Details of the Researcher

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Hisayuki Mitsui
Section
Graduate School of Life Sciences
Job title
Associate Professor
Degree

  • 博士（農学）（東京大学）

Research History 4

  • 1999/02 - 2001/03
    Institute of Genetic Ecology, Tohoku University　Associate Professor

  • 1994/04 - 1999/01
    Institute of Genetic Ecology, Tohoku University　助手

  • 1993/04 - 1994/03
    三菱化成生命科学研究所　特別研究員

  • 2001/04 -
    Graduate School of Life Sciences, Tohoku University　Associate Professor

Education 2

  • The University of Tokyo　Graduate School, Division of Agricultural Science　農芸化学

    - 1993/03

  • The University of Tokyo　Faculty of Agriculture　農芸化学

    - 1988/03

Committee Memberships 10

  • The Journal of General and Applied Microbiology　Editorial Board Member

    2008/01 - 2013/12

  • The Journal of General and Applied Microbiology　Editorial Board Member

    2008/01 - 2013/12

  • Microbes and Environments　Associate Editor

    2011/01 - 2012/12

  • Microbes and Environments　Associate Editor

    2011/01 - 2012/12

  • Microbes and Environments　Managing Editor

    2008/01 - 2010/12

  • Microbes and Environments　Managing Editor

    2008/01 - 2010/12

  • The Journal of General and Applied Microbiology　Editorial Board Member

    2005/01 - 2006/12

  • The Journal of General and Applied Microbiology　Editorial Board Member

    2005/01 - 2006/12

  • 日本微生物生態学会　庶務幹事

    2001/01 - 2002/12

  • 日本微生物生態学会　庶務幹事

    2001/01 - 2002/12

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Professional Memberships 3

  • 植物微生物研究会

  • American Society For Microbiology

  • 日本農芸化学会

Research Interests 10

  • stress response

  • alphaproteobacteria

  • iron-sulfur protein

  • legume

  • cell cycle

  • transcription

  • gene expression

  • endosymbiosis

  • nitrogen fixation

  • rhizobium

Research Areas 4

  • Life sciences / Cell biology /

  • Life sciences / Applied biochemistry /

  • Life sciences / Molecular biology /

  • Life sciences / Applied microbiology /

Papers 90

  1. Bradyrhizobium ottawaense efficiently reduces nitrous oxide through high nosZ gene expression

    Sawa Wasai-Hara, Manabu Itakura, Arthur Fernandes Siqueira, Daisaku Takemoto, Masayuki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Noritoshi Inagaki, Toshimasa Yamazaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Yoshikazu Shimoda, Kiwamu Minamisawa

    Scientific Reports　13　(1)　2023/11/01

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41598-023-46019-w 　

    eISSN： 2045-2322

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    Abstract N2O is an important greenhouse gas influencing global warming, and agricultural land is the predominant (anthropogenic) source of N2O emissions. Here, we report the high N2O-reducing activity of Bradyrhizobium ottawaense, suggesting the potential for efficiently mitigating N2O emission from agricultural lands. Among the 15 B. ottawaense isolates examined, the N2O-reducing activities of most (13) strains were approximately five-fold higher than that of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110T under anaerobic conditions. This robust N2O-reducing activity of B. ottawaense was confirmed by N2O reductase (NosZ) protein levels and by mitigation of N2O emitted by nodule decomposition in laboratory system. While the NosZ of B. ottawaense and B. diazoefficiens showed high homology, nosZ gene expression in B. ottawaense was over 150-fold higher than that in B. diazoefficiens USDA110T, suggesting the high N2O-reducing activity of B. ottawaense is achieved by high nos expression. Furthermore, we examined the nos operon transcription start sites and found that, unlike B. diazoefficiens, B. ottawaense has two transcription start sites under N2O-respiring conditions, which may contribute to the high nosZ expression. Our study indicates the potential of B. ottawaense for effective N2O reduction and unique regulation of nos gene expression towards the high performance of N2O mitigation in the soil.

  2. Evolution of rhizobial symbiosis islands through insertion sequence-mediated deletion and duplication Peer-reviewed

    Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Ryota Noda, Kaori Kakizaki, Satoshi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

    The ISME Journal　16　(1)　112-121　2022/01

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41396-021-01035-4 　

    ISSN： 1751-7362

    eISSN： 1751-7370

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    <title>Abstract</title>Symbiosis between organisms influences their evolution via adaptive changes in genome architectures. Immunity of soybean carrying the <italic>Rj2</italic> allele is triggered by NopP (type III secretion system [T3SS]-dependent effector), encoded by symbiosis island A (SymA) in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA122. This immunity was overcome by many mutants with large SymA deletions that encompassed T3SS (<italic>rhc</italic>) and N2 fixation (<italic>nif</italic>) genes and were bounded by insertion sequence (IS) copies in direct orientation, indicating homologous recombination between ISs. Similar deletion events were observed in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA110 and <italic>B. japonicum</italic> J5. When we cultured a USDA122 strain with a marker gene <italic>sacB</italic> inserted into the <italic>rhc</italic> gene cluster, most sucrose-resistant mutants had deletions in <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters, similar to the mutants above. Some deletion mutants were unique to the <italic>sacB</italic> system and showed lower competitive nodulation capability, indicating that IS-mediated deletions occurred during free-living growth and the host plants selected the mutants. Among 63 natural bradyrhizobial isolates, 2 possessed long duplications (261–357 kb) harboring <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters between IS copies in direct orientation via homologous recombination. Therefore, the structures of symbiosis islands are in a state of flux via IS-mediated duplications and deletions during rhizobial saprophytic growth, and host plants select mutualistic variants from the resultant pools of rhizobial populations. Our results demonstrate that homologous recombination between direct IS copies provides a natural mechanism generating deletions and duplications on symbiosis islands.

  3. Identification of genes regulated by the antitermination factor NasT during denitrification in Bradyrhizobium diazoefficiens Peer-reviewed

    Sánchez C, Siqueira AF, Mitsui H, Minamisawa K

    Microbes Environ　34　260-267　2019/11

  4. Symbiotic incompatibility between soybean and Bradyrhizobium arises from one amino acid determinant in soybean Rj2 protein. International-journal Peer-reviewed

    Masayuki Sugawara, Yosuke Umehara, Akito Kaga, Masaki Hayashi, Masao Ishimoto, Shusei Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    PloS one　14　(9)　e0222469　2019

    DOI： 10.1371/journal.pone.0222469 　

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    Cultivated soybean (Glycine max) carrying the Rj2 allele restricts nodulation with specific Bradyrhizobium strains via host immunity, mediated by rhizobial type III secretory protein NopP and the host resistance protein Rj2. Here we found that the single isoleucine residue I490 in Rj2 is required for induction of symbiotic incompatibility. Furthermore, we investigated the geographical distribution of the Rj2-genotype soybean in a large set of germplasm by single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping using a SNP marker for I490. By allelic comparison of 79 accessions in the Japanese soybean mini-core collection, we suggest substitution of a single amino acid residue (R490 to I490) in Rj2 induces symbiotic incompatibility with Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122. The importance of I490 was verified by complementation of rj2-soybean by the dominant allele encoding the Rj2 protein containing I490 residue. The Rj2 allele was also found in Glycine soja, the wild progenitor of G. max, and their single amino acid polymorphisms were associated with the Rj2-nodulation phenotype. By SNP genotyping against 1583 soybean accessions, we detected the Rj2-genotype in 5.4% of G. max and 7.7% of G. soja accessions. Distribution of the Rj2-genotype soybean plants was relatively concentrated in the temperate Asian region. These results provide important information about the mechanism of host genotype-specific symbiotic incompatibility mediated by host immunity and suggest that the Rj2 gene has been maintained by environmental conditions during the process of soybean domestication.

  5. Variation in bradyrhizobial NopP effector determines symbiotic incompatibility with Rj2-soybeans via effector-triggered immunity International-journal Peer-reviewed

    M. Sugawara, S. Takahashi, Y. Umehara, H. Iwano, H. Tsurumaru, H. Odake, Y. Suzuki, H. Kondo, Y. Konno, T. Yamakawa, S. Sato, H. Mitsui, K. Minamisawa

    Nature Communications　9　(1)　3139-3139　2018/08

    DOI： 10.1038/s41467-018-05663-x 　

    More details Close

    Genotype-specific incompatibility in legume-rhizobium symbiosis has been suggested to be controlled by effector-triggered immunity underlying pathogenic host-bacteria interactions. However, the rhizobial determinant interacting with the host resistance protein (e.g., Rj2) and the molecular mechanism of symbiotic incompatibility remain unclear. Using natural mutants of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, we identified a type III-secretory protein NopP as the determinant of symbiotic incompatibility with Rj2-soybean. The analysis of nopP mutations and variants in a culture collection reveal that three amino acid residues (R60, R67, and H173) in NopP are required for Rj2-mediated incompatibility. Complementation of rj2-soybean by the Rj2 allele confers the incompatibility induced by USDA 122-type NopP. In response to incompatible strains, Rj2-soybean plants activate defense marker gene PR-2 and suppress infection thread number at 2 days after inoculation. These results suggest that Rj2-soybeans monitor the specific variants of NopP and reject bradyrhizobial infection via effector-triggered immunity mediated by Rj2 protein.

  6. Expression of Two RpoH Sigma Factors in Sinorhizobium meliloti upon Heat Shock Peer-reviewed

    Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　32　(4)　394-397　2017/12

    DOI： 10.1264/jsme2.ME17087 　

    ISSN： 1342-6311

  7. Regulation of nitrous oxide reductase genes by NasT-mediated transcription antitermination in Bradyrhizobium diazoefficiens Peer-reviewed

    Cristina Sanchez, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS　9　(4)　389-396　2017/08

    DOI： 10.1111/1758-2229.12543 　

    ISSN： 1758-2229

  8. Complete genome sequence of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, a nitrogen-fixing soybean symbiont Peer-reviewed

    Masayuki Sugawara, Takahiro Tsukui, Takakazu Kaneko, Yoshiyuki Ohtsubo, Shusei Sato, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    Genome Announcements　5　(9)　e01743-16　2017

    Publisher: American Society for Microbiology

    DOI： 10.1128/genomeA.01743-16 　

    ISSN： 2169-8287

  9. Metagenomic Analysis Revealed Methylamine and Ureide Utilization of Soybean-Associated Methylobacterium Peer-reviewed

    Tomoyuki Minami, Misue Anda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Hirohito Tsurumaru, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　31　(3)　268-278　2016/09

    DOI： 10.1264/jsme2.ME16035 　

    ISSN： 1342-6311

  10. A Sinorhizobium meliloti RpoH-Regulated Gene Is Involved in Iron-Sulfur Protein Metabolism and Effective Plant Symbiosis under Intrinsic Iron Limitation Peer-reviewed

    Shohei Sasaki, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    JOURNAL OF BACTERIOLOGY　198　(17)　2297-2306　2016/09

    DOI： 10.1128/JB.00287-16 　

    ISSN： 0021-9193

    eISSN： 1098-5530

  11. Complete genome sequence of Methylobacterium sp. strain AMS5, an isolate from a soybean stem Peer-reviewed

    Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa

    Genome Announcements　4　(2)　e00144-16　2016

    Publisher: American Society for Microbiology

    DOI： 10.1128/genomeA.00144-16 　

    ISSN： 2169-8287

  12. Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome Peer-reviewed

    Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA　112　(46)　14343-14347　2015/11

    DOI： 10.1073/pnas.1514326112 　

    ISSN： 0027-8424

  13. Peribacteroid solution of soybean root nodules partly induces genomic loci for differentiation into bacteroids of free-living Bradyrhizobium japonicum cells Peer-reviewed

    Naoko Ohkama-Ohtsu, Sachiko Ichida, Hiroko Yamaya, Takuji Ohwada, Manabu Itakura, Yoshino Hara, Hisayuki Mitsui, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kouhei Tejima, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Makoto Hayashi, Takaki Maekawa, Yoshikatsu Murooka, Shigeyuki Tajima, Kenshiro Simomura, Mika Nomura, Toshiki Uchiumi, Akihiro Suzuki, Yoshikazu Shimoda, Mikiko Abe, Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima, Tadashi Yokoyama

    SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　61　(3)　461-470　2015/05

    DOI： 10.1080/00380768.2014.994470 　

    ISSN： 0038-0768

    eISSN： 1747-0765

  14. Low Nitrogen Fertilization Adapts Rice Root Microbiome to Low Nutrient Environment by Changing Biogeochemical Functions Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Kazuhiro Sasaki, Takashi Okubo, Akifumu Yamashita, Kimihiro Terasawa, Zhihua Bao, Dongyan Liu, Takeshi Watanabe, Jun Murase, Susumu Asakawa, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　29　(1)　50-59　2014/04

    DOI： 10.1264/jsme2.ME13110 　

    ISSN： 1342-6311

  15. A Rice Gene for Microbial Symbiosis, Oryza sativa CCaMK, Reduces CH4 Flux in a Paddy Field with Low Nitrogen Input Peer-reviewed

    Bao, Zhihua, Watanabe, Aya, Sasaki, Kazuhiro, Okubo, Takashi, Tokida, Takeshi, Liu, Dongyan, Ikeda, Seishi, Imaizumi-Anraku, Haruko, Asakawa, Susumu, Sato, Tadashi, Mitsui, Hisayuki, Minamisawaa, Kiwamu

    Applied and Environmental Microbiology　80　(6)　1995-2003　2014

    DOI： 10.1128/AEM.03646-13 　

  16. Impact of Azospirillum sp B510 Inoculation on Rice-Associated Bacterial Communities in a Paddy Field Peer-reviewed

    Zhihua Bao, Kazuhiro Sasaki, Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Mizue Anda, Eiko Hanzawa, Kaori Kakizaki, Tadashi Sato, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　28　(4)　487-490　2013/12

    DOI： 10.1264/jsme2.ME13049 　

    ISSN： 1342-6311

  17. Involvement of a Novel Genistein-Inducible Multidrug Efflux Pump of Bradyrhizobium japonicum Early in the Interaction with Glycine max (L.) Merr Peer-reviewed

