TOHOKU UNIVERSITY Researchers

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Minoru Ikeda

Section

Graduate School of Agricultural Science

Job title

Professor

Degree

博士（農学）（東北大学）

researchmap

https://researchmap.jp/read0121298

J-GLOBAL ID

200901067841375063

Committee Memberships 13

宮城県女川原子力発電所環境保全監視協議会委員

2024/02 - Present
日本水産学会東北支部　支部幹事

2016/04 - Present
水産育種研究会　編集幹事

2003/04 - Present
宮城県女川原子力発電所環境調査測定技術会・評価委員

2013/04 - 2023/03
水産育種研究会　会計幹事

2015/04 - 2017/03
日本水産資源保護協会　平成28年度水産資源保護啓発研究活動推進委員

2017/01 - 2017/02
水産庁委託事業「クロマグロ親魚選抜技術開発」　外部評価委員

2011/06 - 2016/03
水産資源保護協会　平成25年度水産資源保護啓発研究活動推進委員

2013/12 - 2014/01
岩手県水産試験研究評価委員会　外部評価委員

2010/06 - 2012/05
先端技術を活用した農林水産研究高度化事業「アユ冷水病耐性形質のマーカー選抜育種技術の開発」　外部評価委員

2006/09 - 2010/03
日本水産学会東北支部　幹事

2006/04 - 2008/03
水産育種研究会　会計幹事

1999/04 - 2003/03
水産育種研究会シンポジウム「親子判別法の栽培漁業と水産育種への応用」　会計幹事

2016/11 -

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Professional Memberships 5

日本魚類学会

- Present
日本進化学会

- Present
日本生態学会

- Present
The Japanese Society of Fish Genetics and Breeding Science

- Present
The Japanese Society of Fisheries Science

Research Interests 4

DNAマーカー
conservation genetics
phylogeography
population structure

Research Areas 3

Life sciences / Biodiversity and systematics /
Environmental science/Agricultural science / Biological resource conservation /
Life sciences / Aquaculture /

Awards 13

日本水産学会東北支部長賞

2022/02　日本水産学会東北支部　核DNAのSTRとミトコンドリアDNAのCytb分析により再検討したハタハタの系群構造
日本水産学会東北支部長賞

2021/02　日本水産学会東北支部　東北地方太平洋沿岸域における両側回遊性スジエビ2系統の分布と混在河川の確認
日本水産学会東北支部長賞

2020/02　日本水産学会東北支部　形態とDNA分析により検討したヒメヌマエビにおける体表模様2型間の関係
日本水産学会東北支部長賞

2018/02　日本水産学会東北支部　ミトコンドリアDNA分析によって検討した日本列島沿岸におけるマコガレイの遺伝的グループ
日本水産学会東北支部長賞

2017/02　日本水産学会東北支部　マコガレイ集団におけるミトコンドリア DNA のハプロタイプ分類について
日本水産学会東北支部長賞

2015/02　日本水産学会東北支部　エゾイソアイナメ（Physiculus maximowiczi）とチゴダラ（P. japonicus）の分類学的再検討
The Best Published Paper in the Inland Fisheries Category of the Dr. Elvira O. Tan Memorial Awards for 2010

2010/07　The Philippine Council for Aquatic and Marine Research and Development of the Department of Science and Technology　優れた論文
日本水産学会東北支部長賞

2009/02　日本水産学会東北支部　DNA分析により検討した十和田湖のワカサギ個体群の起源
日本水産学会東北支部長賞

2009/02　日本水産学会東北支部　小河川に遡上したアユ年級群間における血縁度の比較
日本水産学会東北支部支部長賞

2006/02/02　日本水産学会東北支部
日本水産学会東北支部長賞

2005/02　日本水産学会東北支部　ミトコンドリアDNA分析により評価した利根川におけるハクレンの遺伝的多様性
農学研究科長賞

2004/01　東北大学大学院農学研究科
ベストポスター賞

2002/02　第２回栽培漁業国際シンポジウム事務局

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Papers 100

Genetic population structure and demographic history of the sailfin sandfish Arctoscopus japonicus associated with sea level changes during the Last Glacial Maximum Peer-reviewed

Hiroaki Kurihara, Minoru Ikeda

Marine Ecology Progress Series　747　133-149　2024/10

DOI： 10.3354/meps14701 　
Implication of homoplasy in hypervariable region (HVR) of mitochondrial DNA in a population of marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae: consideration for conducting population genetic analyses using the HVR Peer-reviewed

Yuki Yamamoto, Airi Takanashi, Yuji Yokosawa, Minoru Ikeda

Fisheries Science　2024/06

DOI： 10.1007/s12562-024-01792-z 　
Indel variation in the mitochondrial ND5 region supports monophyly of the tribe Hippoglossoidini (sensu Vinnikov et al. 2018) within the family Pleuronectidae Peer-reviewed

Hiroaki Kurihara, Shigeru M. Shirai, Kunihiro Fujiwara, Minoru Ikeda

Ichthyological Research　2024/05

DOI： 10.1007/s10228-024-00978-w 　
First record of Blackfin seabass Lateolabrax latus (Teleostei, Lateolabracidae) from Pacific Ocean side of Tohoku region, Japan and investigation of the distribution range based on the environmental DNA database Peer-reviewed

Aizawa, T, Ikeda, M

Aquatic Animals　AA2024-9　2024/04

DOI： 10.34394/aquaticanimals.2024.0_AA2024-9 　
Morphological and genetic diversity assessment of Freshwater Prawns (Macrobrachium spp.) in the Cairawan River, Antique Province, Panay Island, Philippines Peer-reviewed

Mary Nia M. Santos, Daisy Wowor, Minoru Ikeda, Philip Ian Padilla, Maria Rowena Romana-Eguia

The Philippine Journal of Fisheries　31　(1)　35-48　2024/01

DOI： 10.31398/tpjf/31.1.2023-0009 　
Morphological and genetic characteristics of Korean seahorse Hippocampus haema (Teleostei, Syngnathidae) collected from the Pacific Ocean side of Japanese Archipelago Peer-reviewed

Toshihiro Aizawa, Minoru Ikeda

Aquatic Animals　AA2023-5　2023/03

DOI： 10.34394/aquaticanimals.2023.0_AA2023-5 　
Screening of microsatellite DNA markers for population genetic analysis of sailfin sandfish Arctoscopus japonicus Peer-reviewed

Kurihara H, Ikeda M

Aquatic Animals　2022　(14)　2022/07

DOI： 10.34394/aquaticanimals.2022.0_AA2022-14 　
Distribution of Palaemon paucidens C type in Amami-Oshima and Kakeroma Islands with the data for the genetic characteristics and seawater requirement of the larvae Peer-reviewed

Masaki Takada, Minoru Ikeda

Aquatic Animals　2022　(2)　2022/02

DOI： 10.34394/aquaticanimals.2022.0_1 　
Genomic evidence for speciation with gene flow in broadcast spawning marine invertebrates. International-journal Peer-reviewed

Shotaro Hirase, Yo Y Yamasaki, Masashi Sekino, Masato Nishisako, Minoru Ikeda, Motoyuki Hara, Juha Merilä, Kiyoshi Kikuchi

Molecular Biology and Evolution　38　(11)　4683-4699　2021/07/26

DOI： 10.1093/molbev/msab194 　

More details Close

How early stages of speciation in free-spawning marine invertebrates proceeds is poorly understood. The Western Pacific abalones, Hatiois discus, H. madaka, and H. gigantea occur in sympatry with shared breeding season and are capable of producing viable F1 hybrids in spite of being ecologically differentiated. Population genomic analyses revealed that although the three species are genetically distinct, there is evidence for historical and ongoing gene flow among these species. Evidence from demographic modeling suggests that reproductive isolation among the three species started to build in allopatry and have proceeded with gene flow, possibly driven by ecological selection. We identified 27 differentiation islands between the closely related H. discus and H. madaka characterized by high F ST and dA, but not high d XY values, as well as high genetic diversity in one H. madaka population. These genomic signatures suggest differentiation driven by recent ecological divergent selection in presence of gene flow outside of the genomic islands of differentiation. The differentiation islands showed low polymorphism in H. gigantea, and both high FST, dXY, and dA values between H. discus and H. gigantea, as well as between H. madaka and H. gigantea. Collectively, the western Pacific abalones appear to occupy the early stages speciation continuum, and the differentiation islands associated with ecological divergence among the abalones do not appear to have acted as barrier loci to gene flow in the younger divergences but appear to do so in older divergences.
Comparative seascape genetics of co-distributed intertidal snails Monodonta spp. in the Japanese and Ryukyu archipelagoes Peer-reviewed

Yamazaki D., Miura S., Uchida M., Ikeda M., and Chiba S.

Marine Ecology Progress Series　657　135-146　2021/01/07
Publisher: Inter-Research Science Center
DOI： 10.3354/meps13553 　

ISSN： 0171-8630

eISSN： 1616-1599

More details Close

Recent molecular ecological studies have focused on how the relationships between physical and ecological factors influence marine biogeography. Comparative phylogeography using closely related species is a powerful approach to evaluate the role of ecological traits in the genetic variation of marine organisms. In the present study, we compared ecological traits and genetic variation in 3 species of the intertidal snail genus <italic>Monodonta</italic> that co-occur in the Japanese and Ryukyu archipelagoes. We found that <italic>M. labio</italic> was dominant in sheltered habitats and <italic>M. perplexa</italic> was dominant in wave-exposed habitats, while <italic>M. confusa</italic> showed no habitat specificity. This indicates that <italic>M. labio</italic> and <italic>M. perplexa</italic> are <italic />habitat specialists regarding wave exposure, while <italic>M. confusa </italic>is a generalist. <italic>M. labio</italic> and <italic>M. perplexa</italic> showed lower genetic diversity and greater genetic differentiation among populations than <italic>M. confusa</italic>. Our findings support the specialist-generalist variation hypothesis in a well-connected marine environment.
徳島県で見出された国内外来由来のオヤニラミ個体群と遺伝的撹乱の懸念 Peer-reviewed

山田裕貴, 氏部崇之, 清水孝昭, 佐藤陽一, 田代優秋, 佐藤仁泉, 池田実, 高木基裕

保全生態学的研究　25　(1)　9-23　2020/03
Genetic diversity in type B of Palaemon paucidens Peer-reviewed

Chow S, Yanagimoto T, Konishi K, Ichikawa T, Komatsu N, Maruyama T, Ikeda M, Nohara K, Onuki T, Imai T

Aquatic Animals　2019　(11)　2019/12
Genetic diversity in freshwater shrimp Palaemon pausidens Peer-reviewed

Chow S, Yanagimoto T, Maruyama T, Ikeda M, Matsutani N, Oonuki T, Imai T

Bulletin of the Biogeographical Society of Japan　73　1-16　2018/12
Genetic assessment of milkfish (Chanos chanos Forsskal) stocks based on novel short tandem repeats for marker-aided broodstock management Peer-reviewed

Maria Rowena R. Romana-Eguia, Brian S. Santos, Minoru Ikeda, Zubaida U. Basiao, Akihiro Kijima

Aquaculture Research　49　(4)　1557-1568　2018/04/01
Publisher: Blackwell Publishing Ltd
DOI： 10.1111/are.13610 　

ISSN： 1365-2109 1355-557X
Genetic diversity of the flathead flounder Hippoglossoides dubius population in Funka Bay inferred from mitochondrial DNA analysis Peer-reviewed

Yamamoto Y, Ikeda M, Nakaya M, Suzuki K, Takatsu T

Japanese Journal of Ichthyology　65　75-80　2018/04
A DNA marker to discriminate two types of freshwater shrimp Palaemon paucidens and the distribution of these two types in Japan Peer-reviewed

Chow S, Imai T, Ikeda M, Maki S, co-author

Nippon Suisan Gakkaishi　84　(4)　674-681　2018/04
Publisher: The Japanese Society of Fisheries Science
DOI： 10.2331/suisan.17-00082 　

ISSN： 0021-5392

More details Close

<p> Among the palaemonid shrimp species of the genus Palaemon known from Japan, Palaemon paucidens is the only species inhabiting freshwater areas. Two genetically distinct types (designated by A and B) were found by allozyme electrophoresis analysis three decades ago. We developed a simple multiplex-PCR assay to discriminate the two types based on 18S rDNA sequences. A total of 422 individuals collected at 152 localities in Japan were analyzed by the multiplex-PCR assay. No heterozygote was observed, indicating that these two types have been reproductively isolated. Both types were distributed throughout Japan; type A was observed in ponds, lakes and rivers, while type B was observed only in rivers.</p>
Genetic diversification of intertidal gastropoda in an archipelago: the effects of islands, oceanic currents, and ecology Peer-reviewed

Daishi Yamazaki, Osamu Miura, Minoru Ikeda, Akihiro Kijima, Do Van Tu, Tetsuro Sasaki, Satoshi Chiba

MARINE BIOLOGY　164　(9)　184　2017/09

DOI： 10.1007/s00227-017-3207-9 　

ISSN： 0025-3162

eISSN： 1432-1793
Development of a Multiplex PCR assay system for genetic diversity analysis of the Japanese flounder Paralichthys olivaceus Peer-reviewed

Ando M, Ikeda M, Sekino M, Sugaya T, Katamachi D, Yoseda K, Kijima A

Fish Genetics and Breeding Science　46　(2)　65-76　2017/03/24
Publisher:
ISSN： 1343-7917
The functionality and usage of the newly developed software supporting the massive parentage analysis in the evaluation of the effect of stock enhancement Peer-reviewed

Sugaya T, Saio M, Murakami S, Tokihiro K, Noguchi N, Katamachi D, Ikeda M, Obata Y

Fish Genetics and Breeding Science　46　(2)　87-91　2017/03/24
Publisher:
ISSN： 1343-7917
Evaluation for recent stck enhancement program of Japanese flounder Paralichthys olivaceus baced on relatedness analysis Peer-reviewed

Ikeda M, Ando D, Sugaya T, Katamachi D, Yoseda K, Fujii T, Obata Y

Fish Genetics and Breeding Science　46　(2)　99-104　2017/03/24
Publisher:
ISSN： 1343-7917
Genetic characteristics of hatchery-reared juveniles for stock enhancement program of tiger puffer Takifugu rubripes Peer-reviewed

Katamachi D, Ikeda M, Ando D, Sugaya T, Yoseda K, Fujii T, Obata Y

Fish Genetics and Breeding Science　46　(2)　105-110　2017/03/24
Publisher:
ISSN： 1343-7917
Stability of genetic diversity in an intertidal goby population after exposure to tsunami disturbance Peer-reviewed

Shotaro Hirase, Minoru Ikeda, Shun Hayasaka, Wataru Iwasaki, Akihiro Kijima

MARINE ECOLOGY-AN EVOLUTIONARY PERSPECTIVE　37　(5)　1161-1167　2016/10

DOI： 10.1111/maec.12377 　

ISSN： 0173-9565

eISSN： 1439-0485
II-6. Evaluation for genetic diversity of marine fisheries resources after the tsunami caused by the 2011 off the pacific coast of Tohoku Earthquake Peer-reviewed

