugi, N Tokuda, M Maeda, S Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 11 (19) 2577-2579 2001/10

    DOI: 10.1016/S0960-894X(01)00505-4  

    ISSN: 0960-894X

  42. A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions

    F Nagatsugi, N Tokuda, M Maeda, S Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 11 (19) 2577-2579 2001/10

    DOI: 10.1016/S0960-894X(01)00505-4  

    ISSN: 0960-894X

  43. W-shape nucleic acid (WNA) for selective formation of non-natural anti-parallel triplex including a TA interrupting site

    S Sasaki, H Yamauchi, F Nagatsugi, R Takahashi, Y Taniguchi, M Maeda

    TETRAHEDRON LETTERS 42 (39) 6915-6918 2001/09

    DOI: 10.1016/S0040-4039(01)01446-0  

    ISSN: 0040-4039

  44. W-shape nucleic acid (WNA) for selective formation of non-natural anti-parallel triplex including a TA interrupting site

    S Sasaki, H Yamauchi, F Nagatsugi, R Takahashi, Y Taniguchi, M Maeda

    TETRAHEDRON LETTERS 42 (39) 6915-6918 2001/09

    DOI: 10.1016/S0040-4039(01)01446-0  

    ISSN: 0040-4039

  45. Selective reaction to a flipping cytidine of the duplex DNA mediated by triple helix formation

    F Nagatsugi, D Usui, T Kawasaki, M Maeda, S Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 11 (3) 343-345 2001/02

    DOI: 10.1016/S0960-894X(00)00666-1  

    ISSN: 0960-894X

  46. Selective reaction to a flipping cytidine of the duplex DNA mediated by triple helix formation

    F Nagatsugi, D Usui, T Kawasaki, M Maeda, S Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 11 (3) 343-345 2001/02

    DOI: 10.1016/S0960-894X(00)00666-1  

    ISSN: 0960-894X

  47. Efficient cross-linking to cytidine under neutral conditions using the 2-amino-6-vinylpurine derivative having an additional activating group(共著)

    Nucleic Acids Res. Supplement 1(), 87-88 2001

  48. Site-directed alkylation to cytidine within duplex by the oligonucleotides containing functional nucleobases

    F Nagatsugi, T Kawasaki, N Tokuda, M Maeda, S Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 20 (4-7) 915-919 2001

    DOI: 10.1081/NCN-100002458  

    ISSN: 1525-7770

  49. Efficient cross-linking to cytidine under neutral conditions using the 2-amino-6-vinylpurine derivative having an additional activating group(共著)

    Nucleic Acids Res. Supplement 1(), 87-88 2001

  50. Site-directed alkylation to cytidine within duplex by the oligonucleotides containing functional nucleobases

    F Nagatsugi, T Kawasaki, N Tokuda, M Maeda, S Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 20 (4-7) 915-919 2001

    DOI: 10.1081/NCN-100002458  

    ISSN: 1525-7770

  51. Efficient Cross-Linking to Cytidine Using Substituted Phenylsulfide Derivatives of 2-Amino-6-Vinylpurine Nucleoside via Synchronous Activation within Duplex(共著)

    Nucleic Acids, Symp. 44(), 129-130 2000

  52. Efficient Cross-Linking to Cytidine Using Substituted Phenylsulfide Derivatives of 2-Amino-6-Vinylpurine Nucleoside via Synchronous Activation within Duplex(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 44(), 129-130 2000

  53. Highly efficient and selective cross-linking to cytidine based on a new strategy for auto-activation within a duplex [4]

    Fumi Nagatsugi, Takeshi Kawasaki, Daisaku Usui, Minoru Maeda, Shigeki Sasaki

    Journal of the American Chemical Society 121 (28) 6753-6754 1999/07/21

    DOI: 10.1021/ja990356e  

    ISSN: 0002-7863

  54. Highly efficient and selective cross-linking to cytidine based on a new strategy for auto-activation within a duplex

    F Nagatsugi, T Kawasaki, D Usui, M Maeda, S Sasaki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 121 (28) 6753-6754 1999/07

    DOI: 10.1021/ja990356e  

    ISSN: 0002-7863

  55. Highly efficient and selective cross-linking to cytidine based on a new strategy for auto-activation within a duplex

    F Nagatsugi, T Kawasaki, D Usui, M Maeda, S Sasaki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 121 (28) 6753-6754 1999/07

    DOI: 10.1021/ja990356e  

    ISSN: 0002-7863

  56. 配列特異的な三本鎖形成クロスリンク反応を目指した新しい反応性人工塩基の開発

    日本薬学会第119年会(徳島)要旨集2 68 1999

  57. 遺伝子を標的とする新しい癌診断及び癌治療法の開発

    医療科学社 (8月) 67-68 1999

  58. 2 '-deoxynucleoside derivatives of 6-substituted 2-aminopurine as highly efficient and selective cross-linking agent to cytidine

    S Sasaki, F Nagatsugi, M Maeda

    CHEMISTRY OF NUCLEIC ACID COMPONENTS 2 114-118 1999

  59. 2 '-deoxynucleoside derivatives of 6-substituted 2-aminopurine as highly efficient and selective cross-linking agent to cytidine

    S Sasaki, F Nagatsugi, M Maeda

    CHEMISTRY OF NUCLEIC ACID COMPONENTS 2 114-118 1999

  60. Development of the Novel Cross-linking Reagent Activated within Duplex

    67 1999

  61. 配列特異的な3本鎖形成クロスリンク反応を目指した新規反応性人工塩基の開発

    第9回アンチセンスシンポジウム(京都) 1999

  62. 2本鎖内で活性化される高効率的、高選択的な新規クロスリンク剤の開発

    第25回反応と合成の進歩シンポジウム(富山国際会議場)要旨集 8-10 1999

  63. Development of novel reactive artificial bases for site-specific cross-linking reaction based on triplex formation

    68 1999

  64. 非天然型3本鎖DNA形成のためのAbasic型認識分子の開発

    日本薬学会第119年会(徳島)要旨集2 67 1999

  65. 2本鎖複合体内で活性化されるクロスリンク分子の開発

    日本薬学会第119年会(徳島)要旨集2 67 1999

  66. Efficient cross-linking to cytidine by functional nucleobases capable of in situ activation(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 42(), 43-44 1999

  67. Efficient cross-linking to cytidine by functional nucleobases capable of in situ activation

    46 1999

  68. Efficient cross-linking to cytidine by functional nucleobases capable of in situ activation

    Nucleic Acids, Symp. Ser. 42 43-44 1999

  69. Efficient cross-linking to cytidine by functional nucleobases capable of in situ activation(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 42(), 43-44 1999

  70. Abasic型認識分子を組み込んだオリゴヌクレオチドによる非天然型3本鎖DNA形成の検討

    生体機能関連シンポジウム(愛媛大学)要旨集 547 1998

  71. 塩基配列特異的な反応を行う核酸アナログの設計

    第15回日本薬学会九州支部大会(九州大学薬学部)、要旨集18 1998

  72. 非天然型3本鎖形成を目指したAbasic型新規認識分子の検討

    第15回日本薬学会九州支部大会(九州大学薬学部)、要旨集17 1998

  73. 新規反応性核酸誘導体2-amino-6-vinylpurineを組み込んだオリゴヌクレオチドによる2本鎖及び3本鎖形成クロスリンク反応

    第8回アンチセンスシンポジウム(幕張メッセ)要旨集 14 1998

  74. 2-アミノ-6-ビニルプリンを組み込んだオリゴDNAによるクロスリンク反応及びクロスリンク付加体の構造決定

    生体関連化学サマースクール、湯布院(大分) 1998

  75. Structural Analysis of Cross-Linked Adducts with the Oligonucleotides Incorporating 2-Amino-6-Vinylpurine(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 39(), 103-104 1998

  76. Structural analysis of cross-linked adducts with the oligonudeotides in corporating 2-amino-6-vinylpurine

    103 1998

  77. Structural Analysis of Cross-Linked Adducts with the Oligonucleotides Incorporating 2-Amino-6-Vinylpurine(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 39(), 103-104 1998

  78. 遺伝子イメージングを目指した効率的な放射性ヨウ素標識オリゴDNAの合成と機能評価

    日本薬学会第118年会(京都)要旨集4 134 1998

  79. シチジン選択的に反応する機能性核酸を組み込んだオリゴヌクレオチドの合成とそのクロスリンク反応

    日本薬学会第118年会(京都)要旨集2 97 1998

  80. Abasicsite型認識分子を含むオリゴ核酸による3本鎖DNA形成の検討

    日本薬学会第118年会(京都)要旨集2 97 1998

  81. Abasic型新規認識分子を組み込んだオリゴヌクレオチドによる非天然型3本鎖形成の検討

    生体関連化学サマースクール、湯布院(大分) 1998

  82. Structural analysis of cross-linked addeucts with the oligonucleotides incorporating 2-amino-6-vinylpurine

    Nucleic Acids, Symp. Ser. 39 103-104 1998

  83. 2-aminopurine derivatives with C6-substituted olefin as novel cross-linking agents and the synthesis of the corresponding beta-phosphoramidite precursors

    F Nagatsugi, K Uemura, S Nakashima, M Maeda, S Sasaki

    TETRAHEDRON 53 (9) 3035-3044 1997/03

    ISSN: 0040-4020

  84. 2-aminopurine derivatives with C6-substituted olefin as novel cross-linking agents and the synthesis of the corresponding beta-phosphoramidite precursors

    F Nagatsugi, K Uemura, S Nakashima, M Maeda, S Sasaki

    TETRAHEDRON 53 (9) 3035-3044 1997/03

    DOI: 10.1016/S0040-4020(97)00069-0  

    ISSN: 0040-4020

  85. 2-aminopurine derivatives with C6-substituted olefin as novel cross-linking agents and the synthesis of the corresponding beta-phosphoramidite precursors

    F Nagatsugi, K Uemura, S Nakashima, M Maeda, S Sasaki

    TETRAHEDRON 53 (9) 3035-3044 1997/03

    ISSN: 0040-4020

  86. シチジン選択的な反応性を持つ人工塩基をくみこんだDNAオリゴマーの合成とクロスリンク反応の評価

    第12回生体関連化学シンポジウム(盛岡) 1997

  87. 非天然型3本鎖DNA形成のための人工塩基の検索

    薬学会117年会 1997

  88. Novel Cross-Linking Reaction of Oligonuceotides Incorporating New Base Analogs with Selective Reactivity towad Cytidine(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser. 37(), 67-68 1997

  89. Novel Cross-Linking Reaction of Oligonuceotides Incorporating New Base Analogs with Selective Reactivity towad Cytidine(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser. 37(), 67-68 1997

  90. New Approach to Diagnostic and Therapeutic Application of Radio Labeled Oligonucleotides.

    RADIOISOTOPES 46 (10) 791-792 1997

    Publisher: Japan Radioisotope Association

    DOI: 10.3769/radioisotopes.46.791  

    ISSN: 0033-8303 1884-4111

  91. 一般的な2本鎖DNAと塩基対選択的に3本鎖を形成するための新規核酸塩基の開発

    第12回生体関連化学シンポジウム(盛岡) 189 1997

  92. CGおよびTAミスマッチ配列を含む非天然三木鎖DNA形成のための人工塩基の開発

    第12回生体成分の分析化学シンポジウム(広島) 174 1997

  93. 一般的な2本鎖DNAに対して非天然型三本鎖DNAを形成できる新規人工塩基の開発

    薬学会117年会 1997

  94. Synthesis and Evaluation of Oligonucleotides Incorporating Novel Artificial Nucleobases for the Selective Formation of Non-Natural Type Triplexes(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 37(), 33-34 1997

  95. New Approach to Diagnostic and Therapeutic Application of Radio Labeled Oligonucleotides.

    RADIOISOTOPES 46(10), 791-792 (10) 791-792 1997

    Publisher: Japan Radioisotope Association

    DOI: 10.3769/radioisotopes.46.791  

    ISSN: 0033-8303

  96. Novel Cross-Linking Reaction of Oligonuceotides Incorporating New Base Analogs with Selective Reactivity towad Cytidine

    Nucleic Acids, Symp. Ser. 37 67-68 1997

  97. New Approach to Diagnostic and Therapeutic Application of Radio Labeled Oligonucleotides(共著)

    RADIOISOTOPES 46(10), 791-792 1997

    DOI: 10.3769/radioisotopes.46.791  

  98. 新しい機能性核酸誘導体を組み込んだオリゴヌクレオチドによるシチジン選択的なクロスリンク反応

    第23回反応と合成の進歩シンポジウム(熊本)要旨集 401 1997

  99. 6-エチルチオフェニル-2-アミノプリン誘導体を組み込んだオリゴ核酸の合成及びビニル誘導体への変換

    薬学会117年会 1997

  100. Synthesis and Evaluation of Oligonucleotides Incorporating Novel Artificial Nucleobases for the Selective Formation of Non-Natural Type Triplexes

    Nucleic Acids, Symp. Ser. 37 33-34 1997

  101. Synthesis and Evaluation of Oligonucleotides Incorporating Novel Artificial Nucleobases for the Selective Formation of Non-Natural Type Triplexes(共著)

    Nucleic Acids, Symp. Ser 37(), 33-34 1997

  102. 20-[F-18]fluoroarachidonic acid: Tissue biodistribution and incorporation into phospholipids

    F Nagatsugi, J Hokazono, S Sasaki, M Maeda

    BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 19 (10) 1316-1321 1996/10

    DOI: 10.1248/bpb.19.1316  

    ISSN: 0918-6158

  103. 20-[F-18]fluoroarachidonic acid: Tissue biodistribution and incorporation into phospholipids

    F Nagatsugi, J Hokazono, S Sasaki, M Maeda

    BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 19 (10) 1316-1321 1996/10

    DOI: 10.1248/bpb.19.1316  

    ISSN: 0918-6158

  104. 20-[F-18]fluoroarachidonic acid: Tissue biodistribution and incorporation into phospholipids

    F Nagatsugi, J Hokazono, S Sasaki, M Maeda

    BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 19 (10) 1316-1321 1996/10

    DOI: 10.1248/bpb.19.1316  

    ISSN: 0918-6158

  105. Synthesis of Oligonucleotides Incorporating New Nucleobases Susceptible to Oxidative Activation for Cross-Linking(共著)

    Nucleic acids Symposiuum Series. 35 (), 105-106 1996

  106. The New Artificial Nucleobases for the Selective Formation of the Non-Natural Type Triple Complex with T-A and C-G (共著)Base Pairs

    Nucleic Acids, Symp. Ser 35 (), 105-106 1996

  107. The New Artificial Nucleobases for the Selective Formation of the Non-Natural Type Triple Complex with T-A and C-G (共著)Base Pairs