    Keisuke Takeshima, Tatsuo Hidaka, Min Wei, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Mikiko Abe, Yoshihiko Tokuji, Takuji Ohwada

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　28　(4)　414-421　2013/12

    DOI： 10.1264/jsme2.ME13057 　

    ISSN： 1342-6311

  18. Linked Expressions of nap and nos Genes in a Bradyrhizobium japonicum Mutant with Increased N2O Reductase Activity Peer-reviewed

    Cristina Sanchez, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　79　(13)　4178-4180　2013/07

    DOI： 10.1128/AEM.00703-13 　

    ISSN： 0099-2240

  19. Genome analysis suggests that the soil oligotrophic bacterium agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of aeschynomene indica Peer-reviewed

    Takashi Okubo, Shohei Fukushima, Manabu Itakura, Kenshiro Oshima, Aphakorn Longtonglang, Neung Teaumroong, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori, Kiwamu Minamisawa

    Applied and Environmental Microbiology　79　(8)　2542-2551　2013/04

    DOI： 10.1128/AEM.00009-13 　

    ISSN： 0099-2240 1098-5336

  20. The type III secretion system of Bradyrhizobium japonicum USDA122 mediates symbiotic incompatibility with Rj2 soybean plants Peer-reviewed

    Takahiro Tsukui, Shima Eda, Takakazu Kaneko, Shusei Sato, Shin Okazaki, Kaori Kakizaki-Chiba, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Akifumi Yamashita, Kimihiro Terasawa, Kiwamu Minamisawa

    Applied and Environmental Microbiology　79　(3)　1048-1051　2013/02

    DOI： 10.1128/AEM.03297-12 　

    ISSN： 0099-2240 1098-5336

  21. N2O Emission from Degraded Soybean Nodules Depends on Denitrification by Bradyrhizobium japonicum and Other Microbes in the Rhizosphere Peer-reviewed

    Shoko Inaba, Fumio Ikenishi, Manabu Itakura, Masakazu Kikuchi, Shima Eda, Naohiko Chiba, Chie Katsuyama, Yuichi Suwa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(4)　470-476　2012/12

    DOI： 10.1264/jsme2.ME12100 　

    ISSN： 1342-6311

  22. Complete Genome Sequence of Acidovorax sp Strain KKS102, a Polychlorinated-Biphenyl Degrader Peer-reviewed

    Yoshiyuki Ohtsubo, Fumito Maruyama, Hisayuki Mitsui, Yuji Nagata, Masataka Tsuda

    JOURNAL OF BACTERIOLOGY　194　(24)　6970-6971　2012/12

    DOI： 10.1128/JB.01848-12 　

    ISSN： 0021-9193

  23. Exploration of natural nod gene inducers for Mesorhizobium loti in seed and root exudates of Lotus corniculatus. Peer-reviewed

    Katsuhiro Kojima, Tadashi Yokoyama(corresponding Author, Naoko Ohkama-Ohtsu, Suwat Saengkerdsub, Manabu Itakura, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa, Yasuhiro Arima

    Soil Microorganisms　66　(1)　12-21　2012/01

    Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology

    DOI： 10.18946/jssm.66.1_12 　

    ISSN： 0912-2184

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    Tetronic acid is a candidate for an inducer of nodulation (nod) gene expression in Mesorhizobium loti. However, there is no evidence that tetronic acid is secreted from Lotus species, the host plants of M. loti. This suggests that Lotus plants may produce other genuine nod gene inducers that differ from tetronic acid. In this study, M. loti cells harboring a nodA-lacZ fusion were enclosed in dialysis tubing and immersed in L. corniculatus culture solution. Significant β-galactosidase activities were detected in the M. loti cells, indicating that nod gene inducers were present in the seed and root exudates. β-galactosidase activities in M. loti cells were also determined after cells were exposed to seed and root exudates or tetronic acid in vitro. Seed and root exudates induced greater β-galactosidase activity in M. loti cells in 1 mM CaSO_4 solution than in YEM medium. In contrast, tetronic acid induced greater β-galactosidase activity in M. loti cells in YEM medium than in 1 mM CaSO_4 solution. Further, β-galactosidase activities induced by seed and root exudates and tetronic acid tended to decrease as the pH of the medium became neutral. In an LC-MS analysis, we could not detect tetronic acid in the concentrated seed and root exudates. These findings indicate that Lotus plants release genuine nod gene inducers for M. loti that differ from tetronic acid. Finally, seed exudates of L. corniculatus were fractionated according to molecular size and polarity, and it was clarified that a putative nod gene inducer in the seed exudates was a low molecular weight and high polarity substance.

  24. Complete genome sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: insights into symbiosis evolution in soil oligotrophs. Peer-reviewed

    Takashi Okubo, Takahiro Tsukui, Hiroko Maita, Shinobu Okamoto, Kenshiro Oshima, Takatomo Fujisawa, Akihiro Saito, Hiroyuki Futamata, Reiko Hattori, Yumi Shimomura, Shin Haruta, Sho Morimoto, Yong Wang, Yoriko Sakai, Masahira Hattori, Shin-Ichi Aizawa, Kenji V P Nagashima, Sachiko Masuda, Tsutomu Hattori, Akifumi Yamashita, Zhihua Bao, Masahito Hayatsu, Hiromi Kajiya-Kanegae, Ikuo Yoshinaga, Kazunori Sakamoto, Koki Toyota, Mitsuteru Nakao, Mitsuyo Kohara, Mizue Anda, Rieko Niwa, Park Jung-Hwan, Reiko Sameshima-Saito, Shin-Ichi Tokuda, Sumiko Yamamoto, Syuji Yamamoto, Tadashi Yokoyama, Tomoko Akutsu, Yasukazu Nakamura, Yuka Nakahira-Yanaka, Yuko Takada Hoshino, Hideki Hirakawa, Hisayuki Mitsui, Kimihiro Terasawa, Manabu Itakura, Shusei Sato, Wakako Ikeda-Ohtsubo, Natsuko Sakakura, Eli Kaminuma, Kiwamu Minamisawa

    Microbes and environments　27　(3)　306-15　2012

    DOI： 10.1264/jsme2.ME11321 　

    eISSN： 1347-4405

    More details Close

    Bradyrhizobium sp. S23321 is an oligotrophic bacterium isolated from paddy field soil. Although S23321 is phylogenetically close to Bradyrhizobium japonicum USDA110, a legume symbiont, it is unable to induce root nodules in siratro, a legume often used for testing Nod factor-dependent nodulation. The genome of S23321 is a single circular chromosome, 7,231,841 bp in length, with an average GC content of 64.3%. The genome contains 6,898 potential protein-encoding genes, one set of rRNA genes, and 45 tRNA genes. Comparison of the genome structure between S23321 and USDA110 showed strong colinearity; however, the symbiosis islands present in USDA110 were absent in S23321, whose genome lacked a chaperonin gene cluster (groELS3) for symbiosis regulation found in USDA110. A comparison of sequences around the tRNA-Val gene strongly suggested that S23321 contains an ancestral-type genome that precedes the acquisition of a symbiosis island by horizontal gene transfer. Although S23321 contains a nif (nitrogen fixation) gene cluster, the organization, homology, and phylogeny of the genes in this cluster were more similar to those of photosynthetic bradyrhizobia ORS278 and BTAi1 than to those on the symbiosis island of USDA110. In addition, we found genes encoding a complete photosynthetic system, many ABC transporters for amino acids and oligopeptides, two types (polar and lateral) of flagella, multiple respiratory chains, and a system for lignin monomer catabolism in the S23321 genome. These features suggest that S23321 is able to adapt to a wide range of environments, probably including low-nutrient conditions, with multiple survival strategies in soil and rhizosphere.

  25. Nitrate-Dependent N2O Emission from Intact Soybean Nodules via Denitrification by Bradyrhizobium japonicum Bacteroids Peer-reviewed

    Junta Hirayama, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(24)　8787-8790　2011/12

    DOI： 10.1128/AEM.06262-11 　

    ISSN： 0099-2240

  26. The Genotype of the Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Gene (CCaMK) Determines Bacterial Community Diversity in Rice Roots under Paddy and Upland Field Conditions Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Naoya Takeda, Mari Banba, Kazuhiro Sasaki, Haruko Imaizumi-Anraku, Shinsuke Fujihara, Yoshinari Ohwaki, Kenshiro Ohshima, Yoshimichi Fukuta, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Masahira Hattori, Tadashi Sato, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(13)　4399-4405　2011/07

    DOI： 10.1128/AEM.00315-11 　

    ISSN： 0099-2240

    eISSN： 1098-5336

  27. Isolation and Genetic Characterization of Aurantimonas and Methylobacterium Strains from Stems of Hypernodulated Soybeans Peer-reviewed

    Mizue Anda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Takashi Okubo, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(2)　172-180　2011/06

    DOI： 10.1264/jsme2.ME10203 　

    ISSN： 1342-6311

  28. Identification of Mesorhizobium loti Genes Relevant to Symbiosis by Using Signature-Tagged Mutants Peer-reviewed

    Naoganchaolu Borjigin, Keisuke Furukawa, Yoshikazu Shimoda, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　26　(2)　165-171　2011/06

    DOI： 10.1264/jsme2.ME10213 　

    ISSN： 1342-6311

  29. Involvement of the SmeAB Multidrug Efflux Pump in Resistance to Plant Antimicrobials and Contribution to Nodulation Competitiveness in Sinorhizobium meliloti Peer-reviewed

    Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(9)　2855-2862　2011/05

    DOI： 10.1128/AEM.02858-10 　

    ISSN： 0099-2240

    eISSN： 1098-5336

  30. Autoregulation of Nodulation Interferes with Impacts of Nitrogen Fertilization Levels on the Leaf-Associated Bacterial Community in Soybeans Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Mizue Anda, Shoko Inaba, Shima Eda, Shusei Sato, Kazuhiro Sasaki, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Tadashi Sato, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　77　(6)　1973-1980　2011/03

    DOI： 10.1128/AEM.02567-10 　

    ISSN： 0099-2240

  31. 土着ダイズ根粒菌の亜酸化窒素還元酵素遺伝子(nosZ)の分布と亜酸化窒素還元能を利用したN_2O削減(2011年度大会一般講演要旨)

    板倉 学, 椎名 陽子, Choi Hyunseok, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　65　(2)　154-154　2011

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.65.2_154_1 　

  32. The cbbL Gene is Required for Thiosulfate-Dependent Autotrophic Growth of Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

    Sachiko Masuda, Shima Eda, Chiaki Sugawara, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　25　(3)　220-223　2010/09

    DOI： 10.1264/jsme2.ME10124 　

    ISSN： 1342-6311

  33. Community- and Genome-Based Views of Plant-Associated Bacteria: Plant-Bacterial Interactions in Soybean and Rice Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Mizue Anda, Hideo Nakashita, Michiko Yasuda, Shusei Sato, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shima Eda, Ayumi Momiyama, Kimihiro Terasawa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　51　(9)　1398-1410　2010/09

    DOI： 10.1093/pcp/pcq119 　

    ISSN： 0032-0781

    eISSN： 1471-9053

  34. Impact of plant genotype and nitrogen level on rice growth response to inoculation with Azospirillum sp. strain B510 under paddy field conditions Peer-reviewed

    Kazuhiro Sasaki, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Eiko Hanzawa, Chiharu Kisara, Yuri Kazama, Atsuhiko Kushida, Takuro Shinano, Kiwamu Minamisawa, Tadashi Sato

    SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION　56　(4)　636-644　2010/08

    DOI： 10.1111/j.1747-0765.2010.00499.x 　

    ISSN： 0038-0768

  35. Temperature-Dependent Expression of Type III Secretion System Genes and Its Regulation in Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

    Min Wei, Keisuke Takeshima, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Mikiko Abe, Satoshi Ishii, Takuji Ohwada

    MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS　23　(5)　628-637　2010/05

    DOI： 10.1094/MPMI-23-5-0628 　

    ISSN： 0894-0282

  36. Thiosulfate-Dependent Chemolithoautotrophic Growth of Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

    Sachiko Masuda, Shima Eda, Seishi Ikeda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　76　(8)　2402-2409　2010/04

    DOI： 10.1128/AEM.02783-09 　

    ISSN： 0099-2240

    eISSN： 1098-5336

  37. Community shifts of soybean stem-associated bacteria responding to different nodulation phenotypes and N levels Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Takashi Okubo, Takakazu Kaneko, Shoko Inaba, Tomiya Maekawa, Shima Eda, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    ISME JOURNAL　4　(3)　315-326　2010/03

    DOI： 10.1038/ismej.2009.119 　

    ISSN： 1751-7362

  38. Complete genomic structure of the cultivated rice endophyte Azospirillum sp. B510. International-journal Peer-reviewed

    Takakazu Kaneko, Kiwamu Minamisawa, Tsuyoshi Isawa, Hiroki Nakatsukasa, Hisayuki Mitsui, Yasuyuki Kawaharada, Yasukazu Nakamura, Akiko Watanabe, Kumiko Kawashima, Akiko Ono, Yoshimi Shimizu, Chika Takahashi, Chiharu Minami, Tsunakazu Fujishiro, Mitsuyo Kohara, Midori Katoh, Naomi Nakazaki, Shinobu Nakayama, Manabu Yamada, Satoshi Tabata, Shusei Sato

    DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes　17　(1)　37-50　2010/02

    DOI： 10.1093/dnares/dsp026 　

    More details Close

    We determined the nucleotide sequence of the entire genome of a diazotrophic endophyte, Azospirillum sp. B510. Strain B510 is an endophytic bacterium isolated from stems of rice plants (Oryza sativa cv. Nipponbare). The genome of B510 consisted of a single chromosome (3,311,395 bp) and six plasmids, designated as pAB510a (1,455,109 bp), pAB510b (723,779 bp), pAB510c (681,723 bp), pAB510d (628,837 bp), pAB510e (537,299 bp), and pAB510f (261,596 bp). The chromosome bears 2893 potential protein-encoding genes, two sets of rRNA gene clusters (rrns), and 45 tRNA genes representing 37 tRNA species. The genomes of the six plasmids contained a total of 3416 protein-encoding genes, seven sets of rrns, and 34 tRNAs representing 19 tRNA species. Eight genes for plasmid-specific tRNA species are located on either pAB510a or pAB510d. Two out of eight genomic islands are inserted in the plasmids, pAB510b and pAB510e, and one of the islands is inserted into trnfM-CAU in the rrn located on pAB510e. Genes other than the nif gene cluster that are involved in N(2) fixation and are homologues of Bradyrhizobium japonicum USDA110 include fixABCX, fixNOQP, fixHIS, fixG, and fixLJK. Three putative plant hormone-related genes encoding tryptophan 2-monooxytenase (iaaM) and indole-3-acetaldehyde hydrolase (iaaH), which are involved in IAA biosynthesis, and ACC deaminase (acdS), which reduces ethylene levels, were identified. Multiple gene-clusters for tripartite ATP-independent periplasmic-transport systems and a diverse set of malic enzymes were identified, suggesting that B510 utilizes C(4)-dicarboxylate during its symbiotic relationship with the host plant.

