研究者詳細

顔写真

ウチダ ナリヤ
内田 就也
Nariya Uchida
所属
大学院理学研究科 物理学専攻 固体統計物理学講座(物性理論分野)
職名
准教授
学位
  • 博士(理学) (京都大学)

委員歴 3

  • 教務委員会委員(専攻内委員会) 学内委員

    2017年4月 ~ 継続中

  • 「物性研究・電子版」編集委員会 各地編集委員

    2016年9月 ~ 2022年3月

  • 「物性研究」編集委員会 各地編集委員

    2003年4月 ~ 2006年3月

所属学協会 1

  • 日本物理学会

研究キーワード 3

  • パターン形成

  • 相転移

  • ソフトマター

研究分野 1

  • 自然科学一般 / 数理物理、物性基礎 /

論文 68

  1. Conditions for metachronal coordination in arrays of model cilia. 国際誌

    Fanlong Meng, Rachel R Bennett, Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118 (32) 2021年8月10日

    DOI: 10.1073/pnas.2102828118  

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    On surfaces with many motile cilia, beats of the individual cilia coordinate to form metachronal waves. We present a theoretical framework that connects the dynamics of an individual cilium to the collective dynamics of a ciliary carpet via systematic coarse graining. We uncover the criteria that control the selection of frequency and wave vector of stable metachronal waves of the cilia and examine how they depend on the geometric and dynamical characteristics of a single cilium, as well as the geometric properties of the array. We perform agent-based numerical simulations of arrays of cilia with hydrodynamic interactions and find quantitative agreement with the predictions of the analytical framework. Our work sheds light on the question of how the collective properties of beating cilia can be determined using information about the individual units and, as such, exemplifies a bottom-up study of a rich active matter system.

  2. Control of synchronization in models of hydrodynamically coupled motile cilia 査読有り

    Armando Maestro, Nicolas Bruot, Jurij Kotar, Nariya Uchida, Ramin Golestanian, Pietro Cicuta

    Communications Physics 1 28-1-28-8 2018年6月

    DOI: 10.1038/s42005-018-0031-6  

  3. Synchronization and Collective Dynamics of Flagella and Cilia as Hydrodynamically Coupled Oscillators 招待有り 査読有り

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian, Rachel R. Bennett

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN 86 (10) 101007-1-101007-8 2017年10月

    DOI: 10.7566/JPSJ.86.101007  

    ISSN:0031-9015

  4. Direct observation of rotation and steps of the archaellum in the swimming halophilic archaeon Halobacterium salinarum 査読有り

    Yoshiaki Kinosita, Nariya Uchida, Daisuke Nakane, Takayuki Nishizaka

    Nature Microbiology 1 (11) 16148-16148 2016年8月

    出版者・発行元: Springer Nature

    DOI: 10.1038/nmicrobiol.2016.148  

  5. Hydrodynamic synchronization between objects with cyclic rigid trajectories 招待有り 査読有り

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL E 35 (12) 135-1-135-14 2012年12月

    DOI: 10.1140/epje/i2012-12135-5  

    ISSN:1292-8941

    eISSN:1292-895X

  6. Many-Body Theory of Synchronization by Long-Range Interactions 査読有り

    Nariya Uchida

    PHYSICAL REVIEW LETTERS 106 (6) 064101-1-064101-4 2011年2月

    DOI: 10.1103/PhysRevLett.106.064101  

    ISSN:0031-9007

  7. Generic Conditions for Hydrodynamic Synchronization 査読有り

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    PHYSICAL REVIEW LETTERS 106 (5) 058104-1-058104-4 2011年2月

    DOI: 10.1103/PhysRevLett.106.058104  

    ISSN:0031-9007

    eISSN:1079-7114

  8. Hydrodynamic synchronization at low Reynolds number 招待有り 査読有り

    Ramin Golestanian, Julia M. Yeomans, Nariya Uchida

    SOFT MATTER 7 (7) 3074-3082 2011年

    DOI: 10.1039/c0sm01121e  

    ISSN:1744-683X

    eISSN:1744-6848

  9. Synchronization and Collective Dynamics in a Carpet of Microfluidic Rotors 査読有り

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    PHYSICAL REVIEW LETTERS 104 (17) 178103-1-178103-4 2010年4月

    DOI: 10.1103/PhysRevLett.104.178103  

    ISSN:0031-9007

    eISSN:1079-7114

  10. Dynamical Theory of Elastic Synchronization of Cardiomyocytes 査読有り

    Akinari Tomiie, Nariya Uchida

    Journal of the Physical Society of Japan 2026年7月15日

    DOI: 10.7566/JPSJ.95.073001  

  11. Defect binding-unbinding transition in active nematic membranes 査読有り

    Yuki Hirota, Nariya Uchida

    Physical Review E 2026年5月18日

    DOI: 10.1103/jqkw-69d1  

  12. Topological defects in spiral wave chimera states 査読有り

    Lintao Liu, Nariya Uchida

    Physical Review E 2026年5月8日

    DOI: 10.1103/yhbq-ztk8  

  13. Collective behaviors of self-propelled particles with tunable alignment angles. 国際誌 査読有り

    Zichen Qin, Nariya Uchida

    Physical Review E 113 (1-2) 015411-015411 2026年1月

    DOI: 10.1103/1dhq-6fb1  

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    We present an aligning active matter model by extending the nematic alignment rule in self-propelled rods to tunable alignment angles, as represented by the collision of cone-shaped particles. Nonvanishing alignment angles introduce frustration in the many-body interactions, and we investigate its effect on the collective behavior of the system. Through numerical simulations of an agent-based microscopic model, we find that the system exhibits distinct phenomenology compared to the original self-propelled rods. In particular, antiparallel bands are observed in an intermediate parameter range. The linear stability analysis of the continuum description derived from the Boltzmann approach demonstrates qualitative consistency with the microscopic model, while frustration due to many-body interactions in the latter destabilizes homogeneous nematic order over a wide range of the alignment angle.

  14. Active nematic liquid crystals under a quenched random field

    Yutaka Kinoshita, Nariya Uchida

    Europhysics Letters 2025年9月1日

    DOI: 10.1209/0295-5075/adfee6  

  15. Nonreciprocal amplification toward chaos in a chain of Duffing oscillators 査読有り

    Luekai Zhao, Bojun Li, Nariya Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 112 (1) 2025年7月17日

    DOI: 10.1103/gl1t-t2c4  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  16. Boltzmann approach to collective motion via nonlocal visual interaction 査読有り

    Susumu Ito, Nariya Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 111 (4) 2025年4月28日

    DOI: 10.1103/PhysRevE.111.044411  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  17. Synchronization of Two Bacterial Flagella as a Stochastic Process 査読有り

    Jing Qin, Nariya Uchida

    Journal of the Physical Society of Japan 94 (4) 044803-1-5 2025年3月27日

    出版者・発行元: Physical Society of Japan

    DOI: 10.7566/jpsj.94.044803  

    ISSN:0031-9015

    eISSN:1347-4073

  18. Collective excitations in active solids featuring alignment interactions. 国際誌 査読有り

    Yutaka Kinoshita, Nariya Uchida, Andreas M Menzel

    The Journal of chemical physics 162 (5) 054906-1-15 2025年2月7日

    DOI: 10.1063/5.0244615  

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    With increasing emphasis on the study of active solids, the features of these classes of nonequilibrium systems and materials beyond their mere existence shift into focus. One concept of active solids addresses them as active, self-propelled units that are elastically linked to each other. The emergence of orientationally ordered, collectively moving states in such systems has been demonstrated. We here analyze the excitability of such collectively moving elastic states. To this end, we determine corresponding fluctuation spectra. They indicate that collectively excitable modes exist in the migrating solid. Differences arise when compared to those of corresponding passive solids. We provide evidence that the modes of excitation associated with the intrinsic fluctuations are related to corresponding modes of entropy production. Overall, by our investigation, we hope to stimulate future experimental studies that focus on excitations in active solids.