Minoru Ikeda, Yuki Minegishi, Daiki Ando, Manami Kanno, Akihiro Kijima, Shotaro Hirase, Sei-Ichi Okumura, Shunduke Moriyama, Kenta Adachi, Masakado Kawata, Ayako Suda, Sakiko Orui, Kiyotaka Takishita, Katsunori Fujikura

Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition)　82　(2)　149　2016
Publisher: Nihon Suisan Gakkai
DOI： 10.2331/suisan.WA2247-15 　

ISSN： 1349-998X 0021-5392
Improvement of mitochondrial DNA haplotyping in Japanese flounder populations using the sequences of control region and ND2 gene Peer-reviewed

Daiki Ando, Minoru Ikeda, Masashi Sekino, Takuma Sugaya, Daisuke Katamachi, Kenzo Yoseda, Akihiro Kijima

NIPPON SUISAN GAKKAISHI　82　(5)　712-719　2016

DOI： 10.2331/suisan.16-00025 　

ISSN： 0021-5392

eISSN： 1349-998X
Hybrid population of highly divergent groups of the intertidal goby Chaenogobius annularis Peer-reviewed

Shotaro Hirase, Minoru Ikeda

JOURNAL OF EXPERIMENTAL MARINE BIOLOGY AND ECOLOGY　473　121-128　2015/12

DOI： 10.1016/j.jembe.2015.08.010 　

ISSN： 0022-0981

eISSN： 1879-1697
Novel microsatellite marker development from the unassembled genome sequence data of the marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae Peer-reviewed

Yuki Minegishi, Minoru Ikeda, Akihiro Kijima

MARINE GENOMICS　24　357-361　2015/12

DOI： 10.1016/j.margen.2015.09.002 　

ISSN： 1874-7787

eISSN： 1876-7478
宮城県に侵入した淡水エビ：カワリヌマエビ属Neocaridina spp.の分布拡大とヌカエビParatya compressa improvisaへの影響 Peer-reviewed

Hasegawa M, Ikeda M, Fujimoto Y

Distribution of the exotic freshwater shrimp Neocaridina spp. in Miyagi Prefecture and influence on the habitat of native shrimp Paratya compressa improvisa　9　47-56　2015/09/01
Publisher: The Miyagi Prefectural Izunuma-Uchinuma Environmental Foundation
DOI： 10.20745/izu.9.0_47 　

More details Close

<p>Distribution of exotic freshwater shrimp Neocaridina spp. and native species Paratya compressa improvisa were investigated in rivers, drains, and ponds in northern Miyagi Prefecture. Neocaridina spp. and P. c. improvisa was distributed in 57.0% and 38.6% of sampling sites in rivers or drains, respectively, and then, the number of captured P. c. improvisa per sampling site was less than half of the number of Neocaridina spp.. In the investigation of the ponds, Neocaridina spp. and P. c. improvisa were distributed 11 and 36 sites, respectively. To evaluate competition between the two species, we analyzed distribution patterns of them using generalized linear mixed model. The models indicated that introduction of Neocaridina spp. is caused negative effects on P. c. improvisa in river and pond environment. These results suggest that expansion of Neocaridina spp. and reduction of P. c. improvisa will be going to continue in Miyagi Prefecture.</p>
Genomic Resources Notes accepted 1 February 2015-31 March 2015 Peer-reviewed

Wolfgang Arthofer, Laura Bertini, Carla Caruso, Francesco Cicconardi, Lynda F. Delph, Peter D. Fields, Minoru Ikeda, Yuki Minegishi, Silvia Proietti, Heike Ritthammer, Birgit C. Schlick-Steiner, Florian M. Steiner, Gregor A. Wachter, Herbert C. Wagner, Laura A. Weingartner

MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES　15　(4)　1014-1015　2015/07

DOI： 10.1111/1755-0998.12419 　

ISSN： 1755-098X

eISSN： 1755-0998
Development and characterization of nine novel microsatellite markers for the milkfish Chanos chanos Peer-reviewed

Brian S. Santos, Maria Rowena R. Romana-Eguia, Zubaida U. Basiao, Minoru Ikeda

CONSERVATION GENETICS RESOURCES　7　(2)　451-453　2015/06

DOI： 10.1007/s12686-014-0393-3 　

ISSN： 1877-7252

eISSN： 1877-7260
Identification of spawning sites of the tiger puffer Takifugu rubripes in Nanao Bay, Japan, using DNA analysis Peer-reviewed

Daisuke Katamachi, Minoru Ikeda, Katsutoshi Uno

FISHERIES SCIENCE　81　(3)　485-494　2015/05

DOI： 10.1007/s12562-015-0867-6 　

ISSN： 0919-9268

eISSN： 1444-2906
The draft genome sequence data (raw reads, assembled contigs and unassembled reads) and RAD-tag read data of the marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae. Peer-reviewed

Genomic Resources Development Consortium, Arthofer W, Bertini L, Caruso C, Cicconardi F, Delph L.F, Fields P.D, Ikeda M, Minegishi Y, Proietti S, Ritthammer H, Schlick-Steiner B.C, Steiner F.M, Wachter G.A, Wagner H.C, Weingartner L.A

Molecular Ecology Resources　15　1014-1015　2015
Divergence of mitochondrial DNA lineage of the rocky intertidal goby Chaenogobius gulosus around the Japanese Archipelago: reference to multiple Pleistocene isolation events in the Sea of Japan Peer-reviewed

S. Hirase, M. Ikeda

MARINE BIOLOGY　161　(3)　565-574　2014/03

DOI： 10.1007/s00227-013-2359-5 　

ISSN： 0025-3162

eISSN： 1432-1793
Development of a multiplex PCR assay for population genetic analysis of the tiger puffer Takifugu rubripes using 16 microsatellite DNA loci Peer-reviewed

Katamachi D, Ikeda M, Sat T, Suzuki S, Kikuchi K, Ojima D

Aquaculture Science　62　(1)　55-63　2014/02
Publisher: Japanese Society for Aquaculture Science
DOI： 10.11233/aquaculturesci.62.55 　

ISSN： 0371-4217

eISSN： 2185-0194

More details Close

The tiger puffer Takifugu rubripes is a marine fish species economically important to East Asia, particularly Japan. To evaluate the genetic variability and population structure of the tiger puffer in detail, we generated a multiplex PCR assay of microsatellite DNA loci, a fast and cost-effective technique that allows high-throughput genotyping. In this study, we report the development of four multiplex PCR assays for this species using 16 microsatellite DNA loci located on independent chromosomes. We ensured quality control throughout all steps of the multiplex PCR assay development, i.e., exclusion of loci detected with stuttering, allele dropouts, or null alleles. We evaluated this set of microsatellite DNA loci for polymorphisms using 113 fishes collected from three different locations in the sea around Japan. This combination of loci will prove useful for future investigations of the fine-scale population genetic structure of this species.
Long-term vicariance and post-glacial expansion in the Japanese rocky intertidal goby Chaenogobius annularis Peer-reviewed

Shotaro Hirase, Minoru Ikeda

MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES　499　217-U467　2014

DOI： 10.3354/meps10641 　

ISSN： 0171-8630

eISSN： 1616-1599
Genetic population structure of Strongylocentrotus nudus inferred from microsatellite DNA and mtDNA analyses Peer-reviewed

Wonshik Nam, Manami Kanno, Masato Watanabe, Minoru Ikeda, Akihiro Kijima

Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition)　80　(5)　726-740　2014
Publisher: Nihon Suisan Gakkai
DOI： 10.2331/suisan.80.726 　

ISSN： 1349-998X 0021-5392
Evidence of the restricted gene flow within a small spatial scale in the Japanese common intertidal goby Chaenogobius annularis Peer-reviewed

Shotaro Hirase, Manami Kanno, Minoru Ikeda, Akihiro Kijima

MARINE ECOLOGY-AN EVOLUTIONARY PERSPECTIVE　33　(4)　481-489　2012/12

DOI： 10.1111/j.1439-0485.2012.00512.x 　

ISSN： 0173-9565

eISSN： 1439-0485
Detection of regional allozyme divergence in the rocky intertidal goby Chaenogobius annularis Peer-reviewed

Shotaro Hirase, Minoru Ikeda, Manami Kanno, Akihiro Kijima

ICHTHYOLOGICAL RESEARCH　59　(3)　264-267　2012/07

DOI： 10.1007/s10228-012-0272-4 　

ISSN： 1341-8998
Phylogeography of the intertidal goby Chaenogobius annularis associated with paleoenvironmental changes around the Japanese Archipelago Peer-reviewed

S. Hirase, M. Ikeda, M. Kanno, A. Kijima

MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES　450　(450)　167-179　2012

DOI： 10.3354/meps09584 　

ISSN： 0171-8630
Distributions of two ectosymbionts, branchiobdellidans (Annelida: Clitellata) and scutariellids (Platyhelminthes: "Turbellaria": Temnocephalida), on atyid shrimp (Arthropoda: Crustacea) in southeast China Peer-reviewed

A. Ohtaka, S. R. Gelder, M. Nishino, M. Ikeda, H. Toyama, Y. -D. Cui, X. -B. He, H. -Z. Wang, R. -B. Chen, Z. -Y. Wang

JOURNAL OF NATURAL HISTORY　46　(25-26)　1547-1556　2012

DOI： 10.1080/00222933.2012.692826 　

ISSN： 0022-2933
mtDNAならびに新規に開発したマイクロサテライトDNAマーカーを用いて比較した長江と利根川におけるハクレン集団の遺伝的多様性 Peer-reviewed

片町太輔, 董仕, 池田実, 谷口順彦

水産育種　40　(2)　105-112　2011/03
Publisher:
ISSN： 1343-7917
Genetic variability of silver carp Hypophthalmichthys molitrix population introduced into the Tone River basin, Japan assessed by mtDNA analysis Peer-reviewed

Daisuke Katamachi, Minoru Ikeda, Shi Dong, Nobuhiko Taniguchi

NIPPON SUISAN GAKKAISHI　77　(1)　31-39　2011/01

DOI： 10.2331/suisan.77.31 　

ISSN： 0021-5392
Growth comparison of Asian Nile and red tilapia strains in controlled and uncontrolled farm conditions Peer-reviewed

Maria Rowena R. Romana-Eguia, Minoru Ikeda, Zubaida U. Basiao, Nobuhiko Taniguchi

AQUACULTURE INTERNATIONAL　18　(6)　1205-1221　2010/10

DOI： 10.1007/s10499-010-9334-7 　

ISSN： 0967-6120
Genetic diversity and differentiation in allozymes and shell sculpture of the clams Ruditapes spp. in natural populations of Japan and China Peer-reviewed

Vargas K, Hamasaki K, Asakura Y, Nakajima K, Ikeda M, Tsuchiya K, Taniguchi N, Kitada S

Fish Genetics and Breeding Science　40　(1)　37-46　2010/10
Publisher:
ISSN： 1343-7917
東京湾と伊勢・三河湾におけるマコガレイ個体群の遺伝的特徴と個体群形成過程の検討

池田実, 遠藤和歌子, 藤井徹生, 石井光廣, 赤羽祥明, 中村元彦, 一色竜也, 片山知史

東京湾の漁業と環境　(1)　7-7　2010/01
Genetic diversity and population structure of the golden cuttlefish, Sepia esculenta (Cephalopoda: Sepiidae) indicated by microsatellite DNA variations Peer-reviewed

Xiaodong Zheng, Minoru Ikeda, Lingfeng Kong, Xiangzhi Lin, Qi Li, Nobuhiko Taniguchi

MARINE ECOLOGY-AN EVOLUTIONARY PERSPECTIVE　30　(4)　448-454　2009/12

DOI： 10.1111/j.1439-0485.2009.00294.x 　

ISSN： 0173-9565
Allozyme variation of littleneck clam Ruditapes philippinarum and genetic mixture analysis of foreign clams in Ariake Sea and Shiranui Sea off Kyushu Island, Japan Peer-reviewed

Kelly Vargas, Yoshiho Asakura, Minoru Ikeda, Nobuhiko Taniguchi, Yasuhiro Obata, Katsuyuki Hamasaki, Kotaro Tsuchiya, Shuichi Kitada

FISHERIES SCIENCE　74　(3)　533-543　2008/06

DOI： 10.1111/j.1444-2906.2008.01556.x 　

ISSN： 0919-9268
Inheritance of mitochondrial DNA variable number of tandem repeats in barfin flounder Verasper moseri and spotted halibut Peer-reviewed

Maria del Mar Ortega-Villaizan Romo, Minoru Ikeda, Masato Aritaki, Shigenori Suzuki, Nobuhiko Taniguchi

FISHERIES SCIENCE　73　(2)　463-465　2007/04

DOI： 10.1111/j.1444-2906.2007.01355.x 　

ISSN： 0919-9268
イセエビ成体集団における遺伝的異質性の検出

守谷英司, 池田実, 谷口順彦

日本水産学会東北支部会報　57　16　2007/03
北海道沿岸におけるワカサギの集団構造

橋本昭彦, 池田実, 谷口順彦

日本水産学会誌東北支部会報　57　17　2007/03
Isolation and characterization of microsatellite DNA loci from the golden cuttlefish, Sepia esculenta Hoyle (Cephalopoda) Peer-reviewed

Xiaodong Zheng, Minoru Ikeda, Anna Barinova, Nobuhiko Taniguchi

MOLECULAR ECOLOGY NOTES　7　(1)　40-42　2007/01

DOI： 10.1111/j.1471-8286.2006.01518.x 　

ISSN： 1471-8278
Genetic population evaluation of two closely related flatfish species, the rare barfin flounder and spotted halibut, along the Japanese coast Peer-reviewed

María Del Mar Ortega-Villaizán Romo, Masato Aritaki, Shigenori Suzuki, Minoru Ikeda, Takashi Asahida, Nobuhiko Taniguchi

Fisheries Science　72　(3)　556-567　2006/06

DOI： 10.1111/j.1444-2906.2006.01184.x 　

ISSN： 0919-9268 1444-2906
ワカサギ個体群の遺伝的分化－中国産ワカサギの起源の検討も含めて－

池田実, 片山知史, 木村和彦, 白川仁, 中野俊樹

日本水産学会東北支部会報　56　53　2006/03
Genetic variation in skipjack tuna Katsuwonus pelamis (L.) using PCR-RFLP analysis of the mitochondrial DNA D-loop region Peer-reviewed

M. R. Menezes, M. Ikeda, N. Taniguchi

Journal of Fish Biology　68　(1)　156-161　2006/03

DOI： 10.1111/j.0022-1112.2006.00993.x 　

ISSN： 0022-1112 1095-8649
Isolation and characterization of microsatellite DNA loci for endangered fish, Japanese huchen (Hucho perryi) Peer-reviewed

M Hatakeyama, T Watanabe, M Ikeda, M Nakajima, H Kawamula, N Taniguchi

MOLECULAR ECOLOGY NOTES　5　(4)　893-895　2005/12

DOI： 10.1111/j.1471-8286.2005.01101.x 　

ISSN： 1471-8278
Isolation and characterization of microsatellite DNA markers from mangrove crab, Scylla paramamosain Peer-reviewed