  39. ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較 : USDA122株特異的遺伝子の探索(2010年度大会一般講演要旨)

    津久井 隆裕, 金子 貴一, 佐藤 修正, 山田 学, 板倉 学, 三井 久幸, 江田 志磨, 南澤 究

    土と微生物　64　(2)　142-142　2010

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.64.2_142_2 　

  40. ダイズ老化根粒からの亜酸化窒素発生に関与する土壌生物(2010年度大会一般講演要旨)

    南澤 究, 稲葉 尚子, 早津 雅仁, 星野(高田) 裕子, 岡田 浩明, 江田 志磨, 三井 久幸

    土と微生物　64　(2)　137-137　2010

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.64.2_137_3 　

  41. Identification of the Mesorhizobium loti gene responsible for glycerophosphorylation of periplasmic cyclic beta-1,2-glucans Peer-reviewed

    Yasuyuki Kawaharada, Hiromasa Kiyota, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    FEMS MICROBIOLOGY LETTERS　302　(2)　131-137　2010/01

    DOI： 10.1111/j.1574-6968.2009.01843.x 　

    ISSN： 0378-1097

  42. Development of a bacterial cell enrichment method and its application to the community analysis in soybean stems. International-journal Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn E E Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

    Microbial ecology　58　(4)　703-14　2009/11

    DOI： 10.1007/s00248-009-9566-0 　

    More details Close

    A method was developed for enriching bacterial cells from soybean stems which was recalcitrant for a culture-independent analysis of bacterial community due to the interference with plant DNA. Stem homogenates were fractionated by a series of differential centrifugations followed by a Nycodenz density gradient centrifugation. The efficiency of bacterial cell enrichment was assessed by ribosomal intergenic spacer analysis (RISA). The intensity and the number of bacterial amplicons of RISA were markedly increased in the DNA extracted from the enriched bacterial cells compared to that in the DNA directly extracted from soybean stems. The phylogenetic diversity of the enriched bacterial cells was evaluated by analyzing a clone library of 16S rRNA gene in comparison with those of the culturable fractions of the enriched and non-enriched stem-associated bacteria, endophytic bacteria, and epiphytic bacteria. The results indicated that the method was able to enrich both endophytic and epiphytic bacteria from soybean stems, and was useful to assess the bacterial diversity based on a 16S rRNA gene clone library. When the sequence data from all clones (1,332 sequences) were combined, 72 operational taxonomic units were affiliated with Proteobacteria (Alpha-, Beta-, and Gammaproteobacteria), Actinobacteria, Firmicutes, and Bacteroidetes, which also provided the most comprehensive set of data on the bacterial diversity in the aerial parts of soybeans.

  43. Aerobic Vanillate Degradation and C-1 Compound Metabolism in Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

    Nirinya Sudtachat, Naofumi Ito, Manabu Itakura, Sachiko Masuda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Yasuyuki Kawaharada, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　75　(15)　5012-5017　2009/08

    DOI： 10.1128/AEM.00755-09 　

    ISSN： 0099-2240

    eISSN： 1098-5336

  44. Genomic comparison of Bradyrhizobium japonicum strains with different symbiotic nitrogen-fixing capabilities and other Bradyrhizobiaceae members Peer-reviewed

    Manabu Itakura, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Keina Honnma, Konosuke Fujita, Hiroyoshi Iwata, Yuichi Saeki, Yoshino Hara, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    ISME JOURNAL　3　(3)　326-339　2009/03

    DOI： 10.1038/ismej.2008.88 　

    ISSN： 1751-7362

    eISSN： 1751-7370

  45. Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成と競合能に関わる遺伝子の探索(2009年度大会一般講演要旨)

    古川 啓介, 大久保 卓, 三井 久幸, 江田 志磨, 南澤 究

    土と微生物　63　(2)　115-115　2009

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.63.2_115_4 　

  46. Nodulation-Dependent Communities of Culturable Bacterial Endophytes from Stems of Field-Grown Soybeans Peer-reviewed

    Takashi Okubo, Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　24　(3)　253-258　2009

    DOI： 10.1264/jsme2.ME09125 　

    ISSN： 1342-6311

  47. Nitrous Oxide Emission and Microbial Community in the Rhizosphere of Nodulated Soybeans during the Late Growth Period Peer-reviewed

    Shoko Inaba, Kenji Tanabe, Shima Eda, Seishi Ikeda, Atsushi Higashitani, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　24　(1)　64-67　2009

    DOI： 10.1264/jsme2.ME08544 　

    ISSN： 1342-6311

  48. Generation of Bradyrhizobium japonicum Mutants with Increased N2O Reductase Activity by Selection after Introduction of a Mutated dnaQ Gene Peer-reviewed

    Manabu Itakura, Kazufumi Tabata, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiriko Murakami, Junichi Yasuda, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(23)　7258-7264　2008/12

    DOI： 10.1128/AEM.01850-08 　

    ISSN： 0099-2240

    eISSN： 1098-5336

  49. Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics. International-journal Peer-reviewed

    Yoshikazu Shimoda, Hisayuki Mitsui, Hiroko Kamimatsuse, Kiwamu Minamisawa, Eri Nishiyama, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Sayaka Shinpo, Akiko Watanabe, Mitsuyo Kohara, Manabu Yamada, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Shusei Sato

    DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes　15　(5)　297-308　2008/10

    DOI： 10.1093/dnares/dsn017 　

    More details Close

    Rhizobia are nitrogen-fixing soil bacteria that establish endosymbiosis with some leguminous plants. The completion of several rhizobial genome sequences provides opportunities for genome-wide functional studies of the physiological roles of many rhizobial genes. In order to carry out genome-wide phenotypic screenings, we have constructed a large mutant library of the nitrogen-fixing symbiotic bacterium, Mesorhizobium loti, by transposon mutagenesis. Transposon insertion mutants were generated using the signature-tagged mutagenesis (STM) technique and a total of 29,330 independent mutants were obtained. Along with the collection of transposon mutants, we have determined the transposon insertion sites for 7892 clones, and confirmed insertions in 3680 non-redundant M. loti genes (50.5% of the total number of M. loti genes). Transposon insertions were randomly distributed throughout the M. loti genome without any bias toward G+C contents of insertion target sites and transposon plasmids used for the mutagenesis. We also show the utility of STM mutants by examining the specificity of signature tags and test screenings for growth- and nodulation-deficient mutants. This defined mutant library allows for genome-wide forward- and reverse-genetic functional studies of M. loti and will serve as an invaluable resource for researchers to further our understanding of rhizobial biology.

  50. Microbial community analysis of field-grown soybeans with different nodulation phenotypes Peer-reviewed

    Seishi Ikeda, Lynn Esther E. Rallos, Takashi Okubo, Shima Eda, Shoko Inaba, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　74　(18)　5704-5709　2008/09

    DOI： 10.1128/AEM.00833-08 　

    ISSN： 0099-2240

  51. Structural characterization of neutral and anionic glucans from Mesorhizobium loti Peer-reviewed

    Yasuyuki Kawaharada, Hiromasa Kiyota, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    CARBOHYDRATE RESEARCH　343　(14)　2422-2427　2008/09

    DOI： 10.1016/j.carres.2008.07.007 　

    ISSN： 0008-6215

  52. Soybean Seed Extracts Preferentially Express Genomic Loci of Bradyrhizobium japonicum in the Initial Interaction with Soybean, Glycine max (L.) Merr Peer-reviewed

    Min Wei, Tadashi Yokoyama, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui, Manabu Itakura, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Omori, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchium, Mlkiko Abe, Takuji Ohwada

    DNA RESEARCH　15　(4)　201-214　2008/08

    DOI： 10.1093/dnares/dsn012 　

    ISSN： 1340-2838

  53. A Mesorhizobium loti mutant with reduced glucan content shows defective invasion of its host plant Lotus japonicus Peer-reviewed

    Yasuyuki Kawaharada, Shima Eda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    MICROBIOLOGY-SGM　153　(12)　3983-3993　2007/12

    DOI： 10.1099/mic.0.2007/008631-0 　

    ISSN： 1350-0872

  54. Rhizobitoxine production in Agrobacterium tumefaciens C58 by Bradyrhizobium elkanii rtxACDEFG genes Peer-reviewed

    Masayuki Sugawara, Ryota Haramaki, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shin Okazaki, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    FEMS MICROBIOLOGY LETTERS　269　(1)　29-35　2007/04

    DOI： 10.1111/j.1574-6968.2006.00590.x 　

    ISSN： 0378-1097

  55. 野生イネ,栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析(2007年度大会一般講演要旨)

    南澤 究, 金子 貴一, 中村 保一, 渡辺 安希子, 佐藤 雅志, 阿部 匡, 江田 志磨, 三井 久幸, 板倉 学, 田畑 哲之

    土と微生物　61　(2)　154-154　2007

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.61.2_154_1 　

  56. Rhizobitoxine modulates plant-microbe interactions by ethylene inhibition Peer-reviewed

    M Sugawara, S Okazaki, N Nukui, H Ezura, H Mitsui, K Minamisawa

    BIOTECHNOLOGY ADVANCES　24　(4)　382-388　2006/07

    DOI： 10.1016/j.biotechadv.2006.01.004 　

    ISSN： 0734-9750

  57. Symbiotic Bradyrhizobium japonicum reduces N2O surrounding the soybean root system via nitrous oxide reductase Peer-reviewed

    R Sameshima-Saito, K Chiba, J Hirayama, M Itakura, H Mitsui, S Eda, K Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　72　(4)　2526-2532　2006/04

    DOI： 10.1128/AEM.72.4.2526-2532.2006 　

    ISSN： 0099-2240

  58. Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる根粒形成、非根粒形成Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム比較(2006年度大会一般講演要旨)

    板倉 学, 佐伯 和彦, 大森 博文, 横山 正, 金子 貴一, 田畑 哲之, 大和田 琢二, 田島 茂行, 内海 俊樹, 鮫島 玲子, 三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　60　(2)　144-144　2006

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.60.2_144_2 　

  59. ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける新規共生能欠損変異株の解析(2006年度大会一般講演要旨)

    川原田 泰之, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　60　(2)　145-145　2006

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.60.2_145_2 　

  60. Global Gene Expression in Bradyrhizobium japonicum Cultured with Vanillin, Vanillate, 4-Hydroxybenzoate and Protocatechuate Peer-reviewed

    Naofumi Ito, Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Ohwada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Eiji Masai, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    Microbes and Environments　21　(4)　240-250　2006

    DOI： 10.1264/jsme2.21.240 　

    ISSN： 1347-4405 1342-6311

  61. Expression of the nifH gene of a Herbaspirillum endophyte in wild rice species: Daily rhythm during the light-dark cycle Peer-reviewed

    M You, T Nishiguchi, A Saito, T Isawa, H Mitsui, K Minamisawa

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　71　(12)　8183-8190　2005/12

    DOI： 10.1128/AEM.71.12.8183-8190.2005 　

    ISSN： 0099-2240

  62. Acetylation of a fucosyl residue at the reducing end of Mesorhizobium loti nod factors is not essential for nodulation of Lotus japonicus Peer-reviewed

    S Shibata, H Mitsui, H Kouchi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　46　(6)　1016-1020　2005/06

    DOI： 10.1093/pcp/pci099 　

    ISSN： 0032-0781

  63. 根粒菌の環境ストレス耐性と共生能の両方に重要な転写因子RpoH_1の機能解析(2005年度大会一般講演要旨)

    三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　59　(2)　132-132　2005

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.59.2_132_1 　

  64. Sphingomonas oligophenolica sp nov., a halo- and organo-sensitive oligotrophic bacterium from paddy soil that degrades phenolic acids at low concentrations Peer-reviewed

    H Ohta, R Hattori, Y Ushiba, H Mitsui, M Ito, H Watanabe, A Tonosaki, T Hattori

    INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY　54　2185-2190　2004/11

    DOI： 10.1099/ijs.0.02959-0 　

    ISSN： 1466-5026

  65. Sinorhizobium meliloti RpoH(1) is required for effective nitrogen-fixing symbiosis with alfalfa Peer-reviewed

    H Mitsui, T Sato, Y Sato, N Ito, K Minamisawa

    MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS　271　(4)　416-425　2004/05

    DOI： 10.1007/s00438-004-0992-x 　

    ISSN： 1617-4615

    eISSN： 1617-4623

  66. Expression islands clustered on the symbiosis island of the Mesorhizobium loti genome Peer-reviewed

    T Uchiumi, T Ohwada, M Itakura, H Mitsui, N Nukui, P Dawadi, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Omori, M Hayashi, T Maekawa, R Sriprang, Y Murooka, S Tajima, K Simomura, M Nomura, A Suzuki, Y Shimoda, K Sioya, M Abe, K Minamisawa

    JOURNAL OF BACTERIOLOGY　186　(8)　2439-2448　2004/04

    DOI： 10.1128/JB.186.8.2439-2448.2004 　

    ISSN： 0021-9193

  67. Phylogeny and distribution of extra-slow-growing Bradyrhizobium japonicum harboring high copy numbers of RS alpha, RS beta and IS1631 Peer-reviewed

