研究者詳細

顔写真

サカタ　ナツミ
坂田　菜摘
Natsumi Sakata
所属
大学院医学系研究科　医科学専攻　生体機能学講座（医化学分野）
職名
助教
学位

  • 博士（医学） （東北大学）

e-Rad 研究者番号
11022343
プロフィール

医師・博士（医学）

MD, PhD

経歴 1

  • 2025年4月 ～ 継続中
    東北大学大学院 医学系研究科　医化学分野　助教

学歴 3

  • 東北大学　医学部　医学科

    2014年4月 ～ 2025年3月

  • 東北大学　大学院医学系研究科　医科学専攻博士課程

    2018年4月 ～ 2021年3月

  • 東北大学　大学院医学系研究科　医科学専攻修士課程

    2017年4月 ～ 2018年3月

所属学協会 2

  • 日本分子生物学会

  • 日本生化学会

研究分野 3

  • ライフサイエンス / 医化学 /

  • ライフサイエンス / 細胞生物学 /

  • ライフサイエンス / 分子生物学 /

受賞 4

  1. 医学部学生奨学賞 最優秀賞

    2023年2月　東北大学医学部

  2. JB論文賞

    2022年7月　日本生化学会　Double prenylation of SNARE protein Ykt6 is required for lysosomal hydrolase trafficking

  3. 医学部博士課程奨学助成

    2018年4月　公益財団法人武田科学振興財団

  4. ｢動脈硬化 Update｣研究助成 最優秀研究

    2017年11月　日本心臓財団　糖尿病治療薬メトホルミンの新規抗炎症・抗動脈硬化機構の解明

論文 10

  1. Lysosomes and Supersulfides: Emerging Links in Cellular Metabolism and Homeostasis 招待有り 査読有り

    Natsumi Sakata, Takaaki Akaike, Hozumi Motohashi

    The Journal of Biochemistry　2026年7月24日

    出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)

    DOI： 10.1093/jb/mvag058 　

    ISSN：0021-924X

    eISSN：1756-2651

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    Abstract Supersulfides, a class of catenated sulfur-containing biomolecules, are increasingly recognized as key regulators of redox signaling, mitochondrial function, and inflammatory responses. Recent evidence suggests that lysosomes, central organelles for intracellular degradation and nutrient sensing, are closely linked to supersulfide metabolism through lysosomal acidification, cysteine metabolism, and autophagy. Conversely, supersulfides modulate lysosomal activity and inflammatory responses. This review summarizes recent progress in supersulfide biology and lysosomal regulation and discusses evidence supporting functional interactions between these systems. We propose the lysosome-supersulfide axis as a new concept in cellular homeostasis and metabolic regulation.

  2. The anti‐inflammatory effect of metformin: The molecular targets 査読有り

    Natsumi Sakata

    Genes to Cells　2024年3月

    DOI： 10.1111/gtc.13098 　

  3. Ral GTPase promotes metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma via elevation of TGF-β1 production 査読有り

    Mingxin Cao, Xinming Li, Duc-Anh Trinh, Shingo Yoshimachi, Kota Goto, Natsumi Sakata, Masaharu Ishida, Hideo Ohtsuka, Michiaki Unno, Yuxia Wang, Ryutaro Shirakawa, Hisanori Horiuchi

    Journal of Biological Chemistry　299　(6)　104754-104754　2023年6月

    出版者・発行元： Elsevier {BV}

    DOI： 10.1016/j.jbc.2023.104754 　

    ISSN：0021-9258

  4. The Ral GTPase‐activating protein regulates the malignancy of pancreatic ductal adenocarcinoma 査読有り

    Shingo Yoshimachi, Ryutaro Shirakawa, Mingxin Cao, Duc Anh Trinh, Pan Gao, Natsumi Sakata, Kento Miyazaki, Kota Goto, Takayuki Miura, Kyohei Ariake, Shimpei Maeda, Kunihiro Masuda, Masaharu Ishida, Hideo Ohtsuka, Michiaki Unno, Hisanori Horiuchi

    Cancer Science　2021年5月19日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/cas.14970 　

    ISSN：1347-9032 1349-7006

  5. Double prenylation of SNARE protein Ykt6 is required for lysosomal hydrolase trafficking 査読有り

    Natsumi Sakata, Ryutaro Shirakawa, Kota Goto, Duc Anh Trinh, Hisanori Horiuchi

    The Journal of Biochemistry　169　(3)　363-370　2021年4月18日

    出版者・発行元： Oxford University Press ({OUP})

    DOI： 10.1093/jb/mvaa111 　

    ISSN：0021-924X 1756-2651

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    <jats:title>Abstract</jats:title> <jats:p>Ykt6 is an evolutionarily conserved SNARE protein regulating Golgi membrane fusion and other diverse membrane trafficking pathways. Unlike most SNARE proteins, Ykt6 lacks a transmembrane domain but instead has a tandem cysteine motif at the C-terminus. Recently, we have demonstrated that Ykt6 undergoes double prenylation at the C-terminal two cysteines first by farnesyltransferase and then by a newly identified protein prenyltransferase named geranylgeranyltransferase type-III (GGTase-III). GGTase-III consists of a novel α subunit PTAR1 and the β subunit of RabGGTase. PTAR1 knockout (KO) cells, where Ykt6 is singly prenylated with a farnesyl moiety, exhibit structural and functional abnormalities in Golgi apparatus with delayed intra-Golgi trafficking and impaired protein glycosylation. It remains unclear whether the second prenylation of Ykt6 is required for proper trafficking of lysosomal hydrolases from Golgi to lysosomes. Here we show that lysosomal hydrolases, cathepsin D and β-hexosaminidase, were missorted at the trans-Golgi network and secreted into the extracellular space in PTAR1 KO cells. Moreover, maturation of these hydrolases was disturbed. LC3B, an autophagy marker, was accumulated in PTAR1 KO cells, suggesting defects in cellular degradation pathways. Thus, doubly prenylated Ykt6, but not singly prenylated Ykt6, is critical for the efficient sorting and trafficking of acid hydrolases to lysosomes.</jats:p>