  19. Boundaries and cross-linking densities modulate domain sizes of polydomain nematic elastomers 招待有り 査読有り

    Takuya Ohzono, Kaoru Katoh, Nariya Uchida

    Soft Matter 21 1233-1240 2025年1月13日

    DOI: 10.1039/d4sm01419g  

    ISSN:1744-683X

    eISSN:1744-6848

  20. Metastability of multi-population Kuramoto-Sakaguchi oscillators 査読有り

    Bojun Li, Nariya Uchida

    Chaos 35 (1) 013105-1-9 2025年1月3日

    DOI: 10.1063/5.0220321  

    ISSN:1054-1500

    eISSN:1089-7682

  21. Selective decision-making and collective behavior of fish by the motion of visual attention 査読有り

    Susumu Ito, Nariya Uchida

    PNAS Nexus 3 (7) pgae264-1-11 2024年7月1日

    DOI: 10.1093/pnasnexus/pgae264  

    eISSN:2752-6542

  22. Vortex phase matching of a self-propelled model of fish with autonomous fin motion 招待有り 査読有り

    Susumu Ito, Nariya Uchida

    Physics of Fluids 35 (11) 111902-1-18 2023年11月1日

    DOI: 10.1063/5.0173672  

    ISSN:1070-6631

    eISSN:1089-7666

  23. Flow patterns and defect dynamics of active nematic liquid crystals under an electric field 査読有り

    Yutaka Kinoshita, Nariya Uchida

    Physical Review E 108 (1) 014605-1-9 2023年7月19日

    DOI: 10.1103/PhysRevE.108.014605  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  24. Effect of mobility on collective phase dynamics of nonlocally coupled oscillators with a phase lag

    Bojun Li, Nariya Uchida

    Physical Review E 106 (5) 054210-1-054210-7 2022年11月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.106.054210  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  25. Emergence of a Giant Rotating Cluster of Fish in Three Dimensions by Local Interactions

    Susumu Ito, Nariya Uchida

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN 91 (6) 064806-1-064806-6 2022年6月

    DOI: 10.7566/JPSJ.91.064806  

    ISSN:0031-9015

  26. Effect of gravitational field on collective motion of fish

    S. Ito, N. Uchida

    EPL 138 (1) 17001-p1-17001-p7 2022年4月

    DOI: 10.1209/0295-5075/ac6621  

    ISSN:0295-5075

    eISSN:1286-4854

  27. Gait switching with phase reversal of locomotory waves in the centipede Scolopocryptops rubiginosus 国際誌 査読有り

    Shigeru Kuroda, Nariya Uchida, Toshiyuki Nakagaki

    Bioinspiration & Biomimetics 17 (2) 026005-026005 2022年3月7日

    出版者・発行元: IOP Publishing

    DOI: 10.1088/1748-3190/ac482d  

    ISSN:1748-3182

    eISSN:1748-3190

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    <title>Abstract</title> Crawling using locomotory waves is a common method of locomotion for limbless and many-legged invertebrates and stimulates the biomimetic engineering of flexible locomotion. It is generally believed that the direction of locomotory waves is fixed for a given species. However, we found that a centipede, <italic>Scolopocryptops rubiginosus</italic>, flexibly generated its gait to allow for locomotory waves that varied in direction, depending on (i) locomotion speed and (ii) the physical conditions of terrain. We also found a new type of centipede’s swimming gait unlike eel-like way known so far which is using posteriorly traveling waves of horizontal body undulation. The gait patterns of the centipede were examined in various conditions and analyzed how the waves switched in detailed. We showed that gait patterns were associated with control of stride length rather than stride frequency. Discussion was made on a possible scenario of the gait transition in the centipede compatible with our observations. This finding may give a hint at bio-inspired control of flexible gait switching in response to irregular terrain.

  28. Large-scale spatiotemporal patterns in a ring of nonlocally coupled oscillators with a repulsive coupling 査読有り

    Bojun Li, Nariya Uchida

    Physical Review E 104 (5) 054210-1-054210-6 2021年11月22日

    出版者・発行元: American Physical Society (APS)

    DOI: 10.1103/physreve.104.054210  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  29. Motor torque measurement of Halobacterium salinarum archaellar suggests a general model for ATP-driven rotary motors 査読有り

    Seiji Iwata, Yoshiaki Kinosita, Nariya Uchida, Daisuke Nakane, Takayuki Nishizaka

    Communications Biology 2019年12月

    DOI: 10.1038/s42003-019-0422-6  

  30. Hydrodynamic synchronization and collective dynamics of colloidal particles driven along a circular path

    Takumi Miyamoto, Masayuki Imai, Nariya Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 100 (3) 2019年9月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.100.032607  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  31. Three-dimensional tracking of microbeads attached to the tip of single isolated tracheal cilia beating under external load 査読有り

    Takanobu A. Katoh, Koji Ikegami, Nariya Uchida, Toshihito Iwase, Daisuke Nakane, Tomoko Masaike, Mitsutoshi Setou, Takayuki Nishizaka

    Scientific Reports 8 (1) 15562-1-15562-9 2018年10月

    出版者・発行元: Springer Nature

    DOI: 10.1038/s41598-018-33846-5  

    ISSN:2045-2322

  32. Dynamic gait transition in theScolopendromorpha scolopocryptops rubiginosus L. Kochcentipede

    Shigeru Kuroda, Nariya Uchida, Toshiyuki Nakagaki

    2018年5月

    出版者・発行元: Cold Spring Harbor Laboratory

    DOI: 10.1101/312280  

  33. How Do Nanorobots Swim in Slime? 招待有り 査読有り

    Nariya Uchida

    JPSJ News and Comments 14 05 2017年4月24日

    DOI: 10.7566/JPSJNC.14.05  

  34. Impurity-tuned non-equilibrium phase transition in a bacterial carpet 査読有り

    Yi-Teng Hsiao, Kuan-Ting Wu, Nariya Uchida, Wei-Yen Woon

    APPLIED PHYSICS LETTERS 108 (18) 183701-1-183701-5 2016年5月

    DOI: 10.1063/1.4948766  

    ISSN:0003-6951

    eISSN:1077-3118

  35. 流体力学相互作用による鞭毛と繊毛の集団ダイナミクス 査読有り

    内田就也, ラミンゴレスタニアン

    数理解析研究所講究録 1994 12-16 2016年4月

    出版者・発行元: 京都大学

    ISSN:1880-2818

  36. Separating Ciliary Beating Force into Dynein-Driven Force and Axoneme-Intrinsic Bending Force By 3-D Tracking Microscopy 査読有り

    Takanobu A. Katoh, Koji Ikegami, Nariya Uchida, Toshihito Iwase, Tomoko Masaike, Mitsutoshi Setou, Takayuki Nishizaka

    BIOPHYSICAL JOURNAL 110 (3) 132A-132A 2016年2月

    DOI: 10.1016/j.bpj.2015.11.756  

    ISSN:0006-3495

    eISSN:1542-0086

  37. バクテリア懸濁液の界面近傍における集団運動

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 71 3126-3126 2016年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.71.2.0_3126  

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    <p>高濃度バクテリア懸濁液は自発的に渦を生成しアクティブ乱流相を形成することが知られている。一方で界面近傍における高濃度バクテリア懸濁液の集団運動のパターンはよく分かっていない。われわれは固・液・界面および固・液・気3相界面における集団運動のモデルとして、バクテリア間の排除体積相互作用および流体力学相互作用を取り入れた離散モデルを導入し、数値シミュレーションを行なった。本講演ではその結果を報告する。</p>

  38. Reinforced shape-tunable microwrinkles formed on a porous-film-embedded elastomer surface 査読有り

    T. Ohzono, Y. Hirai, K. Suzuki, M. Shimomura, N. Uchida

    SOFT MATTER 10 (37) 7165-7169 2014年

    DOI: 10.1039/c4sm00942h  

    ISSN:1744-683X

    eISSN:1744-6848

  39. 流体力学的同期現象:鞭毛や繊毛の集団運動の理解に向けて 査読有り

    内田就也

    日本物理学会誌 67 (11) 754-757 2012年11月5日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN:0029-0181

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    水中に棲息する単細胞生物の多くは鞭毛や繊毛の集団運動を利用して泳動を制御している。これらの運動には流体力学相互作用が重要な役割を果たしていると考えられるが,その具体的な機構はまだよく理解されていない.われわれはそのミニマルモデルとして,鞭毛や繊毛の重心運動に着目した回転子モデルを提案し,同期が起きるための一般的条件や,多様な集団運動パターンを見出した.