    R Sameshima, T Isawa, MJ Sadowsky, T Hamada, H Kasai, A Shutsrirung, H Mitsui, K Minamisawa

    FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　44　(2)　191-202　2003/05

    DOI： 10.1016/S0168-6496(03)00009-6 　

    ISSN： 0168-6496

  68. Horizontal Transfer of Nodulation Genes in soils and Microcosms from Bradyrhizobium japonicum to B. elkanii Peer-reviewed

    Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Masako Suzuki, Kazunori Ichige, Tsuyoshiisawa, Ken-Ichi Yuhashi, Hisayuki Mitsui

    Microbes and Environments　17　(2)　82-90　2002

    DOI： 10.1264/jsme2.2002.82 　

    ISSN： 1347-4405 1342-6311

  69. Endophytic Colonization and in Planta Nitrogen Fixation by a Herbaspirillum sp. Isolated from Wild Rice Species Peer-reviewed

    Adel Elbeltagy, Kiyo Nishioka, Tadashi Sato, Hisa Suzuki, Bin Ye, Toru Hamada, Tsuyoshi Isawa, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    Applied and Environmental Microbiology　67　(3-12)　5285-5293　2001

    DOI： 10.1128/AEM.67.11.5285-5293.2001 　

    ISSN： 0099-2240

  70. DNA Sequence and Mutational Analysis of Rhizobitoxine Biosynthesis Genes in Bradyrhizobium elkanii Peer-reviewed

    Tsuyoshi Yaslta, Shin Okazaki, Hisayuki Mitsui, Ken-Ichi Yuhashi, Hiroshi Ezura, Kiwamu Minamisawa

    Applied and Environmental Microbiology　67　(3-12)　4999-5009　2001

    DOI： 10.1128/AEM.67.11.4999-5009.2001 　

    ISSN： 0099-2240

  71. Two RpoH homologs responsible for the expression of heat shock protein genes in Sinorhizobium meliloti Peer-reviewed

    Y. Ono, H. Mitsui, T. Sato, K. Minamisawa

    Molecular and General Genetics　264　(6)　902-912　2001

    DOI： 10.1007/s004380000380 　

    ISSN： 0026-8925

  72. Phylogenetic analysis of the phytopathogenic fungus Fusarium solani based on the rDNA-ITS region Peer-reviewed

    H. Suga, T. Hasegawa, H. Mitsui, K. Kageyama, M. Hyakumachi

    Mycological Research　104　(10)　1175-1183　2000/10

    DOI： 10.1017/S0953756200002719 　

    ISSN： 0953-7562

  73. Endophytic colonization in rice by diazotrophic Herbaspirillum sp. isolated from wild rice(The Annual Meeting of the Society in 2000)

    Elbeltagy Adel, Nishioka Kiyo, Suzuki Hisa, Miyaki Taro, Yuhashi Ken-Ichi, Sato Tadashi, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    Soil Microorganisms　54　(2)　172-172　2000

    Publisher: Japanese Society of Soil Microbiology

    DOI： 10.18946/jssm.54.2_172_1 　

  74. Isolation and characterization of endophytic bacteria from wild and traditionally cultivated rice varieties Peer-reviewed

    Adel Elbeltagy, Kiyo Nishioka, Hisa Suzuki, Tadashi Sato, Yo-Ichiro Sato, Hisao Morisaki, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    Soil Science and Plant Nutrition　46　(3)　617-629　2000

    DOI： 10.1080/00380768.2000.10409127 　

    ISSN： 1747-0765 0038-0768

  75. IS1631 occurrence in Bradyrhizobium japonicum highly reiterated sequence-possessing strains with high copy numbers of repeated sequences RSα and RSβ Peer-reviewed

    Tsuyoshi Isawa, Reiko Sameshima, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    Applied and Environmental Microbiology　65　(8)　3493-3501　1999/08

    ISSN： 0099-2240

  76. Characterization of katD, a kinesin-like protein gene specifically expressed in floral tissues of Arabidopsis thaliana Peer-reviewed

    Katsunori Tamura, Kimihiko Nakatani, Hisayuki Mitsui, Yukio Ohashi, Hideo Takahashi

    Gene　230　(1)　23-32　1999/04/01

    DOI： 10.1016/S0378-1119(99)00070-0 　

    ISSN： 0378-1119

  77. Dhh1p, a putative RNA helicase, associates with the general transcription factors Pop2p and Ccr4p from Saccharomyces cerevisiae Peer-reviewed

    Hata H, Mitsui H, Liu H, Bai YL, Denis CL, Shimizu Y, Sakai A

    Genetics　148　571-579　1998/06

  78. Slow-growing and oligotrophic soil bacteria phylogenetically close to Bradyrhizobium japonicum Peer-reviewed

    Akihiro Saito, Hisayuki Mitsui, Reiko Hattori, Kiwamu Minamisawa, Tsutomu Hattori

    FEMS Microbiology Ecology　25　(3)　277-286　1998/03

    DOI： 10.1016/S0168-6496(98)00009-9 　

    ISSN： 0168-6496

  79. 6-21 ダイズ根粒菌HRS株からの根粒形成遺伝子の水平伝達(6.土壌生物)

    板倉 学, 伊沢 剛, 三井 久幸, 南沢 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　44　45-45　1998

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_45_1 　

    ISSN： 0288-5840

  80. 6-20 ダイズ根粒菌HRS株の分布とその生態的意義(6.土壌生物)

    伊沢 剛, 板倉 学, 市川 徳一, 西岡 キヨ, 三井 久幸, 南沢 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　44　44-44　1998

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    DOI： 10.20710/dohikouen.44.0_44_2 　

    ISSN： 0288-5840

  81. Incubation time and media requirements of culturable bacteria from different phylogenetic groups Peer-reviewed

    Hisayuki Mitsui, Krystyna Gorlach, Hyong-Jin Lee, Reiko Hattori, Tsutomu Hattori

    Journal of Microbiological Methods　30　(2)　103-110　1997/08/01

    DOI： 10.1016/S0167-7012(97)00052-3 　

    ISSN： 0167-7012

  82. Advances in soil microbial ecology and the biodiversity Peer-reviewed

    Tsutomu Hattori, Hisayuki Mitsui, Hideki Haga, Norio Wakao, Shuichi Shikano, Krystyna Gorlach, Yasuhiro Kasahara, Adel El-Beltagy, Reiko Hattori

    Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology　72　(1)　21-28　1997

    DOI： 10.1023/A:1000201017238 　

    ISSN： 0003-6072

  83. Na+-induced structural change of a soil bacterium, S34, and Ca2+ requirement for preserving its original structure Peer-reviewed

    Hisayuki Mitsui, Reiko Hattori, Hiroshi Watanabe, Akira Tonosaki, Tsutomu Hattori

    Journal of Bacteriology　179　(10)　3350-3353　1997

    Publisher: American Society for Microbiology

    DOI： 10.1128/jb.179.10.3350-3353.1997 　

    ISSN： 0021-9193

  84. Cell cycle-dependent accumulation of a kinesin-like protein, KatB/C, in synchronized tobacco BY-2 cells Peer-reviewed

    H. Mitsui, S. Hasezawa, T. Nagata, H. Takahashi

    Plant Molecular Biology　30　(1)　177-181　1996

    Publisher: Kluwer Academic Publishers

    DOI： 10.1007/BF00017812 　

    ISSN： 0167-4412

  85. 6-23 草地DNB細菌の分類(6.土壌生物)

    斎藤 明広, 三井 久幸, 服部 勉

    日本土壌肥料学会講演要旨集　41　48-48　1995

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    DOI： 10.20710/dohikouen.41.0_48_1 　

    ISSN： 0288-5840

  86. 6-22 水田DNB細菌の16SrDNA部分塩基配列による類別(6.土壌生物)

    李 亨珍, 三井 久幸, ゴルラッハ K., 服部 勉

    日本土壌肥料学会講演要旨集　41　47-47　1995

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    DOI： 10.20710/dohikouen.41.0_47_2 　

    ISSN： 0288-5840

  87. Sequencing and characterization of the kinesin-related genes katB and katC of Arabidopsis thaliana Peer-reviewed

    Mitsui H, Nakatani K, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Nishikawa K, Takahashi H

    Plant Mol Biol　25　865-876　1994/06

  88. Identification of a gene family (kat) encoding kinesin-like proteins in Arabidopsis thaliana and the characterization of secondary structure of KatA Peer-reviewed

    H. Mitsui, K. Yamaguchi-Shinozaki, K. Shinozaki, K. Nishikawa, H. Takahashi

    MGG Molecular &amp; General Genetics　238　(3)　362-368　1993/04

    Publisher: Springer-Verlag

    DOI： 10.1007/BF00291995 　

    ISSN： 0026-8925 1617-4623

  89. Delimitation of cohesive ends site (cos) of Streptomyces temperate bacteriophage R4 Peer-reviewed

    Hisayuki Mitsui, Hideo Takahashi

    Biochemical and Biophysical Research Communications　186　(3)　1663-1668　1992/08/14

    DOI： 10.1016/S0006-291X(05)81599-2 　

    ISSN： 1090-2104 0006-291X

  90. Cohesive single-stranded ends of Streptomyces temperate bacteriophage R4 Peer-reviewed

    Hisayuki Mitsui, Hideo Takahashi

    MGG Molecular &amp; General Genetics　231　(3)　360-362　1992/02

    Publisher: Springer-Verlag

    DOI： 10.1007/BF00292703 　

    ISSN： 0026-8925 1617-4623

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Misc. 82

  1. Bradyrhizobium ottawaense株における温室効果ガスN2Oの還元能

    原沙和, 原沙和, SIQUEIRA Arthur Fernandes, 菅原雅之, 板倉学, 三井久幸, GOMES Cristina Sanchez, 佐藤修正, 下田宜司, 今泉(安楽)温子, 南澤究

    日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022

    ISSN： 2424-0575

  2. ミヤコグサが土壌微生物叢を操る仕組み

    中川知己, 中川知己, 佐伯和彦, 豊岡公徳, 佐藤繭子, 平川英樹, 大澤美芙, 若崎眞由美, 福原舞, 福原舞, 川東拓司, 吉田彩恵, 菅沼教生, 三井久幸, 佐藤修正, 川口正代司, 川口正代司

    日本植物生理学会年会(Web)　59th　2018

  3. ミヤコグサはいかにして働かないcheating根粒菌を排除するのか?

    中川知己, 中川知己, 佐伯和彦, 豊岡公徳, 佐藤繭子, 平川英樹, 大澤美芙, 若崎眞由美, 福原舞, 福原舞, 川東拓司, 吉田彩恵, 菅沼教生, 佐藤修正, 三井久幸, 岡崎伸, 川口正代司, 川口正代司

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　27th　2017

    ISSN： 1341-0652

  4. メタゲノム解析によるダイズMethylobacterium属細菌のメチルアミン・ウレイド代謝の発見

    南智之, 按田瑞恵, 三井久幸, 菅原雅之, 金子貴一, 佐藤修正, 佐藤修正, 池田成志, 原新太郎, 南澤究

    日本土壌微生物学会講演要旨集　2016　17　2016/06/06

  5. Bacterial Glade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome

    Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, Hisayuki Mitsui

    GENES & GENETIC SYSTEMS　90　(6)　376-376　2015/12

    ISSN： 1341-7568

    eISSN： 1880-5779

  6. 根粒菌シグマ因子RpoH1の制御を受ける機能未知遺伝子の鉄硫黄タンパク質生合成への関与

    佐々木祥平, 門屋亨介, 笠原康裕, 南澤究, 三井久幸

    日本ゲノム微生物学会年会要旨集　8th　2014

  7. O33-02 rRNA遺伝子オペロンが9.4kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見(口頭発表)

    按田 瑞恵, 大坪 嘉行, 大久保 卓, 菅原 雅之, 三井 久幸, 永田 裕二, 津田 雅孝, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　2014　120-120　2014

    Publisher: 日本微生物生態学会

  8. P23-4 アイソトポマー分析を利用したFusarium属糸状菌による根圏N_2O発生の特定(ポスター発表)

    森内 真人, 葛貫 桂一, 池西 史生, 板倉 学, 包 智華, 豊田 栄, 吉田 尚弘, 鮫島 玲子, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　2014　229-229　2014

    Publisher: 日本微生物生態学会

  9. P3-1-16 水田土壌から分離されたDeinococcus sp. S34株の分類と生態的考察(ポスター,3-1 土壌生物の生態と機能,2013年度名古屋大会)

    太田 寛行, 服部 黎子, 三井 久幸, 服部 勉

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(59)　44-44　2013/09/11

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  10. Aurantimonas属細菌AU20株のポピュレーションはミヤコグサ根粒形成遺伝型に応答して変化する

    按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　22nd　(JA)49,(EN)50,49　2013/05

    ISSN： 1341-0652

  11. PG-016 光合成Bradyrhizobium属細菌のメタノール依存的な生育に及ぼす希土類元素の影響(生理・代謝・増殖,ポスター発表)

    関 謙二郎, 包 智華, 三井 亮司, 谷 明生, 増田 幸子, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　128-128　2013

    Publisher: 日本微生物生態学会

  12. PB-001 N_2O emission from soybean rhizosphere mediated partially by fungal denitrification by Fusarium species :

    Moriuchi Makoto, Inaba Shoko, Ikenishi Fumio, Itakura Manabu, Kikuchi Masakazu, Eda Shima, Chiba Naohiko, Katsuyama Chie, Suwa Yuichi, Sameshima-Saito Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (29)　105-105　2013

    Publisher: 日本微生物生態学会

  13. 土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophica S58Tのゲノム解析

    大久保卓, 大島健志朗, 三井久幸, 服部勉, 服部正平, 南澤究

    日本ゲノム微生物学会年会要旨集　6th　64　2012

  14. 6-23 ダイズ根粒根圏からの亜酸化窒素発生機構と根粒菌を利用した低減化(6.土壌生物)

    板倉 学, 稲葉 尚子, 池西 史生, 椎名 陽子, Choi Hyunseok, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(57)　42-42　2011/08/08