M Takano, A Barinova, T Sugaya, Y Obata, T Watanabe, M Ikeda, N Taniguchi

MOLECULAR ECOLOGY NOTES　5　(4)　794-795　2005/12

DOI： 10.1111/j.1471-8286.2005.01065.x 　

ISSN： 1471-8278
Monitoring of the genetic variability of the hatchery and recaptured fish in the stock enhancement program of the rare species barfin flounder Verasper moseri Peer-reviewed

M Ortega-Villaizan, S Suzuki, M Ikeda, M Nakajima, N Taniguchi

FISHERIES SCIENCE　71　(5)　1120-1130　2005/10

DOI： 10.1111/j.1444-2906.2005.01051.x 　

ISSN： 0919-9268
Relationships between genetic diversity and number of successive generations in hatchery populations of ayu Plecoglossus altivelis assessed by microsatellite DNA polymorphism Peer-reviewed

Minoru Ikeda, Shuzo Takagi, Nobuhiko Taniguchi

Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition)　71　(5)　768-774　2005/09

DOI： 10.2331/suisan.71.768 　

ISSN： 0021-5392 1349-998X
A simple method to distinguish Blue king crab Paralithodes platypus from Red king crab P. camtschatica using mtDNA PCR-RFLP Peer-reviewed

H. Uyama, M. Ikeda, N. Taniguchi

Fish Genetics and Breeding Science　34　(2)　111-115　2005/07
Publisher:
ISSN： 1343-7917
ミトコンドリアDNAの配列情報に基づくタラバガニとアブラガニの判別法

宇山博人, 池田実, 谷口順彦

日本水産学会東北支部会報　55　15　2005/03
利根川流域に定着したハクレン集団の遺伝的評価

片町太輔, 池田実, 谷口順彦

日本水産学会東北支部会報　55　21　2005/03
アユの継代数と遺伝的多様性の関係-マイクロサテライトとミトコンドリアDNAマーカーによるモニタリング-

池田実, 谷口順彦

日本水産学会東北支部会報　55　22　2005/03
Genetic changes during mass selection for growth in Nile tilapia, Oreochromis niloticus (L.), assessed by microsatellites Peer-reviewed

MRR Romana-Eguia, M Ikeda, ZU Basiao, N Taniguchi

AQUACULTURE RESEARCH　36　(1)　69-78　2005/01

DOI： 10.1111/j.1365-2109.2004.01185.x 　

ISSN： 1355-557X
Genetic diversity in fanned Asian Nile and red hybrid tilapia stocks evaluated from microsatellite and mitochondrial DNA analysis Peer-reviewed

MRR Romana-Eguia, M Ikeda, ZU Basiao, N Taniguchi

AQUACULTURE　236　(1-4)　131-150　2004/06

DOI： 10.1016/j.aquaculture.2004.01.026 　

ISSN： 0044-8486
Lack of mitochondrial gene flow between populations of the endangered amphidromous fish Plecoglossus altivelis ryukyuensis inhabiting Amami-oshima Island Peer-reviewed

M Ikeda, M Nunokawa, N Taniguchi

FISHERIES SCIENCE　69　(6)　1162-1168　2003/12

DOI： 10.1111/j.0919-9268.2003.00741.x 　

ISSN： 0919-9268
Isolation and characterization of microsatellite DNAmarkers for population genetics study of masu salmon, Onchorhynchus masou masou Peer-reviewed

Noguchi D, Ikeda M, Nakajima M, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　33　(1)　61-66　2003/11
Publisher:
ISSN： 1343-7917
Population genetic analysis of larvae and juvenile stages of amphidromous ayu, Plecoglossus altivelis, in the coastal region of Wakayama Prefecture using mitochondrial DNA marker Peer-reviewed

Goto H, Ikeda M, Nunokawa M, Azuma K, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　32　127-134　2002/10
Relatedness structure estimated by microsatellites DNA and mitochondrial DNA polymerase chain reaction - Restriction fragment length polymorphisms analyses in the wild population of kuruma prawn Penaeus japonicus Peer-reviewed

Takuma Sugaya, Minoru Ikeda, Nobuhiko Taniguchi

Fisheries Science　68　(4)　793-802　2002/08

DOI： 10.1046/j.1444-2906.2002.00495.x 　

ISSN： 0919-9268
Inheritance mode of microsatellite DNA markers and their use for kinship estimation in kuruma prawn Penaeus japonicus Peer-reviewed

T Sugaya, M Ikeda, H Mori, N Taniguchi

FISHERIES SCIENCE　68　(2)　299-305　2002/04

DOI： 10.1046/j.1444-2906.2002.00425.x 　

ISSN： 0919-9268
Genetic variation and divergence in populations of ayu Plecoglossus altivelis, including endangered subspecies, inferred from PCR-RFLP analysis of the mitochondrial DNA D-loop region Peer-reviewed

M Ikeda, N Taniguchi

FISHERIES SCIENCE　68　(1)　18-26　2002/02

DOI： 10.1046/j.1444-2906.2002.00384.x 　

ISSN： 0919-9268
Change of relatedness among individuals in seed population of kuruma prawn based on microsatellites DNA markers Peer-reviewed

Sugaya, T, Ikeda M, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　31　97-101　2001/10
Typing of mtDNA in the kuruma prawn based on the PCR-RFLP analysis of mtDNA control region Peer-reviewed

Sugaya T, Ikeda M, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　31　11-15　2001/03
Genetic evaluation of a transplanted population of Ryukyu-ayu (Plecoglossus altivelis ryukyuensis) using microsatellite and mitochondrial DNA markers Peer-reviewed

Ikeda M, Tachihara K, Nunokawa M, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　31　33-37　2001/03
Evaluation for population structure of amphidromous ayu in the east Japan, inferred from allzyme data Peer-reviewed

Nunokawa M, Ikeda M, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　29　61-68　2000/06
Comparison for the genetic variabilities of natural and seed populations of Japanese flounder based on PCR-RFLP analysis of mtDNA D-loop Peer-reviewed

Sugaya T, Ikeda M, Taniguchi N

Fish Genetics and Breeding Science　28　65-73　1999/06
Genetic relationships among breeds of goldfish based on isozyme variations Peer-reviewed

M Ikeda, T Kawakami, Y Fujio

FISHERIES SCIENCE　65　(2)　182-185　1999/04

DOI： 10.2331/fishsci.65.182 　

ISSN： 0919-9268
Genetic control for lactate dehydorogenase isozymes of the Japanese crucian carp (Carassius auratus subsp.)

Ikeda M, Takase T, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　49　1-8　1998/09
Typing of mtDNA in the Japanese flounder based on the length variation and the RFLP analysis of mtDNA D-loop region Peer-reviewed

Sugaya T, Ikeda M, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　26　33-40　1998/06
Genetic differentiation among populations of Japanese freshwater crab, Geothelphusa dehaani (White), with reference to the body color variation Peer-reviewed

Ikeda M, Suzuki T, Fujio Y

Benthos Research　53　(1)　47-52　1998/06
Publisher:
DOI： 10.5179/benthos1996.53.1_47 　

ISSN： 0289-4548
Linked with a null allele for liver esterase in crusian carp

Yamamoto S, Takase H, Ikeda M, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　48　(3)　93-101　1998/03

ISSN： 0040-8719
Estimation of actual number of parents contributing to seed production of the Japanese flounder

Ikeda M, Liu S, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　48　(3)　103-109　1998/03

ISSN： 0040-8719
Biochemical and morphological evidence of two sympatric forms, interpreted as sibling species, in the estuarine grapsid crab Hemigrapsus penicillatus (De Haan) Peer-reviewed

Takano M, Ikeda M, Kijima A

Benthos Research　52　111-117　1997/11

DOI： 10.5179/benthos1996.52.2_111 　
Genetic controls of MDH and LDH isozymes of the goldfish

Ikeda M, Yamamoto S, Fujio, Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　48　43-52　1997/09
Genetic features within and amng seed lots of the plaice Peer-reviewed

Liu S, Maeda K, Ikeda M, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　25　49-55　1997/06
Genetic variability and differentiation within and among populations of Japanese char: a comparison between isozyme and RAPD polymorphism Peer-reviewed

Kikuchi M, Ikeda M, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　25　27-36　1997/06
Selective advantage of heterozygotes at the liver isocitrate dehydrogenase locus in the plaice

Liu S, Ikeda M, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　47　(3)　97-103　1997/03

ISSN： 0040-8719
Genetic features of natural and cultured populations in plaice (Paralichthys olivaceus)

Liu S, Ikeda M, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　47　(3)　85-96　1997/03

ISSN： 0040-8719
Genetic and morphological analysis of geographic differentiation in Japanese common freshwater shrimp, Paratya compressa (Decapoda: Atyidae)

Ikeda M, Kijima A, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　47　(1)　37-45　1996/09

ISSN： 0040-8719
Genetic variability of RAPD pattern in cultured populations of the coho salmon Peer-reviewed

Ikeda M, Hashimoto D, Kijima A, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　23　51-58　1996/06
Genetic study on geographic distribution and differentiation in freshwater shrimp, Paratya compressa (Decapoda: Atyidae) Peer-reviewed

Ikeda M, Kijima A, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　22　1-11　1995/06
Electrophoretic evidence of two types in the common freshwater shrimp Paratya compressa compressa (Decapoda: Atyidae)

Ikeda M, Kijima A, Fujio Y

Tohoku Journal of Agricultural Research　45　(3)　70-77　1995/03

ISSN： 0040-8719
DIFFERENT EXPRESSION IN MDH ISOZYMES AMONG LOCAL-POPULATIONS IN FRESH-WATER SHRIMP, PARATYA-COMPRESSA (DECAPODA, ATYIDAE) Peer-reviewed

M IKEDA, A KIJIMA, Y FUJIO

JAPANESE JOURNAL OF GENETICS　69　(6)　679-684　1994/12

DOI： 10.1266/jjg.69.679 　

ISSN： 0021-504X
Sex dimorphism of the last thoracic sternal plate in Paratya compressa Peer-reviewed

Ikeda M, Kijima Y, Fujio Y

Benthos Research　47　37-39　1994/10
Genetic differentiation between Haliotis kamtchatcana and H. discus hannai Peer-reviewed

Ikeda M, Hoshikawa H, Kijima A

Fish Genetics and Breeding Science　20　17-24　1994/06
Genetic differentiation among local populations of common freshwater shrimp Paratya compressa improvisa Peer-reviewed

Minoru IKEDA, Akihiro KIJIMA, Yoshihisa FUJIO

The Japanese Journal of Genetics　68　(4)　293-302　1993/06

DOI： 10.1266/jjg.68.293 　
Genetic differentiation among local populations in B-type of Palaemon paucidens Peer-reviewed

Ikeda M, Kijima Y, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　19　21-28　1993/06
Genetic divergence between two subspecies in Paratya compressa (Decapoda: Atyidae) Peer-reviewed

Minoru Ikeda, Akihiro Kijima, Yoshihisa Fujio

Nippon Suisan Gakkaishi　58　(5)　819-824　1992/10
Publisher: The Japanese Society of Fisheries Science
DOI： 10.2331/suisan.58.819 　

ISSN： 0021-5392

More details Close

In order to estimate the degree of genetic divergence between two Paratya subspecies, Paratya compressa compressa and P. c. improvisa, which are common freshwater shrimp in Japan, isozymic analysis was carried out by starch gel electorophoresis. Eighteen loci coding for 15 enzymes were scored in both subspecies. Of the 18 loci, 7 divergent loci with no common allele were observed between the two subspecies. Nei's genetic distance between the subspecies was 0.597. Average heterozygosity was 0.044 in P. c. compressa but 0.069 in P. c. improvisa, indicating a difference in genetic variability between the two subspecies. These results indicate that the two subspecies are genetically divergent. The number of divergent loci and genetic similarities pointed to useful in-dices for genetic divergence between closely related species in the process of speciation.
Genetic characteristics of the artificial seed populations of abalone Peer-reviewed

Kijima A, Ikeda M, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　18　53-64　1992/06
Gene expression of isozyme in triploids of pacific oyster Crassostrea gigas Peer-reviewed

Akashige S, Ikeda M, Fujio Y

Fish Genetics and Breeding Science　18　33-39　1992/06
CHROMOSOMAL COMPLEMENTS OF 2 FORMS OF NEANTHES-JAPONICA (POLYCHAETA, NEREIDIDAE) WITH EVIDENCE OF MALE-HETEROGAMETIC SEX-CHROMOSOMES Peer-reviewed

M SATO, M IKEDA

MARINE BIOLOGY　112　(2)　299-307　1992/02

ISSN： 0025-3162
Chromosome preparations from larvae and adult tissues of Polychaetas Peer-reviewed

Minoru Ikeda, Masanori Sato

Benthos Research　41　29-35　1991/09

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Misc. 40

Looking Back 14 Years After the 2011 Tsunami Damage Invited

Minoru Ikeda

JAMBIO News Letter　13　8-9　2025/03
Comparative population genomics of yellow striped flounder Pseudopleuronectes herzensteini and marbled flounder P. yokohamae with contrasting early life histories (mini-review) Invited Peer-reviewed

Yamamoto, Y., Ikeda, M.

Fish Genetics and Breeding Science　53　(2)　39-43　2024/04
Reconstructing the historical distribution of the sailfin sandfish: From constructing reference genome sequence to population demographic analysis (mini-review) Invited Peer-reviewed

Kurihara, H., Ikeda, M.

Fish Genetics and Breeding Science　53　(2)　35-38　2024/03
Population genomics in wild fisheries organisms (mini-review) Invited Peer-reviewed

Ikeda, M., Hirase, S., Kikuchi, K.

Fish Genetics and Breeding Science　53　(2)　21-23　2024/03
3. Comparative population genomics of yellow striped flounder Pseudopleuronectes herzensteini and marbled flounder P. yokohamae with contrasting early life histories (summary) Invited Peer-reviewed

Yamamoto, Y., Ikeda, M.

Nippon Suisan Gakkaishi　90　(2)　143-143　2024/03

DOI： 10.2331/suisan.WA3095-3 　
2. Reconstructing the historical distribution of the sailfin sandfish: From constructing reference genome sequence to population demographic analysis (summary) Invited Peer-reviewed

Kurihara, H., Ikeda, M.

Nippon Suisan Gakkaishi　90　(2)　142-142　2024/03

DOI： 10.2331/suisan.WA3095-2 　
Population genomics in wild fisheries organisms (summary) Invited Peer-reviewed

Ikeda, M., Hirase, S., Kikuchi, K.

