東北大学研究者紹介 - 大久保　智司

研究者詳細

ホーム

日本語 English

顔写真

オオクボ　サトシ

大久保　智司

Satoshi Ohkubo

所属

大学院生命科学研究科　生態発生適応科学専攻　土壌微生物分野

職名

特任助教（研究）

学位

博士（人間・環境学）（京都大学）

researchmap

https://researchmap.jp/sutegoma_a

J-GLOBAL ID

201801002599122690

経歴 9

2022年4月～継続中

東北大学　大学院生命科学研究科　特任助教
2022年1月～ 2022年3月

東北大学　大学院生命科学研究科
2021年4月～ 2021年12月

東北大学　大学院生命科学研究科　学術研究員
2019年10月～ 2021年3月

東京農工大学　大学院農学府　産学官連携研究員
2017年10月～ 2019年9月

東京農工大学　グローバルイノベーション研究院　産学官連携研究員
2016年4月～ 2017年9月

京都大学　大学院農学研究科　産学官連携研究員
2013年5月～ 2016年3月

埼玉大学　大学院理工学研究科　産学官連携研究員
2009年8月～ 2013年3月

京都大学　大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻　研究員
2009年4月～ 2009年7月

京都大学　大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻　研修員

︎全件表示 ︎最初の5件までを表示

学歴 4

京都大学　大学院人間・環境学研究科　相関環境学専攻

2006年4月～ 2009年3月
京都大学　大学院人間・環境学研究科　相関環境学専攻

2004年4月～ 2006年3月
京都大学　総合人間学部　自然環境学科

2002年4月～ 2004年3月
京都大学　工学部　地球工学科

2000年4月～ 2002年3月

所属学協会 6

日本土壌肥料学会

2021年9月～継続中
日本作物学会

2016年8月～継続中
日本植物生理学会

2014年3月～継続中
日本光合成学会

2011年5月～継続中
日本藻類学会

2005年3月～継続中
日本微生物生態学会

2004年10月～継続中

︎全件表示 ︎最初の5件までを表示

研究キーワード 9

市民科学
一酸化二窒素
土壌微生物
イネ
藻類
環境応答
シアノバクテリア
光合成
微生物生態学

研究分野 3

ライフサイエンス / 植物分子、生理科学 /
環境・農学 / 作物生産科学 /
ライフサイエンス / 生態学、環境学 /

論文 25

Genetic design of soybean hosts and bradyrhizobial endosymbionts reduces N2O emissions from soybean rhizosphere

Hanna Nishida, Manabu Itakura, Khin Thuzar Win, Feng Li, Kaori Kakizaki, Atsuo Suzuki, Satoshi Ohkubo, Luong Van Duc, Masayuki Sugawara, Koji Takahashi, Matthew Shenton, Sachiko Masuda, Arisa Shibata, Ken Shirasu, Yukiko Fujisawa, Misa Tsubokura, Hiroko Akiyama, Yoshikazu Shimoda, Kiwamu Minamisawa, Haruko Imaizumi-Anraku

Nature Communications　2025年9月4日

DOI： 10.1038/s41467-025-63223-6 　
Metabolic diversity analysis and genome wide assessment of oxalate accumulation in the leaves of rice (<i>Oryza sativa</i>) cultivars

Atsuko Miyagi, Nobuhiro Tanaka, Matthew Shenton, Kaworu Ebana, Satoshi Ohkubo, Shunsuke Adachi, Taiichiro Ookawa, Maki Kawai-Yamada

Plant Biotechnology　2024年
出版者・発行元： Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology
DOI： 10.5511/plantbiotechnology.23.1025a 　

ISSN：1342-4580

eISSN：1347-6114
Genome-wide association study of leaf photosynthesis using a high-throughput gas exchange system in rice

Sotaro Honda, Ayumu Imamura, Yoshiaki Seki, Koki Chigira, Marina Iwasa, Kentaro Hayami, Tomohiro Nomura, Satoshi Ohkubo, Taiichiro Ookawa, Atsushi J. Nagano, Makoto Matsuoka, Yu Tanaka, Shunsuke Adachi