  40. 低レイノルズ数における流体力学的同期現象:ミニマルアプローチ

    内田就也

    数理解析研究所講究録 1808 78-87 2012年9月

    出版者・発行元: 京都大学

    ISSN:1880-2818

  41. 1SF-03 鞭毛や繊毛の流体力学相互作用による同期 : ミニマルアブローチ(1SF 生物の動きと変形への理論的アプローチ,シンポジウム,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

    内田 就也, Golestanian Ramin

    生物物理 52 S6 2012年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本生物物理学会

    DOI: 10.2142/biophys.52.S6_3  

  42. マイクロ流動回転子系の流体力学的同期現象

    内田就也

    数理解析研究所講究録 1742 42-48 2011年5月

    出版者・発行元: 京都大学

    ISSN:1880-2818

  43. Orientational ordering of buckling-induced microwrinkles on soft substrates (vol 6, pg 5729, 2010) 査読有り

    Nariya Uchida, Takuya Ohzono

    SOFT MATTER 7 (24) 11551-11551 2011年

    ISSN:1744-683X

  44. Synchronization in a carpet of hydrodynamically coupled rotors with random intrinsic frequency 査読有り

    N. Uchida, R. Golestanian

    EPL 89 (5) 50011 2010年3月

    DOI: 10.1209/0295-5075/89/50011  

    ISSN:0295-5075

    eISSN:1286-4854

  45. Orientational ordering of buckling-induced microwrinkles on soft substrates 招待有り 査読有り

    Nariya Uchida, Takuya Ohzono

    SOFT MATTER 6 (22) 5729-5735 2010年

    DOI: 10.1039/c0sm00357c  

    ISSN:1744-683X

  46. Viscoelasticity of entangled semiflexible polymers via primitive path analysis 査読有り

    N. Uchida, Gary S. Grest, Ralf Everaers

    COMPLEX SYSTEMS-BOOK 1 982 536-+ 2008年

    DOI: 10.1063/1.2897854  

    ISSN:0094-243X

  47. Viscoelasticity and primitive path analysis of entangled polymer liquids: From F-actin to polyethylene 査読有り

    Nariya Uchidaa, Gary S. Grest, Ralf Everaers

    JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 128 (4) 044902-1-044902-6 2008年1月

    DOI: 10.1063/1.2825597  

    ISSN:0021-9606

    eISSN:1089-7690

  48. Numerical simulation of the TGB phase of chiral liquid crystals 招待有り 査読有り

    Hiroto Ogawa, Nariya Uchida

    MOLECULAR CRYSTALS AND LIQUID CRYSTALS 477 (1) 511-515 2007年

    DOI: 10.1080/15421400701.734031  

    ISSN:1542-1406

  49. "Structure of Large-angle Twist-Grain-Boundary of Chiral Liquid Crystals

    Hiroto Ogawa, Nariya Uchida

    物性研究 87 (1) 93-94 2006年10月

    出版者・発行元: 物性研究刊行会

    ISSN:0525-2997

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    フラストレートした液晶は位相欠陥によって数百nmスケールの超構造を形成することがある。我々は、液晶の層状秩序と螺旋秩序のフラストレーションによる欠陥構造(Twist-Grain-Boundary相)の安定メカニズムを探るために、連続体(Landau-de Gennes)モデルを数値最小化して位相欠陥の構造を解析した。特に、解析計算が困難な大きくねじれたときの構造に着目し、近似的なモデル(極小曲面)と比較した。その結果、ねじれ角の増加に伴い、液晶の分子密度と分子配向の自由度の分離により層の曲げ弾性が著しく弱化することが明らかになった。

  50. Numerical simulation of the twist-grain-boundary phase of chiral liquid crystals 査読有り

    Hiroto Ogawa, Nariya Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 73 (6) 060701(R)-1-060701(R)-4 2006年6月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.73.060701  

    ISSN:1539-3755

  51. Simulation of complex fluids with multiple intrinsic lengths 査読有り

    H. Ogawa, N. Uchida

    FLOW DYNAMICS 832 324-+ 2006年

    DOI: 10.1063/1.2204517  

    ISSN:0094-243X

  52. Boundary conditions for equilibrating incommensurate periodic patterns 査読有り

    Hiroto Ogawa, Nariya Uchida

    Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 72 (5) 2005年11月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.72.056707  

    ISSN:1539-3755 1550-2376

  53. Boundary conditions for equilibrating incommensurate periodic patterns 査読有り

    H Ogawa, N Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 72 (5) 056707-1-056707-7 2005年11月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.72.056707  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  54. Orientational order in buckling elastic membranes 招待有り 査読有り

    N Uchida

    PHYSICA D-NONLINEAR PHENOMENA 205 (1-4) 267-274 2005年6月

    DOI: 10.1016/j.physd.2005.01.009  

    ISSN:0167-2789

  55. 膜の座屈による皺パターン

    内田 就也

    数理解析研究所講求録 1413 130-138 2005年2月

    出版者・発行元: 京都大学

    ISSN:1880-2818

  56. Numerical study of microphase separation in gels and random media 査読有り

    N Uchida

    PHYSICS LETTERS A 328 (2-3) 201-206 2004年7月

    DOI: 10.1016/j.physleta.2004.05.059  

    ISSN:0375-9601

    eISSN:1873-2429

  57. Pattern formation in microphase-separating copolymer gels 査読有り

    N Uchida

    JOURNAL OF PHYSICS-CONDENSED MATTER 16 (4) L21-L27 2004年2月

    DOI: 10.1088/0953-8984/16/4/L01  

    ISSN:0953-8984

    eISSN:1361-648X

  58. Dynamics of orientational phase ordering coupled to elastic degrees of freedom 査読有り

    N Uchida

    SLOW DYNAMICS IN COMPLEX SYSTEMS 708 160-161 2004年

    ISSN:0094-243X

  59. ネマティック液晶ゲルにおけるソフト弾性構造 招待有り

    内田就也

    物性研究 80 (4) 554-592 2003年7月

    出版者・発行元: 物性研究刊行会

    ISSN:0525-2997

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    液晶高分子ゲルは,液晶の持つ方向自由度とゲルの弾性変形の結合によるユニークな力学的性質を示す.中でもネマティック相にある液晶ゲルは,シアー変形に対する応力が一定条件下でゼロになるソフト弾性を示す.本稿ではこれを可能にする相関構造を特定し,配向の乱れた液晶ゲルで見られるソフト大変形を説明する.また,この乱れの原因として,非平衡状態で生成されたゲルのネットワーク構造に凍結されたランダム応力を取り上げる.さらに方向自由度を縮約した有効弾性自由エネルギーの解析により,歪みの自発的な対称性の破れからソフトモードが生じることが一般的に示される.その応用として相分離に伴うパターン形成を議論する.

  60. Dynamics of orientational ordering in fluid membranes 査読有り

    N Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 66 (4) 040902-1-040902-4 2002年10月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.66.040902  

    ISSN:1539-3755

  61. Pattern formation in phase-separating gels with spontaneous shear 査読有り

    N Uchida

    PHYSICAL REVIEW LETTERS 89 (2) 025702-1-025702-4 2002年7月

    DOI: 10.1103/PhysRevLett.89.025702  

    ISSN:0031-9007

    eISSN:1079-7114

  62. Casimir effect in fluids above the isotropic-lamellar transition 査読有り

    N Uchida

    PHYSICAL REVIEW LETTERS 87 (21) 216101-1-216101-4 2001年11月

    DOI: 10.1103/PhysRevLett.87.216101  

    ISSN:0031-9007

  63. Phase separation in liquid crystal/gel composites: Role of network elasticity 査読有り

    N Uchida

    MOLECULAR CRYSTALS AND LIQUID CRYSTALS 366 2709-2716 2001年

    ISSN:1542-1406

    eISSN:1563-5287

  64. Soft and nonsoft structural transitions in disordered nematic networks 査読有り

    N Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 62 (4) 5119-5136 2000年10月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.62.5119  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  65. Anomalous elasticity of disordered nematic gels 査読有り

    N Uchida

    STATISTICAL PHYSICS 519 214-216 2000年

    ISSN:0094-243X

  66. Elastic effects in disordered nematic networks 査読有り

    N Uchida

    PHYSICAL REVIEW E 60 (1) R13-R16 1999年7月

    DOI: 10.1103/PhysRevE.60.R13  

    ISSN:2470-0045

    eISSN:2470-0053

  67. 液晶高分子ネットワーク複合系における弾性相互作用

    内田就也

    京都大学数理解析研究所講究録 1081 30-47 1999年2月

  68. Elastic interactions in nematic elastomers and gels 査読有り

    N Uchida, A Onuki

    EUROPHYSICS LETTERS 45 (3) 341-347 1999年2月

    DOI: 10.1209/epl/i1999-00169-0  

    ISSN:0295-5075

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MISC 50

  1. 微生物流体力学;生き物の動き・形・流れを探る

    内田 就也

    日本物理学会誌 79 (4) 202-202 2024年4月5日

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/butsuri.79.4_202_1  

    ISSN: 0029-0181

    eISSN: 2423-8872

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    新著紹介 微生物流体力学;生き物の動き・形・流れを探る