Nippon Suisan Gakkaishi　90　(2)　140-140　2024/03

DOI： 10.2331/suisan.WA3095-0 　
トラフグ放流魚は子供を残しているのか?:種苗生産用親魚と天然集団のDNAデータセットからの推測

片町太輔, 菅谷琢磨, 中道礼一郎, 池田実, 齋尾雅宏, 村上智, 大石淳之, 竹ノ内洋平, 佐藤尚史, 小島大輔, 片山貴士, 山本義久, 太田健吾

日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM)　2024　2024
奄美大島固有のＣタイプを含む「スジエビ」の３タイプについて Invited

武田真城, 池田実

うみうし通信　120　5-7　2023/09
「普通種」の中の絶滅危惧種あるいは集団：「スジエビ」の例 Invited

池田実, 武田真城

水産育種　52　(2)　57-66　2023/03
野生ヒラメの血縁推定における尤度比のパーミュテーション検定

大林武, 安藤大樹, 池田実

研究報告バイオ情報学（BIO）　56　1-7　2022/06
トラフグ放流魚における天然海域中での再生産の検討

片町太輔, 菅谷琢磨, 池田実, 佐藤尚史, 小島大輔, 片山貴士, 太田健吾, 山本義久, 小畑泰弘, 崎山一孝, 本田聡

日本水産学会大会講演要旨集　2020　2020
スジエビ2タイプの判別と分布

張成年, 矢田崇, 児玉紗希江, 箱山洋, 丹羽健太郎, 長井敏, 柳本卓, 今井正, 池田実, 槇宗市郎, 大貫貴清, 武藤文人, 野原健司, 古澤千春, 七里浩志, 渾川直子, 浦垣直子, 川村顕子, 市川竜也, 潮田健太郎, 樋口正仁, 手賀太郎, 児玉晃治, 伊藤雅浩, 市村政樹, 松崎浩二, 平澤桂, 戸倉渓太, 中畑勝見, 斎藤和敬, 中屋光裕, 丸山智朗

日本水産学会大会講演要旨集　2018　131　2018/03/26
Evaluation of the Tsunami Impact on the Genetic Diversity of the Marbled Flounder Pseudopleuronectes yokohamae in Sendai Bay, Miyagi, Japan Invited Peer-reviewed

Yuki Minegishi, Minoru Ikeda, Yutaka Kurita, Hiroyuki Togashi, Yukinori Nakane, Akihiro Kijima

Bulletin of Japan Fisheries Research and Education Agency　45　69-73　2017/10
天然のヒラメ親魚集団から生産された放流用種苗の遺伝的多様性について Invited

池田実, 安藤大樹

豊かな海　(42)　8-13　2017/07
Publisher: 全国豊かな海づくり推進協会
Development of the system to determine parentage and sibship in hatchery population for stock enhancement programs of Japanese flounder Paralichthys olivaceus

D. Ando, M. Ikeda, T. Sugaya, D. Katamachi, T. Fujii, A. Kijima

AQUACULTURE　472　126-126　2017/04

ISSN： 0044-8486

eISSN： 1873-5622
GENETIC RELATIONSHIPS AMONG MEMBERS OF THE PACIFIC ABALONE SPECIES COMPLEX INFERRED FROM POPULATION MITOGENOMIC DATA

M. Ikeda, M. Nishisako, M. Sekino, M. Hara, A. Kijima

AQUACULTURE　472　130-130　2017/04

ISSN： 0044-8486

eISSN： 1873-5622
DEBRIS RECYCLING IN GENOME SEQUENCING: REFERENCE DEVELOPMENT AND MICROSATELLITES ISOLATION FOR POPULATION GENETIC ANALYSES OF THE MARBLED FLOUNDER Pseudopleuronectes yokohamae

Y. Minegishi, M. Ikeda, A. Kijima

AQUACULTURE　472　134-134　2017/04

ISSN： 0044-8486

eISSN： 1873-5622
GENETIC ASSESSMENT OF PHILIPPINE MILKFISH (Chanos chanos) STOCKS BASED ON NOVEL MICROSATELLITES FOR MARKERAIDED BROODSTOCK MANAGEMENT

M. R. R. Romana-Eguia, B. S. Santos, M. Ikeda, Z. U. Basiao, E. G. De Jesus-Ayson, A. Kijima

AQUACULTURE　472　136-136　2017/04

ISSN： 0044-8486

eISSN： 1873-5622
女川フィールドセンターの復興 Invited

Ikeda M

Nippon Suisan Gakkaishi　83　(2)　245-248　2017/03
Publisher: 公益社団法人日本水産学会
DOI： 10.2331/suisan.WA2376 　
イシダタミ・オキナワイシダタミ間の集団遺伝構造の比較:集団構造の違いに生息地嗜好性は寄与するか?

山崎大志, 千葉聡, 三浦収, 池田実

Venus　75　(1/4)　2017

ISSN： 1348-2955
魚介類遺伝資源への影響と今後について

池田実, 峰岸有紀, 安藤大樹, 菅野愛美, 木島明博, 平瀬祥太朗, 奥村誠一, 森山俊介, 足立賢太, 河田雅圭, 須田亜弥子, 大類穂子, 瀧下清貴, 藤倉克

Nippon Suisan Gakkaishi　82　149　2016/03
日本沿岸におけるトラフグの集団構造

片町太輔, 池田実, 佐藤尚史, 小島大輔

日本水産学会大会講演要旨集　2016　2016
宮城県沿岸域における生態系保全調査

吾妻行雄, 青木優和, 遠藤光, 堀越彩香, 荒川久幸, 池田実, 菅野愛美, 木島明博, 峰岸有紀, 鈴木徹, 横井勇人, 河田雅圭

国立大学法人東北大学、学校法人北里研究所　10-18　2014/06
Publisher: 東北大学マリンサイエンス復興支援室
Tsunami disaster situation in Onagawa Fielad Center Invited

Minoru Ikeda

Bulletin of Integrated Field Science Center　27　(27)　67-71　2012/03
Publisher: 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター
分類学的に整理されていない「種」の侵入−DNA分析の重要性−

池田実

日本水産学会誌　77　(2)　307-308　2011/03/15
東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター（複合水域生産システム部）（施設紹介） Invited

池田実

日本水産学会誌　75　(6)　1094-1094　2009/11
The 10th International Symposium on Genetics in Aquacultureに参加して Invited

池田実

水産育種　39　(1)　67-69　2009/10
Publisher: 水産育種研究会
ISSN： 1343-7917
書評−「生物系統地理学：種の進化を探る」 Invited

池田実

水産育種　39　(1)　25-26　2009/10
Recent research topics in genetic approaches for sustainable yield and conservation of marine organisms

Akihiro Kijima, Minoru Ikeda, Manami Kanno

Tohoku journal of agricultural research　59　(3-4)　93-95　2009
Publisher: Faculty of Agriculture, Tohoku University
ISSN： 0040-8719
支部長賞を受賞して Invited

池田実

日本水産学会誌　72　292-292　2006/04
アユの健苗性の促進に関する研究

谷口順彦, 中嶋正道, 池田実, 谷口道子, 高木秀蔵

2005/10
Publisher: 財団法人高知県内水面種苗センター
Inheritance mode of microsatellite DNA markers and their use for kinship estimation in kuruma prawn Penaeus japonicus (vol 68, pg 299, 2002)

T Sugaya, M Ikeda, H Yagi, N Taniguchi

FISHERIES SCIENCE　69　(2)　430-430　2003/04

ISSN： 0919-9268
和歌山県沿岸におけるアユの遺伝的多様性と集団構造

池田実

和歌山の海産アユの増殖に関する遺伝・生態学的調査研究, 財団法人かき研究所　2003/03
Publisher: 財団法人かき研究所
遺伝学的にみたヌマエビの「種」

池田実

Aquabiology　123　(4)　299-307　1999/08
Publisher: 生物研究社
ISSN： 0285-4376
アイソザイム分析とDNA分析.

藤尾芳久, 池田実

水族における遺伝資源の存在様式と保全　13-41　1999/03
Publisher: かき研究所
日本産ヌマエビの遺伝的分化.

池田実

水族における遺伝資源の存在様式と保全　42-56　1999/03
Publisher: かき研究所
湖沼内におけるフナの集団構造.

池田実

水族における遺伝資源の存在様式と保全　57-66　1999/03
Publisher: かき研究所
ヒラメの天然集団と種苗放流との関係.

藤尾芳久, 池田実

水族における遺伝資源の存在様式と保全　103-114　1999/03
Publisher: かき研究所
ヌマエビ地域集団間におけるMDHアイソザイムの遺伝的分化

池田実, 木島明博, 藤尾芳久

The Japanese journal of genetics　69　(6)　679-684　1994/12
Publisher: Genetics Society of Japan
ISSN： 0021-504X

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Books and Other Publications 3

遺伝的多様性を維持しながら生息池拡大を実現-シナイモツゴおよびゼニタナゴ移植個体群の遺伝的多様性調査-「よみがえる魚たち」

池田実

恒星社厚生閣　2017/07/01
「アユ学-アユの遺伝的多様性の利用と保全-」

谷口順彦, 池田実

築地書館　2009/10/20

ISBN: 9784806713852
DNA分析で見えてきた内水面移殖の新たな問題「水産資源の増殖と保全」

池田実, 北田修一, 帰山雅秀, 浜崎活幸, 谷口順彦

成山堂書店　2008/10/18

ISBN: 9784425884414

Presentations 155

Long-Term Meta-Epigenomic Monitoring Platform to Elucidate Marine Plankton Dynamics in Onagawa Bay, Sanriku Coast

Obayashi, T., Fujii, T., Kitamura, A., Kumano, G., Ikeda, M.

The 32nd International Plant and Animal Genome Conference (PAG32)　2025/01/13
After Picking Up the Pieces: Tsunami Damage and Rebuilding of Onagawa Field Center, Tohoku University International-presentation Invited

Ikeda, M.

The 2nd World Congress of Marine Stations (Shizuoka, Japan)　2024/11/28
Population genomics of the marbled flounder, Pseudopleuronectes yokohamae, in the coast of the Japanese Archipelago: Remarkable genetic differentiation with hybridization between closely related species International-presentation

Yamamoto Y., Sekino M., Togashi H., Ikeda M.

11th International Flatfish Symposium (Wageningen, The Netherlands)　2024/11/26
Common genetic border of the intertidal snail species found in the geopark including two different coastal landscapes: a case of genus Littorina & Nucella International-presentation

Yamazaki, D., Ito, S., Kagawa, O., Chiba, S., Ikeda, M.

The 5th Asian Marine Biology Symposium (Bangkok, Thailand)　2024/10/29
Establishing an Epigenomics Research Platform for Marine Plankton in Onagawa Bay:Advancing Ecological Understanding

Obayashi T., Fujii T., Kitamura A., Kumano G., Ikeda M.

1st Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference　2024/10/24
ハタハタ資源の系群構造と時空間的動態の解明 −集団ゲノミクスによるアプローチ−

栗原寛明, 池田実

平成6年度日本水産学会東北支部大会（秋田市）　2024/10/20
女川湾のプランクトン動態解明に向けたゲノム解析基盤の整備

大林武, 藤井豊展, 北村茜, 池田実

トーゴーの日シンポジウム「AI + ロボティクス + データベースが変える生命科学」（品川）　2024/10/05
日本海におけるハタハタ集団の回遊規模の時空間的変動と集団構造の形成過程

栗原寛明, 飯田真也, 佐久間啓, 白川北斗, 藤井豊展, 池田実

2024年度日本魚類学会年会（福岡市）　2024/09/07
鹿島台町のため池に移殖されたシナイモツゴおよびゼニタナゴ個体群の遺伝的多様性評価 Invited

池田実

経団連自然保護協議会国内支援プロジェクト視察「アメリカザリガニ防除による里山水辺の自然再生」（大崎市）　2024/09/04
トラフグ放流魚は子供を残しているのか？：種苗生産用親魚と天然集団の DNAデータセットからの推測

片町太輔, 菅谷琢磨, 中道礼一郎, 池田実, 齋尾雅宏, 村上智, 大石淳之, 竹ノ内洋平, 佐藤尚史, 小島大輔, 片山貴史, 山本義久, 太田健吾

平成６年度日本水産学会春季大会（品川）　2024/03/29
RAD-seqデータを用いて検討したマガレイの遺伝的集団構造 ―局所適応と逆位多型の可能性―

山本佑樹, 冨樫博幸, 千葉悟, 池田実

平成６年度日本水産学会春季大会（品川）　2024/03/29
ツチクジラを対象としたマイクロサテライトDNA 解析の有用性に関する検討

近藤昭仁, 村瀬弘人, 上田真久, 宮城真鈴, 中村玄, 栗原寛明, 池田実, 前田光

平成６年度日本水産学会春季大会（品川）　2024/03/29
マイクロサテライトDNA を用いた南方系コビレゴンドウ（マゴンドウ）の集団遺伝学的研究

宮城真鈴, 上田真久, 中村玄, 村瀬弘人, 前田ひかり, 栗原寛明, 池田実

平成６年度日本水産学会春季大会（品川）　2024/03/30
種分布モデリングによって検証したハタハタの生息適地面積の変動と歴史的集団動態との対応

栗原寛明, 藤井豊展, 藤原邦浩, 池田実

平成６年度日本水産学会春季大会（品川）　2024/03/29
東北沿岸域のキツネメバル複合種群の形態的特徴と生活史

大西渉太, 和田由香, 栗原寛明, 池田実, 村上弘章, 片山知史

底魚会議（八戸市）　2024/03/04
The Coast of the Japanese Archipelago as a Field for the Study of Genetic Diversity of Marine Organisms International-presentation Invited

Minoru Ikeda

2023 JAAP Research Forum, Awarding of Filipino JSPS Fellows and General Assembly (Iloilo, Philippines)　2023/11/23
牡鹿半島の小規模漁港内に形成されたアマモ場における仔稚魚の種組成と経時的変化

相澤俊洋, 池田実

令和5年度日本水産学会秋季大会（仙台市）　2023/09/21
対照的な初期生活史を有するマガレイとマコガレイの比較集団ゲノミクス Invited

山本佑樹, 池田実

令和５年度日本水産学会秋季大会ミニシンポジウム「野生水産動物における集団ゲノミクス」（仙台市）　2023/09/22
ハタハタの分布域形成史を復元する：参照ゲノム配列の構築から集団動態解析まで Invited

栗原寛明, 池田実

令和５年度日本水産学会秋季大会ミニシンポジウム「野生水産動物における集団ゲノミクス」（仙台市）　2023/09/22
野生水産動物における集団ゲノミクス Invited

池田実, 平瀬祥太朗, 菊池潔

令和５年度日本水産学会秋季大会ミニシンポジウム「野生水産動物における集団ゲノミクス」（仙台市）　2023/09/22
ミトコンドリアDNA解析によるハタハタの集団動態史の推定復元

栗原寛明, 池田実

令和５年度日本水産学会春季大会（品川）　2023/03/31
RAD-seqデータで検討した日本列島沿岸におけるマコガレイの遺伝的集団構造

山本佑樹, 池田実, 冨樫博幸, 栗田豊

令和５年度日本水産学会春季大会（品川）　2023/03/30
ハタハタArctoscopus japonicusのドラフトゲノム配列の決定

栗原寛明, 黒田真道, 中林信康, 池田実

平成５年度日本水産学会春季大会（品川）　2023/03/30
川エビの多様性と保全 Invited

池田実

2022年度PICSオンライン市民講座プログラム（仙台市）　2023/03/22
Kinship Analysis on wild populations of olive flounder

Takeshi Obayashi, Minori Ikeda

Symposium of Yotta Informatics - Research Platform for Yotta-Scale Data Science 2023 - (Sendai)　2023/03/09
「普通種」の中の絶滅危惧種あるいは集団 Invited

