研究者詳細

顔写真

スヤマ　ヨシヒサ
陶山　佳久
Yoshihisa Suyama
所属
大学院農学研究科　生物生産科学専攻　植物生命科学講座（森林生態学分野）
職名
教授
学位

  • 博士（農学）（筑波大学）

  • 農学修士（農林学）（筑波大学）

委員歴 28

  • 宮城県環境審議会　委員

    2016年8月 ～ 継続中

  • 宮城県試験研究機関評価委員会 林業関係試験研究機関評価部会　部会長

    2015年4月 ～ 継続中

  • 個体群生態学会　Population Ecology副編集長

    2015年1月 ～ 継続中

  • 日本生態学会東北地区会　地区委員

    2008年8月 ～ 継続中

  • 日本生態学会・Ecological Research編集委員会　編集長

    2020年1月 ～ 2021年12月

  • 種生物学会　会長

    2019年1月 ～ 2021年12月

  • 宮城県自然環境保全審議会環境基本計画策定専門委員会　専門委員

    2019年4月 ～ 2021年3月

  • 文部科学省　遺伝子組換え生物等の第一種使用規程の申請に対する学識経験者

    2018年11月 ～ 2020年10月

  • 国立研究開発法人 森林総合研究所 外部課題評価委員会　委員

    2016年4月 ～ 2020年3月

  • 日本生態学会・Ecological Research編集委員会　副編集委員長

    2018年1月 ～ 2019年12月

  • 一般社団法人日本生態学会　代議員

    2015年11月 ～ 2019年12月

  • 種生物学会　和文誌副編集委員長

    2016年1月 ～ 2018年12月

  • 種生物学会　副会長

    2016年1月 ～ 2018年12月

  • 宮城県自然環境保全審議会　委員

    2016年10月 ～ 2018年9月

  • 宮城県自然環境保全審議会地球温暖化対策地方公共団体実行計画（区域施策編）策定専門委員会　専門委員

    2017年4月 ～ 2018年7月

  • 日本生態学会東北地区会　地区委員長

    2016年8月 ～ 2018年7月

  • 宮城県試験研究機関評価委員会　委員

    2015年4月 ～ 2018年3月

  • 日本生態学会　Ecological Research編集委員会委員

    2004年4月 ～ 2017年12月

  • 一般社団法人日本生態学会　監事

    2015年1月 ～ 2017年3月

  • 種生物学会　和文誌編集委員長

    2013年1月 ～ 2015年12月

  • 種生物学会　地区幹事

    2013年1月 ～ 2015年12月

  • 一般社団法人日本生態学会　専務理事

    2013年1月 ～ 2014年12月

  • East Asian Federation of Ecological Societies　Executive Committee

    2013年1月 ～ 2014年12月

  • 日本生態学会自然保護専門委員会委員　自然保護専門委員会委員

    2008年3月 ～ 2014年3月

  • 日本森林学会　Journal of Forest Research編集委員会委員

    2004年4月 ～ 2012年12月

  • 種生物学会　和文誌編集委員

    2001年1月 ～ 2012年12月

  • 日本植物学会　Journal of Plant Research編集委員

    2007年1月 ～ 2010年12月

  • 日本花粉学会　会誌編集委員

    2003年4月 ～ 2006年3月

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所属学協会 5

  • 日本進化学会

  • 種生物学会

  • 日本植物学会

  • 日本森林学会

  • 日本生態学会

研究キーワード 3

  • 保全遺伝

  • 森林生態

  • 分子生態

研究分野 3

  • ライフサイエンス / 遺伝学 /

  • ライフサイエンス / 森林科学 /

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学 /

受賞 5

  1. 日本DNA多型学会優秀研究賞

    2018年12月　日本DNA多型学会　日本DNA多型学会優秀研究賞

  2. 森林遺伝育種学会賞

    2018年11月　森林遺伝育種学会　森林遺伝育種学的研究のためのMIG-seq（multiplexed ISSR genotyping by sequencing）法の開発

  3. 平成30年度日本森林学会賞

    2018年1月12日　日本森林学会　森林生態・遺伝育種学的研究のための分子生物学的分析手法の開発と普及

  4. WET Excellent Paper Award

    2012年6月30日　Water and Environment Technology Conference 2012　受賞論文名: Soil faunal diversity and possible role on wastewater treatment in the beds of a full-scale vertical flow constructed wetland

  5. 日本菌学会平塚賞

    2004年5月29日　日本菌学会

論文 308

  1. A new variety of Spiranthes hachijoensis (orchidaceae) from Kumamoto prefecture, Japan 査読有り

    Kenji Suetsugu, Shun K. Hirota, Yuki Yoshida, Yoshihisa Suyama

    Journal of Japanese Botany　100　(1)　18-30　2025年2月20日

    DOI： 10.51033/jjapbot.ID0265 　

  2. Sugar‐Rich Resources Mediate Geographic Morphological Variation in a Dominant, Neotropical Savanna Ant

    Marianne Azevedo‐Silva, Sebastian F. Sendoya, Marina C. Côrtes, Pedro A. S. Longo, Anselmo Nogueira, Gustavo M. Mori, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Anete P. Souza, Paulo S. Oliveira

    Journal of Biogeography　2025年2月18日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/jbi.15111 　

    ISSN：0305-0270

    eISSN：1365-2699

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    ABSTRACT Aim Trait variation across geographic gradients can reveal how species respond to different environmental settings, which is crucial under the growing threat of climate change. Although on the basis of evolutionary theory, the patterns and drivers of intraspecific functional variation remain largely underexplored. In ants, pilosity and body size are morphological traits associated to thermoregulation and heat tolerance, which are critical concerns in the context of global warming. Here, we focused on the dominant ant Camponotus crassus to investigate trait variation and its potential drivers across a latitudinal gradient in the Brazilian Cerrado savanna. Location Brazilian Cerrado savanna. Taxon Camponotus crassus Mayr, 1862 (Hymenoptera: Formicidae). Methods We measured mesosoma pilosity and body size of C. crassus across multiple sites, and evaluated their relationship with temperature, rainfall, solar radiation, vegetation and sugar‐rich resource variables. We also assessed morphological and genetic covariation to search for possible phenotypic plasticity or adaptation in C. crassus. Results Only sugar‐rich resources were found to significantly influence C. crassus pilosity. Specifically, a negative relationship between ant pilosity and sugar‐rich resources (i.e., proportion of plants with extrafloral nectaries and hemipteran trophobionts) was found. No covariation between pilosity and genetic dissimilarities was observed, suggesting phenotypic plasticity. None of the variables were significant to predict body size, while this trait positively covaried with genetics. Main Conclusions Our findings suggest resource availability as a critical factor for species thermoregulation under environmental change, a hypothesis previously reported in the literature. We emphasise the importance of examining intraspecific variation and phenotypic plasticity across large geographic scales, particularly under the scenario of rapid global change and the current threat to Cerrado savanna. Our work covers a still poorly investigated aspect of intraspecific variation of tropical eusocial insects, and sheds new light on trait variation associated with large geographical gradients and resource availability in a major ecosystem.

  3. Evaluation of the conservation value and conservation difficulty of local populations of the rare plant Viola raddeana based on genetic diversity and gene expression information using next‐generation sequencers 査読有り

    Hiroaki Shiraishi, Yoshihisa Suyama, Takashi Makino, Shun K. Hirota, Kazuo Obata, Jung‐Hyun Lee, Hyeok Jae Choi, Yoshihiko Tsumura

    Plant Species Biology　2025年2月5日

    DOI： 10.1111/1442-1984.12507 　

  4. Reticulate Evolution in Japanese Sceptridium (Ophioglossaceae), including diploid, tetraploid, and hexaploid species

    Sousuke Ishii, Norio Sahashi, Atushi Ebihara, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Yasuyuki Watano

    Molecular Phylogenetics and Evolution　202　108244-108244　2025年1月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.ympev.2024.108244 　

    ISSN：1055-7903

  5. Evolutionary Histories of Camellia japonica and Camellia rusticana

    Harue Abe, Saneyoshi Ueno, Ayumi Matsuo, Shun K. Hirota, Hiroki Miura, Mong‐Huai Su, Yun‐Guang Shen, Yoshihiko Tsumura, Yoshihisa Suyama, Zhong‐Lang Wang

    Ecology and Evolution　14　(12)　2024年12月24日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1002/ece3.70721 　

    ISSN：2045-7758

    eISSN：2045-7758

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    ABSTRACT The genus Camellia is widely distributed, primarily in East Asia. Camellia japonica is located at the northern limit of this genus distribution, and understanding changes in its distribution is crucial for understanding the evolution of plants in this region, as well as their relationship with geological history and climate change. Moreover, the classification of sect. Camellia in Japan has not been clarified. Therefore, this study aims to understand the evolutionary history of the Japanese sect. Camellia. The genetic population structure was analysed using SNP data and MIG‐seq. The relationship between the Japanese sect. Camellia, including the related species in China, was further inferred from the phylogeny generated by RA x ML, SplitsTree and PCA. Population genetic structure was inferred using a Bayesian clustering method (ADMIXTURE). We subsequently employed approximate Bayesian computation, which was further supported by the coalescent simulations (DIYABC, fastsimcoal and Bayesian Skyline Plots) to explore the changes in population, determining which events appropriately explain the phylogeographical signature. Ecological niche modelling was combined with genetic analyses to compare current and past distributions. The analyses consistently showed that C. japonica and C. rusticana are distinct, having diverged from each other during the Middle to Late Miocene period. Furthermore, C. japonica differentiated into four major populations (North, South, Ryukyu‐Taiwan and Continent). The Japanese sect. Camellia underwent speciation during archipelago formation, reflecting its ancient evolutionary history compared with other native Japanese plants. C. rusticana did not diverge from C. japonica in snow‐rich environments during the Quaternary period. Our results suggest that both species have been independent since ancient times and that ancestral populations of C. japonica have persisted in northern regions. Furthermore, the C. japonica population on the continent is hypothesised to have experienced a reverse‐colonisation event from southern Japan during the late Pleistocene glaciation.

  6. Towards the understanding of genetic and morphological variations of a highly abundant seaweed-associated marine invertebrate

    Pedro Augusto dos Santos Longo, Marianne Azevedo-Silva, Karine Ferreira Ribeiro Mansur, Thais Aparecida Marinho, André Guilherme Madeira, Anete Pereira de Souza, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Gustavo Maruyama Mori, Fosca Pedini Pereira Leite

    Estuarine, Coastal and Shelf Science　309　108977-108977　2024年12月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.ecss.2024.108977 　

    ISSN：0272-7714

  7. Freeze-dried fecal microorganisms as an effective biomaterial for the treatment of calves suffering from diarrhea

    Jahidul Islam, Natsuki Ohtani, Yu Shimizu, Masae Tanimizu, Yoshiaki Goto, Masumi Sato, Eiji Makino, Toru Shimada, Chise Ueda, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshifumi Sakai, Niel A. Karrow, Hiroshi Yoneyama, Ryota Hirakawa, Mutsumi Furukawa, Hidekazu Tanaka, Tomonori Nochi

    Scientific Reports　14　(1)　2024年11月14日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41598-024-79267-5 　

    eISSN：2045-2322

  8. Conservation units and the origin of planted individuals of an endangered endemic species Lobelia boninensis in the Ogasawara Islands

    Chikashi Hata, Chiharu Endo, Hiroshi Tanaka, Miho Hiruma, Maiko Kumamoto, Izumi Takenaka, Takashi Makino, Kento Niinaka, Yoshihisa Suyama, Shun K. Hirota, Michimasa Yamasaki, Yuji Isagi

    Scientific Reports　2024年11月9日

    DOI： 10.1038/s41598-024-78452-w 　

    ISSN：2045-2322

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    <jats:title>Abstract</jats:title><jats:p>The Ogasawara Islands, one of the UNESCO World Natural Heritage Site located about 1000 km south of Japan’s main island, harbor numerous endemic species, many of which are as endangered. One of the endemic plant species, <jats:italic>Lobelia boninensis</jats:italic>, found in the Mukojima, Chichijima, and Hahajima archipelagoes, is endangered due to predation. As part of conservation efforts, translocation is now underway, especially on Chichijima. However, we lack essential information, such as the genetic population structure, to develop appropriate translocation strategies for both wild and planted individuals. Here, we aimed to identify the conservation units and the origin of planted individuals by estimating the genetic population structure and phylogenetic relationships across all habitats of this species. We identified two distinct genetic clusters, indicating genetic differentiation between the northern and southern populations. The genetic population components detected at an isolated site on Chichijima showed a mixture of these distinct clusters, probably due to hybridization. The transplanted individuals in Chichijima were found to have originated from a population in Hahajima. These results suggest the presence of two distinct conservation units. Furthermore, the current translocation strategy poses a risk of genetic contamination between these units, highlighting the need for revised conservation management practices.</jats:p>

  9. Does decline and recovery process affect clonal and genetic diversity of a coastal plant population?

    Yoshihiro Tsunamoto, Yoko Nishikawa, Takashi Shimamura, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo

    Restoration Ecology　2024年9月16日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/rec.14283 　

    ISSN：1061-2971

    eISSN：1526-100X

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    The evaluation of genetic diversity is important for the conservation of species. However, changes in genetic diversity during conservation are complex processes that depend on the characteristics of the species and environment. To evaluate the changes in genetic diversity from decline to recovery, we surveyed the coastal herb Calystegia soldanella in areas with varying degrees of non‐coastal plant invasion. First, to evaluate genetic diversity before the conservation measures, the spatial clonal structure of adults was investigated in a population invaded by non‐coastal plants. Second, to evaluate genetic diversity after the conservation measures, the regenerated individuals were investigated in the restoration plot. Moreover, to predict future genetic diversity without conservation measures, the effects of non‐coastal plant invasion on the production and genetic diversity of seeds were investigated using individuals from areas with various levels of non‐coastal plant invasion. In the adult population, 16 genets were identified in an 80 m × 4 m area. The maximum genet size was 30.3 m, suggesting the importance of clonal reproduction for population maintenance. In the restoration plots comprising 10 m × 10 m × 3 replicates, many seedlings (1.14 ramets/m2) emerged, resulting in high clonal diversity compared to that of the adult population. Therefore, the biomass and genetic diversity were rapidly restored at the beginning of the conservation practice. Non‐coastal plant invasion did not affect the genetic diversity of the seeds. However, it significantly reduced seed production. This suggests that non‐coastal plant invasion reduces sexual reproduction, resulting in the long‐term loss of genetic diversity.

  10. Detection of reproductive interference between closely related Salvia species with small-scale separated distributions by multifaceted pollination and molecular analyses

    Sachiko Nishida, Atsuko Takano, Yoshihisa Suyama, Satoshi Kakishima

    Journal of Plant Research　2024年8月30日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10265-024-01577-6 　

    ISSN：0918-9440

    eISSN：1618-0860

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    Abstract Reproductive interference, an interspecific interaction in reproductive process that exerts an adverse effect, has gained attention as a contributing factor in promoting exclusive distributions between closely related species. However, detailed studies on the possibility of reproductive interference between native plants are still lacking, presumably because strong reproductive interference can rapidly realize exclusive distributions, leaving the two species apparently independent. Salvia japonica and S. lutescens are found in separate localities at a small scale, although their distributions overlap at a large scale. We investigated the possibility of reproductive interference between them through field surveys, hand-pollination experiments, evaluation of hybrid fertility, cpDNA and nrDNA genotyping, and genome-wide DNA analysis. The field survey results did not reveal apparent negative interaction in competition for pollinator services. Mixed pollination with conspecific pollen and counterpart pollen reduced seed set in S. japonica, and hybrid progeny produced by mixed pollination were less than 20% as fertile compared to the pure species. The DNA genotyping results suggested the possibility of hybridization where their distributions overlap, and the genome-wide DNA analysis results showed clear genetic differentiation between the two species as well as the existence of hybrids. These results suggest that bi-directional reproductive interference between S. japonica and S. lutescens may have led to their present separated distributions at a small scale.

  11. The population structure and demography of an intertidal gastropod Lunella correensis around the Japanese Archipelago affected by past environmental change

    Osamu Kagawa, Shun K. Hirota, Takahiro Hirano, Kazuki Kimura, Genki Kobayashi, Yoshihisa Suyama, Satoshi Chiba, Daishi Yamazaki

    Marine Biology　171　(9)　2024年8月13日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s00227-024-04497-0 　

    ISSN：0025-3162

    eISSN：1432-1793

  12. Secondary contact zone and genetic introgression in closely related haplodiploid social spider mites 査読有り

    Konaka, Shota, Hirota, Shun K, Sato, Yukie, Matsumoto, Naoki, Suyama, Yoshihisa, Tsumura, Yoshihiko

    Heredity　2024年8月

    DOI： 10.1038/s41437-024-00708-y 　

    ISSN：1365-2540

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    How frequently hybridisation and gene flow occur in the contact zones of diverging taxa is important for understanding the speciation process. Stigmaeopsis sabelisi and Stigmaeopsis miscanthi high-aggression form (hereafter, S. miscanthi HG) are haplodiploid, social spider mites that infest the Chinese silver grass, Miscanthus sinensis. These two species are closely related and parapatrically distributed in Japan. In mountainous areas, S. sabelisi and S. miscanthi HG are often found in the highlands and lowlands, respectively, suggesting that they are in contact at intermediate altitudes. It is estimated that they diverged from their common ancestors distributed in subtropical regions (south of Japan) during the last glacial period, expanded their distribution into the Japanese Archipelago, and came to have such a parapatric distribution (secondary contact). As their reproductive isolation is strong but incomplete, hybridisation and genetic introgression are expected at their distributional boundaries. In this study, we investigated their spatial distribution patterns along the elevation on Mt. Amagi using male morphological differences, and investigated their hybridisation status using single-nucleotide polymorphisms by MIG-seq. We found their contact zone at altitudes of 150-430&#x2009;m, suggesting that their contact zone is prevalent in the parapatric area, which is in line with a previous study. Interspecific mating was predicted based on the sex ratio in the contact zone. No obvious hybrids were found, but genetic introgression was detected although it was extremely low.

  13. Comprehensive genetic analysis reveals the genetic structure and diversity of Calanthe hoshii (Orchidaceae), an endemic species of the Ogasawara Islands: Implications for appropriate conservation of a critically endangered species 査読有り

    Mayu Katafuchi, Satoshi Narita, Yoshiteru Komaki, Atsushi J. Nagano, Tomohisa Yukawa, Yoshihisa Suyama, Shun K. Hirota, Michimasa Yamasaki, Yuji Isagi

    Plant Species Biology　2024年7月23日

    DOI： 10.1111/1442-1984.12479 　

    ISSN：0913-557X 1442-1984

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    <jats:title>Abstract</jats:title><jats:p>The Ogasawara Islands, isolated from the continent throughout their geological history, harbor abundant endemic species. However, 32% of the native plant species are on the Japanese Red List, signaling their endangered status. Among these endangered species, <jats:italic>Calanthe hoshii</jats:italic> stands out as highly susceptible to extinction. Two wild and 89 ex situ individuals were alive in 2020, but the last known wild individual died in October 2021, indicating this species may have become extinct in the wild. Despite the conservation efforts under the Act for the Conservation of Endangered Species of Wild Fauna and Flora, the lack of essential information regarding genetic diversity and population structure among the remaining individuals poses a significant obstacle to developing effective conservation measures. In this research, we conducted a genetic analysis of the wild and ex situ individuals, which revealed notably reduced genetic diversity between individuals, with individual heterozygosity levels (1.0 × 10<jats:sup>−5</jats:sup>) measuring one‐ninth of those observed within a closely related species <jats:italic>Calanthe triplicata</jats:italic> (1.5 × 10<jats:sup>−4</jats:sup>). Comprehensive genetic analysis revealed that <jats:italic>C. hoshii</jats:italic> consisted of three genetic clusters of different sizes: cluster 1 comprised 95% of the total population, while clusters 2 and 3, with few individuals, were only found in the ex situ populations at Koishikawa Botanical Garden. Since extant <jats:italic>C. hoshii</jats:italic> maintains a remarkably low genetic diversity at both individual and population levels, it is necessary to consider future management strategies, such as artificial breeding among different clades identified in this study, to safeguard the stability and resilience of this species.</jats:p>

  14. Genetic diversity in the traditional cultivars and wild ancestor of near-threatened Japanese iris (Iris ensata Thunb.)

    Makiko Mimura, Marina Takeuchi, Takayuki Kobayashi, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Hirofumi Yamaguchi, Toshihito Tabuchi

    Conservation Genetics　25　(5)　1079-1086　2024年7月18日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10592-024-01625-7 　

    ISSN：1566-0621

    eISSN：1572-9737

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    Abstract Wild relatives of cultivars are crucial sources of genetic variation for further enhancement, yet they face potential threats due to contemporary environmental changes. Iris ensata var. spontanea, a wild progenitor of the Japanese iris cultivars (I. ensata var. ensata), is extensively cultivated in Japanese gardens, is distributed across mesic meadows and wetlands in Japan and East Asia. This species is currently threatened owing to habitat loss linked to land use alterations. We assessed genetic diversity and phylogenetic relationships in 32 wild accessions and the 14 principal Edo Group of Japanese iris cultivars, originally bred during the Edo period (1600–1868). In the phylogenetic tree, the cultivars formed a cluster with reduced inbreeding coefficients, suggesting a singular origin and interbreeding between the genetically distinct accessions. Conversely, wild accessions exhibited greater overall genetic diversity and higher inbreeding coefficients than cultivars, indicating frequent inbreeding within divergent natural populations. Our findings highlight the distinct genetic reservoirs of both wild accessions and Edo cultivars, although the former may face inbreeding challenges. Urgent conservation action is needed to ensure the genetic diversity of wild populations as natural resources.

  15. Insular environment-dependent introgression from an arid-grassland orchid to a wetland orchid on an oceanic island

    Kenji Suetsugu, Shun K Hirota, Masayuki Ishibashi, Kenya Ishida, Hiroshi Hayakawa, Yoshihisa Suyama

    Evolution Letters　2024年7月15日

    出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)

    DOI： 10.1093/evlett/qrae034 　

    eISSN：2056-3744

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    Abstract Adaptive introgression plays a vital role in allowing recipient species to adapt and colonize new environments. However, our understanding of such environment-dependent introgressions is primarily limited to specific plant taxa in particular settings. In Japan, two related orchid species, the autonomously self-pollinating Pogonia minor and the outcrossing Pogonia japonica, typically inhabit dry grasslands and wetlands, respectively. Intriguingly, an island ecotype of P. japonica exists in arid, wind-swept, open sites on volcanic mountain slopes on Kozu Island, in the oceanic Izu Islands. To investigate potential introgression and its implications between P. japonica and P. minor on Kozu Island, we applied a comprehensive approach that included examining morphological traits, genome-wide SNP data, and plastid DNA sequences. We also examined the breeding systems of these species on Kozu Island through artificial pollination experiments to determine if introgression from P. minor has endowed the P. japonica ecotype with selfing capabilities. Extensive sampling on Kozu Island revealed that all P. japonica specimens exhibit signs of introgression from P. minor, suggesting the absence of pure P. japonica populations on the island. Furthermore, the chloroplast haplotypes of the insular P. japonica ecotype consistently match those of P. minor, indicating a predominantly asymmetrical initial hybridization with P. minor acting mainly as the maternal parent in the formation of F1 hybrids. Despite the advantages of self-fertilization in isolated environments, the insular P. japonica does not exhibit autogamy. Consequently, the scarcity of moist habitats, rather than selection pressure for selfing, likely contributes to the observed widespread introgression. Our study strongly suggests that the arid-environment-adapted P. minor has introgressed into the insular ecotype of P. japonica, enabling its successful colonization of arid volcanic mountain slopes of the oceanic island.

  16. Phylogenetic relationships and divergence time of Hydrangea sect. Macrophyllae (Hydrangeaceae) revealed by genome-wide SNPs

    Shoki Murakami, Takuro Ito, Tatsuya Uemachi, Shinji Fujii, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Masayuki Maki

    Plant Systematics and Evolution　310　(4)　2024年7月4日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s00606-024-01902-5 　

    ISSN：0378-2697

    eISSN：1615-6110

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    Abstract Hydrangea sect. Macrophyllae comprises deciduous shrubs including two species with seven infraspecific taxa distributed throughout the Japanese Archipelago and adjacent areas. In this study, we revealed a phylogeny of Hydrangea sect. Macrophyllae by using a larger dataset of genome-wide SNPs than those employed in a previous study and by adding more comprehensive taxa/populations, which cover the entire distribution of the section. We then revised the taxonomic treatment of sect. Macrophyllae based on the higher-resolution phylogenetic trees obtained in this study. The phylogenetic trees estimated in this study showed five major clades, suggesting that H. serrata var. minamitanii and var. yesoensis should be treated as independent species from other H. serrata, that H. serrata var. australis and var. yakushimensis could be subclassified under the major clades and that var. angustata could be a synonym of var. serrata. The divergence time of these major clades was estimated to be in the Pleistocene.

  17. Genomic and morphological data reveal a critically endangered new species from the Atlantic Forest, Paepalanthus salimenae (Eriocaulaceae)

    MYLENA CABRINI, CATARINA LIRA, YOSHIHISA SUYAMA, DAIKI TAKAHASHI, NAOKO ISHIKAWA, ISIS PAGLIA, MARCELO TROVÓ

    Phytotaxa　655　(2)　173-186　2024年6月25日

    出版者・発行元： Magnolia Press

    DOI： 10.11646/phytotaxa.655.2.5 　

    ISSN：1179-3155

    eISSN：1179-3163

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    During our investigation of the genetic and morphological variation within the distribution range of Paepalanthus calvus, we observed that specimens from Juiz de Fora municipality, Minas Gerais (Brazil) were morphologically divergent. Through genome-wide analyses using MIG-seq and detailed morphological comparisons, we were able to establish consistent differences between P. calvus and the Juiz de Fora specimens, which supported the recognition of a new species, Paepalanthus salimenae sp. nov. This new species is primarily distinguished by the narrow leaves; trichomes on the leaves, spathes, and scapes; densely pilose involucral bracts; and the tufted apex of some floral organs. Paepalanthus salimenae exhibits low genetic diversity and strong population structure. A preliminary conservation risk assessment suggests this species as Critically Endangered, highlighting the urgent need for conservation efforts to protect its habitat and intraspecific diversity. We provide photographs, line drawings and additional commentaries on the distribution, habitat, and morphological affinities of P. salimenae to congeneric taxa.

  18. Development of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I primer sets to construct DNA barcoding library using next-generation sequencing

    Seikan Kurata, Shota Mano, Naoyuki Nakahama, Shun Hirota, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito

    Biodiversity Data Journal　12　2024年6月18日

    出版者・発行元： Pensoft Publishers

    DOI： 10.3897/bdj.12.e117014 　

    ISSN：1314-2836

    eISSN：1314-2828

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    Insects are one of the most diverse eukaryotic groups on the planet, with one million or more species present, including those yet undescribed. The DNA barcoding system has been developed, which has aided in the identification of cryptic species and undescribed species. The mitochondrial cytochrome c oxidase I region (mtDNA COI) has been utilised for the barcoding analysis of insect taxa. Thereafter, next-generation sequencing (NGS) technology has been developed, allowing for rapid acquisition of massive amounts of sequence data for genetic analyses. Although NGS-based PCR primers designed to amplify the mtDNA COI region have been developed, their target regions were only a part of COI region and/or there were taxonomic bias for PCR amplification. As the mtDNA COI region is a traditional DNA marker for the DNA barcoding system, modified primers for this region would greatly contribute to taxonomic studies. In this study, we redesigned previously developed PCR primer sets that targetted the mtDNA COI barcoding region to improve amplification efficiency and to enable us to conduct sequencing analysis on NGS. As a result, the redesigned primer sets achieved a high success rate (&amp;gt; 85%) for species examined in this study, covering four insect orders (Coleoptera, Lepidoptera, Orthoptera and Odonata). Thus, by combining the primers with developed primer sets for 12S or 16S rRNA regions, we can conduct more detailed taxonomic, phylogeographic and conservation genetic studies using NGS.

  19. Taxonomic revision of the formerly monotypic orchid genus Dactylostalix

    KENJI SUETSUGU, SHUN K HIROTA, TAKAHIRO YAGAME, TOMOHISA YUKAWA, YOSHIHISA SUYAMA

    Phytotaxa　652　(2)　83-99　2024年6月5日

    出版者・発行元： Magnolia Press

    DOI： 10.11646/phytotaxa.652.2.1 　

    ISSN：1179-3155

    eISSN：1179-3163

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    The Calypsoinae orchid genus Dactylostalix, previously considered a monotypic genus endemic to Japan and the Russian Far East (the Kuril Islands and Sakhalin Island), is now redefined to encompass two species. This reclassification is based not only on the examination of type specimens and literature but also on molecular data. While Pergamena uniflora has long been regarded as a synonym of Dactylostalix ringens, it is distinguishable by its shorter scape, smaller flower, less spotted tepals, drooping sepals and lateral petals, labellum with smaller, narrowly triangular to ovate lateral lobes, more distinct keels on the adaxial surface of the lip, and a slender column with a smaller stigma and weakly developed clinandrium. We propose the new combination Dactylostalix uniflora, recognizing it as a distinct species within the genus Dactylostalix. Phylogenetic analysis utilizing genome-wide markers has also demonstrated that the two species are genetically distinct. Our findings, obtained through the integration of morphological data and molecular phylogenetics, indicate that D. uniflora represents a distinct evolutionary lineage from D. ringens. Examination of type specimens has led us to conclude that Calypso japonica, Dactylostalix maculosa, and Dactylostalix ringens f. punctatus are junior synonyms of D. ringens. Additionally, we designate the lectotypes for P. uniflora (= D. uniflora), C. japonica, and D. maculosa.

  20. Contrasting population genetic structure of three semi‐terrestrial brachyuran crabs on the coast of the Japanese archipelago

    Takeshi Yuhara, Hajime Ohtsuki, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Jotaro Urabe

    Ecology and Evolution　14　(6)　2024年6月5日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1002/ece3.11484 　

    ISSN：2045-7758

    eISSN：2045-7758

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    Abstract Anthropogenic activities have reduced ecotones between the ocean and land, which is likely to threaten the population of brackish‐water brachyuran crabs. To assess the current status of these crabs, we examine the population genetic structures of three semi‐terrestrial brachyuran crabs widely distributed along the coast of the Japan and to clarify factors determining their genetic structures. We collected 184 Orisarma dehaani, 252 Chiromantes haematocheir, and 151 Helice tridens crabs from 36 localities of the Japanese archipelago. Genome‐wide SNP data from these crabs were analyzed using MIG‐seq. Bayesian clustering of STRUCTURE and DAPC analysis were used to identify genetically disturbed populations and to visualize genetic differentiation between local populations. Genetic population structure showed clear differentiation between populations on the Pacific coast of the Tohoku region and on other Japanese coasts in O. dehaani, but not in C. haematocheir or H. tridens. The inbreeding coefficient of O. dehaani was significantly higher on the Pacific coast of the Tohoku region compared to other Japanese coasts. C. haematocheir and H. tridens had homogeneous genetic structures along the Japanese coast, but showed genetic differentiation of a local population at their range limits. Thus, O. dehaani showed little gene flow and clear genetic differentiation between populations in the Tohoku Pacific region and those on other Japanese coasts due to ocean currents. Although such a regional differentiation was not found in C. haematocheir and H. tridens, one population of C. haematocheir was genetically isolated at the edge of its distribution range and likely vulnerable to environmental changes.

  21. Deer grazing drove an assemblage‐level evolution of plant dwarfism in an insular system 査読有り

    Daiki Takahashi, Yoshihisa Suyama, Keitaro Fukushima, Hiroaki Setoguchi, Shota Sakaguchi

    Journal of Ecology　2024年5月8日

    DOI： 10.1111/1365-2745.14309 　

  22. Phylogeographic incongruence between two related <scp>Geranium</scp> species with divergent habitat preferences in East Asia

    Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Shun K. Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito

    Ecological Research　2024年3月7日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/1440-1703.12458 　

    ISSN：0912-3814

    eISSN：1440-1703

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    Abstract Plant species with overlapping distributions are expected to experience the same historical events. In contrast, species with different preferred habitat types may exhibit incongruent phylogeographic patterns because of their habitat‐dependent demographic changes in spite of their overlapping distributions. On the western side of the Japanese Archipelago, boreal forest and non‐forest vegetation were dominant during the last glacial period; subsequently, temperate forests expanded, and open vegetation (e.g., grasslands) decreased. Such vegetation shifts can result in incongruent phylogeographic patterns among temperate forest and grassland species; however, few phylogeographic studies have investigated this hypothesis. Here, we evaluated the phylogeographic structure of two related Geranium species that occur in grassland (Geranium krameri) and temperate forest (Geranium shikokianum) habitats using chloroplast genome sequencing and nuclear genome‐wide single‐nucleotide polymorphisms genotyping. The phylogeographic structure was stronger for the temperate forest species than the grassland species, despite its currently scattered distribution for grassland species. The observed patterns indicate that the phylogeographic histories of these species were influenced by their habitat configurations since the last glacial period. During the ice age, grasslands in Japan were much more widespread than today; this would have enabled the grassland species to form a continuous distribution, leading to low divergence among regional populations. In contrast, the significant genetic divergence within the forest species can be attributed to the glacial isolation of regional populations. Our genetic results suggest that vegetation transitions have variously controlled the population dynamics of two species with overlapping distributions.

  23. Genetic consequences of Last Glacial–Holocene changes in snowfall regime in Arnica mallotopus populations: A plant confined to heavy‐snow areas of Japan

    Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Koki Nagasawa, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Kazuhiro Sawa, Shigeru Fukumoto, Masae I. Ishihara, Harue Abe, Hayato Tsuboi, Tsuguoki Tango, Sayoko Mori, Shota Sakaguchi

    American Journal of Botany　2024年2月2日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1002/ajb2.16275 　

    ISSN：0002-9122

    eISSN：1537-2197

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    Abstract Premise Snow is an important environmental factor affecting plant distribution. Past changes in snowfall regimes may have controlled the demographies of snow‐dependent plants. However, our knowledge of changes in the distribution and demographies of such plants is limited because of the lack of fossil records. Methods Population genetic and landscape genetic analyses were used to investigate the response of population dynamics of Arnica mallotopus (Asteraceae)—a plant confined to heavy‐snow areas of Japan—to changes in snowfall regimes from the Last Glacial Period to the Holocene. Results The population genetic analysis suggested that the four geographic lineages diverged during the Last Glacial Period. The interaction between reduced snowfall and lower temperatures during this period likely triggered population isolation in separate refugia. Subpopulation differentiation in the northern group was lower than in the southern group. Our ecological niche model predicted that the current distribution was patchy in the southern region; that is, the populations were isolated by topologically flat and climatically unsuitable lowlands. The landscape genetic analysis suggested that areas with little snowfall acted as barriers to the Holocene expansion of species distribution and continued limiting gene flow between local populations. Conclusions These findings indicate that postglacial population responses vary among regions and are controlled by environmental and geographic factors. Thus, changes in snowfall regime played a major role in shaping the distribution and genetic structure of the snow‐dependent plant.

  24. Evolutionary and ecological trends in the Neotropical cycad genus Dioon (Zamiaceae): An example of success of evolutionary stasis

    José Said Gutiérrez‐Ortega, Miguel Angel Pérez‐Farrera, Mitsuhiko P. Sato, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Andrew P. Vovides, Francisco Molina‐Freaner, Tadashi Kajita, Yasuyuki Watano

    Ecological Research　2024年2月

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/1440-1703.12442 　

    ISSN：0912-3814

    eISSN：1440-1703

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    Abstract Cycads represent an example of the success of evolutionary stasis. Despite their early origin, they survived multiple events of mass extinction and diversified in modern tropical ecosystems during the Cenozoic without major changes in their morphology. What factors have allowed their persistence and diversification despite their conservative nature? We reviewed documentation on the micro‐ and macro‐evolutionary processes involved in the diversification of the Neotropical genus Dioon. Dioon comprises 18 species from varied habitats in Mexico and Honduras, and serves as a model to understand the patterns of cycad diversification. Here, we synthesize evidence reached from different fields, especially biogeography, phylogenetics, population ecology, and speciation, to propose a mechanism that can explain the current patterns of biodiversity in Dioon. At the macroevolutionary scale, a Paleogene origin for Dioon is more likely than an alternative hypothesis of a Neogene origin. Dioon lineages have dispersed along with the expansion of tropical forests throughout main mountain chains. Subsequently, climate change, and particularly aridification, promoted the fragmentation of the tropical forests, allowing the main Dioon clades to evolve in isolation at distinct biogeographic regimes. At the microevolutionary scale, low seed dispersal capability, stochastic demographic processes, and niche conservatism restrict the lineages to isolate themselves at narrow habitats, promoting local adaptation in populations. Local adaptation seems to be a process achieved through many generations under stabilizing selection. Altogether, these processes shaped the diversification in Dioon. This review attempts to stimulate further research on cycads and other biological groups that have diversified despite their apparent evolutionary stasis.