  2. 走化性と配向相互作用を持つアクティブ粒子系のBoltzmann-Ginzburg-Landau理論

    櫻井駿, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 79 (1) 2024年

    ISSN: 2189-079X

  3. 視線上の局所的視覚情報を用いた魚の集団運動モデル

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 79 (1) 2024年

    ISSN: 2189-079X

  4. ランダム場下でのアクティブネマティック液晶の凍結パターン

    木下豊, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 79 (2) 2024年

    DOI: 10.1209/0295-5075/adfee6  

    ISSN: 2189-079X

  5. 非局所な視覚相互作用を介した集団運動のボルツマン方程式の構築

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 79 (2) 2024年

    ISSN: 2189-079X

  6. トポロジカル相互作用による巨大な回転魚群の形成機構

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会誌 78 (4) 2023年

    ISSN: 0029-0181

  7. 魚の集団運動における重力場の効果

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 78 (1) 2023年

    ISSN: 2189-079X

  8. 位相遅れのある非局所結合を持つモバイル振動子系の集団位相ダイナミクス

    LI Bojun, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 78 (1) 2023年

    ISSN: 2189-079X

  9. 逆カルマン渦を介した魚間流体相互作用の平板翼による自己推進モデル

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 78 (2) 2023年

    ISSN: 2189-079X

  10. 固体基板上の自己駆動液滴の自走・合体ダイナミクス

    小谷野由紀, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77 (1) 2022年

    ISSN: 2189-079X

  11. 魚の回転する巨大な群れの局所相互作用を用いたモデル

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77 (1) 2022年

    ISSN: 2189-079X

  12. 光渦で駆動される粒子集団の位相ダイナミクス

    宮本 拓実, 今井 正幸, 内田 就也

    日本物理学会講演概要集 74.2 2672-2672 2019年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.74.2.0_2672  

    eISSN: 2189-0803

  13. 一次元非局所結合振動子系におけるマルチキメラ状態の時空相関構造II

    川瀬 克哉, 内田 就也

    日本物理学会講演概要集 74.2 2296-2296 2019年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.74.2.0_2296  

    eISSN: 2189-0803

  14. アーキアべん毛作動機構解明のための精密顕微測定技術

    木下佳明, 内田就也, 中根大介, 西坂崇之

    バイオインダストリー 34 (3) 61-69 2017年3月12日

    出版者・発行元: シーエムシー出版

  15. アクティブ乱流が誘起するコロイド粒子の偏析

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 72.2 2760-2760 2017年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.72.2.0_2760  

    eISSN: 2189-0803

  16. アーキア H. salinarum の歳差運動を伴う遊泳の流体力学モデル

    内田 就也, 木下 佳昭, 中根 大介, 西坂 崇之

    日本物理学会講演概要集 72 (0) 3155-3155 2017年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    詳細を見る 詳細を閉じる

    &lt;p&gt;古細菌 Halobacterium salinarum はラセン状のべん毛を回転させて歳差運動をしながら遊泳することが最近の顕微鏡観察によって定量的に示された(Kinosita et al., Nature Microbiology 1, 16148, 2016)。われわれは、 流体力学モデル(抵抗力理論) を用いて遊泳速度や遊泳パターンの再現を試みると共に、モーターのエネルギー効率を評価した。その結果について報告する。&lt;/p&gt;

  17. 三次元位置検出顕微鏡を用いた曲り力測定と運動中の形状測定から明らかになった繊毛内部におけるダイニンの力発生

    加藤孝信, 池上浩司, 内田就也, 岩瀬寿仁, 政池知子, 政池知子, 瀬藤光利, 西坂崇之

    日本細胞生物学会大会(Web) 68th ROMBUNNO.T1‐8 (WEB ONLY)-50 2016年5月

    出版者・発行元: (一社)日本細胞生物学会

  18. Unitary Steps of Supermolecular Motility Machineries in Gliding Bacteria and Swimming Arcaea 査読有り

    Yoshiaki Kinosita, Nakane Daisuke, Nariya Uchida, Makoto Miyata, Takayuki Nishizaka

    BIOPHYSICAL JOURNAL 110 (3) 198A-198A 2016年2月

    DOI: 10.1016/j.bpj.2015.11.1107  

    ISSN: 0006-3495

    eISSN: 1542-0086

  19. 同期現象の数理 蔵本モデルとその周辺

    内田就也

    数理科学 54 (1) 32-38 2016年1月1日

    出版者・発行元: サイエンス社

    ISSN: 0386-2240

  20. 24pAR-10 繊毛メタクロナル波のミニマルモデルIII

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 70.1 3454 2015年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.70.1.0_3454  

    eISSN: 2189-0803

  21. 8pPSA-56 繊毛メタクロナル波のミニマルモデルII(8pPSA 領域11ポスターセッション,領域11(物性基礎論・統計力学・流体物理・応用数学・社会経済物理))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 69.2.2 145 2014年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.69.2.2.0_145_1  

    eISSN: 2189-0803

  22. 27pPSB-37 Smoothed Profile Methodによるアクティブ粒子系の流体シミュレーション(27pPSB 領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 68 (1) 383-383 2013年3月26日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  23. 26aKL-1 繊毛メタクロナル波のミニマルモデル(生物合同2,領域11,領域12合同,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 68.2.2 240 2013年

    出版者・発行元: 一般社団法人 日本物理学会

    DOI: 10.11316/jpsgaiyo.68.2.2.0_240_1  

    eISSN: 2189-0803

  24. 7G11 流体力学的同期現象のミニマルモデル : 繊毛や鞭毛の協同運動の理解に向けて(OS17 繊毛・鞭毛・微生物のバイオメカニクス)

    内田 就也, Golestanian Ramin

    バイオエンジニアリング講演会講演論文集 2012 (24) "7G11-1"-"7G11-2" 2012年1月6日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本機械学会

  25. 23pGU-8 流体力学的同期現象のミニマルモデル(23pGU 反応拡散系・振幅方程式系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也, Golestanian Ramin

    日本物理学会講演概要集 66 (2) 287-287 2011年8月24日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  26. アクティブ流動カーペットと長距離結合振動子系の同期現象(非平衡系の物理-非平衡ゆらぎと集団挙動-,研究会報告)

    内田, 就也

    物性研究 96 (1) 55-58 2011年4月5日

    出版者・発行元: 物性研究刊行会

    ISSN: 0525-2997

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    この論文は国立情報学研究所の電子図書館事業により電子化されました。

  27. 25pTF-10 アクティブ流動回転子系の同期現象 : 鞭毛や繊毛の集団運動の理解に向けて(25pTF 反応拡散系・振幅方程式系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也, Golestanian Ramin

    日本物理学会講演概要集 66 (1) 298-298 2011年3月3日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  28. 23pTD-2 長距離結合振動子系の同期現象の理論(23pTD 反応拡散系・振幅方程式系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 65 (2) 215-215 2010年8月18日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  29. 22pEJ-14 基盤上に配列したマイクロ流動回転子系の流体力学的同期と集団ダイナミクス(22pEJ 複雑な流れ,渦運動,地球・宇宙流体,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也, Golestanian Ramin

    日本物理学会講演概要集 65 (1) 340-340 2010年3月1日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  30. フラクタル都市構造に見る異文化比較

    渡邊 あしな, 菊池 伯夫, 内田 就也

    形の科学会誌 = Bulletin of the Society for Science on Form 22 (1) 76-77 2007年5月1日

    ISSN: 0915-6089

  31. 20pPSA-28 乱れた層状液晶エラストマー・ゲルの力学応答(領域12ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 62 (1) 362-362 2007年2月28日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  32. 24pPSB-14 スメクティックA液晶の有効層曲げ弾性(24pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    小川 洋人, 内田 就也

    日本物理学会講演概要集 61 (2) 263-263 2006年8月18日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  33. 30pRH-9 TGB相の欠陥コア構造の数値シミューレーション(30pRH 液晶・シミュレーション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    小川 洋人, 内田 就也