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  15. 202a-2 異なる土壌型におけるnosZ保有・非保有Bradyrhizobium japonicumの出現頻度と系統分布(202a 土壌生態系,口頭発表)

    椎名 陽子, 板倉 学, 大久保 卓, Choi Hyunseok, 稲葉 尚子, 佐伯 雄一, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(27)　62-62　2011

    Publisher: 日本微生物生態学会

  16. P-81 Community analysis of nitrogen-fixing bacteria in rice roots grown in paddy field(Poster Session)

    KITANO AINA, IKEDA SEISHI, EDA SHIMA, MITSUI HISAYUKI, MINAMISAWA KIWAMU

    日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　135-135　2010/11/23

    Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology

  17. ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集 : Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH (Fluorescence in situ hybridization)解析(2010年度大会一般講演要旨)

    飯田 隆之, 池田 成志, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　64　(2)　146-146　2010/10/01

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.64.2_146_4 　

    ISSN： 0912-2184

  18. 根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析(2010年度大会一般講演要旨)

    按田 瑞恵, 池田 成志, 佐藤 修正, 田畑 哲之, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　64　(2)　147-147　2010/10/01

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.64.2_147_3 　

    ISSN： 0912-2184

  19. 8-16 異なる土壌型におけるダイズ根粒菌nosZ保有株の出現頻度 : 出現頻度の高い沖積土と低い黒ボク土の主成分解析(8.共生,2010年度北海道大会)

    椎名 陽子, 板倉 学, 大久保 卓, Choi Hyunseok, 稲葉 尚子, 佐伯 雄一, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　49-49　2010/09/07

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  20. 8-17 ダイズ根粒菌のN_2O還元能による根粒根圏モデル系からのN_2O発生低減化(8.共生,2010年度北海道大会)

    板倉 学, 椎名 陽子, Choi Hyunseok, 植竹 佑輔, 江田 志磨, 松本 貴嗣, 吉川 博文, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(56)　49-49　2010/09/07

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  21. ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集:Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH(Fluorescence in situ hybridization)解析

    飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌微生物学会講演要旨集　2010　45　2010/05/21

  22. 根粒超着生ダイズ由来のMethylobacterium属細菌の分離と系統解析

    按田瑞恵, 池田成志, 佐藤修正, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌微生物学会講演要旨集　2010　48　2010/05/21

  23. イネ共生細菌の群集構造解析

    南澤究, 池田成志, 佐々木和浩, 大久保卓, 北野愛奈, 大島健志朗, 服部正平, 佐藤雅志, 今泉(安楽)温子, 飯田隆之, 按田瑞恵, 江田志磨, 三井久幸

    日本ゲノム微生物学会年会要旨集　4th　53　2010/03/04

  24. バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510のゲノム構造解析

    金子貴一, 南澤究, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之, 佐藤修正

    日本ゲノム微生物学会年会要旨集　4th　2010

  25. バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510のゲノム構造解析

    金子貴一, 南澤究, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之, 佐藤修正

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　19th　2010

    ISSN： 1341-0652

  26. 1C-1 Functional analysis of Bradyrhizobium japonicum genes identified by signature-tagged mutagenesis(Oral Session)

    FURUKAWA KEISUKE, OKUBO TAKASHI, MITSUI HISAYUKI, EDA SHIMA, MINAMISAWA KIWAMU

    (26)　76-76　2010

    Publisher: 日本微生物生態学会

  27. 1A-12 The cep gene is necessary for invasion of leguminous hosts by Mesorhizobium loti(Oral Session)

    SUGAWARA SATOSHI, KAWAHARADA YASUYUKI, MATSUMOTO TAKASHI, SHIWA YUU, YOSHIKAWA HIROHUMI, EDA SHIMA, MITSUI HISAYUKI, MINAMISAWA KIWAMU

    (26)　66-66　2010

    Publisher: 日本微生物生態学会

  28. 根粒超着生ダイズからのMethylobacterium属及びAurantimonas属細菌の分離

    按田瑞恵, 池田成志, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

    環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集　40th　39　2010

  29. ダイズ茎由来の単離困難な細菌群集:Acinetobacter属とMicrobacterium属細菌のFISH(Fluorescence in situ hybridization)解析

    飯田隆之, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集　40th　42　2010

  30. 8-22 根粒着生変異と窒素施肥レベルに応答したダイズ葉の細菌群集構造変化(8.共生,2010年度北海道大会)

    池田 成志, 佐藤 修正, 田畑 哲之, 佐々木 和浩, 佐藤 雅志, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　56　(0)　51-51　2010

    Publisher: 一般社団法人 日本土壌肥料学会

    DOI： 10.20710/dohikouen.56.0_51_1 　

    ISSN： 0288-5840

  31. 8-23 窒素施肥レベルに応答したイネ細菌群集の構造変化 : 低窒素区の根圏における窒素固定細菌とメタン酸化細菌の増加(8.共生,2010年度北海道大会)

    佐々木 和浩, 大久保 卓, 池田 成志, 北野 愛奈, 飯田 隆之, 江田 志摩, 三井 久幸, 佐藤 雅志, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　56　(0)　51-51　2010

    Publisher: 一般社団法人 日本土壌肥料学会

    DOI： 10.20710/dohikouen.56.0_51_2 　

    ISSN： 0288-5840

  32. 1A-13 ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化(口頭発表)

    池田 成志, 大久保 卓, 金子 貴一, 稲葉 尚子, 前川 富也, 江田 志摩, 佐藤 修正, 田畑 哲之, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　7-7　2009/11/21

    Publisher: 日本微生物生態学会

  33. 1B-16 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養(口頭発表)

    増田 幸子, 江田 志磨, 三井 久幸, 池田 成志, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　16-16　2009/11/21

    Publisher: 日本微生物生態学会

  34. 23-2 ダイズ老化根粒におけるN_2O発生メカニズムの解明 : 根粒菌脱窒と硝化過程の関与(23.地球環境,2009年度京都大会)

    稲葉 尚子, 菊池 真和, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　185-185　2009/09/15

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  35. 6-7 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育(6.土壌生物,2009年度京都大会)

    増田 幸子, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　40-40　2009/09/15

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  36. 6-5 変異型dnaQプラスミドによる高N_2O還元酵素活性を示すダイズ根粒菌変異株の取得(6.土壌生物,2009年度京都大会)

    板倉 学, 田畑 和文, 江田 志磨, 三井 久幸, 村上 紀里子, 安田 淳一, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　39-39　2009/09/15

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  37. S6-15 非培養法による植物共生微生物の多様性解析 : 非培養法によるダイズ共生微生物の群集構造に対する根粒共生系及び窒素施肥の影響評価(S6.分子生態学的解析手法を研究室のルーチンワークに!パート2それによって見えるもの、見たいもの,6.土壌生物,2009年度京都大会)

    池田 成志, 大久保 卓, 金子 貴一, 稲葉 尚子, 前川 富也, 江田 志摩, 佐藤 修正, 田畑 哲之, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(55)　42-42　2009/09/15

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  38. 異なる根粒形成表現型ダイズにおける細菌エンドファイトの多様性解析

    大久保卓, 池田成志, 佐藤修正, 金子貴一, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　(JA)51,(EN)52　2009/03

    ISSN： 1341-0652

  39. 異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

    池田成志, RALLOS Lynn, Esther E, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　(JA)53-54,(EN)54,53　2009/03

    ISSN： 1341-0652

  40. バクテリアエンドファイトAzospirillum sp.B510ゲノムの全塩基配列決定と解析

    金子貴一, 南澤究, 佐藤修正, 中務弘基, 三井久幸, 川原田泰之, 中村保一, 田畑哲之

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　18th　2009

    ISSN： 1341-0652

  41. 1B-15 超純水中におけるBradyrhizobium属細菌の生存と適応(口頭発表)

    菅原 千晶, 増田 幸子, 板倉 学, 川原田 泰之, 三井 久幸, 江田 志摩, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　16-16　2009

    Publisher: 日本微生物生態学会

  42. 異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

    池田成志, RALLOS Lynn, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

    日本微生物生態学会講演要旨集　24th　(24)　136-136　2008/11/25

    Publisher: 日本微生物生態学会

  43. 10-183 Microbial community analysis of soybean stems by bacterial cell enrichment(Microbial community analysis)

    Ookubo Takashi, Ikeda Seishi, Kaneko Takakazu, Rallos Lynn, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Satou Syuusei, Nakamura Yasukazu, Tabata Satoshi, Minamisawa Kiwamu

    日本微生物生態学会講演要旨集　(24)　150-150　2008/11/25

    Publisher: Japanese Society of Microbial Ecology

  44. イネ内生細菌ゲノムの遺伝子構成比較解析

    金子貴一, 南澤究, 中村保一, 渡辺安希子, 小野章子, 山田学, 小原光代, 佐藤雅志, 阿部匡, 江田志摩, SUDTACHAT Nirinya, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

    植物微生物研究会研究交流会講演要旨集　17th　2008

    ISSN： 1341-0652

  45. 06-101 Bradyrhizobium japonicum mutants with higher activity of nitrous oxide reductase by a plasmid carrying mutated dnaQ gene(Methodology)

    Itakura Manabu, Tabata Kazufumi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Murakami Kiriko, Yasuda Junichi, Minamisawa Kiwamu

    (24)　109-109　2008

    Publisher: 日本微生物生態学会

  46. 08-149 Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum(Physiology/Growth)

    Masuda Sachiko, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (24)　133-133　2008

    Publisher: 日本微生物生態学会

  47. PA-30 ダイズ根粒根圏のN_2O発生に関わる微生物の解明(農耕地生態系,ポスターセッションA,ポスター発表)

    菊池 真和, 田邉 謙二, 池田 成志, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　91-91　2007/09/15

    Publisher: 日本微生物生態学会

  48. 8-4 野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析(8.共生,2007年度東京大会)

    南澤 究, 金子 貴一, 中村 保一, 渡辺 安希子, 佐藤 雅志, 阿部 匡, 江田 志磨, 三井 久幸, 板倉 学, 田畑 哲之

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(53)　53-53　2007/08/22

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  49. PB-51 ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおけるN_2O還元酵素高発現株の作成(物質環境,ポスターセッションB,ポスター発表)

    植竹 佑輔, 千葉 芳里, 平山 潤太, 江田 志磨, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　140-140　2007

    Publisher: 日本微生物生態学会

  50. PB-44 Analysis of metabolic features of naturally-occurring aromatic compounds in Bradyrhizobium japonicum based on array and gene disruption(Metabolism/Chemical activity,Poster presentation B) :

    Sudtachat Nirinya, Ito Naofumi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (23)　136-136　2007

    Publisher: 日本微生物生態学会

  51. 1-10 Community structures of endophytes in soybeans with different nodulation genotypes(Agricultural ecosystem,Oral presentaion) :

    Rallos Lynn Esther E., Ikeda Seishi, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (23)　41-41　2007

    Publisher: 日本微生物生態学会

  52. 3-06 根粒菌Mesorhizobium lotiの環状グルカンの細胞内含有量に影響を与えるcep遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染において必須の役割を有する(共生・相互作用,口頭発表)

    三井 久幸, 川原田 泰之, 江田 志磨, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(23)　65-65　2007

    Publisher: 日本微生物生態学会

  53. 全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの芳香族化合物分解系およびエネルギー獲得系の解析(2006年度大会一般講演要旨)

    伊藤 尚文, 増田 幸子, 三井 久幸, 江田 志磨, 南澤 究

    土と微生物　60　(2)　2006/10/01

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    ISSN： 0912-2184

  54. 8-12 ダイズ根粒シンビオソーム溶液を処理した単生ダイズ根粒菌に誘導される新規遺伝子応答の網羅的解析(8. 共生, 2006年度秋田大会講演要旨)

    横山 正, 大石 真子, 有馬 泰紘, 大和田 琢二, 南澤 究, 三井 久幸, 板倉 学, 佐伯 和彦, 田島 茂行, 内海 俊樹, 阿部 美紀子

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　44-44　2006/09/05

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  55. 6-8 ダイズ根粒菌のゲノムの構造比較と共生窒素固定能(6. 土壌生物, 2006年度秋田大会講演要旨)

    板倉 学, 佐伯 和彦, 大森 博文, 横山 正, 金子 貴一, 田畑 哲之, 大和田 琢二, 田島 茂行, 内海 俊樹, 藤田 耕之助, 本間 佳奈, 鮫島 玲子, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(52)　32-32　2006/09/05

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  56. PA-64 Comparison of genome structures bewteen Bradyrhizobium joponicum highly reiterated sequence-possessing (HRS) strains and non-HRS strains(Other section,Session A,(1)Poster Presentation)

    Itakura Manabu, Isawa Tsuyoshi, Sameshima Reiko, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (22)　118-118　2006

    Publisher: 日本微生物生態学会

  57. A-19 Screening of Bradyrhizobium japonicum genes relevant to growth and survival under nitrate respiration using soil extract as a substrate by signature-tagged mutagenesis(Agricultural soil ecosystem,(2)Oral presentation)

    Kamimatsuse Hiroko, Itakura Manabu, Eda Shima, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (22)　219-219　2006

    Publisher: 日本微生物生態学会

  58. 全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析(2005年度大会一般講演要旨)

    伊藤 尚文, 増田 幸子, 三井 久幸, 南澤 究

    土と微生物　59　(2)　132-132　2005/10/01

    Publisher: 日本土壌微生物学会

    DOI： 10.18946/jssm.59.2_132_2 　

    ISSN： 0912-2184

  59. A-20 Expression of nifH gene of a Herbaspirillum endophytes in wild rice species : Daily rhythm during the light-dark cycle(GENETIC ANALYSIS,(2) Oral presentation)

    You Mu, Nishiguchi Tomohiro, Saito Asami, Isawa Tsuyoshi, Mitsui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (21)　216-216　2005

    Publisher: 日本微生物生態学会

  60. C-08 Exploration of genes relevant to carbon-starvation response in Mesorhizobium loti by signature-tagged mutagenesis(PHYSIOLOGY/GROWTH,(2) Oral presentation)