  25. Ice age land bridges to continental islands: Repeated migration of the forest‐dwelling sable in northeastern Asia

    Gohta Kinoshita, Takuma Sato, Shota Murakami, Vladimir Monakhov, Alexey P. Kryukov, Lyubov V. Frisman, Yoshihiro Tsunamoto, Yoshihisa Suyama, Takahiro Murakami, Hitoshi Suzuki, Jun J. Sato

    Journal of Biogeography　2024年1月16日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/jbi.14797 　

    ISSN：0305-0270

    eISSN：1365-2699

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    Abstract Aim The continental island system comprising Sakhalin, Hokkaido and the southern Kuril Islands (SHSK) in northeastern Asia serves as one of the southernmost habitats for many boreal and arctic organisms, with colonization via land bridges formed during glacial periods. To understand the impacts of past land‐bridge formation under Quaternary climate changes across SHSK, we investigated the demographic history of forest‐dwelling marten species. Location Sakhalin, Hokkaido and the southern Kuril Islands in northeastern Asia. Taxon Sable, Martes zibellina (Carnivora, Mustelidae). Methods We employed multiplexed inter‐simple sequence repeat genotyping by sequencing (MIG‐seq) to obtain genome‐wide single nucleotide polymorphisms (SNPs). We tested possible scenarios of colonization and diversification for SHSK sables using several population genetics approaches including clustering analysis, population tree estimation and approximate Bayesian computation modelling. We also examined haplotype diversity for the mitochondrial ND2 gene. Results The genetic diversity of the island populations and their affinity for continental populations were found to be higher in the order Sakhalin &gt; Hokkaido &gt; Iturup in both nuclear SNP and mitochondrial DNA analyses. Demographic analyses indicated that the sable migrated repeatedly from the continent, particularly to the neighbouring Sakhalin Island. However, only an earlier colonized lineage has persisted on marginal Iturup Island since the Middle Pleistocene. The stronger effects of repeated migrations and/or isolation influenced by the distance to the continent have shaped the contemporary genetic diversity and differentiation of sable populations in SHSK. Main Conclusions Genome‐wide and comprehensive sampling approaches demonstrated that the forest‐dwelling sable had long‐term persistence with partial admixture of multiple lineages in SHSK, suggesting the existence of forest corridors and refugia on the islands during the last several glacial periods. The SHSK system of continental islands is valuable for understanding the impacts of Quaternary climate changes on the genetic diversity and evolutionary histories of boreal organisms.

  26. Double migration of the endangered Tricyrtis formosana (Liliaceae) in Japan. 国際誌

    Kaori Tsunenari, Takuro Ito, Masatsugu Yokota, Mayu Shibabayashi, Chiharu Endo, Kuo-Fang Chung, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Atsushi Abe, Akiyo Naiki, Hiroaki Setoguchi, Takashi Makino, Yuji Isagi

    Scientific reports　14　(1)　957-957　2024年1月10日

    DOI： 10.1038/s41598-024-51431-x 　

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    The Ryukyu Islands of Japan are a biodiversity hotspot due to geographical and historical factors. Tricyrtis formosana is a perennial herbaceous plant that commonly found in Taiwan. But only a few populations have been identified in a limited habitat on Iriomote Island, while populations of unknown origin occur near human settlements in an area on the main island of Okinawa. To better understand these populations of the phylogenetic uniqueness and intrinsic vulnerability, we conducted comparative analyses including (1) phylogeny and population structure with MIG-seq data, (2) photosynthesis-related traits of plants grown under common conditions and (3) transcriptome analysis to detect deleterious variations. Results revealed that T. formosana was split into two clades by the congeners and that Iriomote and Okinawa populations independently derived from ancestral Taiwanese populations in each clade. Photosynthetic efficiency was lowest in the Iriomote population, followed by Okinawa and Taiwan. Transcriptome analysis showed that the Iriomote population accumulated more deleterious variations, suggesting intrinsic vulnerability. These results indicate that each T. formosana population in Japan is phylogenetically unique and has been independently dispersed from Taiwan, and that the Iriomote population presents a high conservation difficulty with a unique photosynthesis-related characteristic and a larger amount of deleterious variations.

  27. Contrasting patterns of genetic structure and population demography in two Dicraeus species feeding on bamboo flowers in Japan

    Yuzu Sakata, Shun K Hirota, Ayumi Matsuo, Keito Kobayashi, Naoyuki Nakahama, Yoshihisa Suyama

    Biological Journal of the Linnean Society　2024年1月3日

    出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)

    DOI： 10.1093/biolinnean/blad171 　

    ISSN：0024-4066

    eISSN：1095-8312

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    Abstract Population outbreaks of insects provide an excellent opportunity to elucidate their evolutionary history. In this study, we uncovered the phylogenetic relationships of Dicraeus spp. in Japan and compared the population genetic structure of two bamboo-feeding Dicraeus spp., Dicraeus phyllostachyus and Dicraeus nartshukae, by leveraging a recent nationwide mass flowering event of several bamboo species in Japan. We performed analysis using mitochondrial COI gene sequencing and genome-wide single-nucleotide polymorphisms detected by multiplexed inter-simple sequence repeat genotyping by sequencing (MIG-seq). We found genetic similarity in COI haplotypes over a large geographical range in the two Dicraeus spp., but, for both species, no concordance was detected between the collected host plants and genetic structures. In the genome-wide single-nucleotide polymorphism data, no clear genetic clusters were detected for D. phyllostachyus populations, whereas D. nartshukae populations were divided into two groups, in the north and south of Japan. Demographic analysis indicated that D. phyllostachyus had greatly expanded its population recently compared with D. nartshukae. These contrasting patterns between the two species might reflect the differences in the demographic history between the species. Our study suggested that the mass flowering event might cascade to the genetic structure of the florivorous insects through trophic interactions.

  28. Refugia within refugium of Geranium yesoense varieties: a follow-up study using chloroplast genome sequencing data of specimens from Mt. Asama, Japan

    Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Osamu Kurashima, Risa Ogawa, Yoshihisa Suyama, Sachiko Nishida, Motomi Ito

    Biological Journal of the Linnean Society　2024年1月2日

    出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)

    DOI： 10.1093/biolinnean/blad121 　

    ISSN：0024-4066

    eISSN：1095-8312

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    Abstract Recent phylogeographical studies have revealed that refugia sometimes retain high levels of genetic heterogeneity due to multiple colonization events, a phenomenon defined as ‘refugia within refugium’. In previous research, we reported a complex genetic structure within the Geranium yesoense complex, an alpine plant found in an interglacial refugium at high elevation in Central Japan, probably resulting from multiple colonization and hybridization events. However, we were unable to evaluate instances of introgression due to limited sample size. In the present study, we performed additional chloroplast genome sequencing, along with Sanger sequencing of selected chloroplast DNA regions, to elucidate the phylogenetic relationships among the refugial populations. The chloroplast genome sequence of a sample from Mt. Asama (an important refugium) was nested within the northern lineage (i.e. var. yesoense and var. pseudopratense), and haplotypes from Mt. Asama and Mt. Ibuki were also grouped with those of the northern lineage. Although our previous study suggested hybridization events between northern and southern lineages (i.e. var. nipponicum) at Mt. Asama, haplotypes from the southern lineage were not detected at range margins. This suggests that directional introgression occurred in these regions. Overall, our results further support that genetic heterogeneity within these refugia was amplified by recolonization and hybridization during past climate oscillations.

  29. Evolution of secondary metabolites, morphological structures and associated gene expression patterns in galls induced by four closely related aphid species on a host plant species 査読有り

    Mayu Mizuki, Yohei Kaneko, Yoshitaka Yukie, Yoshihisa Suyama, Shun K. Hirota, Shinichiro Sawa, Minoru Kubo, Akira Yamawo, Michiko Sasabe, Hiroshi Ikeda

    Molecular Ecology　2024年

    DOI： 10.1111/mec.17466 　

    ISSN：0962-1083

    eISSN：1365-294X

  30. A new natural hybrid Goodyera ×kazumae (Orchidaceae) from Tomakomai City, Hokkaido Prefecture, Japan

    Kenji Suetsugu, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama

    Taiwania　69　(3)　309-316　2024年

    DOI： 10.6165/tai.2024.69.309 　

    ISSN：0372-333X

  31. Evaluating the potential of interpopulation outbreeding to rescue plant populations facing reproductive failures

    Shota Sakaguchi, Shigeru Fukumoto, Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Daisuke Fujiki, Reiichi Miura, Kazuki Yamamoto, Misyo Ota, Masae I. Ishihara

    Ecological Research　2024年

    DOI： 10.1111/1440-1703.12472 　

    ISSN：0912-3814

    eISSN：1440-1703

  32. Genome-wide SNPs reveal clonality and population genetic structure of Nymphoides peltata in Japan (Menyanthaceae)

    Akira Asakawa, Shoki Murakami, Sachiko Horie, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Shinji Fujii, Masayuki Maki

    Aquatic Botany　190　103720-103720　2024年1月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.aquabot.2023.103720 　

    ISSN：0304-3770

  33. Phylogenetic, population structure, and population demographic analyses reveal that Vicia sepium in Japan is native and not introduced

    Ichiro Tamaki, Mizuo Mizuno, Tatsuo Ohtsuki, Kohtaroh Shutoh, Ryoichi Tabata, Yoshihiro Tsunamoto, Yoshihisa Suyama, Yusuke Nakajima, Naoki Kubo, Takeru Ito, Naohiko Noma, Emiko Harada

    Scientific Reports　13　(1)　2023年11月25日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41598-023-48079-4 　

    eISSN：2045-2322

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    Abstract Vicia sepium (bush vetch) is a perennial legume widely distributed throughout the Eurasian continent. However, its distribution in Japan is limited to Mt. Ibuki and small parts of central and southern Hokkaido. Therefore, each Japanese V. sepium lineage has been considered to have been introduced separately from Europe. Here, we examined whether the species was introduced or not on the basis of cpDNA sequences and genome-wide SNPs from Japanese and overseas samples. Both the cpDNA haplotype network and the nuclear DNA phylogenetic tree showed that Japanese V. sepium is monophyletic. Furthermore, although the nuclear DNA phylogenetic tree also showed that each lineage is clearly monophyletic, genetic admixture of the genetic cluster dominated in the Hokkaido lineage was also detected in the Mt. Ibuki lineage. Population divergence analysis showed that the two lineages diverged during the last glacial period. The Mt. Ibuki lineage showed a sudden population decline 300–400 years ago, indicating that some anthropogenic activity might be involved, while the Hokkaido lineage showed a gradual population decline from 5000 years ago. Consequently, these two lineages show low current genetic diversity compared with overseas lineages. These results show that the Japanese V. sepium is not introduced but is native.

  34. Molecular phylogeny and taxonomy of Hosta (Asparagaceae) on Shikoku Island, Japan, including five new species, one new subspecies, and two new status assignments 査読有り

    Tetsukazu Yahara, Shun K. Hirota, Seiko Fujii, Yasushi Kokami, Kengo Fuse, Hiroyuki Sato, Shuichiro Tagane, Yoshihisa Suyama

    Phytokeys　235　137-187　2023年11月18日

    DOI： 10.3897/phytokeys.235.99140 　

  35. 西表島において発見された日本初記録種Thrixspermum annamenseとその種内分類群に関する考察

    末次 健司, 廣田 峻, 米倉 浩司, 阿部 篤志, 陶山 佳久

    植物地理・分類研究　71　(2)　208　2023年11月17日

    出版者・発行元： 日本植物分類学会

    DOI： 10.18942/chiribunrui.0712-28 　

    ISSN：0388-6212

    eISSN：2433-0469

  36. The phylogenetic reconstruction of the Neotropical cycad genus Ceratozamia (Zamiaceae) reveals disparate patterns of niche evolution

    José Said Gutiérrez-Ortega, Miguel Angel Pérez-Farrera, Ayumi Matsuo, Mitsuhiko P. Sato, Yoshihisa Suyama, Michael Calonje, Andrew P. Vovides, Tadashi Kajita, Yasuyuki Watano

    Molecular Phylogenetics and Evolution　107960-107960　2023年11月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.ympev.2023.107960 　

    ISSN：1055-7903

  37. The absence of bumblebees on an oceanic island blurs the species boundary of two closely related orchids. 国際誌

    Kenji Suetsugu, Shun K Hirota, Takuto Shitara, Kenya Ishida, Narumi Nakato, Hiroshi Hayakawa, Yoshihisa Suyama

    The New phytologist　2023年10月17日

    DOI： 10.1111/nph.19325 　

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    Oceanic islands offer valuable natural laboratories for studying evolution. The Izu Islands, with their recent geological origin, provide an exceptional opportunity to explore the initial evolution on oceanic islands. Another noteworthy aspect is the absence of bumblebee species on most Izu Islands. We used ecological, morphological, and molecular data to investigate the impact of bumblebee absence on the evolution of two closely related orchid species, Goodyera henryi and Goodyera similis, focusing on Kozu Island, the Izu Islands. Our investigation revealed that while G. henryi exclusively relies on a bumblebee species for pollination on the mainland, G. similis is pollinated by scoliid wasps on both the mainland and the island. Intriguingly, all specimens initially categorized as G. henryi on Kozu Island are hybrids of G. henryi and G. similis, leading to the absence of pure G. henryi distribution on the island. These hybrids are pollinated by the scoliid wasp species that also pollinates G. similis on the island. The absence of bumblebees might result in sporadic and inefficient pollination of G. henryi by scoliid wasps, consequently promoting hybrid proliferation on the island. Our findings suggest that the absence of bumblebees can blur plant species boundaries.

  38. Phylogeographical evidence for historical long-distance dispersal in the flightless stick insect Ramulus mikado. 国際誌 査読有り

    Kenji Suetsugu, Tomonari Nozaki, Shun K Hirota, Shoichi Funaki, Katsura Ito, Yuji Isagi, Yoshihisa Suyama, Shingo Kaneko

    Proceedings. Biological sciences　290　(2008)　20231708-20231708　2023年10月11日

    DOI： 10.1098/rspb.2023.1708 　

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    Exploring how organisms overcome geographical barriers to dispersal is a fundamental question in biology. Passive long-distance dispersal events, although infrequent and unpredictable, have a considerable impact on species range expansions. Despite limited active dispersal capabilities, many stick insect species have vast geographical ranges, indicating that passive long-distance dispersal is vital for their distribution. A potential mode of passive dispersal in stick insects is via the egg stage within avian digestive tracts, as suggested by experimental evidence. However, detecting such events under natural conditions is challenging due to their rarity. Therefore, to indirectly assess the potential of historical avian-mediated dispersal, we examined the population genetic structure of the flightless stick insect Ramulus mikado across Japan, based on a multifaceted molecular approach [cytochrome oxidase subunit I (COI) haplotypes, nuclear simple sequence repeat markers and genome-wide single nucleotide polymorphisms]. Subsequently, we identified unique phylogeographic patterns, including the discovery of identical COI genotypes spanning considerable distances, which substantiates the notion of passive long-distance genotypic dispersal. Overall, all the molecular data revealed the low and mostly non-significant genetic differentiation among populations, with identical or very similar genotypes across distant populations. We propose that long-distance dispersal facilitated by birds is the plausible explanation for the unique phylogeographic pattern observed in this flightless stick insect.

  39. Somatic mutation rates scale with time not growth rate in long-lived tropical trees

    Akiko Satake, Ryosuke Imai, Takeshi Fujino, Sou Tomimoto, Kayoko Ohta, Mohammad Na’iem, Sapto Indrioko, Widiyatno, Susilo Purnomo, Almudena Mollá–Morales, Viktoria Nizhynska, Naoki Tani, Yoshihisa Suyama, Eriko Sasaki, Masahiro Kasahara

    eLife　2023年10月9日

    DOI： 10.7554/elife.88456.2 　

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    <jats:p>The rates of appearance of new mutations play a central role in evolution. However, mutational processes in natural environments and their relationship with growth rates are largely unknown, particular in tropical ecosystems with high biodiversity. Here, we examined the somatic mutation landscapes of two tropical trees, Shorea laevis (slow-growing) and S. leprosula (fast-growing), in central Borneo, Indonesia. Using newly-constructed genomes, we identified a greater number of somatic mutations in tropical trees than in temperate trees. In both species, we observed a linear increase in the number of somatic mutations with physical distance between branches. However, we found that the rate of somatic mutation accumulation per meter of growth was 3.7-fold higher in S. laevis than in S. leprosula. This difference in the somatic mutation rate was scaled with the slower growth rate of S. laevis compared to S. leprosula, resulting in a constant somatic mutation rate per year between the two species. We also found that somatic mutations are neutral within an individual, but those mutations transmitted to the next generation are subject to purifying selection. These findings suggest that somatic mutations accumulate with absolute time and older trees have a greater contribution towards generating genetic variation.</jats:p> <jats:p>The significance of our study lies in the discovery of an absolute time-dependent accumulation of somatic mutations in long-lived tropical trees, independent of growth rate. Through a comparative analysis of somatic mutation landscapes in slow- and fast-growing species, we observed a clock-like accumulation of somatic mutations in both species, regardless of their growth rates. Although the majority of somatic mutations were restricted to a single branch, we also identified mutations present in multiple branches, likely transmitted during growth. Our findings suggest that older trees make a greater contribution towards generating genetic variation.</jats:p>

  40. Introduction pathways and evolutionary mechanisms of alien species of Lolium spreading across sandy coasts in Japan

    Momoko Hirata, Yumiko Higuchi, Ayumi Matsuo, Mitsuhiko P. Sato, Yoshihisa Suyama, Takako Kiyoshi, Akihiro Konuma, Tohru Tominaga, Yoshiko Shimono

    Journal of Ecology　2023年10月7日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/1365-2745.14206 　

    ISSN：0022-0477

    eISSN：1365-2745

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    Abstract Estimating the role of specific processes in the spread of alien species necessitates the determination of introduction pathways and source populations of invaded areas. Alien grasses in the genus Lolium that have extensively invaded Japan provide a unique opportunity to estimate the expansion process through direct comparison between source and naturalised populations because the introduction pathways, contaminants in grain commodities and commercial cultivars for fodder crops or revegetation materials are well‐known. Therefore, by directly comparing source and naturalised populations, we estimated the introduction pathways and whether adaptative evolution occurred in Lolium species on sandy coasts in Japan. Lolium individuals sampled from naturalised populations in croplands, seaports, and sandy coasts were compared with those from two introduction sources for morphological and genetic variations based on a genome‐wide single nucleotide polymorphism analysis and a common garden experiment. Furthermore, we conducted a reciprocal transplant experiment between cropland and sandy coast. Populations naturalised in croplands were closely related to the cultivars, whereas those naturalised in seaports and sandy coasts were associated with contaminants. These results indicate that the cropland and sandy coast populations are derived from cultivars and contaminants, respectively. In addition, asymmetric gene flow from cropland populations to sandy coast populations was observed. The reciprocal transplant experiment clearly demonstrated the home site advantage; populations derived from croplands yielded higher floret numbers than those derived from other habitats at the cropland site; sandy coast populations had higher survival rates than those from croplands at the coastal site. Port populations exhibited a similar tendency as sandy coast populations, indicating that contaminants may be originally adapted to salty and dry environments, such as that in sandy coasts. The flowering phenology in the sandy coast populations evolved in the late flowering; therefore, late flowering alleles may have been transferred from cropland populations to sandy coast populations. Synthesis. We demonstrated that two congeneric species with different ecological characteristics were introduced through multiple introduction pathways and spread across different habitats. A direct comparison between source and naturalised populations can considerably elucidate the patterns and processes of biological invasions.

  41. Demographic history and conservation aspects of two relict shrubs (Daphnimorpha spp., Thymelaeaceae) showing disjunct and restricted distribution in the southern part of Japan

    Daiki Takahashi, Yoshihisa Suyama

    Tree Genetics & Genomes　2023年10月

    DOI： 10.1007/s11295-023-01618-6 　

  42. Range shift and introgression of three Japanese Abies species: insights from population genetic data and species distribution modeling

    Kentaro Uchiyama, Sayaka Fujii, Ikutaro Tsuyama, Nobuyuki Tanaka, Suzuki Setsuko, Megumi K. Kimura, Yoshihisa Suyama, Yoshihiko Tsumura

    TREE GENETICS & GENOMES　19　(5)　2023年10月

    DOI： 10.1007/s11295-023-01617-7 　

    ISSN：1614-2942

    eISSN：1614-2950

  43. Reconsidering invasion history of common land snails in Japan through genome-wide analyses

    Takahiro Hirano, Daishi Yamazaki, Shun Ito, Mitsuhiko P. Sato, Ayumi Matsuo, Takumi Saito, Hirotaka Nishi, Bin Ye, Zhengzhong Dong, Do Van Tu, Aileen Tan Shau-Hwai, Yoshihisa Suyama, Satoshi Chiba

    Biological Invasions　2023年8月3日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10530-023-03123-2 　

    ISSN：1387-3547

    eISSN：1573-1464

  44. Potential contribution of floral thermogenesis to cold adaptation, distribution pattern, and population structure of thermogenic and non/slightly thermogenic Symplocarpus species

    Mitsuhiko P. Sato, Ayumi Matsuo, Koichi Otsuka, Kohei Takenaka Takano, Masayuki Maki, Kunihiro Okano, Yoshihisa Suyama, Yasuko Ito‐Inaba

    Ecology and Evolution　13　(7)　2023年7月15日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1002/ece3.10319 　

    ISSN：2045-7758

    eISSN：2045-7758

  45. Host-shift speciation proceeded with gene flow in algae covering shells

    Osamu Kagawa, Shun K. Hirota, Takumi Saito, Shota Uchida, Hiroaki Watanabe, Ryusuke Miyazoe, Takanobu Yamaguchi, Taiki Matsuno, Kouta Araki, Hinata Wakasugi, Sayaka Suzuki, Genki Kobayashi, Hikaru Miyazaki, Yoshihisa Suyama, Takeaki Hanyuda, Satoshi Chiba

    The American Naturalist　202　(5)　721-732　2023年6月13日

    出版者・発行元： University of Chicago Press

    DOI： 10.1086/726221 　

    ISSN：0003-0147

    eISSN：1537-5323

  46. The molecular clock in long-lived tropical trees is independent of growth rate

    Ryosuke Imai, Takeshi Fujino, Sou Tomimoto, Kayoko Ohta, Mohammad Na’iem, Sapto Indrioko, Widiyatno, Susilo Purnomo, Almudena Mollá-Morales, Viktoria Nizhynska, Naoki Tani, Yoshihisa Suyama, Eriko Sasaki, Masahiro Kasahara, Akiko Satake

    2023年6月6日

    出版者・発行元： eLife Sciences Publications, Ltd

    DOI： 10.7554/elife.88456.1 　

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    The rates and patterns of somatic mutations in wild plants, as well as how they relate to longevity, are largely unknown1–3. Here, we examined the somatic mutation landscapes of slow- and fast-growing tropical species in central Borneo, Indonesia. Using newly-constructed genomes, we identified an average of 480 mutations in the slow-growing species (265-year-old, 44.1 m in height), which was five times greater than that observed in the fast-growing species (66-year-old, 43.9 m). The number of somatic mutations increased linearly with branch length. The somatic mutation rate per meter was higher in the slow-growing species, yet the rate per year remained constant across both species. The mutational spectra exhibited a dominance of spontaneous mutations, specifically cytosine-to-thymine substitutions at CpG sites. An analysis of nucleotide substitutions at both the intra- and inter-individual level revealed that somatic mutations are neutral within an individual, but those mutations transmitted to the next generation are subject to purifying selection. We developed a model to evaluate the relative contribution of cell division on mutational processes, and postulate that cell-division independent mutagenesis predominates. These findings deepen our understanding of mutational processes underlying the generation of genetic diversity in a tropical ecosystem.

  47. Geographical genetic structure of Lespedeza cuneata var. cuneata in Japan: necessity of genetic considerations in slope revegetation

    Junichi Imanishi, Ayumi Imanishi, Yoshihisa Suyama, Yuji Isagi

    Landscape and Ecological Engineering　2023年5月31日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s11355-023-00564-8 　

    ISSN：1860-1871

    eISSN：1860-188X

  48. 日本産白トリュフ・ホンセイヨウショウロの系統地理と集団遺伝

    木下 晃彦, 松尾 歩, 小長谷 啓介, 中村 慎崇, 佐々木 廣海, 陶山 佳久, 山中 高史, 奈良 一秀

    日本森林学会大会発表データベース　134　615　2023年5月30日

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.134.0_615 　

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    国内における生物多様性の形成過程の研究は動物や植物が中心で、菌類をはじめ微生物についての事例は極めて少ない。ホンセイヨウショウロはブナ科やマツ科樹木と共生する外生菌根菌で、子実体を地中に形成する。従って本種の分布拡大は、菌根の根外菌糸から他個体へ伝播する無性繁殖と、動物による子実体の摂食と有性胞子の散布によって達成される。本研究では、本種の国内における遺伝構造の解明を目的とした。2006年から2021年に14県25集団から採集した子実体標本からDNAを抽出し、MIG-seq法により一塩基多型を検出した。最尤法による分子系統解析を行なった結果、本種は2つの主要グループに分かれた。1つは東北、関東、中部地方からなるクレードで、もう１つは近畿東部、近畿西部・中国地方東部、中国西部・四国からなるクレードである。すなわち本種には明瞭な地理的遺伝構造が存在し、東日本と西日本で集団が分けられることが明らかになった。この結果は、先行研究によるコナラなど宿主樹木の遺伝構造パタンと一致したことから、本種は宿主との同調的な多様化プロセスにより分布拡大を達成した可能性が示唆された。

  49. Discrimination of Camellia cultivars using iD-NA analysis

    Hitomi S. Kikkawa, Mitsuhiko P. Sato, Ayumi Matsuo, Takanori Sasaki, Yoshihisa Suyama, Kouichiro Tsuge

    2023年5月24日

    出版者・発行元： Research Square Platform LLC

    DOI： 10.21203/rs.3.rs-2883695/v1 　

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    Abstract Recently, many new cultivars are taken abroad illegally, which is now considered an international issue. Botanical evidence found at a crime scene provides valuable information about the origin of the sample. However, botanical resources for forensic evidence remain underutilized because molecular markers, such as microsatellites, are not available without a limited set of species. Multiplexed ISSR genotyping by sequencing (MIG-seq) has been used to determine a number of genome-wide genetic markers and can be applied for every plant, including species that lack genetic information. Camellia cultivars are popular worldwide and are often planted in many gardens and bred to make new cultivars. In this study, we aimed to analyze Camellia cultivars/species through MIG-seq. Through this, MIG-seq could discriminate similar samples, such as bud mutations and closely related samples which could not be distinguished based on morphological features. This discrimination was consistent with that of a previous study which classified cultivars by short tandem repeat (STR) markers, indicating that MIG-seq has the same or higher discrimination ability as STR markers. Furthermore, based on our results, unknown phylogenetic relationships were observed. Since MIG-seq can be applied to unlimited species and low-quality DNA, it may be useful for various scientific fields.

  50. Resurrection of Spicantopsis hancockii (Blechnaceae) as an endemic species to Taiwan-Reidentification of Spicantopsis in the Tokara Islands, Japan

    Atsushi Ebihara, Shuichiro Tagane, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Narumi Nakato, Li Yaung Kuo

    Taiwania　68　(2)　148-154　2023年5月18日

    DOI： 10.6165/tai.2023.68.148 　

    ISSN：0372-333X

  51. Phylogeography of the temperate grassland plant Tephroseris kirilowii (Asteraceae) inferred from multiplexed inter-simple sequence repeat genotyping by sequencing (MIG-seq) data

    Tomoka Sakaba, Akiko Soejima, Shinji Fujii, Hajime Ikeda, Takaya Iwasaki, Hiroaki Saito, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Andrey E. Kozhevnikov, Zoya V. Kozhevnikova, Hongfeng Wang, Siqi Wang, Jae-Hong Pak, Noriyuki Fujii

    Journal of Plant Research　136　(4)　437-452　2023年5月6日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10265-023-01452-w 　

    ISSN：0918-9440

    eISSN：1618-0860

  52. Spiranthes hachijoensis (Orchidaceae), a new species within the S. sinensis species complex in Japan, based on morphological, phylogenetic, and ecological evidence.

    Kenji Suetsugu, Shun K Hirota, Hiroshi Hayakawa, Shohei Fujimori, Masayuki Ishibashi, Tian-Chuan Hsu, Yoshihisa Suyama

    Journal of plant research　136　(3)　333-348　2023年5月

    DOI： 10.1007/s10265-023-01448-6 　

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    The systematics of the Old World Spiranthes sinensis (Pers.) Ames species complex (Orchidaceae) has been complicated by its wide distribution and morphological variations. Within the species complex, S. australis Lindl. has been generally accepted as the only Spiranthes Rich. species distributed on the Japanese mainland. The present study provides morphological, phylogenetic, and ecological evidence for the recognition of S. hachijoensis Suetsugu as a new species of the S. sinensis species complex on the Japanese mainland. Spiranthes hachijoensis is morphologically similar to S. hongkongensis S.Y. Hu & Barretto and S. nivea T.P. Lin & W.M. Lin, sharing a degenerated rostellum, pollinia without a viscidium, and distinctly trilobed stigma. However, the taxon can be morphologically distinguished from S. hongkongensis by its glabrous rachis, ovaries, and sepals, and from S. nivea by its papillate labellum disc, larger papillate basal labellum callosities, and glabrous rachis, ovaries, and sepals. The autogamy and flowering phenology (i.e., earlier flowering) of S. hachijoensis are most likely responsible for premating isolation from the sympatric S. australis. A MIG-seq-based high-throughput molecular analysis indicated that the genetic difference between S. hachijoensis and its putative sister species S. sinensis is comparable to, or even greater than, the genetic difference between pairs of other species within the S. sinensis species complex. Our multifaceted approach strongly supports the recognition of S. hachijoensis as a morphologically, phenologically, phylogenetically, and ecologically distinct species.

  53. Inferring future changes in gene flow under climate change in riverscapes: a pilot case study in fluvial sculpin

    Souta Nakajima, Hiroaki Suzuki, Makoto Nakatsugawa, Ayumi Matsuo, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Futoshi Nakamura

    Landscape Ecology　38　(5)　1351-1362　2023年3月15日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10980-023-01633-x 　

    ISSN：0921-2973

    eISSN：1572-9761

  54. Mixed cropping of determinate and indeterminate soybean lines enhances productivity

    Rongling Ye, Ryosuke Tajima, Ayumi Sadaike, Daiki Saito, Momoko Ogawa, Issei Kawamura, Shun Ishimori, Takayuki Nakajima, Toru Uno, Kenichi Kano, Toyoaki Ito, Yoshihisa Suyama, Shin Kato, Akio Kikuchi, Koki Homma

    Field Crops Research　291　108785-108785　2023年2月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.fcr.2022.108785 　

    ISSN：0378-4290

  55. The contrary conservation situations of two local critically endangered species, Vaccinium emarginatum (Ericaceae) and Elatostema platyphyllum (Urticaceae), growing on the eastern edge of the distribution

    Mayu Shibabayashi, Taiga Shimizu, Chinatsu Tokuhiro, Yoshihisa Suyama, Shota Sakaguchi, Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Kuo-Fang Chung, Jun’ichi Nagasawa, Toshiaki Shiuchi, Goro Kokubugata, Atsushi Abe, Akiyo Naiki, Atsushi J. Nagano, Yuji Isagi

    Frontiers in Ecology and Evolution　11　2023年1月26日

    出版者・発行元： Frontiers Media SA

    DOI： 10.3389/fevo.2023.1093321 　

    eISSN：2296-701X

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    As biodiversity loss continues, there is an urgent need to develop efficient conservation measures to protect diversity with limited conservation resources. Conservation targets have generally been selected based on their population size, but more detailed assessments clarifying the phylogenetic genetic status, history, and phylogenetic uniqueness of rare species is crucial to set more appropriate and effective conservation measures. In Japan, the Act on Conservation of Endangered Species of Wild Fauna and Flora designated endangered plants with high conservation priority, but &amp;gt;40% of these species also grow overseas. We conducted comparative analyses based on ddRADseq and MIG-seq to evaluate the population conservation status and value of Vaccinium emarginatum and Elatostema platyphyllum which are growing across national borders at the eastern edge of their species distribution range. The analyses revealed contrasting conservation status between the two species; the Japanese population of V. emarginatum had lower genetic diversity at the individual level and phylogenetically differentiated from Taiwanese populations, while that of E. platyphyllum had higher diversity at the individual level and is a relatively recent migrant with little phylogenetical differentiation from Taiwanese populations. The two species, which share the common feature of being critically rare in Japan, showed contrasting genetic/phylogenetic characteristics. This study provided useful information for appropriate conservation measures based on species’ phylogenetic traits and genetic diversity.

  56. Spiranthes minamitaniana (Orchidaceae), a new orchid species from Japan based on morphological and phylogenetic data

    Kenji Suetsugu, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama

    Phytotaxa　599　(3)　139-149　2023年

    DOI： 10.11646/phytotaxa.599.3.1 　

    ISSN：1179-3155

    eISSN：1179-3163

  57. First Record of Thrixspermum annamense (Orchidaceae) from Iriomote Island, Ryukyu Islands, Japan, with Discussions on its Intraspecific Taxonomy

    Kenji Suetsugu, Shun K. Hirota, Koji Yonekura, Atsushi Abe, Yoshihisa Suyama, Tian Chuan Hsu

    Acta Phytotaxonomica et Geobotanica　74　(2)　121-129　2023年

    DOI： 10.18942/apg.202306 　

    ISSN：1346-7565

    eISSN：2189-7042

  58. Twenty-year changes in the composition of a mixed stock of foraging green turtles in the Yaeyama Islands of Japan 査読有り

    Tomoko Hamabata, Masakado Kawata, Satomi Kondo, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Kazuyuki Suzuki, Kazunari Kameda

    Marine Ecology Progress Series　2023年

    DOI： 10.3354/meps14367 　

  59. Monotropastrum kirishimense (Ericaceae), a new mycoheterotrophic plant from Japan based on multifaceted evidence.

    Kenji Suetsugu, Shun K Hirota, Tian-Chuan Hsu, Shuichi Kurogi, Akio Imamura, Yoshihisa Suyama

    Journal of plant research　136　(1)　3-18　2023年1月

    DOI： 10.1007/s10265-022-01422-8 　

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    Due to their reduced morphology, non-photosynthetic plants have been one of the most challenging groups to delimit to species level. The mycoheterotrophic genus Monotropastrum, with the monotypic species M. humile, has been a particularly taxonomically challenging group, owing to its highly reduced vegetative and root morphology. Using integrative species delimitation, we have focused on Japanese Monotropastrum, with a special focus on an unknown taxon with rosy pink petals and sepals. We investigated its flowering phenology, morphology, molecular identity, and associated fungi. Detailed morphological investigation has indicated that it can be distinguished from M. humile by its rosy pink tepals and sepals that are generally more numerous, elliptic, and constantly appressed to the petals throughout its flowering period, and by its obscure root balls that are unified with the surrounding soil, with root tips that hardly protrude. Based on genome-wide single-nucleotide polymorphisms, molecular data has provided clear genetic differentiation between this unknown taxon and M. humile. Monotropastrum humile and this taxon are associated with different Russula lineages, even when they are sympatric. Based on this multifaceted evidence, we describe this unknown taxon as the new species M. kirishimense. Assortative mating resulting from phenological differences has likely contributed to the persistent sympatry between these two species, with distinct mycorrhizal specificity.