Photosynthesis Research　2024年1月

DOI： 10.1007/s11120-023-01065-3 　
葉のCO₂同化速度の簡便迅速測定システムの開発

本田爽太郎, 大久保智司, 新家寿建, 秋山重之, 青木直史, 田中佑, 安達俊輔

日本作物学会紀事　92　(4)　289-299　2023年10月5日
出版者・発行元：日本作物学会
DOI： 10.1626/jcs.92.289 　

ISSN：0011-1848

eISSN：1349-0990

詳細を見る詳細を閉じる

野外に生育する植物の葉のCO₂同化速度を評価する方法は，専用のガス交換測定装置を持ち運び，測定対象葉を同化箱に挟んで数分間の待機を繰り返すことが一般的である．これには時間，労力，コストを要するため，1度の実験で測定できるサンプル数には限りがあった．そこで筆者らは，新型の赤外線ガス分析機構を搭載した新たなCO₂同化速度測定装置MIC-100を開発した．閉鎖系測定装置であるMIC-100は，一般的に使用される開放系測定装置に比べて葉1枚あたりの測定時間を約1/7に短縮し，かつ強光条件下では開放系測定装置と同様の測定値を示した．さらに筆者らは，野外圃場で栽培したイネの光合成測定をより簡便化・迅速化するため，アシストスーツによる測定者の身体的負担の軽減策ならびに市販のドキュメントスキャナを利用した効率的な葉面積計測手法を考案した．これら一連の測定システムによって過去に例を見ない大規模な光合成測定実験が可能となり，イネ遺伝資源の多様性解析や多数のイネ系統の時系列解析などを実施できるようになった．MIC-100とその関連技術は，様々な植物の光合成研究や，作物の生育管理等へ活用されることが期待される．
野外時系列トランスクリプトームを利用したイネ草丈予測モデルの開発と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会関東談話会報　38　40-41　2023年
出版者・発行元：日本作物学会関東談話会
DOI： 10.20768/jcskantod.38.0_40 　

ISSN：2759-0631

eISSN：2759-3703
Physiological and morphological factors affecting leaf sheath reinforcement and their contribution to lodging resistance in rice

Tomohiro Nomura, Satoshi Ohkubo, Atsushi J. Nagano, Ahmad Fahim Samadi, Shunsuke Adachi, Taiichiro Ookawa

Plant Production Science　1-17　2023年1月1日
出版者・発行元： Informa UK Limited
DOI： 10.1080/1343943x.2022.2160362 　

ISSN：1343-943X

eISSN：1349-1008
Metabolomic analysis of rice brittle culm mutants reveals each mutant- specific metabolic pattern in each organ

Atsuko Miyagi, Kazuhisa Mori, Toshiki Ishikawa, Satoshi Ohkubo, Shunsuke Adachi, Masatoshi Yamaguchi, Taiichiro Ookawa, Toshihisa Kotake, Maki Kawai-Yamada

Metabolomics　18　(12)　2022年11月19日
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1007/s11306-022-01958-9 　

eISSN：1573-3890
野外トランスクリプトームによるイネ個葉光合成速度予測モデルの改良と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 岡村昌樹, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　254　116-116　2022年9月18日
出版者・発行元：日本作物学会
DOI： 10.14829/jcsproc.254.0_116 　
Draft Genome Sequence of the Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain Nb3U1. 国際誌

Christopher L Pierpont, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Scott R Miller

Microbiology resource announcements　11　(5)　e0025122　2022年5月19日

DOI： 10.1128/mra.00251-22 　

詳細を見る詳細を閉じる

We report the 3.5-Mb draft genome sequence of the cyanobacterium Synechococcus sp. strain Nb3U1, which was isolated from a microbial mat sample collected from Nakabusa Hot Spring, Nagano, Japan.
Evolution of rhizobial symbiosis islands through insertion sequence-mediated deletion and duplication

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Ryota Noda, Kaori Kakizaki, Satoshi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

The ISME Journal　16　(1)　112-121　2022年1月
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41396-021-01035-4 　