    Nucleic Acids, Symp. Ser 35 (), 105-106 1996

  108. シチジン選択的な反応性を持つ人工塩基をくみこんだDNAオリゴマーの合成とクロスリンク反応の評価

    生体機能関連シンポジウム要旨集 34-36 1996

  109. 効率的な新規クロスリンク剤の合成及び反応性の評価

    薬学会116年会(学会発表) 1996

  110. Synthesis of Oligonucleotides Incorporating New Nucleobases Susceptible to Oxidative Activation for Cross-Linking(共著)

    Nucleic acids Symposiuum Series. 35 79-80 1996

  111. Synthesis of Oligonucleotides Incorporating New Nucleobases Susceptible to Oxidative Activation for Cross-Linking(共著)

    Nucleic acids Symposiuum Series. 35 (), 105-106 1996

  112. 拡大Hoogsteen型水素結合部位を有する新しい人工塩基の開発-一般的配列の2本鎖DNAとの三本鎖形成を行うための認識分子の設計

    生体機能関連シンポジウム(1996)要旨集 172-174 1996

  113. Design of a novel artificial nucleobase for the selective formation of a triple-complex with a cytosine-guanine base pair

    S Sasaki, S Nakashima, F Nagatsugi, Y Tanaka, M Hisatome, M Maeda

    TETRAHEDRON LETTERS 36 (52) 9521-9524 1995/12

    DOI: 10.1016/0040-4039(95)02064-0  

    ISSN: 0040-4039

  114. Design of a novel artificial nucleobase for the selective formation of a triple-complex with a cytosine-guanine base pair

    S Sasaki, S Nakashima, F Nagatsugi, Y Tanaka, M Hisatome, M Maeda

    TETRAHEDRON LETTERS 36 (52) 9521-9524 1995/12

    ISSN: 0040-4039

  115. Design of a novel artificial nucleobase for the selective formation of a triple-complex with a cytosine-guanine base pair

    S Sasaki, S Nakashima, F Nagatsugi, Y Tanaka, M Hisatome, M Maeda

    TETRAHEDRON LETTERS 36 (52) 9521-9524 1995/12

    DOI: 10.1016/0040-4039(95)02064-0  

    ISSN: 0040-4039

  116. F-18 LABELED OCTANOATES AS POTENTIAL AGENTS FOR CEREBRAL FATTY-ACID STUDIES - THE INFLUENCE OF 4-SUBSTITUTION AND THE FLUORINE POSITION ON BIODISTRIBUTION

    F NAGATSUGI, F INOUE, S SASAKI, M MAEDA

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 43 (4) 607-615 1995/04

    DOI: 10.1248/cpb.43.607  

    ISSN: 0009-2363

  117. F-18 LABELED OCTANOATES AS POTENTIAL AGENTS FOR CEREBRAL FATTY-ACID STUDIES - THE INFLUENCE OF 4-SUBSTITUTION AND THE FLUORINE POSITION ON BIODISTRIBUTION

    F NAGATSUGI, F INOUE, S SASAKI, M MAEDA

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 43 (4) 607-615 1995/04

    DOI: 10.1248/cpb.43.607  

    ISSN: 0009-2363

  118. 18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution

    Fumi Nagatsugi, Fumiko Inoue, Shigeki Sasaki, Minoru Maeda

    Chemical and Pharmaceutical Bulletin 43 (4) 607-615 1995

    DOI: 10.1248/cpb.43.607  

    ISSN: 1347-5223 0009-2363

  119. 6-VINYLATED GUANOSINE AS A NOVEL CROSS-LINKING AGENT AND ITS VERSATILE SYNTHESIS FROM THE 6-O-TOSYLATE BY PD(0)-CATALYZED CROSS-COUPLING

    F NAGATSUGI, K UEMURA, S NAKASHIMA, M MAEDA, S SASAKI

    TETRAHEDRON LETTERS 36 (3) 421-424 1995/01

    DOI: 10.1016/0040-4039(94)02224-Y  

    ISSN: 0040-4039

  120. シトシンーングアニンに対して選択的に三重錯体を形成する新規人工核酸塩基の設計

    36 (52) 1995

  121. Design and Synthesis of New Cross-Linking Agents(共著)

    Nucleic acids Symposiuum Series 34(), 171 1995

  122. 新しいクロスリンク剤の設計と合成

    34 (171) 1995

  123. Design and Synthesis of New Cross-Linking Agents

    Nucleic acids Symposium Series 34 (171) 1995

  124. 6-VINYLATED GUANOSINE AS A NOVEL CROSS-LINKING AGENT AND ITS VERSATILE SYNTHESIS FROM THE 6-O-TOSYLATE BY PD(0)-CATALYZED CROSS-COUPLING

    F NAGATSUGI, K UEMURA, S NAKASHIMA, M MAEDA, S SASAKI

    TETRAHEDRON LETTERS 36 (3) 421-424 1995/01

    DOI: 10.1016/0040-4039(94)02224-Y  

    ISSN: 0040-4039

  125. Design and Synthesis of New Cross-Linking Agents(共著)

    Nucleic acids Symposiuum Series 34(), 171 1995

  126. 6-VINYLATED GUANOSINE AS A NOVEL CROSS-LINKING AGENT AND ITS VERSATILE SYNTHESIS FROM THE 6-O-TOSYLATE BY PD(0)-CATALYZED CROSS-COUPLING

    F NAGATSUGI, K UEMURA, S NAKASHIMA, M MAEDA, S SASAKI

    TETRAHEDRON LETTERS 36 (3) 421-424 1995/01

    DOI: 10.1016/0040-4039(94)02224-Y  

    ISSN: 0040-4039

  127. SYNTHESIS OF 20-[F-18]FLUOROARACHIDONIC ACID - A POTENTIAL PHOSPHOLIPID METABOLIC AGENT

    F NAGATSUGI, J HOKAZONO, S SASAKI, M MAEDA

    JOURNAL OF LABELLED COMPOUNDS & RADIOPHARMACEUTICALS 34 (12) 1121-1127 1994/12

    DOI: 10.1002/jlcr.2580341202  

    ISSN: 0362-4803

  128. 8-[F-18] FLUOROOCTANOIC ACID AND ITS BETA-SUBSTITUTED DERIVATIVES AS POTENTIAL AGENTS FOR CEREBRAL FATTY-ACID STUDIES - SYNTHESIS AND BIODISTRIBUTION

    F NAGATSUGI, S SASAKI, M MAEDA

    NUCLEAR MEDICINE AND BIOLOGY 21 (6) 809-817 1994/08

    DOI: 10.1016/0969-8051(94)90160-0  

    ISSN: 0883-2897

  129. 8-[F-18] FLUOROOCTANOIC ACID AND ITS BETA-SUBSTITUTED DERIVATIVES AS POTENTIAL AGENTS FOR CEREBRAL FATTY-ACID STUDIES - SYNTHESIS AND BIODISTRIBUTION

    F NAGATSUGI, S SASAKI, M MAEDA

    NUCLEAR MEDICINE AND BIOLOGY 21 (6) 809-817 1994/08

    DOI: 10.1016/0969-8051(94)90160-0  

    ISSN: 0883-2897

  130. 8-[F-18] FLUOROOCTANOIC ACID AND ITS BETA-SUBSTITUTED DERIVATIVES AS POTENTIAL AGENTS FOR CEREBRAL FATTY-ACID STUDIES - SYNTHESIS AND BIODISTRIBUTION

    F NAGATSUGI, S SASAKI, M MAEDA

    NUCLEAR MEDICINE AND BIOLOGY 21 (6) 809-817 1994/08

    DOI: 10.1016/0969-8051(94)90160-0  

    ISSN: 0883-2897

  131. 18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution(共著)18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4・・・

    J. Labelled Compds. Radiopahrm. 34(), 1121-1127 1994

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    18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution(共著)18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution(共著)<br /> <br />

  132. Analogs of Arachidonic Acid: Synthesis and Preliminary In Vivo Distribution in Rats of Methyl w-[18F]Fluoroarachidonate(共著)

    J. Labelled Compds. Radiopharm. 35(), 337-338 1994

  133. 遺伝子発現の制御を目指した分子設計・合成および反応性の評価

    反応と合成の進歩シンポジウム(学会発表) 1994

  134. 18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution(共著)18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-S・・・

    J. Labelled Compds. Radiopahrm. 34(), 1121-1127 1994

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    18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution(共著)18F-Labeled Octanoates as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies. The Influence of 4-Substitution and the Fluorine Position on Biodistribution(共著) <br />

  135. Analogs of Arachidonic Acid: Synthesis and Preliminary In Vivo Distribution in Rats of Methyl w-[18F]Fluoroarachidonate(共著)

    J. Labelled Compds. Radiopharm. 35(), 337-338 1994

  136. 18F-Labelled analogs of aruchidonic acid : Synthesis and preliminary in vivo distribution in rats of methyl ω-[ 18F] fluoroarachidonate

    Journal of Labelled Compounds and Radiopharmaceuticals 35(), 337-338 1994

  137. Molecular Design for the Regulation of Gene Expression

    1994

  138. 8-[18F]Fluoro- octanoic Acid and its b-Substituted Derivatives as Potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies: Synthesis and Bidistribution(共著)

    Nucl. Med. Biol., 21(), 809-817 1994

    DOI: 10.1016/0969-8051(94)90160-0  

  139. 8-[18F]fluorooctanoic acid and its β-substituted derivatives as potential agents for cerebral fatty acid studies: Synthesis and biodistribution

    Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki, Minoru Maeda

    Nuclear Medicine and Biology 21 (6) 809-817 1994

    DOI: 10.1016/0969-8051(94)90160-0  

    ISSN: 0969-8051

  140. ω位標識F-18フルオロアラキドン酸投与ラットの脳及び心臓における代謝について

    1993

  141. シトシンをチミン等価体に変換する新規機能性核酸塩基の設計と合成

    1993

  142. SYNTHESIS OF OMEGA-FLUORINATED OCTANOIC-ACID AND ITS BETA-SUBSTITUTED DERIVATIVES

    F NAGATSUGI, S SASAKI, M MAEDA

    JOURNAL OF FLUORINE CHEMISTRY 56 (3) 373-383 1992/03

    ISSN: 0022-1139

  143. SYNTHESIS OF OMEGA-FLUORINATED OCTANOIC-ACID AND ITS BETA-SUBSTITUTED DERIVATIVES

    F NAGATSUGI, S SASAKI, M MAEDA

    JOURNAL OF FLUORINE CHEMISTRY 56 (3) 373-383 1992/03

    DOI: 10.1016/S0022-1139(00)81186-0  

    ISSN: 0022-1139

  144. ω位標識F-18オクタン酸指与ラットの血中代謝物と脳移行性について

    1992

  145. ω位標識F-18オクタン酸:ラット生体内分布に及ぼす4位及び7位置換基の影響

    1991

  146. F-18標識オクタン酸:ラット生体内分布に及ぼすフッ素置換位置の影響

    1991

  147. 脂質代謝による脳機能測定を指向したw位標識 18F脂肪酸合成とラット生体内分布

    1990

  148. Synthesis and Biodistribution of ω 18Flabeled fatlyacids : potential Agents for Cerebral Fatty Acid Studies

    1990

  149. STUDIES OF SUBSTITUENT EFFECT IN THE FORMATION OF BENZONITRILE OXIDES AND 1,3-DIPOLAR ADDUCTS OF THE BENZONITRILE OXIDES WITH 2,3,4,6-TETRA-O-ACETYL-1-THIO-BETA-D-GLUCOPYRANOSE

    S SAITO, H UZAWA, F NAGATSUGI

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 37 (9) 2519-2522 1989/09

    DOI: 10.1248/cpb.37.2519  

    ISSN: 0009-2363

  150. STUDIES OF SUBSTITUENT EFFECT IN THE FORMATION OF BENZONITRILE OXIDES AND 1,3-DIPOLAR ADDUCTS OF THE BENZONITRILE OXIDES WITH 2,3,4,6-TETRA-O-ACETYL-1-THIO-BETA-D-GLUCOPYRANOSE

    S SAITO, H UZAWA, F NAGATSUGI

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 37 (9) 2519-2522 1989/09

    DOI: 10.1248/cpb.37.2519  

    ISSN: 0009-2363

  151. TOTAL SYNTHESIS OF (+)-4-OXO-5,6,9,10-TETRADEHYDRO-4,5-SECOFURANOEREMOPHILANE-5,1-CARBOLACTONE VIA NOVEL LACTONE CONSTRUCTION THROUGH ALLENE INTRAMOLECULAR CYCLO-ADDITION

    K HAYAKAWA, F NAGATSUGI, K KANEMATSU

    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 53 (4) 860-863 1988/02

    DOI: 10.1021/jo00239a033  

    ISSN: 0022-3263

  152. TOTAL SYNTHESIS OF (+)-4-OXO-5,6,9,10-TETRADEHYDRO-4,5-SECOFURANOEREMOPHILANE-5,1-CARBOLACTONE VIA NOVEL LACTONE CONSTRUCTION THROUGH ALLENE INTRAMOLECULAR CYCLO-ADDITION

    K HAYAKAWA, F NAGATSUGI, K KANEMATSU

    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 53 (4) 860-863 1988/02

    DOI: 10.1021/jo00239a033  

    ISSN: 0022-3263

  153. セコエレモフィラン類の合成研究

    1986

  154. (±)セコエレモフィランの全合成

    1985

  155. Total Synthesis of (±) secofuranoeremophilane

    J. Org. Chem. 53(), 860-863 1985

  156. Site-directed Reaction to Cytidine by Functional Nucleobases Activated within A Duplex Cordon Conference(nucleic acids), New Port(U. S. A)

  157. 2'-Deoxy Nucleoside Derivatives of 6-Substituted 2-Aminopurine as Highly Efficient and Selective Cross-Linking Agent to Cytidine,

    Chem. Commun. , Symp. Series, in press.