  60. Has long‐distance flight ability been maintained by pigeons in highly insular habitats?

    Daichi Tsujimoto, Haruko Ando, Hajime Suzuki, Kazuo Horikoshi, Nobuyoshi Nakajima, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Chieko Fujii, Yuji Isagi

    Journal of Biogeography　50　(1)　235-246　2023年1月

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/jbi.14529 　

    ISSN：0305-0270

    eISSN：1365-2699

  61. Genetic Structure of the Liriope muscari Polyploid Complex and the Possibility of Its Genetic Disturbance in Japan. 国際誌

    Keita Watanabe, Makoto Yaneshita, Tetsuo Denda, Masatsugu Yokota, Shun K Hirota, Yoshihisa Suyama, Yoshihiko Tsumura

    Plants (Basel, Switzerland)　11　(22)　2022年11月8日

    DOI： 10.3390/plants11223015 　

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    Anthropogenic activities, such as the movement of plants through greening, can result in genetic disturbance that can interfere with local adaptation in wild populations. Although research is underway to prevent genetic disturbance associated with greening, genetic disturbance of intraspecific polyploidy, which is estimated to be present in 24% of vascular plants, has not been well studied. Liriope muscari is a polyploid complex with known diploid (2n = 36), tetraploid (2n = 72), and hexaploid (2n = 108) forms. The plants of this species tolerate dry and hot conditions and are therefore frequently used for greening and gardening. However, the distribution of this polyploid in Japan, its genetic structure, and genetic disturbance are not known. In this study, we investigated the polyploidy distribution and genetic structure in naturally distributed L. muscari in Japan using chloroplast DNA (cpDNA) haplotypes and nuclear DNA (nDNA). Commercially produced individuals were also studied and compared with natural populations to assess any genetic disturbance of the ploidy complex in this species. Chromosome counts, cpDNA, and nDNA results showed three genetically and cytologically distinct groups in Japan: first, a tetraploid group in mainland Japan; second, a hexaploid group in the Ryukyu Islands; and third, a diploid and tetraploid group in the Ryukyu Islands. Significant isolation by distance was also detected within the three groups (p = 0.001). Genetic disturbance due to greening and gardening should be avoided among the three groups. Genetic disturbance can be reduced by using individuals derived from natural populations that are close to the sites used for greening and gardening. For commercially produced individuals, genetic disturbance is unlikely in the Kanto region, an area of high usage, while genetic disturbance is thought possible in the Ryukyu Islands.

  62. Assessing the effectiveness of DNA barcoding for exploring hidden genetic diversity in deep-sea fishes

    Akinori Teramura, Keita Koeda, Ayumi Matsuo, Mitsuhiko P. Sato, Hiroshi Senou, Hsuan-Ching Ho, Yoshihisa Suyama, Kiyoshi Kikuchi, Shotaro Hirase

    MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES　701　83-98　2022年11月

    DOI： 10.3354/meps14193 　

    ISSN：0171-8630

    eISSN：1616-1599

  63. Even short‐distance dispersal over a barrier can affect genetic differentiation in Gyraulus , an island freshwater snail

    Takumi Saito, Tetsuro Sasaki, Yoshihiro Tsunamoto, Shota Uchida, Kiyoshi Satake, Yoshihisa Suyama, Satoshi Chiba

    Freshwater Biology　67　(11)　1971-1983　2022年11月

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/fwb.13990 　

    ISSN：0046-5070

    eISSN：1365-2427

  64. A New Species of Lithocarpus (Fagaceae) from Ca Dam Mountain of Quang Ngai Province, Vietnam

    Nguyen Van Ngoc, Hoang Thanh Son, Hoang Thi Binh, Shuichiro Tagane, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    Systematic Botany　47　(3)　729-737　2022年9月16日

    出版者・発行元： American Society of Plant Taxonomists

    DOI： 10.1600/036364422x16573019348265 　

    ISSN：0363-6445

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    Abstract—Lithocarpus cadamensis Ngoc &amp; Son, a new species of Fagaceae, is described and illustrated from Mt. Ca Dam, Tra Bong District, Quang Ngai Province, central Vietnam. The new species is characterized by its large leaf blades with long petioles, solitary and subsessile cupules which almost completely cover the nut, and spiny cupule scales, in a combination that clearly differs from the previously known species of Lithocarpus including the most similar species in the region, L. campylolepis, L. eucalyptifolius, and L. gougerotae. A MIG-seq phylogeny based on genome-wide SNPs reveals a phylogenetic position close to L. eucalyptifolius, from which the new species is differentiated by multiple morphological characters. A morphological description and comparison with related species, photographs, line drawing, preliminary conservation status, and DNA barcode sequences are provided for the new species.

  65. Predicting diversity changes in subalpine moorland ecosystems based on geometry of species distributions and realistic area loss. 査読有り

    Makishima, D, Ishii, N, Sutou, R, Goto, A, Kawai, Y, Taniguchi, H, Uchida, K, Shimazaki, M, Nakashizuka, T, Suyama, Y, Hikosaka, K, Sasaki, T

    Journal of Vegetation Science　33　(5)　in press　2022年9月

    DOI： 10.1111/jvs.13150 　

    ISSN：1100-9233

    eISSN：1654-1103

  66. Geographical and seasonal variation of plant taxa detected in faces of Cervus nippon yakushimae based on plant <scp>DNA</scp> analysis in Yakushima Island

    Yuto Higashi, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    Ecological Research　37　(5)　582-597　2022年9月

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/1440-1703.12319 　

    ISSN：0912-3814

    eISSN：1440-1703

  67. A new species of Quercus genus (Fagaceae) from Son Tra Peninsula, Central Vietnam

    Nguyen Van Ngoc, Hoang Thi Binh, Hoang Thanh Son, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    PhytoKeys　206　61-73　2022年8月26日

    出版者・発行元： Pensoft Publishers

    DOI： 10.3897/phytokeys.206.85635 　

    ISSN：1314-2011

    eISSN：1314-2003

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    A new species, Quercus sontraensis Ngoc, Binh &amp; Son is described from Son Tra Nature Reserve, Son Tra Peninsula, Central Vietnam. We examined the morphology and constructed a highly resolved phylogeny of Q. sontraensis and its relatives (including Q. langbianensis and Q. cambodiensis) using Multiplex ISSR genotyping by sequencing (MIG-seq). The morphological analyses and molecular evidence support the distinction between the new species (Q. sontraensis) and its relatives.

  68. Plant and microbial community composition jointly determine moorland multifunctionality 査読有り

    Takehiro Sasaki, Naohiro I. Ishii, Daichi Makishima, Rui Sutou, Akihito Goto, Yutaka Kawai, Hayami Taniguchi, Kunihiro Okano, Ayumi Matsuo, Alfred Lochner, Simone Cesarz, Yoshihisa Suyama, Kouki Hikosaka, Nico Eisenhauer

    Journal of Ecology　in press　(10)　2507-2521　2022年8月17日

    DOI： 10.1111/1365-2745.13969 　

    ISSN：0022-0477

    eISSN：1365-2745

  69. Evolutionary history of mycorrhizal associations between Japanese Oxygyne (Thismiaceae) species and Glomeraceae fungi 国際誌

    Kenji Suetsugu, Hidehito Okada, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama

    New Phytologist　235　(3)　836-841　2022年8月

    DOI： 10.1111/nph.18163 　

    ISSN：0028-646X

    eISSN：1469-8137

  70. From East Asia to Beringia: reconstructed range dynamics of Geranium erianthum (Geraniaceae) during the last glacial period in the northern Pacific region

    Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Hajime Ikeda, Shun K. Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito

    Plant Systematics and Evolution　308　(4)　2022年8月

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s00606-022-01820-4 　

    ISSN：0378-2697

    eISSN：1615-6110

  71. Species–genetic diversity correlations depend on ecological similarity between multiple moorland plant species

    Naohiro I. Ishii, Shun K. Hirota, Ayumi Matsuo, Mitsuhiko P. Sato, Takehiro Sasaki, Yoshihisa Suyama

    Oikos　2022年6月30日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/oik.09023 　

    ISSN：0030-1299

    eISSN：1600-0706

  72. Inferring future changes in gene flow under climate change in riverscapes

    Souta Nakajima, Hiroaki Suzuki, Makoto Nakatsugawa, Ayumi Matsuo, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Futoshi Nakamura

    bioRxiv　2022年5月

    DOI： 10.1101/2022.05.10.491062 　

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    Global climate change poses a significant threat to the habitat connectivity of cold-water-adapted organisms, leading to species extinctions. Because gene flow is itself a functional connectivity among wild populations, if gene flow is modeled by landscape variables, changes in population connectivity could be predicted. In this study, using a model-based riverscape genetics technique and a hydrological model to estimate water temperature, we inferred the determinants of and future changes in gene flow of the fluvial sculpin Cottus nozawae in the upstream section of the Sorachi River, Hokkaido, Japan. As a result of model selection, stream order, water temperature, slope, and distance were detected as landscape variables affecting the strength of gene flow in each stream section. In particular, the trend of greater gene flow in sections with higher stream order and lower temperature fluctuations or summer water temperatures was pronounced. The map from the model showed that gene flow is overall prevented in small tributaries in the southern area, where spring-fed environments are less prevalent. Estimating future changes in gene flow using future water temperature predictions, genetic connectivity was predicted to decrease dramatically until the end of the 21st century under IPCC representative concentration pathway scenario 8.5 (RCP8.5).

  73. Stable persistence of relict populations involved evolutionary shifts of reproductive characters in the genus Tanakaea (Saxifragaceae)

    Daiki Takahashi, Yuji Isagi, Pan Li, Ying-Xiong Qiu, Hiroaki Setoguchi, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Yoshihiro Tsunamoto, Shota Sakaguchi

    JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION　60　(6)　1405-1416　2022年5月

    DOI： 10.1111/jse.12849 　

    ISSN：1674-4918

    eISSN：1759-6831

  74. Norway spruce postglacial recolonization of Fennoscandia. 国際誌

    Kevin Nota, Jonatan Klaminder, Pascal Milesi, Richard Bindler, Alessandro Nobile, Tamara van Steijn, Stefan Bertilsson, Brita Svensson, Shun K Hirota, Ayumi Matsuo, Urban Gunnarsson, Heikki Seppä, Minna M Väliranta, Barbara Wohlfarth, Yoshihisa Suyama, Laura Parducci

    Nature communications　13　(1)　1333-1333　2022年3月14日

    DOI： 10.1038/s41467-022-28976-4 　

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    Contrasting theories exist regarding how Norway spruce (Picea abies) recolonized Fennoscandia after the last glaciation and both early Holocene establishments from western microrefugia and late Holocene colonization from the east have been postulated. Here, we show that Norway spruce was present in southern Fennoscandia as early as 14.7 ± 0.1 cal. kyr BP and that the millennia-old clonal spruce trees present today in central Sweden likely arrived with an early Holocene migration from the east. Our findings are based on ancient sedimentary DNA from multiple European sites (N = 15) combined with nuclear and mitochondrial DNA analysis of ancient clonal (N = 135) and contemporary spruce forest trees (N = 129) from central Sweden. Our other findings imply that Norway spruce was present shortly after deglaciation at the margins of the Scandinavian Ice Sheet, and support previously disputed finds of pollen in southern Sweden claiming spruce establishment during the Lateglacial.

  75. Can Rumex madaio (Polygonaceae) be threatened by natural hybridization with an invasive species in Japan

    Ryudo Uemura, Akira Asakawa, Shinji Fujii, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Masayuki Maki

    Nordic Journal of Botany　2022年3月3日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/njb.03543 　

    ISSN：0107-055X

    eISSN：1756-1051

  76. Ribes fujisanense (Grossulariaceae): a new species of obligate epiphytic gooseberry discovered in central Japan 査読有り

    Shota Sakaguchi, Mitsuru Oishi, Daiki Takahashi, Ayumi Matsuo, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Hiroaki Setoguchi

    Acta Phytotaxonomica et Geobotanica　73　(1)　49-56　2022年3月

  77. Development of a rational framework for the therapeutic efficacy of fecal microbiota transplantation for calf diarrhea treatment. 国際誌

    Jahidul Islam, Masae Tanimizu, Yu Shimizu, Yoshiaki Goto, Natsuki Ohtani, Kentaro Sugiyama, Eriko Tatezaki, Masumi Sato, Eiji Makino, Toru Shimada, Chise Ueda, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshifumi Sakai, Mutsumi Furukawa, Katsuki Usami, Hiroshi Yoneyama, Hisashi Aso, Hidekazu Tanaka, Tomonori Nochi

    Microbiome　10　(1)　31-31　2022年2月21日

    DOI： 10.1186/s40168-021-01217-4 　

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    BACKGROUND: Establishing fecal microbiota transplantation (FMT) to prevent multifactorial diarrhea in calves is challenging because of the differences in farm management practices, the lack of optimal donors, and recipient selection. In this study, the underlying factors of successful and unsuccessful FMT treatment cases are elucidated, and the potential markers for predicting successful FMT are identified using fecal metagenomics via 16S rRNA gene sequencing, fecal metabolomics via capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry, and machine learning approaches. RESULTS: Specifically, 20 FMT treatment cases, in which feces from healthy donors were intrarectally transferred into recipient diarrheal calves, were conducted with a success rate of 70%. Selenomonas was identified as a microorganism genus that showed significant donor-recipient compatibility in successful FMT treatments. A strong positive correlation between the microbiome and metabolome data, which is a prerequisite factor for FMT success, was confirmed by Procrustes analysis in successful FMT (r = 0.7439, P = 0.0001). Additionally, weighted gene correlation network analysis confirmed the positively or negatively correlated pairs of bacterial taxa (family Veillonellaceae) and metabolomic features (i.e., amino acids and short-chain fatty acids) responsible for FMT success. Further analysis aimed at establishing criteria for donor selection identified the genus Sporobacter as a potential biomarker in successful donor selection. Low levels of metabolites, such as glycerol 3-phosphate, dihydroxyacetone phosphate, and isoamylamine, in the donor or recipients prior to FMT, are predicted to facilitate FMT. CONCLUSIONS: Overall, we provide the first substantial evidence of the factors related to FMT success or failure; these findings could improve the design of future microbial therapeutics for treating diarrhea in calves. Video abstract.

  78. Identification of source populations for reintroduction in extinct populations based on genome-wide SNPs and mtDNA sequence: a case study of the endangered subalpine grassland butterfly Aporia hippia (Lepidoptera; Pieridae) in Japan

    Naoyuki Nakahama, Toshimichi Hanaoka, Tateo Itoh, Toshio Kishimoto, Atsushi Ohwaki, Ayumi Matsuo, Masahiko Kitahara, Shin ichi Usami, Yoshihisa Suyama, Takeshi Suka

    Journal of Insect Conservation　26　(1)　121-130　2022年2月

    DOI： 10.1007/s10841-022-00369-4 　

    ISSN：1366-638X

    eISSN：1572-9753

  79. 5S-IGS rDNA in wind-pollinated trees (Fagus L.) encapsulates 55 million years of reticulate evolution and hybrid origins of modern species. 国際誌

    Simone Cardoni, Roberta Piredda, Thomas Denk, Guido W Grimm, Aristotelis C Papageorgiou, Ernst-Detlef Schulze, Anna Scoppola, Parvin Salehi Shanjani, Yoshihisa Suyama, Nobuhiro Tomaru, James R P Worth, Marco Cosimo Simeone

    The Plant journal : for cell and molecular biology　109　(4)　909-926　2022年2月

    DOI： 10.1111/tpj.15601 　

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    Standard models of plant speciation assume strictly dichotomous genealogies in which a species, the ancestor, is replaced by two offspring species. The reality in wind-pollinated trees with long evolutionary histories is more complex: species evolve from other species through isolation when genetic drift exceeds gene flow; lineage mixing can give rise to new species (hybrid taxa such as nothospecies and allopolyploids). The multi-copy, potentially multi-locus 5S rDNA is one of few gene regions conserving signal from dichotomous and reticulate evolutionary processes down to the level of intra-genomic recombination. Therefore, it can provide unique insights into the dynamic speciation processes of lineages that diversified tens of millions of years ago. Here, we provide the first high-throughput sequencing (HTS) of the 5S intergenic spacers (5S-IGS) for a lineage of wind-pollinated subtropical to temperate trees, the Fagus crenata - F. sylvatica s.l. lineage, and its distant relative F. japonica. The observed 4963 unique 5S-IGS variants reflect a complex history of hybrid origins, lineage sorting, mixing via secondary gene flow, and intra-genomic competition between two or more paralogous-homoeologous 5S rDNA lineages. We show that modern species are genetic mosaics and represent a striking case of ongoing reticulate evolution during the past 55 million years.

  80. Intraspecific independent evolution of floral spur length in response to local flower visitor size in Japanese Aquilegia in different mountain regions. 国際誌

    Tsubasa Toji, Shun K Hirota, Natsumi Ishimoto, Yoshihisa Suyama, Takao Itino

    Ecology and evolution　12　(3)　e8668　2022年2月

    DOI： 10.1002/ece3.8668 　

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    Geographic differences in floral traits may reflect geographic differences in effective pollinator assemblages. Independent local adaptation to pollinator assemblages in multiple regions would be expected to cause parallel floral trait evolution, although sufficient evidence for this is still lacking. Knowing the intraspecific evolutionary history of floral traits will reveal events that occur in the early stages of trait diversification. In this study, we investigated the relationship between flower spur length and pollinator size in 16 populations of Aquilegia buergeriana var. buergeriana distributed in four mountain regions in the Japanese Alps. We also examined the genetic relationship between yellow- and red-flowered individuals, to see if color differences caused genetic differentiation by pollinator isolation. Genetic relationships among 16 populations were analyzed based on genome-wide single-nucleotide polymorphisms. Even among populations within the same mountain region, pollinator size varied widely, and the average spur length of A. buergeriana var. buergeriana in each population was strongly related to the average visitor size of that population. Genetic relatedness between populations was not related to the similarity of spur length between populations; rather, it was related to the geographic proximity of populations in each mountain region. Our results indicate that spur length in each population evolved independently of the population genetic structure but in parallel in response to local flower visitor size in different mountain regions. Further, yellow- and red-flowered individuals of A. buergeriana var. buergeriana were not genetically differentiated. Unlike other Aquilegia species in Europe and America visited by hummingbirds and hawkmoths, the Japanese Aquilegia species is consistently visited by bumblebees. As a result, genetic isolation by flower color may not have occurred.

  81. Morphological, ecological, and molecular phylogenetic approaches reveal species boundaries and evolutionary history of Goodyeracrassifolia (Orchidaceae, Orchidoideae) and its closely related taxa. 国際誌

    Kenji Suetsugu, Shun K Hirota, Narumi Nakato, Yoshihisa Suyama, Shunsuke Serizawa

    PhytoKeys　212　111-134　2022年

    DOI： 10.3897/phytokeys.212.91536 　

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    Species delimitation within the genus Goodyera is challenging among closely related species, because of phenotypic plasticity, ecological variation, and hybridization that confound identification methods based solely on morphology. In this study, we investigated the identity of Goodyeracrassifolia H.-J.Suh, S.-W.Seo, S.-H.Oh & T.Yukawa, morphologically similar to Goodyeraschlechtendaliana Rchb.f. This recently described taxon has long been known in Japan as "Oh-miyama-uzura" or "Gakunan" and considered a natural hybrid of G.schlechtendaliana and G.similis Blume (= G.velutina Maxim. ex Regel). Because the natural hybrid between G.schlechtendaliana and G.similis was described as G.×tamnaensis N.S.Lee, K.S.Lee, S.H.Yeau & C.S.Lee before the description of G.crassifolia, the latter might be a synonym of G.×tamnaensis. Consequently, we investigated species boundaries and evolutionary history of G.crassifolia and its closely related taxa based on multifaceted evidence. Consequently, morphological examination enabled us to distinguish G.crassifolia from other closely related species owing to the following characteristics: coriaceous leaf texture, laxly flowered inflorescence, long pedicellate ovary, large and weakly opened flowers, and column with lateral appendages. Ecological investigation indicates that G.crassifolia (2n = 60) is agamospermous, requiring neither pollinators nor autonomous self-pollination for fruit set, whereas G.schlechtendaliana (2n = 30) is neither autogamous nor agamospermous but is obligately pollinator-dependent. MIG-seq-based phylogenetic analysis provided no evidence of recent hybridization between G.crassifolia and its close congeners. Thus, molecular phylogeny reconstructed from MIG-seq data together with morphological, cytological, and ecological analyses support the separation of G.crassifolia as an independent species.

  82. Possible dispersal of coastal and subterranean carabid beetle Thalassoduvalius masidai (Coleoptera) by ocean currents 査読有り

    Naoyuki Nakahama, Ryosuke Okano, Yuichiro Nishimoto, Ayumi Matsuo, Noboru Ito, Yoshihisa Suyama

    Biological Journal of the Linnean Society　135　265-276　2022年

  83. Complementary combination of multiplex high-throughput DNA sequencing for molecular phylogeny

    Yoshihisa Suyama, Shun K. Hirota, Ayumi Matsuo, Yoshihiro Tsunamoto, Chika Mitsuyuki, Atsuki Shimura, Kunihiro Okano

    Ecological Research　37　(1)　171-181　2022年1月

    DOI： 10.1111/1440-1703.12270 　

    ISSN：0912-3814

    eISSN：1440-1703

  84. Molecular phylogeny and taxonomy of the Hydrangeaserrata complex (Hydrangeaceae) in western Japan, including a new subspecies of H.acuminata from Yakushima. 国際誌

    Shun K Hirota, Tetsukazu Yahara, Kengo Fuse, Hiroyuki Sato, Shuichiro Tagane, Shinji Fujii, Tadashi Minamitani, Yoshihisa Suyama

    PhytoKeys　188　49-71　2022年

    DOI： 10.3897/phytokeys.188.64259 　

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    According to the contemporary classification of Hydrangea native to Japan, H.serrata is a polymorphic species including six varieties. We discovered a plant identified as H.serrata, but morphologically distinct from previously known varieties, in Yakushima island where approximately 50 endemic species are known. To determine the relationship of this plant with previously known varieties, we examined morphology and constructed a highly resolved phylogeny of H.serrata and its relatives using three chloroplast genomic regions, rbcL, trnL intron, psbA-trnH, and two nuclear genomic regions, ITS1 and ITS2, and Multiplex ISSR genotyping by sequencing (MIG-seq). Based on these morphological and phylogenetic observations, we describe Hydrangeaacuminatasubsp.yakushimensissubsp. nov. as a newly discovered lineage in Yakushima, Japan and propose Hydrangeaminamitanii stat. nov. and Hydrangeaacuminatasubsp.australisstat. nov. which were previously treated as varieties of H.serrata.

  85. Corrigendum to “Genetic diversity, population size, and population stability of common plant species in a Mongolian grassland” [J. Arid Environ. 194 (2021) 104607]

    Naohiro I. Ishii, Masaya Takahashi, Yu Yoshihara, Nyambayar Dashzeveg, Tserendejid Ayush, Yoshihisa Suyama, Takehiro Sasaki

    Journal of Arid Environments　195　104624-104624　2021年12月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.jaridenv.2021.104624 　

    ISSN：0140-1963

  86. Phylogenetics of Japanese Geranium (Geraniaceae) using chloroplast genome sequences and genome-wide single nucleotide polymorphisms

    Seikan Kurata, Diego Tavares Vasques, Shota Sakaguchi, Shun K. Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Sachiko Nishida, Motomi Ito

    Plant Systematics and Evolution　307　(6)　2021年12月

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s00606-021-01788-7 　

    ISSN：0378-2697

    eISSN：1615-6110

  87. Genetic diversity, population size, and population stability of common plant species in a Mongolian grassland

    Naohiro I. Ishii, Masaya Takahashi, Yu Yoshihara, Nyambayar Dashzeveg, Tserendejid Ayush, Yoshihisa Suyama, Takehiro Sasaki

    Journal of Arid Environments　194　104607-104607　2021年11月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.jaridenv.2021.104607 　

    ISSN：0140-1963

  88. Revegetation in Japan overlooks geographical genetic structure of native Artemisia indica var. maximowiczii populations

    Satoshi Wagatsuma, Junichi Imanishi, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Mitsuhiko P Sato, Chika Mitsuyuki, Yoshihiro Tsunamoto, Tohru Tominaga, Yoshiko Shimono

    Restoration Ecology　2021年9月24日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1111/rec.13567 　

    ISSN：1061-2971

    eISSN：1526-100X

  89. Validation of Hosta alata (Asparagaceae) as a new species and its phylogenetic affinity

    Tetsukazu Yahara, Shun K. Hirota, Kengo Fuse, Hiroyuki Sato, Shuichiro Tagane, Yoshihisa Suyama

    PhytoKeys　181　79-93　2021年9月3日

    出版者・発行元： Pensoft Publishers

    DOI： 10.3897/phytokeys.181.64245 　

    ISSN：1314-2011

    eISSN：1314-2003

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    Molecular phylogenetic studies of <italic>Hosta pulchella</italic> (Asparagaceae) and its relatives, which are native to Japan, have been conducted and resulted in a highly resolved phylogeny. Specifically, the relationship of <italic>H. pulchella</italic> to <italic>H. alata</italic> Hatusima, <bold>nom. nud.</bold> is investigated. These data include genome-wide SNPs obtained through conducting multiplexed ISSR genotyping by sequencing (MIG-seq). Based on these phylogenetic results, morphological observations, distribution, and differences in flowering periods of <italic>H. alata</italic> collections sympatric with <italic>H. pulchella</italic>, we find the two species closely related, but distinct. As such, we formally describe <italic>Hosta alata</italic><bold>sp. nov.</bold> from the Oita Prefecture of Kyushu island, southwestern Japan.

  90. The gut microbiota induces Peyer’s-patch-dependent secretion of maternal IgA into milk

    Katsuki Usami, Kanae Niimi, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshifumi Sakai, Shintaro Sato, Kohtaro Fujihashi, Hiroshi Kiyono, Saeka Uchino, Mutsumi Furukawa, Jahidul Islam, Kaori Ito, Taiki Moriya, Yutaka Kusumoto, Michio Tomura, Russell C. Hovey, Junichi Sugawara, Hiroshi Yoneyama, Haruki Kitazawa, Kouichi Watanabe, Hisashi Aso, Tomonori Nochi

    Cell Reports　36　(10)　109655-109655　2021年9月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.celrep.2021.109655 　

    ISSN：2211-1247

  91. A strategic sampling design revealed the local genetic structure of cold-water fluvial sculpin: a focus on groundwater-dependent water temperature heterogeneity

    Souta Nakajima, Masanao Sueyoshi, Shun K. Hirota, Nobuo Ishiyama, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Futoshi Nakamura

    Heredity　2021年8月20日

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41437-021-00468-z 　

    ISSN：0018-067X

    eISSN：1365-2540

  92. A new natural hybrid, Goodyera xtanakae (Orchidaceae) from Japan with a discussion on the taxonomic identities of G. foliosa, G. sonoharae, G. velutina, G. xmaximo-velutina and G. henryi, based on morphological and molecular data

    Kenji Suetsugu, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama

    TAIWANIA　66　(3)　277-286　2021年8月

    DOI： 10.6165/tai.2021.66.277 　

    ISSN：0372-333X

  93. Spatial Autocorrelation Analysis Using MIG-seq Data Indirectly Estimated the Gamete and Larval Dispersal Range of the Blue Coral, Heliopora coerulea, Within Reefs

    Daniel Frikli Mokodongan, Hiroki Taninaka, La Sara, Taisei Kikuchi, Hideaki Yuasa, Yoshihisa Suyama, Nina Yasuda

    Frontiers in Marine Science　8　2021年7月20日

    DOI： 10.3389/fmars.2021.702977 　

    eISSN：2296-7745

  94. Genetic consequences of habitat fragmentation in a perennial plant Trillium camschatcense are subjected to its slow‐paced life history

    Yoichi Tsuzuki, Mitsuhiko P. Sato, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Masashi Ohara

    Population Ecology　64　(1)　5-18　2021年7月7日

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1002/1438-390x.12093 　

    ISSN：1438-3896

    eISSN：1438-390X

  95. Evolutionary history of Hemerocallis in Japan inferred from chloroplast and nuclear phylogenies and levels of interspecific gene flow

    Shun K. Hirota, Akiko A. Yasumoto, Kozue Nitta, Misa Tagane, Nozomu Miki, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    Molecular Phylogenetics and Evolution　164　107264-107264　2021年7月

    出版者・発行元： Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.ympev.2021.107264 　

    ISSN：1055-7903

  96. How co-distribution of two related azaleas (Rhododendron) developed in the Japanese archipelago: insights from evolutionary and demographic analyses

    Watanabe Yoichi, Etsuo Ono, Yoshihiro Tsunamoto, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Koichi Uehara

    TREE GENETICS & GENOMES　17　(3)　2021年6月

    DOI： 10.1007/s11295-021-01512-z 　

    ISSN：1614-2942

    eISSN：1614-2950

  97. グイマツ遺伝資源の系統構成の偏りを葉緑体ゲノムスクリーニングで調べる

    石塚 航, 松尾 歩, 陶山 佳久, 福田 陽子, 花岡 創, 新田 紀敏, 小野 清美, 原 登志彦

    日本森林学会大会発表データベース　132　96　2021年5月24日

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.132.0_96 　

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    北方系針葉樹グイマツ (Larix gmelinii var. japonica) は北海道に自生しないが、ニホンカラマツとの交雑次代が初期成長や材強度・耐鼠性に優れることから、古くより北海道に導入され、林業利用されている。これまでに106精英樹が選抜されたほか、後代や追加収集した遺伝資源の選抜育種が進められるものの、多くの来歴は不確かであった。著者らのこれまでの研究で、遺伝的系統を判別するための効率的な葉緑体ゲノムスクリーニングの枠組みができたことから、本研究では、(1)確かな生育地情報を有する植物標本・現生個体を対象とし、遺伝的系統とその地理的広がりを明らかにするとともに、(2)北海道に導入されたグイマツ遺伝資源がどのような遺伝的系統で構成されているか明らかにした。 遺伝解析は、15箇所のインフォマティブな葉緑体ゲノムの変異を選出し、NGSを用いて多検体で効率的に調べるマルチシーケンス技術によった。結果より、地理的分布に特徴のある6系統グループが見出され、L. gmelinii種群内の変種と対応していた。全系統グループがグイマツ遺伝資源で検出されたが、その構成には来歴と関連するとみられる偏りがあった。

  98. Detection and dispersal risk of genetically disturbed individuals in endangered wetland plant species Pecteilis radiata (Orchidaceae) in Japan

    Naoyuki Nakahama, Takeshi Asai, Shuji Matsumoto, Kenji Suetsugu, Osamu Kurashima, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama

    Biodiversity and Conservation　30　(6)　1913-1927　2021年5月

    出版者・発行元： Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10531-021-02174-y 　

    ISSN：0960-3115

    eISSN：1572-9710

  99. Diversification of terpenoid emissions proposes a geographic structure based on climate and pathogen composition in Japanese cedar. 国際誌

    Tsutom Hiura, Hayate Yoshioka, Sou N Matsunaga, Takuya Saito, Tetsuo I Kohyama, Norihisa Kusumoto, Kentaro Uchiyama, Yoshihisa Suyama, Yoshihiko Tsumura

    Scientific reports　11　(1)　8307-8307　2021年4月15日

    DOI： 10.1038/s41598-021-87810-x 　

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    Biogenic volatile organic compounds emitted from plants are important constituents of atmospheric chemistry and play a major role in the resistance of plants against various environmental stresses. However, little is known about how abiotic and biotic environments on a geographic scale relate to diversifications of the emission. Here, we present variations of terpenes stored in and emitted from leaves of a single species in a common garden, using genetically differentiated local populations of Japanese cedar, the most dominant and widely distributed tree species in Japan. Furthermore, we determined the composition of fungal communities in 50 locations, based on the presence or absence of 158 fungal species inhabiting the cedar. The results showed that terpenoids, especially those that are emitted, were highly diversified and geographically structured among the 12 populations. The total amount of stored terpenes was negatively affected by warm and less-snow climates. On the other hand, variations in some emitted terpenoid species among the populations were correlated to antagonistic fungal species inhabiting the Japanese cedar. We propose that the diversification of composition and amount of stored and emitted terpenoids in the tree species is not only structured by climate, but also antagonistic fungal communities through biological interactions.

  100. IMPATIENS SUBFALCATA (BALSAMINACEAE), A NEW SPECIES FROM LAOS

    P. Souladeth, S. Tagane, Y. Suyama, N. Ishii, A. Nagahama, K. Souvannakhoummane

    Edinburgh Journal of Botany　78　1-10　2021年4月7日

    出版者・発行元： Royal Botanic Garden Edinburgh

    DOI： 10.24823/ejb.2021.358 　

    ISSN：0960-4286

    eISSN：1474-0036

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    Impatiens subfalcata Soulad. &amp; Tagane, a new species of Balsaminaceae from southern Laos, is described and illustrated. The new species is morphologically similar to Impatiens attopeuensis and I. notoptera in having succulent stems, serrate leaf margins and pinkish flowers, but distinguished from these two by its falcate lanceolate or oblanceolate leaves, more numerous secondary veins, shorter petioles and smaller dorsal petals.

  101. Comparative analysis of spatial genetic structures in sympatric populations of two riparian plants,Saxifraga acerifoliaandSaxifraga fortunei

    Kana Magota, Shota Sakaguchi, Shun K. Hirota, Yoshihiro Tsunamoto, Yoshihisa Suyama, Kensei Akai, Hiroaki Setoguchi

    American Journal of Botany　108　(4)　680-693　2021年4月

    出版者・発行元： Wiley

    DOI： 10.1002/ajb2.1644 　

    ISSN：0002-9122

    eISSN：1537-2197

  102. Evaluating the genetic diversity in two tropical leguminous trees, Dalbergia cochinchinensis and D. nigrescens, in lowland forests in Cambodia and Thailand using MIG-seq.

    Moeko Hirata, Chika Mitsuyuki, Etsuko Moritsuka, Phourin Chhang, Shuichiro Tagane, Hironori Toyama, Heng Sokh, Sukid Rueangruea, Somran Suddee, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara, Kousuke M Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    Genes & genetic systems　96　(1)　41-53　2021年3月18日

    DOI： 10.1266/ggs.20-00026 　

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    It is vital to measure the levels of genetic diversity and differentiation between populations in a species to understand the current genetic structure and evolution of the species. Here, MIG-seq (multiplexed inter-simple sequence repeat genotyping by sequencing) was employed to assess the genetic variation in two tropical leguminous tree species, Dalbergia cochinchinensis and D. nigrescens, in Cambodia and Thailand. Sequence data for 255-618 loci, each with an approximate length of 100 bp, were obtained, and the nucleotide diversity, Tajima's D and FST were computed. The estimates calculated from the data obtained by MIG-seq were compared to those obtained by Sanger sequencing of nine nuclear coding genes in D. cochinchinensis in our previous study. The nucleotide diversity at the MIG-seq loci was slightly higher than that at silent sites in the coding loci, whereas the FST values at the MIG-seq loci were generally lower than those at the coding loci, although the differences were not significant. Moreover, nucleotide diversities within populations of the two species were similar to each other, at approximately 0.005. Three and four population clusters were genetically recognized in D. cochinchinensis and D. nigrescens, respectively. Although the populations were differentiated from each other, the levels of differentiation among them, as measured by FST, were higher in D. cochinchinensis than in D. nigrescens. This indicates higher levels of gene flow between the populations in the latter species. We recommend using MIG-seq for quick surveys of genetic variation because it is cost-effective and results in smaller variance in the estimates of population genetic parameters.

  103. A New Species of Actinodaphne (Lauraceae), A. lambirensis from Sarawak, Malaysia, and an Analysis of its Phylogenetic Position using MIG-seq and ITS Sequences

    Okabe Norikazu, Yahara Tetsukazu, Tagane Shuichiro, Mitsuyuki Chika, Matsuo Ayumi, Sasaki Takanori, Moritsuka Etsuko, Fuse Kengo, Shimizu-Kaya Usun, Sang Julia Anak, Pungga Runi Sylvester, Suyama Yoshihisa

    Acta phytotaxonomica et geobotanica　72　(1)　43-59　2021年2月28日

    出版者・発行元： The Japanese Society for Plant Systematics

    DOI： 10.18942/apg.202005 　 10.3897/phytokeys.186.69878_references_DOI_VMT0Wq3pq5CtrU7g6ARl9lD3Eyx 　 10.1111/1440-1703.12270_references_DOI_VMT0Wq3pq5CtrU7g6ARl9lD3Eyx 　

    ISSN：1346-7565

    eISSN：2189-7042

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    A new species, Actinodaphne lambirensis Tagane, Yahara & N. Okabe (Lauraceae) from Lambir Hills National Park, Miri District, Sarawak, Malaysia, is described and illustrated. It is characterized by glabrous twigs and leaves, small lamina (4.3–9.2 × 1.7–2.8 cm), and long fruiting peduncles. Because only fruiting specimens were available, the position of A. lambirensis was determined by the phylogenetic trees based on 22 species of Actinodaphne, including the type species of the genus, A. pruinosa Nees, and 11 species of Neolitsea from Southeast Asia using multiplexed inter-simple sequence repeats genotyping by sequencing (MIG-seq). Additionally, a phylogenetic tree was constructed using internal transcribed spacer (ITS) sequences for 36 species of Actinodaphne and 40 species of Neolitsea that include our MIGseq samples and additional species for which ITS sequences were determined in previous studies. Both the MIG-seq tree and ITS tree supported A. lambirensis as belonging with Actinodaphne.