ISSN：1751-7362

eISSN：1751-7370

詳細を見る詳細を閉じる

<title>Abstract</title>Symbiosis between organisms influences their evolution via adaptive changes in genome architectures. Immunity of soybean carrying the <italic>Rj2</italic> allele is triggered by NopP (type III secretion system [T3SS]-dependent effector), encoded by symbiosis island A (SymA) in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA122. This immunity was overcome by many mutants with large SymA deletions that encompassed T3SS (<italic>rhc</italic>) and N₂ fixation (<italic>nif</italic>) genes and were bounded by insertion sequence (IS) copies in direct orientation, indicating homologous recombination between ISs. Similar deletion events were observed in <italic>B. diazoefficiens</italic> USDA110 and <italic>B. japonicum</italic> J5. When we cultured a USDA122 strain with a marker gene <italic>sacB</italic> inserted into the <italic>rhc</italic> gene cluster, most sucrose-resistant mutants had deletions in <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters, similar to the mutants above. Some deletion mutants were unique to the <italic>sacB</italic> system and showed lower competitive nodulation capability, indicating that IS-mediated deletions occurred during free-living growth and the host plants selected the mutants. Among 63 natural bradyrhizobial isolates, 2 possessed long duplications (261–357 kb) harboring <italic>nif</italic>/<italic>rhc</italic> gene clusters between IS copies in direct orientation via homologous recombination. Therefore, the structures of symbiosis islands are in a state of flux via IS-mediated duplications and deletions during rhizobial saprophytic growth, and host plants select mutualistic variants from the resultant pools of rhizobial populations. Our results demonstrate that homologous recombination between direct IS copies provides a natural mechanism generating deletions and duplications on symbiosis islands.
Maintaining higher leaf photosynthesis after heading stage could promote biomass accumulation in rice

Sotaro Honda, Satoshi Ohkubo, Nan Su San, Anothai Nakkasame, Kazuki Tomisawa, Keisuke Katsura, Taiichiro Ookawa, Atsushi J. Nagano, Shunsuke Adachi

Scientific Reports　11　(1)　2021年12月
出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC
DOI： 10.1038/s41598-021-86983-9 　

eISSN：2045-2322

詳細を見る詳細を閉じる

<title>Abstract</title>Leaf photosynthetic rate changes across the growing season as crop plants age. Most studies of leaf photosynthesis focus on a specific growth stage, leaving the question of which pattern of photosynthetic dynamics maximizes crop productivity unanswered. Here we obtained high-frequency data of canopy leaf CO₂ assimilation rate (<italic>A</italic>) of two elite rice (<italic>Oryza sativa</italic>) cultivars and 76 inbred lines across the whole growing season. The integrated <italic>A</italic> value after heading was positively associated with crop growth rate (CGR) from heading to harvest, but that before heading was not. A curve-smoothing analysis of <italic>A</italic> after heading showed that accumulated <italic>A</italic> at > 80% of its maximum (<italic>A</italic>₈₀) was positively correlated with CGR in analyses of all lines mixed and of lines grouped by genetic background, while the maximum <italic>A</italic> and accumulated <italic>A</italic> at ≤ 80% were less strongly correlated with CGR. We also found a genomic region (~ 12.2 Mb) that may enhance both <italic>A</italic>₈₀ and aboveground biomass at harvest. We propose that maintaining a high <italic>A</italic> after heading, rather than having high maximum <italic>A</italic>, is a potential target for enhancing rice biomass accumulation.
Potential of rice landraces with strong culms as genetic resources for improving lodging resistance against super typhoons. 国際誌

Tomohiro Nomura, Yoshiaki Seki, Makoto Matsuoka, Kenji Yano, Koki Chigira, Shunsuke Adachi, Francisco J Piñera-Chavez, Matthew Reynolds, Satoshi Ohkubo, Taiichiro Ookawa

Scientific reports　11　(1)　15780-15780　2021年8月4日

DOI： 10.1038/s41598-021-95268-0 　

詳細を見る詳細を閉じる

It is generally believed that rice landraces with long culms are susceptible to lodging, and have not been utilized for breeding to improve lodging resistance. However, little is known about the structural culm strength of landraces and their beneficial genetic loci. Therefore, in this study, genome-wide association studies (GWAS) were performed using a rice population panel including Japanese rice landraces to identify beneficial loci associated with strong culms. As a result, the landraces were found to have higher structural culm strength and greater diversity than the breeding varieties. Genetic loci associated with strong culms were identified, and it was demonstrated that haplotypes with positive effects of those loci were present in a high proportion of these landraces. These results indicated that the utilization of the strong culm-associated loci present in Japanese rice landraces may further improve the lodging resistance of modern breeding varieties that have relied on semi-dwarfism.
Genomic Basis of Transcriptome Dynamics in Rice Under Field Conditions

Makoto Kashima, Ryota L Sakamoto, Hiroki Saito, Satoshi Ohkubo, Ayumi Tezuka, Ayumi Deguchi, Yoichi Hashida, Yuko Kurita, Koji Iwayama, Shunsuke Adachi, Atsushi J Nagano