池田実

令和4年度水産育種研究会定例シンポジウム日本の希少な水圏生物を守るために遺伝学に何ができるのか？　2022/12/10
The Sanriku Coast as a marine phylogeographic research field. International-presentation Invited

Ikeda, M

Tohoku University – OIST 3rd Joint Workshop on Biodiversity: From Genes and Species to Ecosystem Services and Resilience　2022/10/25
マイクロサテライトを用いた野生ヒラメの血縁推定における尤度比のパーミュテーション検定

大林武, 安藤大樹, 池田実

第24回日本進化学会年大会　2022/08/05
野生ヒラメの血縁推定における尤度比のパーミュテーション検定

大林武, 安藤大樹, 池田実

第70回情報処理学会バイオ情報学研究会 (SIGBIO70)　2022/06/29
核DNAのSTRとミトコンドリアDNAの塩基配列分析に基づくハタハタの系群構造および個体群動態史の解析

栗原寛明, 池田実, 千葉晋, 白井滋

令和４年度日本水産学会春季大会　2022/03/29
奄美大島と加計呂麻島におけるスジエビの分布と遺伝的特性

武田真城, 池田実

令和４年度日本水産学会春季大会　2022/03/29
Kinship Analysis on wild populations of olive flounder

Takeshi Obayashi, Minoru Ikeda

Symposium of Yotta Informatics - Research Platform for Yotta-Scale Data Science 2022 -　2022/03/18
日本および琉球列島における体色模様2型を伴ったヒメヌマエビ種群の解明

荻野洸二, 池田実

令和３年度日本水産学会春季大会　2021/03/29
東北地方太平洋沿岸域における両側回遊性スジエビ2系統の分布と遺伝的集団構造

武田真城, 池田実

令和３年度日本水産学会春季大会　2021/03/29
東北地方におけるスジエビ研究事情 Invited

池田実, 武田真城

水辺の自然再生ミニシンポジウム・地域研修会里山里地水辺の自然再生と保全活動　2021/03/01
同一水系から採集された”ヒメヌマエビ”と”コテラヒメヌマエビ”が混在する標本集団のDNAおよび形態分析

荻野洸二, 池田実

2020年度日本甲殻類学会　2020/10/31
東北地方太平洋沿岸域における両側回遊性スジエビ2系統の分布と接触域における混在河川の確認

武田真城, 張成年, 池田実

令和2年度日本水産学会東北支部会　2020/10/10
日本産大型アワビ類3種の種分化プロセスの推定と遺伝子コピー数多型の検出

平瀬祥太朗, 山崎曜, 關野正志, 池田実, 原素之, 菊池潔

令和2年度日本水産学会春季大会　2020/03/29
トラフグ放流魚における天然海域中での再生産の検討

片町太輔, 菅谷琢磨, 池田実, 佐藤尚史, 小島大輔, 片山貴士, 太田健吾, 山本義久, 小畑泰弘, 崎山一孝, 本田聡

令和２年度日本水産学会春季大会　2020/03/28
日本列島および周辺島嶼におけるヒメヌマエビの遺伝的集団構造と体表模様2型の地理的分布

荻野洸二, 池田実

令和２年度日本水産学会春季大会　2020/03/30
１匹だけでも殖えるザリガニ：ミステリークレイフィッシュ Invited

水辺の自然再生ミニシンポジウム・地域研修会里山里地水辺の自然再生と保全活動　2020/02/22
集団の遺伝的多様性を血縁dyadによって測る

池田実

令和元年度百島合同セミナー「ガザミ・クルマエビの資源回復に向けて何を知り、目指すべきか」　2019/12/16
キタノスジエビとスジエビ B タイプの比較

張成年, 柳本卓, 小西光一, 野原健司, 澤本彰三, 大貫貴清, 池田実, 丸山智朗, 今井正

日本甲殻類学会第57回大会　2019/10/19
形態とDNA分析により検討したヒメヌマエビにおける体表模様2型間の関係

荻野洸二, 池田実

令和元日本水産学会東北支部大会　2019/10/06
Population genomics of Pacific abalone species complex in early phase of marine speciation International-presentation

Hirase S, Sekino M, Hara M, Ikeda M, Kikuchi K

Evolution 2019　2019/06/20
ゲノムワイドSNP解析による日本産大型アワビ類3種の遺伝的類縁関係

平瀬祥太郎, 関野正志, 池田実, 原素之, 菊池潔

平成31年度日本水産学会春季大会　2019/03/27
Genetic research initiatives for sustainable aquaculture production in the Philippines International-presentation Invited

Maria Rowena, R. Romana-Eguia, Ma. Carmen, Ablan Lagman, Zubaida U. Basiao, Minoru Ikeda

The 16th International Symposium on Integrated Field Science "Future of Marine Aquaculture: Finding Solutions to Challenges"　2019/03/22
Future of Marine Aquaculture: Finding Solutions to Challenges International-presentation Invited

IKEDA Minoru

The 16th International Symposium on Integrated Field Science "Future of Marine Aquaculture: Finding Solutions to Challenges"　2019/03/22
環境DNA分析の現状 Invited

池田実

水辺の自然再生シンポジウム・地域研修会里山の自然と水辺の自然再生　2019/02/23
外来淡水エビNeocaridina spp.による国内在来種ミナミヌマエビNeocaridina denticulata denticulata集団への遺伝子汚染

張替仁人, 西野麻知子, 池田実, 占部城太郎

日本甲殻類学会第56回大会　2018/10/21
「スジエビ」"Palaemon paucidens"には何種類いるのだろうか？

張成年, 柳本卓, 今井正, 丸山智朗, 池田実, 大貫貴清

日本甲殻類学会第56回大会　2018/10/21
血縁dyadで測る集団の遺伝的多様性

池田実, 安藤大樹

平成30年度日本水産学会秋季大会　2018/09/16
Growth and microsatellite DNA marker analysis of Philippine donkey’s ear abalone Haliotis asinina stocks for use in broodstock development International-presentation

Romana-Eguia, M.R.R, Sibonga R.C, Ikeda M, Delgado L.H, De la Pena M, Kijima A

2018 International Symposium of Genetics in Aquaculture　2018/07/17
東アジア産イシダタミ属貝類の集団遺伝構造･生息地嗜好性の比較

山崎大志, 内田翔太, 三浦収, 池田実, 千葉聡

平成30年度日本貝類学会　2018/05/26
DNA血縁鑑定によるヒラメ栽培漁業の評価 Invited

池田実

百島セミナー：沿岸増養殖種の新たな資源解析に向けて　2018/04/27
山本佑樹、池田実、遠藤和歌子、中村武、木島明博、片山知史、栗田豊、冨樫博幸、赤羽祥明、石井光廣、一色竜也、飯田益生、中村元彦、後藤友明、髙梨愛梨、横澤祐司、藤井徹生

mtDNA分析により検討した日本列島沿岸におけるマコガレイとマガレイの集団構造

平成30年度日本水産学会春季大会　2018/03/28
ヒラメの親魚、種苗、漁獲物の遺伝的関係に関する調査の概要 Invited

池田実

第2回広域種資源造成型栽培漁業推進検討会（日本海北部海域）　2018/02/27
DNA分析からみた東北地方における在来ヌマエビ類の多様性 Invited

池田実, 槇宗市郎

水辺の自然再生シンポジウム・地域研修会里山の自然と水辺の自然再生　2018/02/10
Genetic diversification of intertidal gastropoda in an archipelago: the effects of islands, oceanic currents, and ecology. International-presentation

Yamazaki, D, Miura, O, Ikeda, M, Kijima, A., Tu, D.,V, Sasaki, T, Chiba, S

The Third Asian Marine Biology Symposium　2017/11/04
ミトコンドリアDNA分析によって検討した日本列島沿岸におけるマコガレイの遺伝的グループ

山本佑樹, 池田実, 木島明博

平成29年度日本水産学会東北支部大会　2017/10/29
キャビテーション現象を利用した有害カイアシ類の駆除技術

栗田喜久, 千葉郁雄, 小濱泰昭, 池田実, 木島明博

第19回マリンバイオテクノロジー学会大会　2017/06/03
「閖上赤貝」を含む仙台湾産アカガイと他地域産アカガイの遺伝的・形態的差異

佐藤仁, 池田実, 西峰千晴, 西川正純, 千葉郁雄, 鈴木貢治, 木島明博

平成29年度日本水産学会春季大会　2017/03/26
キャビテーション処理による養殖水槽で発生する有害微小甲殻類駆除技術の開発

栗田喜久

平成29年度日本水産学会春季大会　2017/03/26
天然のヒラメ親魚集団から生産された放流用人工種苗の遺伝的多様性評価

安藤大樹, 槇宗一郎, 菅谷琢磨, 片町太輔, 小畑泰弘, 木島明博, 池田実

平成29年度日本水産学会春季大会　2017/03/26
DNA血縁鑑定によるヒラメ栽培漁業の評価 Invited

2017/02/28
旧品井沼周辺ため池群に生息するゼニタナゴの遺伝子分析

水辺の自然再生シンポジウム・地域研修会里山の自然と水辺の自然再生　2017/02/18
DNA血縁鑑定によるヒラメ栽培漁業の評価 Invited

池田実, 安藤大樹

広域種資源造成型栽培漁業推進検討会（東北太平洋海域）　2017/02/17
アユ集団の遺伝的多様性 Invited

全国湖沼河川養殖研究会アユ資源研究部会　2017/02/02
DNA血縁鑑定によるヒラメ栽培漁業の評価

安藤大樹

水産育種研究会シンポジウム「親子判別法を用いた栽培漁業と水産育種への応用」　2016/11/03
大規模な放流効果調査での親子判定作業に対応して開発した支援ソフトウェアの機能と使用法

菅谷琢磨

水産育種研究会シンポジウム「親子判別法を用いた栽培漁業と水産育種への応用」　2016/11/03
トラフグ放流用人工種苗の遺伝的特性

水産育種研究会シンポジウム「親子判別法を用いた栽培漁業と水産育種への応用」　2016/11/03
震災後の女川フィールドセンター，そしてこれから

平成28年度日本水産学会北海道−東北支部合同支部大会シンポジウム「北海道・東北の水産を支える人材育成」　2016/10/22
天然魚を用いて生産されたヒラメ人工種苗の遺伝的多様性評価

安藤大樹, 槇宗一郎, 木島明博, 菅谷琢磨, 片町太輔, 小畑泰宏

平成28年度日本水産学会北海道-東北合同支部大会　2016/10/22
マコガレイ集団におけるミトコンドリア DNA のハプロタイプ分類について

山本佑樹, 後藤友明, 髙梨愛梨, 横澤祐司, 木島明博

平成28年度日本水産学会北海道-東北合同支部大会　2016/10/22
同一河川内に生息するヌマエビ２グループ間の遺伝的分岐

槇宗市郎

平成28年度日本水産学会北海道-東北合同支部大会　2016/10/22
「閖上赤貝」を含む仙台湾産アカガイと他地域産アカガイの遺伝的・形態的差異

佐藤仁, 池田実, 西峰千晴, 西川正純, 千葉郁雄, 鈴木貢治, 木島明博

平成28年度日本水産学会北海道-東北合同支部大会　2016/10/22
漁業対象生物等の遺伝的多様性調査ー東北大チームの取り組み2015ー

早坂瞬, 峰岸有紀, 佐藤仁, 栗田喜久, 木島明博

平成28年度東北マリンサイエンス拠点形成事業における全体会議　2016/06/03
Evaluation of the genetic diversity of the marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae in Sendai Bay International-presentation

Yuki Minegishi, Minoru Ikeda, Yutaka Kurita, Hiroyuki Togashi, Yukinori Nakane, Akihiro Kijima

International Symposium on Restoration after Great East Japan Earthquake -Our Knowledge on the Ecosystem and Fisheries-　2016/03
旧品井沼周辺ため池群に生息するゼニタナゴの遺伝子分析

シナイモツゴ郷の会シンポジウム　2016/02
Genetic diversity of the spiny king crab on the far eastern coast: connectivity between Japanese and Russian populations International-presentation

東北アジア地域研究の新たなパラダイム　2015/12/05
Evaluation of the tsunami impact on the genetic diversity of the marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae in Sendai Bay, Miyagi, Japan. International-presentation

Minegishi Y, Ikeda M, Kurita Y, Togashi H, Nakane Y, Kijima A

The 43rd Scientific Symposium of UJNR Aquaculture Panel “Evaluation of the impact of breeding organisms on the ecosystem and aquaculture industry”　2015/11/10
Evaluation of the tsunami impact on the genetic diversity of the marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae in Sendai Bay, Miyagi, Japan. International-presentation

Yuki Minegishi, Minoru Ikeda, Yutaka Kurita, Hiroyuki Togashi, Yukinori Nakane, Akihiro Kijima

The 43rd Scientific Symposium of UJNR Aquaculture Panel “Evaluation of the impact of breeding organisms on the ecosystem and aquaculture industry”　2015/11
An impact of stocking of wild population with Japanese flounder Paralichthys olivaceus on “stocking and reproductive simulation” International-presentation

Ando D, Ikeda M, Sugaya T, Katamachi D, Fujii T, Kijima A

The 5th International Symposium on Stock Enhancement and Sea Ranching　2015/10
Identification of offspring of hatchery-produced tiger puffer in the wild International-presentation

Katamachi D, Ikeda M, Sugaya T, Fujii T

The 5th International Symposium on Stock Enhancement and Sea Ranching　2015/10
仙台湾のマコガレイ個体群に対する津波の影響

峰岸有紀, 池田実, 栗田豊, 富樫博幸, 中根幸則, 木島明博

平成27年度日本水産学会秋季大会　2015/09
魚介類遺伝資源への影響と今後について

池田実, 峰岸有紀, 安藤大樹, 菅野愛美, 木島明博, 平瀬祥太朗, 奥村誠一, 森山俊介, 足立賢太, 河田雅圭, 須田亜弥子, 大類穂子, 瀧下清貴, 藤倉克則

平成27年度日本水産学会理事特別シンポジウム　2015/09
Debris recycling in genome sequencing: reference development and microsatellites isolation for population genetic analyses of the marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae International-presentation

Yuki Minegishi, Minoru Ikeda, Akihiro Kijima

ISGA XII – The international symposium on genetics in aquaculture XII　2015/06
Development of the system to determine parentage and sibship in hatchery population for stock enhancement program of Japanese flounder Paralichthys olivaceus International-presentation

Ando D, Ikeda M, Sugaya T, Katamachi D, Fujii T, Kijima A

ISGA XII – The international symposium on genetics in aquaculture XII　2015/06
Genetic relationships among members of the Pacific abalone species complex inferred from population mitogenomic data International-presentation

Ikeda M, Nishisako M, Sekino M, Hara M, Kijima A

ISGA XII – The international symposium on genetics in aquaculture XII　2015/06
Genetic assessment of Philippine milkfish (Chanos chanos) stocks based on novel microsatellites for marker-aided broodstock management International-presentation

Romana-Eguia M.R.R, Santos B.S, Ikeda M, Basiao Z.U, De Jesus-Ayson E.G, Kijima A