  104. Refugia within refugium of Geranium yesoense (Geraniaceae) in Japan were driven by recolonization into the southern interglacial refugium

    Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Shun K Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Sachiko Nishida, Motomi Ito

    Biological Journal of the Linnean Society　132　(3)　552-572　2021年2月17日

    出版者・発行元： Oxford University Press (OUP)

    DOI： 10.1093/biolinnean/blaa212 　

    ISSN：0024-4066

    eISSN：1095-8312

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    <title>Abstract</title> Recent studies have found that geographical fragmentation and recurrent colonization result in complex genetic structures in refugial areas. This phenomenon, known as ‘refugia within refugium’, has been identified from many geographical locations. In Japan, the high-elevation mountains of central Honshu provided an interglacial refugium for alpine plants. Here we focused on the Geranium yesoense complex, which exhibits increased morphological variation in the refugial area, to determine whether this variation was shaped by recurrent colonization, range fragmentation or phenotypic changes independent of population history. We analysed single nucleotide polymorphism data and chloroplast genome sequences. Diversification in the G. yesoense species complex occurred in the mid-Pleistocene. The varieties are distinct entities and suggest the presence of a genetic cluster with highly disjunct distributions, occurring both in northern Japan and in southern refugial areas in central Honshu. Demographic analysis suggests that a single ancestral variety (var. nipponicum) evolved in the alpine region of central Honshu, and that subsequent migration from one of the two diverged northern varieties (var. pseudopratense) led to secondary contact with var. nipponicum during the last glacial period. Recolonization into refugial populations in central Honshu and hybridization between diverged populations have resulted in complex genetic structures among refugial populations.

  105. Potential extinction debt due to habitat loss and fragmentation in subalpine moorland ecosystems

    Daichi Makishima, Rui Sutou, Akihito Goto, Yutaka Kawai, Naohiro Ishii, Hayami Taniguchi, Kei Uchida, Masaya Shimazaki, Tohru Nakashizuka, Yoshihisa Suyama, Kouki Hikosaka, Takehiro Sasaki

    PLANT ECOLOGY　222　(4)　445-457　2021年2月

    DOI： 10.1007/s11258-021-01118-4 　

    ISSN：1385-0237

    eISSN：1573-5052

  106. Genetic Diversity and Structure of Apomictic and Sexually Reproducing Lindera Species (Lauraceae) in Japan

    Mizuho Nakamura, Satoshii Nanami, Seiya Okuno, Shun Hirota, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Hayato Tokumoto, Shizue Yoshihara, Akira Itoh

    Forests　12　(2)　1-13　2021年2月

    DOI： 10.3390/f12020227 　

    eISSN：1999-4907

  107. マレーシア・サラワク州産のクスノキ科アクチノダフネ属の新種 Actinodaphne lambirensis と MIG-seq，ITS 配列を用いた その系統的位置に関する解析

    岡部 憲和, 矢原 徹一, 田金 秀一郎, 満行 知花, 松尾 歩, 佐々木 崇徳, 森塚 絵津子, 布施 健吾, 清水 加耶, Sang Julia Anak, Pungga Runi Sylvester, 陶山 佳久

    植物地理・分類研究　69　(2)　262　2021年

    出版者・発行元： 日本植物分類学会

    DOI： 10.18942/chiribunrui.0692-24 　

    ISSN：0388-6212

    eISSN：2433-0469

  108. Two new species and 18 new records for the flora of Laos

    Shuichiro Tagane, Phetlasy Souladeth, Deuanta Kongxaysavath, Sukid Rueangruea, Somran Suddee, Yoshihisa Suyama, Eizi Suzuki, Tetsukazu Yahara

    Thai Forest Bulletin (Botany)　49　111-126　2021年

    出版者・発行元： The Forest Herbarium

    DOI： 10.20531/tfb.2021.49.1.14 　

    eISSN：2465-423X

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    Six pteridophyte species of five families and 12 spermatophyte species of 10 families are reported from Bolaven Plateau, southern Laos, as new records to the flora of Laos. Moreover, two new species, Sterculia bolavenensis (Malvaceae) and Wikstroemia bolavenensis (Thymelaeaceae), are described. For each species, voucher specimens are cited, photographs are shown and additional information including geographical distribution, ecology and taxonomic notes are provided.

  109. Morphological and molecular evidence reveals three new species of Lithocarpus (Fagaceae) from Bidoup-Nui Ba National Park, Vietnam. 国際誌

    Nguyen Van Ngoc, Hoang Thi Binh, Ai Nagahama, Shuichiro Tagane, Hironori Toyama, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    PhytoKeys　186　73-92　2021年

    DOI： 10.3897/phytokeys.186.69878 　

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    Three new species, Lithocarpusbidoupensis Ngoc & Tagane, L.congtroiensis Ngoc & Yahara, and L.hongiaoensis Ngoc & Binh are described from Bidoup-Nui Ba National Park, Central Highland of Vietnam. Morphological analyses and Maximum likelihood tree based on genome-wide SNPs support the distinction of those species from the previously known taxa in the region. The three new species are considered to be endemic to the Bidoup-Nui Ba National Park and the preliminary conservation status for each species is evaluated as Critically Endangered.

  110. A new subspecies of Stellariaalsine (Caryophyllaceae) from Yakushima, Japan. 国際誌

    Tetsukazu Yahara, Shun K Hirota, Kengo Fuse, Hiroyuki Sato, Shuichiro Tagane, Yoshihisa Suyama

    PhytoKeys　187　177-188　2021年

    DOI： 10.3897/phytokeys.187.64023 　

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    An unknown taxon of Stellaria was discovered in Yakushima, a Japanese island known to harbor several endemic species. To determine the identity of this taxon, this study employed MIG-seq for the reconstruction of a finely resolved phylogenetic tree of the newly discovered taxon, along with some related species of Stellaria. The results showed that the newly discovered taxon is a relative of S.alsine. Based on this result, Stellariaalsinesubsp.nanasubsp. nov. was published.

  111. Functional traits divergence in parallelly evolved rheophytic populations of solidago virgaurea l. Complex (asteraceae) in japan

    Shota Sakaguchi, Atsushi Abe, Koki Nagasawa, Daiki Takahashi, Hiroaki Setoguchi, Masayuki Maki, Ryuta Kyan, Takako Nishino, Naoko Ishikawa, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito

    Acta Phytotaxonomica et Geobotanica　72　(2)　93-111　2021年

    DOI： 10.18942/apg.202012 　

    ISSN：1346-7565

    eISSN：2189-7042

  112. First record of goodyera × tamnaensis (Orchidaceae) from boso peninsula, chiba prefecture, japan, based on morphological and molecular data

    Kenji Suetsugu, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama

    Taiwania　66　(1)　113-120　2021年

    DOI： 10.6165/tai.2021.66.113 　

    ISSN：0372-333X

  113. Testing species hypotheses in the mangrove genus Rhizophora from the Western hemisphere and South Pacific islands

    Gustavo Maruyama Mori, Andre Guilherme Madeira, Mariana Vargas Cruz, Yoshiaki Tsuda, Koji Takayama, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Takaya Iwasaki, Anete Pereira de Souza, Maria Imaculada Zucchi, Tadashi Kajita

    ESTUARINE COASTAL AND SHELF SCIENCE　248　2021年1月

    DOI： 10.1016/j.ecss.2020.106948 　

    ISSN：0272-7714

    eISSN：1096-0015

  114. Contact zone of two different chloroplast lineages and genetic guidelines for seed transfer inQuercus serrataandQuercus crispula

    Kataru Onosato, Takuto Shitara, Asako Matsumoto, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshihiko Tsumura

    PLANT SPECIES BIOLOGY　36　(1)　72-83　2021年1月

    DOI： 10.1111/1442-1984.12296 　

    ISSN：0913-557X

    eISSN：1442-1984

  115. A Narrow Endemic or a Species Showing Disjunct Distribution? Studies on Meehania montis-koyae Ohwi (Lamiaceae). 国際誌

    Atsuko Takano, Shota Sakaguchi, Pan Li, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Guo-Hua Xia, Xi Liu, Yuji Isagi

    Plants (Basel, Switzerland)　9　(9)　2020年9月8日

    DOI： 10.3390/plants9091159 　

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    Meehania montis-koyae Ohwi (Lamiaceae), which has been considered a narrow endemic and endangered species in Japan, was found in eastern China in 2011. China and Japan belong to the same floristic region and share many plant species, but it is very rare that Japanese narrow endemic species are newly found outside of the country. We examined herbarium specimens of both countries, and conducted analyses of molecular phylogenetics, population genetics, and divergence time estimation using two nuclear (ITS and ETS) gene regions and MIG-seq data. Chinese plants tend to become larger than Japanese, and they are different in leaf shape and floral features. Molecular phylogenetic analysis shows Chinese and Japanese M. montis-koyae are the closest relatives to each other. Population genetic analysis indicates no current gene flow between the Chinese and Japanese populations, and divergence time analysis shows they were separated during the late Miocene. We reach the conclusion that Chinese and Japanese M. montis-koyae have already become distinct biological entities, and a new taxon name Meehania zheminensis A. Takano, Pan Li, G.-H.Xia is proposed for the Chinese plants. A key to Asian Meehania species is provided.

  116. Genetic consequences of plant edaphic specialization to solfatara fields: Phylogenetic and population genetic analysis of Carex angustisquama (Cyperaceae). 国際誌 査読有り

    Koki Nagasawa, Hiroaki Setoguchi, Masayuki Maki, Hayato Goto, Keitaro Fukushima, Yuji Isagi, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Yoshihiro Tsunamoto, Kazuhiro Sawa, Shota Sakaguchi

    Molecular ecology　29　(17)　3234-3247　2020年9月

    DOI： 10.1111/mec.15324 　

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    Edaphic specialization is one of the main drivers of plant diversification and has multifaceted effects on population dynamics. Carex angustisquama is a sedge plant growing only on heavily acidified soil in solfatara fields, where only extremophytes can survive. Because of the lack of closely related species in similar habitats and its disjunct distribution, the species offers ideal settings to investigate the effects of adaptation to solfatara fields and of historical biogeography on the genetic consequences of plant edaphic specialization to solfatara fields. Here, genome-wide single nucleotide polymorphisms were used to reveal the phylogenetic origin of C. angustisquama, and 16 expressed sequence tag-simple sequence repeat markers were employed to infer population demography of C angustisquama. Molecular phylogenetic analysis strongly indicated that C. angustisquama formed a monophyletic clade with Carex doenitzii, a species growing on nonacidified soil in the sympatric subalpine zone. The result of population genetic analysis showed that C. angustisquama has much lower genetic diversity than the sister species, and notably, all 16 loci were completely homozygous in most individuals of C. angustisquama. Approximate Bayesian computation analysis supported the model that assumed hierarchical declines of population size through its evolutionary sequence. We propose that the edaphic specialist in solfatara fields has newly attained the adaptation to solfatara fields in the process of speciation. Furthermore, we found evidence of a drastic reduction in genetic diversity in C. angustisquama, suggesting that the repeated founder effects associated with edaphic specialization and subsequent population demography lead to the loss of genetic diversity of this extremophyte in solfatara fields.

  117. Natal Origin Identification of Green Turtles in the North Pacific by Genome-Wide Population Analysis With Limited DNA Samples 査読有り

    Tomoko Hamabata, Ayumi Matsuo, Mitsuhiko P. Sato, Satomi Kondo, Kazunari Kameda, Isao Kawazu, Takuya Fukuoka, Katsufumi Sato, Yoshihisa Suyama, Masakado Kawata

    Frontiers in Marine Science　7　2020年8月7日

    出版者・発行元： Frontiers Media SA

    DOI： 10.3389/fmars.2020.00658 　

    eISSN：2296-7745

  118. Genetic Structure and Population Demography of White-Spotted Charr in the Upstream Watershed of a Large Dam

    Souta Nakajima, Shun Hirota, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Futoshi Nakamura

    Water　12　(9)　2406-2406　2020年8月

    出版者・発行元： MDPI AG

    DOI： 10.3390/w12092406 　

    eISSN：2073-4441

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    White-spotted charr (Salvelinus leucomaenis leucomaenis) is an anadromous fish that has been severely harmed by human land-use development, particularly through habitat fragmentation. However, the anthropogenic impacts on populations of this species have not been evaluated, except those on small dammed-off populations. Using multiplexed ISSR genotyping by sequencing, we investigated the genetic structure of white-spotted charr in four tributaries in the upper section of the Kanayama Dam in the Sorachi River, Hokkaido Island, Japan. There were no distinct genetic structures (FST = 0.014), probably because some active individuals migrate frequently among tributaries. By model-flexible demographic simulation, historical changes in the effective population size were inferred. The result indicates that the population size has decreased since the end of the last glacial period, with three major population decline events, including recent declines that were probably associated with recent human activities. Nevertheless, populations in the watershed upstream of the Kanayama Dam are still expected to be at low risk of immediate extinction, owing to the large watershed size and the limited number of small check dams. An effective conservation measure for sustaining the white-spotted charr population is to maintain high connectivity between tributaries, such as by providing fishways in check dams during construction.

  119. Spatial genet dynamics of a dwarf bamboo: Clonal expansion into shaded forest understory contributes to regeneration after an episodic die‐off 査読有り

    Hiroshi Tomimatsu, Ayumi Matsuo, Yuichiro Kaneko, Eri Kudo, Ryotaro Taniguchi, Tomoyuki Saitoh, Yoshihisa Suyama, Akifumi Makita

    Plant Species Biology　35　(3)　185-196　2020年5月3日

    DOI： 10.1111/1442-1984.12272 　

    ISSN：0913-557X

    eISSN：1442-1984

  120. Salt Tolerance Seedlings Derived from Putative Hybrid Pines (Pinus × densi-thunbergii): 査読有り

    Takashi Yonemichi, Takeshi Tsukagoshi, Tsutomu Karukome, Yoko Hisamoto, Yoshihiro Ohmori, Chunlan Lian, Mitsuhiko P. Sato, Takanori Sasaki, Ayumu Matsuo, Yoshihisa Suyama, Susumu Goto

    Journal of the Japanese Forest Society　102　(2)　101-107　2020年4月1日

    出版者・発行元： The Japanese Forest Society

    DOI： 10.4005/jjfs.102.101 　

    ISSN：1349-8509

    eISSN：1882-398X

  121. Cryptocarya kaengkrachanensis, a new species of Lauraceae from Kaeng Krachan National Park, southwest Thailand 国際誌

    Meng Zhang, Tetsukazu Yahara, Shuichiro Tagane, Sukid Rueangruea, Somran Suddee, Etsuko Moritsuka, Yoshihisa Suyama

    PHYTOKEYS　140　(140)　139-157　2020年3月

    DOI： 10.3897/phytokeys.140.34574 　

    ISSN：1314-2011

    eISSN：1314-2003

  122. Genetic diversity and the origin of commercial plantation of Indonesian teak on Java Island 査読有り

    Eko Prasetyo, Widiyatno, Sapto Indrioko, Mohammad Na'iem, Tetsuya Matsui, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshihiko Tsumura

    TREE GENETICS & GENOMES　16　(2)　34　2020年3月

    DOI： 10.1007/s11295-020-1427-5 　

    ISSN：1614-2942

    eISSN：1614-2950

  123. Genet dynamics of a regenerating dwarf bamboo population across heterogeneous light environments in a temperate forest understorey 査読有り

    Ayumi Matsuo, Hiroshi Tomimatsu, Yushin Sangetsu, Yoshihisa Suyama, Akifumi Makita

    Ecology and Evolution　8　(3)　1746-1757　2020年2月

    DOI： 10.1002/ece3.3793 　

    eISSN：2045-7758

  124. Salt tolerance seedlings derived from putative hybrid pines (Pinus × densi-thunbergii): Possibility of candidate materials for coastal forest restoration

    Takashi Yonemichi, Takeshi Tsukagoshi, Tsutomu Karukome, Yoko Hisamoto, Yoshihiro Ohmori, Chunlan Lian, Mitsuhiko P. Sato, Takanori Sasaki, Ayumu Matsuo, Yoshihisa Suyama, Susumu Goto

    Nihon Ringakkai Shi/Journal of the Japanese Forestry Society　102　(2)　101-107　2020年

    出版者・発行元： Nihon Ringakkai

    DOI： 10.4005/jjfs.102.101 　

    ISSN：0021-485X

  125. Revisiting museum collections in the genomic era: potential of MIG-seq for retrieving phylogenetic information from aged minute dry specimens of ants (Hymenoptera: Formicidae) and other small organisms

    Katsuyuki Eguchi, Emiko Oguri, Takanori Sasaki, Ayumi Matsuo, Dai Dac Nguyen, WeeyaWat Jaitrong, Bakhtiar Effendi Yahya, Zhilin Chen, Rijal Satria, Wendy Yanling Wang, Yoshihisa Suyama

    MYRMECOLOGICAL NEWS　30　151-159　2020年

    DOI： 10.25849/myrmecol.news_030:151 　

    ISSN：1994-4136

  126. Genome-wide MIG-seq and morphometric data reveals heterospecificity of the Gnamptogenys taivanensis group (Hymenoptera: Formicidae: Ectatomminae) in the northern mountainous region of Vietnam

    Dai D. Nguyen, Emiko Oguri, Aiki Yamada, Chung-Chi Lin, Chen Zhilin, Anh D. Nguyen, Yoshihisa Suyama, Katsuyuki Eguchi

    RAFFLES BULLETIN OF ZOOLOGY　68　539-555　2020年

    DOI： 10.26107/RBZ-2020-0070 　

    ISSN：0217-2445

  127. Museomics for reconstructing historical floristic exchanges: Divergence of stone oaks across Wallacea. 国際誌

    Joeri S Strijk, Hoàng Thi Binh, Nguyen Van Ngoc, Joan T Pereira, J W Ferry Slik, Rahayu S Sukri, Yoshihisa Suyama, Shuichiro Tagane, Jan J Wieringa, Tetsukazu Yahara, Damien D Hinsinger

    PloS one　15　(5)　e0232936　2020年

    DOI： 10.1371/journal.pone.0232936 　

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    Natural history collections and tropical tree diversity are both treasure troves of biological and evolutionary information, but their accessibility for scientific study is impeded by a number of properties. DNA in historical specimens is generally highly fragmented, complicating the recovery of high-grade genetic material. Furthermore, our understanding of hyperdiverse, wide-spread tree assemblages is obstructed by extensive species ranges, fragmented knowledge of tropical tree diversity and phenology, and a widespread lack of species-level diagnostic characters, prohibiting the collecting of readily identifiable specimens which can be used to build, revise or strengthen taxonomic frameworks. This, in turn, delays the application of downstream conservation action. A sizable component of botanical collections are sterile-thus eluding identification and are slowing down progress in systematic treatments of tropical biodiversity. With rapid advances in genomics and bioinformatic approaches to biodiversity research, museomics is emerging as a new field breathing life into natural collections that have been built up over centuries. Using MIGseq (multiplexed ISSR genotyping by sequencing), we generated 10,000s of short loci, for both freshly collected materials and museum specimens (aged >100 years) of Lithocarpus-a widespread tropical tree genus endemic to the Asian tropics. Loci recovery from historical and recently collected samples was not affected by sample age and preservation history of the study material, underscoring the reliability and flexibility of the MIGseq approach. Phylogenomic inference and biogeographic reconstruction across insular Asia, highlights repeated migration and diversification patterns between continental regions and islands. Results indicate that co-occurring insular species at the extremity of the distribution range are not monophyletic, raising the possibility of multiple independent dispersals along the outer edge of Wallacea. This suggests that dispersal of large seeded tree genera throughout Malesia and across Wallacea may have been less affected by large geographic distances and the presence of marine barriers than generally assumed. We demonstrate the utility of MIGseq in museomic studies using non-model taxa, presenting the first range-wide genomic assessment of Lithocarpus and tropical Fagaceae as a proof-of-concept. Our study shows the potential for developing innovative genomic approaches to improve the capture of novel evolutionary signals using valuable natural history collections of hyperdiverse taxa.

  128. Phylogenetic origin of Magnolia pseudokobus (Magnoliaceae), a rare Magnolia extinct in the wild, revealed by chloroplast genome sequencing, genome-wide SNP genotyping and microsatellite analysis 査読有り

    Shota Sakaguchi, Koki Nagasawa, Yukie Umetsu, Jun ichi Nagasawa, San ei Ichikawa, Satoru Kinoshita, Ken ichi Hiratsuka, Yoshihisa Suyama, Yoshihiro Tsunamoto, Yuji Isagi, Hiroaki Setoguchi

    Journal of Forest Research　2020年

    DOI： 10.1080/13416979.2020.1767268 　

    ISSN：1341-6979

    eISSN：1610-7403

  129. Elucidation of the Effects of a Current X-SCID Therapy on Intestinal Lymphoid Organogenesis Using an In Vivo Animal Model. 国際誌 査読有り

    Tomonori Nochi, Shunichi Suzuki, Shun Ito, Shotaro Morita, Mutsumi Furukawa, Daiichiro Fuchimoto, Yoji Sasahara, Katsuki Usami, Kanae Niimi, Osamu Itano, Minoru Kitago, Sachiko Matsuda, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Yoshifumi Sakai, Guoyao Wu, Fuller W Bazer, Kouichi Watanabe, Akira Onishi, Hisashi Aso

    Cellular and molecular gastroenterology and hepatology　10　(1)　83-100　2020年

    DOI： 10.1016/j.jcmgh.2020.01.011 　

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    BACKGROUND & AIMS: Organ-level research using an animal model lacking Il2rg, the gene responsible for X-linked severe combined immunodeficiency (X-SCID), is clinically unavailable and would be a powerful tool to gain deeper insights into the symptoms of patients with X-SCID. METHODS: We used an X-SCID animal model, which was first established in our group by the deletion of Il2rg gene in pigs, to understand the clinical signs from multiple perspectives based on pathology, immunology, microbiology, and nutrition. We also treated the X-SCID pigs with bone marrow transplantation (BMT) for mimicking a current therapeutic treatment for patients with X-SCID and investigated the effect at the organ-level. Moreover, the results were confirmed using serum and fecal samples collected from patients with X-SCID. RESULTS: We demonstrated that X-SCID pigs completely lacked Peyer's patches (PPs) and IgA production in the small intestine, but possessed some dysfunctional intestinal T and B cells. Another novel discovery was that X-SCID pigs developed a heterogeneous intestinal microflora and possessed abnormal plasma metabolites, indicating that X-SCID could be an immune disorder that affects various in vivo functions. Importantly, the organogenesis of PPs in X-SCID pigs was not promoted by BMT. Although a few isolated lymphoid follicles developed in the small intestine of BMT-treated X-SCID pigs, there was no evidence that they contributed to IgA production and microflora formation. Consistently, most patients with X-SCID who received BMT possessed abnormal intestinal immune and microbial environments regardless of the presence of sufficient serum IgG. CONCLUSIONS: These results indicate that the current BMT therapies for patients with X-SCID may be insufficient to induce the organogenesis of intestinal lymphoid tissues that are associated with numerous functions in vivo.

  130. Message from the New Editor-in-Chief 査読有り

    Yoshihisa Suyama

    Ecological Research　35　(1)　5　2020年1月1日

    DOI： 10.1111/1440-1703.12088 　

    ISSN：0912-3814

    eISSN：1440-1703

  131. Role of ancient lakes in genetic and phenotypic diversification of freshwater snails 査読有り

    Takahiro Hirano, Takumi Saito, Yoshihiro Tsunamoto, Joichiro Koseki, Larisa Prozorova, Van Tu Do, Keiji Matsuoka, Katsuki Nakai, Yoshihisa Suyama, Satoshi Chiba

    Molecular Ecology　28　(23)　5032-5051　2019年12月1日

    DOI： 10.1111/mec.15272 　

    ISSN：0962-1083

    eISSN：1365-294X

  132. Enigmatic incongruence between mtDNA and nDNA revealed by multi-locus phylogenomic analyses in freshwater snails 査読有り

    Takahiro Hirano, Takumi Saito, Yoshihiro Tsunamoto, Joichiro Koseki, Bin Ye, Van Tu Do, Osamu Miura, Yoshihisa Suyama, Satoshi Chiba

    Scientific Reports　9　(1)　2019年12月1日

    DOI： 10.1038/s41598-019-42682-0 　

    eISSN：2045-2322

  133. Opening the black box: microspatial patterns of zoospore dispersal, parentage, and selfing in the kelp Ecklonia cava as revealed by microsatellite markers 査読有り

    Tomoko Itou, Manami Kanno, Yoshihisa Suyama, Kazuo Inaba, Masakazu N. Aoki

    Journal of Applied Phycology　31　(5)　3283-3294　2019年10月1日

    DOI： 10.1007/s10811-019-01790-0 　

    ISSN：0921-8971

    eISSN：1573-5176

  134. Testing the effects of plant species loss on multiple ecosystem functions based on extinction scenarios 査読有り

    Yu Yoshihara, Takehiro Sasaki, Dashzeveg Nyambayar, Yu Matsuki, Yasunori Baba, Yoshihisa Suyama

    BASIC AND APPLIED ECOLOGY　38　13-22　2019年8月

    DOI： 10.1016/j.baae.2019.05.005 　

    ISSN：1439-1791

    eISSN：1618-0089

  135. Shortia brevistyla comb. et stat. nov., (Diaspensiaceae), A narrow endemic from the headwaters of the Catawba River in North Carolina, U. S. A. 査読有り

    L. L. Gaddy, T. H. Carter, B. Ely, S. Sakaguchi, A. Matsuo, Y. Suyama

    Phytologia　101　(2)　101-107　2019年6月

  136. Seedling Selection Using Molecular Approach for Ex Situ Conservation of Critically Endangered Tree Species (Vatica bantamensis (Hassk.) Benth. &amp; Hook. ex Miq.) in Java, Indonesia 査読有り

    Yayan Wahyu C. Kusuma, Siti R. Ariati, Rosniati A. Risna, Chika Mitsuyuki, Yoshihisa Suyama, Yuji Isagi

    Tropical Conservation Science　12　2019年5月1日

    DOI： 10.1177/1940082919849506 　

    eISSN：1940-0829

  137. Distinct phylogeographic structure of the halophyte Suaeda malacosperma (Chenopodiaceae/Amaranthaceae), endemic to Korea–Japan region, influenced by historical range shift dynamics 査読有り

    Jong-Soo Park, Koji Takayama, Yoshihisa Suyama, Byoung-Hee Choi

    Plant Systematics and Evolution　305　(3)　193-203　2019年3月1日

    DOI： 10.1007/s00606-018-1562-8 　

    ISSN：0378-2697

    eISSN：1615-6110

  138. The integration and application of genomic information in mangrove conservation 査読有り

    Alison K.S. Wee, Gustavo M. Mori, Catarina F. Lira, Juan Núñez-Farfán, Koji Takayama, Leanne Faulks, Suhua Shi, Yoshiaki Tsuda, Yoshihisa Suyama, Takashi Yamamoto, Takaya Iwasaki, Yukio Nagano, Zhengzhen Wang, Shin Watanabe, Tadashi Kajita

    Conservation Biology　33　(1)　206-209　2019年2月

    DOI： 10.1111/cobi.13140 　

    ISSN：0888-8892

    eISSN：1523-1739

  139. MIG-seq法を用いたシイタケ品種のDNA識別 査読有り

    松尾 歩, 廣田 峻, 宮崎 和弘, 木下 晃彦, 福井 陸夫, 倉島 治, 伊藤 元己, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　600-600　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_600 　

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    <p> 我が国の主要食用きのこであるシイタケ（Lentinula edodes）では、近年国内品種の育成者権を侵害する疑義のある事例がしばしば指摘され、深刻な問題となっている。このような権利侵害を防ぐためには、品種鑑定技術による侵害事実の科学的証明が必須である。しかしながら、現状では育成者権を守るために実効力のある迅速で安価な鑑定技術がなく、このままでは莫大な金額に相当する育成者権侵害の危険性が危惧されている。そこで本研究では、次世代シーケンサーを用いたゲノムワイドDNA塩基配列分析（MIG-seq）を用いることにより、実効性のある新たな品種識別技術の開発を目的とした。 まず予備調査用試料として、シイタケ71品種（74菌株）を対象にDNAを抽出してMIG-seq分析を行った。その結果、全74菌株から合計1406の一塩基変異（SNV）が得られた。また、品種間には相当数のSNVが安定して検出され、この技術によって品種の識別が可能であると考えられた。今後は、日本産シイタケ品種のSNV情報を網羅的に収集してデータベースを構築し、より簡便・安価・正確なDNA品種識別技術を確立する予定である。</p>

  140. 佐渡島と本州におけるヤマアカガエルの遺伝的分化の検証 査読有り

    小池 南, 松尾 歩, 廣田 峻, 岸田 治, 陶山 佳久, 阿部 晴恵

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　424-424　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_424 　

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    <p>佐渡島はサドガエル等の固有種が生息する生物学上貴重な島である。一方、その生態系を構成する生物の遺伝的多様性や固有性については、調べられてない種も多い。こうした孤立集団は、遺伝的に脆弱な可能性があるだけでなく、外来の捕食者等に対する防衛能力も脆弱な可能性が高いと考えられる。したがって、このような島内在来種・集団について、その遺伝的多様性・固有性と島外からの外来種の影響を調べることが、保全対策上重要である。そこで本研究では、佐渡島のヤマアカガエルを対象とし、本州のヤマアカガエルと遺伝的多様性を比較し、それらの遺伝的分化について調べた。材料として佐渡島9地点と本州14地点から採取した、合計23サンプルを用い、SSRマーカー11座の遺伝解析を行った。その結果、佐渡島のヤマアカガエルは本州よりも遺伝的多様性が低いことが分かった。また、遺伝的集団構造解析や、系統関係解析の結果、佐渡島のヤマアカガエルは本州のものと別グレードを構成し、遺伝的に分化していることが示された。今後は、島外からの外来種として、数十年前に佐渡に移入されたヒキガエルの影響が懸念されるため、近年における集団動態について解析する予定である。</p>

  141. 島嶼環境においてヒメネズミはオニグルミを採食するのか？ 査読有り

    小林 郁奈, 松尾 歩, 廣田 峻, 陶山 佳久, 阿部 晴恵

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　425-425　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_425 　

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    <p>堅い殻に包まれたオニグルミ種子は、一般にアカネズミには採食されるが、より小型のヒメネズミには採食されない。しかし、アカネズミの分布しない新潟県粟島ではオニグルミ種子がヒメネズミに採食されると言われている（林ら、私信）。私たちの予備的観察では、佐渡島や粟島で小型のオニグルミ核果が多く観察されたため、オニグルミとヒメネズミの共進化が起こっているのではないかと予測した。そこで本研究では、島嶼3集団（粟島、佐渡島、金華山）および本州の7集団でオニグルミ核果を採取してサイズを計測し、さらに各集団から採取したオニグルミ計80個体を対象として、MIG-seq法を用いた集団遺伝学的解析を行うことで、島嶼と本州間での遺伝的分化と核果サイズ変異との関係を調査した。その結果、島嶼ではオニグルミの核果サイズが多様で、本州集団と比較すると小型だった。一方で島嶼と本州のオニグルミは遺伝的に分化しておらず、核果サイズ変異と遺伝的変異との関係は確認できなかった。また、野外にセンサーカメラを設置しヒメネズミがオニグルミ核果を持ち去るかどうかを撮影したところ、粟島では持ち去りが確認されたが、佐渡島では確認できなかった。</p>

  142. ツバキ節を中心とする形態比較およびＭＩＧ－ｓｅｑを用いた分子系統解析 査読有り

    片山 瑠衣, 松尾 歩, 廣田 峻, 陶山 佳久, 阿部 晴恵

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　277-277　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_277 　

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    <p>日本に自生するヤブツバキ（Camellia japonica）とユキツバキ（C. rusticana）は、ツバキ属ツバキ節（sect. Camellia）に属する。ヤブツバキは赤く大きな花弁を持つ鳥媒介植物であり、ユキツバキの花弁色や大きさは同様に鳥媒シンドロームに属するものである。しかし、先行研究によると、ユキツバキは昆虫が主要な花粉媒介者であることが報告されている。また、これらの在来種と比較して、アジア大陸に自生するツバキ属は、色や大きさにおいて、より多様な花形態を示す。これらの背景から、ツバキ節における系統解析は、花の進化過程の解明に大きく貢献できると考えられる。そこで本研究では、選択圧が大きく影響すると考えられる花形態に着目し、花形態の比較およびMIG-seq法を用いた分子系統解析を行うことで、日本産ツバキ節の種分化の要因と系統的な位置づけを探ることを目的とした。花形態の比較では、東アジアから東南アジアにかけて自生するCamellia属のうち、27種を対象に各3花ずつ採取して花形態の測定および解析を行った。その結果、花形態は節ごとに異なった傾向を示した。この結果をMIG-seqを用いた分子系統解析と合わせて考察する予定である。</p>

  143. MIG-seq分析による宮城県産スギ精英樹クローン間の遺伝的関係解析 査読有り

    小沼 拓矢, 河部 恭子, 山崎 修宜, 今野 幸則, 松尾 歩, 廣田 峻, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　282-282　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_282 　

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    <p> スギは我が国の主要造林樹種であり、その種苗は主に精英樹クローンにより構成される採種園において生産されている。一方、我が国に現存するスギの天然林には主に4系統（東北北端・日本海側・太平洋側・屋久島）あることが知られている。しかし、各精英樹とこれら地域系統の関係や、各精英樹クローン間の遺伝的関係については十分に整理されていない。そこで本研究では、宮城県林業技術総合センターに植栽されている宮城県産スギ精英樹クローンを対象として、全国のスギ天然林系統と合わせて遺伝的関係の解析を行うこととした。 材料として、全国の天然スギ23集団から得られた313個体と、宮城県産スギ精英樹クローン160個体の計473個体を対象とした。これらのDNAサンプルを用い、ゲノムワイドSNP分析（MIG-seq）を行なった。 その結果、合計2151のSNPの情報が得られ、宮城県産スギ精英樹各クローンについて、スギ天然林地域系統との関係を明らかにした。また、「同名異木・異名同木」として扱われているケースも判明した。 このような遺伝的情報は、各精英樹の基本的情報として有用なだけでなく、採種園の材料管理等に活かすことができる。</p>

  144. 森林遺伝育種学的研究におけるMIG-seq 法の利用 査読有り

    陶山 佳久

    森林遺伝育種　8　(2)　85-89　2019年

    出版者・発行元： 森林遺伝育種学会

    DOI： 10.32135/fgtb.8.2_85 　

    ISSN：2187-3453

  145. Multiplexed ISSR genotyping by sequencing distinguishes two precious coral species (Anthozoa: Octocorallia: Coralliidae) that share a mitochondrial haplotype 査読有り

    Kenji Takata, Hiroki Taninaka, Masanori Nonaka, Fumihito Iwase, Taisei Kikuchi, Yoshihisa Suyama, Satoshi Nagai, Nina Yasuda

    PeerJ　2019　(10)　2019年

    DOI： 10.7717/peerj.7769 　

    eISSN：2167-8359

  146. Pretreatment of lignocellulosic biomass with cattle rumen fluid for methane production: Fate of added rumen microbes and indigenous microbes of methane seed sludge 査読有り

    Yasunori Baba, Yu Matsuki, Shuhei Takizawa, Yoshihisa Suyama, Chika Tada, Yasuhiro Fukuda, Masanori Saito, Yutaka Nakai

    Microbes and Environments　34　(4)　421-428　2019年

    DOI： 10.1264/jsme2.ME19113 　

    ISSN：1342-6311

    eISSN：1347-4405

  147. Molecular and cytological evidences denied the immediate-hybrid hypothesis for saxifraga yuparensis (Sect. bronchiales, saxifragaceae) endemic to mt. yubari in Hokkaido, northern Japan 査読有り

    Saya Tamura, Tomoko Fukuda, Elena A. Pimenova, Ekaterina A. Petrunenko, Pavel V. Krestov, Svetlana N. Bondarchuk, Olga A. Chernyagina, Yoshihisa Suyama, Yoshihiro Tsunamoto, Ayumu Matsuo, Hayato Tsuboi, Hideki Takahashi, K. E.N. Sato, Yoko Nishikawa, Takashi Shimamura, Hiroko Fujita, K. O.H. Nakamura

    Phytotaxa　373　(1)　53-70　2018年10月23日

    DOI： 10.11646/phytotaxa.373.1.2 　

    ISSN：1179-3155

    eISSN：1179-3163

  148. Integrated evidence reveals a new species in the ancient blue coral genus Heliopora (Octocorallia). 査読有り

    Richards ZT, Yasuda N, Kikuchi T, Foster T, Mitsuyuki C, Stat M, Suyama Y, Wilson NG

    Scientific reports　8　(1)　15875　2018年10月

    DOI： 10.1038/s41598-018-32969-z 　

    ISSN：2045-2322

  149. ダイズの生産性の向上を目指した無限伸育型と有限伸育型の混植栽培 第三報 葉面積垂直分布の非破壊的簡易推定 査読有り

    川村一成, 斎藤大暉, 定池歩美, 本間香貴, 中嶋孝幸, 陶山佳久, 伊藤豊彰

    日本作物学会第246回講演会要旨集　107-107　2018年9月

  150. ダイズの生産性の向上を目指した無限伸育型と有限伸育型の混植栽培 第二報 子実重/葉面積比に与える影響 査読有り

    斎藤大暉, 小川桃子, 川村一成, 定池歩美, 本間香貴, 中嶋孝幸, 伊藤豊彰, 陶山佳久

    日本作物学会第246回講演会要旨集　28-28　2018年9月

  151. Species Identification of Pinus Pollen Found in Belukha Glacier, Russian Altai Mountains, Using a Whole-Genome Amplification Method 査読有り

    Nakazawa Fumio, Suyama Yoshihisa, Imura Satoshi, Motoyama Hideaki

    FORESTS　9　(8)　2018年8月

    DOI： 10.3390/f9080444 　

    ISSN：1999-4907

  152. Development of microsatellite markers for the endangered orchid Calanthe izu-insularis (Orchidaceae). 査読有り

    Naoyuki Nakahama, Azusa Ito, Shingo Kaneko, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Azusa Hayano, Miho Murayama, Yuji Isagi

    Genes & genetic systems　93　(1)　31-35　2018年7月13日

    DOI： 10.1266/ggs.17-00021 　

    ISSN：1341-7568

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    Microsatellite markers were developed for the endangered orchid Calanthe izu-insularis (Orchidaceae). This species is unique to the Izu Islands in Japan. Unfortunately, its population size has decreased because of excessive collection for horticultural purposes. In addition, although natural hybridization between C. izu-insularis and C. discolor var. discolor has been reported, morphological differences between C. izu-insularis and the hybridized individuals remain unclear. Using next-generation sequencing, 11 polymorphic microsatellite markers were developed. All developed markers could amplify C. aristulifera and nine markers could amplify C. d. var. discolor, two other orchid species that are also endangered in Japan. The number of alleles and expected heterozygosity at each locus were 1-6 (mean, 2.35) and 0.00-0.79 (mean, 0.30), respectively. These microsatellite markers will help conservation geneticists in their investigation of the proportion of pure C. izu-insularis individuals in the Izu Islands.