    Kashiwabara Daisuke, Itakura Manabu, Mitui Hisayuki, Minamisawa Kiwamu

    (21)　252-252　2005

    Publisher: 日本微生物生態学会

  61. 土壌低栄養細菌 Sphingomonas oligophenolica sp. nov.(関東支部講演会, 日本土壌肥料学会支部講演会講演要旨集2004年度)

    太田 寛行, 服部 黎子, 牛場 裕司, 三井 久幸, 服部 勉

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(50)　290-290　2004/09/14

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  62. B-08 マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析(遺伝子伝播,口頭発表)

    原 圭乃, 板倉 学, 佐伯 和彦, 大森 博文, 横山 正, 金子 貴一, 田畑 哲之, 大和田 琢二, 田島 茂行, 内海 俊樹, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　170-170　2004

    Publisher: 日本微生物生態学会

  63. P-075 ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索 : リン酸トランスポーター遺伝子の解析(共生・相互作用,ポスター発表)

    川原田 泰之, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　97-97　2004

    Publisher: 日本微生物生態学会

  64. P-029 炭素源飢餓条件下で高発現するミヤコグサ根粒菌遺伝子破壊株の増殖特性(生理・増殖,ポスター発表)

    柏原 大介, 板倉 学, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　51-51　2004

    Publisher: 日本微生物生態学会

  65. P-079 根粒菌のマメ科植物との共生成立に必須な転写因子の解析(共生・相互作用,ポスター発表)

    三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　101-101　2004

    Publisher: 日本微生物生態学会

  66. 8-17 共生・微好気・炭素飢餓条件におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析(8.共生)

    大和田 琢二, 南澤 究, 三井 久幸, 板倉 学, 貫井 憲之, 田畑 哲之, 金子 貴一, 横山 正, 手島 光平, 佐伯 和彦, 大森 博文, 室岡 義勝, 林 誠, 前川 隆紀, 田島 茂行, 野村 美加, 下村 憲司朗, 阿部 美紀子, 内海 俊樹, 鈴木 章弘, 下田 宣司, 塩谷 幸樹

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(49)　60-60　2003/08/20

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  67. 共生窒素固定研究の最新情報(11)マメ科植物との共生にかかわる根粒菌の遺伝子

    三井久幸, 南澤究

    農業技術　58　223-228　2003/04

  68. 28-C-10 根粒菌Bradyrhizobium elkaniiのリゾビトキシン生合成遺伝子rtxACの機能解析(共生・相互作用,一般講演)

    菅原 雅之, 岡崎 伸, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　116-116　2003

    Publisher: 日本微生物生態学会

  69. 27-C-21 炭素源飢餓条件下で発現誘導されるミヤコグサ根粒菌の遺伝子(生理・増殖,一般講演)

    板倉 学, 大和田 琢二, 南澤 究, 三井 久幸, 金子 貴一, 田畑 哲之, 横山 正, 手島 光平, 佐伯 和彦, 大森 博文, 室岡 義勝, 林 誠, 田島 茂行, 下村 憲司朗, 阿部 美紀子, 内海 俊樹, 鈴木 章弘, 下田 宜司

    日本微生物生態学会講演要旨集　(19)　79-79　2003

    Publisher: 日本微生物生態学会

  70. Analysis of gene expression of mesorhizobium loti by genomic macro-array

    T Ohwada, K Minamisawa, P Dawady, H Mitsui, M Itakura, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Ohmori, Y Murooka, M Hayashi, S Tajima, M Nomura, K Shimomura, M Abe, A Suzuki, Y Shimoda, T Uchiumi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　44　S210-S210　2003

    ISSN： 0032-0781

  71. B-06 炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的な遺伝子発現解析(生理・増殖2,口頭発表)

    板倉 学, 大和田 琢二, 折笠 善丈, 南澤 究, 三井 久幸, 金子 貴一, 田畑 哲之, 横山 正, 手島 光平, 佐伯 和彦, 室岡 義勝, 林 誠, 田島 茂行, 野村 美加, 下村 憲司朗, 阿部 美紀子, 鈴木 章弘, 下田 宜司, 内海 俊樹

    日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　74-74　2002/11/15

    Publisher: 日本微生物生態学会

  72. 6-21 全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析(6.土壌生物)

    大和田 琢二, 折笠 善丈, 南澤 究, 三井 久幸, 板倉 学, 田畑 哲之, 金子 貴一, 横山 正, 手島 光平, 佐伯 和彦, 大森 博文, 室岡 義勝, 林 誠, 田島 茂行, 野村 美加, 下村 憲司朗, 阿部 美紀子, 内海 俊樹, 鈴木 章弘, 下田 宜司

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(48)　31-31　2002/03/25

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  73. B-31 ダイズ根粒菌リゾビトキシン生合成遺伝子の機能(共生・相互作用,口頭発表)

    南澤 究, 岡崎 伸, 菅原 雅之, 三井 久幸

    日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　99-99　2002

    Publisher: 日本微生物生態学会

  74. A-01 根粒菌の共生窒素固定能とシグマ因子RpoH(遺伝子解析・水圏生態系1,口頭発表)

    三井 久幸, 佐藤 善克, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(18)　19-19　2002

    Publisher: 日本微生物生態学会

  75. Global analysis of gene expression of Mesorhizobium loti MAFF303099

    T Uchiumi, T Ohwada, Y Orikasa, K Minamisawa, H Mitsui, M Itakura, T Kaneko, S Tabata, T Yokoyama, K Tejima, K Saeki, H Omori, Y Murooka, M Hayashi, S Tajima, M Nomura, K Shimomura, M Abe, A Suzuki, Y Shimoda

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY　43　S73-S73　2002

    ISSN： 0032-0781

  76. B-6 根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子(遺伝子解析,B会場,口頭発表)

    三井 久幸, 伊藤 尚文, 佐藤 俊文, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(17)　56-56　2001/11/09

    Publisher: 日本微生物生態学会

  77. 6-28 挿入配列によるダイズ根粒菌のゲノム再編成と環境適応(6.土壌生物)

    鮫島 玲子, 伊沢 剛, 三井 久幸, 南澤 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(46)　46-46　2000/03/25

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  78. C-132 ミヤコグサ根粒菌はVBNC(viable but nonculturable)状態になるか(共生・相互作用-1,ポスター発表)

    板倉 学, 葉 繽, 三井 久幸, 南澤 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　124-124　2000

    Publisher: 日本微生物生態学会

  79. A-07 根粒菌の共生窒素固定に関与するrpoH遺伝子の発現と機能(遺伝子解析など-2,口頭発表)

    三井 久幸, 佐藤 俊文, 南沢 究

    日本微生物生態学会講演要旨集　(16)　23-23　2000

    Publisher: 日本微生物生態学会

  80. 6-41 低栄養細菌Sphingomonas sp. S213のフェルラ酸利用特性(6.土壌生物)

    太田 寛行, 三井 久幸, 服部 黎子, 服部 勉

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(45)　67-67　1999/07/25

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  81. 6-29 ダイズ根粒菌HRS株と通常株の共生領域の比較(6.土壌生物)

    伊沢 剛, 鮫島 玲子, 板倉 学, 三井 久幸, 南沢 究

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(45)　61-61　1999/07/25

    Publisher: 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  82. DNA REARRANGEMENTS IN Bradyrhizobium japonicum FIELD ISOLATES AND HORIZONTAL GENE TRANSFER OF SYMBIOTIC GENES.

    ISAWA Tsuyoshi, SAMESHIMA Reiko, ITAKURA Manabu, MITSUI Hisayuki, MINAMISAWA Kiwamu

    40　s133-s133　1999/03

    ISSN： 0032-0781

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Books and Other Publications 2

  1. Soil Biochemistry (vol. 10)

    Minamisawa K, Mitsui H

    Marcel Dekker, New York　2000/06

  2. 新・土の微生物（3）遺伝子と土壌微生物

    三井久幸

    博友社　1998/10/30

Presentations 97

  1. ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化

    池田 成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

    第25回日本微生物生態学会　2009/11/21

  2. 超純水中におけるBradyrhizobium属細菌の生存と適応

    菅原千晶, 増田幸子, 板倉学, 川原田泰之, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    第25回日本微生物生態学会　2009/11/21

  3. 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養

    増田 幸子, 江田志磨, 三井久幸, 池田成志, 南澤究

    第25回日本微生物生態学会　2009/11/21

  4. Signature-tagged mutagenesisに基づくミヤコグサ根粒菌の共生および競合に関与する遺伝子の網羅的探索養

    包日吉金閙干朝魯, 下田宜司, 田畑哲之, 佐藤修正, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    第25回日本微生物生態学会　2009/11/21

  5. 変異型dnaQプラスミドによる高N2O還元酵素活性を示すダイズ根粒菌変異株の取得

    板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

    日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14

  6. 低濃度チオ硫酸を電子供与体としたダイズ根粒菌の化学独立栄養生育

    増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14

  7. 非培養法によるダイズ共生微生物の群集構造に対する根粒共生系及び窒素施肥の影響評価

    池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14

  8. ダイズ老化根粒におけるN2O発生メカニズムの解明：根粒菌脱窒と硝化過程の関与

    稲葉尚子, 菊池真和, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌肥料学会2009年度京都大会　2009/09/14

  9. ダイズの根粒着生変異と窒素施肥に応答したアルファ・ガンマプロテオバクテリアの群集構造変化

    池田成志, 大久保卓, 金子貴一, 稲葉尚子, 前川富也, 江田志磨, 佐藤修正, 田畑哲之, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第19回研究交流会　2009/09/08

  10. ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較

    津久井隆裕, 金子貴一, 板倉 学, 山田 学, 佐藤修正, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    植物微生物研究会第19回研究交流会　2009/09/08

  11. エンドファイトAzospirillum sp. B510 株接種がイネ幼苗の生育・形態・遺伝子発現 に及ぼす影響

    樅山歩美, 江田志磨, 安田美智子, 仲下英雄, 佐藤雅志, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第19回研究交流会　2009/09/08

  12. Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成と競合能に関わる遺伝子の探索

    古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    日本土壌微生物学会2009年度大会　2009/06/12

  13. 変異型dnaQプラスミドを用いたBradyrhizobium japonicum高N2O還元酵素活性変異株の取得

    板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

    日本農芸化学会2009年度大会　2009/03/27

  14. 根粒菌の環状グルカンに存在する酸性置換基が共生窒素固定に果たす役割

    川原田泰之, 清田洋正, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本農芸化学会2009年度大会　2009/03/27

  15. 植物生息微生物の群集構造に対する根粒共生系の影響

    南澤 究, 池田成志, 大久保卓, 金子貴一, ynn Ester E. Rallos, 江田志摩, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之

    第３回ゲノム微生物学会　2009/03/05

  16. Bacterial cell enrichment represents higher diversity of culturable and unculturable communities associated with soybean stems International-presentation

    Seishi Ikeda, Takakazu Kaneko, Takashi Okubo, Lynn Esther E. Rallos, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Kiwamu Minamisawa

    Plant and Animal Genome XVII Conference　2009/01/10

  17. 細胞濃縮法を用いたダイズ茎関連細菌の群集構造解析

    大久保卓, 池田成志, 金子貴一, Lynn Esther E. Rallos, 江田志磨, 三井久幸, 佐藤修正, 中村保一, 田畑哲之, 南澤究

    日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25

  18. Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum: A functional genomic approach for geobiochemistry.

    増田幸子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25

  19. ダイズ根粒菌変異型dnaQプラスミドを用いた高N2O還元酵素活性変異株の取得

    板倉学, 田畑和文, 江田志磨, 三井久幸, 村上紀里子, 安田淳一, 南澤究

    日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25

  20. 異なる根粒形成表現型ダイズにおける微生物多様性解析

    池田成志, Lynn Rallos, 大久保卓, 江田志磨, 稲葉尚子, 三井久幸, 南澤究

    日本微生物生態学会第24回大会　2008/11/25

  21. Identification of sox gene cluster responsible for thiosulfate oxidation in Bradyrhizobium japonicum: A functional genomic approach for geobiochemistry International-presentation

    Sachiko Masuda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    7th International Symposium for Subsurface Microbiology　2008/11/16

  22. 菌体外多糖合成におけるアルファルファ根粒菌外膜蛋白質TolCの機能解析

    森有季子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17

  23. Signature-tagged mutagenesisによるダイズ根粒菌の根粒形成に関わる因子の探索

    古川啓介, 大久保卓, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17

  24. Signature-tagged Mutagenesisによるミヤコグサ根粒菌の競合的根粒形成能の解析

    包日吉金閙干朝魯, 下田宜司, 三井久幸, 江田志磨, 田畑哲之, 佐藤修正, 南澤究

    植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17

  25. ミヤコグサに内生するバクテリアエンドファイトの解析

    川原田泰之, 板倉学, 金子貴一, 江田志磨, 三井久幸, 田畑哲之, 南澤究

    植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17

  26. 異なる根粒形成表現型ダイズにおける細菌エンドファイトの多様性解析

    大久保卓, 池田成志, 佐藤修正, 金子貴一, 田畑哲之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第18回研究交流会　2008/09/17

  27. Ethylene-mediated interactions between plants and bacteria: Rhizobitoxine production and ACC deaminase. International-presentation

    Minamisawa, K, M. Sugawara, S. Okazaki, N. Nukui, H. Ezura, S. Eda, H. Mitsui

    11th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes　2008/08/30

  28. Genomic comparison of Bradyrhizobium japonicum strains with different symbiotic N2-fixing capabilities: A QTL approach for N2-fixing efficiency in rhizobia. International-presentation

    Itakura, M, K. Saeki, H. Omori, T. Yokoyama, T. Kaneko, S. Tabata, T. Ohwada, S. Tajima, T. Uchiumi, K. Honnma, K. Fujita, H. Iwata, Y. Saeki, Y. Hara, S. Ikeda, S. Eda, H. Mitsui, K. Minamisawa

    11th International Symposium on Nitrogen Fixation with Non-Legumes　2008/08/30

  29. ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける環状グルカンの構造決定とその構造変化が及ぼす共生過程への影響