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Books and Other Publications 8

  1. Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids

    Fumi Nagatsugi

    Springer 2022

    ISBN: 9789811613135

  2. 進化を続ける核酸化学 : ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬

    永次 史, 鬼塚 和光

    化学同人 2021/10

    ISBN: 9784759814019

  3. Middle Molecular Strategy Flow synthesis to functional molecules

    Fumi Nagatsugi, Kazumitsu Onizuka

    2021/06

  4. 核酸科学ハンドブック

    永次 史

    講談社 2020/12/22

  5. ハイブリッド形成によりマルチ制御機能を持つインテリジェント核酸の創製

    永次, 史

    [永次史] 2007/05

  6. Frontiers in Organic Chemistry Vol 1 in Y. Hayakawa ed

    S. Sasaki, F. Nagatsugi

    Bentham Science Publishers Ltd. The Netherlands 2005/04

  7. 新規反応性核酸によるゲノム配列特異的な点変異導入法の開発

    永次, 史

    [九州大学] 2005/03

  8. 2本鎖DNAに対して選択的な反応を誘起する新規反応性核酸の開発

    永次, 史

    [九州大学] 2003/05

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Presentations 279

  1. 新規光誘起型環化反応を用いた抗腫瘍化合物の活性制御

    法月 健真, 岡村 秀紀, 川森 有沙, 小澤 眞美子, 永次 史

    日本薬学会第145年会 2025/03/27

  2. Development of alkynylated purine-pyridone unnatural base pairs

    Wenjue Fan, Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    2025/03/27

  3. Chemoenzymatic incorporation of modified nucleosides into plasmids toward gene expression control

    Nadya Syahla Soemawisastra, Hidenori Okamura, Takeyuki Yao, Fumi Nagatsugi

    2025/03/28

  4. 新規光誘起型環化反応を用いた抗腫瘍化合物の光分子構築

    法月 健真, 岡村 秀紀, 川森 有沙, 小澤 眞美子, 永次 史

    第39回有機合成化学若手研究者の仙台セミナー 2024/12/21

  5. Development of the Selective Reactions to Target RNA Invited

    Fumi Nagatsugi

    Asia 3 Roundtable on Nucleic Acids 2024 2024/11/03

  6. 生体機能制御を可能とする人工分子の有機合成とその機能評価 Invited

    永次 史

    GTRセミナー(名古屋大学) 2024/10/11

  7. 光誘起型分子内環化反応を用いた抗腫瘍化合物の光分子構築

    法月 健真, 岡村 秀紀, 坂田 洸樹, 川森 有沙, 永次 史

    第53回複素環化学討論会 2024/10/11

  8. Development of 2-amino-6-vinyl-7-deazapurine nucleosides for uracil-selective RNA cross-link formation

    2024/10/11

  9. 含酸素芳香族複素環を構築可能な光誘起型ラジカル環化反応の開発

    坂田 洸樹, 岡村 秀紀, 川森 有沙, 永次 史

    第53回複素環化学討論会 2024/10/11

  10. プリン・ピリダジン環を母骨格にもつ人工的な核酸塩基対の合成と機能評価

    岡村秀紀, Wenjue Fan, Giang, Hoang Trinh, Zhuoxin Dong, 永次史

    第53回複素環化学討論会 2024/10/11

  11. 生体機能制御を可能とする人工分子の有機合成とその機能評価 Invited

    永次 史

    「ニューモダリティと有機合成化学」 第12回勉強会 2024/10/07

  12. 遺伝子発現をホスト−ゲスト相互作用で制御可能な人工核酸の開発

    岡村秀紀, 矢尾健行, 永次史

    第18回バイオ関連化学シンポジウム 2024/09/12

  13. Synthesis of interstrand crosslinked nucleic acids using 2’- deoxythioguanosine-functionalized oligonucleotides

    Jamila A. Osman, Kazumitsu Onizuka, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    Young researcher’s symposium of IRT2024 2024/09/07

  14. Study on base pairing and polymerase recognition of the unnatural alkynylated purine-pyridazine base pairs

    Wenjue Fan, Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang, Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 2024/09/03

  15. N6-guest modified adenosines enable reversible control of gene expression via host-guest interaction

    Hidenori Okamura, Takeyuki Yao, Fumi Nagatsug

    XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 2024/09/03

  16. Analysis of abasic site generation in DNA by photo-catalytic reaction

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Altan Okan, Madoka Sasaki, Ahmed Mostafa, Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    IRT2024TOKYO 2024/09/03

  17. Large-scale analysis of RNA alkylations using multiplexed RNA structure libraries

    Kazumitsu Onizuka, Yutong Chen, Emi Miyashita, Kaoru R. Komatsu, Ping-Yun Lan, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    IRT2024TOKYO 2024/09/03

  18. Exploration of small molecule-RNA pairs that bind through complementary hydrogen bonds

    Kosuke Tsuzuki, Kazumitsu Onizuka, Ryosuke Nagasawa, Emi Miyashita, Kaoru R. Komatsu, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    IRT2024TOKYO 2024/09/03

  19. Synthesis of interstrand crosslinked nucleic acids using 2’- deoxythioguanosine-functionalized oligonucleotides

    Jamila A. Osman, Kazumitsu Onizuka, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    IRT2024TOKYO 2024/09/03

  20. Formation of pseudorotaxane and catenane by chemically cyclized oligo DNAs

    Kazuki Kuwahara, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    IRT2024TOKYO 2024/09/03

  21. Large-scale analysis of RNA-binding selectivity of a small molecule utilizing structured RNA libraries

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    IRT2024TOKYO 2024/10/03

  22. Study of the combination of RNA-binding small molecule with hydrogen bonding

    Kosuke Tsuzuki, Kazumitsu Onizuka, Ryosuke Nagasawa, Emi Miyashita, Kaoru, R. Komatsu, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2024/08/26

  23. Analysis of the DNA damage by photo catalytic reaction

    2024/08/26

  24. Novel photo-induced cyclization reaction via oxygen-centered radical

    Kouki Sakata, Hidenori Okamura, Arisa Kawamori, Yui Kaneyama, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

    Chemistry Summer School 2024 (Tohoku University) 2024/07/19

  25. ホスト-ゲスト相互作用を利用した可逆的な遺伝子発現制御法の開発

    岡村秀紀, 矢尾健行, 永次史

    日本核酸医薬学会第9回年会 2024/07/16

  26. Development of 2-amino-6-vinyl-7-deazapurine deoxynucleosides for base-selective cross-linking and inhibition of miRNA function

    2024/07/16

  27. ホスト−ゲスト相互作用で駆動する遺伝子発現制御法の開発

    岡村秀紀, 矢尾健行, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会第18回年会 2024/05/28

  28. 細胞内有機化学を目指した人工分子の設計・合成及び機能評価 Invited

    永次 史

    第34回 福岡万有シンポジウム 2024/05/24

  29. Development of the photo-induced intramolecular radical cyclization under physiological conditions

    2024/05/18

  30. Development of N6-modified adenosines for reversible control of nucleic acid functions by host-guest interaction

    Hidenori Okamura, Takeyuki Yao, Fumi Nagatsugi

    ISBC2024 2024/04/24

  31. Uracil-selective RNA cross-linking and inhibition of miRNA function by 2-amino-6-vinyl-7-deazapurine deoxynucleosides

    Nadya Soemawisastra, Hidenori Okamura, Ahmed Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

    The 3rd Intertnaional Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2024) 2024/04/24

  32. Non-enzymatic abasic site generation in DNA by photo-catalytic reaction

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Altan Okan, Madoka Sasaki, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    ISBC2024 2024/04/24

  33. Interstrand crosslinking mediated by 2’-deoxythioguanosine-containg oligonucleotides

    Jamila Abbas Osman, Kazumitsu Onizuka, Yuuhei Yamano, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    2024/04/24

  34. Elucidation of RNA-binding selectivity of an aminoglycoside-thiazole orange probe by large-scale analysis and its application to RNA binder screening

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Ryohei Iwata, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    ISBC2024 2024/04/24

  35. Large-scale analysis of small molecule-RNA interactions by barcode microarray method

    Kazumitsu Onizuka, Ryosuke Nagasawa, Ryohei Iwata, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    ISBC2024 2024/04/24

  36. 新規光誘起型環化反応の開発に基づく薬理活性の光化学制御

    岡村 秀紀, 川森 有, 飯田 百, 金山 唯, 小澤 眞美子, 永次 史

    日本薬学会第144年会 2024/03/29

  37. 細胞機能制御を実現する人工分子創製を夢見て Invited

    永次 史, 鬼塚和光

    第104回 日本化学会春季年会シンポジウム 2024/03/20

  38. Investigation of pull-down unit position for large-scale analysis of RNA alkylation

    Ping-Yun Lan, Kazumitsu Onizuka, Yutong Chen, Emi Miyashita, Kaoru R. Komatsu, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2024/03/21

  39. Development of a new screening system to discover RNA-binding small molecules for RNA-targeting therapeutics

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Ryohei Iwata, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2024/03/21

  40. Interstrand crosslinks using oligonucleotides containing 2’-deoxythioguanosine

    Jamila Abbas Osman, Kazumitsu Onizuka, Yuuhei Yamano, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    2024/03/20

  41. Pseudorotaxane formation by cyclized oligo DNAs and approach to accelerating its formation

    Kazuki Kuwahara, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    2024/03/19

  42. Analysis of generation of of abasic site in DNA by photo oxidation

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Altan Okan, Madoka Sasaki, Ahmed Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    2024/03/19

  43. 新規光誘起型環化反応の開発に基づく抗腫瘍活性の光化学制御

    岡村 秀紀, 川森 有沙, 飯田 百香, 金山 唯, 小澤 眞美子, 永次 史

    日本化学会第104春季年会 2024/03/20

  44. Enzymatic incorporation and extension studies of the unnatural alkynylated purine-pyridazine base pair

    2024/03/20

  45. ホストゲスト相互作用を利用した遺伝子発現制御法の開発

    矢尾健行, 岡村秀紀, 永次史

    日本化学会第104春季年会 2024/03/20

  46. 酸素中心ラジカルを生成する光反応の開発と含酸素芳香環構築への応用

    坂田洸樹, 岡村秀紀, 川森有沙, 永次史

    日本化学会第104春季年会 2024/03/19

  47. Analysis of photo-catalytic abasic site generation in DNA

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Altan Okan, Madoka Sasaki, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsug

    S-FISNA 2024/02/29

  48. Large-scale analysis of RNA binding of small molecule G-clamp and its applications

    Kazumitsu Onizuka, Ryosuke Nagasawa, Ryohei Iwata, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    S-FISNA 2024/02/29

  49. Development of the reactive molecules to RNA higher ordered structure Invited

    FISNA pre-Symposium 2024/02/28

  50. ホスト−ゲスト相互作用で駆動する遺伝子発現制御法の開発

    矢尾健行, 岡村秀紀, 永次史

    第23回 東北大学多元物質科学研究所研究発表会 2023/12/07

  51. 含窒素複素環を与える光誘起型分子内環化反応の開発と薬理活性の光制御への応用

    岡村秀紀, 飯田百香, 川森有沙, 金山唯, 小澤眞美子, 永次史

    第40回メディシナルケミストリーシンポジウム 2023/11/14

  52. Synthesis and enzymatic incorporation study of unnatural purine-pyridone base pairs

    Wenjue Fan, Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang, Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/02

  53. Creation of base flipping-out structures on DNA and RNA using carbazole-modified thymidine analogs

    Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Madoka Sasaki, Ahmed Mostafa Abdelhady, Kei Ishida, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/02

  54. Interstrand-crosslinking using 2’-deoxythioguanosine-containing oligonucleotides

    Jamila Osman, Kazumitsu Onizuka, Yuuhei Yamano, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/02

  55. Large-scale analysis of nucleic acid-protein interactions by using photocatalyst-modified nucleic acid

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Tatsuki Masuzawa, Shinichi Sato, Keita Nakane, Takanori Oyoshi, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/02

  56. Chemically modified nucleosides enable reversible control of gene expression via host-guest interaction

    Takeyuki Yao, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/01

  57. Orthogonal control of DNA duplex hybridization driven by host-guest interaction

    Hidenori Okamura, Takeyuki Yao, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/01

  58. Abasic site generation by photo-catalytic reaction

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Altan Okan, Madoka Sasaki, Ahmed Mostafa Abdelhady, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/01

  59. Development of pyrimidine structure-based alkylating agents for nucleic acids modification

    Ping-Yun Lan, Kazumitsu Onizuka, Yutong Chen, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/01

  60. 近接効果によるRNAアルキル化反応に対するハイスループット解析法の開発

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Fumi Nagatsug

    ISNAC2023 2023/11/01

  61. Formation of pseudorotaxane and catenane structures using novel cyclized oligodeoxynucleotides

    Kazuki Kuwahara, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/01

  62. Development of novel fluorescent indicators to discover new RNA-binding small molecules in FID assay based on large-scale profiles of RNA-indicator interactions

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Ryohei Iwata, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2023 2023/11/01

  63. Development of novel fluorescent indicators to discover new RNA-targeting small molecules in FID assay driven by large-scale profiles of RNA-indicator interactions

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Ryohei Iwata, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2023/10/24

  64. 含窒素複素環を与える光誘起型環化反応の開発と薬理活性の光制御への応用

    岡村 秀紀, 飯田 百香, 川森 有沙, 金山 唯, 小澤 眞美子, 永次 史

    第52回複素環化学討論会 2023/10/14

  65. 含酸素芳香族複素環を与える光誘起型分子内環化反応の開発

    坂田 洸樹, 岡村 秀紀, 川森 有沙, 永次 史

    第52回複素環化学討論会 2023/10/12

  66. Development of the Selective Chemical Reactions to Target Nucleic Acids for the Effective Regulation for the Biological Function Invited

    Nagatsugi Fumi

    2023/09/19

  67. Design and synthesis of unnatural base pairs composed of alkynylated purine and pyridone nucleosides

    Wenjue Fan, Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang, Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    2023/09/08

  68. Development of unnatural nucleosides for reversible control of DNA duplex formation by host-guest interaction

    Takeyuki Yao, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    2023/09/08

  69. Construction of anticancer agents by photo-triggered cyclization reaction under physiological conditions

    Arisa Kawamori, Hidenori Okamura, Momoka Iida, Yui Kaneyama, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

    2023/09/08

  70. ホスト-ゲスト相互作用に基づく可逆的な二重鎖核酸制御法の開発

    岡村秀紀, 矢尾健行, 永次史

    第17回バイオ関連化学シンポジウム 2023/09/08

  71. Development of nucleic acids alkylating agents based on pyrimidine structure

    Pingyun Lan, Kazumitsu Onizuka, Yutong Chen, Fumi Nagatsugi

    2023/09/08

  72. Development of large-scale analytical approaches for proximity-induced RNA alkylation

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2023/09/08

  73. Synthesis of interstrand-crosslinked nucleic acids using 2'-deoxythioguanosine-containing oligonucleotides

    Jamila Osman, Kazumitsu Onizuka,Ahmed Mostafa Abdelhady, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    2023/09/08