  6. A SNARE geranylgeranyltransferase essential for the organization of the Golgi apparatus 査読有り

    Shirakawa, R., Goto-Ito, S., Goto, K., Wakayama, S., Kubo, H., Sakata, N., Trinh, D.A., Yamagata, A., Sato, Y., Masumoto, H., Cheng, J., Fujimoto, T., Fukai, S., Horiuchi, H.

    EMBO Journal　2020年

    DOI： 10.15252/embj.2019104120 　

  7. Inhibitor of Growth 4 (ING4) is a positive regulator of rRNA synthesis 査読有り

    Trinh, D.-A., Shirakawa, R., Kimura, T., Sakata, N., Goto, K., Horiuchi, H.

    Scientific Reports　9　(1)　2019年

    DOI： 10.1038/s41598-019-53767-1 　

  8. Ral GTPase Activation by Downregulation of RalGAP Enhances Oral Squamous Cell Carcinoma Progression 査読有り

    Gao, P., Liu, S., Yoshida, R., Shi, C.Y., Yoshimachi, S., Sakata, N., Goto, K., Kimura, T., Shirakawa, R., Nakayama, H., Sakata, J., Kawashiri, S., Kato, K., Wang, X.Y., Horiuchi, H.

    Journal of Dental Research　98　(9)　2019年

    DOI： 10.1177/0022034519860828 　

  9. Metformin directly binds the alarmin HMGB1 and inhibits its proinflammatory activity 査読有り

    Horiuchi, T., Sakata, N., Narumi, Y., Kimura, T., Hayashi, T., Nagano, K., Liu, K., Nishibori, M., Tsukita, S., Yamada, T., Katagiri, H., Shirakawa, R., Horiuchi, H.

    Journal of Biological Chemistry　292　(20)　2017年

    DOI： 10.1074/jbc.M116.769380 　

  10. Prostaglandin E<inf>2</inf> inhibits neutrophil extracellular trap formation through production of cyclic AMP 査読有り

    Shishikura, K., Horiuchi, T., Sakata, N., Trinh, D.-A., Shirakawa, R., Kimura, T., Asada, Y., Horiuchi, H.

    British Journal of Pharmacology　173　(2)　2016年

    DOI： 10.1111/bph.13373 　

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MISC 3

  1. 膵癌においてRal GTPase-activating protein(Ral-GAP)の発現低下は腫瘍形成や浸潤・転移能を促進する

    吉町信吾, 大塚英郎, 白川龍太郎, 高攀, 坂田菜摘, 後藤孝太, 宮崎健人, TRINH Duc Anh, 三浦孝之, 有明恭平, 益田邦洋, 石田晶玄, 元井冬彦, 内藤剛, 亀井尚, 海野倫明, 堀内久徳

    日本外科学会定期学術集会(Web)　120th　SF-7　2020年

    出版者・発行元： (一社)日本外科学会

  2. メトホルミンはHMGB1に直接結合しその炎症促進作用を抑制する

    坂田 菜摘, 堀内 崇弘, 鳴海 善洋, 木村 朋寛, 林 隆史, 長野 圭介, 劉 克約, 西堀 正洋, 突田 壮平, 山田 哲也, 片桐 秀樹, 白川 龍太郎, 堀内 久徳

    生命科学系学会合同年次大会　2017年度　[3PT26-12(3P　2017年12月

    出版者・発行元： 生命科学系学会合同年次大会運営事務局

  3. プロスタグランジンE2はサイクリックAMP産生を介してNETs形成を阻害する

    木村 朋寛, 宍倉 匡祐, 堀内 嵩弘, 坂田 菜摘, Trinh Duc-Anh, 白川 龍太郎, 堀内 久徳

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集　88回・38回　[2T特p-06(2P1155)]　2015年12月

    出版者・発行元： (公社)日本生化学会

講演・口頭発表等 4

  1. ダブルプレニルYkt6はリソソーム水解酵素の輸送を制御する

    第45回 日本分子生物学会年会　2022年11月30日

  2. ダブルプレニルYkt6はリソソーム水解酵素の輸送を制御する

    第95回日本生化学会大会　2022年11月9日

  3. A novel protein complex and nutrient sensing mechanism

    第93回 日本生化学会大会　2019年12月2日

  4. Metformin directly binds the alarmin HMGB1 and inhibits its proinflammatory activity

    第90回 日本生化学会大会　2017年2月6日

共同研究・競争的資金等の研究課題 1

  1. リソソームによる超硫黄分子の制御

    坂田 菜摘

    2025年7月31日 ～ 2027年3月31日