  153. Considering evolutionary processes in cycad conservation: identification of evolutionarily significant units within Dioon sonorense (Zamiaceae) in northwestern Mexico 査読有り

    José Said Gutiérrez-Ortega, Karen Jiménez-Cedillo, Miguel Angel Pérez-Farrera, Andrew P. Vovides, José F. Martínez, Francisco Molina-Freaner, Ryosuke Imai, Yoshiaki Tsuda, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Yasuyuki Watano, Tadashi Kajita

    Conservation Genetics　19　(5)　1-13　2018年5月26日

    DOI： 10.1007/s10592-018-1079-2 　

    ISSN：1572-9737 1566-0621

    eISSN：1572-9737

  154. Development of immune and microbial environments is independently regulated in the mammary gland 査読有り

    K. Niimi, K. Usami, Y. Fujita, M. Abe, M. Furukawa, Y. Suyama, Y. Sakai, M. Kamioka, N. Shibata, E. J. Park, S. Sato, H. Kiyono, H. Yoneyama, H. Kitazawa, K. Watanabe, T. Nochi, H. Aso

    Mucosal Immunology　11　(3)　643-653　2018年5月1日

    出版者・発行元： Nature Publishing Group

    DOI： 10.1038/mi.2017.90 　

    ISSN：1935-3456 1933-0219

    eISSN：1935-3456

  155. Phylogeographic analysis suggests two origins for the riparian azalea Rhododendron indicum (L.) Sweet 査読有り

    Watanabe Yoichi, Izumi Kawamata, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Koichi Uehara, Motomi Ito

    Heredity　121　(6)　1-11　2018年2月26日

    出版者・発行元： Nature Publishing Group

    DOI： 10.1038/s41437-018-0064-3 　

    ISSN：1365-2540 0018-067X

  156. The phylogeography of the cycad genus Dioon (Zamiaceae) clarifies its Cenozoic expansion and diversification in the Mexican transition zone 査読有り

    José Said Gutiérrez-Ortega, María Magdalena Salinas-Rodr-Guez, José Martínez, Francisco Molina-Freaner, Miguel Angel Pérez-Farrera, Andrew P. Vovides, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Takeshi A. Ohsawa, Yasuyuki Watano, Tadashi Kajita

    Annals of Botany　121　(3)　535-548　2018年2月16日

    出版者・発行元： Oxford University Press

    DOI： 10.1093/aob/mcx165 　

    ISSN：1095-8290 0305-7364

  157. A taxonomic study of Quercus langbianensis complex based on morphology and DNA barcodes of classic and next generation sequences 査読有り

    Hoang Thi Binh, Nguyen Van Ngoc, Shuichiro Tagane, Hironori Toyama, Keiko Mase, Chika Mitsuyuki, Joeri Sergej Strijk, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    PhytoKeys　(95)　37-70　2018年2月7日

    出版者・発行元： Pensoft Publishers

    DOI： 10.3897/phytokeys.95.21126 　

    ISSN：1314-2003 1314-2011

  158. 類似分布を有する近縁ツツジ属2種の対照的な個体群動態史

    渡辺 洋一, 小野 悦生, 綱本 良啓, 陶山 佳久, 上原 浩一

    日本森林学会大会発表データベース　129　(0)　576-576　2018年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.129.0_576 　

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    <p>近年の比較系統地理学における興味の１つは、過去の第四紀気候変動に伴う分布変遷史の群集レベルでの類似性は各種の遺伝的変異に保存されているかという点である。温帯地域での化石記録と遺伝解析を併せた研究から、各地域で多くの種は似たような分布変遷を経験し、それが遺伝的変異に反映されている可能性が提示されている。ただし、必ずしもすべての種で共通した傾向が認められてはおらず、この議論は終結していない。そこで本研究では、分布域が大きく重複しており、生活史特性の類似性も高いツツジ属2種（ツクシアケボノツツジ、シロヤシオ）を対象として、種内遺伝的構造とその進化史を明らかにした。葉緑体DNA非コード4領域の塩基配列とMIG-seq法により取得したゲノムワイドSNPsを用いて遺伝解析を行った結果、ツクシアケボノツツジでは11葉緑体DNAハプロタイプ、シロヤシオでは3ハプロタイプを認識した。ツクシアケボノツツジでは葉緑体・核ともに集団間分化が著しく、シロヤシオでは集団間分化があまり明瞭ではない傾向が確認された。発表では、これら2種の種内変異の違いとそれを形成した歴史的過程を進化年代・個体群動態の両面から明らかにする。</p>

  159. A new species and two new records of Quercus (Fagaceae) from northern Vietnam 査読有り

    Hoang Thi Binh, Nguyen Van Ngoc, Trinh Ngoc Bon, Shuichiro Tagane, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    PhytoKeys　92　(92)　1-15　2018年

    出版者・発行元： Pensoft Publishers

    DOI： 10.3897/phytokeys.92.21831 　

    ISSN：1314-2003 1314-2011

  160. Ancient plant DNA in lake sediments 査読有り

    Laura Parducci, Keith D. Bennett, Gentile Francesco Ficetola, Inger Greve Alsos, Yoshihisa Suyama, Jamie R. Wood, Mikkel Winther Pedersen

    NEW PHYTOLOGIST　214　(3)　924-942　2017年5月

    DOI： 10.1111/nph.14470 　

    ISSN：0028-646X

    eISSN：1469-8137

  161. Pretreatment of lignocellulosic biomass by cattle rumen fluid for methane production: Bacterial flora and enzyme activity analysis 査読有り

    Yasunori Baba, Yu Matsuki, Yumi Mori, Yoshihisa Suyama, Chika Tada, Yasuhiro Fukuda, Masanori Saito, Yutaka Nakai

    JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING　123　(4)　489-496　2017年4月

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.11.008 　

    ISSN：1389-1723

    eISSN：1347-4421

  162. Population and genetic status of a critically endangered species in Korea: Hydrangea luteovenosa (Hydrangeaceae) 査読有り

    Hyeok-Jae Choi, Takuya Ito, Masashi Yokogawa, Shingo Kaneko, Yoshihisa Suyama, Yuji Isagi

    Korean Journal of Plant Taxonomy　47　(1)　1-5　2017年3月

    出版者・発行元： The Korean Society of Plant Taxonomists

    DOI： 10.11110/kjpt.2017.47.1.1 　

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    国際共著論文

  163. Inconsistency between morphological traits and ancestry of individuals in the hybrid zone between two Rhododendron japonoheptamerum varieties revealed by a genotyping-by-sequencing approach 査読有り

    Ichiro Tamaki, Watanabe Yoichi, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Mizuo Mizuno

    TREE GENETICS & GENOMES　13　(1)　4　2017年2月

    DOI： 10.1007/s11295-016-1084-x 　

    ISSN：1614-2942

    eISSN：1614-2950

  164. MIG−seq法による熱帯林樹木の保全遺伝学的研究

    満行 知花, 綱本 良啓, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　128　(0)　699-699　2017年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.128.0_699 　

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    <p>MIG-seq法は、NGSを使ってゲノムワイドな配列情報を取得するPCRベースの新たな手法であり、これまで主に同一種内を対象としたSNP情報による集団・個体識別等の解析に使われてきた。しかしMIG-seq法の適用範囲はさらに広く、増幅された配列（座）の共有情報を利用すれば、多種間の種間関係解析を行うことができる。本講演ではこのような解析例として、東南アジア産シロダモ属81サンプル（既知種17、未記載種35）を対象とした系統分類学的研究を紹介する。この解析では、MiSeqを用いた 1ランのみで配列情報を取得し、得られた11,809の共有配列の有無情報を用いて近隣結合法によって分岐図を作成した。その結果、形態およびITSの塩基配列情報から部分的に推定されていた類縁関係によく合致する種間関係が示され、未記載種の位置付けも明らかになった。本講演では、その他にMIG-seqデータを用いたクローン識別、集団間の遺伝的分化や集団動態推定、雑種識別等についても紹介する。MIG-seq法では、幅広い対象の解析に同じ手法（マーカー）で対応することが可能であり、今後の森林保全遺伝学研究への応用が期待される。</p>

  165. Differential responses and mechanisms of productivity following experimental species loss scenarios 査読有り

    Takehiro Sasaki, Yu Yoshihara, Masaya Takahashi, Lkhagvasuren Byambatsetseg, Risa Futahashi, Dashzeveg Nyambayar, Yoshihisa Suyama

    OECOLOGIA　183　(3)　785-795　2017年

    DOI： 10.1007/s00442-016-3806-z 　

    ISSN：0029-8549

    eISSN：1432-1939

  166. 自家不和合性の樹木クリにおける開花フェノロジー：二重雌雄異熟性（duodichogamy） 査読有り

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    日本生態学会誌　67　(1)　31-39　2017年

    出版者・発行元：

    DOI： 10.18960/seitai.67.1_31 　

    ISSN：0021-5007

  167. Inferences of population structure and demographic history for Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequencing analysis 査読有り

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Kousuke Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    AMERICAN JOURNAL OF BOTANY　103　(11)　1937-1949　2016年11月

    DOI： 10.3732/ajb.1600046 　

    ISSN：0002-9122

    eISSN：1537-2197

  168. Lack of genetic variation prevents adaptation at the geographic range margin in a damselfly 査読有り

    Yuma Takahashi, Yoshihisa Suyama, Yu Matsuki, Ryo Funayama, Keiko Nakayama, Masakado Kawata

    MOLECULAR ECOLOGY　25　(18)　4450-4460　2016年9月

    DOI： 10.1111/mec.13782 　

    ISSN：0962-1083

    eISSN：1365-294X

  169. Extremely low genetic diversity of the northern limit populations of Nypa fruticans (Arecaceae) on Iriomote Island, Japan 査読有り

    Kyoko Sugai, Shin Watanabe, Taiki Kuishi, Shinya Imura, Keiichi Ishigaki, Masatsugu Yokota, Shinichi Yanagawa, Yoshihisa Suyama

    CONSERVATION GENETICS　17　(1)　221-228　2016年2月

    DOI： 10.1007/s10592-015-0773-6 　

    ISSN：1566-0621

    eISSN：1572-9737

  170. ホンシャクナゲとキョウマルシャクナゲの交雑起源集団における花形態の標高クライン

    玉木 一郎, 渡辺 洋一, 松木 悠, 陶山 佳久, 水野 瑞夫

    日本森林学会大会発表データベース　127　762-762　2016年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.127.0_762 　

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    ホンシャクナゲとキョウマルシャクナゲの2変種は形態的に類似するが，花の数性が明確に異なり，それぞれ7と5数性を示す。本研究では2種とこれらの中間的な個体が標高的に連続して生育する集団（乙女渓谷）で，花形態の標高分布と各個体の遺伝的背景から集団の成立過程を明らかにすることを目的とした。数性は標高と有意な負の相関を示し，標高が高くなるにつれ，ホンシャクナゲからキョウマルシャクナゲに変化する形態クラインが見られた。乙女渓谷に加え，2種の参照集団を含めた3集団でMIG-seqを行い，75 SNPを決定した。Admixture解析の結果，最適クラスター数（K）は2または3を示し，K=2の場合，参照集団の2種は明確に区別され，乙女渓谷のほぼ全て個体は中間的なクラスター組成を示した。K=3の場合，各集団は個別のクラスター組成を示した。乙女渓谷の集団は高い固有SNP数を示した。乙女渓谷の個体の花形態とK=2のクラスター組成に有意な相関は認められなかった。以上より，乙女渓谷は，現在，種間交雑が生じている集団ではなく，過去に種間交雑で成立し何世代も経て現在に至った集団であると考えられる。

  171. 落葉広葉樹クリにおける種子散布制限と尾根ごとに異なる遺伝的組成

    長谷川 陽一, 高田 克彦, 陶山 佳久, 清和 研二

    日本森林学会大会発表データベース　127　759-759　2016年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.127.0_759 　

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    樹木の遺伝的多様性は、集団内の個体間で多く見られ、一般に樹木の集団間の分化の程度は低いと言われている。しかし、遺伝子流動が制限されれば樹木であっても集団間の遺伝的分化が生じる可能性がある。そこで本研究では、地形構造が樹木の空間的遺伝構造に与える影響を検証した。6ヘクタールの調査地において、3つの谷に隔てられた3つの尾根に分布するクリを対象に、SSRマーカーを用いて成木集団と実生集団の空間的遺伝構造と、種子と花粉の散布パターンを調べた。ソフトウェアGENELANDを用いた解析によって、3つの尾根の上にパッチ状に分布する成木集団は、3つの遺伝的クラスターに別れた。また、実生集団も同様の3つのクラスターに別れたことから、遺伝構造は成木集団から実生集団へ伝搬していることが明らかになった。種子の散布は、谷を越えずクラスター内への短い散布に限られており、遺伝構造の形成に強い影響を与えていると考えられた。これらのことから、クリ天然林では、集団が谷によって隔離されると、ネズミ類によって散布される種子の移動が制限され、パッチ集団ごとの遺伝的クラスターが形成されることが示唆された。

  172. 実規模の鉛直流型人工湿地における植物栄養生長期の大型動物群集

    中村 和德, 矢野 篤男, 陶山 佳久, 西村 修, 中野 和典

    日本水処理生物学会誌　52　(3)　45-54　2016年

    出版者・発行元： 日本水処理生物学会

    DOI： 10.2521/jswtb.52.45 　

    ISSN：0910-6758

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    人工湿地での植栽が大型土壌動物群集に与える影響を明らかにするために、実規模の鉛直流型人工湿地の濾床で大型土壌動物数を調査した。調査対象は、餌資源となる有機物が最も多く堆積する一段目の濾床とし、植栽したヨシが旺盛にバイオマス量を増加している栄養生長期に行なった。植物の栄養生長期における大型土壌動物数は、無植栽区よりも植栽区で多く、人工湿地への植栽が土壌動物の多様性を高めることが確認できた。また植物の存在によって多様性に影響を受ける動物群が確認された。人工湿地には餌資源となる豊富な有機物が堆積するにも関わらず、植栽が土壌動物の多様性に大きく影響を与えた。大型ミミズは植栽区の0－10 cm層で最も個体数が多かった一方で、無植栽区では10－20 cm層で最も多く採取された。これらの結果は、植栽は大型土壌動物へ餌資源（リターなど）を供給する役割よりもむしろ急激な温度変化などの劇的な環境変化を緩和する役割の方が大きいことを示しており、廃水由来の有機物が常に供給される人工湿地においても植栽が大型土壌動物の多様性にとって重要であることが明らかとなった。

  173. High-throughput linkage mapping of Australian white cypress pine (Callitris glaucophylla) and map transferability to related species 査読有り

    Shota Sakaguchi, Takeshi Sugino, Yoshihiko Tsumura, Motomi Ito, Michael D. Crisp, David M. J. S. Bowman, Atsushi J. Nagano, Mie N. Honjo, Masaki Yasugi, Hiroshi Kudoh, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Yuji Isagi

    TREE GENETICS & GENOMES　11　(6)　121　2015年12月

    DOI： 10.1007/s11295-015-0944-0 　

    ISSN：1614-2942

    eISSN：1614-2950

  174. MIG-seq: an effective PCR-based method for genome-wide single-nucleotide polymorphism genotyping using the next-generation sequencing platform 査読有り

    Yoshihisa Suyama, Yu Matsuki

    SCIENTIFIC REPORTS　5　16963　2015年11月

    DOI： 10.1038/srep16963 　

    ISSN：2045-2322

  175. A spatially explicit model for flowering time in bamboos: long rhizomes drive the evolution of delayed flowering 査読有り

    Yuuya Tachiki, Akifumi Makita, Yoshihisa Suyama, Akiko Satake

    JOURNAL OF ECOLOGY　103　(3)　585-593　2015年5月

    DOI： 10.1111/1365-2745.12390 　

    ISSN：0022-0477

    eISSN：1365-2745

  176. Variation in Pollen-Donor Composition among Pollinators in an Entomophilous Tree Species, Castanea crenata, Revealed by Single-Pollen Genotyping 査読有り

    Yoichi Hasegawa, Yoshihisa Suyama, Kenji Seiwa

    PLOS ONE　10　(3)　e0120393　2015年3月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0120393 　

    ISSN：1932-6203

  177. Pollinator-Mediated Selection on Flower Color, Flower Scent and Flower Morphology of Hemerocallis: Evidence from Genotyping Individual Pollen Grains On the Stigma (vol 8, e85601, 2013) 査読有り

    S. K. Hirota, K. Nitta, Y. Suyama, N. Kawakubo, A. A. Yasumoto

    PLOS ONE　10　(2)　2015年2月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0117885 　

    ISSN：1932-6203

  178. 全ゲノム増幅法を用いたベルーハ氷河（アルタイ山脈・ロシア）中のマツ属花粉の種同定

    中澤 文男, 陶山 佳久, 伊村 智, 本山 秀明

    雪氷研究大会講演要旨集　2015　23-23　2015年

    出版者・発行元： 公益社団法人 日本雪氷学会／日本雪工学会

    DOI： 10.14851/jcsir.2015.0_23 　

  179. 南極雪試料中の花粉DNA分析

    中澤 文男, 陶山 佳久, 伊村 智, 本山 秀明

    雪氷研究大会講演要旨集　2015　194-194　2015年

    出版者・発行元： 公益社団法人 日本雪氷学会／日本雪工学会

    DOI： 10.14851/jcsir.2015.0_194 　

  180. Pollen dispersal efficiency of insects in C. crenata. 査読有り

    Hasegawa Y, Suyama Y, Seiwa K

    Plos One　2015年

  181. Proxy comparison in ancient peat sediments: pollen, macrofossil and plant DNA 査読有り

    Laura Parducci, Minna Valiranta, J. Sakari Salonen, Tiina Ronkainen, Irina Matetovici, Sonia L. Fontana, Tiina Eskola, Pertti Sarala, Yoshihisa Suyama

    PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES　370　(1660)　20130382　2015年1月

    DOI： 10.1098/rstb.2013.0382 　

    ISSN：0962-8436

    eISSN：1471-2970

  182. Female and male fitness consequences of clonal growth in a dwarf bamboo population with a high degree of clonal intermingling 査読有り

    Ayumi Matsuo, Hiroshi Tomimatsu, Jun-Ichirou Suzuki, Tomoyuki Saitoh, Shozo Shibata, Akifumi Makita, Yoshihisa Suyama

    ANNALS OF BOTANY　114　(5)　1035-1041　2014年10月

    DOI： 10.1093/aob/mcu176 　

    ISSN：0305-7364

    eISSN：1095-8290

  183. The distribution and population status of Quercus myrsinifolia (Fagaceae) on Korean peninsula 査読有り

    Jung-Hyun Lee, Dong-Hyuk Lee, Hyeok-Jae Choi, Yoshihisa Suyama, Toshaki kondo, Yuji Isagi, Byoung-Hee Choi

    Korean Journal of Plant Taxonomy　44　(3)　165-170　2014年9月

    DOI： 10.11110/kjpt.2014.44.3.165 　

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    国際共同研究

  184. Clonal Structure, Seed Set, and Self-Pollination Rate in Mass-Flowering Bamboo Species during Off-Year Flowering Events 査読有り

    Inoue Mizuki, Ayaka Sato, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Jun-Ichirou Suzuki, Akifumi Makita

    PLOS ONE　9　(8)　e105051　2014年8月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0105051 　

    ISSN：1932-6203

  185. Effects of genotypic diversity of Phragmites australis on primary productivity and water quality in an experimental wetland 査読有り

    Hiroshi Tomimatsu, Kazunori Nakano, Nozomi Yamamoto, Yoshihisa Suyama

    OECOLOGIA　175　(1)　163-172　2014年5月

    DOI： 10.1007/s00442-014-2896-8 　

    ISSN：0029-8549

    eISSN：1432-1939

  186. Patterns of Nucleotide Diversity at Photoperiod Related Genes in Norway Spruce [Picea abies (L.) Karst.] 査読有り

    Thomas Kallman, Stephane De Mita, Hanna Larsson, Niclas Gyllenstrand, Myriam Heuertz, Laura Parducci, Yoshihisa Suyama, Ulf Lagercrantz, Martin Lascoux

    PLOS ONE　9　(5)　e95306　2014年5月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0095306 　

    ISSN：1932-6203

  187. 地理情報システム技術を用いた歴史生物地理学的解析 査読有り

    岩崎貴也, 阪口翔太, 横山良太, 高見泰興, 大澤剛士, 池田紘士, 陶山佳久

    日本生態学会誌　64　(3)　183-199　2014年

  188. Pollinator-Mediated Selection on Flower Color, Flower Scent and Flower Morphology of Hemerocallis: Evidence from Genotyping Individual Pollen Grains On the Stigma 査読有り

    Shun K. Hirota, Kozue Nitta, Yoshihisa Suyama, Nobumitsu Kawakubo, Akiko A. Yasumoto, Tetsukazu Yahara

    PLOS ONE　8　(12)　e85601　2013年12月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0085601 　

    ISSN：1932-6203

  189. Population and genetic status of a critically endangered species in Korea, Euchresta japonica (Leguminosae), and their implications for conservation 査読有り

    Hyeok-Jae Choi, Shingo Kaneko, Masashi Yokogawa, Gwan-Pil Song, Dae-Shin Kim, Shin-Ho Kang, Yoshihisa Suyama, Yuji Isagi

    JOURNAL OF PLANT BIOLOGY　56　(4)　251-257　2013年8月

    DOI： 10.1007/s12374-013-0106-6 　

    ISSN：1226-9239

  190. Molecular- and pollen-based vegetation analysis in lake sediments from central Scandinavia 査読有り

    Laura Parducci, Irina Matetovici, Sonia L. Fontana, K. D. Bennett, Yoshihisa Suyama, James Haile, Kurt H. Kjaer, Nicolaj K. Larsen, Andreas D. Drouzas, Eske Willerslev

    MOLECULAR ECOLOGY　22　(13)　3511-3524　2013年7月

    DOI： 10.1111/mec.12298 　

    ISSN：0962-1083

    eISSN：1365-294X

  191. 津波被災地の海岸林再生に用いるタブノキの遺伝的地域性の解析

    小笠原 玄記, 高野 義智, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　124　494-494　2013年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.124.0.494.0 　

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    2011年に発生した東日本大震災により、海岸林は甚大な被害を受けた。今後津波による防潮の役割を考慮し、植林によりこのような海岸林を再度形成していくことが重要と考えられている。しかし、むやみに由来不明の苗木を植林することは、その土地に自生していた同種の遺伝的構造を撹乱してしまう恐れがあるうえ、苗木の生育不良などの可能性も示唆されている。そこで、本研究ではマイクロサテライトマーカーを用いて集団遺伝学的解析を行うことによりそれぞれの地域集団の遺伝的差異などを分析し、適切な地域区分を設定することにより、遺伝的地域性を消失させないような植林計画の策定に役立てることを目的とした。具体的には、クスノキ科タブノキ属に属する落葉高木のタブノキ（Machilus thunbergii）に注目し、1自治体の区分を1集団と定義し、宮城・岩手・福島県を中心として計22集団112個体を採取した。分析には開発された19座のマイクロサテライトマーカーのうち多型検出が可能であった7座を用い、集団遺伝学的解析を行った。その結果、現段階では明確な遺伝的地域性は検出できなかった。

  192. DNA analysis for section identification of individual Pinus pollen grains from Belukha glacier, Altai Mountains, Russia 査読有り

    Fumio Nakazawa, Jun Uetake, Yoshihisa Suyama, Ryo Kaneko, Nozomu Takeuchi, Koji Fujita, Hideaki Motoyama, Satoshi Imura, Hiroshi Kanda

    ENVIRONMENTAL RESEARCH LETTERS　8　(1)　014032　2013年1月

    DOI： 10.1088/1748-9326/8/1/014032 　

    ISSN：1748-9326

  193. DNA extraction and amplification methods for ephippial cases of Daphnia resting eggs in lake sediments: a novel approach for reconstructing zooplankton population structure from the past 査読有り

    Seiji Ishida, Hajime Ohtsuki, Tamotsu Awano, Narumi K. Tsugeki, Wataru Makino, Yoshihisa Suyama, Jotaro Urabe

    LIMNOLOGY　13　(3)　261-267　2012年12月

    DOI： 10.1007/s10201-012-0380-x 　

    ISSN：1439-8621

    eISSN：1439-863X

  194. ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF MICROSATELLITE LOCI IN A POLYPLOID ALPINE HERB, CALLIANTHEMUM MIYABEANUM (RANUNCULACEAE) 査読有り

    Harue Abe, Yoko Nishikawa, Takashi Shimamura, Ken Sato, Yoshihisa Suyama

    AMERICAN JOURNAL OF BOTANY　99　(12)　E484-E486　2012年12月

    DOI： 10.3732/ajb.1200202 　

    ISSN：0002-9122

  195. Ammonia-Oxidizing Bacteria Rather than Ammonia-Oxidizing Archaea were Widely Distributed in Animal Manure Composts from Field-Scale Facilities 査読有り

    Nozomi Yamamoto, Ryu Oishi, Yoshihisa Suyama, Chika Tada, Yutaka Nakai

    MICROBES AND ENVIRONMENTS　27　(4)　519-524　2012年12月

    DOI： 10.1264/jsme2.ME12053 　

    ISSN：1342-6311

  196. Population genetic structure of a widespread coniferous tree, Taxodium distichum [L.] Rich. (Cupressaceae), in the Mississippi River Alluvial Valley and Florida 査読有り

    Ayako Tanaka, Masato Ohtani, Yoshihisa Suyama, Nobuyuki Inomata, Yoshihiko Tsumura, Beth A. Middleton, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    TREE GENETICS & GENOMES　8　(5)　1135-1147　2012年10月

    DOI： 10.1007/s11295-012-0501-z 　

    ISSN：1614-2942

  197. 日本の絶滅危惧樹木シリーズ(40)ーゴヨウザンヨウラクー 査読有り

    陶山佳久

    林木の育種　245　(245)　20-22　2012年10月

    出版者・発行元： 林木育種協会

    ISSN：0387-9119

  198. Morph-specific mating patterns in a low-density population of a heterodichogamous tree, Juglans ailantifolia 査読有り

    Megumi K. Kimura, Susumu Goto, Yoshihisa Suyama, Masaki Matsui, Keith Woeste, Kenji Seiwa

    PLANT ECOLOGY　213　(9)　1477-1487　2012年9月

    DOI： 10.1007/s11258-012-0105-6 　

    ISSN：1385-0237

  199. Development of 12 polymorphic microsatellite DNA markers for the kelp Ecklonia cava (Phaeophyceae, Laminariales) 査読有り

    Tomoko Itou, Manami Kanno, Yoshihisa Suyama, Azusa Kamiyama, Shingo X. Sakamoto, Akihiro Kijima, Kazuo Inaba, Masakazu N. Aoki

    CONSERVATION GENETICS RESOURCES　4　(2)　459-461　2012年6月

    DOI： 10.1007/s12686-011-9574-5 　

    ISSN：1877-7252

  200. Growth of Ammonia-Oxidizing Archaea and Bacteria in Cattle Manure Compost under Various Temperatures and Ammonia Concentrations 査読有り

    Ryu Oishi, Chika Tada, Ryoki Asano, Nozomi Yamamoto, Yoshihisa Suyama, Yutaka Nakai

    MICROBIAL ECOLOGY　63　(4)　787-793　2012年5月

    DOI： 10.1007/s00248-011-9971-z 　

    ISSN：0095-3628

  201. Glacial Survival of Boreal Trees in Northern Scandinavia 査読有り

    Laura Parducci, Tina Jorgensen, Mari Mette Tollefsrud, Ellen Elverland, Torbjorn Alm, Sonia L. Fontana, K. D. Bennett, James Haile, Irina Matetovici, Yoshihisa Suyama, Mary E. Edwards, Kenneth Andersen, Morten Rasmussen, Sanne Boessenkool, Eric Coissac, Christian Brochmann, Pierre Taberlet, Michael Houmark-Nielsen, Nicolaj Krog Larsen, Ludovic Orlando, M. Thomas P. Gilbert, Kurt H. Kjaer, Inger Greve Alsos, Eske Willerslev

    SCIENCE　335　(6072)　1083-1086　2012年3月

    DOI： 10.1126/science.1216043 　

    ISSN：0036-8075

  202. Detection of parasitizing coccidia and determination of host crane species, sex and genotype by faecal DNA analysis 査読有り

    H. Honma, Y. Suyama, Y. Nakai

    MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES　11　(6)　1033-1044　2011年11月

    DOI： 10.1111/j.1755-0998.2011.03048.x 　

    ISSN：1755-098X

  203. Accurate analysis of prevalence of coccidiosis in individually identified wild cranes in inhabiting and migrating populations in Japan 査読有り

    Hajime Honma, Yoshihisa Suyama, Yuki Watanabe, Fumio Matsumoto, Yutaka Nakai

    ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　13　(11)　2876-2887　2011年11月

    DOI： 10.1111/j.1462-2920.2011.02563.x 　

    ISSN：1462-2912

  204. Clipping stimulates productivity but not diversity in improved and semi-natural pastures in temperate Japan 査読有り

    Takehiro Sasaki, Yu Yoshihara, Yoshihisa Suyama, Tohru Nakashizuka

    AGRICULTURE ECOSYSTEMS & ENVIRONMENT　142　(3-4)　428-431　2011年8月

    DOI： 10.1016/j.agee.2011.06.009 　

    ISSN：0167-8809

  205. Isolation and characterization of microsatellite loci for Menziesia goyozanensis, an endangered shrub species endemic to Mt. Goyo in northern Japan 査読有り

    Harue Abe, Masayuki Maki, Sachiko Horie, Yoshihisa Suyama

    CONSERVATION GENETICS RESOURCES　3　(3)　569-571　2011年7月

    DOI： 10.1007/s12686-011-9406-7 　

    ISSN：1877-7252

  206. 落葉広葉樹クリの送受粉システム：雌花上の花粉組成と母樹による花粉選択 査読有り

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    林木の育種　(240)　12-21　2011年7月

  207. Procedure for Single-Pollen Genotyping 査読有り

    Yoshihisa Suyama

    SINGLE-POLLEN GENOTYPING　7-15　2011年

    DOI： 10.1007/978-4-431-53901-8_2 　

  208. Difference in Pollen Donor Composition During the Early Phases of Reproduction as Revealed by DNA Analysis of Pollen Grains and Seeds in the Monoecious Tree Castanea crenata 査読有り

    Yoichi Hasegawa, Yoshihisa Suyama, Kenji Seiwa

    SINGLE-POLLEN GENOTYPING　33-+　2011年

    DOI： 10.1007/978-4-431-53901-8_4 　

  209. Cryptosporidium genotypes and subtypes in dairy calves in Egypt (vol 169, pg 382, 2010) 査読有り

    Said Amer, Hajime Honma, Makoto Ikarashi, Chika Tada, Yasuhiro Fukuda, Yoshihisa Suyama, Yutaka Nakai

    VETERINARY PARASITOLOGY　172　(3-4)　361-361　2010年9月

    DOI： 10.1016/j.vetpar.2010.05.021 　

    ISSN：0304-4017

    eISSN：1873-2550

  210. Differences in transpiration characteristics of Japanese beech trees, Fagus crenata, in Japan 査読有り

    Makiko Tateishi, TomO'Omi Kumagai, Yoshihisa Suyama, Tsutom Hiura

    TREE PHYSIOLOGY　30　(6)　748-760　2010年6月

    DOI： 10.1093/treephys/tpq023 　

    ISSN：0829-318X

  211. Cryptosporidium genotypes and subtypes in dairy calves in Egypt 査読有り

    Said Amer, Hajime Honma, Makoto Ikarashi, Chika Tada, Yasuhiro Fukuda, Yoshihisa Suyama, Yutaka Nakai

    VETERINARY PARASITOLOGY　169　(3-4)　382-386　2010年5月

    DOI： 10.1016/j.vetpar.2010.01.017 　

    ISSN：0304-4017

    eISSN：1873-2550

  212. Comparison of direct and indirect genetic methods for estimating seed and pollen dispersal in Fagus sylvatica and Fagus crenata 査読有り

    Sylvie Oddou-Muratorio, Aurore Bontemps, Etienne K. Klein, Igor Chybicki, Giovanni G. Vendramin, Yoshihisa Suyama

    FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT　259　(11)　2151-2159　2010年5月

    DOI： 10.1016/j.foreco.2010.03.001 　

    ISSN：0378-1127

  213. The Relationship between Reproductive Success and Clonal Structure in a Simultaneous Flowering Population of the Monocarpic Dwarf Bamboo, Sasa veitchii var. hirsuta 査読有り

    MATSUO A, SUYAMA Y, SHIBATA S, MAKITA A

    Tohoku J Agric Res　60　(3-4)　156　2010年3月25日

  214. タケ・ササ類の一斉開花に関する一考察 査読有り

    陶山佳久, 鈴木準一郎, 蒔田明史

    日本生態学会誌　60　(1)　97-106　2010年3月

    DOI： 10.18960/seitai.60.1_97 　

  215. Bamboo-その不思議な生活史 査読有り

    蒔田明史, 鈴木準一郎, 陶山佳久

    日本生態学会誌　60　(1)　45-50　2010年3月

  216. Molecular analysis of Cryptosporidium parvum HNJ-1 isolated in Japan. 査読有り

    Said Amer, Honma H, Ikarashi M, Tada C, Fukuda Y, Suyama Y, Nakai Y

    J. Vet. Med. Sci　72　(12)　1647-1649　2010年

    出版者・発行元： JAPANESE SOCIETY OF VETERINARY SCIENCE

    DOI： 10.1292/jvms.10-0118 　

    ISSN：0916-7250

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    Cryptosporidium parvum HNJ-1 is widely used as a reference strain in Japan. In the present study, the parasite was subjected for further molecular analysis including transcribed ribosomal region (ITS rRNA), dihydrofolate reductase (DHFR) and surface glycoprotein (GP60) genes. Partial sequence analysis of these genes indicated extensive polymorphism in ITS region compared with relevant sequences of other Cryptosporidium parvum isolates. In addition, this strain was identified as C. parvum IIaA15G2R1 subtype, based on the sequence results of GP60 gene locus.<br>