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会　2007/12/11

  30. ミヤコグサ細菌エンドファイトの分離

    川原田泰之, 板倉学, 金子貴一, 江田志磨, 三井久幸, 田畑哲之, 南澤究

    植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19

  31. ミヤコグサ根粒菌におけるグルカン修飾基転移酵素遺伝子の同定と共生過程での役割

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19

  32. リゾビトキシン生産Agrobacterium tumefaciensを用いた植物の形質転換

    原槙良太, 菅原雅之, 野中聡子, 江面 浩, 江田志麿, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19

  33. STM(signature-tagged mutagenesis)法によるダイズ根粒菌の競合的根粒形成を決定してしている遺伝子の探索

    大久保卓, 三井久幸, 江田志麿, 南澤究

    植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19

  34. 根粒形成過程におけるアルファルファ根粒菌TolC蛋白質の役割

    森有季子, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第17回研究交流会　2007/09/19

  35. 根粒菌 Mesorhizobium loti の環状グルカンの細胞含有量に影響を与える cep 遺伝子は、宿主ミヤコグサへの感染に必須の役割を有する

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    第23回日本微生物生態学会　2007/09/15

  36. Community structures of endophytes in soybeans with different nodulation genotypes

    Lynn Esther E. Rallos, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    第23回日本微生物生態学会　2007/09/15

  37. Analysis of metabolic features of naturally-occurring aromatic compounds in Bradyrhizobium japonicum based on array and gene disruption

    Nirinya Sudtachat, Naofumi Ito, Shima Eda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa

    第23回日本微生物生態学会　2007/09/15

  38. ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumにおけるN2O還元酵素高発現株の作成

    植竹佑輔, 千葉芳里, 平山潤太, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    第23回日本微生物生態学会　2007/09/15

  39. ダイズ根粒根圏のN2O発生に関わる微生物の解明

    菊池真和, 田邉謙二, 池田成志, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    第23回日本微生物生態学会　2007/09/15

  40. Ethylene-mediated interactions between plants and bacteria by rhizobitoxine and 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase International-presentation

    Kiwamu Minamisawa, Masayuki Sugawara, Shin Okazaki, Noriyuki Nukui, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, Shima Eda

    International Conference Rhizosphere-2　2007/08/26

  41. 野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

    南澤 究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部 匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉 学, 田畑哲之

    日本土壌肥料学会2007年度大会　2007/08/22

  42. 野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

    南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部 匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉 学, 田畑哲之

    日本土壌微生物学会2007年度大会　2007/06/07

  43. アルファルファ根粒菌の２つのRpoHが熱ショック応答に果たす役割

    三井久幸, 南澤究

    日本農芸化学会2007年度大会　2007/03/24

  44. ミヤコグサ根粒菌の新規共生必須遺伝しsagは環状グルカンにおける酸性修飾基の付加に関与する

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本農芸化学会2007年度大会　2007/03/24

  45. 野生イネ、栽培イネに内生する細菌エンドファイトのゲノム解析

    南澤究, 金子貴一, 中村保一, 渡辺安希子, 佐藤雅志, 阿部 匡, 江田志磨, 三井久幸, 板倉学, 田畑哲之

    第１回日本ゲノム微生物学会　2007/03/01

  46. ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiのペリプラズムグルカン合成に関与する遺伝子の同定と宿主植物との共生能における役割

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    第１回日本ゲノム微生物学会　2007/03/01

  47. ダイズ根粒菌超反復配列保有株(HRS)株と通常株(non-HRS)株のゲノム構造比較

    板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    第１回日本ゲノム微生物学会　2007/03/01

  48. 土壌抽出基質と硝酸呼吸条件下におけるダイズ根粒菌の増殖・生残遺伝子のSTMによる探索

    上松瀬裕子, 板倉学, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本微生物生態学会第22回大会　2006/10/27

  49. ダイズ根粒菌超反復配列保有（HRS）株と通常（non-HRS）株のゲノム構造比較

    板倉学, 伊沢剛, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    日本微生物生態学会第22回大会　2006/10/27

  50. ミヤコグサ根粒菌の新規共生必須遺伝子は、酸性サイクリックグルカンの合成に関与する

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20

  51. リゾビトキシン生産アグロバクテリウムの構築と遺伝子導入への影響

    菅原雅之, 原槙良太, 野中聡子, 江面浩, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20

  52. 芳香族化合物を基質としたダイズ根粒菌培養細胞の網羅的遺伝子発現解析芳香族化合物を基質としたダイズ根粒菌培養細胞の網羅的遺伝子発現解析

    伊藤尚文, 板倉 学, 江田志磨, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂之, 内海俊樹, 三井久幸, 政井英司, 津田雅孝, 南澤究

    植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20

  53. ダイズ根粒菌株の可変ゲノム領域と共生窒素固定能の相関解析

    板倉 学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山 正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢治, 田島茂之, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 江田志摩, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第16回研究交流会　2006/09/20

  54. ダイズ根粒菌のゲノムの構造比較と共生窒素固定能

    板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 藤田耕之助, 本間佳奈, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌肥料学会2006年度大会　2006/09/05

  55. GENOMIC MICROEVOLUTION AND METABOLIC VERSATILITY OF BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM AND CLOSE RELATIVES IN BRADYRHIZOBIACEAE International-presentation

    K MINAMISAWA, M ITAKURA, S EDA, K SAEKI, H OOMORI, T YOKOYAMA, T KANEKO, S TABATA, T OOWADA, S TAJIMA, T UCHIUMI, H MITSUI, R SAMESHIMA-SAITO

    11th International Symposium on Microbial Ecology　2006/08/20

  56. A novel symbiotic gene is required for the synthesis of anionic cyclic beta-glucans in Mesorhizboum loti International-presentation

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本学術振興会欧米・大洋州諸国との共同研究・セミナー（持続的農業のための植物微生物共生ゲノムサイエンス）　2006/08/15

  57. ミヤコグサ根粒菌 Mesorhizobium loti における新規共生能欠損変異株の解析

    川原田泰之, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10

  58. Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる根粒形成、非根粒形成Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム比較

    板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10

  59. 全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumの芳香族化合物分解系およびエネルギー獲得系の解析

    伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    日本土壌微生物学会2006年度大会　2006/06/10

  60. ダイズ根粒菌マクロアレイによる芳香属化合物分解系の解析

    伊藤尚文, 江田志磨, 三井久幸, 南澤究

    土壌微生物学会サテライトミーティング「植物根圏の微生物・微小動物の機能と相互作用」　2006/06/09

  61. Genome Plasticity of Symbiotic and Non-symbiotic members of Bradyrhzobiaceae: Dynamics of Symbiosis Island International-presentation

    Kiwamu Minamisawa, Manabu Itakura, Shima Eda, Kazuhiko Saeki, Hirofumi Oomori, Tadashi Yokoyama, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Takuji Oowada, Shigeyuki Tajima, Toshiki Uchiumi, Hisayuki Mitsui, Reiko Sameshima

    International Symposium on the Comparative Biology of the Alphaproteobacteria　2006/04/26

  62. ダイズ根粒菌のゲノム比較と環境中の機能ゲノミクス

    南澤 究, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 伊藤尚文, 増田幸子, 原圭乃, 江田志磨, 板倉学

    第８回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンテイア」　2006/03/03

  63. 全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌の芳香族化合物分解系およびチオ硫酸酸化系の解析

    伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 江田志磨, 南澤究

    第８回ワークショップ「微生物ゲノム研究のフロンテイア」　2006/03/03

  64. STM法の構築によるミヤコグサ根粒菌の炭素源飢餓応答に関連する遺伝子の探索

    柏原大介, 板倉学, 三井久幸, 南澤究

    微生物生態学会第21回大会　2005/10/30

  65. Bradyrhizobium japonicum DNAマクロアレイによる共生、非共生Bradyrhizobiaceae科細菌のゲノム可塑性

    板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10

  66. リゾビトキシン前駆物質としてのグルタミンの役割

    菅原雅之, 三井久幸, 江面浩, 南澤究

    植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10

  67. ミヤコグサ根粒菌におけるリン酸トランスポーターの解析

    川原田泰之, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10

  68. HerbaspirillumエンドファイトのnifH発現の光誘導性

    西口友広, 游牧, 斉藤朝美, 伊沢剛, 三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10

  69. 根粒菌のRNAポリメラーゼシグマ因子の発現調節

    三井久幸, 南澤究

    植物微生物研究会第15回研究交流会　2005/09/10

  70. Bradyrhizobiaceae科細菌における共生アイランドとゲノムの可塑性

    板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    第７回日本進化学会大会　2005/08/26

  71. 全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析

    伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

    日本土壌微生物学会2005年度大会　2005/06/11

  72. 根粒菌の環境ストレス耐性と共生能の両方に重要な転写因子RpoH1の機能解析

    三井久幸, 南澤究

    日本土壌微生物学会2005年度大会　2005/06/11

  73. マメ科植物との共生成立における根粒菌シグマ因子RpoH1のレギュロンの機能

    南澤究

    日本農芸化学会2005年度大会　2005/03/28

  74. ミヤコグサ根粒菌の共生成立過程でのリン酸トランスポーター遺伝子pstSの役割

    川原田泰之, 南澤究

    日本農芸化学会2005年度大会　2005/03/28

  75. Bradyrhizobium属細菌ゲノムにおける共生窒素固定と光合成

    板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 鮫島玲子, 三井久幸, 南澤究

    特定領域研究「統合ゲノム」主催第7回ワークショップ 「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2005/03/05

  76. 全ゲノム塩基配列情報に基づくダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicumのエネルギー獲得系および芳香族化合物分解系の解析

    伊藤尚文, 増田幸子, 三井久幸, 南澤究

    特定領域研究「統合ゲノム」主催第7回ワークショップ 「微生物ゲノム研究のフロンティア」　2005/03/05

  77. 根粒菌のマメ科植物との共生成立に必須な転写因子の解析

    南澤究

    第20回日本微生物生態学会　2004/11/21

  78. ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索-リン酸トランスポーター遺伝子の解析

    川原田泰之, 南澤究

    第20回日本微生物生態学会　2004/11/21

  79. 炭素源飢餓条件下で高発現するミヤコグサ根粒菌遺伝子破壊株の増殖特性

    柏原大介, 板倉学, 南澤究

    第20回日本微生物生態学会　2004/11/21

  80. マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析

    原圭乃, 板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 金子貴一, 田畑哲之, 大和田琢二, 田島茂行, 内海俊樹, 南澤究

    第20回日本微生物生態学会　2004/11/21

  81. 根粒菌の遺伝子発現制御と細胞内共生過程

    南澤究

    植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06

  82. ミヤコグサ根粒菌の共生必須遺伝子の探索―リン酸トランスポーター遺伝子の解析

    川原田泰之, 南澤究

    植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06

  83. マクロアレイによるダイズ根粒菌バクテロイドの網羅的遺伝子発現解析

    原圭乃, 板倉学, 佐伯和彦, 大森博文, 横山正, 内海俊樹, 大和田琢二, 金子貴一, 田畑哲之, 田島茂行, 南澤究

    植物微生物研究会第14回研究交流会　2004/09/06

  84. Rhizobia selected leguminous plant cells for their habitat during earth's history International-presentation

    Minamisawa K

    16th International Symposium on Environmental Biogeochemistry　2003/09/01

  85. 共生・微好気・炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

    大和田琢二, 南澤 究, 板倉学, 貫井憲之, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 前川隆紀, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司, 塩屋幸樹

    日本土壌肥料学会　2003/08/20

  86. 根粒菌の細胞内共生・窒素固定にはたらく制御因子

    日本分子生物学会第25回年会　2002/12/11

  87. 根粒菌の細胞内CtrAレベルの変化と共生能

    伊藤尚文, 齋藤明広, 南澤 究

    日本分子生物学会第25回年会　2002/12/11

  88. 根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoHの機能

    佐藤善克, 南澤 究

    日本分子生物学会第25回年会　2002/12/11

  89. 根粒菌の共生窒素固定能とシグマ因子RpoH

    佐藤善克, 南澤 究

    第18回日本微生物生態学会　2002/11/15

  90. ダイズ根粒菌リゾビトキシン生合成遺伝子の機能

    南澤究, 岡崎伸, 菅原雅之

    第18回日本微生物生態学会　2002/11/15

  91. 炭素飢餓条件下におけるミヤコグサ根粒菌の網羅的な遺伝子発現解析

    板倉学, 大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 金子貴一, 田畑哲之, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 鈴木章弘, 下田宜司, 内海俊樹

    第18回日本微生物生態学会　2002/11/15

  92. 根粒菌のシグマ因子RpoHの機能

    佐藤善克, 南澤究

    植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11

  93. ミヤコグサ根粒菌 の共生および飢餓条件下における網羅的遺伝子発現解析

    大和田琢二, 南澤究, 板倉学, 貫井憲之, プラモッド・ダワデイ, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

    植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11

  94. Bradyrhizobium elkanii のリゾビトキシン生合成遺伝子rtxAの機能と制御

    菅原雅之, 岡崎伸, 南澤究

    植物微生物研究会第12回研究交流会　2002/10/11

  95. 全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

    大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

    日本土壌肥料学会　2002/04/02

  96. 根粒菌の共生窒素固定に必須なシグマ因子RpoH

    伊藤尚文, 南澤 究

    日本農芸化学会2002年度大会　2002/03/24

  97. 全ゲノム塩基配列情報に基づくミヤコグサ根粒菌の網羅的遺伝子発現解析

    大和田琢二, 折笠善丈, 南澤究, 板倉学, 田畑哲之, 金子貴一, 横山正, 手島光平, 佐伯和彦, 大森博文, 室岡義勝, 林誠, 田島茂行, 野村美加, 下村憲司朗, 阿部美紀子, 内海俊樹, 鈴木章弘, 下田宜司

    日本農芸化学会2002年度大会　2002/03/24

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Research Projects 13

  1. アルファプロテオバクテリアの遺伝学 Competitive

    System: Ordinary Research

    2016/04 - Present

  2. Studies on the transcriptional regulation of gene expression during rhizobial life history Competitive

    2002/04 - Present

  3. Studies on the endosymbiosis of rhizobia with leguminous plants Competitive

    2000/04 - Present

  4. Studies on the symbiotic nitrogen fixation between rhizobia and legumes Competitive

    1998/04 - Present

  5. Co-evolution between bradyrhizobia and plants: Experimental evolution of rhizobia and endophytes

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Institution: Tohoku University

    2018/04/01 - 2022/03/31

  6. Characterization of RpoH1 and its regulated genes involved in iron-sulfur protein metabolism and effective symbiosis in Sinorhizobium meliloti

    Mitsui Hisayuki

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Institution: Tohoku University

    2016/04/01 - 2019/03/31

    More details Close

    This study showed that the heat shock sigma factor RpoH1-regulated gene, sufT, balances iron limitation in the cell to maintain iron-sulfur protein levels and to establish effective symbiosis in Sinorhizobium meliloti. The paradox that iron-sulfur proteins should be synthesized under iron limitation in the cells is universal to all living organisms. This study demonstrates that the regulatory circuit involving RpoH1 and SufT underlies this paradox, leading to understanding the mechanisms for adaptation of alpha-proteobacteria to diverse conditions on the earth.