    日本物理学会講演概要集 61 (1) 391-391 2006年3月4日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  34. 22pPSA-10 ソフト基板上の細胞成長における弾性相互作用(領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 60 (2) 253-253 2005年8月19日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  35. 弾性膜の座屈ダイナミクスと皺パターン

    内田 就也

    形の科学会誌 = Bulletin of the Society for Science on Form 20 (1) 91-92 2005年6月1日

    ISSN: 0915-6089

  36. 26pYB-12 ソフト基板上の弾性膜の座屈パターン(その他の系(破壊・Tsallis統計・ソフトマター・パターン形成),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 60 (1) 303-303 2005年3月4日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  37. 14aTC-11 弾性膜の座屈による皺パターン(統計力学・ソフトマター・摩擦, 領域 11)

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 59 (2) 233-233 2004年8月25日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  38. 17. 膜のEuler座屈によるパターン形成(ポスターセッション,ソフトマターの物理学2004-変形と流動-,研究会報告)

    内田 就也

    物性研究 83 (3) 395-395 2004年

    出版者・発行元: 物性研究刊行会

    ISSN: 0525-2997

  39. 23aZB-1 ブロックコポリマーゲルのミクロ相分離

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 58 (2) 320-320 2003年8月15日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  40. 29aYC-5 ネマティックゲルの有効非線形弾性とソフトモード

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 58 (1) 344-344 2003年3月6日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  41. ブロックコポリマーゲルのミクロ相分離(ソフトマターの物理学2003-普遍性と多様性-,研究会報告)

    内田 就也

    物性研究 81 (2) 285-285 2003年

    出版者・発行元: 物性研究刊行会

    ISSN: 0525-2997

  42. 24pYB-6 等方・層状相転移近傍における擬Casimir力(24pYB 複雑液体・高分子溶液,領域12(高分子・液晶,化学物理,生物物理分野))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 57 (1) 308-308 2002年3月1日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  43. 24aYB-11 ネマティック液晶ゲルの相分離II(24aYB 液晶・ゲル,領域12(高分子・液晶,化学物理,生物物理分野))

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 57 (1) 303-303 2002年3月1日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  44. 相転移ダイナミクスにおける方向秩序と弾性の結合(基研研究会「ソフトマターの物理学」,研究会報告)

    内田 就也

    物性研究 79 (2) 193-193 2002年

    出版者・発行元: 物性研究刊行会

    ISSN: 0525-2997

  45. 24pZC-9 ネマティック液晶ゲルの配向ゆらぎ

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 55 (1) 300-300 2000年3月10日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  46. Soft and nonsoft structural transitions in disordered nematic networks

    Physical review. E 62 (4) 5119-5136 2000年

    出版者・発行元: American Physical Society

    ISSN: 1539-3755

  47. 24aN-9 ネマティック液晶ゲルの相分離

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 54 (2) 288-288 1999年9月3日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  48. 28a-XG-6 ネマティック高分子ネットワークにおける弾性相互作用

    内田 就也

    日本物理学会講演概要集 54 (1) 720-720 1999年3月15日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

  49. Elastic effects in disordered nematic networks

    UCHIDA N.

    Physical review. E 60 (1) R13-R16 1999年

    出版者・発行元: American Physical Society

    ISSN: 1539-3755

  50. 2a-YC-13 Emulsificationのダイナミクス

    内田 就也, 小貫 明

    日本物理学会講演概要集 53 (1) 724-724 1998年3月10日

    出版者・発行元: 一般社団法人日本物理学会

    ISSN: 1342-8349

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書籍等出版物 2

  1. 高校で物理を履修しなかった人のための力学

    内田, 就也

    共立出版 2021年1月

    ISBN: 9784320035034

  2. 自己組織化ハンドブック

    内田就也

    エヌ・ティー・エス 2009年11月

講演・口頭発表等 75

  1. Selective decision-making and collective motion induced by the visual attention of fish

    Susumu Ito, Nariya Uchida

    Engineering of Chemical Complexity 11 2025年7月31日

  2. 非局所的視覚相互作用を介した集団運動のボルツマン方程式による転移現象

    伊藤将, 内田就也

    日本物理学会 2025年春季大会 2025年3月20日

  3. Hydrodynamic effects in the collective motion of bacteria 招待有り

    内田就也

    Active Matter Workshop 2018 2018年1月20日

  4. 整列を伴うラン・アンド・タンブル走化性の格子モデル

    内田就也, 金吉漢

    第27回日本数理生物学会年会 2017年10月6日

  5. アクティブ乱流が誘起するコロイド粒子の偏析

    内田就也, Hartmut Loewen

    日本物理学会2017年秋季大会 2017年9月21日

  6. Boundary effects on the collective motion of swimming bacteria

    Nariya Uchida

    新学術領域研究「ゆらぎと構造の協奏」第4回領域研究会 2017年6月23日

  7. 高度好塩菌ハロバクテリウムサリナラムのアーキアべん毛の回転 とステップの検出

    木下 佳昭, 内田 就也, 中根 大介, 西坂 崇之

    第90回日本細菌学会 2017年3月19日

  8. アーキア H. salinarum の歳差運動を伴う遊泳の流体力学モデル

    木下佳昭, 中根大介, 西坂崇之

    日本物理学会第72回年次大会 2017年3月17日

  9. 滑走バクテリアと遊泳アーキアの運動超分子マシナリーの単位ステップ観察

    木下 佳昭, 中根 大介, 宮田 真人, 西坂 崇之

    第54回日本生物物理学会 2016年11月25日

  10. 高度高塩菌ハロバクテリウムサリナラムのべん毛の回転とステップ運動の直接観察

    木下 佳昭, 中根 大介, 西坂 崇之

    第54回日本生物物理学会 2016年11月25日

  11. Some applications of Smoothed Profile Method for active flow in and out of cells 国際会議

    Nariya Uchida

    International Workshop on Hydrodynamic Flows in/of Cells 2016年11月24日

  12. 固液界面上でのバクテリアの集団運動

    内田就也

    第13回「生物数学の理論とその応用」 2016年11月14日

  13. Collective dynamics of flagella, cilia and active filaments near surfaces 国際会議

    Nariya Uchida

    Current and Future Perspectives in Active Matter 2016年10月28日

  14. Hydrodynamic model of Halobacterium Salinarum as an example of helical swimmers

    木下 佳昭, 中根 大介, 西坂 崇之

    生物流体現象におけるミクロ運動とマクロ運動 2016年10月24日

  15. 繊毛、べん毛の流体力学的同期現象と集団運動

    内田就也

    第35回エアロ・アクアバイオメカニズム学会定例講演会 2016年9月20日

  16. バクテリア懸濁液の界面近傍における集団運動

    内田就也

    日本物理学会2016年秋季大会 2016年9月13日

  17. Collective Dynamics of Bacteria at Interfaces

    Nariya Uchida

    The 26th Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology 2016年9月7日

  18. Non‐equilibrium transition in self‐propelled particle array mediated through hydrodynamic interactions 国際会議

    Wei Yen Woon, Yi‐Teng Hsiao, Kuan‐Ting Wu

    The 13th Taiwan International Symposium on Statistical Physics and Complex Systems 2016年9月6日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    presented by Wei Yen Woon

  19. Collective Dynamics of Bacteria at Interfaces

    内田就也

    新学術領域研究「ゆらぎと構造の協奏」第3回領域研究会 2016年6月17日

  20. べん毛と繊毛の流体相互作用による同期と集団運動

    内田就也

    研究会「第二回 非線形現象の捉え方」 2016年5月13日

  21. アクティブ乱流中のコロイド粒子の輸送特性

    内田就也, Hartmut Lowen

    日本物理学会第71回年次大会 2016年3月19日

  22. べん毛と繊毛の流体力学モデル

    内田就也

    新学術領域研究「ゆらぎと構造の協奏」若手勉強会 2016年3月10日

  23. Real-time imaging of a helical handedness, pitch and rotation rate of archaeal flagella

    木下佳昭, 中根大介, 西坂崇之

    木下佳昭, 内田就也, 中根大介, 西坂崇之 2016年3月6日

  24. べん毛と繊毛の流体力学モデル: 個と多を結ぶ

    新学術領域研究「ゆらぎと構造」A03班会議 2016年1月25日

  25. 繊毛メタクロナル波の流体力学モデル

    アクティブマター研究会2016 2016年1月22日

  26. 繊毛メタクロナル波の流体力学モデル

    第5回ソフトマター研究会 2015年12月17日

  27. 流体力学相互作用による 鞭毛と繊毛の集団ダイナミクス

    内田就也, ラミン・ゴレスタニアン

    RIMS 研究集会 「生物数学の理論とその応用」 2015年11月24日

  28. Collective Motion of Flagella and Cilia by Hydrodynamic Interaction 国際会議

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    The First International Symposium on Swarm Behavior and Bio­Inspired Robotics 2015年10月28日