Plant and Cell Physiology　2021年6月16日
出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)
DOI： 10.1093/pcp/pcab088 　

ISSN：0032-0781

eISSN：1471-9053

詳細を見る詳細を閉じる

<title>Abstract</title> How genetic variations affect gene expression dynamics of field-grown plants remains unclear. Expression quantitative trait loci (eQTL) analysis is frequently used to find genomic regions underlying gene expression polymorphisms. This approach requires transcriptome data for the complete set of the QTL mapping population under the given conditions. Therefore, only a limited range of environmental conditions is covered by a conventional eQTL analysis. We sampled sparse time-series of field-grown rice from chromosome segment substitution lines (CSSLs) and conducted RNA-sequencing (RNA-Seq). Then, by using statistical analysis integrating meteorological data and the RNA-Seq data, we identified 1675 expression quantitative trait loci (eQTLs) leading to polymorphisms in expression dynamics under field conditions. A genomic region on chromosome 11 influences the expression of several defense-related genes in a time-of-day- and scaled-age-dependent manner. This includes the eQTLs that possibly influence the time-of-day- and scaled-age-dependent differences in the innate immunity between Koshihikari and Takanari. Based on the eQTL and meteorological data, we successfully predicted gene expression under environments different from training environments, and in rice cultivars with more complex genotypes than the CSSLs. Our novel approach of eQTL identification facilitated the understanding of the genetic architecture of expression dynamics under field conditions, which is difficult to assess by conventional eQTL studies. The prediction of expression based on eQTLs and environmental information would contribute to the understanding of plant traits under diverse field conditions. (224/250 words)
Rice Cultivar Takanari Has Higher Photosynthetic Performance Under Fluctuating Light Than Koshihikari, Especially Under Limited Nitrogen Supply and Elevated CO2 査読有り

Satoshi Ohkubo, Yu Tanaka, Wataru Yamori, Shunsuke Adachi

FRONTIERS IN PLANT SCIENCE　11　2020年9月

DOI： 10.3389/fpls.2020.01308 　

ISSN：1664-462X
Microbial Community Structures in Terrestrial Subsurface Sediments from the Southern Kanto Plain, Japan 査読有り

Satoshi Ohkubo, Takeshi Saito, Muhammad Abul Kalam Azad, Hiromitsu Kawai, Wataru Suda, Shin Kore-eda, Shoichiro Hamamoto, Hirotaka Saito, Takato Takemura, Toshiko Komatsu, Jun-ichi Ohnishi

GEOMICROBIOLOGY JOURNAL　37　(7)　595-602　2020年7月

DOI： 10.1080/01490451.2020.1743390 　

ISSN：0149-0451

eISSN：1521-0529
Genetic determination for source capacity to support breeding of high-yielding rice (Oryza sativa) 査読有り

Shunsuke Adachi, Satoshi Ohkubo, Nan Su San, Toshio Yamamoto

MOLECULAR BREEDING　40　(2)　2020年2月

DOI： 10.1007/s11032-020-1101-5 　

ISSN：1380-3743

eISSN：1572-9788
High-yielding rice Takanari has superior photosynthetic response to a commercial rice Koshihikari under fluctuating light 査読有り

Shunsuke Adachi, Yu Tanaka, Atsuko Miyagi, Makoto Kashima, Ayumi Tezuka, Yoshihiro Toya, Shunzo Kobayashi, Satoshi Ohkubo, Hiroshi Shimizu, Maki Kawai-Yamada, Rowan F. Sage, Atsushi J. Nagano, Wataru Yamori

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY　70　(19)　5287-5297　2019年10月

DOI： 10.1093/jxb/erz304 　

ISSN：0022-0957

eISSN：1460-2431
A niche for cyanobacteria producing chlorophyll f within a microbial mat 査読有り

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita

ISME JOURNAL　11　(10)　2368-2378　2017年10月

DOI： 10.1038/ismej.2017.98 　

ISSN：1751-7362

eISSN：1751-7370
Temperature change affected groundwater quality in a confined marine aquifer during long-term heating and cooling 査読有り

Takeshi Saito, Shoichiro Hamamoto, Takashi Ueki, Satoshi Ohkubo, Per Moldrup, Ken Kawamoto, Toshiko Komatsu

WATER RESEARCH　94　120-127　2016年5月

DOI： 10.1016/j.watres.2016.01.043 　

ISSN：0043-1354
Discovery of Chlorophyll d in Acaryochloris marina and Chlorophyll f in a Unicellular Cyanobacterium, Strain KC1, Isolated from Lake Biwa