  74. RNA結合性大規模情報を持つ新規蛍光指示薬の開発とRNA結合性小分子のスクリーニング

    長澤 瞭佑, 鬼塚 和光, 岩田 遼平, 小松 馨, 宮下 映見, 壇辻 さやか, 村瀬 裕貴, 小澤 眞美子, 齊藤 博英, 永次 史

    第17回バイオ関連化学シンポジウム 2023/09/08

  75. 新規光誘起型環化反応を用いた薬理活性制御法の開発

    川森 有沙, 岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 小澤 眞美子, 永次 史

    2023年光化学討論会 2023/09/07

  76. o-ニトロベンジルが誘起するN-O開裂を用いた含窒素芳香環構築反応の開発

    岡村 秀紀, 金山 唯, 飯田 百香, 川森 有沙

    2023年光化学討論会 2023/09/07

  77. Development of the Chemical Reactions for Regulation of Biological Function Invited

    Fumi Nagatsugi

    6th Asian Chemical Biology Conference (ACBC 2023) 2023/08/22

  78. Reversible regulation of DNA duplex formation driven by host-guest interaction

    Takeyuki Yao, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    2023/08/07

  79. Photo-control of drug activity using a novel photo-induced cyclization reaction

    Arisa Kawamori, Hidenori Okamura, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

    2023/08/07

  80. Large-scale analysis of RNA alkylation reaction with vinyl-quinazolinone (VQ) derivatives

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2023/07/15

  81. 低分子 G-clamp の RNA 結合性大規模解析とその応用 Invited

    鬼塚 和光, 長澤 瞭佑, 岩田 遼平, 村瀬 裕貴, 小松 リチャード馨, 宮下 映見, 小澤 眞美子, 齊藤 博英, 永次 史

    日本核酸医薬学会 第8回年会 若手シンポジウム 2023/07/11

  82. Development of novel binding-type fluorescent indicators with large-scale data of RNA-binding selectivity

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Ryohei Iwata, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2023/07/05

  83. Reversible base-pairing system driven by host-guest interaction enables control of duplex formation

    日本核酸医薬学会第, 回年会

    2023/07

  84. ホスト−ゲスト相互作用を利用したDNA構造制御法の開発

    矢尾健行, 岡村秀紀, 永次史

    第20回 ホスト-ゲスト・超分子化学シンポジウム 2023/06/17

  85. 擬ロタキサンの貫通方向制御能とカテナン形成能を有する新規環状化核酸の開発

    桑原和貴, 鬼塚和光, 矢島さやか, 山野雄平, 永次史

    第20回 ホスト-ゲスト・超分子化学シンポジウム 2023/06/17

  86. 生理的条件下で含窒素芳香環を構築できる光反応の開発と応用研究 Invited

    川森 有沙, 岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 永次 史

    第33回万有福岡シンポジウム 2023/06/03

  87. 生理的条件下で含窒素芳香環を構築できる光反応の開発と応用研究 Invited

    川森 有沙, 岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 永次 史

    第16回 三地区若手交歓会 福岡ミニシンポジウム 2023/06/02

  88. 含窒素芳香環を細胞内で構築可能な光誘起型環化反応の開発

    岡村秀紀, 飯田百香, 金山唯, 川森有沙, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会 2023/05/31

  89. 擬ロタキサンの貫通方向制御能とカテナン形成能を有する新規環状化核酸の開発

    桑原和貴, 鬼塚和光, 矢島さやか, 山野雄平, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会 2023/05/29

  90. RNA結合性大規模情報を保持した新規蛍光指示薬の開発と評価

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 岩田遼平, 小松リチャード馨, 宮下映見, 村瀬裕貴, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会 2023/05/29

  91. 生理的条件下で含窒素芳香環を構築できる光反応の開発と応用研究

    川森 有沙, 岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 永次 史

    第34回万有仙台シンポジウム 2023/04/22

  92. Development of uridine-selective cross-linkable 2-amino-7-deaza-6-vinylpurine deoxyriboside toward miRNA inhibition

    Nadya Soemawisastra, Hidenori Okamura, Ahmed Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

    2023/03/27

  93. 含窒素芳香環の細胞内構築を可能にする光誘起型環化反応の開発

    岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 川森 有沙, 永次 史

    日本薬学会第143年会 2023/03/27

  94. RNA結合性情報を持つ新規蛍光指示薬の開発

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 岩田 遼平, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    日本薬学会第143年会

  95. Design and synthesis of alkynylated C-pyridone nucleosides for selective unnatural base pairing

    Wenjue Fan, Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    2023/03/22

  96. ホストーゲスト相互作用で駆動する二重鎖DNAの可逆制御機構の開発

    矢尾 健行, 岡村 秀紀, 永次 史

    日本化学会 第103春季年会 2023/03/22

  97. 光誘起型環化反応を用いたトポイソメラーゼ阻害剤の光構築

    川森 有沙, 岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 永次 史

    日本化学会 第103春季年会 2023/03/24

  98. 光誘起型N-O開裂に基づく含窒素芳香環構築反応の開発

    金山 唯, 岡村 秀紀, 飯田 百香, 川森 有紗, 永次 史

    日本化学会 第103春季年会 2023/03/25

  99. 擬ロタキサンおよびカテナン形成能を持つ新規環状化核酸の開発

    桑原和貴, 鬼塚和光, 矢島さやか, 山野雄平, 永次史

    日本化学会 第103春季年会

  100. 光触媒導入DNAプローブを利用した核酸光修飾法の開発

    山野雄平, 鬼塚和光, 佐々木まどか, 佐藤伸一, 永次史

    日本化学会 第103春季年会

  101. Development of reactive OFF-ON type alkylating agents based on pyrimidine structure

    Pingyun Lan, Kazumitsu Onizuka, Yutong Chen, Fumi Nagatsugi

  102. Large-scale analysis of RNA alkylation using OFF-ON type alkylators

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

  103. Photocatalytic profiling of G4 DNA-interacting proteins

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Shinichi Sato, Tatsuki Masuzawa, Takanori Oyoshi, Fumi Nagatsugi

  104. RNA 標的創薬を指向した結合性小分子スクリーニングシステムの開発 Invited

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    理学・生命科学2研究科合同オンラインシンポジウム2023 2023/02/17

  105. Alkylation of G4 nucleic acids by reactive Off-On type reagent and its application

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Emi Miyashita, Kaoru R. Komatsu, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2022/12/08

  106. Development of the alkynylated pyridone nucleosides toward selective unnatural base pairing

    Wenjue Fan, Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang, Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

  107. evelopment of 2-amino-7-deaza-6-vinylpurine deoxyriboside as a U-selective cross-linker toward miRNA inhibition

    Nadya Soemawisastra, Hidenori Okamura, Ahmed Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

  108. Development of a chemically-convertible nucleoside system toward enzymatic amplification of the minor-groove modified DNA

    Hidenori Okamura, Rina Ito, Kenta Sato, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2022

  109. Large-scale analysis of RNA-fluorescence indicator interactions and screening for RNA-binding small molecules

    Ryosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2022

  110. Pseudorotaxane and catenane formation via the slipping process

    Kazumitsu Onizuka, Kazuki Kuwahara, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2022

  111. Nucleic acids modification by photo-catalytic reaction

    Yuuhei Yamano, Kazumitsu Onizuka, Madoka Sasaki, Shinichi Sato, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2022

  112. Development of 2-amino-7-deaza-6-vinylpurine deoxyriboside as a U-selective cross-linker toward miRNA inhibition

    Nadya Soemawisastra, Hidenori Okamura, Ahmed Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Mamiko Ozawa, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2022

  113. Selective photo-catalytic proximity labeling of G4 DNAinteracting proteins for the interaction proteomes of G4 DNA

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Tatsuki Masuzawa, Shinichi Sato, Keita Nakane, Takanori Oyoshi, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2022

  114. Development of a screening system for RNA-binding small molecules based on large-scale information of interactions between RNAs and a fluorescence indicato

  115. スリッピング方向が制御可能な貫通構造形成核酸の開発とそのメカニズム解明

    桑原和貴, 鬼塚和光, 矢島さやか, 山野雄平, 永次史

    第12回 CSJ化学フェスタ2022

  116. Creation of novel fluorescent indicators for screening of RNA binding small molecules

    Ryohei Iwata, Kazumitsu Onizuka, Ryosuke Nagasawa, Hirotaka Murase, Fumi Nagatsugi

  117. Development of novel threaded structure-forming nucleic acids with the ability of slipping direction control and their mechanism elucidation

    Kazuki Kuwahara, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Yuuhei Yamano, Fumi Nagatsugi

  118. RNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析とRNA結合分子探索

    鬼塚和光, 長澤瞭佑, 小松リチャード馨, 宮下映見, 岩田遼平, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    第16回バイオ関連化学シンポジウム

  119. 光感受性オキシムの特異な反応性に着目した新規光環化反応の開発

    岡村秀紀, 飯田百香, 金山唯, 永次史

    第16回バイオ関連化学シンポジウム 2022/09/11

  120. 初期地球におけるホルモース型反応を用いた核酸塩基類似物およびヌクレオシド類似物の生成

    平川祐太, 岡村秀紀, 永次史, 掛川武, 古川善博

    日本地球化学会第69回年会 2022/09/07

  121. Development of the Selective Chemical Reactions to Target Nucleic Acids Invited

    Nagatsugi Fumi

    2022 Tohoku University Chemistry Summer School 2022/08/19

  122. 機能性オリゴヌクレオチドの開発 Invited

    永次 史

    日本核酸医薬学会 第7回年会 2022/08/02

  123. Selective light-based proximity labeling of DNA-interacting proteins) Invited

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Tatsuki Masuzawa, Shinichi Sato, Keita Nakane, Takanori Oyoshi, Fumi Nagatsugi

    2022/08/01

  124. RNA-蛍光指示薬間相互作用大規模情報を利用したRNA結合分子スクリーニング

    長澤瞭佑、鬼塚和光、小松リチャード馨、宮下映見、小澤眞美子、齊藤博英、永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会

  125. 含窒素芳香環を細胞内構築できる光誘起型環化反応の開発

    岡村秀紀, 飯田百香, 金山唯, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会 2022/05/30

  126. RNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析情報を用いた疾患関連pre-miRNA結合分子の探索

    長澤 瞭佑, 鬼塚 和光, 小松 馨, 宮下 映見, 小澤 眞美子, 齊藤 博英, 永次 史

    日本薬学会 第142年会 2022/03/28

  127. CGGリピートRNAの構造変換を誘起する1,3-diazaphenoxazine誘導体の開発

    村瀬 裕貴, 永次 史, 佐々木 茂貴

    日本薬学会 第142年会 2022/03/27

  128. Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (76) : Structure-based Chemical Modification of Berberine to Improve the RNA Binding Property

    Sagar Satpathi, Tamaki Endoh, Yutong Chen, Saki Matsumoto, Tatsuya Ohyama, Peter Podbev, Janez Plavec, Kazumitsu Onizuka, Fumi Nagatsugi, Naoki Sugimoto

    2022/03/24

  129. Development of novel OFF-ON type alkylating reagent

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Pingyun Lan, Fumi Nagatsugi

    2022/03/23

  130. Synthesis and cross-link properties of 2-amino-6-vinyl-7-deazapurine-deoxyriboside for anti-miRNA therapy

    Nadya Syahla Soemawisastra, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    2022/03/23

  131. RNA結合大規模情報に基づいた新規蛍光指示薬の創製

    岩田 遼平, 鬼塚 和光, 長澤 瞭佑, 村瀬 裕貴, 永次 史

    日本化学会 第102春季年会 2022/03/23

  132. DACN-MMCと3-アジドクマリンを用いた生体分子の蛍光標識化

    林原 智也, 河崎 悠也, 鬼塚 和光, 井川 和宣, 永次 史, 友岡 克彦

    日本化学会 第102春季年会 2022/03/26

  133. 光感受性オキシム構造を用いた生体適合性の光誘起型環化反応の開発

    岡村 秀紀, 飯田 百香, 金山 唯, 永次 史

    日本化学会 第102春季年会 2022/03/23

  134. Development of the reactive OFF-ON type alkylating agents to higher ordered nucleic acids structures Invited

    Fumi Nagatsugi, Madoka E. Hazemi, Norihiro Sato, Gen-ichiro Tsuji, Shunya Ishikawa, Mamiko Ozawa, Kazumitsu Onizuka

    Pacifichem2021 New Challenge in Interdisciplinary and Multiscale Supramolecular Sciences 2021/12/22

  135. Unnatural base pairs with spatially isolated pseudo-nucleobases in the major groove of DNA Invited

    Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang Hoang Trinh, Yoshiaki Masaki, Kohji Seio, Fumi Nagatsugi

    Pacifichem2021 Satellite Symposium - Modified DNA and XNA for therapeutic application 2021/12/19

  136. Unnatural base pairs with spatially isolated pseudo-nucleobases in the major groove of DNA Invited

    Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang Hoang Trinh, Yoshiaki Masaki, Kohji Seio, Fumi Nagatsugi

    2021/12/18

  137. RNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析に基づくRNA結合分子探索

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    第21回東北大学多元物質科学研究所研究発表会 2021/12/09

  138. Unnatural base pairs with spatially isolated hydrogen-bonding units in the DNA major groove

    Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2021 2021/11/11

  139. Creation of interstrand cross-linked nucleic acids and their application for miRNA inhibition

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Yu Hirano, Komatsu, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2021 2021/11/11

  140. Reactivity modulation of reactive OFF-ON type alkylating reagents for higher-ordered structures of nucleic acids

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Fumi Nagatsugi

    ISNAC2021 2021/11/11

  141. 標的核酸に対する選択的化学反応の開発 Invited

    永次 史

    核酸化学若手フォーラム 2021 2021/11/10

  142. RNA標的低分子創薬を目指したRNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    第11回CSJ化学フェスタ2021 2021/10/21

  143. Screening RNA-binding small molecules by means of large-scale analysis of RNA-fluorescence indicator interactions

    2021/10/02

  144. Development of a photo-cyclization reaction producing phenanthridines in aqueous media

    2021/10/02

  145. 副溝修飾アプタマーの探索を指向した置換基着脱型人工核酸の開発

    岡村秀紀, 伊藤理奈, 佐藤健太, 永次史

    第15回 バイオ関連化学シンポジウム 2021/09/09

  146. RNA結合性・アルキル化反応性の大規模解析技術開発

    鬼塚和光, 小松リチャード馨, 長澤瞭佑, Yutong Chen, 宮下映見, 石川竣也, 小嶋かんな, 村瀬裕貴, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    第15回 バイオ関連化学シンポジウム 2021/09/08

  147. Novel reactivity modulable alkylating agents for higher-order structures of nucleic acids

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Fumi Nagatsugi

    2021/09/03

  148. Development of 2-amino-6-vinyl-7-deazapurine-deoxyriboside as an efficient cross-linking nucleoside for anti-miRNA therapy