  29. 繊毛メタクロナル波の流体力学モデル

    ラミン ゴレスタニアン

    2015 年度 RIMS 研究集会『生物流体力学における運動の諸相』 2015年10月26日

  30. 繊毛メタクロナル波による流体輸送の効率

    Ramin Golestanian

    日本物理学会2015年秋季大会 2015年9月16日

  31. アクティブ乱流中のコロイド粒子のダイナミクス

    Hartmut Lowen

    日本物理学会2015年秋季大会 2015年9月16日

  32. Hydrodynamic Model of Ciliary Metachronal Waves 国際会議

    2015 Joint Meeting of The 5th China-Japan-Korea Colloquium on Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology 2015年8月26日

  33. Collective Dynamics of Cilia and Flagella by Hydrodynamic Interaction 国際会議

    International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015 2015年8月20日

  34. Dynamics of Particles Suspended in Active Turbulent Fluids 国際会議

    Yukawa International Seminar 2015: New Frontiers in Non­equilibrium Statistical Physics 2015年8月17日

  35. 繊毛メタクロナル波のミニマルモデル

    ゆらぎと構造の協奏第2回公開シンポジウム 2015年5月1日

  36. 繊毛メタクロナル波のミニマルモデルIII

    Ramin Golestanian

    日本物理学会第70回年次大会 2015年3月21日

  37. 流体効果によるアクティブ振動子の同期現象と集団運動

    Ramin Golestanian

    新学術領域研究「ゆらぎと構造」研究会「アクティブ・マター研究の過去・現在・未来」 2015年3月14日

  38. 繊毛の流体相互作用による 同期とメタクロナル波

    Ramin Golestanian

    2015年生体運動合同班会議 2015年1月8日

  39. 繊毛メタクロナル波のミニマルモデルII

    Ramin Golestanian

    日本物理学会2014年秋季大会 2014年9月7日

  40. 流体相互作用によるアクティブ回転子の同期現象

    新学術領域研究「ゆらぎと構造の協奏」第2回領域研究会 2014年8月29日

  41. Hydrodynamic Synchronization and Collective Dynamics of Cilia and Flagella 国際会議

    Ramin Golestanian

    Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology 2014年7月28日

  42. 低レイノルズ数における自己駆動素子の流体効果による集団運動

    新学術領域研究「ゆらぎと構造の協奏」公募班キックオフ研究会 2014年4月26日

  43. 繊毛メタクロナル波のミニマルモデル

    Ramin Golestanian

    日本物理学会2013年秋季大会 2013年9月25日

  44. Hydrodynamic synchronization and collective dynamics of rigid-body rotors 国際会議

    Ramin Golestanian

    Dynamics of Suspensions, Gels, Cells and Tissues 2013年6月24日

  45. Topological Defects in Nematic Elastomers, Gels and Membranes 国際会議

    Liquid Crystal Defects and their Geometry, Active and Solid Liquid Crystals, and Related Systems 2013年6月24日

  46. Smoothed Profile Method によるアクティブ粒子系の流体シミュレーション

    日本物理学会第68回年次大会 2013年3月26日

  47. Smoothed profile method for simulating active suspensions 国際会議

    Nariya Uchida

    Self-organization and Emergent Dynamics in Active Soft Matter 2013年2月18日

  48. Synchronization of flagella and cilia by hydrodynamic interactions: minimal approaches 国際会議

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    Active Soft and Biological Matter: A Conference in honour of Jacques Prost 2012年9月30日

  49. Hydrodynamic Synchronization and Collective Dynamics of Microfluidic Rotors 国際会議

    Nariya Uchida, Ramin Golestanian

    Japanese-German-French Workshop “Physics of Active Soft Matter” 2012年9月24日

  50. 鞭毛や繊毛の流体力学相互作用による同期:ミニマルアプローチ

    内田就也

    第50回日本生物物理学会 2012年9月22日

  51. マイクロ流動回転子の同期現象と集団動力学

    内田就也

    The 2nd Workshop on "Fracture, Cracking, Dislocation" 2012年8月31日

  52. 繊毛メタクロナル波のミニマルモデル

    非平衡系の物理-その普遍的理解を目指して 2012年8月1日

  53. Hydrodynamic synchronization at low Reynolds number: minimal approaches 国際会議

    Ramin Golestanian

    Topical Research Meetings on Physics: Swimming and Complexity at Low Reynolds Number 2012年6月7日

  54. 低レイノルズ数における流体力学的同期現象:ミニマルアプローチ

    生物流体力学における同期および関連する現象 2012年5月21日

  55. 長距離結合振動子系の集団同期転移

    日本物理学会第67回年次大会 2012年3月24日

  56. Minimal models of hydrodynamic synchronization and the collective dynamics of flagella and cilia 国際会議

    Phase Transition Dynamics in Soft Matter : Bridging Microscale and Mesoscale 2012年2月20日

  57. 流体力学的同期現象のミニマルモデル-繊毛や鞭毛の協同運動の理解に向けて-

    Ramin Golestanian

    日本機械学会 第24回バイオエンジニアリング講演会 2012年1月7日

  58. Minimal Models of Hydrodynamic Synchronization at Low Reynolds Number 国際会議

    Ramin Golestanian

    International Symposium on Complex Systems 2011 2011年12月1日

  59. 流体力学的同期現象のミニマルモデル

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    日本物理学会 2011年秋季大会 2011年9月21日

  60. 流体力学的同期現象のミニマルモデル

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    非平衡系の物理 -ミクロとマクロの架け橋- 2011年8月18日

  61. 流体力学的同期現象のミニマルモデル - 鞭毛や繊毛の集団運動の理解に向けて-

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    生物ロコモーションと同期現象 2011年8月16日

  62. 流体力学的同期現象のミニマルモデル

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    第1回ソフトマター研究会 2011年8月3日

  63. Soft and non-soft elasticity of polydomain nematic elastomers: a numerical study 国際会議

    Physics of Poly-Domain Liquid Crystalline Elastomers 2011年6月9日

  64. Hydrodynamic Synchronization of Active Microfluidic Rotors 国際会議

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    Far-From-Equilibrium Dynamics 2011年1月4日

  65. アクティブ流動カーペットと長距離結合振動子系の同期現象

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    非平衡系の物理 -非平衡ゆらぎと集団挙動- 2010年11月18日

  66. マイクロ流動回転子系の流体力学的同期現象

    Ramin Golestanian, iv. of Oxf

    力学系研究集会 ---理論から応用へ、応用から理論へ--- 2010年9月27日

  67. 長距離結合振動子系の同期現象の理論

    日本物理学会 2010年秋季大会 2010年9月23日

  68. 基盤上に配列したマイクロ流動回転子系の流体力学的同期と集団ダイナミクス

    Ramin Golestanian, iv. of Sheffiel

    日本物理学会第65回年次大会 2010年3月20日

  69. Collective Dynamics of Microfluidic Rotors 国際会議

    Ramin Golestanian, iv. of Sheffiel

    Frontiers in Non-Equilibrium Physics 2009年7月31日

  70. Polydomain-Monodomain Transition in Smectic Liquid Crystal Elastomers 国際会議

    The 10th Pacific Polymer Conference 2007年12月4日

  71. 乱れた層状液晶エラストマー・ゲルの力学応答

    日本物理学会 2007年春季大会 2007年3月18日

  72. スメクティックA液晶の有効層曲げ弾性

    小川洋人

    日本物理学会 2006年秋季大会 2006年9月23日

  73. Structure of Large-angle Twist-Grain-Boundary of Chiral Liquid Crystals 国際会議

    Hiroto Ogawa

    YITP Workshop "Structures and Dynamics in Soft Matter -Beyond Self-Organization and Hierarchical Structures-" 2006年7月14日

  74. Numerical simulation of the TGB phase of chiral liquid crystals 国際会議

    Hiroto Ogawa

    21st International Liquid Crystal Conference 2006年7月2日

  75. TGB相の欠陥コアの数値シミュレーション

    小川洋人

    日本物理学会第61回年次大会 2006年3月27日

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共同研究・競争的資金等の研究課題 9

  1. 生物の階層的自由度が織りなす流体力学的同期現象の解明

    内田 就也

    提供機関:Japan Society for the Promotion of Science

    制度名:Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    研究機関:Tohoku University