  217. <企画趣旨>Bamboo-その不思議な生活史(<特集>Bambooはなぜ一斉開花するのか?～熱帯から温帯へのクローナル特性と開花更新習性の進化を探る～)

    蒔田 明史, 鈴木 準一郎, 陶山 佳久

    日本生態学会誌　60　(1)　45-50　2010年

    出版者・発行元： 一般社団法人 日本生態学会

    ISSN：0021-5007

  218. チュウゴクザサとチシマザサにおける地下茎の分枝・伸長様式とジェネットの空間分布構造(<特集>Bambooはなぜ一斉開花するのか?～熱帯から温帯へのクローナル特性と開花更新習性の進化を探る～) 査読有り

    松尾 歩, 陶山 佳久, 蒔田 明史

    日本生態学会誌　60　(1)　81-88　2010年

    出版者・発行元： 日本生態学会暫定事務局

    DOI： 10.18960/seitai.60.1_81 　

    ISSN：0021-5007

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    長期にわたって栄養成長を続けるタケ・ササ類の地下茎の分枝・伸長様式は、稈やジェネットの空間分布構造を決定づけ、有性生殖時の交配様式や遺伝的多様性の維持に大きな影響を与える重要な形質であると考えられる。そこで、表土剥ぎ取り調査とDNA分析によって、地下茎の分枝・伸長様式とジェネットの空間分布構造を明らかにした例として、(1)2007年に一斉開花したチュウゴクザサ(Sasa veitchii var.hirsuta)個体群と、(2)秋田県十和田湖南岸域で1995年の一斉開花時に開花せずにパッチ状に残されたチシマザサ(Sasa kurilensis)個体群を対象として行った研究成果を報告する。調査の結果、チュウゴクザサは単軸型地下茎による分枝・伸長様式によって、ジェネットが混在する空間分布構造を形成していることが確認された。一方、チシマザサは単軸型と連軸型の地下茎をもつ混合型の分枝・伸長様式によって、広範囲にわたって特定のジェネットが空間を独占する分布構造を形成していることが確認された。このように、それぞれの種が異なる地下茎の分枝・伸長様式に従った栄養成長を行うことによって、それぞれ異なるジェネットの空間分布構造が形成されたと考えた。

  219. Recent research topics in ecological and genetic approaches for sustainable forest management 査読有り

    Seiwa, K, Suyama, Y

    Tohoku Journal of Agricultural Research　60　(1-2)　59-62　2009年12月15日

    出版者・発行元： Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University

    ISSN：0040-8719

  220. Development of microsatellite markers for the dwarf bamboo species Sasa cernua and Sasa kurilensis (Poaceae) in northern Japan 査読有り

    Keiko Kitamura, Tomoyuki Saitoh, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama

    MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES　9　(6)　1470-1472　2009年11月

    DOI： 10.1111/j.1755-0998.2009.02675.x 　

    ISSN：1755-098X

  221. 48年周期で一斉開花するタケ：インド・ミゾラム州におけるMelocanna bacciferaの開花周期記録 招待有り 査読有り

    陶山佳久, 齋藤智之, 西脇亜也, 蒔田明史, 長谷川尚史, 柴田昌三

    時間生物学　15　(2)　12-16　2009年10月31日

  222. Distribution of Genets of Perenniporia subacida in Stands of Chamaecyparis obtusa (Japanese Cypress) Determined by AFLP Fingerprints and Somatic Incompatibility 査読有り

    Masanobu Tabata, Yoshihisa Suyama, Yasuhisa Abe

    PLANT DISEASE　93　(8)　826-831　2009年8月

    DOI： 10.1094/PDIS-93-8-0826 　

    ISSN：0191-2917

    eISSN：1943-7692

  223. DNA analysis of a single Pinus pollen grain in a glacier 査読有り

    Fumio Nakazawa, Jun Uetake, Hiroshi Kanda, Yoshihisa Suyama, Nozomu Takeuchi, Koji Fujita

    Summaries of JSSI and JSSE Joint Conference on Snow and Ice Research　2009　127　2009年

    DOI： 10.14851/jcsir.2009.0.127.0 　

    ISSN：1883-0889 1883-0870

  224. ササの部分開花は単一ジェネットの開花か？:～部分開花地における開花・非開花稈のジェネット識別～ 査読有り

    松尾 歩, 品川 朋仁, 佐藤 朋華, 陶山 佳久, 蒔田 明史

    日本森林学会大会発表データベース　120　(0)　790-790　2009年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.120.0.790.0 　

  225. Pollen donor composition during the early phases of reproduction revealed by DNA genotyping of pollen grains and seeds of Castanea crenata 査読有り

    Yoichi Hasegawa, Yoshihisa Suyama, Kenji Seiwa

    NEW PHYTOLOGIST　182　(4)　994-1002　2009年

    DOI： 10.1111/j.1469-8137.2009.02806.x 　

    ISSN：0028-646X

  226. Bacterial populations in epilithic biofilms along two oligotrophic rivers in the Tohoku region in Japan 査読有り

    Hajime Honma, Ryoki Asano, Masahiko Obara, Kenichi Otawa, Yoshihisa Suyama, Yutaka Nakai

    Journal of General and Applied Microbiology　55　(5)　359-371　2009年

    DOI： 10.2323/jgam.55.359 　

    ISSN：0022-1260 1349-8037

  227. Airborne-pollen pool and mating pattern in a hybrid zone between Pinus pumila and P-parviflora var. pentaphylla 査読有り

    Megumi Ito, Yoshihisa Suyama, Takeshi A. Ohsawa, Yasuyuki Watano

    MOLECULAR ECOLOGY　17　(23)　5092-5103　2008年12月

    DOI： 10.1111/j.1365-294X.2008.03966.x 　

    ISSN：0962-1083

  228. Effect of local stand density on reproductive processes of the sub-boreal conifer Picea jezoensis Carr. (Pinaceae) 査読有り

    Motoshi Tomita, Hideyuki Saito, Yoshihisa Suyama

    FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT　256　(6)　1350-1355　2008年9月

    DOI： 10.1016/j.foreco.2008.06.037 　

    ISSN：0378-1127

  229. Gene flow, genetic structure and conservation genetics of Fagus crenata

    Yoshihisa Suyama

    Proceedings: The 8th IUFRO International Beech Symposium　43-45　2008年9月

  230. Analysis of short DNA fragments from Holocene peatmoss samples 査読有り

    Y. Suyama, U. Gunnarsson, L. Parducci

    HOLOCENE　18　(6)　1003-1006　2008年9月

    DOI： 10.1177/0959683608093540 　

    ISSN：0959-6836

  231. 海岸砂防用広葉樹の選抜と更新技術に関する研究．－海岸林造成に使用された苗木の産地と造成に用いられたカシワのフェノロジー－

    田村浩喜, 陶山佳久

    秋田県農林水産技術センター森林技術センター研究報告　(18)　84-93　2008年6月

    出版者・発行元： 秋田県農林水産技術センター森林技術センター

    ISSN：1881-5502

  232. DNA分析によって検出されたチシマザサの大ジェネット 査読有り

    松尾歩, 陶山佳久, 山月融心, 藤晋一, 蒔田明史

    Bamboo Journal　25　64-73　2008年3月31日

  233. 一斉開花したチュウゴクザサ群落におけるクローン構造と繁殖努力

    松尾 歩, 西脇 亜也, 鈴木 準一郎, 蒔田 明史, 陶山 佳久, 住吉 千夏子, 井鷺 裕司, 斎藤 誠子, 柴田 昌三, 長谷川 尚史, 阿部 佑平, 齋藤 智之

    日本森林学会大会発表データベース　119　(0)　630-630　2008年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.119.0.630.0 　

  234. Determining the location of a deceased mother tree and estimating forest regeneration variables by use of microsatellites and spatial genetic models 査読有り

    Kenichiro Shimatani, Megumi Kimura, Keiko Kitamura, Yoshihisa Suyama, Yuji Isagi, Hisashi Sugita

    POPULATION ECOLOGY　49　(4)　317-330　2007年10月

    DOI： 10.1007/s10144-007-0050-8 　

    ISSN：1438-3896

    eISSN：1438-390X

  235. What makes the sex ratio female-biased in the dioecious tree Salix sachalinensis? 査読有り

    Naoto Ueno, Yoshihisa Suyama, Kenji Seiwa

    JOURNAL OF ECOLOGY　95　(5)　951-959　2007年9月

    DOI： 10.1111/j.1365-2745.2007.01269.x 　

    ISSN：0022-0477

  236. The determination of multiple microsatellite genotypes and DNA sequences from a single pollen grain 査読有り

    Y. Matsuki, Y. Isagi, Y. Suyama

    MOLECULAR ECOLOGY NOTES　7　(2)　194-198　2007年3月

    DOI： 10.1111/j.1471-8286.2006.01588.x 　

    ISSN：1471-8278

  237. エゾマツ天然林における繁殖構造と種子生産 -局所的な林分密度の違いと花粉散布の関係に着目して-

    富田基史, 斎藤秀之, 陶山佳久

    北海道の林木育種　49　(2)　13-16　2007年2月1日

  238. 残存ブナ個体群における遺伝的多様性と空間的遺伝構造の大面積調査 査読有り

    沼野直人, 陶山佳久

    複合生態フィールド教育研究センター報告　22　31-38　2006年12月

    出版者・発行元： 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター

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    樹木個体群の遺伝的多様性と空間的遺伝構造は,種子散布と花粉散布を介した遺伝子流動範囲に大きく影響される。しかしながら,これまでに森林内の優占樹種を対象として行われてきた研究では,遺伝子流動範囲をカバーする面積を対象とすることはほとんどなかった。そこで本研究では,伐採によって分布の連続性が低下したブナ個体群を対象として,残存するブナ成木の遺伝的多様性と空間的遺伝構造を大面積調査によって明らかにした。これによって,1)遺伝子流動範囲における詳細な遺伝構造と,2)残存ブナ個体群における遺伝的多様性と遺伝構造の現状,3)伐採等による樹木個体群の小集団化が遺伝的多様性と遺伝構造に及ぼす影響を明らかにすることを目的とした。2005年及び2006年の早春,東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター内の約500haの同一河川流域内に設定した調査地内をくまなく踏査し,胸高直径15cm以上の全てのブナ成木1571本から葉の採取を行った。それらについてSSR7遺伝子座の遺伝子型を決定し,遺伝的多様性と空間的遺伝構造について解析を行った。その結果,残存ブナ個体群においては,分集団間レベルでは遺伝的に有意な集団の分化は起きていないが,個体間レベルでは約90m未満の範囲に遺伝的に類似した個体が生育していることが明らかとなった。また,残存個体群において遺伝的多様性が低下している傾向は認められず,近親交配が過剰に起きている傾向も認められなかった。さらに,小集団化後に更新したと考えられる成木であっても,遺伝的多様性の低下や遺伝的な集団の分化の傾向は認められなかった。これらの結果は,ブナの遺伝子流動の特徴である近距離の旺盛な種子・花粉散布と,量的には少ないが種子生産に効果的に働く長距離花粉散布を反映したものであると考えられた。

  239. Microsatellite analysis of Japanese sea cucumber, Stichopus (Apostichopus) japonicus, supports reproductive isolation in color variants 査読有り

    Manami Kanno, Yoshihisa Suyama, Qi Li, Akihiro Kijima

    MARINE BIOTECHNOLOGY　8　(6)　672-685　2006年11月

    DOI： 10.1007/s10126-006-6014-8 　

    ISSN：1436-2228

  240. Genetic structure of natural and planted populations of Fagus crenata in Miyagi prefecture, Japan

    Manabu Kanno, Yoshihisa Suyama, Masatoshi Hara, Makoto Takahashi, Atsushi Watanabe

    Programme and Conference Abstract Book: Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation. A joint conference of IUFRO Working Groups 2.04.01 (Population, ecological and conservation genetics) a　169-197　2006年10月

  241. Effects of population density on pollen flow in the wind-pollinated tree, Fagus crenata

    Naoto Numano, Yoshihisa Suyama

    Programme and Conference Abstract Book: Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation. A joint conference of IUFRO Working Groups 2.04.01 (Population, ecological and conservation genetics) a　228-229　2006年10月

  242. Heterogeneous pattern of pollen flow and mating success in a small, isolated population of Picea glehnii Masters in Mt. Hayachine, northern Japan

    Motoshi Tomita, Yoshihisa Suyama, Takeshi Seki, Hisashi Sugita

    Programme and Conference Abstract Book: Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation. A joint conference of IUFRO Working Groups 2.04.01 (Population, ecological and conservation genetics) a　254-255　2006年10月

  243. Construction of high-resolution chloroplast haplotype map in Fagus crenata for phylogeography and conservation

    M. Takahashi, A. Watanabe, S. Goto, E. Fukatsu, Y. Goto-Fukuda, M. Kanno, Y. Suyama, N. Tomaru

    Programme and Conference Abstract Book: Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation. A joint conference of IUFRO Working Groups 2.04.01 (Population, ecological and conservation genetics) a　252-253　2006年10月

  244. ウルシ属果実化石の種同定のためのDNA分析

    陶山佳久, 長谷川陽一

    近野遺跡IX －県立美術館及び県道里見丸山線建設事業に伴う遺跡発掘調査報告－，青森県埋蔵文化財調査報告書　(418)　332-336　2006年3月31日

  245. ブナ林の分断化がブナ実生の遺伝的多様性に及ぼす影響． 査読有り

    沼野直人, 陶山佳久, 山本志保, 富田瑞樹, 清和研二

    複合生態フィールド教育研究センター報告　21　21-26　2005年12月

    出版者・発行元： 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター

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    ブナ天然林では戦後の拡大造林により大規模な伐採が行われ,もともとの林が細い帯状の林分(保残帯)としてわずかな面積で残されていることが多い。このようなブナ保残帯では,本来の広範囲な遺伝子流動が制限され,次世代の更新がうまく行われていない可能性が危惧される。本研究では,ブナ林の分断化が次世代に及ぼす影響を明らかにすることを目的として,保残帯に生存する実生個体群の遺伝的多様性を調査した。栗駒山南部に位置する幅50mのブナ保残帯に実生調査区(35m×30m)を計3つ(保残帯区),保残帯から2.5km程離れたブナ天然林内に実生調査区を1つ(対照区)設け,実生調査区内に生存する10年生以下の実生及び,実生調査区を中心とする成木調査区内(140m×130m)に分布する成木個体についてサンプリングを行なった。計1123個体の葉片から1115個体についてDNAを抽出し,その内1110個体について8つのマイクロサテライト遺伝子座の遺伝子型を決定し,集団遺伝学的な解析を行なった。その結果保残帯区と対照区の実生間で,遺伝的多様性の指標に有意な差はなかった。つまり,保残帯区においても次世代の遺伝的多様性は維持されていることが明らかとなった。しかし,保残帯区と対照区における実生の個体数は大きく異なっており,特に保残帯区の当年生及び1年生実生の個体数は対照区の1割にも満たなかった。以上のことから,伐採によるブナ林の分断化は,充実率や種子生産数,または実生段階における生存率に影響を及ぼしているのではないかと考えられた。

  246. Selfing and inbreeding depression in seeds and seedlings of Neobalanocarpus heimii (Dipterocarpaceae) 査読有り

    Y Naito, A Konuma, H Iwata, Y Suyama, K Seiwa, T Okuda, SL Lee, N Muhammad, Y Tsumura

    JOURNAL OF PLANT RESEARCH　118　(6)　423-430　2005年12月

    DOI： 10.1007/s10265-005-0245-z 　

    ISSN：0918-9440

  247. Thysanophora penicillioides includes multiple genetically diverged groups that coexist respectively in Abies mariesii forests in Japan 査読有り

    Susumu Iwamoto, Seiji Tokumasu, Yoshihisa Suyama, Makoto Kakishima

    Mycologia　97　(6)　1238-1250　2005年11月

    DOI： 10.3852/mycologia.97.6.1238 　

    ISSN：0027-5514

  248. Ancient DNA from pollen: a genetic record of population history in Scots pine 査読有り

    L Parducci, Y Suyama, M Lascoux, KD Bennett

    MOLECULAR ECOLOGY　14　(9)　2873-2882　2005年8月

    DOI： 10.1111/j.1365-294X.2005.02644.x 　

    ISSN：0962-1083

  249. Population dynamics of seedlings of Fagus crenata revealed by parentage analysis with microsatellite DNA

    Suyama, Y, K. Maruyama, M. Tomita, M. Takahashi, K. Seiwa

    Abstracts: The Ecological Society of America 90th Annual Meeting held jointly with the IX International Congress of Ecology　621　2005年8月

  250. A new primer for discrimination of arbuscular mycorrhizal fungi with polymerase chain reaction-denature gradient gel electrophoresis 査読有り

    Kouichi Sato, Yoshihisa Suyama, Masanori Saito, Kazuo Sugawara

    Grassland Science　51　(2)　179-181　2005年6月

    出版者・発行元： Wiley-Blackwell

    DOI： 10.1111/j.1744-697x.2005.00023.x 　

  251. A new primer for discrimination of arbuscular mycorrhizal fungi with PCR-DGGE. 査読有り

    Sato K, Suyama Y, Saito M, Sugawara K

    Grassland Sci　51　(2)　179-181　2005年

    出版者・発行元： Japanese Society of Grassland Science

    DOI： 10.1111/j.1744-697X.2005.00023.x 　

    ISSN：1744-6961

  252. 冷温帯落葉広葉樹林における地形と樹木種の分布パターンとの関係

    寺原幹生, 山崎実希, 加納研一, 陶山佳久, 清和研二

    複合生態フィールド教育研究センター報告　20　(20)　23-28　2004年12月

  253. Defoliation effects on the community structure of arbuscular mycorrhizal fungi based on 18S rDNA sequences 査読有り

    K Saito, Y Suyama, S Sato, K Sugawara

    MYCORRHIZA　14　(6)　363-373　2004年12月

    DOI： 10.1007/s00572-003-0286-x 　

    ISSN：0940-6360

  254. Identification of rabbiteye blueberry cultivars (Vaccinium ashei Reade) and analysis of genetic relationships using amplified fragment length polymorphism (AFLP). 査読有り

    E. Prokaj, H. Watanabe, Y. Suyama, M. Saigusa

    International Journal of Horticultural Science　10　(4)　27-30　2004年12月

  255. Mating system and pollen flow in a heterodichogamous tree, Juglans ailanthifolia

    Kimura, M, Y. Suyama, K. Seiwa, K. Woeste

    Proceedings of the First EAFES International Congress　125　2004年10月

    DOI： 10.1111/j.1442-1984.2003.00088.x 　

  256. Gene dispersal and relative fertility in Fagus crenata: Male vs. female function

    Suyama, Y, K. Maruyama, K. Seiwa, M. Tomita, J. Takahashi, M. Takahashi, N. Ueno

    Population, Evolutionary and Ecological Genomics of Forest Trees　39　2004年9月

  257. Geographical distribution of two haplotypes of chloroplast DNA in four oak species (Quercus) in Japan 査読有り

    M Kanno, J Yokoyama, Y Suyama, M Ohyama, T Itoh, M Suzuki

    JOURNAL OF PLANT RESEARCH　117　(4)　311-317　2004年8月

    DOI： 10.1007/s10265-004-0160-8 　

    ISSN：0918-9440

  258. Flowering system of heterodichogamous Juglans ailanthifolia 査読有り

    Megumi Kimura, Kenji Seiwa, Yoshihisa Suyama, Naoto Ueno

    Plant Species Biology　18　(2-3)　75-84　2003年12月

    DOI： 10.1111/j.1442-1984.2003.00088.x 　

    ISSN：0913-557X

  259. Seed and pollen dispersal in Japanese beech: exact identification of parental trees with pericarp and cotyledon DNA

    Suyama, Y, K. Maruyama, K. Seiwa, M. Tomita, J. Takahashi, M. Takahashi, N. Ueno

    International Symposium “Diversity of Reproductive System in Plants: Ecology, Evolution and Conservation”　32　2003年10月

  260. Genetic structure and pollen flow in heterodichogamous Juglans ailanthifolia

    Kimura, M, Y. Suyama, K. Seiwa

    International Symposium “Diversity of Reproductive System in Plants: Ecology, Evolution and Conservation”　36　2003年10月

    DOI： 10.1111/j.1442-1984.2003.00088.x 　

  261. Isolation of DNA from subfossil pollen

    Suyama, Y, L. Parducci, M. Lascoux, K. Bennett

    Abstracts of the Symposium: Introducing genetic and palaeogenetic approaches in plant palaeoecology and archaeology　32　2003年9月

  262. Outcrossing rates of Shorea curtisii: comparison between undisturbed and selectively logged compartments in Semangkok Forest Reserve 査読有り

    Lee, C.T, Norwati, M, Lee, S.L, Obayashi, K, Tsumura, Y, Suyama, Y, Niiyama, K

    Proceedings of the Seventh Round-Table Conference on Dipterocarps　16-23　2003年8月

  263. Clonal structure of Sasa palmate population by AFLP analysis in Fagus crenata forest understorey

    T. Saitoh, K. Seiwa, Y. Suyama

    7th Clonal Plant Workshop (Reproductive strategies, biotic interactions and metapopulation dynamics)　67　2003年8月

  264. Dynamics of clonal structure in a Bamboo cohort during 21 years in the regeneration process after mass flowering

    A. Makita, Y. Suyama, T. Saitoh, A. Nishiwaki

    7th Clonal Plant Workshop (Reproductive strategies, biotic interactions and metapopulation dynamics)　49　2003年8月

  265. Molecular Approaches to the Analysis of Regeneration Process of Forest Trees

    Y. Suyama, K. Maruyama, J. Takahashi, M. Tomita, M. Takahashi, N. Ueno, K. Seiwa

    第50回日本生態学会大会講演要旨集　78　2003年3月

  266. 7-15 P-45 胞子を材料とした、アーバスキュラー菌根菌の種間および種内変異の PCR-DGGE 法による検出

    佐藤 航一, 陶山 佳久, 斎藤 雅典, 菅原 和夫

    日本草地学会誌　49　414-415　2003年

    出版者・発行元： 日本草地学会

    DOI： 10.14941/grass.49.414 　

  267. Characteristics of a novel type of bovine Cryptosporidium andersoni 査読有り

    M Satoh, K Hikosaka, T Sasaki, Y Suyama, T Yanai, M Ohta, Y Nakai

    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY　69　(1)　691-692　2003年1月

    DOI： 10.1128/AEM.69.1.691-692.2003 　

    ISSN：0099-2240

  268. 下層植生の違いが野ネズミのクリ種子散布に与える影響

    佐藤元紀, 清和研二, 陶山佳久, 加納研一

    川渡農場報告　18　(18)　49-58　2002年12月

    出版者・発行元： 東北大学

  269. Intraspecific diversity of Thysanophora penicillioides and genetic structure in the species population

    Iwamoto S, Tokumasu S, Ogawa Y, Suyama Y, Kakishima M

    Seventh International Mycological Congress　2002年8月

  270. Identification of the maternal trees for current-year seedlings of Fagus crenata based on microsatellite analysis

    Suyama, Y, M. Tomita, J. Takahashi, M. Takahashi, N. Ueno, K. Seiwa

    Proceedings of the VIII INTECOL International Congress of Ecology　258　2002年8月

  271. Reproductive effort, reproductive success and pollen flow in heterodichogamous Juglans ailanthifolia

    Kimura, M, Y. Suyama, K. Seiwa, K. Woeste

    Proceedings of the VIII INTECOL International Congress of Ecology　138　2002年8月

  272. Molecular phylogeny of four selected species of the strictly anamorphic genus Thysanophora using nuclear ribosomal DNA sequences 査読有り

    Susumu Iwamoto, Seiji Tokumasu, Yoshihisa Suyama, Makoto Kakishima

    Mycoscience　43　(2)　169-180　2002年4月25日

    出版者・発行元： Springer Japan

    DOI： 10.1007/S102670200024 　

    ISSN：1340-3540

  273. Genetic diversity and outcrossing rate between undisturbed and selectively logged forests of Shorea curtisii (Dipterocarpaceae) using microsatellite DNA analysis 査読有り

    K Obayashi, Y Tsumura, T Ihara-Ujino, K Niiyama, H Tanouchi, Y Suyama, Washitani, I, CT Lee, SL Lee, N Muhammad

    INTERNATIONAL JOURNAL OF PLANT SCIENCES　163　(1)　151-158　2002年1月

    DOI： 10.1086/324549 　

    ISSN：1058-5893

  274. オニグルミ自然林での3年間にわたる開花特性

    木村恵, 清和研二, 陶山佳久, 上野直人

    川渡農場報告　17　(17)　43-52　2001年12月

    出版者・発行元： 東北大学

  275. Chloroplast DNA inversion polymorphism in populations of Abies and Tsuga 査読有り

    Y Tsumura, Y Suyama, K Yoshimura

    MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION　17　(9)　1302-1312　2000年9月

    ISSN：0737-4038

  276. Molecular phylogenetic position of Japanese Abies (Pinaceae) based on chloroplast DNA sequences 査読有り

    Y Suyama, H Yoshimaru, Y Tsumura

    MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION　16　(2)　271-277　2000年8月

    DOI： 10.1006/mpev.2000.0795 　

    ISSN：1055-7903

  277. Synchronous flowering of clones of dwarf bamboo

    A. Nishiwaki, A. Makita, Y. Suyama

    Abstract of International Workshop Clone~2000 (Current Progress & Developments in Clonal Plant Research)　64　2000年8月

  278. Clonal structure in a dwarf bamboo (Sasa senanensis) population inferred from amplified fragment length polymorphism (AFLP) fingerprints 査読有り

    Y Suyama, K Obayashi, Hayashi, I

    MOLECULAR ECOLOGY　9　(7)　901-906　2000年7月

    DOI： 10.1046/j.1365-294X.2000.00943.x 　

    ISSN：0962-1083

    eISSN：1365-294X

  279. AFLP and CAPS linkage maps of Cryptomeria japonica 査読有り

    AM Nikaido, T Ujino, H Iwata, K Yoshimura, H Yoshimura, Y Suyama, M Murai, K Nagasaka, Y Tsumura

    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS　100　(6)　825-831　2000年4月

    DOI： 10.1007/s001220051358 　

    ISSN：0040-5752

  280. Genetic diversity and differentiation of Taxodium in the south-eastern United States using cleaved amplified polymorphic sequences 査読有り

    Y Tsumura, N Tomaru, Y Suyama, S Bacchus

    HEREDITY　83　(3)　229-238　1999年9月

    ISSN：0018-067X

  281. Segregation distortion for AFLP markers in Cryptomeria japonica 査読有り

    A Nikaido, H Yoshimaru, Y Tsumura, Y Suyama, M Murai, K Nagasaka

    GENES & GENETIC SYSTEMS　74　(2)　55-59　1999年4月

    DOI： 10.1266/ggs.74.55 　

    ISSN：1341-7568

    eISSN：1880-5779

  282. DNA analysis of coniferous fossil pollen from Lake Baikal

    Y. Suyama, H. Yoshimaru, K. Kawamuro, Y. Tsumura, H. Takahara, K. Yoshimura

    Proceedings of BICER, BDP and DIWPA Joint International Symposium on Lake Baikal　1998年11月

  283. Differentiation of mitochondrial DNA polymorphisms in populations of five Japanese Abies species 査読有り

    Y Tsumura, Y Suyama

    EVOLUTION　52　(4)　1031-1042　1998年8月

    ISSN：0014-3820

  284. Detection of quantitative trait loci for juvenile growth, flower bearing and rooting ability based on a linkage map of sugi (Cryptomeria japonica D Don) 査読有り

    H Yoshimaru, K Ohba, K Tsurumi, N Tomaru, M Murai, Y Mukai, Y Suyama, Y Tsumura, T Kawahara, Y Sakamaki

    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS　97　(1-2)　45-50　1998年7月

    DOI： 10.1007/s001220050865 　

    ISSN：0040-5752

  285. Application of STS-based co-dominant markers derived from cDNA clones from Cryptomeria japonica to the related species

    Y. Tsumura, N. Tomaru, Y. Suyama, W. J. Libby, S. Bucchus, H. Yoshimaru, X. Hui, K. Ngasaka

    Proceedings of Plant & Animal Genome VI　1998年1月

  286. A cline of allozyme variation in Abies mariesii 査読有り

    Y Suyama, Y Tsumura, K Ohba

    JOURNAL OF PLANT RESEARCH　110　(1098)　219-226　1997年6月

    DOI： 10.1007/BF02509310 　

    ISSN：0918-9440

  287. Sequence-tagged-sites (STSs) of cDNA clones in Cryptomeria japonica and their evaluation as molecular markers in conifers 査読有り

    Y Tsumura, Y Suyama, K Yoshimura, N Shirato, Y Mukai

    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS　94　(6-7)　764-772　1997年5月

    DOI： 10.1007/s001220050476 　

    ISSN：0040-5752

  288. Detection of quantitative trait loci for growth and flower characters in Cryptomeria japonica

    H. Yoshimaru, K. Ohba, K. Tsurumi, M. Murai, Y. Mukai, Y. Tsumura, T. Kawahara, Y. Suyama

    Proceedings of Plant & Animal Genome V　1997年1月

  289. Development of new molecular marker based on Sequence-Tagged-Sites (STSs) of cDNA clones in Cryptomeria japonica and their applications

    Y. Tsumura, Y. Suyama, N. Tomaru, K. Yoshimura, N. Kuramoto, Y. Mukai

    Proceedings of Plant & Animal Genome V　1997年1月

  290. Polymorphism caused by a large inversion in chloroplast DNA was conserved in Japanese Abies species but the mitochondrial variation showed clear geographical and species differentiation

    Y. Tsumura, Y. Suyama, K. Yoshimura

    Proceedings of IUFRO '96, Diversity and adaptation in forest ecosystems in a changing world　1996年8月

  291. Molecular phylogeny of Pinus armandii and the related taxa

    T. Kawahara, Y. Suyama, S. Wu

    Proceedings of International Symposium on Floristic Characteristics and Diversity of East Asian Plant　1996年7月

  292. DNA sequence from a fossil pollen of Abies spp from Pleistocene peat 査読有り

    Y Suyama, K Kawamuro, Kinoshita, I, K Yoshimura, Y Tsumura, H Takahara

    GENES & GENETIC SYSTEMS　71　(3)　145-149　1996年6月

    DOI： 10.1266/ggs.71.145 　

    ISSN：1341-7568

    eISSN：1880-5779

  293. Assignment of RFLP linkage groups to their respective chromosomes in aneuploids of sugi (Cryptomeria japonica) 査読有り

    Y Suyama, Y Mukai, T Kondo

    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS　92　(3-4)　292-296　1996年3月

    DOI： 10.1007/s001220050127 　

    ISSN：0040-5752

  294. 致死遺伝子座と標識遺伝子座、RFLP座およびRAPD座との組換価の計算プログラム（RECLOD 20）

    大庭喜八郎, 河崎久男, 倉本哲嗣, 戸丸信弘, 津村義彦, 荒木眞之, 内田煌二, 中村徹, 奥泉久人, 陶山佳久, 戸丸智恵美

    筑波大学農林技術センター演習林報告　12　(12)　159-195　1996年3月

    出版者・発行元： 筑波大学

    ISSN：0912-1765

  295. DNA sequence from a fossil pollen of Abies spp. from Pleistocene peat

    Yoshihisa Suyama, Kimiyasu Kawamuro, Isao Kinoshita, Kensuke Yoshimura, Yoshihiko Tsumura, Hikaru Takahara

    Genes and Genetic Systems　71　(3)　145-149　1996年

    DOI： 10.1266/ggs.71.145 　

    ISSN：1341-7568

  296. Sequence-tagged-site (STS) markers developed from mapped cDNA clones of Cryptomeria japonica as landmarks for Taxodiaceae genome study

    Y. Tsumura, Y. Mukai, Y. Suyama, K. Yoshimura, N. Shirato, H. Yoshimaru, K. Ohba

    Proceedings of Plant Genome IV　1996年1月

  297. Inspection of DNA in fossil pollen of Abies spp. from Late Pleistocene peat 査読有り

    K. Kawamuro, I. Kinoshita, Y. Suyama, H. Takahara

    Journal of the Japanese Forestry Society　77　(3)　272-274　1995年5月

    DOI： 10.11519/jjfs1953.77.3_272 　

  298. A LINKAGE MAP FOR SUGI (CRYPTOMERIA-JAPONICA) BASED ON RFLP, RAPD, AND ISOZYME LOCI 査読有り

    Y MUKAI, Y SUYAMA, Y TSUMURA, T KAWAHARA, H YOSHIMARU, T KONDO, N TOMARU, N KURAMOTO, M MURAI

    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS　90　(6)　835-840　1995年5月

    ISSN：0040-5752

  299. スギゲノムの遺伝子及びRFLPの連鎖分析におけるアイソザイム遺伝子座の橋渡し方式に関する研究 3.致死遺伝子座と標識遺伝子座,RFLP座およびRAPD座との組換価の推定

    大庭喜八郎, 河崎久男, 倉本哲嗣, 戸丸信弘, 津村義彦, 荒木眞之, 内田煌二, 中村徹, 奥泉久人, 陶山佳久, 戸丸智恵美

    筑波大学農林技術センタ-演習林報告　11　(11)　85-157　1995年3月

    出版者・発行元： 筑波大学

    ISSN：0912-1765

  300. GEOGRAPHICAL CLINE OF CHLOROPLAST DNA VARIATION IN ABIES MARIESII 査読有り

    Y TSUMURA, H TAGUCHI, Y SUYAMA, K OHBA

    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS　89　(7-8)　922-926　1994年12月

    ISSN：0040-5752

  301. A linkage map for sugi (Cryptomeria japonica) based on RFLP, RAPD and isozyme loci

    Y. Mukai, Y. Suyama, Y. Tsumura, T. Kawahara, H. Yoshimaru, T. Kondo, N. Tomaru, N. Kuramoto, M. Murai

    Proceedings of the Second international symposium on the applications of biotechnology to tree culture, protection, and utilization　1994年10月

  302. Intraspecific variation of chloroplast DNA in the Japanese Abies genus

    Y. Tsumura, Y. Suyama

    Proceedings of XV International Botanical Congress　1993年8月

  303. A partial linkage map for sugi (Cryptomeria japonica) based on RFLP, RAPD and isozyme loci

    Y. Mukai, Y. Suyama, Y. Tsumura, T. Kawahara, H. Yoshimaru, T. Kondo, N. Tomaru, M. Murai

    Proceedings of XV International Botanical Congress　1993年8月

  304. スギゲノムの遺伝子及びRFLPの連鎖分析におけるアイソザイム遺伝子座の橋渡し方式に関する研究 2.共優性遺伝子座間の連鎖分析における胚致死遺伝子による分離比の偏りの補正

    大庭喜八郎, 河崎久男, 倉本哲嗣, 戸丸信弘, 津村義彦, 内田煌二, 中村徹, 奥泉久人, 陶山佳久, 高橋智恵美

    筑波大学農林技術センタ-演習林報告　9　(9)　35-139　1993年3月

  305. Inheritance of isozyme variants and allozyme diversity of Abies mariesii in three isolated natural forests 査読有り

    Y. Suyama, Y. Tsumura, K. Ohba

    Journal of the Japanese Forestry Society　74　(2)　65-73　1992年3月

    DOI： 10.11519/jjfs1953.74.2_65 　

  306. スギゲノムの遺伝子及びRFLPの連鎖分析におけるアイソザイム遺伝子座の橋渡し方式に関する研究 1.劣性標識遺伝子ホモ個体の利用と胚致死遺伝子による分離比の偏りの補正