    Nadia Syahla Soemawisastra, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    IS3NA-IRT Virtual Symposium 2021 2021/08/26

  149. Efficient cross-linking reaction using base flip-inducing oligodeoxynucleotides

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Kei Ishida, Eriko Mano, Fumi Nagatsugi

    IS3NA–IRT 2021 2021/08/26

  150. Unnatural base pairs with spatially-isolated nucleobase-like modules in the major groove of DNA

    Hidenori Okamura, Zhuoxin Dong, Giang Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    2021/08/05

  151. Structural optimization of alkynylated purine-pyridazine pairs for enhanced selectivity against natural nucleobases

    Zhuoxin Dong, Hidenori Okamura, Giang Hoang Trinh, Fumi Nagatsugi

    2021/08/06

  152. Efficient alkene–alkene photo-cross-linking reaction on the flipping-out field in duplex DNA

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Kei Ishida, Eriko Mano, Fumi Nagatsugi

    2021/08/05

  153. RNA 結合性低分子探索に向けたRNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    生体機能関連化学部会若手の会 第32回サマースクール 2021/07/16

  154. RNA-小分子間化学シグナル大規模解析技術の展開

    鬼塚和光, 小松リチャード馨, 齊藤博英, 永次史

    「化学コミュニケーションのフロンティア」第8回公開シンポジウム 2021/07/02

  155. 副溝修飾アプタマーの探索を指向した置換基着脱型ヌクレオシドの開発

    岡村秀紀, 伊藤理奈, 佐藤健太, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第15回年会 2021/06/22

  156. RNAアルキル化反応の大規模解析技術開発

    鬼塚和光, 小松リチャード馨, 石川竣也, Yutong Chen, 小嶋かんな, 村瀬裕貴, 長澤瞭佑, 小澤眞美子, 宮下映見, 齊藤博英, 永次史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第15回年会 2021/06/21

  157. RNA 標的創薬を志向したRNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    第32回万有仙台シンポジウム 2021/05/15

  158. RNA標的創薬を志向したRNA-小分子間相互作用大規模解析技術の開発

    鬼塚和光, 小松リチャード馨, 小嶋かんな, 村瀬裕貴, 石川竣也, 小澤眞美子, 長澤瞭佑, 宮下映見, 齊藤博英, 永次史

    日本薬学会第141年会 2021/03/29

  159. RNAの高次構造変化を誘起する新規低分子リガンドの開発

    村瀬 裕貴, 永次 史, 佐々木 茂貴

    日本薬学会第141年会 2021/03/29

  160. Investigation of on-column Sonogashira coupling for structural optimization of alkynylated purine-pyridazine base pairs

    Giang Hoang Trinh, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    2021/03/22

  161. 光感受性オキシムを用いた新規光環化反応の開発

    飯田百香, 岡村秀紀, 永次史

    日本化学会 第101春季年会 2021/03/21

  162. Alkynylated purine-pyridazine base pairs with enhanced orthogonality by utilizing non-classical hydrogen bond

    Zhuoxin Dong, Hidenori Okamura, Fumi Nagatsugi

    2021/03/22

  163. 化学修飾アプタマーの開発を指向した置換基着脱型ヌクレオシドの設計と合成

    岡村秀紀, 伊藤理奈, 永次史

    日本化学会 第101春季年会 2021/03/19

  164. 標的核酸塩基のフリップアウトを誘起する人工核酸の開発とその機能化

    佐々木まどか, 鬼塚和光, 矢島さやか, Ahmed Mostafa Abdelhady, 石田圭, 永次史

    日本化学会 第101春季年会 2021/03/19

  165. DACNを用いた蛍光標識型クリック反応の開発

    河崎 悠也, 林原 智也, 鬼塚 和光, 井川 和宣, 永次 史, 友岡 克彦

    日本化学会 第101春季年会 2021/03/20

  166. Alkene–alkene photo-cross-linking reaction on the flipping-out field in duplex DNA

    Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Sayaka Yajima, Kei Ishida, Eriko Mano, Fumi Nagatsugi

    2021/03/20

  167. Reactivity modulation of reactive OFF-ON type G4-DNA alkylating reagents

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Fumi Nagatsugi

    2021/03/19

  168. RNA結合分子のハイスループット探索に向けたRNA-蛍光指示薬間相互作用大規模解析

    長澤瞭佑, 鬼塚和光, 小松リチャード馨, 宮下映見, 小澤眞美子, 齊藤博英, 永次史

    日本化学会 第101春季年会 2021/03/19

  169. RNAを標的としたアルキル化反応の大規模解析技術開発

    鬼塚和光, 小松リチャード馨, 石川竣也, Yutong Chen, 小嶋かんな, 村瀬裕貴, 長澤瞭佑, 小澤眞美子, 宮下映見, 齊藤博英, 永次史

    日本化学会 第101春季年会 2021/03/22

  170. ベルベリンによるRNA2次構造の認識機構の解析とRNAアルキル化剤への拡張

    遠藤玉樹, スタパチ サガー, チェン ユートン, 鬼塚和光, 永次 史, 杉本直己

    第20回多元研発表会 2020/12/08

  171. Alkylation of G-quadruplex DNA by reactive Off-On type reagents

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Madoka E. Hazemi, Fumi Nagatsugi

    2020/12/08

  172. Development of unnatural nucleosides for functionalization of nucleic acids

    Hidenori Okamura, Rina Ito, Fumi Nagatsugi

    2020/12/01

  173. Stable and orthogonal DNA base pair with translocated recognition units

    Hidenori Okamura, Giang Hoang Trinh, Zhuoxin Dong, Fumi Nagatsugi

    The 4th Symposium for The Core Research Cluster for Materials Science and the 3rd Symposium on International Joint Graduate Program in Materials Science 2020/11/17

  174. アプタマー探索適用を目指した新規修飾ヌクレオシドの開発

    伊藤理奈, 岡村秀紀, 永次 史

    第31回 万有シンポジウム 2020/10/17

  175. 標的RNAに対して効率的架橋反応性を持つ人工核酸の開発 Invited

    永次 史, 阿部友亮, 山田 研, 福間清乃, 唐东来, 岡村秀紀

    第69回高分子討論会 2020/09/17

  176. 核酸塩基フリップアウト場における特異な化学反応

    鬼塚 和光, 石田 圭, 矢島 さやか, 間野 絵梨子, 永次 史

    日本薬学会第140年会 2020/03/28

  177. Development of the novel artificial nucleic acids to induce the base flipping out

    2020/03/23

  178. 付加的な水素結合部位を付与したヌクレオシド類縁体による直行型塩基対形成

    岡村 秀紀, Trinh Hoang Giang, 永次 史

    日本化学会第100春季年会 2020/03/22

  179. 化学修飾アプタマーの探索を指向した新規人工ヌクレオシドの創製

    伊藤 理奈, 岡村 秀紀, 永次 史

    日本化学会第100春季年会 2020/03/22

  180. 核酸高次構造を標的とした反応性中分子の開発

    永次 史

    新学術領域 反応集積化が導く中分子戦略 第9回成果報告会 2020/01/24

  181. 高機能化遺伝子発現システムの構築を指向した新規人工塩基対の創製

    岡村秀紀, Trinh Hoang Giang, 永次 史

    第19回多元物質科学研究所研究発表会 2019/12/12

  182. Reactive OFF-ON type alkylating agents for higher-ordered structures of nucleic acids International-presentation Invited

    F. Nagatsugi, M. HAZEMI, E. Ganbold, K. Onizuka

    The 4th A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub 2019/11/20

  183. Orthogonal base pair formation by nucleoside analogs bearing additional hydrogen-bonding units International-presentation

    H. Okamura, G. H. Trinh, F. Nagatsugi

    ISNAC 2019 2019/10/31

  184. Base-flip-inducing oligo DNA and photo-crosslinking on the flipping-out field International-presentation

    K. Onizuka, K. Ishida, S. Yajima, E. Mano, F. Nagatsugi

    ISNAC 2019 2019/10/30

  185. 付加的な水素結合ユニットを有するデュアルヘッド型人工塩基対の開発

    岡村秀紀, Trinh Hoang Giang, 永次 史

    第13回バイオ関連化学シンポジウム 2019/09/06

  186. 核酸塩基フリップアウト場における特異な光反応

    鬼塚 和光, 石田 圭, 間野 江梨子, 永次 史

    第13回バイオ関連化学シンポジウム 2019/09/05

  187. 遺伝子発現制御を目指した核酸の特殊反応場における選択的化学反応の開発

    永次 史

    有機合成夏季セミナー 明日の有機合成化学 2019/08/28

  188. Development of the functional molecules for alkylating G-quadruplex, International-presentation

    S. Ishikawa, M. E. Hazemi, K.Onizuka, F.Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2019 2019/08/27

  189. Development of the alkylation reactions to the higher-ordered structures of nucleic acids International-presentation

    K.Onizuka, M.E. Hazemi, N. Sato, G. Tsuji, S. Ishikawa, F. Nagatsugi

    CISNAC 2019, 2019/07/23

  190. Base flip-inducing oligo DNA and photo-crosslinking

    K.Onizuka, K. Ishida, E. Mano, F. Nagatsugi

    CISNAC 2019 2019/07/21

  191. 効率的遺伝子制御を目指した配座固定型架橋反応性オリゴヌクレオチドの開発

    永次 史, 福間清乃, 阿部友亮, 山田 研, 村瀬裕貴, 岡村秀紀

    第5回日本核酸医薬学会年会 2019/07/11

  192. 核酸高次構造選択的アルキル化反応は遺伝子発現を制御する

    鬼塚和光, ハゼミ・マドカ, 石川俊也, 永次 史

    第22回生命化学研究会(北見) 2019/06/21

  193. 核酸高次構造選択的アルキル化のための反応性OFF-ON型反応素子の開発

    鬼塚和光, Madoka E. Hazemi, 石川竣也, 永次 史

    、日本ケミカルバイオロジー学会 第14回年会 2019/06/11

  194. 反応性OFF-ON型核酸高次構造選択的アルキル化剤の開発

    鬼塚和光, Madoka E. Hazemi, 石川竣也, 永次 史

    第115回有機合成化学シンポジウム 2019/06/03

  195. 遺伝子発現を制御する機能性中分子の創製

    永次 史

    新学術領域成果報告会 2019/05/31

  196. Development of the effective alkylating probes for the higher-ordered structure of nucleic acids, Development of the effective alkylating probes for G-Quadruplex, International-presentation

    K.Onizuka, M.E. Hazemi, N. Sato, G. Tsuji, S. Ishikawa, F.Nagatsugi

    27th FJS Symposium – Fukuoka – Japan, Fukuoka 2019/05/21

  197. 標的核酸を捕らえる新しい反応性分子開発 Invited

    鬼塚和光, 永次 史

    標的核酸を捕らえる新しい反応性分子開発、日本薬学会 139年会 2019/03/23

  198. Development of a selective labeling reagent for pseudouridine in RNA International-presentation

    H. Okamura, F. Nagatsugi

    日本化学会 第99春季年会 2019/03/21

  199. 標的核酸塩基のフリップアウトを誘起する人工核酸の開発と特異な光反応

    鬼塚 和光, 石田 圭, 間野 江梨子, 永次 史

    2019/03/16

  200. 、G四重鎖をアルキル化する機能性分子の開発

    石川 竣也, Hazemi E. Madoka, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本化学会 第99春季年会 2019/03/16

  201. 遺伝子発現を標的とした創薬手法の開発 Invited

    永次 史

    TRセンター第11回シンポジウム 2019/01/26

  202. Selective Binding Molecules to Nucleic Acids in the Higher-Ordered Structures, International-presentation Invited

    NAGATSUGI Fumi

    ACBI, Myanmar meeting 2019/01/20

  203. Development of the Cross-linkable Oligonucleotides for the Control of Gene Expression International-presentation

    Fumi Nagatsugi, Ken Yamada, Yusuke Abe, Kiyono Fukuma, Hirotaka Murase

    2018/11/14

  204. Spontaneous pseudorotaxane formation targeting nucleic acids and fluorogenic click chemistry International-presentation

    K.Onizuka, J. Matsuyama, T.Miyashita, Y. Kawasaki, K. Igawa, K.Tomooka, F. Nagatsug

    The 45th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2018/11/08

  205. Development of small molecular G-clamp derivatives binding to RNA higher-order structure International-presentation

    Hirotaka Murase, Fumi Nagatsugii

    The 45th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2018/11/07

  206. Selective Binding Molecules to Nucleic Acids in the Higher-Ordered Structures International-presentation Invited

    Fumi Nagatsugi, HAZEMI, Madoka Eurika, Akira Usami, Norihiro Sato, Kazumitsu Onizuka

    The 3rd A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub 2018/11/02

  207. 疾患関連核酸高次構造を標的とした反応性プローブの開発 Invited

    永次 史

    成30年度化学系学協会東北大会 2018/09/16

  208. 標的核酸天気をフリップアウトさせる機能性核酸の開発

    石田 圭, 鬼塚 和光, 永次 史

    第12回バイオ関連化学シンポジウム 2018/09/11

  209. 核酸高次構造アルキル化のための新規反応剤の開発

    鬼塚 和光, Hazemi E.Madoka, 丹野宏亮, 石川俊也, 佐藤憲大, 永次 史

    第12回バイオ関連化学シンポジウム 2018/09/09

  210. Spontaneous pseudorotaxane formation targeting nucleic acids International-presentation

    Kazumitsu Onizuka, Jumpei Matsuyama, Takuya Miyashita, Yuuya Kawasaki, Kazunobu Igawa, Katsuhiko Tomooka, Fumi Nagatsug

    XXIII Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids Chemical Biology of Nucleic Acids 2018/08/28

  211. Development of fluorescent probe for RNA higher-order structure International-presentation

    Hirotaka Murase, Fumi Nagatsugi

    XXIII Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids Chemical Biology of Nucleic Acids 2018/08/28

  212. Development of the effective alkylating probes for G-Quadruplex International-presentation

    Fumi Nagatsugi, Norihiro Sato, Madoka Hazemi Eurika, Kazumitsu Onizuka

    XIII Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids Chemical Biology of Nucleic Acids 2018/08/27