Hideaki Miyashita

Journal of Physical Chemistry & Biophysics　4　(4)　2014年
出版者・発行元： {OMICS} Publishing Group
DOI： 10.4172/2161-0398.1000149 　

ISSN：2161-0398
Composition of carotenoids and identification of aerial microalgae isolated from the surface of rocks in mountainous districts of Japan 査読有り

Nobuhiro Aburai, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Katsuya Abe

ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS　2　(3)　237-243　2013年7月

DOI： 10.1016/j.algal.2013.03.001 　

ISSN：2211-9264
Selective Detection and Phylogenetic Diversity of Acaryochloris spp. That Exist in Association with Didemnid Ascidians and Sponge 査読有り

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita

MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(3)　217-225　2012年9月

DOI： 10.1264/jsme2.ME11295 　

ISSN：1342-6311
Genetic diversity of symbiotic cyanobacteria in Cycas revoluta (Cycadaceae) 査読有り

Shuntaro Yamada, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Hiroaki Setoguchi

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY　81　(3)　696-706　2012年9月

DOI： 10.1111/j.1574-6941.2012.01403.x 　

ISSN：0168-6496
Evidence of Global Chlorophyll d 査読有り

Y. Kashiyama, H. Miyashita, S. Ohkubo, N. O. Ogawa, Y. Chikaraishi, Y. Takano, H. Suga, T. Toyofuku, H. Nomaki, H. Kitazato, T. Nagata, N. Ohkouchi

Science　321　(5889)　658-658　2008年8月1日
出版者・発行元： American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI： 10.1126/science.1158761 　

ISSN：0036-8075

eISSN：1095-9203
Molecular detection of epiphytic Acaryochloris spp. on marine macroalgae 査読有り

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Akio Murakami, Haruko Takeyama, Tohru Tsuchiya, Mamoru Mimuro

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　72　(12)　7912-7915　2006年12月

DOI： 10.1128/AEM.01148-06 　

ISSN：0099-2240

︎全件表示 ︎最初の5件までを表示

MISC 42

野外トランスクリプトーム推定を利用したイネ個葉光合成速度およびバイオマス生産の予測

本田爽太郎, 宮下大輝, 大久保智司, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　259th　2025年
イネの遺伝子発現量予測におけるサンプリング条件の影響解析

永壽暖, 前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 渡邊渡邊, 安達俊輔, 永野惇, 永野惇, 永野惇

日本植物生理学会年会(Web)　65th　2024年
野外時系列トランスクリプトームを利用したイネ草丈予測モデルの開発と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会関東談話会報(Web)　38　2023年

ISSN： 2759-3703
メタボローム解析から探るイネのカマイラズ変異体の代謝変動

宮城敦子, 宮城敦子, 森和久, 石川寿樹, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 山口雅利, 小竹敬久, 川合真紀

日本植物生理学会年会(Web)　64th　2023年
シチズンサイエンスによる温室効果ガス削減微生物の探索

大久保智司

日本植物生理学会年会(Web)　64th　2023年
イネにおける遺伝子発現予測のためのサンプリング条件の最適化

永壽暖, 前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 森直哉, 渡邊博之, 安達俊輔, 永野惇, 永野惇, 冨田勝, 冨田勝

日本植物生理学会年会(Web)　64th　2023年
土壌由来の温室効果ガス削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023年
市民参加型研究プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」の現状と展望土壌に眠る温室効果ガス消去微生物をみんなの力で掘り起こそう

大久保智司, 青木裕一, 青木裕一, 戸田聡一郎, 加藤広海

化学と生物　61　(5)　2023年

ISSN： 0453-073X
土壌由来の温室効果ガス削減に向けた市民科学による微生物探索

大久保智司, 青木裕一

土と微生物　77　(1)　2023年

ISSN： 0912-2184
GWASおよび代謝解析から探るイネのシュウ酸蓄積機構

宮城敦子, 宮城敦子, 田中伸裕, SHENTON Matthew, 江花薫子, 大久保智司, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 川合真紀

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　87th　2023年
土壌由来の温室効果ガス削減に向けた市民科学による微生物探索

大久保智司, 青木裕一

日本土壌微生物学会講演要旨集　2022 (CD-ROM)　2022年
土壌から発生するN₂O削減をめざす市民科学プロジェクト~地球冷却微生物を探せ~

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 菊地美穂, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022年