    大庭喜八郎, 河崎久男, 倉本哲嗣, 津村義彦, 戸丸信弘, 内田煌二, 中村徹, 奥泉久人, 陶山佳久, モハマドナイム, 高橋誠, 高橋智恵美

    筑波大学農林技術センタ-演習林報告　8　(8)　139-273　1992年3月

    出版者・発行元： 筑波大学

    ISSN：0912-1765

  307. アイソザイム実験法

    津村義彦, 戸丸信弘, 陶山佳久, モハマド=ナイム, 大庭喜八郎

    筑波大学農林技術センター演習林報告　6　(6)　63-96　1990年3月

  308. アカマツ人工林におけるアカマツ当年生実生の個体群動態 査読有り

    陶山佳久, 中村 徹

    日本林学会誌　70　(12)　510-517　1988年12月

    DOI： 10.11519/jjfs1953.70.12_510 　

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MISC 214

  1. 多雪植物群集の遺伝的分化:25種の比較系統地理解析で探る地理隔離と種特性の影響

    阪口翔太, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 廣田峻, 陶山佳久, 高橋大樹, 沢和浩, 堀江健二, 坂田ゆず, 坪井勇人, 柳田宏光, 白井伸和, 石原正恵, 福本繁, 藤木大介, 阿部晴恵, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　23rd　2024年

  2. 邦産ビャクシン属ネズミサシ節における網羅的分子系統地理解析

    田口裕哉, 高橋大樹, 伊東拓朗, 田金秀一郎, 菅原崚太, 菅原崚太, 小栗恵美子, 阿部晴恵, 陶山佳久

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　23rd　2024年

  3. 多雪植物群集の遺伝的分化を探る:25種を対象とした比較系統地理解析

    阪口翔太, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 廣田峻, 陶山佳久, 高橋大樹, 沢和浩, 堀江健二, 坂田ゆず, 坪井勇人, 柳田宏光, 白井伸和, 石原正恵, 福本繁, 藤木大介, 阿部晴恵, 瀬戸口浩彰

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　71st　2024年

  4. 佐渡島モリアオガエルのニッチ拡大に基づく形態およびライフサイクルの変化とその要因

    藤田健, 田口裕哉, 澤田聖人, 陶山佳久, 杉山稔恵, 阿部晴恵

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　71st　2024年

  5. サザンカの分子系統地理

    阿部晴恵, 松尾歩, 陶山佳久, 高嶋敦史, 畑邦彦, 松倉君予

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　71st　2024年

  6. 全ゲノム解析による屋久島産矮小植物の進化過程の解明

    高橋大樹, 陶山佳久, 長澤耕樹, 石川直子, 瀬戸口浩彰, 阪口翔太

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　71st　2024年

  7. 北海道大学植物園におけるヒダカソウCallianthemum miyabeanum生息域外保全の10年間(2011~2020年)の成果—Achievements of 10years (2011-2020) of Ex-situ conservation of Callianthemum miyabeanum at Botanic Garden, Hokkaido University

    永谷 工, 稲川 博紀, 高田 純子, 西川 洋子, 島村 崇志, 陶山 佳久, 水永 優紀, 中村 剛

    日本植物園協会誌　(57)　66-71　2023年2月

    出版者・発行元： 日本植物園協会

    ISSN： 0389-5246

  8. 多雪植物群集の遺伝的分化を探る:25種を対象とした比較系統地理解析

    阪口翔太, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 廣田峻, 陶山佳久, 高橋大樹, 沢和浩, 堀江健二, 坂田ゆず, 坪井勇人, 柳田宏光, 白井伸和, 石原正恵, 福本繁, 藤木大介, 阿部晴恵, 瀬戸口浩彰

    森林遺伝育種学会大会講演要旨集(Web)　12th　2023年

  9. MIG-seq法を用いたスミレ科オオバキスミレ群の系統解析

    渡辺蕗, 瀬戸口浩彰, いがり まさし, 堀江健二, 内藤健, 坪井勇人, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 藤井紀行, 高橋大樹, 矢原徹一, 沢和浩, KOZHEVNIKOV Andrey E., KOZHEVNIKOVA Zoya V., IM Hyoung-Tak, JANG Su-Kil, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 石川直子, 阪口翔太

    日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　87th　2023年

  10. 全ゲノム解析で紐解くスミレ科オオバキスミレ群の適応放散史

    渡辺蕗, 瀬戸口浩彰, いがり まさし, 堀江健二, 内藤健, 坪井勇人, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 藤井紀行, 高橋大樹, 矢原徹一, 沢和浩, KOZHEVNIKOV Andrey E., KOZHEVNIKOVA Zoya V., IM Hyoung-Tak, JANG Su-Kil, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 石川直子, 阪口翔太

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　22nd　2023年

  11. サワシロギクの蛇紋岩適応と微生物作用~植物炭疽病菌は敵か,味方か~

    林雅貴, 仲野慶大, 阪口翔太, 福島慶太郎, 石川直子, 井鷺裕司, 陶山佳久, 伊藤元己, 西野貴子

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　22nd　2023年

  12. 日本の島嶼域に隔離分布するオキナワハイネズ近縁種群の分子系統地理学的解析

    田口裕哉, 高橋大樹, 伊東拓朗, 田金秀一郎, 菅原崚太, 菅原崚太, 小栗恵美子, 阿部晴恵, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023年

  13. 佐渡島の山地と平野間におけるモリアオガエルの形態変化と遺伝子流動

    藤田健, 田口裕哉, 澤田聖人, 陶山佳久, 阿部晴恵

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023年

  14. 日本列島におけるホタルブクロ属の系統地理

    阿部晴恵, 松尾歩, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023年

  15. チュウゴクザサ更新初期の個体群動態に影響を及ぼす生態学的要因

    谷口直, 松尾歩, 富松裕, 岡野邦宏, 陶山佳久, 齋藤智之, 柴田昌三, 鈴木準一郎, 蒔田明史, 立木佑弥

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　70th　2023年

  16. MIG-seq法に基づいたカブトムシの集団遺伝構造及び遺伝的撹乱リスクの検証

    濱野友, 陶山佳久, 松尾歩, 伴光哲, 渡部晃平, 山崎健史, 山崎健史, 山田量崇, 山田量崇, 中濱直之, 中濱直之

    日本昆虫学会大会プログラム・講演要旨集　83rd (Web)　2023年

  17. 西日本に産する広義ヤハズハハコ(キク科ヤマハハコ属)の遺伝的分化

    片岡利文, 米岡克啓, 藤原泰央, 廣田峻, 陶山佳久, 矢原徹一, 村上哲明

    日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　87th　2023年

  18. サワシロギク蛇紋岩型の複数集団はどのように成立したか

    林雅貴, 阪口翔太, 福島慶太郎, 石川直子, 井鷺裕司, 陶山佳久, 伊藤元己, 西野貴子

    日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　86th　2022年

  19. 自然林におけるVOCsを介したブナの植物間コミュニケーション

    萩原幹花, 塩尻かおり, 陶山佳久, 松尾歩, 石原正恵

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　69th　2022年

  20. 絶滅危惧植物カンランの域外保全に向けた遺伝解析

    西原美佳, 阪口翔太, 長澤淳一, 市河三英, 廣田峻, 陶山佳久, 遊川知久, 平塚健一, 山下幸司, 橋本季正, 矢部幸太, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  21. 日本産ヤマハハコ属(キク科)の分類学的再検討

    片岡利文, 米岡克啓, 藤原泰央, 加藤英寿, 廣田俊, 陶山佳久, 矢原徹一, 村上哲明

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  22. 標本ゲノミクスで明らかになった広義アキノキリンソウのユーラシア拡散史

    阪口翔太, SEREGIN Alexey P, MARCHUK Elena, SEMPLE John, PAN Li, QIU Yinqiong, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 陶山佳久, 廣田峻, 石川直子, CHERNYAGINA Olga, CHOI Hyeokjae, 中臺亮介, 重信秀治, 山口勝司, 伊藤元己

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  23. 日本における塩生植物フクドの系統地理学的研究

    江田悠河, 阪口翔太, 陶山佳久, 廣田峻, CHOI Hyeok Jae, LI Pan, HAN Qingxiang, 山下純, 黒田有寿茂, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  24. 全国全種サンプリングとMIG-seqによる日本の野生植物の分類学的再検討 トダシバ属を例に

    佐藤広行, 布施健吾, 田金秀一郎, 廣田峻, 藤井伸二, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  25. MIG-seqによる日本産スミレ属タチツボスミレ類植物の系統関係の推定

    YU Jiaxin, 瀬戸口浩彰, 増田和俊, 堀江健二, 陶山佳久, 廣田峻, 阪口翔太

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  26. 矮化オオバコの集団ゲノム解析

    石川直子, 阪口翔太, 高橋大樹, 廣田峻, 陶山佳久, 伊藤元己

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  27. 日本産スイレン亜属の系統地理学的解析

    内藤芳香, 岩崎貴也, 加藤将, 首藤光太郎, 陶山佳久, 廣田峻, 志賀隆

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　21st (CD-ROM)　2022年

  28. マルハナバチ属昆虫が駆動する花のサイズの山域間独立進化-4種植物における共通点-

    田路翼, 廣田峻, 石本夏海, 中瀬悠太, 江川信, 中村駿介, 服部充, 陶山佳久, 市野隆雄

    日本昆虫学会大会プログラム・講演要旨集　82nd　2022年

  29. 歴史的な降雪変化が日本の多雪依存植物チョウジギクの個体群に与えた遺伝的影響

    増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 廣田峻, 陶山佳久, 沢和浩, 福本繁, 石原正恵, 阿部晴恵, 坪井勇人, 丹後亜興, 森小夜子, 阪口翔太

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　69th　2022年

  30. ヤブツバキとユキツバキの分子系統地理

    阿部晴恵, 上野真義, 松尾歩, 廣田峻, 陶山佳久, 三浦弘毅, SHEN Yunguang, SU Monghuai, WANG Zhong lang

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　69th　2022年

  31. 日本,屋久島の絶滅危惧種,Gentiana yakushimensisにおける極めて低レベルの遺伝的多様性【JST・京大機械翻訳】

    Ishii, N. I., Hirota, S. K., Tsunamoto, Y., Matsuo, A., Abe, H., Suyama, Y.

    bioRxiv　2022年

  32. シイタケ原木栽培における特定防除資材を用いた病原菌対策に関する研究(IV)-食酢を施用したときのシイタケ子実体収量への影響等について-

    宮崎和弘, 木下晃彦, 福井陸夫, 倉島治, 大林夏湖, 伊藤元己, 陶山佳久

    九州森林研究　(74)　2021年

    ISSN： 1347-0779

  33. 関東中部地方から伊豆諸島,南硫黄島,トカラ列島に生育するタマアジサイ類の分子系統地理解析

    岩崎貴也, 谷川茜, 阿部晴恵, 綱本良啓, 陶山佳久, 高山浩司, 加藤英寿, 尾関雅章

    日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　85th　2021年

  34. ハクサンオオバコとオオバコの系統関係および遺伝的交流について

    石川直子, 四方貴士, 中山祐一郎, 阪口翔太, 支倉千賀子, SHIPUNOV Alexey, 塚谷裕一, 廣田峻, 松尾歩, 陶山佳久, 池田博, 伊藤元己

    日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　85th　2021年

  35. サワシロギク土壌生態型の遺伝子流動と集団動態

    林雅貴, 阪口翔太, 福島慶太郎, 石川直子, 井鷺裕司, 陶山佳久, 伊藤元己, 西野貴子

    日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)　85th　2021年

  36. 近いようで遠い尾瀬沼と尾瀬ヶ原:ゲノム縮約情報解析で明らかになった尾瀬地域におけるヒツジグサの遺伝構造

    内藤芳香, 加藤将, 岩崎貴也, 廣田峻, 黒沢高秀, 大森威宏, 陶山佳久, 薄葉満, 志賀隆

    日本陸水学会甲信越支部会報　(47 (CD-ROM))　2021年

    ISSN： 0913-4859

  37. 日本海側気候の変化が植物の集団動態に与えた影響:多雪依存種チョウジギクを用いた検証

    増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 廣田峻, 陶山佳久, 沢和浩, 福本繁, 石原正恵, 阿部晴恵, 坪井勇人, 丹後亜興, 森小夜子, 阪口翔太

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　20th (CD-ROM)　2021年

  38. 満鮮要素オカオグルマの分布変遷過程の考察

    坂場友香, 陶山佳久, 松尾歩, 藤井紀行, 藤井伸二, 副島顕子

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　20th (CD-ROM)　2021年

  39. MIG-seq解析を利用したオキナグサの分子系統地理学的研究

    西藤大朗, 陶山佳久, 松尾歩, 池田啓, 藤井紀行, 副島顕子

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　20th (CD-ROM)　2021年

  40. 分子系統地理学的解析で見えた襲速紀要素クサヤツデ,ヤハズアジサイの共通項と相違点

    竹下(村山)香織, 満行知花, 松尾歩, 渡邊幹男, 岩崎貴也, 陶山佳久, 藤井紀行

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　20th (CD-ROM)　2021年

  41. 多雪地植物ハイイヌガヤの遺伝的多様性と進化過程の推定

    蔡惠美, 松尾歩, 陶山佳久, 渡辺洋一

    日本森林学会大会学術講演集　132nd　2021年

    ISSN： 2187-6576

  42. 分布最前線ニホンジカの個体群構造-mtDNAとnDNAを用いた遺伝解析-

    山田志穂, 永田純子, 津田吉晃, 松尾歩, 加藤朱音, 兼子伸吾, 高橋裕史, 相川拓也, 陶山佳久, 津村義彦

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　68th　2021年

  43. ボルネオ熱帯雨林の樹木における過去の種間交雑の可能性とそのニッチ進化への影響

    伊東明, 辰巳茉優, 荒井瑶史, 奥野聖也, YIN Tingting, 名波哲, 上谷浩一, 松山周平, 永野惇, 手塚あゆみ, 陶山佳久, 松尾歩, TAN Sylvester, MOHIZAH Mohamad

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　68th　2021年

  44. 天然スギ針葉に含まれるテルペン類の地理的変異

    楠本倫久, HAN Qingmin, 金谷整一, 陶山佳久, 津村義彦, 内山憲太郎

    日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM)　71st　2021年

    ISSN： 1349-0532

  45. 放牧地の植物種多様性がウシの採食種構成とルーメンおよび糞中細菌叢に与える影響

    後藤佑理子, 柿原秀俊, 宍戸哲郎, 福田康弘, 瀧澤修平, 陶山佳久, 松尾歩, 中野美和, 小倉振一郎

    日本草地学会誌　67　2021年

    ISSN： 0447-5933

  46. 琉球諸島における非固有性の国内希少植物を対象とした保全遺伝学的解析

    徳弘千夏, 井鷺裕司, 伊東拓朗, 國府方吾郎, 阿部篤志, 内貴章世, 松尾歩, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  47. ベトナム南部の熱帯山地林における樹木の展葉・開花・結実フェノロジー

    永濱藍, 田金秀一郎, NGOC Nguyen Van, BINH Hoang Thi, CUONG Truong Quang, THU Nguyen Thi Anh, 土屋考人, ZHANG Meng, THANH Hoang Viet, THINH Nguyen Cuong, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 森塚絵津子, 遠山弘法, 永益英敏, 内貴章世, 矢原徹一

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  48. ベトナム南部の山地林におけるブナ科とクスノキ科の種多様性とフェノロジー

    永濱藍, 田金秀一郎, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 森塚絵津子, NGUYEN Van Ngoc, HOANG Thi Binh, ZHANG Meng, 永益英敏, 内貴章世, 遠山弘法, 矢原徹一

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  49. ポリネーションシフトに基づくツバキ節の種分化

    阿部晴恵, 三浦弘毅, 片山瑠衣, 上野真義, 陶山佳久, 松尾歩, WANG Zhonglang

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  50. 満鮮要素植物ツチグリのMIG-seq解析を用いた分子系統地理学的解析

    小畠彪, 仁木教陽, 平良玲央奈, 竹下(村山)香織, 陶山佳久, 松尾歩, 佐藤光彦, 副島顕子, 岩崎貴也, 池田啓, 藤井紀行

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  51. 満鮮要素オカオグルマの系統地理学的研究

    坂場友香, 陶山佳久, 松尾歩, 池田啓, 藤井紀行, 藤井伸二, 副島顕子

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  52. MIG-seq解析を用いた草原性植物種シロスミレの分布変遷過程

    山本隆聖, 藤井紀行, 陶山佳久, 松尾歩, いがり まさし, 副島顕子

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  53. 絶滅危惧種の分布フロント個体群を対象としたゲノムワイド解析

    芝林真友, 伊東拓朗, 國府方吾郎, 阿部篤志, 横田昌嗣, 遊川知久, 陶山佳久, 内貴章世, 栗田和紀, 永野惇, 本庄三恵, 井鷺裕司

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  54. 日本におけるスゲ属2節の種多様性形成過程の解明

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 沢和浩, 堀江健二, 永野惇, 陶山佳久, 松尾歩, 綱本良啓, 阪口翔太

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  55. 日本周辺の大陸棚外縁部に生息する12魚種の集団構造解析

    手良村知功, 松尾歩, 佐藤光彦, 陶山佳久, 菊池潔, 平瀬祥太朗

    日本魚類学会年会講演要旨　54th (CD-ROM)　2020年

  56. MIG-seqによるシイタケ品種の識別と特異的マーカーの開発

    佐藤光彦, 木下晃彦, 松尾歩, 宮崎和弘, 福井陸夫, 倉島治, 大林夏湖, 伊藤元己, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  57. MIG-seqデータ解析パイプラインの開発

    倉島治, 廣田峻, 松尾歩, 伊藤元己, 大林夏湖, 佐藤光彦, 木下晃彦, 宮崎和弘, 福井陸夫, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  58. MIG-seq法を用いた日本産低地性2倍体タンポポ全種の集団遺伝学的解析

    満行知花, 渡邊幹男, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  59. 襲速紀要素3種を用いた比較分子系統地理学

    竹下(村山)香織, 渡邊幹男, 満行知花, 松尾歩, 岩崎貴也, 陶山佳久, 藤井紀行

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  60. クロマツ林における外生菌根菌の成長菌糸群集

    清水智史, 小泉敬彦, 松尾歩, 陶山佳久

    日本菌学会大会講演要旨集　64th　2020年

  61. ボルネオ熱帯雨林に同所的に生育するフタバガキ科樹種の種分化とニッチ分化の推定

    伊東明, 荒井瑶史, 奥野聖也, YIN Tingting, 名波哲, 山倉拓夫, 上谷浩一, 松山周平, 陶山佳久, 松尾歩, TAN Sylvester, MOHIZAH Mohamad

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  62. 日本産ヒシ属植物の系統地理に関する研究

    山岸洋貴, 松尾歩, 陶山佳久, 片岡太郎, THI Lam Dinh, 石川隆二

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  63. ヤクシカの食性の地域・季節差-糞中の植物rbcL配列組成を用いた食性推定-

    東悠斗, 廣田峻, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  64. 石狩浜カシワ・ミズナラ林の分断化パッチにおける潜葉性昆虫の群集構造

    松浦輝, 松尾歩, 佐藤光彦, 陶山佳久, 内海俊介

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  65. スギ針葉部におけるテルペンの内在量と放出量について

    吉岡颯, 松永壮, 斉藤拓也, 楠本倫久, 内山憲太郎, 陶山佳久, 津村義彦, 日浦勉

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　67th　2020年

  66. ミジンコ個体群の新生息地移入に伴う環境適応機構:湖沼堆積物と休眠卵を用いた遺伝構造と形質の時系列変動分析から

    大竹裕里恵, 大槻朝, 占部城太郎, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 印南秀樹, 木村成子, 山田和芳, 吉田丈人, 吉田丈人

    日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会講演要旨集　2020　2020年

  67. 生物個体群は移入先の環境にどのように適応するか:湖沼堆積物と休眠卵を用いた,長野県深見池におけるミジンコ個体群の環境適応の分析

    大竹裕里恵, 大槻朝, 占部城太郎, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 印南秀樹, 木村成子, 山田和芳, 吉田丈人, 吉田丈人

    日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web)　22nd　2020年

  68. 日本産トビカズラ属植物(マメ科)の遺伝的多様性

    平塚健一, 阪口翔太, 阪口翔太, 阿部篤志, 大谷拓也, 石川智昇, 長澤淳一, 陶山佳久, 松尾歩, 瀬戸口浩彰, 瀬戸口浩彰

    日本植物園協会誌　(55)　2020年

    ISSN： 0389-5246

  69. シイタケ原木栽培における特定防除資材を用いた病原菌対策に関する研究 IV-食酢を施用したときのシイタケ子実体収量への影響-

    宮崎和弘, 木下晃彦, 福井陸夫, 倉島治, 大林夏湖, 伊藤元己, 陶山佳久

    九州森林学会大会(Web)　76th　2020年

  70. きわめて多型なダイモンジソウ(広義)は複数の分類群を含むのか-分子系統地理学的解析による種内遺伝的分化の実態の解明-

    白石大晴, 藤井伸二, 陶山佳久, 松尾歩, 牧雅之

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　19th　2020年

  71. メドハギの葉緑体DNA変異の地理的分布について

    今西純一, 今西亜友美, 陶山佳久, 井鷺裕司

    2019年度日本景観生態学会第29回京都大会, 京都先端科学大学太秦キャンパス, 京都　2019年6月

  72. 自生および外国産コマツナギにおける葉緑体ゲノムの遺伝的差異

    今西亜友美, 今西純一, 陶山佳久, 井鷺裕司

    2019年度日本景観生態学会第29回京都大会, 京都先端科学大学太秦キャンパス, 京都　2019年6月

  73. 緑化植物メドハギの遺伝的地域性について

    今西純一, 今西亜友美, 陶山佳久, 井鷺裕司

    2019年度日本造園学会全国大会, 筑波大学筑波キャンパス, 茨城　2019年5月

  74. 在来緑化植物ヨモギの形態および遺伝的組成の地理的変異と緑化法面における個体の由来

    我妻総, 下野嘉子, 今西純一, 陶山佳久, 松尾歩, 満行知花, 綱本良啓, 冨永達

    日本生態学会第66回全国大会, 神戸国際会議場・神戸国際展示場, 兵庫　66th　2019年3月

  75. 同所的に生育するエチゼンダイモンジソウとダイモンジソウの遺伝構造比較

    孫田佳奈, 阪口翔太, 廣田峻, 綱本良啓, 陶山佳久, 赤井賢成, 瀬戸口浩彰

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.P1‐131 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  76. MIG‐seqとマルチDNAバーコーディングによるNGSベースの種・品種識別

    松尾歩, 廣田峻, 綱本良啓, 満行知花, 岡野邦宏, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.P2‐281 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  77. 希少種の保全価値評価と効果的な保全

    井鷺裕司, 牧野能士, 津田吉晃, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.W07‐1 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  78. 国内希少野生動植物種のヤクシマソウは雑種を形成するのか?

    西岡龍樹, 末次健司, 陶山佳久, 松尾歩, 井鷺裕司

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.P1‐160 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  79. 硫気孔原土壌への進出による遺伝的帰結

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 後藤隼, 福島慶太郎, 井鷺裕司, 陶山佳久, 綱本良啓, 阪口翔太

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.P1‐132 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  80. 同所的近縁種の多い熱帯樹木(Syzygium属)の交雑解析

    辰巳茉優, 奥野聖也, TAN Sylvester, MOHAMAD B. Mohizah, 永野惇, 手塚あゆみ, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 名波哲, 伊東明

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.P1‐121 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  81. チシマザサ個体群の長期動態:一斉枯死後の回復過程とクローン成長の寄与

    富松裕, 谷口稜太郎, 工藤恵梨, 金子悠一郎, 松尾歩, 齋藤智之, 陶山佳久, 蒔田明史

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　ROMBUNNO.K02‐02 (WEB ONLY)　2019年2月9日

  82. ベトナムのランビアン山における樹木の種構成と開花・結実フェノロジー

    永濱藍, 田金秀一郎, MENG Zhang, 土屋考人, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 森塚絵津子, NGOC Nguyen Van, BINH Hoang Thi, 永益英敏, 内貴章世, 遠山弘法, 矢原徹一

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　18th (CD-ROM)　2019年

  83. ハビタツトの違いは遺伝構造に影響するか;滝に生きるエチゼンダイモンジソウと姉妹種の比較

    孫田佳奈, 阪口翔太, 廣田峻, 綱本良啓, 陶山佳久, 赤井賢成, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　18th (CD-ROM)　2019年

  84. ゲノムワイドなSNP情報を用いた水生植物アギナシ(オモダカ科)の集団遺伝解析

    坪田和真, CHOI Hyeok-Jae, 陶山佳久, VOLKOVA Polina A., 松尾歩, 綱本良啓, 廣田峻, 志賀隆

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　18th (CD-ROM)　2019年

  85. 多雪がヒノキアスナロの樹形と遺伝構造に与える影響

    内木翔大, 松尾歩, 陶山佳久, HASEGAWA Yoichi, 阿部晴恵, 崎尾均

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　2019年

  86. mtDNA及びゲノムワイドSNPに基づくモリアオガエルの分子系統

    阿部晴恵, 塩崎大, 廣田峻, 陶山佳久, 長谷川雅美

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　2019年

  87. 佐渡島の多雪環境がヒノキアスナロの樹形と群落構造に与える影響

    内木翔大, 阿部晴恵, HASEGAWA Yoichi, 松尾歩, 陶山佳久, 崎尾均

    日本森林学会大会学術講演集　130th　2019年

    ISSN： 2187-6576

  88. アオサンゴの隠蔽系統分布と異時的種分化の可能性

    谷中絢貴, RICHARDS Zoe T., TANG Sen-Lin, 和田直久, 陶山佳久, 菊地泰生, 井口亮, 本郷悠貴, 安田仁奈

    DNA多型　27　(1)　2019年

    ISSN： 2188-3815

  89. 東南アジアの植物多様性評価

    田金秀一郎, 満行知花, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　66th　2019年

  90. MIG-seq解析を用いた襲速紀要素ハガクレツリフネの分子系統地理学的検証と集団動態推定

    村山(竹下)香織, 渡邊幹男, 満行知花, 松尾歩, 岩崎貴也, 陶山佳久, 藤井紀行

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　18th (CD-ROM)　2019年

  91. 2018年度神奈川大学総合理学研究所共同研究助成論文 腊葉標本DNAのMIG-seq法による利用可能性・解析手法の検討

    岩崎 貴也, 小玉 あすか, 松尾 歩, 陶山 佳久, 大西 亘, 尾関 雅章, 中濱 直之, 山本 薫

    Science journal of Kanagawa University = 神奈川大学理学誌　30　89-96　2019年

    出版者・発行元： 神奈川大学総合理学研究所

    ISSN： 1880-0483

  92. ブナ天然分布北進最前線集団における由来推定の試み

    北村 系子, 津田 吉晃, 今井 亮介, 松尾 歩, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　114-114　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_114 　

    詳細を見る 詳細を閉じる

    <p>ブナ天然林の分布北限は北海道渡島半島北部にあり、現在分布を北に拡大していると考えられる。既知の北限ラインから北へ１２km離れた地点に新たに北進最前線と考えられるブナの小集団が発見された。当該集団は数十個体の成熟木と若木、稚樹からなり、実生繁殖も行われている。周辺にはブナ集団あるいはブナの個体は発見されていないことから、既知の北限集団から種子が運ばれて定着した創始者集団だと考えられる。この集団を構成するブナはどの集団に由来するかを探るために、既知の北限ラインに位置する隔離小集団、北限地帯の比較的大面積の集団とともに、核マイクロサテライト、EST-SSR、MIGseqデータによる解析を行った。いずれの集団についても過去の集団減少パターンがみられたが、その減少強度や時期は集団によって異なっていた。ブナは北限に近づくほど遺伝的多様性が低くなることが知られているとおり、新たに発見された北進最前線集団の遺伝的多様性は低く、有効な集団サイズも小さかった。また、この集団への遺伝子流動も小さいことことが示唆された。これらの時間スケールの評価について現在解析を進めている。</p>

  93. 吉原佑氏宮地賞受賞総説論文へのコメント

    陶山 佳久

    日本生態学会誌　69　(1)　11-12　2019年

    出版者・発行元： 一般社団法人 日本生態学会

    DOI： 10.18960/seitai.69.1_11 　

    ISSN： 0021-5007

  94. 衰退過程にあるスズタケの景観的遺伝構造：MIG-seqによる解析

    鈴木 智之, 綱本 良啓, 松尾 歩, 下野 綾子, 久本 洋子, 蒔田 明史, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　130　(0)　603-603　2019年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.130.0_603 　

    ISSN： 2187-6576

    詳細を見る 詳細を閉じる

    <p>奥秩父山地のスズタケは、2000年頃以降のニホンジカの個体数増加と2010年代前半の広域的な開花枯死の結果、現在は局所的な低密度のパッチが残るのみである。本研究では、衰退過程にある秩父山地のスズタケの遺伝構造を景観レベルで解析し、現在の遺伝的多様性を評価した。 2016年に、東京大学秩父演習林（約6千ha）のほぼ全域よりスズタケの葉を約300サンプル採取した。また、すでにスズタケが消失した区域において2005年・2010年に採取されたサンプルも一部使用した。このうち263サンプルをMIG-seq法によってゲノムワイドの一塩基多型を解析した。 遺伝的集団構造解析の結果、地理的な位置に対応した複数の遺伝的グループが検出された。大きく２グループに分類した場合、演習林内で東西に走る荒川およびその主支流を境として主に分布がわかれていた。さらに細かく５グループに分類した場合、荒川の北側の特定の柵内とすでに消失した区域のみでみられる遺伝的グループが認められた。これはスズタケの衰退の過程で、特定の遺伝的グループが縮小したことを示唆すると考えられた。またクローン識別の結果、広域にわたり特定のジェネットのみが残る場所も認められた。</p>

  95. Analysis on genetic characteristics of Lespedeza cuneata utilized for revegetation works in Japan using MIG-seq

    Imanishi, J, Imanishi, A, Suyama, Y, Isagi, Y

    International Consortium of Landscape and Ecological Engineering (ICLEE) 9th Conference, Taichung, Taiwan　2018年11月

  96. 同所的に生育するエチゼンダイモンジソウとダイモンジソウの遺伝構造比較

    孫田佳奈, 阪口翔太, 廣田峻, 綱本良啓, 陶山佳久, 赤井賢成, 瀬戸口浩彰

    日本植物学会大会研究発表記録　82nd　181　2018年9月1日

  97. MIG-seqによるメドハギ類の緑化用種子および緑化法面生育個体の遺伝的特徴の解析

    今西純一, 今西亜友美, 陶山佳久, 井鷺裕司

    第49回日本緑化工学会大会研究交流発表会, 東京都市大学横浜キャンパス, 神奈川　2018年9月

  98. 日華区系におけるイワユキノシタ属の隔離分布形成史と繁殖システムの進化

    阪口翔太, 高橋大樹, 瀬戸口浩彰, 綱本良啓, 陶山佳久, QIU Yingxiong, LI Pan, LU Ruisen, 井鷺裕司

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　17th　29　2018年3月6日

  99. 硫気孔原植物ヤマタヌキランの起源と遺伝的特性

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 後藤隼, 福島慶太郎, 井鷺裕司, 陶山佳久, 綱本良啓, 阪口翔太

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　17th　7　2018年3月6日

  100. 牡鹿半島狐崎浜沿岸におけるアラメ個体群間の遺伝子交流と遊走子の分散距離

    鈴木はるか, 青木智也, 満行知花, 綱本良啓, 陶山佳久, 吾妻行雄, 青木優和

    藻類　66　(1)　2018年

    ISSN： 0038-1578

  101. MIG-seq法を用いた在来2倍体タンポポの遺伝的集団構造

    満行知花, 渡邊幹男, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　65th　2018年

  102. ニューカレドニアで適応放散したシソ科植物Oxera baladicaの全分布域を対象とした遺伝的集団構造解析

    藤田琴実, 満行知花, 綱本良啓, 井鷺裕司, GATEBLE Gildas, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　65th　2018年

  103. 屋久島の国有林におけるヤクシカの餌植物~次世代シーケンサーを用いたヤクシカ糞の植物DNA解析~

    東悠斗, 矢原徹一, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　65th　ROMBUNNO.P2‐153 (WEB ONLY)　2018年

  104. ダイズの生産性の向上を目指した無限伸育型と有限伸育型の混植栽培:第三報 葉面積垂直分布の非破壊的簡易推定

    川村 一成, 斎藤 大暉, 定池 歩美, 本間 香貴, 中嶋 孝幸, 陶山 佳久, 伊藤 豊彰

    日本作物学会講演会要旨集　246　(0)　107-107　2018年

    出版者・発行元： 日本作物学会

    DOI： 10.14829/jcsproc.246.0_107 　

  105. ダイズの生産性の向上を目指した無限伸育型と有限伸育型の混植栽培:第二報 子実重/葉面積比に与える影響

    斎藤 大暉, 小川 桃子, 川村 一成, 定池 歩美, 本間 香貴, 中嶋 孝幸, 伊藤 豊彰, 陶山 佳久

    日本作物学会講演会要旨集　246　(0)　28-28　2018年

    出版者・発行元： 日本作物学会

    DOI： 10.14829/jcsproc.246.0_28 　

  106. MIG‐seqによるホトトギス属の系統分類:特にむかごを形成するTricyrtis sp.の系統的位置づけについて

    中舛理玖, 井上康彦, 陶山佳久, 綱本良啓, 阪口翔太, 瀬戸口浩彰

    日本植物学会大会研究発表記録　81st　149　2017年9月1日

  107. The geographical distribution of genetic variation of Lespedeza cuneata (Dum.Cours.) G.Don

    Imanishi, A, Imanishi, J, Kimura, M, Mitsuyuki, C, Tsunamoto, Y, Isagi, Y, Suyama, Y

    International Consortium of Landscape and Ecological Engineering (ICLEE) 8th Conference, September 22-25, 2017, Nagoya, Japan　2017年9月

  108. Comparisons of morphological and genetic variations between native and foreign Artemisia indica populations used for revegetation in Japan

    Wagatsuma, S, Shimono, Y, Imanishi, J, Suyama, Y, Mitsuyuki, C, Tsunamoto, Y, Tominaga, T

    The 26th Asian-Pacific Weed Science Society Conference (APWSS), September 19-22, 2017, Kyoto, Japan　2017年9月

  109. 東南アジア熱帯低地林におけるマメ科樹木のMIG‐seq法による集団遺伝学的解析

    平田萌子, 満行知佳, CHHANG Phourin, 田金秀一郎, 遠山弘法, 森塚絵津子, 楠見淳子, SOKH Heng, 矢原徹一, 陶山佳久, 手島康介, 舘田英典

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集　89th　103　2017年8月28日

  110. MIG‐seq法によって明らかになった琵琶湖での劇的な形態の変化:タニシ科貝類を例として

    平野尚浩, 齊藤匠, 中井克樹, 綱本良啓, 陶山佳久, 千葉聡, 千葉聡

    日本貝類学会大会研究発表要旨集　2017　13　2017年4月10日

  111. 在来緑化植物ヨモギの外国産緑化個体と 在来個体間の形態および遺伝構造の比較

    我妻総, 下野嘉子, 今西純一, 陶山佳久, 満行知花, 綱本良啓, 冨永達

    日本雑草学会第56回大会, シーガイアコンベンションセンター, 宮崎　56th　2017年4月

  112. ゲノムワイドSNP解析によるムカゴを形成するホトトギス属植物の系統的位置づけ

    中舛理玖, 井上康彦, 陶山佳久, 綱本良啓, 阪口翔太, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　16th　26　2017年3月5日

  113. Mix Cropping Trial of Determinate and Indeterminate Soybean Lines in Kawatabi Field Science Center

    SADAIKE Ayumi, OGAWA Momoko, HOMMA Koki, ITO Toyoaki, NAKAJIMA Takayuki, SUYAMA Yoshihisa, IIZUKA Shinji, KARUBE Isao, MOTOYAMA Yoshiaki, KATO Shin

    Journal of Integrated Field Science　14　113-113　2017年3月

    出版者・発行元： Field Science Center, Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University

    ISSN： 2433-6122

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    Poster Sessions

  114. ウシルーメン液によるメタン発酵前処理過程の微生物群集構造解析

    馬場保徳, 馬場保徳, 馬場保徳, 松木悠, 馬場(森)裕美, 馬場(森)裕美, 陶山佳久, 多田千佳, 福田康弘, 三宅克英, 齋藤雅典, 中井裕

    日本生物工学会大会講演要旨集　69th　2017年

  115. ウシルーメン液による植物バイオマス可溶化処理およびその後のメタン発酵過程の微生物群集構造解析

    馬場保徳, 馬場保徳, 馬場保徳, 松木悠, 馬場(森)裕美, 馬場(森)裕美, 陶山佳久, 多田千佳, 福田康弘, 三宅克英, 齋藤雅典, 中井裕

    日本微生物生態学会大会(Web)　2017　2017年

  116. ゲノムワイド塩基配列多型検出のためのMIG-seq法試料として,さく葉標本から抽出したDNAは使用可能か?