ISGA XII – The international symposium on genetics in aquaculture XII　2015/06
漁業対象生物等の遺伝的多様性調査 −東北大チームの取り組み 2014−

池田実, 安藤大樹, 西峯千晴, 木島明博

東北マリンサイエンス拠点形成事業平成27年度全体会議　2015/05
ヒラメにおける血縁鑑定システムの評価

安藤大樹, 池田実, 木島明博, 菅谷琢磨, 片町太輔, 藤井徹生

平成27年度日本水産学会春季大会　2015/03/27
旧品井沼周辺ため池群に生息するゼニタナゴの遺伝子分析

旧品井沼周辺ため池群に生息するゼニタナゴの復元　2015/02/21
漁獲されたヒラメの血縁関係をDNA分析によって推定することは可能か？

安藤大樹, 菅谷琢磨, 片町太輔, 藤井徹生, 木島明博

平成26年度日本水産学会東北支部大会　2014/11/07
エゾイソアイナメ（Physiculus maximowiczi）とチゴダラ（P. japonicus）の分類学的再検討

三宅隆人, 片山知史

平成26年度日本水産学会東北支部大会　2014/11/07
栽培漁業の復興に向けた遺伝学的アプローチ

宮城県復興協議会研究連絡会　2014/09/02
漁業対象生物等の遺伝的多様性調査-東北大チームの取り組み-

菅野愛美, 南阮植, 安藤大樹, 山崎大志, 木島明博

東北マリンサイエンス拠点形成事業平成25年度全体会議　2014/05/17
血縁関係から評価したヒラメの天然集団と放流用人工種苗の遺伝的多様性

安藤大樹, 菅谷琢磨, 片町太輔, 藤井徹生, 木島明博

平成26年度日本水産学会春季大会　2014/03/27
旧品井沼周辺ため池群に生息するゼニタナゴの遺伝子分析

旧品井沼周辺ため池群のゼニタナゴを復元するために　2014/02/22
ワカサギにおける自然集団の遺伝的分化と創生集団の起源に関する研究

第18回ワカサギに学ぶ会　2014/01/23
身近な水辺に侵入する外来エビの実態

水辺の自然再生「ゆたかな自然を次世代へ」　2013/11/16
IonTorrent PGMを用いたRAD-Seqによるマコガレイの集団遺伝学的解析の試み

峰岸有紀, 原素之, 木島明博

第３回NGS現場の会　2013/09/04
アユの遺伝的多様性の保全ー自然が創った集団・ヒトが創った集団ー

アユ種苗生産技術者会議　2013/09/03
宮城県沿岸域における漁業対象生物等の遺伝的状態調査

東北マリンサイエンス拠点形成事業平成24年度全体会議　2013/06/08
RAD-SeqによるマコガレイゲノムのSNPタイピングの試み

峰岸有紀, 原素之, 木島明博

平成25年度日本水産学会春季大会　2013/03/26
仙台湾における津波後に出生したヒラメ個体群の遺伝的多様性

安藤大樹, 栗田豊, 中根幸則, 木島明博

平成25年度日本水産学会春季大会　2013/03/26
仙台湾における津波後のマコガレイ個体群の遺伝的多様性

中村武, 栗田豊, 中根幸則, 安藤大樹, 峰岸有紀, 木島明博

平成25年度日本水産学会春季大会　2013/03/26
霞ヶ浦北浦におけるワカサギの遺伝的集団構造に関する研究

丹羽晋太郎, Eduardo Graminho, 須能紀之, 荒山和則, 星野貴行, 片山知史

平成25年度日本水産学会春季大会　2013/03/26
シナイモツゴにおける遺伝的多様性の保全

水辺の自然再生よみがえる魚たちⅡ：ゆたかな自然を子どもたちへ　2012/11/03
天然海域でのヒラメ放流種苗のトレースを可能にするDNAマーカーの整備

安藤大樹, 關野正志, 菅谷琢磨, 片町太輔, 藤井徹生, 與世田兼三, 木島明博

平成24年度日本水産学会東北支部大会　2012/11/02
次世代シークエンサーを用いた東北沿岸生物の遺伝的多様性の評価；東北マリンサイエンス拠点形成事業の一環として

峰岸有紀, 池田実, 原素之, 木島明博

平成24年度日本水産学会東北支部大会　2012/11/02
ヒラメ集団のmtDNA鑑定は調節領域の配列情報だけで充分か？

安藤大樹, 關野正志, 菅谷琢磨, 片町太輔, 與世田兼三, 木島明博

平成24年度日本水産学会秋季大会　2012/09/14
宮城県大崎市鹿島台町のため池に導入されたシナイモツゴ集団の遺伝的多様性評価

平瀬祥太朗, 高橋清孝

平成24年度日本水産学会春季大会　2012/03/26
集団ミトゲノム解析により検討したマダカアワビの起源

西迫真登, 木島明博, 原素之

平成24年度日本水産学会春季大会　2012/03/26
壊滅的被害を乗り越えて取り組む遺伝的多様性研究

共同シンポジウム「水辺の自然再生～震災を乗り越える力強い活動～」　2011/11/19
Genetic differentiation and conectivity in the population dynamics of marbled sole International-presentation

Katayama, S, Fujii, T

The 8th International Flatfish Symposium　2011/11/05
東北地方におけるヌカエビ集団の分子系統地理

家口泰道

平成23年度日本水産学会春季大会　2011/03/27
mtDNA15遺伝子のシーケンス分析によるマダカアワビ集団の遺伝的分化

西迫真登, 木島明博, 原素之

平成23年度日本水産学会春季大会　2011/03/27
分類学的に整理されていない「種」の侵入─DNA分析の重要性─

平成22年度日本水産学会東北支部大会ミニシンポジウム「外来生物による水産業と生態系への影響」　2010/11/05
遺伝的多様性をまもるために

共同シンポジウム水辺の自然再生-よみがえる魚たち　2010/10/23
Genetic difference among the sea urchin populations of Strongylocentrotus intermedius with different spawning seasons in northern Japan. International-presentation

Matsui T, Ogasawara M, Nakajima M, Ikeda M, Agatsuma Y

7th European Conference on Echinoderms　2010/10/02
内水面における遺伝的多様性の保全-DNA分析でわかること-

全国湖沼河川養殖研究会第83回大会　2010/09/02
ミトコンドリアDNA分析によるアワビ集団の遺伝的評価

池田実, 原素之, 木島明博

平成22年度日本水産学会春季大会　2010/03/26

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本人の発表
マイクロサテライトDNA分析により検討した十和田湖におけるワカサギ個体群の起源

川島祐一, 池田実, 木村和彦, 片山知史

平成22年度日本水産学会春季大会　2010/03/26

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本人の発表
Coexistence of ectosymbiotic branchiobdellidans (Annelida, Clitellata) and Temnocephalidans (Platyhelminthes, Turbellaria) on atyid shrimps in China International-presentation

Ohtaka, A, M. Nishino, N. Niwa, M. Ikeda, H. Tohyama, Y-D. Cui, H-Z. Wang, Z-Y. Wang, R. Chen

11th International Symposium on Aquatic Oligochaeta　2009/10
Genotyping of Hanasaki crab using DNA extracted from shell tissues: a kind methodology to the large crustaceans International-presentation

Ikeda M, R. Kudo, N. Taniguchi

The Crustacean Society Summer Meeting in Tokyo　2009/09/20

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本人の発表
Invasion and dispersion of alien freshwater shrimps, Neocaridina spp. (Caridea, Atyidae) and its ectosymbionts into Japan. International-presentation

Nishino, M, N. Niwa, M. Ikeda, H. Tohyama

The Crustacean Society Summer Meeting in Tokyo, Japan & the 47thAnnual Meeting of Carcinological Society of Japan　2009/09
Suspected invasion of freshwater atyid shrimp from China into Japan revealed by mitochondrial DNA analysis. International-presentation

Tohyama, H, M. Ikeda, N. Niwa, A. Ohtaka, H. Wang, Y. Cui, Z. Wang, R. Chen, M. Nishino

The Crustacean Society Summer Meeting in Tokyo, Japan & the 47thAnnual Meeting of Carcinological Society of Japan　2009/09

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指導大学院生の発表
Hybrid swarm between two forms of ayu Plecoglossus altivelis unlikely in natural river systems is maintained in a dam reservoir. International-presentation

Ikeda M, Mukada T, Noguchi D, Hatatanaka Y, Imai T, Taniguchi N

10th International Symposium on Genetics in Aquaculture　2009/06/22

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本人の発表
鴨緑江におけるアユ集団の遺伝学的・形態学的特徴

池田実, 佐藤若菜, 董仕, 谷口順彦

平成21年度日本水産学会春季大会　2009/03/27

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本人の発表
両側回遊型ヌマエビにおける日本列島と琉球列島集団間の遺伝的分化

池田実, 相原翔一, 岡本康寿, 斉藤和範

第56回日本生態学会大会　2009/03/17

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本人の発表
mtDNA分析により検討した中国産カワリヌマエビの侵入

遠山裕子, 池田実, 丹羽信彰, 大高明史, H.Wang・Y.Cui, 西野麻知子

日本生態学会　2009/03

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指導大学院生の発表
外来のカワリヌマエビ属の侵入・分布拡大プロセスと在来種との関係

西野麻知子, 丹羽信彰, 池田実, 遠山裕子, 大高明史

日本生態学会　2009/03
東京湾および伊勢・三河湾におけるマコガレイの遺伝的変異性と過去の個体群動態の検討

池田実

東京湾研究会　2009/02/20

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本人の発表
Cryptic invasion of decapods crustacean International-presentation

5th World Fisheries Congress　2008/10/20
Use of environmental and genetic keys for fish traceability. International-presentation

Katayama S, Ikeda M, Kimura K

5th World Fisheries Congress　2008/10/20
Genetic population structure of the clams Ruditapes philippinarum and R. bruguieri in Japan, China and the Korean Peninsula estimated by allozyme analysis. International-presentation

Vargas K, Asakura Y, Taniguchi N, Obata Y, Hamasaki K, Tsuchiya K, Kitada S

5th World Fisheries Congress　2008/10/20
ハナサキガニにおける甲殻組織からのDNAタイピング

工藤良二, 谷口順彦

2008年度日本水産学会春季大会　2008/03/27
北海道太平洋沿岸におけるワカサギは移殖由来か？-AFLP分析による検討-

橋本昭彦, 片山知史

2008年度日本水産学会春季大会　2008/03/27
Population genetic study pf spiny king crab (Paralithodes brevipes): relationship between oceancurrent and patterns of stock structure International-presentation

International Workshop in the Faculty of Agricultural Science and Field Science Center in Tohoku University 2008, Sustainable Yield and Population Conservation for Marine Organisms from the Point of View of Genetic Resources　2008/03/20
水産生物における「集団」をあらためて考える -集団解析におけるDNAマーカーの効用と問題-

第一回海洋生物育種工学研究会シンポジウム-水産増養殖における遺伝資源の利用と保全のあり方を考える-　2007/12/22
系統情報から探る移殖の実態

生態系をベースとした水産資源の増殖　2007/07/19
中国南部におけるアユ集団の遺伝学的・形態学的評価

佐藤若菜, 王志勇, 集美大, 陳少波, 浙江省海洋水研, 董仕(天津師範大, 谷口順彦

2007年度日本水産学会春季大会　2007/03/27
Practical exercise of intraspecies diversity analysis of mtDNA sequence data using computer programs International-presentation

MeREM International Workshop and Training on Fish Diversity of Mekong River　2006/11
ハナサキガニにおけるmtDNA 調節領域の同定と配列情報から調べた遺伝的構造

池田実, 吉村友香理, A.Barinova, D.Galanin, 谷口順彦

第９回マリンバイオテクノロジー学会　2006/05/27
諏訪湖におけるワカサギ集団の遺伝的組成-移殖は成功しているか-

片山知史, 本西晃, 長, 谷口順彦

平成18年度日本水産学会大会　2006/03/29
水産生物における集団構造解析-ボトムアップとトップダウン-

第３回最先端動物遺伝育種セミナー　2005/11/17
ワカサギ個体群の遺伝的分化-中国産ワカサギの由来の検討も含めて-

片山知史, 中野俊樹, 白川仁, 北大, 木村和彦

平成17年度日本水産学会東北・北海道支部合同大会　2005/11/04

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東北支部長賞を受賞した。
ダム湖に導入されたアユ集団の遺伝的多様性と由来

2005年度日本魚類学会年会シンポジウム「分子マーカーによる魚類の集団遺伝学的研究の近年の発展-系統・種分化研究から希少種の保全まで-」　2005/09/22
DNA 分析によるハナサキガニ集団の遺伝的多様性と集団構造

宇山博人, Dmitry A. Galanin(サフニロ, Anna Barinova, 鈴木重則, 谷口順彦

第８回マリンバイオテクノロジー学会　2005/05/28
中国南部におけるアユ集団の保全遺伝学的位置付け

陳少波, 浙江省海洋水研, 谷口順彦

2005年度日本水産学会大会　2005/03/31
アユ種苗の継代数と遺伝的多様性の関係-マイクロサテライトとミトコンドリアDNAマーカーによるモニタリング-

谷口順彦

平成16年度日本水産学会東北支部大会　2004/11/06
核DNAおよびミトコンドリアDNAマーカーによる魚類の集団遺伝学−アユの集団解析の事例から−

谷口順彦

第7回マリンバイオロジー学会大会一般シンポジウム「水産生物における分子集団遺伝学的研究の展開」　2004/06/17
ミトコンドリアDNAのシーケンス分析によるアユ島嶼集団の遺伝的類縁関係

堀江源, 東北大院農, ハンヒョンソブ, 西, 谷口順彦

2004年度日本水産学会大会　2004/04/01
マイクロサテライトDNA分析によるアユ継代種苗の遺伝的変異性

高木秀蔵, 堀江源, 谷口順彦

2004年度日本水産学会大会　2004/04/01

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Industrial Property Rights 3

害敵水生々物殺滅用部材及び後付型殺滅装置並びに養殖設備

木島明博, 小濱泰昭, 池田実, 栗田喜久, 千葉郁雄, 菅野哲也

特許6468541

Property Type: Patent
害敵水生々物殺滅用の多孔ノズル

木島明博, 小濱泰昭, 池田実, 栗田喜久, 千葉郁雄, 菅野哲也

特許6399529

Property Type: Patent
害敵水生々物殺滅用の多孔ノズル

木島明博, 小濱泰昭, 池田実, 栗田喜久, 千葉郁雄, 菅野哲也

特許6230738

Property Type: Patent

Research Projects 16

Environmental monitoring and marine ecosystem modelling of a coastal socio-ecological system on the Sanriku Coast

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2023/04/01 - 2027/03/31
Population genomics of two congeneric flatfish species having contrasting egg traits Competitive

Ikeda Minoru

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Institution: Tohoku University