ISSN： 2424-0575
土壌のN₂O発生削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 加藤広海, 菊地美穂, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web)　68　2022年

ISSN： 2424-0575
イネ品種間差を利用したシュウ酸蓄積因子の探索

宮城敦子, 宮城敦子, 田中伸裕, SHENTON Matthew, 江花薫子, 大久保智司, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 川合真紀

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　86th　2022年
イネのカマイラズ変異体における代謝変動

宮城敦子, 森和久, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 石川寿樹, 山口雅利, 小竹敬久, 川合真紀

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　85th　2021年
深層学習によるイネの野外トランスクリプトームモデルの構築と他種への転移学習

前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 田中克, 森直哉, 渡邊博之, 安達俊輔, 永野惇, 永野惇

日本植物生理学会年会(Web)　62nd　2021年
水稲の葉の光合成速度をトランスクリプトームから予測する

安達俊輔, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇

農作業研究　55　2020年

ISSN： 0389-1763
トランスクリプトームを用いた野外環境におけるイネ光合成速度の予測モデリング

本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　249th　2020年
野外環境と遺伝子発現情報からイネ光合成速度を予測するモデルの構築と改良

大久保智司, 本田爽太郎, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　250th　2020年
イネ個葉光合成速度と地上部バイオマスとの関係―染色体断片置換系統の生育期間を通じたガス交換測定に基づく解析―

富澤和紀, 寺崎千鶴, 大久保智司, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　247th　162　2019年3月28日
光合成誘導反応のイネ品種間差に関わる生理的要因の解析

安達俊輔, 田中佑, 宮城敦子, 鹿島誠, 手塚あゆみ, 戸谷吉博, 小林俊造, 大久保智司, 清水浩, 川合真紀, 永野惇, 矢守航

日本作物学会講演会要旨集　247th　2019年
ドキュメントスキャナによるイネ葉身画像取得法の確立

本田爽太郎, 大久保智司, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会関東支部会報(Web)　34　2019年

ISSN： 2424-2225
新型迅速光合成測定装置を用いたイネ光合成日変化の評価

寺崎千鶴, 富澤和紀, 速水健太郎, 大川泰一郎, 大久保智司, 田中佑, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　246th　129　2018年9月4日
野外圃場で測定したイネの葉の光合成能力の品種間差

大久保智司, 大久保智司, 齊藤大樹, 齊藤大樹, 矢守航, 永野惇, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集　246th　132　2018年9月4日
出版者・発行元：日本作物学会
DOI： 10.14829/jcsproc.246.0_132 　
イネ染色体断片置換系統を用いた,環境情報と遺伝子型に基づく遺伝子発現動態の予測

鹿島誠, 齊藤大樹, 坂本亮太, 大久保智司, 手塚あゆみ, 出口亜由美, 橋田庸一, 栗田悠子, 永野惇

日本植物学会大会研究発表記録　82nd　2018年
野外トランスクリプトームと数理モデリングを用いた,気象情報と遺伝子型に基づくイネの遺伝子発現動態の予測

鹿島誠, 坂本亮太, 齊藤大樹, 齊藤大樹, 大久保智司, 手塚あゆみ, 出口亜由美, 橋田庸一, 栗田悠子, 永野惇

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　41st　2018年
シアノバクテリアの進化とクロロフィルの多様化

宮下英明, 大久保智司, 神川龍馬

日本陸水学会大会講演要旨集　79th (Web)　2014年
PE-008 地下水中の微生物叢に対する地下温度上昇の影響(微生物群集構造,ポスター発表)

大久保智司, 斎藤健志, 濱本昌一郎, 大西純一, 小松登志子

(29)　118　2013年
PE-009 関東平野の地下帯水層土壌に含まれる真正細菌叢の網羅的解析(微生物群集構造,ポスター発表)

大西純一, Azad Mh.Abul Kalam, 大久保智司, 斎藤広隆, 竹村貴人, 濱本昌一郎, 小松登志子

日本微生物生態学会講演要旨集　(29)　119-119　2013年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PE-18 「天狗の麦飯」微生物群集構造の産地間比較(PE 微生物群集構造,ポスター発表)

坂本皆子, 高取淳哉, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　155-155　2012年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PGb-13 シアノバクテリアKC1株におけるクロロフィルf合成誘導条件の考察(PGb 増殖・生理・代謝(光栄養),ポスター発表)