  7. Functional analysis of rhizobial cells responsible for symbiotic nitrogen fixation with leguminous plants

    MITSUI Hisayuki

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Institution: Tohoku University

    2010/04/01 - 2015/03/31

    More details Close

    Sinorhizobium meliloti is a root-nodule bacterium that establishes symbiosis with leguminous plants and performs nitrogen fixation. In this study, we analyzed the regulon of its sigma factor RpoH1, which is essential for heat shock response and effective symtiosis, and identified a member of the regulon, SMc00302 (designated later as sufT) to have an essential role in symbiosis. Functional analysis of this gene showed that SufT homologs are distributed widely over prokaryotes and eukaryotes and the rhizobial SufT operates to enhance the iron-sulfur cluster biogenesis in the cell under iron-limiting conditions.

  8. Studies on the symbiotic function of anionic substituents of periplasmic cyclic glucans in rhizobia

    MITSUI Hisayuki

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Institution: Tohoku University

    2007 - 2008

  9. Research for novel symbiotic genes using RNA polymerase sigma factor rpoH mutants of rhizobia.

    MITSUI Hisayuki

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Institution: Tohoku University

    2003 - 2004

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    Sinorhizobium meliloti is a root-nodulating nitrogen-fixing bacterium. An S.meliloti strain that is mutant for the rpoH_1 gene, which encodes a σ^<32>-like protein, elicits the formation of ineffective nodules on the host plant alfalfa. We characterized the rpoH_1 mutant for phenotypes related to symbiosis. Alfalfa nodules formed by the rpoH_1 mutant exhibited greatly reduced levels of acetylene reduction activity compared to the wild-type nodules. Whereas intracellular colonization by rhizobia was observed in a zone just below the apical meristem, we found ultrastructural abnormality and signs of degeneration of bacteroids within many host cells in the proximally adjacent zone. In the proximal part of the nodule, only a few nodule cells contained bacteroids. In contrast, the rpoH_1 mutant showed normal induction of nitrogen fixation gene expression in microaerobic culture. These results suggest that the rpoH_1 mutation causes early senescence of bacteroids during the endosymbiotic process, but does not affect the invasion process or the synthesis of the nitrogenase machinery. The rpoH_1 mutant exhibited increased sensitivity to various agents and to acid pH, suggesting that RpoH_1 is required to protect the bacterial cell against environmental stresses encountered within the host. Since RpoH_1 was previously reported to be required for the synthesis of some heat shock proteins (Hsps), we examined the transcription of several genes for Hsp homologs. We found that transcription of groESL_5, lon, and clpB after heat shock was RrpoH_1-dependent, and conserved nucleotide sequences were found in the -35 and -10 regions upstream of the transcription start sites of these genes. Although groESL_5 expression is almost completely dependent on RpoH_1, we found that a groESL_5 mutant strain is still capable of normal symbiotic nitrogen fixation on alfalfa.

  10. 根粒菌RpoH(熱ショックシグマ因子ホモログ)の共生窒素固定における役割

    三井 久幸

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 若手研究(B)

    Institution: 東北大学

    2001 - 2002

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    マメ科植物における根粒菌の細胞内共生の分子機構解明に向けて、アルファルファ根粒菌S. melilotiの共生必須な新規RNAポリメラーゼ・シグマ因子であるRpoH_1の解析を通じて、新規共生遺伝子の探索を試みた。 主要な窒素固定遺伝子nifH、fixN、nifAについて、lacZとの融合遺伝子をそれぞれ作成し発現パターンを解析したところ、rpoH_1変異株でも野生株と同様の微好気条件に伴う発現誘導が観察された。すなわち、RpoH_1の制御下の共生必須遺伝子は、既知の窒素固定遺伝子とは別ものである可能性が高いと判断した。 一方,前年度に示した、60-100kDaの数種類のHsp合成の熱ショック誘導へのRpoH_1の関与に基づき、ゲノム上に見出される9個のHspホモログの転写パターンを解析した。その結果、groESL_5、lon、clpBの3遺伝子において、RpoH_1依存・熱ショック誘導の転写を見出し、更にそのプロモーターコンセンサスを推定することができた。しかし、lonとclpBについては、その転写全体に占めるRpoH_1依存度が小さいこと、groESL_5とclpBの遺伝子破壊株は正常な共生能を示したこと等から、この3つはいずれもrpoH_1変異株のFixの原因遺伝子ではないと判断した。S. melilotiゲノム中に存在する、その他Hspホモログについて、上記プロモーターコンセンサス類似の配列を検索したが、見つかってこなかった。 そこで、次にS. meliloti全DNAの3-4kb制限酵素部分消化物をもとに、発現プラスミドベクターを用いて作成したゲノムライブラリーをrpoH_1変異株に導入し、得られた形質転換体をアルファルファに接種することにより、Fix^+株のスクリーニングを試みた。現在までに約50,000個の形質転換体を調べたが、Fix^+は得られなかった。

  11. Genome rearrangements of indigenous soybean bradyrhizobia and their ecological significance

    MINAMISAWA Kiwamu, TSUDA Masataka, MITSUI Hisayuki

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    Institution: Tohoku University

    1998 - 2001

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    In order to understand the generation and ecological roles of Bradyrhizobium japonicum HRS strains possessing high copy numbers of insertion sequences (IS), we have investigated (1) geographical and phylogenetic distributions of HRS strains, (2) their excellent features in field ecosystem, (3) their genome rearrangements, and (4) horizontal transfer of nodulation (nod) gene from HRS strains. We found a correlation among the IS copy number, phylogenetic position, serogroup and growth rate of HRS strains, which are derived from USA, China and Japan. Nodule occupancy of HRS strains increased in a water-logged soil condition. Moreover, HRS strains showed stress resistance. The nif gene cluster of HRS strain were subjected to DNA rearrangement probably by IS elements. We have observed horizontal transfer of nod genes from B. japonicum HRS strain to B. elkanii USDA94 mutant lacking common nod genes as a recipient. In this project, we could show the ecological and genetic features of B. japonicum HRS strains.

  12. 植物との細胞内共生を含む根粒菌の複雑な生活史の分子基盤の探索

    三井 久幸

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 奨励研究(A)

    Institution: 東北大学

    1999 - 2000

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    アルファルファ根粒菌S.melilotiはシグマ因子σ^<32>ホモログをコードする遺伝子を二つ(rpoH_1、rpoH_2)有している。共生に関し、S.melilotiのrpoH_1変異株はNod^+Fix^-、rpoH_2変異株はNod^+Fix^+、rpoH_1rpoH_2二重変異株はNod^-Fix^-となる。このシグマ因子によって転写される遺伝子を探すために以下の実験を行った。各変異株、野生株の液体培養の温度を急上昇させ、その後の細胞内タンパク質合成パターンの変化を追跡した。その結果Hspは1)合成が特に顕著に誘導され、かつrpoHの機能に部分的に依存しているもの 2)合成速度は温度上昇後10分で最大になり、かつrpoHに依存 3)合成は30分で最大、rpoHに依存しないの3グループに類別された。グループ1はウェスタン解析により多重groEL遺伝子の産物、グループ2はA.tumefaciensの知見を参考にClpBとDnaK、とそれぞれ推定した。更に、熱ショック処理の前後や培養細胞・バクテロイド間において、5つのgroE、2つのclpB、及びdnaK各々のmRNA量の変化と転写へのRpoHの関与の有無を調べた。その結果、5つのgroEのうち少なくとも2つのmRNAが熱ショックにより増加し、一方はrpoH_1の機能に依存、他方はrpoH_1、rpoH_2に無関係であることを明らかにした。次に、RpoH_1、RpoH_2各々に対する抗血清を用いて、熱ショック処理や単生・共生の違いに伴う各タンパク質の細胞内濃度の変化を測定した。その結果、RpoH_1タンパク質の細胞内濃度は、熱ショック処理の前後や単生・共生の違いにかかわらず一定の高いレベルを示していた。RpoH_1の高い活性が必要でない細胞内では、RpoH_1分子の大半に転写過程への参加を妨げるような制御が働いていると考えられる。

  13. 植物および微生物の強磁場に対する反応の解析

    本河 光博, 三井 久幸, 高橋 秀幸, 茂木 巖

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 萌芽的研究

    Institution: 東北大学

    1996 - 1997

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    本研究では,植物および微生物の成長・増殖に対する強磁場の影響を検討した.まず,植物の成長に対する強磁場の影響を検討するために,シロイヌナズナの発芽と芽ばえの成長に対する強磁場(4T;テスラ)の影響を調べた結果,強磁場処理区の発芽率は,対照区に比較して高くなることがわかった.また,強磁場処理区の植物体では,胚軸および根の長さが長くなる現象が観察された.そこで,さらに強い磁場が植物の成長に対する影響を解析するために,5日齢のシロイヌナズナを用いて,根の伸長に対する20Tの強磁場と磁場勾配の作用を解析した.その結果,シロイヌナズナの根の伸長は,20Tの強磁場によっても有意に促進されるが,それに対する磁場勾配の顕著な影響はみとめられないことが明らかになった.このとき,根の重力屈性の発現も強磁場によって促進されることがわかった. 一方,強磁場が微生物の増殖と微生物細胞の形態に及ぼす影響を調べた結果,試験した微生物(大腸菌,枯草菌,酵母,根粒菌)に関して,増殖速度,Viability,細胞の形状,いずれにおいても強磁場の影響は全くみとめられなかった.試験微生物種のうち,大腸菌と根粒菌はグラム陰性細菌,枯草菌はグラム陽性細菌,酵母は真核生物である.このような多様な微生物で同様な結果が得られたことから,4T程度の磁場が微生物の増殖には影響を与えないことには一般性があるものと考えられた. このように,本研究では強磁場(4T,20T)が植物の伸長成長に対して促進的に作用することが明らかになった.また4Tの強磁場は微生物の成長に対して,少なくても顕著な阻害作用を示すことはなかった.これは用いた磁場強度からすると驚くべき生物反応であり,今後のストレス生理学上,大変貴重な発見である.

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Social Activities 1

  1. 日英サイエンスワークショップ

    2016/08/02 - 2016/08/06

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    日英6名の高校生を受け入れ、実習の指導を行った。

Other 4

  1. 根粒菌の共生必須シグマ因子を用いた熱ショック遺伝子の試験管内転写解析

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    根粒菌の共生必須シグマ因子を用いた熱ショック遺伝子の試験管内転写解析を行う

  2. 細胞内共生成立に働く根粒菌特異的な遺伝子システムの解明

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    マメ科植物－根粒菌間相互作用を基盤とした新たな有用共生系開発のためには、根粒菌側の共生成立にかかわる遺伝情報の全体像を把握することが肝要である。この点に鑑み、本研究は、知見の乏しい細胞内共生（特にバクテロイド分化）過程に関する根粒菌側の分子機構を解明することを最終目標とする。第I期では、窒素固定や呼吸・エネルギー代謝等に直接関与するものとは別に、細胞内共生特異的に重要なものとして、RpoH（シグマ因子）レギュロン、CtrAを含むHis-Aspリン酸リレー系、といった複数の独立した制御経路がアルファルファ根粒菌S. melilotiで機能していることを示唆する結果を得た。第II期では、前述の遺伝子の詳細な機能解析に加え、更にバクテロイド分化に直接かかわる新規変異株を取得・解析することを通じて、同定される種々の共生必須遺伝子群を細胞内共生過程に働く遺伝子システムとして理解することを第一の目標とする。また、根粒菌の多様性を考慮すると同時に、成果を密接に宿主植物側の研究に生かすことをねらい、モデル宿主植物ミヤコグサの共生菌M. lotiを研究対象に加えている。そこでは、宿主への感染過程や共生窒素固定に必須な代謝経路にかかわるM. loti変異株の取得・解析を通じて、ミヤコグサの系における根粒菌－宿主相互作用の特徴の一端を明らかにすることを目指す。

  3. 細胞内共生の成立を支える根粒菌遺伝子群の解析

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    マメ科植物－根粒菌間相互作用を基盤とした新たな有用共生系開発のためには、根粒菌側の共生成立にかかわる遺伝情報の全体像を把握することが肝要である。この点に鑑み、本研究は、知見の乏しい細胞内共生（特にバクテロイド分化）過程に関する根粒菌側の分子機構を解明することを最終目標とする。そのために、窒素固定や呼吸・エネルギー代謝等に直接関与するものとは別に、細胞内共生特異的に重要なものとして、RpoH（シグマ因子）レギュロン、CtrAを含むHis-Aspリン酸リレー系、といった複数の独立した制御経路がアルファルファ根粒菌S. melilotiで機能していることを示唆する結果を得た。RpoH1については、それによって発現される熱ショックタンパク質遺伝子を同定し、また、種々の環境因子に対する根粒菌の耐性に必須の役割を果たしていること、共生においては宿主細胞への侵入後に重要であることを見出した。一方、窒素固定そのものには関与しないことを見つけた。

  4. 比較プロテオーム解析に基づく根粒細菌の環境適応機構の解明

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    比較プロテオーム解析に基づいて根粒細菌の環境適応機構を解明する