2019/04 - 2022/03

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Although marbled and yellow striped flounders belong to the same genus, the two species exhibit contrasting egg traits: adhesive demersal eggs in the former and isolated pelagic eggs in the latter. This difference in egg traits should be reflected in the population genetic structure within the species. To examine this prediction, population genomic analyses were conducted on both species sample populations collected from the coast of Japan. The mitogenomic analysis revealed that highly genetic differentiation occurred among marbled flounder populations, divided into seven local groups. In contrast, the populations of yellow striped flounder were homogeneous. The results of RAD-Seq analysis using more than 20,000 SNPs in the nuclear genome were consistent with those of the mitogenomic analysis, aside from the detection of weak differentiation among the yellow striped populations. These results support the prediction that differences in egg traits affect the genetic population structure.
Construction of pasturing system for sustainable water environment in Mongolia

Nakai Yutaka, TADA Chika, YOSHIHARA You, YONEZAWA Chinatsu, TAJIMA Ryosuke, IKEDA Minoru

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Tohoku University

2012/04/01 - 2016/03/31

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The effects of water quality in the Tuul River in Mongolia on the genetic diversity of fish and animal health were investigated. The water in the Tuul River was more polluted downstream. In 2014, very high numbers of Escherichia coli were detected in well water. Pathogenic E. coli was detected in animal feces. Sheep and goats had high carriage rates. Cryptosporidium was detected in cattle feces and river water. In 2015, the numbers of E coli in well water decreased after changing the well structure. Sheep that drank water downstream had a higher rate of pathogenic E. coli infection. The genetic diversity of fish was similar to that of fish in Lake Baikal. Satellite image analysis showed that vegetation was better farther from roads. The regulation of well construction and the use of pastures may make the pasturing environment sustainable.
エコゲノミクスで創るヒラメ資源の管理と放流システム Competitive

System: Grant-in-Aid for Scientific Research

2014/04 - 2016/03
アユの地域適応遺伝子と飼育適応遺伝子の探索 Competitive

System: Grant-in-Aid for Scientific Research

2012/04 - 2014/03
日本沿岸におけるアワビ属の分子系統地理と保全単位の設定 Competitive

System: Grant-in-Aid for Scientific Research

2009/04 - 2011/03
The genetic relations between the abalone close species based on molecule ecology

HARA Motoyuki, IKEDA Minoru, KIJIMA Akihiro

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Institution: Fisheries Research Agency

2009 - 2011

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In the relation of the four species, Haliotis discus hannai, H. d. discus, H. madaka and H. gigantes, H. gigantes had a solid boundary between the other three species. Next, the clade of H. madaka belonged to the clade of H. gigantes, and it was derived from near the root, suggesting that H. madaka arose in crossing of Haliotis discus species and H. gigante. The results of genetic relations using a microsatellite and mitochondrial DNA were different and this inconsistency was found also between local populations. It was considered to be the difference from the rate of evolution and adaptation to environment nature, and it was guessed that specialization originated in various historical events instead of one way.
外来個体群の侵入・分散に伴う淡水エビ類の遺伝子汚染と共生システムの撹乱 Competitive

NISHINO Machiko, OHTAKA Akifumi, IKEDA Minoru, YAMATO Sigeyuki, KAWAKATSU Masaharu, NIWA Nobuaki, WANG Hong-Zhu, CUI Yong-De, WANG Zhi-Young, CHEN Rong-Bin, CHEN Rung-Tsung, WU Shi-Kuei, PONCE Leonrodrigo, VOLONTERIO Odile

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grant-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Institution: Lake Biwa Environmental Research Institute

2007/04 - 2010/03

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Recent invasion of taxonomically unsettled atyid shrimp Neocaridina spp. from China into Japan has been suspected through the import as fishing bait. To elucidate this suspicion, the shrimps and their symbionts were collected and analyzed both from Japan and China. Two major haplotype clades were found for Neocaridina spp., based on the sequenced partial CO I and 16SrRNA genes of the mtDNA. Clade I was composed of the haplotypes detected only from Japan, while Clade II was composed of those observed from both countries. Clade II included the haplotypes with identical or few nucleotide differences between Japan and China. This indicates that Clades I and II are assigned to the indigenous lineage in Japan (i.e., N.denticulata denticulata) and the exotic ones from China, respectively. These facts suggest that invasion of Neocaridina spp. from China into Japan has really occurred. In four localities of Japan, the two clades were observed sympatrically, implying the genetic pollution through hybridization or introgression between indigenous and exotic populations. Together with the hearing investigation from exporters and importers of the shrimps, exotic Neocaridina spp. were supposed to have been introduced from the northern and middle part of China, and the symbiotic branchiobdellidan, H. truncatus, recently recorded in central Japan from the middle part of China.
分子生態学的アプローチによるワカサギにおける生活史分岐の実態解明 Competitive

IKEDA Minoru, KATAYAMA Satoshi

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grant-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Institution: Tohoku University

2007/04 - 2010/03

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To elucidate whether genetic differentiation has occurred between the two life history forms (anadoromous and resident) of Japanese pond smelt ( Hypomesus nipponensis) in the Ogawara Lake (Aomori Prefecture, Japan), we examined nuclear microsatellite and mitochondrial DNA analyses for the two form samples classified by Sr : Ca ratio in the otolish, based on comparison with another natural populations inhabit Japanese coastal lagoons. 1) Remarkable genetic differentiation was detected among the natural populations and diagnostic genotypes were observed in each population, suggesting that the natural populations of Japanese pond smelt have been differentiated geographically (probably since last glacial period) and should be regarded as the evolutionary significant units (ESUs). 2) Significant genetic differentiation was not observed between the two life history forms in Ogawara Lake for neither mitochondrial nor microsatellite DNA analyses. This result implicates that two life history forms occur in single gene pool of pond smelt in the lake.
ハナサキガニ資源の遺伝的多様性と集団構造に関する研究 Competitive

System: Funded Research

2004/03 - 2009/03
Study on simulation of minimal kinship selective breeding for conservation of genetic diversity in successive artificial bred lines in fish

TANIGUCHI Nobuhiko, NAKAJIMA Masamichi, IKEDA Minoru

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

2006 - 2007

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In the fish seed production industry, seed populations with high value of inbreeding coefficient are usually produced because the seeds are reproduced using smaller effective size of brood stock. The genetic changes caused by random genetic drift, inbreeding depression, unconscious selection happened in such inbreeding population may give un-restorable effects on wild population. In this project, we tried to evaluate genetic changes happened in the artificially reproduced seed population for stock enhancement programs of economically important fish species to find up way for genetic management to conserve wild populations based on following actions : 1) to develop efficient genetic markers such as DNA polymorphism 2) to accumulate the genetic data of population structure and diversity of both the wild and artificially propagated populations 3) to develop a simulator to generate genotypes of offspring using genetic data of brood stock in artificial seed production 4) to develop a simulator to perform minimal kinship selective breeding for conservation of genetic diversity in the brood stock and wild population 5) to make guideline for seed production to preserve genetic diversity in the brood stock and wild population The fish species used were representative species from aquacultured species, stock enhanced species and endangered species, such as barfin flounder Verasper moserz; Mekong gigantic catfish Pangasianodon gigas, and sakuramasu Oncorhynchus masou. We collected genotype data of DNA markers for the population genetic analysis and simulation studies for these fishes. Using the soft wares developed in this project for minimal kinship selective breeding, the optimum conditions for selection were examined by repetitive virtual reproduction trials for 30 generations. We found the best condition to conserve the genetic variation being equivalent level of the average number of alleles, and heterozygosity observe in the wild population. This method were useful to conserve the enough level of genetic divergence of brood stock in each species, even if the effective size of brood stock are not enough being less than minimum viable size of population (Ne=50).
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究 Competitive

System: Funded Research

2000/04 - 2005/03
Studies on population genetic informatics and conservation genetics in fish culture and stock enhancement by computer simulation

TANIGUCHI Nobuhiko, NAKAJIMA Masamichi, IKEDA Minoru

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: Tohoku University

2003 - 2005

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The management strategy of broodstock must be important in the sustainable production of seed fish not only for aquaculture but also for stock enhancement program where the artificially produced seed fish for release is required to be genetic equivalency with the wild population. In this study, several problems related with conservation of genetic divergence in wild population and broodstock were targeted to obtain useful information concerning with production of qualified seed fish and maintaining appropriate level of genetic divergence which were evaluated by the DNA markers such as microsatellite (MS) and mtDNA polymorphis. Using genotype data of founder stock, the genetic changes in 30^<th> generations were estimated by such indicators of the average number of marker alleles and heterozygosity based on computer simulation. The broodstock management system assisted by DNA markers was also proposed to make a genetically healthy fish seed for aquaculture and to perform the genetically responsible stock enhancement activity.
リュウキュウアユ集団の変動史究明と絶滅リスク評価 Competitive

System: Grant-in-Aid for Scientific Research

2002/04 - 2004/03
A study of genetic management of fish population and genetic diversity used micro satellite DNA markers

TANIGUCHI Nobuhiko, TAKAGI Motohiro, IKEDA Minoru, NAKAJIMA Masamichi

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: Tohoku University

2000 - 2002

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Following species were examined for the research experiment of genetic divereity in fishes, Ayu and Masu salmon as representative natural population, Koi carp as representative ornamental fish, Surf fish as representative viviparous fish, Guppy as experimental fish, and Ryukyu-Ayu and Matsukaws as endangered species. In these species, microsatellite DNA markers were developed to evaluate genetic diversity. Genetic characteristics such as genetic variability and differences were measured in each species used microsatellite DNA markers. The reduction of genetic diversity calculated from average heterozygosity in cultured populations were observed as the results of inbreeding. From the estimation of effective size of population in each cultured population and seed population for release, the degree of emergency could be estimated in the population of the endangered species. The influence of inbreeding to the population were estimated and methods of remediation was proposed. From the simulation of cross experiment based on the genotype data of parent population, the methods for the genetic remediation in endangered species and conservation of genetic diversity were also proporsed.
Study for the Conservation of Aquatic Organisms as Genetic Resources

FUJIO Yoshihisa, IKEDA Minoru, NAKAJIMA Masamichi, KIJIMA Akihiro

Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

System: Grants-in-Aid for Scientific Research

Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Institution: Tohoku University

1996 - 1998

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For conservation of aquatic organisms, genetic diversity in natural and cultured populations. The results are summarized as follows : 1) Genetic divergence is dependent on geographical distribution with reproductive isolation. 2) The cultured populations are genetically more diversified than the natural populations. 3) The amount of genetic variation as measured by average heterozygosity shows that (1) different species have significantly different amount of genetic variation, (2) populations within a species have remarkably similar levels of heterozygodity, and (3) management procedure for culture have resulted in the loss or increase of genetic variation in each cultured population. 4) Although, the recessive deleterious alleles in stoch of homozygotes are eliminated by natural selection, they are mostly present in the state of heterozygotes within a population.

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Social Activities 33

ミステリークレイフィッシュについての解説

ひめポン！

2025/07/23 - 2025/07/23
湖面の氷の穴から噴き出す魚についての解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2025/01/15 - 2025/01/15
池で撮影されたユニークな行動を示す生物についての解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2024/07/31 - 2024/07/31
川で撮影された正体不明の「生き物」についての解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2024/07/31 - 2024/07/31
メダカ水槽に出現した正体不明の魚の解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2023/02/15 - 2023/02/15
ワカサギについての情報提供

ギョギョッとサカナ★スター「ワカサギ」

2022/06/19 - 2022/06/19
デンキウナギの解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2022/06/08 - 2022/06/08
変わった模様のメダカについて資料提供

世界の何だコレ！？ミステリー

2022/01/26 - 2022/01/26
魚類の頭部に生えた藻類についての解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2021/09/08 - 2021/09/08
「あじ島冒険楽校」

2021/07/23 - 2021/07/23
サケの遡上についての情報提供

世界の何だコレ！？ミステリー

2021/02/10 - 2021/02/10
ハクレンの解説

世界の何だコレ！？ミステリー

2020/09/30 - 2020/09/30
「あじ島冒険楽校」

2020/07/23 - 2020/07/24
市民と農民が取り組むシナイモツゴとゼニタナゴの保全

2011/11/19 - 2020/03/31

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シナイモツゴやゼニタナゴの生息環境保全・整備および遺伝的多様性に配慮したゼニタナゴの保全に取り組む。同時に、既存の保護体制をさらに強化して、絶滅危惧種の生息池を継続して保全・拡大し、旧品井沼周辺ため池群の生態系復元を目指す。
ミステリークレイフィッシュに関する情報提供

世界まる見え!テレビ特捜部

2020/01/11 - 2020/01/11
復興支援インターン

2015/09/07 - 2015/09/12

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復興庁ならびに復興大学災害ボランティアステーションが主催する学生のための復興支援インターンプログラム
女川町復興支援インターンプロジェクト

2015/02/23 - 2015/02/28

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復興庁・復興大学が主催する女川町復興支援インターンプロジェクトをサポート。
八戸市水産科学館マリエントにおける地域固有メダカの展示

2011/09/15 - 2011/10/31

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DNA分析手法の指導ならびにその結果を監修し、展示説明に対する協力を行った。
高校生実習への参画

2010/06/24 - 2010/06/25

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仙台向山高校理数科1年生野外巡検において、沿岸岩礁域における生物多様性調査実習を行った。
福島県科学技術教育推進事業東北大高大連携企画

2009/10/31 - 2009/11/01

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福島県安積高校の生徒１５名ならびに教員１名を受け入れ、臨海実習を行った。
サイエンス・パートナーシップ・プロジェクト（SPP）への参画

2009/07/10 - 2009/07/11

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宮城第一高校の生徒15名ならびに教員2名を受入れ、海洋生物実習を行った（分担）。
夢ナビライブWeb WEEK 東京

2020/10/23 -
夢ナビライブWeb WEEK 福岡

2020/10/13 -
夢ナビライブWeb WEEK 仙台

2020/10/03 -
夢ナビライブ

2020/09 -
ごはんジャパン「寿司職人の憧れ閖上赤貝」

2017/12/16 -
宮城県高等学校理科教育研究会

2014/09/16 -

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宮城県高校理科教員の研修会において「タラバガニとアブラガニのDNA分析」に関する講演と実験を担当した。
宮城県高等学校理科教育研究会石巻支部会

2014/08/22 -

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宮城県高校理科教員石巻支部会の研修会において「タラバガニとアブラガニのDNA分析」に関する講演と実験を担当した。
出張講義

2012/12/07 -

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宮城県立泉高等学校１年生46名を対象として「水産生物のDNA分析：遺伝的多様性研究による地域貢献」と題する出張講義を行った。
Japan disaster. Picking up the pieces at ravaged Tohoku University

2011/07 -
第17回海生センターセミナー

2010/03/14 -

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一般市民に対する研究内容の紹介
NPO 法人シナイモツゴ郷の会学習会

2009/04/25 -

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NPO法人シナイモツゴ郷の会会員に対して、附属複合フィールド教育研究センター（女川）の施設紹介ならびに講演を行った。
第16回海生センターセミナー

2009/03/14 -

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一般市民に対する研究内容の啓蒙的講演

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Media Coverage 42

保全活動の先進例視察 -経団連自然保護協が大崎へ-

大崎タイムス

2024/09/07

Type: Newspaper, magazine
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

河北新報

2022/04/02

Type: Newspaper, magazine
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

神戸新聞NEXT

2022/02/24
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

山形新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

富山新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

中国新聞デジタル

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか -「極めて希少」保全訴え

琉球新報デジタル

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

山陽新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

沖縄タイムスプラス

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか

神奈川新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

北海道新聞どうしん電子版

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか

茨城新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」ー保全訴え

徳島新聞電子版

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか

福島民報

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか-

新潟日報デジタルプラス

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビかー「極めて希少」保全訴え

奈良新聞デジタル

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか- 「極めて希少」-保全訴え

高知新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」-保全訴え

北國新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか- 「極めて希少」保全訴え

秋田魁新報電子版

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え、遺伝的に特異な分化遂げたグループと確認

日刊スポーツ

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

福井新聞ONLINE

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか?