  213. 効率的遺伝子制御に向けた架橋反応性7-デアザ-6-ビニルグアニン誘導体の開発

    村瀬裕貴, 福間清乃, 阿部友亮, 山田研, 鬼塚和光, 永次 史

    第4回日本核酸医薬学会年会 2018/07/10

  214. 擬ロタキサン形成核酸の開発とその応用研究

    鬼塚 和光, 松山 潤炳, 宮下 卓也, 河崎 悠也, 井川 和宣, 友岡 克彦, 永次 史

    第4回日本核酸医薬学会年会 2018/07/09

  215. ビオチンを修飾した核酸結合性分子の合成と結合RNA配列解析への展開

    小嶋かんな, 鬼塚和光, 丹野宏亮, 永次 史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第13回年会 2018/06/12

  216. 1,3-ジアザフェノキサジン環によるグアニン認識を利用したRNA高次構造検出プローブの開発

    村瀬裕貴, 永次 史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第13回年会 2018/06/11

  217. 標的RNAを化学的に切断する機能性核酸の開発

    鬼塚 和光, 田口晃史, 永次 史

    日本薬学会138年会 2018/03/25

  218. ビニルキナザオリオン誘導体によるG-4重鎖構造のアルキル化

    永次 史, ハゼミ・マドカ, 佐藤憲大, 鬼塚和光

    日本薬学会138年会 2018/03/25

  219. 高い架橋反応性を持つ7-デアザ-6-ビニルグアニン誘導体の開発

    福間清乃, 阿部友亮, 山田研, 鬼塚和光, 村瀬裕貴, 永次 史

    日本薬学会138年会 2018/03/25

  220. ビオチンをコンジュゲートした核酸結合小分子の合成と結合RNA配列解析への展開

    小嶋かんな, 鬼塚和光, 丹野宏亮, 永次 史

    日本化学会 第98春季年会 2018/03/21

  221. RNA切断能を持つ機能性核酸の開発

    鬼塚 和光, 田口晃史, 永次 史

    日本化学会 第98春季年会 2018/03/20

  222. RNAの非共有結合性蛍光ラベル化を可能にする蛍光OFF/ON型擬ロタキサン形成核酸の開発

    松山 潤炳, 鬼塚 和光, 宮下 卓也, 河崎 悠也, 井川 和宣, 友岡 克彦, 永次 史

    日本化学会 第98春季年会 2018/03/20

  223. 相補塩基のフリップアウトを誘起する人工核酸の開発

    石田 圭, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本化学会 第98春季年会 2018/03/20

  224. 、化学的遺伝子発現制御を目指した標的核酸の選択的アルキル化反応の開発 Invited

    永次 史

    核酸の科学シンポジウム 2018/02/22

  225. Development of novel G-quadruplex alkylating agents International-presentation

    M. E. Hazemi, K. Onizuka, T. Kobayashi, A. Usami, N. Sato, F. Nagatsugi

    ISBC2017 2017

  226. The development of small molecules binding to the hairpin RNA structure International-presentation

    H. Murase, F.Nagatsugi

    ISBC2017 2017

  227. Spontaneous pseudorotaxane formation targeting RNA International-presentation

    K. Onizuka, J. Matsuyama, T. Miyashita, Y. Kawasaki, K. Igawa, K. Tomooka, F. Nagatsugi

    ISBC2017 2017

  228. Development of G-quadruplex Alkylating Small Molecules International-presentation

    M. E. Hazemi, K. Onizuka, T. Kobayashi, A. Usami, N. Sato, F. Nagatsugi

    The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2017

  229. Selective alkylation of T-T mismatched bases in DNA International-presentation

    K. Onizuka, A. Usami, Y. Yamaoki, T. Kobayashi, M. E. Hazemi, T. Chikuni, M. Katahira, F. Nagatsugi

    The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2017

  230. Development of artificial oligonucleotides with the RNA- cleaving ability International-presentation

    A. Taguchi, K. Onizuka, F. Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2016 2017

  231. Development of new efficient alkylating probes targeting double stranded DNA containing an abasic-site International-presentation

    K. Tanno, K. Yamada, Y. Sasaki, N. Sato, K. Onizuka, F. Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2016 2017

  232. Spontaneous pseudorotaxane formation methods targeting on RNA, International-presentation

    K. Onizuka, T. Miyashita, T. Chikuni, F. Nagatsugi

    The 43rd Naito conference on noncoding RNA: biology, chemistry, and diseases 2017

  233. Development of the Reactive Oligonucleotides for the Control of Gene Expression International-presentation

    F. Nagatsugi, K. Yamada, Y. Abe, S. Kusano

    26th FJS symposium 2017

  234. Development of the Reactive Probes for Selective Alkylation to G4 Structure International-presentation

    F. Nagatsugi

    Asian Chemical Biology Initiative 2017

  235. Development of the Chemical Tools for the Alkylation to Nucleic Acid Binding Protein International-presentation

    F. Nagatsugi

    Asian Chemical Biology Initiative 2017

  236. 擬ロタキサン形成時に蛍光を発する機能性核酸の開発

    鬼塚和光, 松山潤炳, 宮下卓也, 河崎悠也, 井川和宣, 友岡克彦, 永次史

    H29年度 アライアンス医療材料・デバイス・システムグループG3 分科会 2017

  237. 高効率遺伝子発現制御を指向した、架橋反応性7-デアザ-6-ビニルグアニン誘導体の開発

    福間清乃, 阿部友亮, 山田研, 鬼塚和光, 村瀬裕貴, 永次 史

    第11回バイオ関連化学シンポジウム 2017

  238. DNA中のT-Tミスマッチ構造を選択的にアルキル化する小分子の開発

    鬼塚 和光, 宇佐美 彬, 山置佑大, 小林倫仁, Madoka Eurika Hazemi, 千国友子, 片平 正人, 永次 史

    第11回バイオ関連化学シンポジウム 2017

  239. 脱塩基部位を持つ2本鎖DNAを選択的にアルキル化する新規プローブの開発

    丹野 宏亮, 山田 研, 佐藤 憲大, 佐々木 欣宏, 鬼塚 和光, 永次 史

    第28回 万有仙台シンポジウム 2017

  240. T-Tミスマッチ構造を選択的にアルキル化する小分子の開発

    鬼塚 和光, 宇佐美 彬, 小林倫仁, Madoka Eurika Hazemi, 永次 史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第12回年会 2017

  241. 環状化核酸を用いたスリッピングによる擬ロタキサン構造形成のメカニズム研究

    鬼塚 和光, 千国 友子, 宮下 卓也, 永次 史

    日本薬学会137年会 2017

  242. Selective G-quadruplex alkylation by vinyl triazine derivatives

    Madoka Eurika Hazemi, 宇佐美 彬, 小林倫仁, 佐藤 憲大, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本化学会 第97春季年会 2017

  243. Mechanistic study of pseudorotaxane formation via the slipping process targeting on nucleic acids

    鬼塚 和光, 千国 友子, 宮下 卓也, 永次 史

    日本化学会 第97春季年会 2017

  244. 脱塩基部位を持つ2本鎖DNAを標的とした効率的アルキル化プローブの開発

    丹野 宏亮, 山田 研, 佐々木 欣宏, 佐藤 憲大, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本化学会 第97春季年会 2017

  245. 擬ロタキサン形成オリゴ核酸機能化のためのリンカー構造の検討

    田口 晃史, 鬼塚 和光, 宮下 卓也, 永次 史

    日本化学会 第97春季年会 2017

  246. 核酸高次構造をアルキル化する中分子の開発〜生体分子に対する選択的化学反応の開発 Invited

    永次 史

    第4回 新学術領域研究 反応集積化が導く中分子戦略:高次生物機能分子の創製、若手シンポジウム 2017

  247. 効率的遺伝子発現制御を目指した核酸をテンプレートにした選択的化学反応の開発 Invited

    永次 史

    第29回万有シンポジウム 2017

  248. 核酸医薬の修飾技術動向、、 Invited

    永次 史

    技術情報協会セミナー 2017

  249. 核酸高次構造をアルキル化する中分子の開発 Invited

    永次 史

    日本薬学会137年会 2017

  250. Synthesis of Middle Molecular Probes for the Selective Chemical Modification to Higher-Order Structures in RNA International-presentation

    A. Usami, T. Kobayashi, M. E. Hazemi, N. Sato, K. Onizuka, F. Nagatsugi

    ISONIS 10 2016

  251. Synthesis of natural-like cross-linked duplex RNA and its properties, International-presentation

    M.E. Hazemi, K. Onizuka, K. Yamada, F. Nagatsugi

    The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2016

  252. Structural optimization of pseudorotaxane-forming oligoDNA targeting on nucleic acids International-presentation

    K. Onizuka, Miyashita, T, F. Nagatsugi

    The 43th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2016

  253. Synthesis of Natural-like Cross-linked duplex RNA for Biochemical Studies, International-presentation

    M. H. Eurika, K. Onizuka, K. Yamada, F. Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2016 2016

  254. Synthesis of a new cross-linkable nucleic acid derivative targeting nucleic acid binding proteins, International-presentation

    K. Odaira, S. Ishiyama, K. Yamada, F. Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2016 2016

  255. Deveropment of psedorotaxane-forming oligonucleotides aiming at translational regulation International-presentation

    T. Miyashita, K. Onizuka, F. Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2016 2016

  256. Development of Middle Molecular Probes for the Selective Chemical Modification to Higher-Order Structures in RNA International-presentation

    A. Usami, T. Kobayashi, M. E. Hazemi, N. Sato, K. Onizuka, F. Nagatsugi

    Tohoku University Campus Asia Program Summer School 2016 2016

  257. Development of the Chemical Tools for the Alkylation to Nucleic Acid Binding Protein International-presentation

    F. Nagatsugi, K. Odaira, K. Yamada

    The Fourth Asian Chemical Biology Conference (ACBC2016) 2016

  258. Preparation of “Cross-Linkable duplex” using the Oligonucleotide Containing 4-amino-2-oxo-6-vinyl-1,3,5-triazine International-presentation

    F. Nagatsugi, K. Odaira, K. Yamada

    The First A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub 2016

  259. Development of the Middle-size Molecules for Alkylation to Highly Ordered Structures of Nucleic Acids International-presentation

    F. Nagatsugi

    The 2nd International Symposium on Middle Molecular Strategy 2016

  260. Selective Reactions to Nucleic Acids with Higher Ordered Structure International-presentation

    F. Nagatsugi, N. Sato, Kobayashi, Y. Sasaki, K.Onizuka, K. Yamada

    12 th International, Symposium on Organic Reactions 2016

  261. Development of the New Probes for the Selective Chemical Modification to Higher Ordered Structured Nucleic Acids International-presentation

    F. Nagatsugi

    Asian Chemical Biology Initiative 2016

  262. 遺伝子発現制御を制御する化学的手法の開発

    永次 史, 鬼塚和光, 山田 研

    アライアンス医療材料・デバイス・システムグループG3 分科会 2016

  263. 翻訳制御を指向した擬ロタキサン形成オリゴ核酸の開発

    鬼塚 和光, 宮下 卓也, 永次 史

    第2回日本核酸医薬学会年会 2016

  264. Spontaneous pseudorotaxane formation methods targeting on nucleic acids

    鬼塚 和光, 宮下 卓也, 千国 友子, 永次 史

    CBI学会2016 2016

  265. U-Uミスマッチ構造選択的な化学修飾を目指した中分子プローブの開発

    宇佐美 彬, 小林 倫仁, Hazemi Eurika Madoka, 鬼塚 和光, 永次 史

    第10回バイオ関連化学シンポジウム 2016

  266. 標的核酸に対して自発的に擬ロタキサン構造を形成する人工核酸の開発

    鬼塚 和光, 宮下 卓也, 永次 史

    第10回バイオ関連化学シンポジウム 2016

  267. 核酸結合性タンパク質を標的とした新規架橋反応性塩基の合成と評価

    小平 健太, 石山 翔午, 山田 研, 永次 史

    第27回 万有仙台シンポジウム 2016

  268. 核酸結合性蛋白質との架橋反応を目指したビニルトリアジン誘導体の開発

    山田 研, 小平 健太, 石山 翔午, 鬼塚和光, 永次 史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第11回年会 2016

  269. DNA/RNAを標的とした擬ロタキサン形成オリゴDNAの構造最適化

    宮下 卓也, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本ケミカルバイオロジー学会 第11回年会 2016

  270. 核酸を標的とした擬ロタキサン形成オリゴ核酸の構造最適化

    鬼塚 和光, 宮下 卓也, 雨宮拓哉

    日本薬学会136年会 2016

  271. 核酸標的擬ロタキサン形成オリゴDNAの構造最適化

    宮下 卓也, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本化学会 第96春季年会 2016

  272. 架橋二重鎖を用いた酵素的DNA伸長反応の阻害

    山田 研, 永次 史

    日本化学会 第96春季年会 2016

  273. 核酸結合性タンパク質を標的とした新規架橋 反応性核酸誘導体の合成

    小平 健太, 石山 翔午, 山田 研, 永次 史

    日本化学会 第96春季年会 2016

  274. U-Uミスマッチ構造を選択的に化学修飾する小分子プローブの開発

    宇佐美 彬, 小林 倫仁, 佐藤 憲大, 鬼塚 和光, 永次 史

    日本化学会 第96春季年会 2016

  275. 核酸医薬品開発における設計の研究動向 Invited

    永次 史

    核酸医薬品における生体内の安定化向上技術に関するセミナー 2016

  276. Vinyl-quinazolinone (VQ) reagents enable RNA motif detection at single-nucleotide resolution by Next Generation Sequencing (NGS)

    Yutong Chen, Kazumitsu Onizuka, Kaoru, R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi

    2024/03/21

  277. 光触媒修飾DNAプローブを利用した核酸の光修飾法の開発

    山野雄平, 鬼塚和光, 佐々木まどか, 佐藤伸一, 永次史

    第16回バイオ関連化学シンポジウム 2022/09/10

  278. Synthesis of a New Cross-Linkable Oligonucleotides having 4-Amino-6-Oxo-2-Vinyl-Triazine International-presentation

    K. Yamada, K. Odaira, S. Ishiyama, F. Nagatsugi

    XXII Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids Chemical Biology of Nucleic Acids

  279. Synthesis of the middle-size molecules for alkylation to highly ordered structures of nucleic acids International-presentation

    N. Sato, Y. Sasaki, G.Tsuji, A.Usami, K. Onizuka, K.Yamada, F. Nagatsugi

    XXII Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids Chemical Biology of Nucleic Acids

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Industrial Property Rights 1

  1. PEG-機能性核酸コンジュゲート国際特許分類 A61K 48/00

    Property Type: Patent

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    国際特許分類 A61K 48/00

Research Projects 27

  1. RNA標的創薬を志向したRNA結合分子探索システムの構築

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 挑戦的研究(萌芽)