    2024年4月1日 ~ 2028年3月31日

  2. フラストレーションを持つ非線形振動子系の多体同期現象と非平衡相転移

    内田 就也

    提供機関:Japan Society for the Promotion of Science

    制度名:Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    研究機関:Tohoku University

    2021年4月1日 ~ 2024年3月31日

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    非局所相互作用を持つ1次元結合位相振動子系について、1万個の振動子からなる多体系の時空パターンを、相互作用の位相遅れをパラメーターとして数値的に解析した。特に、位相遅れがπ/2 より大きい反発的相互作用の場合について、時空パターンの統計的解析を行った。その結果、位相遅れが臨界値より小さい場合は、隣接する振動子の位相差が正または負の一定値を取るツイステッド領域と、それらの境界にある非同期領域からなるマルチキメラ状態が得られた。また、臨界値においてマルチキメラ状態は連続的に消失し、その転移の様相は2つの対称的な吸収状態を持つ有向浸透現象と定性的に類似している一方、定量的には臨界指数が異なり、新種の非平衡臨界現象とみなせることを示した。さらに位相遅れを大きくすると、進行波や蛇行波などの時空パターンを含む新たなマルチキメラ状態が出現することが明らかになった。位相遅れがπ(逆位相結合)に近づくと、振動子の振動数が一様な定在波パターンを持つマルチツイステッド状態に転移した。このように、反発的相互作用を持つ1次元振動子系は、位相遅れの値によって5つの相(動的定常状態)を示すことが分かった。これらの研究成果は、今年度導入したワークステーションを用いた並列計算により得られ、査読付き論文として出版されたほか、国内学会において発表された。 また、上記のモデルの拡張として、振動子が1次元格子上でランダムウォークを行う系について、モデル構築および数値計算を行なった。この系では振動子の移動によって位相場が攪拌されることにより、位相遅れが大きいところでマルチキメラ状態が消失することを示した。また、予備的な結果として、位相遅れがπ/2より小さい引力的相互作用の場合に、マルチキメラ状態の前駆状態となるパルス的な進行波が強化されることが得られた。

  3. 「バクテリアの集団運動の粒子・連続体ハイブリッドモデルの構築」

    内田 就也

    提供機関:Japan Society for the Promotion of Science

    制度名:Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    研究機関:Tohoku University

    2018年4月1日 ~ 2022年3月31日

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    バクテリアの集団的な運動のパターンを、バクテリアを自発的な推進力を持つ棒状粒子として扱い、化学物質の濃度場や流体の速度場を介した相互作用を取り入れてモデル化、解析した。バクテリア誘引物質を分泌して集合する走化性クラスターについては、棒状の形状および細胞分裂の影響で細長いクラスターが形成されることを示した。また、流体中ではバクテリアの方向がそろったレーニング相が形成されやすくなり、流れの影響で密度揺らぎは抑えられることが分かった。さらに菌体を壁に接着すると、バクテリアのドメイン形成による対流パターンが生じること、およびフィラメントの弾性変形により集団的なウェービングが発生することが判明した。

  4. アクティブフィラメントの運動の多階層モデリング

    内田 就也

    提供機関:Japan Society for the Promotion of Science

    制度名:Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目:Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

    研究機関:Tohoku University

    2016年4月1日 ~ 2018年3月31日

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    ・バクテリアの走化性による集団運動 走化性物質を分泌して他の個体を引き付ける性質(自己走化性)によるバクテリアの凝集について、排除体積による整列効果を取り入れたモデルを開発した。ラン・アンド・タンブル運動を行うバクテリアを、格子上をランダムウォークする粒子として表し、走化性物質の濃度の時間勾配に応じて粒子の方向転換の確率が変化するようなルールを導入することで、走化性による運動のモデルを作成した。またこの確率モデルのマスター方程式を粗視化することで古典的な現象論モデル(Keller-Segel 方程式)を再導出した。次に格子点の排他的占有ルールおよび隣接粒子とのネマティック相互作用を導入して、数値計算によってクラスター形成のダイナミクスを解析した。最大クラスターサイズは走化性パラメーターの関数として不連続な転移を示す。ネマティック相互作用の効果によって凝集は阻害、遅延される傾向を持ち、形成されたクラスターは伸長して直進運動する。またクラスター内部は極性秩序を持つ配向ドメインと位相欠陥からなることを示した。 ・バクテリア乱流中におけるコロイド粒子の集団運動 ハルトムート・レーヴェン氏(デュッセルドルフ大学、ドイツ)との共同研究を進め、2次元モデルの数値計算によってコロイド粒子間に働く有効的流体力学相互作用を解析した。この相互作用は粒子間の距離に対して非単調な依存性を示し、距離0で強さが0になることを見い出した。また2個の粒子が同方向、逆方向のいずれに回転する場合でも引力となるが、近接時においては逆方向の回転が選択されることを示した。これにより3個以上の粒子からなるクラスターでは相互作用のフラストレーションが発生し、クラスター凝集を遅延させることが分かった。

  5. 低レイノルズ数における自己駆動素子の流体効果による集団運動

    内田 就也

    2014年4月1日 ~ 2016年3月31日

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    べん毛、繊毛および関連する非平衡コロイド系の流体効果によるダイナミクスについて、以下の研究結果を得た。 (1)アーキアべん毛のモデル:らせん状べん毛の回転によるアーキア(古細菌)の遊泳の流体力学モデルを構築し、重心速度およびべん毛の傾きに起因する歳差運動の角速度を解析した結果、実験データとのよい一致を得た。(学習院大学の木下佳明氏らとの共同研究。論文投稿中) (2)バクテリアカーペットにおけるアクティブ相転移:2種類のべん毛バクテリアを混合したカーペットについて、塩濃度の変化によって誘起される相転移挙動を解析した。混合比の大小によって2種類の挙動が存在することを見出し、理論的説明を与えた。(国立中央大学の温偉源氏らとの共同研究。論文投稿中) (3)バクテリア乱流中におけるコロイド粒子の集団運動:バクテリア乱流の連続体モデルをコロイドの流体シミュレーション手法と組み合わせ、コロイド粒子が乱流を加速することを見出した。(デュッセルドルフ大学のハルトムート・レーヴェン氏との共同研究) (4)繊毛ビーティング運動を模したコロイドの同期現象:繊毛の有効打と回復打を模した周期変動外力によって駆動される2個のコロイド粒子の同期現象を解析し、同期パターンの動的相図および緩和過程のダイナミクスについて実験データとのよい一致を得た。(ケンブリッジ大学のアルマンド・マエストロ氏、オックスフォード大学のラミン・ゴレスタニアン氏らとの共同研究) (5)マウス気管繊毛の弾性復元力および流体抵抗力の解析:単離したマウス気管繊毛のビーティング運動の観察データを弾性フィラメントモデルにより解析し、繊毛の基部および中間部の曲げ弾性定数を評価した。また流体抵抗力を計算してその寄与が小さいことを見出した。(学習院大学の加藤孝信氏らとの共同研究)

  6. アクティブ流動系における同期現象と協同的ダイナミクスの理論 競争的資金

    内田 就也

    提供機関:Japan Society for the Promotion of Science

    制度名:Grant-in-Aid for Scientific Research

    研究種目:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    研究機関:Tohoku University

    2011年4月 ~ 2014年3月

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    本研究課題では流体力学的相互作用による繊毛や鞭毛の集団運動について数理モデルを構築し、次の結果を得た。繊毛の剛体回転子モデルを構築し、繊毛のペアおよび1次元、2次元配列におけるダイナミクスを解析した。繊毛の駆動力のパターン、基盤からの距離、軌道の形状や傾き、繊毛の柔軟性に依存して、多様な同期状態、進行波パターンが生じることを示した。またバクテリアカーペットにおける多数の鞭毛による協同的輸送現象を数値的に解析した。また一般的な長距離相互作用による集団同期転移の特性を場の理論的手法により明らかにした。