松本翔吾, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　162-162　2012年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PA1-02 琵琶湖におけるAcaryochloris spp.の鉛直分布とクロロフィルdの適応的意義(PAa 水圏生態系(一般),ポスター発表)

酒井翔太, 成田隆造, 大久保智司, 石川加奈子, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　132-132　2012年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PGb-10 温泉微生物マット内におけるクロロフィルfの分布(PGb 増殖・生理・代謝(光栄養),ポスター発表)

大久保智司, 松本翔吾, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　162-162　2012年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
PE-17 「天狗の麦飯」の主要構成微生物の門レベルでの識別(PE 微生物群集構造,ポスター発表)

金井眞知子, 坂本皆子, 幡野恭子, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　155-155　2012年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
琵琶湖北湖におけるAcaryochloris spp.の鉛直分布とクロロフィルdの適応的意義

成田隆造, 酒井翔太, 大久保智司, 石川可奈子, 宮下英明

藻類　60　(2)　2012年

ISSN： 0038-1578
1C-7 琵琶湖湖水中におけるクロロフィルd含有シアノバクテリアの分布と遺伝的多様性(A.水圏生態系,口頭発表)

大久保智司, 細川由貴, 石川可奈子, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(26)　79-79　2010年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
THE REASON WHY CHLOROPHYLL D HAS BEEN DETECTED FROM RED MACROALGAE

S. Ohkubo, H. Miyashita

PHYCOLOGIA　48　(4)　99-99　2009年7月

ISSN： 0031-8884
POSSIBLE CONTRIBUTION OF CHLOROPHYLL D ON COASTAL CARBON CYCLE

H. Miyashita, S. Ohkubo, Y. Kashiyama, N. Ohkouchi

PHYCOLOGIA　48　(4)　85-85　2009年7月

ISSN： 0031-8884
1A-14 「天狗の麦飯」微生物群集構造の深度別比較(口頭発表)

高取惇哉, 大河内直彦, 小川奈々子, 田中樹, 近藤洋一, 幡野恭子, 坂本皆子, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集　(25)　7-7　2009年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
Acaryochloris spp.の分布

大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守

日本微生物生態学会講演要旨集　23rd　2007年
C-01 Palauの群体ホヤから検出されるAcaryochloris spp.の遺伝的多様性(分類/系統解析,口頭発表)

大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 竹山春子, 三室守

日本微生物生態学会講演要旨集　(21)　245-245　2005年
出版者・発行元：日本微生物生態学会
A-16 日本沿岸におけるAcaryochloris属シアノバクテリアの検出(分類・系統解析,口頭発表)

大久保智司, 宮下英明, 村上明男, 土屋徹, 竹山春子, 三室守

日本微生物生態学会講演要旨集　(20)　138-138　2004年
出版者・発行元：日本微生物生態学会

︎全件表示 ︎最初の5件までを表示

講演・口頭発表等 3

土壌から出る温室効果ガスN2Oを削減する微生物の探索招待有り

大久保智司

第507回生存圏シンポジウム土壌・植物・大気を跨ぐ物質の循環と機能に関するワークショップ　2023年11月27日
市民の力を活用した温室効果ガス削減微生物の探索招待有り

大久保智司

公開シンポジウム「食・土・肥料－SDGs達成のための基礎科学として－」　2023年7月29日
地球冷却微生物を探せ招待有り

大久保智司

ジオ講演会　2023年1月8日

メディア報道 4

地球温暖化を止める救世主は土の中「温室効果は二酸化炭素の300倍」一酸化二窒素を分解する“地球冷却微生物”とは執筆者本人

tbc東北放送　Nスタみやぎ

2023年10月27日

メディア報道種別: テレビ・ラジオ番組
今夜みんなで大発見!?シチズンラボ生放送スペシャル執筆者本人

NHK　今夜みんなで大発見!?シチズンラボ生放送スペシャル

2023年8月18日

メディア報道種別: テレビ・ラジオ番組
【研究】CO2の300倍!? 温室効果ガスN2Oを分解する地球冷却微生物とは執筆者本人

ミヤギテレビ　ミヤギnews every.

2023年6月30日

メディア報道種別: テレビ・ラジオ番組
目に見えない地球冷却微生物が温暖化から地球を救う東北大学のプロジェクト執筆者本人

khb東日本放送　チャージ！

2023年5月24日

メディア報道種別: テレビ・ラジオ番組