    Institution: 東北大学

    2021/07/09 - 2023/03/31

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    本研究ではRNA結合小分子のハイスループット検索システムの構築を目的として、すでに我々が開発したバーコードマイクロアレイ法と蛍光指示薬競合置換(FID)アッセイを組み合わせた方法論の開発を検討した。具体的にはまず、蛍光指示薬としてチアゾールオレンジ誘導体を固相に固定化し、高次構造を持つRNAライブラリと混合し、低分子が結合したRNA配列のみを分離し、DNAマイクロアレイに伏すことで蛍光分子のRNAに対する親和性情報を取得した。得られた情報からランク上位及び下位のRNA配列を選択し、蛍光滴定によりそれぞれの蛍光指示薬のRNAに対する親和性を求めたところ、ランクの妥当性を示すことができた。さらにこれらの情報から疾患に関連するRNA配列(pre-miRNA、G4RNA)を選択し、化合物ライブラリを使用して、チアゾールオレンジ誘導体を用いた蛍光競合置換アッセイにより標的RNAに対するヒット化合物の探索を行った。その結果、用いる蛍光指示薬の種類によって標的RNAに対して結合するヒット化合物が異なることを見いだした。また蛍光滴定実験によりヒット化合物のRNAに対する見かけの解離定数を算出したところ、すべてのヒット化合物が数マイクロモルから数十マイクロモル程度の結合を示し、本アッセイの妥当性が示された。さらに蛍光指示薬の構造多様化を目指して、RNA結合性ユニットとしてGクランプ構造(G-clamp)及び蛍光性部位であるチアゾールオレンジ(TO)を複合化した分子を合成した。さらにバーコードマイクロアレイ法により得られたGクランプ構造の結合情報から、ランク上位のRNA配列を選択し、TO-G-clampのみかけの解離定数を算出した。その結果、TO-G-clampは結合ユニットのG-clampの選択性を維持していることがわかった。

  2. Development of the method for large-scale analysis of the reactive molecules to RNA higher-ordered structure

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Institution: Tohoku University

    2020/04 - 2023/03

  3. 遺伝子高次構造を標的とした複合化機能性中分子の創製 Competitive

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 新学術領域(計画班)

    2015 - 2019

    More details Close

    近年、核酸で形成される高次構造が遺伝子発現において重要な機能を持つことが明らかとなってきている。しかし現在これらの構造に結合するプローブはほとんど報告されておらず、その機能解明が進んでいない。これらの高次構造に結合しアルキル化するプローブはこれらの構造の役割を明らかにできると期待される。本研究では核酸高次構造を選択的にアルキル化する中分子として標的核酸に近接することで反応を誘起する部位及び標的核酸構造を認識する部位という2つの異なる機能を合わせ持つハイブリッド型核酸標的プローブの開発を目指した。

  4. 薬剤耐性の無い核酸系逆転写阻害薬開発に向けた新たな戦略 Competitive

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 挑戦的萌芽研究

    2015 - 2016

    More details Close

    A number of nucleoside (or nucleotide) reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) are used in the treatment of HIV and hepatitis B. The long term administration of these medicines is required in this treatment, and leads the appearance of the drug-resistance virus. The major mechanism of resistance to NRTIs is a nucleotide excision, in which is removed of chain-terminating 3’-terminal NRTIs. In this study, we aim to develop the new strategy for the design of the reverse transcriptase inhibitor with drug resistance. We expected that the cross-linking reactions between RNA template and primer DNA would lead the inhibition for the reverse transcriptase reaction by forming covalent bond. We prepared the crosslink forming oligonucleotide (CFO) containing 2-amino-6-vinylpurine (AVP) at 3’ terminal position of the DNA primer. The CFO can react to the target thymine at the complementary site. The crosslinked duplex DNA can inhibit the HIV-1 reverse transcriptase by capturing this enzyme.

  5. 遺伝子を標的とした新規機能性低分子プローブの開発 Competitive

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 新学術領域(公募)

    2014 - 2015

    More details Close

    生体分子を化学修飾する分子プロ−ブは生命現象の制御や解明に不可欠であり、その重要性が認識されている。しかし細胞内で核酸を配列選択的に化学修飾する方法論は現在のところほとんど報告されていない。本研究では塩基欠失部位を持つオリゴヌクレオチドと反応性核酸を含む低分子プロ−ブを用いて、DNAの1塩基に対し、ピンポイントの選択性で化学修飾する方法論の開発に成功した。

  6. 新規遺伝子発現制御を目指したDNA疎水空間における部位特異的修飾法の開発 Competitive

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 基盤研究 (B)

    2013 - 2015

    More details Close

    Alkylation to DNA is one of the mechanisms on the anticancer drug. Some of the alkylating agents, for example, cisplatin, melphalan etc., are used as the anticancer drugs for clinical application. But these drugs did not have the selectivity to target genes, resulted in the serious side effects. The alkylated reactions with high selectivity to target genes have the potential for developing the new anticancer drugs without side effects. In our research, we attempted the development the site directed alkylation activated with proximity effects to a target base in the hydrophobic space. We designed the new alkylated probes activated by hydrogen bonding formation to a target base in hydrophobic space. These probes consisted of alkylating part, 2-amino-6-vinylpurine, and binding part, Hoechst, exhibited high selectivity to thymine. These probes are expected to apply for the new tool as a selective control of gene expression

  7. Study on the innovative molecular-targeting medicine based on the nano-DDS encapsulating intelligent artificial oligonucleotides

    SASAKI Shigeki, HARASHIMA Hideyoshi, HYOUDOU Mamoru, NAGATSUGI Fumi, SHINDO Mitsuru, NOMURA Masatoshi

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

    Institution: Kyushu University

    2009/05/11 - 2014/03/31

    More details Close

    Integrated research project for nucleic acids drug has been directed to nano-medicines that can target pathogenetic geneses. Achievements on chemical research for the artificial functional oligonucleotides, determination of the target genes, delivery system for selective targeting cells or tissues, and validation of the nano-medicine using model animals have been accumulates by mutual collaboration. Newly-developed reactive oligonulceotides (ODN) are encapsulated in beta-MEND to target beta-cells, which are delivered into MIN6 cells of beta cell line, resulting in increase of insulin by releasing its native inhibition by miRNA-375 system. Bonkrekic acid, an apoptosis inhibitor, enhanced its activity by encapsulation in MITO-Porter, a mitochondria- targeting delivery system. siRNA targeting Drp1 gene was encapsulated in YSK-MEND (liver-targeting nano-envelope) for validate its effect for the model animal, and a potential as a new therapeutic approach has been suggested.

  8. 遺伝子を標的とした新規機能性低分子プローブの開発 Competitive

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 新学術領域(公募)

    2012 - 2013

    More details Close

    生体分子を化学修飾する分子プロ−ブは生命現象の制御や解明に不可欠であり、その重要性が認識されている。既に蛋白質を化学修飾する低分子プロ−ブは種々検討されており、細胞内において選択的に標的蛋白をラベル化する分子プロ−ブも開発されている。しかし細胞内でDNAやRNAを配列選択的に化学修飾する方法論は現在のところほとんど報告されていない。本研究では核酸に対して選択的に化学修飾する方法論の開発を目指し、脱塩基部位の向かい側に反応する低分子の開発に成功した。

  9. 2本鎖DNAの電子移動制御による選択的点変異誘導法の開発 Competitive

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 挑戦的萌芽研究

    Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    Institution: Tohoku University

    2011 - 2012

    More details Close

    The chemical reactions to DNA are known to induce the mutation in the genetic information and leads to the various diseases, such as cancer. Especially, the electron transfer through duplex DNA can occur under the conditions of oxidative stress, and induce the DNA damage, for example oxidative damage. But it is very difficult to regulate the selectivity of these reactions. In this study, we have developed the new strategy to induce the selective point mutation by regulation of the electron transfer through the DNA. For achievement of our study, there are two key points; one is the producing the effective radical cation by photo-reaction, and second is the reaction to induce the nucleophilic reaction or the oxidative reaction. In this study, we synthesized the oligonucleotides containing anthraquinone as a photosensitizer and 2-amino-6-vinyl derivatives as a reactive moiety. These oligonucleotide provides the possibility to induce the selective reactions to target bases.

  10. Development of the Functional Molecules for Genome Targeting Chemistry

    NAGATSUGI Fumi, HAGIHARA Shinnya, IMOTO Syuhei

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Institution: Tohoku University

    2009 - 2011

    More details Close

    After the human genome project, it is revealed that most of genome has functions without translation to protein. Especially, RNA has a variety of the functions to control the gene expression, for example, rebozyme, riboswich, siRNA and miRNA, so on. In this study, we have developed the novel molecules to recognize strictly the target RNA for regulation of these functions.

  11. クリックケミストリーを応用した2本鎖DNA結合分子の新規検索法の開発

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 萌芽研究

    Institution: 東北大学

    2007 - 2008

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    遺伝子の根幹である2本鎖DNAを認識する分子は生命の基本原理を理解するためのツールとしてだけではなく、遺伝子発現の選択的な制御によるくすりとしての開発も期待されるため、2本鎖DNAの配列情報に基づく一般的なルールの確立に関する研究が多くなされてきた。しかしそのルールの確立にはまだ至っていないのが現状である。さらに研究が進むにつれ、DNAの高次構造が遺伝子発現制御機構に重要な役割を果たしている可能性が次々と示されているが、DNA高次構造の認識分子を論理的に分子設計するのは非常に困難であると考えられる。そこで本研究では、クリックケミストリーを応用したコンビナトリアル化学を用いて、2本鎖DNA認識分子の新しい検索法の開発を検討することとした。昨年度までにインターカレーターであるアクリジン誘導体及び2本鎖DNAに結合することがしられているペプチドを用いて、2本鎖DNAをテンプレートとした、クリックケミストリー反応が進行することを明らかにした。本年度はまず得られたペプチド結合型アクリジン誘導体についてそのDNAに対する結合能の評価を行なった。その結果、得られたペプチド結合型アクリジン誘導体は、ペプチドのみに比べてDNAに対する結合能が向上すること、さらにアクリジンのみに比べても若干ではあるが結合能が上がることがわかった。また固相上に固定化した末端アルキンを導入したペプチドとアクリジン誘導体の間でもクリックケミストリー反応が進行し、ビーズが蛍光を持つことが示された。この蛍光はDNA結合性ペプチドをもたないビーズとアクリジン誘導体の間では観測されないことから、ペプチドを結合させたビーズとアクリジンを用いたランダムスクリーニングによるDNA結合分子の検索法として展開できる可能性を示すことができた。

  12. Application of the Activated Reaction by Hybridization to Target Genes for the Regulation of Gene Expression in Cells

    NAGATSUGI Fumi, IMOTO Shuhei

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Institution: Tohoku University

    2007 - 2008

  13. 細胞内におけるDNA高次構造認識分子の開発

    永次 史, 井本 修平

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 特定領域研究

    Institution: 東北大学

    2007 - 2008

    More details Close

    近年の研究の進歩にともない、遺伝子発現は配列情報だけではなくその高次構造が発現制御機構に重要な役割を持つことが次々とわかってきている。しかし高次構造は合成DNAでは証明されているものの生体内での構造の証明は極めて困難であり、特異的に結合する低分子化合物の開発が望まれている。本研究ではクリックケミストリーを応用したコンビナトリアル化学を用いてDNA高次構造を認識する分子を検索することを目的とした。昨年度までに末端アルキンを導入したDNA結合性のペプチド(1)とDNAにインターカレートするアクリジン誘導体(2)にアジド基を導入した化合物間のクリックケミストリー反応がDNAをテンプレートとして進行することを明らかにした。今年度はまずこの反応の詳細及び得られたペプチド結合型アクリジン誘導体についてそのDNAに対する結合能の評価を行なった。その結果、DNA上におけるペプチドとアクリジン誘導体とのクリックケミストリー反応は、アクリジン誘導体のスペーサーの長さにより、その反応性が異なること、またペプチドが結合する配列を持たない2本鎖DNA上では反応速度が低下することなどが明らかになった。さらに得られたペプチド結合型アクリジン誘導体は、ペプチドのみに比べてDNAに対する結合能が向上すること、さらにアクリジンのみに比べても若干ではあるが結合能が上がることがわかった。固相上に固定化した末端アルキンを導入したペプチドとアクリジン誘導体の間でもクリックケミストリー反応が進行し、ビーズが蛍光を持つことが示された。この蛍光はDNA結合性ペプチドをもたないビーズとアクリジン誘導体の間では観測されないことから、ペプチドを結合させたビーズとアクリジンを用いたランダムスクリーニングによるDNA結合分子の検索法として展開できる可能性を示すことができた。

  14. Development of Genome-Targeting Molecules with Ability of Chemical Reactivity and Application to Intelligent Nano-Medicine

    SASAKI Shigeki, NAKAGAWA Osamu, TANIGUCHI Yosuke, TSUZUKI Teruhisa, NAGATSUGI Fumi

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    Institution: Kyushu University

    2005 - 2008

  15. ハイブリッド形成により細胞情報伝達システムをマルチ制御する機能性分子の開発

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 特定領域研究

    Institution: 東北大学

    2006 - 2007

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    私は標的遺伝子との2本鎖内で特異的に活性化され、反応性官能基のマスキング剤に使ったスルフィド基で結合した分子が放出され、選択的なシチジンに対するクロスリンク反応を開発している。本研究ではこの一連の反応を利用して、癌細胞で過剰発現している遺伝子に対してハイブリッドを形成しその発現を阻害すると同時に、薬剤を放出することで標的タンパクの機能を制御する、マルチ制御機能によりシグナル伝達をコントロールできる機能性分子の開発を目的とした。昨年度、標的遺伝子に対してハイブリツドを形成し、薬物が放出されるのを細胞外から検出する方法として、FRET現象を利用し、薬物の放出を蛍光の増強で確認する方法を検討した。その結果、消光団としてダブシル基、蛍光団としてフルオレセインを持つダブル標識機能性オリゴDNAが、試験管内で標的位置にシトシンを含む相補的配列のオリゴDNAに対してのみ、選択的に消光剤の脱離に伴い蛍光が増強することを明らかにした。本年度はダブル標識機能性オリゴDNAをいくつかのドラッグデリバリーシステムを用いて細胞内への適用に関する検討を行った。その結果、北大の原島教授のグループが開発された機能性リポソームにより100nMという非常に薄い濃度でも蛍光標識オリゴDNAが細胞内へ輸送されることを蛍光で確認した。同様の濃度のダブル標識機能性オリゴDNAを細胞に投与したところ、標的遺伝子を持つ細胞でのみ蛍光の増大がみられ、標的遺伝子のない細胞ではこの蛍光の増大は観測されなかった。この結果は、標的遺伝子依存的にダブシル基の脱離が進行したことを示唆する結果であると考えており、今回合成したダブル標識オリゴDNAを用いて、細胞内においてハイブリッド形成により選択的に進行する化学反応を、蛍光の増強により観測できると期待されるとともに、これらの化学反応が薬物放出システムとしても細胞内で機能する可能性を示したものであると考えている。

  16. Development of the Intelligent Nucleic Acids having Multi Regulation Activity Triggered by Hybridization

    NAGATSUGI Fumi

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    2005 - 2006

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    We have already established the strategy of synchronous activation by hybridization, in which the highly reactive cross-linking agent, 2-amino-6-vinylpurine nucleoside analog, can be generated from its stable precursors, the phenylsulfide derivatives, by a hybridization-promoted activation process with selectivity to cytosine. In this project, this in situ activation system was applied to method for the drug releasing system triggered by hybridization with the target sequence. For the proof of our concept, we first designed the strategies for visualization of the releasing system in cells. In 2004, we investigated that the fluorescent group was connected to 2-amino vinylpurine with sulfide bond and the release of sulfide group could be detected by increasing fluorescence but it did not work. In 2005, we planed to exploit a fluorescence resonance energy transfer (FRET). We synthesized the 5'-fluorecein-labeled ODN containing 2-amino-6-vinylpurine at the position of 3 bases away from 5' end and 4-dimethylamino-azobenzene-thiol as a quencher have reacted to vinyl group. The fluorescence of double-labeled ODN probe decreased relative to the 5'-fluorecein single labeled ODN. When this probe hybridizes to exact complement and forms duplex DNA, the fluorescence increases gradually to be accompanied by release of the thiol group. These results have suggested that double-labeled ODN probe is capable of releasing the molecule triggered by hybridization in a highly sequence specific manner. The drug releasing system can be visualized by using our system in living cell.