千葉日報オンライン

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか ?「極めて希少」保全訴え

熊本日日新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか ,「極めて希少」,保全訴え

中日新聞WEB

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか、「極めて希少」保全訴え

Web東奥

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」、保全訴え

京都新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか東北大発見絶滅リスク高く、保全訴え

毎日新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

東京新聞

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

産経ニュース

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか

西日本新聞

2022/02/24

Type: Newspaper, magazine
奄美のスジエビ、本土と別種か東北大研究チーム

南海日日新聞

2022/02/24

Type: Newspaper, magazine
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

共同通信

2022/02/24

Type: Internet
奄美で新種スジエビか「極めて希少」保全訴え

河北新報オンラインニュース

2022/02/22

Type: Internet
奄美大島のスジエビは固有種の可能性瀬戸内・嘉徳川で発見

南日本新聞

2022/02/21

Type: Newspaper, magazine
瀬戸内町嘉徳川のスジエビ奄美大島の固有種か東北大研究

NHK鹿児島　情報WAVEかごしま

2022/02/18

Type: TV or radio program
シナイモツゴ保全考える

大崎タイムズ

2019/02/26

Type: Newspaper, magazine
シナイモツゴ保護活動に学ぶ

毎日新聞

2019/02/26

Type: Newspaper, magazine
八戸のメダカは地域固有

デーリー東北

2011/09/17

Type: Newspaper, magazine
Japan disaster. Picking up the pieces at ravaged Tohoku University

Science 333: 153-155, 2011

2011/07

Type: Other
網走湖のワカサギ卵全国区

北海道新聞

2009/02/20

Type: Newspaper, magazine
知床の花咲ガニ起源はサハリン

毎日新聞（北海道・函館面）

2008/02/04

Type: Newspaper, magazine
花咲ガニ遺伝的違い確認

読売新聞（道総合面）

2008/02/04

Type: Newspaper, magazine

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ヒラメの種苗、親魚、漁獲物の遺伝的関係の調査

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DNA分析による血縁鑑定により、ヒラメ人工種苗の遺伝的状態、放流後の移動、再生産の有無について調査を行う。
大村湾におけるホシガレイ人工種苗の放流効果に関する遺伝学的研究

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大村湾における栽培漁業重要種であるホシガレイについて、人工種苗ならびに親魚集団の遺伝的モニタリングを行い、放流効果の推定を試みる。
ヒラメの種苗、親魚、漁獲物の遺伝的関係の調査

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DNA分析による血縁鑑定により、ヒラメ人工種苗の遺伝的状態、放流後の移動、再生産の有無について調査を行う。
大村湾におけるナマコ人工種苗の放流効果に関する遺伝学的研究

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長崎県大村湾で放流されたナマコ人工種苗を識別しうるDNA分析手法を開発し、その放流効果について検証する。
ヒラメの種苗、親魚、漁獲物の遺伝的関係の調査

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ヒラメ人工種苗、その親魚集団、漁獲物のDNA分析を行い、天然集団の遺伝的多様性に配慮した種苗生産の方法並びに放流の方法について提言を行う。
神奈川県におけるヒラメ人工種苗とその親魚集団の遺伝的多様性解析

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神奈川県におけるヒラメの人工種苗とその親魚集団のDNA分析を行い、親子鑑定も含めて遺伝的多様性について評価する。
平成26年度種苗放流による資源造成支援委託事業

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本事業は、複数の都道府県の漁業者が利用する資源であって、早急な回復・安定が求められており、関係者間の調整が困難なものについて、期間を限定した集中的な種苗放流を行うことにより、従来のような放流した種苗を成長後にすべて漁獲する「一代回収型」に加えて、親魚を獲り残して再生産を確保する「資源造成型」栽培漁業を推進するための研究開発を行うことを目的とする。この種苗性評価手法の研究開発により、資源に対する放流魚の再生産寄与率を遺伝子情報を用いた手法で推定する技術が開発され、当該技術が全国の民間の種苗生産施設で活用されることにより、放流種苗の再生産効果の実証ひいては資源造成型栽培漁業の推進が図られることとなる。
北の海に未知なる生命と生物多様性を探る

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次世代シーケンサーを活用した環境DNA分析により、北部太平洋における海洋生物多様性（特に魚類）を明らかにする。
平成25年度種苗放流による資源造成支援委託事業

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本事業は、複数の都道府県の漁業者が利用する資源であって、早急な回復・安定が求められており、関係者間の調整が困難なものについて、期間を限定した集中的な種苗放流を行うことにより、従来のような放流した種苗を成長後にすべて漁獲する「一代回収型」に加えて、親魚を獲り残して再生産を確保する「資源造成型」栽培漁業を推進するための研究開発を行うことを目的とする。この種苗性評価手法の研究開発により、資源に対する放流魚の再生産寄与率を遺伝子情報を用いた手法で推定する技術が開発され、当該技術が全国の民間の種苗生産施設で活用されることにより、放流種苗の再生産効果の実証ひいては資源造成型栽培漁業の推進が図られることとなる。
アカガイの高効率複合生産システムによるグローバル増養殖産業の開発

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東日本大震災前までアカガイの水揚げ日本一を誇っていた名取市閖上地区の復興に寄与すべく、水産に関する東北大学の高いレベルの基礎研究と中国における海洋科学技術の進歩に中心的な役割を果たしている中国海洋大学（山東省青島市）が持つ養殖技術、さらに養殖装置開発に高いノウハウを持つ（株）晃和工業（石巻市）が連携することで、アカガイの効率的な養殖技術を確立し、大震災からの産業復興・新生に貢献することを目標に立ち上げた。中国海洋大学の実証フィールド等も用いながら技術開発を進め、人工的な稚貝生産から漁場への放流、さらに、内陸養殖技術開発等の複合的なシステム開発に取り組む。
平成24年度種苗放流による資源造成支援委託事業

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本事業は、複数の都道府県の漁業者が利用する資源であって、早急な回復・安定が求められており、関係者間の調整が困難なものについて、期間を限定した集中的な種苗放流を行うことにより、従来のような放流した種苗を成長後にすべて漁獲する「一代回収型」に加えて、親魚を獲り残して再生産を確保する「資源造成型」栽培漁業を推進するための研究開発を行うことを目的とする。この種苗性評価手法の研究開発により、資源に対する放流魚の再生産寄与率を遺伝子情報を用いた手法で推定する技術が開発され、当該技術が全国の民間の種苗生産施設で活用されることにより、放流種苗の再生産効果の実証ひいては資源造成型栽培漁業の推進が図られることとなる。
平成23年度種苗放流による資源造成支援委託事業

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本事業は、複数の都道府県の漁業者が利用する資源であって、早急な回復・安定が求められており、関係者間の調整が困難なものについて、期間を限定した集中的な種苗放流を行うことにより、従来のような放流した種苗を成長後にすべて漁獲する「一代回収型」に加えて、親魚を獲り残して再生産を確保する「資源造成型」栽培漁業を推進するための研究開発を行うことを目的とする。この種苗性評価手法の研究開発により、資源に対する放流魚の再生産寄与率を遺伝子情報を用いた手法で推定する技術が開発され、当該技術が全国の民間の種苗生産施設で活用されることにより、放流種苗の再生産効果の実証ひいては資源造成型栽培漁業の推進が図られることとなる。
東南アジアにおける重要水産資源の生産と種苗放流に関する集団遺伝学的研究

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東南アジアにおいて重要な水産資源であるアワビ類ならびにノコギリガザミ類の野生集団と人工種苗集団の遺伝的多様性調査を行い、種苗生産や放流の方法を含めた遺伝的多様性維持のための方策について検討する。
絶滅危惧種シナイモツゴの復元のための保全遺伝学的研究

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絶滅危惧種であるシナイモツゴの遺伝的多様性を確保する上で重要な近親交配回避のシステムをDNAマーカーを利用して考案する。
ハナサキガニ資源の遺伝的多様性と集団構造に関する研究5.「2008年度根室ワークショップ第7回ハナサキ・プログラム・ワークショップ開催報告書」, 根室市ハナサキ・プログラム推進委員会, pp. 56-74.
Genetic diversity and population structure of Hanasaki crab V. In “Proceedings of SakhNIRO/Nemuro Joint Workshop for Report and Discussion on Progress in FY2008 and Future Plan of Joint Study on Hanasaki Crab", Committee for Nemuro City Hanasaki Program, Nemuro, pp. 62-79.
東京湾におけるマコガレイの遺伝的特性評価

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「江戸前ガレイ」として知られる東京湾のマコガレイについて集団遺伝学的観点から資源評価を行い、将来のブランド化に向けてバックボーンとなる生物学的知見を提示する。
ハナサキガニ資源の遺伝的多様性と集団構造に関する研究4.「2007年度根室ワークショップ第6回ハナサキ・プログラム・ワークショップ開催報告書」, 根室市ハナサキ・プログラム推進委員会, pp. 4-10.
Genetic diversity and population structure of Hanasaki crab IV. In “Proceedings of SakhNIRO/Nemuro Joint Workshop for Report and Discussion on Progress in FY2007 and Future Plan of Joint Study on Hanasaki Crab”, Committee for Nemuro City Hanasaki Program, Nemuro, pp. 5-11.
ハナサキガニ資源の遺伝的多様性と集団構造に関する研究3.「2006年度根室ワークショップ第５回ハナサキ・プログラム・ワークショップ開催報告書」, 根室市ハナサキ・プログラム推進委員会, pp. 6-14.
Genetic diversity and population structure of Hanasaki crab III. In “Proceedings of SakhNIRO/Nemuro Joint Workshop for Report and Discussion on Progress in FY2006 and Future Plan of Joint Study on Hanasaki Crab”, Committee for Nemuro City Hanasaki Program, Nemuro, pp. 7-14.
日本および中国沿岸におけるコウイカ集団の遺伝的多様性と集団構造の解明

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日本ならびに中国において重要な水産資源の一つであるコウイカのDNAマーカーを開発し、その遺伝的多様性と集団構造を検討する。
東京湾におけるアサリの集団構造と外国産アサリの遺伝子浸透に関する解析

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東京湾におけるアサリの集団構造をアロザイム分析により推定し、中国や朝鮮半島からの種苗の再生産の寄与について集団遺伝学的に検討を行う。
Genetic diversity and population structure of Hanasaki crab II. In “Proceedings of SakhNIRO/Nemuro Joint Workshop for Report and Discussion on Progress in FY2005 and Future Plan of Joint Study on Hanasaki Crab”, Committee for Nemuro City Hanasaki Program, Nemuro, pp. 38-43.
絶滅危惧種イトウのDNAマーカーの開発

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絶滅危惧種であるイトウのDNAマーカーを開発し、遺伝的管理の一助とする。
太平洋およびインド洋におけるカツオ集団の遺伝的構造の検討

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重要な水産資源の一つであるカツオの遺伝的集団構造をDNAマーカーにより検討する。
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究．「健全な内水面生態系復元推進事業報告書（アユの遺伝的多様性保全指針作成調査）」, 水産総合研究センター養殖研究所, 三重, pp.75-109.
ハナサキガニ資源の遺伝的多様性と集団構造に関する研究2.「2005年度根室ワークショップ第４回ハナサキ・プログラム・ワークショップ開催報告書」, 根室市ハナサキ・プログラム推進委員会, pp. 31-36.
Genetic diversity and population structure of Hanasaki crab I. In “Proceedings of SakhNIRO/Nemuro Joint Workshop for Report and Discussion on Progress in FY2004 and Future Plan of Joint Study on Hanasaki Crab”, Committee for Nemuro City Hanasaki Program, Nemuro, pp. 5-11
Phylogeny of Paralithodes: DNA discrimination of P. camtschaticus and P. platypus. In “Proceedings of SakhNIRO/Nemuro Joint Workshop for Report and Discussion on Progress in FY2004 and Future Plan of Joint Study on Hanasaki Crab”, Committee for Nemuro City Hanasaki Program, Nemuro, pp. 12-14.
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究．「平成15年度アユの遺伝的多様性保全指針作成調査事業報告書」, 水産総合研究センター養殖研究所, 三重, pp.31-33.
ハナサキガニ資源の遺伝的多様性と集団構造に関する研究2.「2004年度根室ワークショップ第3回ハナサキ・プログラム・ワークショップ開催報告書」, 根室市ハナサキ・プログラム推進委員会, pp. 6-12.
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究．「平成14年度内水面重要種資源増大対策委託事業（アユの遺伝的多様性保全指針作成調査）報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp.37-41.
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究．「平成13年度内水面重要種資源増大対策委託事業（アユの遺伝的多様性保全指針作成調査）報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp.35-38.
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究．「平成12年度内水面重要種資源増大対策委託事業（アユの遺伝的多様性保全指針作成調査）報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp. 29-31.
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アユのマイクロサテライトDNA多型およびミトコンドリアDNA DループのPCR-RFLP検出マニュアル．「平成12年度内水面重要種資源増大対策委託事業（アユの遺伝的多様性保全指針作成調査）報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp. 35-58.
DNA多型マーカーを利用したアユの集団構造と遺伝的多様性評価に関する研究．「健全な内水面生態系復元推進事業報告書（アユの遺伝的多様性保全指針作成調査）」, 水産総合研究センター養殖研究所, 三重, pp.75-109.
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ヒラメの自然集団及び人工種苗の遺伝的多様性評価. 「水産生物の遺伝的多様性の評価及び保存に関する技術マニュアル」（水産庁依託漁業新技術開発試験事業平成6-10年度総合報告書）, 日本水産資源保護協会, 東京, pp. 19-40.
ヒラメ集団の遺伝的多様性に対する適正評価手法の開発. 「平成9年度水産生物の遺伝的多様性の保存及び評価手法の開発事業報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp. 60-72.
ヒラメ集団の遺伝的多様性に対する適正評価手法の開発. 「平成8年度水産生物の遺伝的多様性の保存及び評価手法の開発事業報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp. 67-77.
ギンザケの形質に関与する遺伝特性の解明.「平成8年度新品種作出基礎技術開発事業研究成果の概要」, 水産庁資源生産推進部研究指導課, 東京, pp. 298-307.
ヒラメ集団の遺伝的多様性に対する適正評価手法の開発. 「平成7年度水産生物の遺伝的多様性の保存及び評価手法の開発事業報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp.66-75.
ヒラメ集団の遺伝的多様性に対する適正評価手法の開発. 「平成6年度水産生物の遺伝的多様性の保存及び評価手法の開発事業報告書」, 日本水産資源保護協会, 東京, pp.51-59.

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