  7. ソフトマター複合系としての細胞力学の数理モデル 競争的資金

    内田 就也

    制度名:Grant-in-Aid for Scientific Research

    2006年4月 ~ 2008年3月

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    1.生体高分子溶液の粘弾性の数値解析とスケーリング理論 細胞骨格をはじめとする生体高分子ネットワークの力学的性質、特に静的弾性率の濃度依存性および高分子の剛直性への依存性を明らかにするため、からみあった高分子の溶液系の分子シミュレーションを行なった。からみあいのトポロジーを決定するいわゆる原始経路を数値的、統計的に解析することによって、剛直性の小さい人工高分子から、剛直性の大きい生体高分子まで広い範囲にわたる高分子系のゴム弾性率を決定し、既存の実験結果とのよい一致を見た。さらに、スケーリング理論により任意の剛直性を持つ(等方的な)高分子ネットワークの弾性率の一般的な表式を導出することに成功した。 (R. Everaers (ENSリヨン校、フランス),G.S. Grest(サンディア国立研究所、米国)との共同研究) 2.水中微生物の持つ回転モーターの集団ダイナミクスのモデル化と数値解析 バクテリアやゾウリムシの泳動器官である鞭毛や繊毛など細胞膜に埋め込まれた回転モーターの、流体を介した相互作用を解析した。回転モーターのモデルとして、平坦な細胞膜から一定の高さで一定のトルクを受けて回転する剛体を考え、回転モーターの集団の非線形動力学を数値的に解析した。その結果、回転モーターが周囲の流体に及ぼすアクティブカの角度によって、大域的同期(方向秩序化)、らせん波、パルスドメインなど多様な同期パターンが生じることを見い出した。これは、長距離相互作用を持つ結合振動子系の新たな具体例を提供するものである。 (R.Golestanian(シェフィールド大学、英国)との共同研究)

  8. ソフトマターにおける方向自由度と粘弾性の協同効果 競争的資金

    内田 就也

    制度名:Grant-in-Aid for Scientific Research

    2003年4月 ~ 2005年3月

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    1.ブロック共重合ポリマーを架橋して作られるゲルのミクロ相分離ドメイン構造を理解するため、架橋時における濃度場のゆらぎを空間的にランダムな外場として取り入れた連続場モデル(Ginzburg-Landau型モデル)を構成し、数値シミュレーションにより2次元ドメイン構造の統計的性質を調べた。共重合体の成分比が1:1の対称組成の場合、弱いランダム場に対しては不均一な層状構造が、強いランダム場に対しては双連結ドメイン構造が得られた。この結果は従来の実験結果および分子シミュレーションの結果と一致している。界面の短波長ゆらぎがピン止めされる結果、散乱関数のピークは高波数側に広がることが分かった。また非対称組成の場合に生じる柱状相では、サイズ多分散性のある液滴状ドメイン構造が得られた。 2.弾性膜の座屈によって生じる皺状パターンを理解するため、ほぼ平坦な膜の非線形弾性を記述するFoeppl-von-Karmanモデルに基づく数値シミュレーションおよび解析を行なった。数値シミュレーションにおいては散逸的な動力学モデルを用いて、急激な圧縮を受けたあとの変形パターンの時間発展を調べた。パターンの特徴的なサイズはべき乗則に従って成長し、べき指数は従来のスケーリング理論から予測されるものとよく一致することが分かった。解析においては、膜の水平方向への変位を断熱的に消去することにより、膜の勾配ベクトルを変数とする2次元ベクトルスピン系にマッピングした。膜のシアー変形が媒介するスピン間の長距離相互作用により、皺の方向に異方的相関が生じることを示した。

  9. 液晶・高分子ネットワーク複合系の統計物理

    内田 就也

    2001年 ~ 2002年

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    1.液晶膜の相転移における流体力学効果 2次元液晶膜の等方・ネマティック相転移に伴う方向秩序化ダイナミクスについて、溶媒の流れが媒介する長距離流体力学相互作用の効果を、高速Fourier変換を用いた数値シミュレーションにより調べた。その結果、方向相関距離は時間の0.17乗に漸近的に比例することが分かった。これは流れがダイナミクスを加速するという予測を裏付ける一方、次元解析から期待される成長法則(時間の1/3乗に比例)に比べて遅い。その可能な理由として、位相的欠陥に伴う膜の曲げ変形のエネルギーが、欠陥間の距離に対して対数的に依存することを示した。 2.方向秩序と弾性の結合した系のソフトモード 液晶ゲルが持つソフトな変形モードを、方向秩序と弾性を合わせ持つ連続媒質という観点から一般的に定式化した。すなわちd次元空間内に埋め込まれたD次元多様体の上に、液晶性を表すベクトル場と多様体の変形を表すスカラーまたはベクトル場がある系を考えた。これら2つの場の相互作用による自発的な対称性の破れにより、自由エネルギー最小状態は異方的な変形を持つ。この状態の周りの微小変形モードは必ずソフト化することが分かった。この特別な例として液晶膜では、曲率一定の平衡状態の周りでの曲げ揺らぎがソフト化する。 3.層状ゲルの弾性の現象論的モデルの構成 ブロック共重合ポリマーを架橋して作られる層状ゲルのモデルを、従来型ゲルのアフィン変形モデルの現象論的拡張により構成した。すなわち共重合ポリマーを構成する2成分の相分離に伴うポリマーの変形が、濃度場の勾配に平行かつアフィン的に起こるものと仮定し、弾性自由エネルギーを濃度場の汎関数として導出した。このモデルに基づく予備的な数値シミュレーションからは、溶媒に対する2成分の親和性が異なる場合、ミクロ相分離により生じる層状の構造が不安定化することが示された。 なお以上の研究は特別研究員辞退後、異動先において補助金の再交付を受けて継続されたものである。

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その他 3

  1. メタクロナル波を用いた生物移動の制御メカニズムと環境 応答特性の解明

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    ムカデなどの多足動物が地を這う運動(這行運動)において、多数の足 の協調運動は体軸に沿って一方向に伝搬する進行波(メタクロナル波) を形成することが知られている。従来、この足波の伝搬方向は動物種に よって固定していると考えられていたが、黒田らはある種のムカデにおいては環境条件によって足波の伝搬方向が逆転することを見出した。す なわちムカデに与えた刺激や這行表面の材質に応じて、足波はムカデの 運動方向と平行または反平行に伝播する。一方ゾウリムシなどの繊毛虫 も、体表にある多数の繊毛の水かき運動が同期してメタクロナル波を形 成するが、その伝播方向は周囲の流体の粘性などの環境条件に応じてや はり変化することが知られている。本申請者はこのような繊毛の協調運 動に関して、繊毛間の流体相互作用を考慮した物理モデルを提案し、 個々の繊毛の運動パターンによってメタクロナル波の伝播方向が制御さ れることを示した。本申請研究ではこの知見をムカデに応用して、力学 的相互作用を介したメタクロナル波の制御メカニズムおよびその環境条 件に対する応答特性を、実験データを反映した数理モデルによって解明 し、生物種を超えた物理的な描像を構築する。

  2. 実験と理論の共同による生物移動におけるメタクロ ナル波の発生メカニズムの解明

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    多足動物の足波と繊毛虫の繊毛波の機能的・力学的類似性に注目し繊毛打のモデルを拡張することによって、ムカデのメタクロナル波へ応用する。具体的には、様々な環境条件における足波を高速カメラによって撮影し、得られた動画像をコンピュータを用いて解析することにより、体軸に並んだ各足の軌道および位相データ等を抽出する(実験および動画像解析)。このデータから直接的にモデルの肝である位相ダイナミクスの推定を試みる。これは、繊毛軌道の定量的測定が困難である繊毛虫に対してムカデが有する優位な特徴である。さらに得られた位相ダイナミクスの理論解析を行い、異なる環境条件におけるムカデの歩行パターンを比較、分析することで、メタクロナル波発生の物理メカニズムを明らかにする(実験データ駆動型数理モデリング)。この間、必要に応じて追加実験を提案し、得られたデータをモデル作成に還元する。このような実験と理論との間の相互フィードバックを行い、モデルの信頼性を向上させていく。得られた多足モデルと繊毛打モデルを比較し、ゾウリムシからムカデまでメタクロナル波を用いた生物移動の理解に向けたより包括的な物理モデルの枠組を探る。

  3. 生物移動におけるメタクロナル波の力学モデル:ゾウリムシ からムカデまで

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    生物において複数の運動器官が協調して進行波状の集団運動を示しこれを用いて移動する現象は、メタクロナル波として知られている。本共同研究では、ゾウリムシからムカデまで、生物種を超えたメタクロナル波の普遍的特徴の抽出と数理モデルの構築を行う。