  17. ハイブリッド形成により細胞情報伝達システムをマルチ制御する機能性分子の開発

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 特定領域研究

    Institution: 九州大学

    2005 - 2005

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    本研究では、癌細胞で過剰発現している遺伝子に対してハイブリッドを形成しその発現を阻害すると同時に、薬剤を放出することで標的タンパクの機能を制御する、マルチ制御機能によりシグナル伝達をコントロールできる機能性分子の開発を目的としている。すでに私は標的との2本鎖内で特異的に活性化されシチジンに対して選択的にクロスリンク反応する2-amino-6-vinyl purineを開発している。さらにこの反応中で反応性官能基のマスキング剤に使ったスルフィド基で結合した分子が放出されることを確認している。本年度はまず細胞内で標的に対してハイブリッドを形成し、スルフィド官能基を効率よく脱離する構造を検索する目的で、これらの反応を可視化できる方法の構築を計画した。その方法としてFRET現象の利用を計画し、まず2つの蛍光団を持つ機能性オリゴDNAを合成し、スルフィド結合した消光団が遊離しFRETが解消されることで増強される蛍光を指標に、標的遺伝子に対しハイブリッドを形成することで容易に遊離するスルフィド官能基の検索を行った。その結果、消光剤としてダブシル基をスルフィド結合させた2-amino-6-alkyl purine誘導体を含むオリゴDNAの末端に、蛍光団としてフルオレセインを導入したオリゴDNAが、効率よくFRET現象を起こすことを見出した。さらにこのオリゴDNAを、試験管内で標的位置にシトシンを含む配列のオリゴDNAと混合したときのみ、消光剤の脱離に伴う蛍光の増強が観測された。この結果は今回合成した機能性オリゴDNAが、標的に対して選択的なハイブリッド形成することで増強される蛍光を指標に、細胞内における化学反応も追跡できるものと考えられる。本年度の研究により細胞内におけるマルチ制御機能によりシグナル伝達をコントロールする機能性分子の開発の方法論の基礎が確立したものと考えている。

  18. The Development of the Method to Introduce the Selective Point Mutation using the Reactive Oligonucleotides

    NAGATSUGI Fumi

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Institution: KYUSHU UNIVERSITY

    2003 - 2004

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    The selective reaction to the gene would have the potential for site-directed mutation. We already demonstrated that triple helix oligonucelotides (TFO) bearing 2-amino-6-vinypurine derivative achieved the selective point mutaitions to a target site in a shuttle vector plasmid, which replicates in mammalian cells. These reactions were very effective in vitro under acidic conditions, but the reactive derivatives to react to the target under neutral condition are necessary for application to the cell. In 2003,we have investigated the new triplex mediated cross-linking reagents with high selectivity toward the target under neutral conditions. We synthesized those reactive TFO using post modification method and studied about the reactivity of them. Unfortunately, these reactive TFO did not react to the target duplex, because these oligonucelotides having reactive molecules were not be able to form the stable triple helix with the targets. Thus, in 2004, we have attempted to develop the novel more reactive derivatives. In these results, we have exploited the more reactive derivatives, which react to cytidine selectively to give the adducts in 50 % yield only after 5 hrs. In addition, we have demonstrated that reactive oligonucelotides increase the efficiency of the antisense inhibition in the cell. These results suggest that these cross-linking reagents may react with the target in the cell. In conclusion, we have developed the high effective cross-linking reagents to react in the cell. Based on the results, we would like to investigate the development of chemical methods to occur the point mutation in the cell.

  19. The Development of the Novel Reactive Nucleobases to the Duplex DNA

    NAGATSUGI Fumi

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Institution: Kyushu University

    2001 - 2002

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    The selective reaction to the gene would have the potential for site-directed mutation. In 2001, we have demonstrated that TFO bearing 2-amino-6-vinypurine derivative achieves triplex mediated cross-linking with high selectivity toward the cytosine of the G-C or the adenosine of the T-A target site. In 2002, we have investigated the use of this reactive TFO to target mutations to a target site in a shuttle vector plasmid, which replicates in mammalian cells. TFOs bearing of this reactive molecular produced adducts only at the complementary position of this reactive molecular and thereby introduced mutations at that site during replication/repair of the plasmid in mammalian cells. In the addition, we attempted the improvement of the reactivity by some modification of this molecule. But this experiment was not successful, because the oligonucleotides bearing modified molecule were not able to form the stable triple helix. It was clear that the triple helix formation was effected by a small change of structure. Now we investigate to develop of the new molecular by using the post modification method and we expect that we can get a new molecule with effective reactivity to gene.

  20. 新規クロスリンク剤を組み込んだペプチド核酸のがん治療及び診断薬への展開

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 奨励研究(A)

    Institution: 九州大学

    1999 - 2000

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    本研究の目的は我々が開発したクロスリンク能をもつ2-アミノ-6-ビニルプリン誘導体を組み込んだペプチド核酸を用いて、効果的な放射性アンチセンス核酸を合成し、癌診断薬剤としての可能性を検討することである。前年度までに、ビニル体を含むオリゴマーDNAが酸性条件下、相補的配列内に含まれるシチジンと塩基選択的かつ配列特異的に反応することを見いだした。しかしその後の検討により、本化合物は酸性条件下でしか反応しないことが明らかとなった。これは生体内の適用を考えた場合問題点となると考えられたため、新たに中性条件下でも反応する誘導体の設計合成を行った。すなわち反応性部位であるビニル基に電子吸引基を導入することで反応性の向上を期待した。本誘導体を組み込んだオリゴマーDNAは設計通り中性条件下でも、シチジンに対して高い選択性及び高い反応性を示すことがわかった。本研究の成果は生体内で使用できる効率的なクロスリンク剤への展開において新たな可能性を提示するものと考えられる。また癌治療薬としてオリゴ核酸の利用を考えた場合、m-RNAは繰り返し生産されるため根本的な治療を行うには、標的を2本鎖DNAに設定したほうが望ましい。そこで2本鎖DNAに対して3本鎖を形成することで反応する、2-アミノ-6-ビニルプリン誘導体の設計、合成を行った。本誘導体を含むオリゴマーDNAは3本鎖を形成し、標的2本鎖DNAの3本鎖から遠い位置にあるピリミジン鎖にあるシチジンに対して選択的に反応することを見いだした。今後はこれらの成果をもとに今回開発した種々の誘導体を組み込んだペプチド核酸を合成し癌の診断・治療薬への展開を行いたいと考えている。

  21. Development of the New Recognition Molecules of DNA Sequences Based on the GC- and AT-Selective Ligands

    SASAKI Shigeki, NAGATSUGI Fumi, TORIGOE Hidetaka, OHISHI Hirofumi

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Institution: KYUSHU UNIVERSITY

    1999 - 2000

    More details Close

    Development of methodology for specific inhibition of gene expression has become of major interest recently, because of great potential of therapeutic application. We expected to develope new ligands toward target DNA sequences. Furthermore, useful information for design of sequence selective ligands would be obtained by structural analysis of binding between the new ligands and the target DNA. In the conceptual mechanism, a primary process of the ligand-binding includes a hydrophobic transfer from an aqueous solution to the DNA minor groove. At this step, the shape of the ligand isohelical with the curvature of the groove is an important factor of the binding. Similar to oligo-tetrahydrofuran compounds that have been shown to take a helix-like conformation, bisTHF compounds with long alkyl chains take a crescent shape as the stable conformation. An MM calculation has indicated that they might fit well in the minor groove. In order to check this hypothesis, we synthesized a variety of new molecules with a diamino-bisTHF structure as the common skeleton. The amino groups were introduced to make a compound soluble in water and to gain some electrostatic binding forces. In conclusion, we have discovered new DNA-binding molecules based on a diamino-bisTHF skeleton. From the fundamental investigation with UV melting curve, ethidium displacement assay and the ITC measurement, selective binding affinity of RR8 to GC pairs with high affinity has become apparent. It has been also clearly shown that both the stereochemistry of the amino groups and the alkyl chain length play major roles for the DNA binding. Footprinting analyses with DNase I has revealed that a GCGC site is the most matched site for RR8 in the sequence studied here. Although the detailed binding mode of RR8 is not yet clear, GC-preference of the new binding motif will provide useful information for the design of new binding molecules for GC-rich sequence.

  22. 遺伝子を標的とする新しい癌診断及び癌治療法の開発

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 奨励研究(A)

    Institution: 九州大学

    1997 - 1998

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    本研究の目的は我々が開発したクロスリンク能をもつ2-アミノ-6-ビニルプリン誘導体を組み込んだオリゴヌクレオチドを用いて、効果的な放射性アンチセンス核酸を合成し、癌診断薬剤としての可能性を検討することである。前年度までに、ビニル体を含むオリゴマーDNAが酸性条件下、相補的配列内に合まれるシチジンと塩基選択的かつ配列特異的に反応することを見いだした。さらにヨウ素標識オリゴマーDNAの合成を目指しそのモデル反応として、ビニル体を含むオリゴマーDNAにρ-ヨードアニリンとを反応させ、ρ-ヨードアニリンを導入したオリゴマーDNAの合成を行った。しかしその後の検討によりフェニルスルフィド基でビニル基を保護した前駆体を用いたオリゴマーの合成には合成可能な配列に制限があることがわかった。そこで今年度はまずどんな配列にでも組み込める安定なビニル体の前駆体として、メチルスルフィド体を組み込んだオリゴマーDNAの合成を検討した。その結果この前駆体は安定であり、どのような配列にも組み込めることがわかった。またビニル体は反応性が高く生体内での使用を考えた場合、生体に存在する種々の求核剤と反応しクロスリンク能の効率が低下することが予想される。そこで標的との複合体形成により活性化される分子の開発を計画し、その候補としてスルフィド前駆体が容易にビニル体を再生することから、種々のスルフィド誘導体について検討することにした。まずフェニルスルフィド体(R=SPh)及びその酸化体(R=SOPh,SO_2Ph)を用いて検討したところ、酸性条件下クロスリンク反応が起こることがわかった。特にフェニルスルフォキサイド体(R=SOPh)ではビニル体を用いた時と同程度の反応効率でクロスリンク体が生成することがわかった。現在、さらに他の構造のスルフィド誘導体を用いてクロスリンク反応を検討中である。今後はこれらの誘導体を用いて標識化したオリゴマーの合成を行い、生体内への適用へと展開する予定である。

  23. 効率的なアンチセンス法による新しい癌診断薬の開発

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 奨励研究(A)

    Institution: 九州大学

    1996 - 1996

    More details Close

    本研究の目的は我々が開発したクロスリンク能をもつ2-アミノ-6-ビニルプリン誘導体を組み込んだオリゴヌクレオチドを用いて、効果的な放射性アンチセンス核酸を合成し、癌診断薬剤としての可能性を検討することである。前年度までに、2-アミノ-6-ビニルプリン誘導体がシチジン及びグアノシンと反応することを見いだした。しかし、2-アミノ-6-ビニルプリンは反応性が高くオリゴマーに組み込むことは困難であったので、その解決策としてビニル基に置換基(メチル、トリメチルシリル基)を導入しビニル基の反応性を低下させた誘導体を合成した。本年度はまず、これらの置換ビニル誘導体を組み込んだオリゴマーの合成を検討した。その結果、トリメチルシリル基を有するビニル体からは、目的のオリゴマーを得ることに成功した。しかしメチル基を有するビニル体からは、オリゴマー合成の際に用いたアンモニアがビニル基に反応したオリゴマーが得られた。この結果から無置換のビニル体に比べ、メチル基を導入した誘導体は反応性は低下しているもののの、オリゴマーにくみこまれた場合にも求核反応性を有することが明らかになった。さらに反応性の高い無置換のビニル体をオリゴマーに組み込む方策として、あらかじめビニル基をスルフィド基で保護しオリゴマーに組み込んだ後ビニル基を再生させることを検討した。その結果、スルフィド基を導入した誘導体は酸化反応及び酸あるいは塩基処理により、ビニル体を発生する事を確認した。そこでさらにこのスルフィド基を有する誘導体を用いてオリゴマーの合成を検討したところ、目的のオリゴマーの合成に成功した。現在これらのオリゴマーを用いてその反応性を検討中である。今後は今回合成したオリゴマーを^<32>Pにより標識し、癌診断薬剤としての基礎評価を行う予定である。

  24. ^<18>F標識脂肪酸を用いた脳内脂肪酸代謝の解明及び脳機能マーカーとしての評価

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 奨励研究(A)

    Institution: 九州大学

    1992 - 1992

  25. 脂肪酸代謝による脳機能測定を指向したフッ素18標識薬剤の創薬

    永次 史

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 奨励研究(A)

    Institution: 九州大学

    1991 - 1991

  26. 機能性核酸塩基の設計と合成 Competitive

  27. Design of the functional nucleotides Competitive

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