    伊藤元己, 加藤俊英, 森重剛志, 上原浩一, 海老原淳, 綱本良啓, 満行知花, 陶山佳久

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　16th　2017年

  117. 次世代型シークエンサーを用いた日本におけるアザミ属(Cirsium)の系統解析

    森重剛志, 渡辺洋一, 伊藤元己, 加藤俊英, 陶山佳久, 綱本良啓, 満行知花, 上原浩一

    日本植物分類学会大会研究発表要旨集　16th　2017年

  118. MIG-seq法のバージョンアップ:複数種を用いた検討によるライブラリー構築方法の改良

    綱本良啓, 満行知花, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　64th　2017年

  119. 特異な分布を示す海浜性の絶滅危惧植物バシクルモンにおける地理的遺伝構造

    大谷雅人, 満行知花, 池田明彦, 指村奈穂子, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　64th　2017年

  120. グッピーの“少数派好き“が受ける恩恵:カラーパターンの違いは遺伝的距離を反映するか?

    稲田垂穂, 青木翔子, 酒井祐輔, 満行知花, 鶴井香織, 辻和希, 陶山佳久, 河田雅圭

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　64th　2017年

  121. 東南アジアに生息するカブトガニ科2種の遺伝的集団構造

    野上凌, 西田伸, YUSLI Wardianto, HANDOKO Adi Susanto, ALI Masher, IRFAN Yulianto, IRZAL Azhar, MING Che Yang, 満行知花, 陶山佳久, 楠見淳子

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集　89th　2017年

  122. 日本産タニシ科貝類の進化史の解明

    平野尚浩, 齊藤匠, 中井克樹, TU Do Van, PROZOROVA Larisa, BIN Ye, 綱本良啓, 陶山佳久, 千葉聡

    日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会講演要旨集　2017　91　2017年

  123. MIG‐seq法によって明らかになった琵琶湖での劇的な形態の変化:タニシ科貝類を例として

    平野尚浩, 齊藤匠, 中井克樹, 綱本良啓, 陶山佳久, 千葉聡, 千葉聡

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　64th　ROMBUNNO.P2‐L‐356 (WEB ONLY)　2017年

  124. 著しい適応放散を示すニューカレドニア産Oxera属植物(シソ科)の保全ゲノミクス

    内山憲太郎, 上野真義, 成田あゆ, GATEBLE Gildas, 陶山佳久, 永野惇, 井鷺裕司

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　64th　ROMBUNNO.S10‐3 (WEB ONLY)　2017年

  125. MIG‐seq法を用いたクスノキ科シロダモ属の系統関係解析

    満行知花, 田金秀一郎, 矢原徹一, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　64th　ROMBUNNO.P2‐K‐331 (WEB ONLY)　2017年

  126. イタドリにみられる地理的変異の解明－在来緑化植物の地域性の検討に向けて－

    木村元則, 今西純一, 今西亜友美, 井鷺裕司, 陶山佳久, 柴田昌三

    第47回日本緑化工学会大会研究交流発表会, 京都府立大学, 京都　2016年10月

  127. Conservation Genetics of Three Endangered Species of the Genus Oxera in the South of New Caledonia

    FUJITA Kotomi, ISAGI Yuji, GATEBLE Gildas, FUSHIMI Manato, SUYAMA Yoshihisa

    Journal of Integrated Field Science　13　54-54　2016年3月

    出版者・発行元： Field Science Center, Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University

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    Poster Presentations

  128. Plant Paleogenetics with Plant Macro-Remains from the Last Glacial Maximum

    TANNO Takane, TAKAHARA Hikaru, SUYAMA Yoshihisa

    Journal of Integrated Field Science　13　55-55　2016年3月

    出版者・発行元： Field Science Center, Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University

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    Poster Presentations

  129. 伊豆から小笠原諸島におけるヒサカキの遺伝的構造

    阿部晴恵, 須貝杏子, 松木悠, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　63rd　2016年

  130. 沖縄の移入グッピー集団における色覚の遺伝的分化

    酒井祐輔, 稲田垂穂, 青木翔子, 鶴井香織, 満行知花, 陶山佳久, 辻和希, 河田雅圭

    日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web)　18th　2016年

  131. NGSを利用したチシマザサのジェネット内SNPs変異

    岡野邦宏, 松尾歩, 蒔田明史, 鈴木準一郎, 陶山佳久, 井上みずき

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　63th　P2‐217 (WEB ONLY)　2016年

  132. ダイズの生産性の向上を目指した無限伸育型と有限伸育型の混植栽培:１．2016年の栽培試験結果

    定池 歩美, 小川 桃子, 本間 香貴, 伊藤 豊明, 陶山 佳久, 飯塚 信二, 軽部 功, 本山 義明, 加藤 信

    日本作物学会講演会要旨集　243　(0)　60-60　2016年

    出版者・発行元： 日本作物学会

    DOI： 10.14829/jcsproc.243.0_60 　

  133. ウシルーメン液による植物バイオマス可溶化処理過程の16S rRNAメタゲノム解析:endo-/exo-glucanaseおよびxylanase生産細菌の推定

    馬場保徳, 馬場保徳, 松木悠, 森裕美, 陶山佳久, 多田千佳, 福田康弘, 齋藤雅典, 中井裕

    日本生物工学会大会講演要旨集　67th　2015年

  134. 絶滅危惧植物の全個体ジェノタイピングによる保全遺伝学的研究

    陶山 佳久, 井鷺 裕司

    森林遺伝育種 = Forest genetics and tree breeding　4　139-142　2015年

    出版者・発行元： 森林遺伝育種学会

    ISSN： 2187-3453

  135. Inference of the history and population structure of Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequence analysis 査読有り

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Kousuke Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    GENES & GENETIC SYSTEMS　89　(6)　313-313　2014年12月

    ISSN： 1341-7568

    eISSN： 1880-5779

  136. 日本の森林樹木の地理的遺伝構造（7）オオシラビソ（マツ科モミ属）

    陶山佳久

    森林遺伝育種　3　(4)　173-178　2014年10月

  137. Molecular- and pollen-based vegetation analysis in lake sediments from central Scandinavia (vol 22, pg 3511, 2013)

    Laura Parducci, Irina Matetovici, Sonia L. Fontana, K. D. Bennett, Yoshihisa Suyama, James Haile, Kurt H. Kjaer, Nicolaj K. Larsen, Andreas D. Drouzas, Eske Willerslev

    MOLECULAR ECOLOGY　23　(4)　986-986　2014年2月

    DOI： 10.1111/mec.12677 　

    ISSN： 0962-1083

    eISSN： 1365-294X

  138. 花粉一粒分析を用いた植物生態学的研究

    阿部晴恵, 松木悠, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨(Web)　61st　2014年

  139. 生物地理学とその関連分野における地理情報システム技術の基礎と応用

    岩崎 貴也, 阪口 翔太, 横山 良太, 高見 泰興, 大澤 剛士, 池田 紘士, 陶山 佳久

    日本生態学会誌　64　(3)　183-199　2014年

    出版者・発行元： 日本生態学会暫定事務局

    DOI： 10.18960/seitai.64.3_183 　

    ISSN： 0021-5007

    詳細を見る 詳細を閉じる

    生物地理学は、歴史的側面や生態的側面などの観点から、生物の分布パターンや分布形成プロセスの解明を目指す学問であり、進化生態学や群集生態学、保全生物学などの分野とも強い関連をもつ学際的領域である。1990年代以降、遺伝解析技術の恩恵を受けた系統地理学の隆盛によって、生物地理学は大きな発展を遂げてきた。さらに近年では「地理情報システム(GIS)」や、それを利用した「気候シミュレーション」、「生態ニッチモデリング」といった新たな解析ツールが、生物地理学分野に新しい流れを生み出しつつある。その基礎的な活用例として、現在の生物種の分布情報と気候要因から生態ニッチモデルを構築し、気候シミュレーションから得られた異なる時代の気候レイヤに投影するというアプローチが挙げられる。これにより、過去や現在、未来における生物の分布を予測することが可能となり、時間的な分布変化を推定することができる。さらに、GISを活用して、モデル化された生態ニッチや系統地理学的データを複合的に解析することで、近縁種間でのニッチ分化や、分布変遷史を考慮に入れた種分化要因の検証、群集レベルでの分布変遷史の検証なども可能となる。本総説では、最初に基礎的な解析ツールについて解説した後、実際にこれらのツールを活用した生物地理学とその関連分野における研究例を紹介する。最後に、次世代シークエンシングによって得られる膨大な遺伝情報や古DNAデータの有用性について紹介した後、それらの情報を用いた生物地理学や関連分野における今後の展望について議論し、GIS技術がその中で重要な役割を果たしうることを示す。

  140. Inference of population structure of Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequence analysis 査読有り

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Kousuke Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    GENES & GENETIC SYSTEMS　88　(6)　385-385　2013年12月

    ISSN： 1341-7568

    eISSN： 1880-5779

  141. 日本産針葉樹の遺伝的多様性

    陶山佳久, 津村義彦

    地球環境　18　(2)　127-136　2013年10月

    出版者・発行元： 一般社団法人 国際環境研究協会

    ISSN： 1342-226X

  142. フィールドセンター北山地区針葉樹林地の土地被覆分類図および針葉樹種分類図

    米澤 千夏, 斎藤 元也, 浪波 史子, 杉原 鷹彦, 矢部 勝也, 陶山 佳久, 國井 大輔

    複合生態フィールド教育研究センター報告　(28)　25-27　2013年3月

    出版者・発行元： 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター

  143. 北スカンジナビアの北方林は最終氷河期から生き残っていた

    陶山佳久

    サイエンス誌に載った日本人研究者　21-21　2013年3月

    出版者・発行元： 米国科学振興協会（AAAS）

  144. 絶滅危惧種ヒダカソウ属(ヒダカソウ,キリギシソウ)の繁殖状況と遺伝的多様性

    阿部晴恵, 佐藤謙, 西川洋子, 島村崇志, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨集　60th　2013年

  145. The analysis of variety-specific genetic differentiation of Taxodium distichum: a coniferous tree on North America 査読有り

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    GENES & GENETIC SYSTEMS　87　(6)　399-399　2012年12月

    ISSN： 1341-7568

    eISSN： 1880-5779

  146. 日本の絶滅危惧樹木シリーズ(40)ーゴヨウザンヨウラクー

    陶山佳久

    林木の育種　245　20-22　2012年10月

  147. 6-4 実用規模の人工湿地から採取された土壌動物群集(6.土壌生物,2012年度鳥取大会)

    中村 和徳, 中野 和典, 矢野 篤男, 陶山 佳久, 西村 修

    日本土壌肥料学会講演要旨集　(58)　36-36　2012年9月4日

    出版者・発行元： 一般社団法人日本土壌肥料学会

    ISSN： 0288-5840

  148. 363 DNA analysis for identification of a Pinus pollen grain at subsection level from the Belukha glacier, Altai Mountains, Russia

    Nakazawa Fumio, Suyama Yoshihisa, Takeuchi Nozomu, Fujita Koji, Imura Satoshi, Kanda Hiroshi, Motoyama Hideaki

    日本花粉学会会誌　58　165-165　2012年8月23日

    出版者・発行元： 日本花粉学会

    ISSN： 0387-1851

  149. 研究室訪問シリーズ(18)—東北大学大学院農学研究科生物共生科学分野—

    陶山佳久

    林木の育種　244　(244)　25-27　2012年7月

    出版者・発行元： 林木育種協会

    ISSN： 0387-9119

  150. PK-18 ミミズ腸内微生物のメタトランスクリプトーム解析(PK 相互作用・共生,ポスター発表)

    中村 和徳, 牧野 能士, 陶山 佳久, 西村 修, 中野 和典

    日本微生物生態学会講演要旨集　(28)　174-174　2012年

    出版者・発行元： 日本微生物生態学会

  151. ベルーハ氷河中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析から導き出された花粉長距離輸送の可能性

    中澤 文男, 陶山 佳久, 竹内 望, 藤田 耕史, 伊村 智, 本山 秀明

    雪氷研究大会　2012　(0)　218-218　2012年

    出版者・発行元： 公益社団法人 日本雪氷学会／日本雪工学会

    DOI： 10.14851/jcsir.2012.0_218 　

    ISSN： 1883-0870

  152. 落葉広葉樹クリの送受粉システム：雌花上の花粉組成と母樹による花粉選択

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    林木の育種　(240)　12-21　2011年7月25日

    出版者・発行元： 林木育種協会

    ISSN： 0387-9119

  153. 絶滅危惧植物ゴヨウザンヨウラクの遺伝的多様性の評価

    阿部晴恵, 牧雅之, 堀江佐知子, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨集　58th　2011年

  154. 高山における絶滅危惧植物保全のための全個体ジェノタイピング

    陶山佳久, 阿部晴恵

    日本生態学会大会講演要旨集　58th　2011年

  155. PA-040 鉛直流型人工湿地ろ過層内における微生物及び動物相の解析(PA 水処理生態系,ポスター発表)

    中村 和徳, 中野 和典, 矢野 篤男, 陶山 佳久, 西村 修

    日本微生物生態学会講演要旨集　(27)　75-75　2011年

    出版者・発行元： 日本微生物生態学会

  156. ブナの小集団化が花粉を介した遺伝子流動と堅果生産性におよぼす影響

    花岡 創, 小谷 二郎, 伊藤 圭佑, 陶山 佳久, 戸丸 信弘, 向井 譲

    日本森林学会大会発表データベース　122　(0)　184-184　2011年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.122.0.184.0 　

  157. 節レベルでの識別を目的としたベルーハ氷河中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析

    中澤 文男, 植竹 淳, 陶山 佳久, 金子 亮, 竹内 望, 藤田 耕史, 本山 秀明, 神田 啓史

    雪氷研究大会講演要旨集　2011　(0)　55-55　2011年

    出版者・発行元： 公益社団法人 日本雪氷学会／日本雪工学会

    DOI： 10.14851/jcsir.2011.0.55.0 　

    ISSN： 1883-0889 1883-0870

  158. 広葉樹の遺伝的多様性を守るために

    津村義彦, 松本麻子, 上野真義, 津田吉晃, 吉丸博志, 高橋誠, 武津英太郎, 岩田洋佳, 陶山佳久, 斉藤陽子, 井出雄二, 小山泰弘, 戸丸信弘, 向井譲

    森林総合研究所研究成果選集　2010　20-21　2010年7月

    ISSN： 1348-9828

  159. The relationship between reproductive success and clonal structure in a simultaneous flowering population of the monocarpic dwarf bamboo, Sasa veitchii var. hirsuta.(Biological Interactions in Arable Land-Grassland-Forest Continuums and their Impact on the Ecosystem Functions, 7th International Symposium on Integrated Field Science)

    MATSUO A., SUYAMA Y., SHIBATA S., MAKITA A.

    Journal of Integrated Field Science　7　117-117　2010年3月

    出版者・発行元： Field Science Center, Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University

  160. The bamboos - their mysterious life histories | (Japanese Source) Bamboos-(Japanese Source)

    Makita, A., Suzuki, J.-I., Suyama, Y.

    Japanese Journal of Ecology　60　(1)　45-50　2010年3月1日

    ISSN： 0021-5007

  161. The relationship between rhizome habits and spatial distribution pattern of genets in two dwarf bamboos, Sasa veitchii var. hirsuta and Sasa kurilensis

    Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Akifumi Makita

    Japanese Journal of Ecology　60　(1)　81-88　2010年3月

    ISSN： 0021-5007

  162. For the comprehension of gregarious flowering in bamboos

    Yoshihisa Suyama, Jun Ichirou Suzuki, Akifumi Makita

    Japanese Journal of Ecology　60　97-106　2010年3月1日

    ISSN： 0021-5007

  163. 家畜糞コンポスト化過程に存在するアンモニア酸化菌の培養試験

    大石竜, 浅野亮樹, 多田千佳, 三宅英成, 山本希, 福田康弘, 陶山佳久, 中井裕

    日本水環境学会年会講演集　44th　2010年

  164. 高山における絶滅危惧植物の全個体ジェノタイピングに基づく保全策の構築-ヤクシマリンドウを例に

    阿部晴恵, 手塚賢至, 荒田洋一, 斎藤俊浩, 手塚田津子, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨集　57th　2010年

  165. 氷河試料中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析（２）

    中澤 文男, 植竹 淳, 陶山 佳久, 金子 亮, 竹内 望, 藤田 耕史, 本山 秀明, 神田 啓史

    雪氷研究大会講演要旨集　2010　(0)　93-93　2010年

    出版者・発行元： 公益社団法人 日本雪氷学会／日本雪工学会

    DOI： 10.14851/jcsir.2010.0.93.0 　

    ISSN： 1883-0889 1883-0870

  166. 48年周期で一斉開花したタケ（Melocanna baccifera）群落のジェネット構造と親子解析

    陶山 佳久, 齋藤 智之, 西脇 亜也, 蒔田 明史, 柴田 昌三

    日本森林学会大会発表データベース　121　(0)　116-116　2010年

    出版者・発行元： 日本森林学会

  167. タケ・ササ類の開花様式の概念整理:-開花習性の進化を考えるために-

    蒔田 明史, 鈴木 準一郎, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　121　(0)　117-117　2010年

    出版者・発行元： 日本森林学会

  168. 48年周期で一斉開花するタケ：インド・ミゾラム州におけるMelocanna bacciferaの開花周期記録

    陶山佳久, 齋藤智之, 西脇亜也, 蒔田明史, 長谷川尚史, 柴田昌三

    時間生物学　15　(2)　12-16　2009年10月

  169. ブナの水利用特性の地理変異

    立石麻紀子, 熊谷朝臣, 陶山佳久, 日浦勉

    日本植物学会大会研究発表記録　73rd　81　2009年9月17日

  170. 異なる場所に生育するブナの蒸散特性

    立石麻紀子, 熊谷朝臣, 内海泰弘, 陶山佳久, 日浦勉

    日本生態学会大会講演要旨集　56th　283　2009年3月17日

  171. チュウゴクザサの一斉開花個体群を対象とした遺伝的多様性解析

    松尾歩, 陶山佳久, 齋藤智之, 住吉千夏子, 斎藤誠子, 井鷺裕司, 柴田昌三, 鈴木準一郎, 西脇亜也, 蒔田明史

    日本生態学会大会講演要旨集　56th　375　2009年3月17日

  172. Recent research topics in ecological and genetic approaches for sustainable forest management

    Seiwa K, Suyama Y

    Tohoku Journal of Agricultural Research　60　59-62　2009年3月

  173. 複数産地由来の苗木が植栽されたブナ造林地における生育状況の比較-地域性種苗を用いる必要性を示す実例として-

    小山泰弘, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨集　56th　2009年

  174. 自然再生事業のための遺伝的多様性の評価技術を用いた植物の遺伝的ガイドラインに関する研究

    津村義彦, 松本麻子, 上野真義, 津田吉晃, 吉丸博志, 菊地賢, 高橋誠, 武津英太郎, 岩田洋佳, 陶山佳久, 戸丸信弘, 向井譲, 斉藤陽子, 内山憲太郎, 井出雄二

    環境保全研究成果集(CD-ROM)　2009　ROMBUNNO.9　2009年

  175. 一斉開花年の異なるチュウゴクザサ集団間の遺伝的組成の比較

    斉藤 誠子, 柴田 昌三, 松尾 歩, 住吉 千夏子, 井鷺 裕司, 陶山 佳久, 西脇 亜也, 蒔田 明史

    日本森林学会大会発表データベース　120　(0)　789-789　2009年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.120.0.789.0 　

  176. タケ類の一斉開花直前の個体群構造ーインド・ミゾラム州におけるMelocanna baccifera

    齋藤 智之, 池田 邦彦, C.H.モンプイヤ, 陶山 佳久, 西脇 亜也, 蒔田 明史, 柴田 昌三

    日本生態学会第56回全国大会　2009年

  177. ブナの地理的変異と広葉樹種苗

    高橋 誠, 戸丸 信弘, 平岡 宏一, 原 正利, 藤井 紀行, 渡邉 敦史, 武津 英太郎, 小山 泰弘, 片井 秀幸, 陶山 佳久

    日本森林学会大会発表データベース　120　(0)　297-297　2009年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.120.0.297.0 　

  178. 一斉開花したチュウゴクザサ個体群における遺伝子流動

    住吉 千夏子, 蒔田 明史, 井鷺 裕司, 松尾 歩, 陶山 佳久, 齋藤 智之, 斎藤 誠子, 柴田 昌三, 西脇 亜也, 鈴木 準一郎

    日本森林学会大会発表データベース　120　(0)　788-788　2009年

    出版者・発行元： 日本森林学会

  179. 葉緑体SNPによるブナの系統地理学的の研究―分布域全体をほぼ網羅したハプロタイプ地図の作成―

    高橋誠, 原正利, 藤井紀行, 陶山佳久, 津田吉晃, 小山泰弘, 片井秀幸, 小谷二郎, 斎藤真己, 上野満, 伊藤聡, 小山浩正, 西川浩己, 小澤創, 宮崎祐子, 瀧井忠人, 和田覚, 島田博匡, 花岡創, 吉丸博志, 松本麻子, 渡邉敦史, 武津英太郎, 岩泉正和, 福田陽子, 橋本光司, 戸丸信弘

    日本生態学会大会講演要旨集　55th　256　2008年3月14日

  180. ブナの水利用様式の地理変異

    立石麻紀子, 熊谷朝臣, 陶山佳久, 日浦勉

    日本生態学会大会講演要旨集　55th　408　2008年3月14日

  181. 三宅島の噴火がヤブツバキの繁殖をめぐる花粉媒介系に与えた影響-鳥類が運ぶ花粉粒の直接遺伝解析

    阿部晴恵, 上野真義, 山本裕, 陶山佳久, 津村義彦, 長谷川雅美

    日本生態学会大会講演要旨集　55th　2008年

  182. 自然再生事業のための遺伝的多様性の評価技術を用いた植物の遺伝的ガイドラインに関する研究

    津村義彦, 松本麻子, 上野真義, 津田吉晃, 吉丸博志, 菊地賢, 高橋誠, 武津英太郎, 岩田洋佳, 陶山佳久, 戸丸信弘, 向井譲, 斉藤陽子, 内山憲太郎, 井出雄二, 市河三英

    環境保全研究成果集(CD-ROM)　2008　ROMBUNNO.10　2008年

  183. 48年ごとに咲くタケ：インド・ミゾラム地方のメロカンナの一斉開花・更新

    柴田 昌三, 池田 邦彦, 陶山 佳久, 齋藤 智之, 長谷川 尚史, 箕口 秀夫, 西脇 亜也, 蒔田 明史

    第55回日本生態学会大会講演要旨集, p.142　2008年

  184. Mautam – Melocanna baccifera flowering – Ecological sharacteristics and influence to the juhm agriculture

    Shibata, Shozo, Ikeda, Kunihiko, Lulmuanpuia, C, Suyama, Yoshihisa, Saito, Tomoyuki, Hasegawa, Hisashi, Nishiwaki, Aya, Makita, Akifumi

    Proceedings of International Conference, Improvement of Bamboo Productivity and Marketing for Sustainable Liveluhood, p.155-161　2008年

  185. ブナ葉緑体ハプロタイプの地理的分布とハプロタイプ間の類縁関係

    高橋誠, 原正利, 小山泰弘, 小谷二郎, 斎藤真己, 小澤創, 西川浩己, 陶山佳久, 菅野学, 渡邉敦史, 武津英太郎, 戸丸信弘

    日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM)　118th　N07-366　2007年4月1日

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.118.0.366.0 　

    ISSN： 1349-8517

  186. 花粉1粒の直接遺伝解析に基づくホオノキ訪花昆虫の送粉効率評価

    松木悠, 舘野隆之輔, 柴田銃江, 陶山佳久, 井鷺裕司

    日本生態学会大会講演要旨集　54th　113　2007年3月19日

  187. ブナの遺伝的地域特性に配慮した種苗配布範囲設定に関する分子系統地理学的研究

    菅野学, 陶山佳久, 原正利, 高橋誠, 渡邊敦史, 清和研二

    日本生態学会大会講演要旨集　54th　173　2007年3月19日

  188. 新緑のブナ林に「動き」を見る．－ブナの親子鑑定－

    陶山佳久

    岳人別冊春山2007　98　2007年2月

    出版者・発行元： 東京新聞出版局

  189. 自然再生事業のための遺伝的多様性の評価技術を用いた植物の遺伝的ガイドラインに関する研究

    津村義彦, 松本麻子, 上野真義, 津田吉晃, 吉丸博志, 菊池賢, 高橋誠, 武津英太郎, 岩田洋佳, 陶山佳久, 戸丸信弘, 向井譲, 斉藤陽子, 内山憲太郎, 市河三英

    環境保全研究成果集(CD-ROM)　2007　ROMBUNNO.12　2007年

  190. インド・ミゾラム州における竹類Melocanna bacciferaの開花について:大面積開花直前の状況について

    齋藤 智之, 陶山 佳久, 西脇 亜也, 蒔田 明史, C. H. モンプイヤ, 池田 邦彦, 阿部 佑平, 柴田 昌三

    日本森林学会大会発表データベース　118　(0)　303-303　2007年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.118.0.303.0 　

  191. クローン構造からみた一斉開花枯死後のチシマザサ群落の回復過程

    松尾 歩, 山月 融心, 陶山 佳久, 藤 晋一, 蒔田 明史

    日本森林学会大会発表データベース　118　(0)　364-364　2007年

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jfsc.118.0.364.0 　

  192. The crossing pattern of Pinus pumila, P. parviflora var. pentaphylla, and their natural hybrid in Mt. Apoi, revealed by seed genotyping

    ITO Megumi, OHSAWA Takeshi A., WATANO Yasuyuki, SUYAMA Yoshihisa

    Journal of plant research　119　52-52　2006年12月1日

    ISSN： 0918-9440

  193. 体表付着花粉の遺伝子型解析によるホオノキ訪花昆虫の送粉特性解析

    松木悠, 井鷺裕司, 陶山佳久, 舘野隆之輔, 柴田銃江

    日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM)　117th　M01　2006年4月3日

    DOI： 10.11519/jfsc.117.0.9.0 　

    ISSN： 1349-8517

  194. 分子系統地理学的解析を用いた宮城県内におけるブナ苗木の流通許容範囲の推定

    菅野学, 陶山佳久, 原正利, 高橋誠, 渡邊敦史, 清和研二

    日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM)　117th　M23　2006年4月3日

    DOI： 10.11519/jfsc.117.0.31.0 　

    ISSN： 1349-8517

  195. 北海道の亜高山性針葉樹林におけるエゾマツの繁殖構造および花粉動態

    富田基史, 斎藤秀之, 陶山佳久

    日本生態学会大会講演要旨集　53rd　232　2006年3月24日

  196. 自然再生事業のための遺伝的多様性の評価技術を用いた植物の遺伝的ガイドラインに関する研究

    津村義彦, 松本麻子, 上野真義, 津田吉晃, 吉丸博志, 菊地賢, 岩田洋佳, 陶山佳久, 戸丸信弘, 向井譲, 斉藤陽子, 市河三英

    環境保全研究成果集(CD-ROM)　2006　ROMBUNNO.13　2006年

  197. 八甲田山のオオシラビソー分布変遷の果てにー

    陶山佳久

    森林科学　43　(43)　110-114　2005年2月1日

    出版者・発行元： 日本森林学会

    DOI： 10.11519/jjsk.43.0_110 　

    ISSN： 0917-1908

  198. 遺伝子の指紋 ; AFLP分析を用いた森林構造の解明-ササ群落の隠された構造を暴く-

    陶山佳久

    森の分子生態学 遺伝子が語る森林のすがた　2005年

    出版者・発行元： 文一総合出版

  199. 自然再生事業のための遺伝的多様性の評価技術を用いた植物の遺伝的ガイドラインに関する研究

    津村義彦, 松本麻子, 上野真義, 吉丸博志, 菊池賢, 岩田洋佳, 陶山佳久, 戸丸信弘, 向井譲, 市河三英

    環境保全研究成果集(CD-ROM)　2005　ROMBUNNO.16　2005年

  200. 冷温帯落葉広葉樹林における地形と樹木種の分布パターンとの関係(投稿論文, 研究報告)

    寺原 幹生, 山崎 実希, 加納 研一, 陶山 佳久, 清和 研二, Mikio TERABARU, Miki YAMAZAKI, Ken-ichi KANOU, Yosihisa SUYAMA, Kenji SEIWA, 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター複合陸域生産システム部博士課程前期, 東北大学大学院農学研究科, 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター複合陸域生産システム部:東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター技術部, 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター複合陸域生産システム部:東北大学大学院資源生物科学専攻・植物生産科学講座生物共生科学分野, 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター複合陸域生産システム部:東北大学大学院資源生物科学専攻・植物生産科学講座生物共生科学分野

    複合生態フィールド教育研究センター報告 = Bulletin of Integrated Field Science Center　20　21-26　2004年12月27日

    出版者・発行元： 東北大学大学院農学研究科附属複合生態フィールド教育研究センター

  201. 森林の更新過程解析のための分子生態学的アプローチ：母方由来・両親由来組織のDNA分析による樹木実生の親木特定法

    陶山佳久

    日本生態学会誌　54　(3)　261-265　2004年12月

    出版者・発行元： 一般社団法人 日本生態学会

    DOI： 10.18960/seitai.54.3_261 　

    ISSN： 0021-5007

  202. 母方由来組織のマイクロサテライト分析による樹木種子・果実・実生の種子親特定

    陶山佳久

    日本林学会誌　86　(2)　177-183　2004年5月16日

    出版者・発行元： THE JAPANESE FORESTRY SOCIETY

    DOI： 10.11519/jjfs1953.86.2_177 　

    ISSN： 0021-485X

    詳細を見る 詳細を閉じる

    多型性の高いマイクロサテライトマーカーを用いれば, 植物自然個体群における親子解析が可能である。しかし,種子親から散布されて両親ともに不明になった次世代については, 両親に由来するDNAの遺伝子型解析によって正確な母性•父性解析を行うことは困難である。そこで本総説では, 種子親特定のための新しいアプローチとして, 母方由来組織のDNAを用いる方法に注目した。種子•果実•実生に付随している果皮などの母方由来組織の遺伝子型はその種子親の遺伝子型と同じであるため, マイクロサテライト分析を用いた遺伝子型の照合によって, 散布後の次世代についても正確に種子親を特定できる。ただし, 母方由来組織の多くからは高品質DNAを得ることが難しいため, DNA抽出•精製法の選択,PCR時のアニーリング温度の設定, フラグメントサイズの格差が大きい場合の遺伝子型判読には特に注意が必要である。これらの点に留意して適切な解析を行えば, 本手法は樹木の種子散布や繁殖成功など, 植物繁殖生態に関する研究において大きな役割を果たすだろう。

  203. 森林研究における分子生態学的アプローチ

    陶山佳久

    林木の育種　(212)　24-29　2004年5月

  204. 花粉化石のDNA分析による植生変動および生物進化の研究

    陶山佳久, 河室公康, 高原光, 志知幸治, 吉丸博志, 木下勲, 吉村研介, 津村義彦

    月刊地球　号外　(42)　187-192　2003年9月1日

    出版者・発行元： 海洋出版

    ISSN： 0916-9733

  205. 植生変遷および生物進化データベースの構築に関する研究

    吉村研介, 河室公康, 志知幸治, 吉丸博志, 陶山佳久, 津村義彦

    月刊地球　号外　(42)　197-204　2003年9月1日

    出版者・発行元： 海洋出版

    ISSN： 0916-9733

  206. 北海道中央部の天然林におけるオニグルミの分布と更新状況(会員研究発表論文)

    松井 理生, 後藤 晋, 芝野 伸策, 木村 恵, 陶山 佳久

    日本林学会北海道支部論文集　(50)　68-69　2002年2月18日

    出版者・発行元： 北方森林学会

    ISSN： 0912-3342

  207. バイカル湖とシベリアタイガ,その起源と変遷に関する研究(その2) 査読有り

    志知 幸治, 吉丸 博志, 陶山 佳久

    水利科学　45　(6)　69-90　2002年

    出版者・発行元： 水利科学研究所

    ISSN： 0039-4858

  208. 遺伝子の指紋 : AFLP分析を用いた森林構造の解明-ササ群落の隠された構造を暴く-

    陶山佳久

    森の分子生態学　19-37　2001年

    出版者・発行元： 文一総合出版

  209. AFLPマーカーによるスギの連鎖地図

    松本麻子, 吉丸博志, 津村義彦, 陶山佳久, 村井正文, 長坂寿俊

    林木の育種　5-7　1999年2月

    ISSN： 0387-9119

  210. 林木のＤＮＡ分析法（３）核ＤＮＡの変異の分析(1) RFLP, PCR-RFLP

    陶山佳久

    林木の育種　(189)　38-41　1998年10月

    出版者・発行元： 林木育種協会

    ISSN： 0387-9119

  211. AFLPマーカーによるスギ連鎖地図の作成

    松本麻子, 吉丸博志, 津村義彦, 陶山佳久, 長坂寿俊

    育種学雑誌　48　71　1998年9月

    ISSN： 0536-3683

  212. スギゲノム上の遺伝マーカー開発におけるAFLP法利用の試み

    松本麻子, 吉丸博志, 津村義彦, 陶山佳久, 長坂寿俊

    育種学雑誌　48　117　1998年4月

    ISSN： 0536-3683

  213. Sequoiadendron giganteumとSequoia sempervirensにおける種内のDNA変異

    戸丸 信弘, 津村 義彦, 陶山 佳久, LIBBY W. J.

    日本植物学会大会研究発表記録 = Proceedings of the annual meeting of the Botanical Society of Japan　61　167-167　1997年9月

  214. PCRベースの共優性マーカーを用いたTax odiumの集団遺伝学的解析

    津村 義彦, 戸丸 信弘, 陶山 佳久, S Bacchus

    日本植物学会大会研究発表記録 = Proceedings of the annual meeting of the Botanical Society of Japan　61　165-165　1997年9月

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書籍等出版物 14

  1. A Picture Guide for the Flora of Bidoup Nui Ba National Park I: Mt. Langbian

    2019年3月

  2. 植物学の百科事典

    陶山佳久

    丸善出版　2016年6月

  3. ブンイチvol. 1 2016

    陶山佳久

    文一総合出版　2016年4月1日

  4. 生物時計の生態学ーリズムを刻む生物の世界

    陶山佳久

    文一総合出版　2015年12月20日

    ISBN: 9784829962060

  5. 地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン

    津村義彦, 陶山佳久

    文一総合出版　2015年6月20日

    ISBN: 9784829965245

  6. Integrative Observations and Assessments

    Shin-Ichi Morinaga, Takaya Iwasaki, Yoshihisa Suyama

    Springer　2014年

    ISBN: 9784431547822

  7. 生態学者が書いたDNAの本 メンデルの法則から遺伝情報の読み方まで

    井鷺裕司, 陶山佳久

    文一総合出版　2013年10月20日

    ISBN: 9784829965221

  8. 森の分子生態学２

    津村義彦, 陶山佳久

    文一総合出版　2012年3月31日

  9. シリーズ現代の生態学８「森林生態学」

    正木隆, 陶山佳久

    共立出版　2011年10月15日

    ISBN: 9784320057364

  10. Single-Pollen Genotyping

    Y.Isagi, Y. Suyama

    Springer　2011年1月

    ISBN: 9784431539001

  11. 森の芽生えの生態学

    陶山佳久

    文一総合出版　2008年3月29日

  12. 森の分子生態学〜遺伝子が語る森林のすがた〜

    陶山佳久, 責任編集, 西脇亜也, 陶山佳久

    文一総合出版　2001年2月28日

  13. 地球環境変動の科学 -バイカル湖ドリリングプロジェクト-

    河室公康, 陶山佳久, 吉丸博志, 木下勲, 津村義彦, 河原孝行, 吉村研介

    古今書院　1998年11月

  14. 森の木の１００不思議

    陶山佳久

    東京書籍印刷㈱　1996年2月15日

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講演・口頭発表等 462

  1. 屋久島一湊川固有のヤクシマカワゴロモの遺伝的多様性評価とジェネット識別

    廣田峻, 布施健吾, 陶山佳久

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  2. ザゼンソウの発熱形質は寒冷適応に寄与するか

    佐藤光彦, 松尾歩, 大塚孝一, 高野(竹中)宏平, 牧雅之, 岡野邦宏, 陶山佳久, 稲葉靖子

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  3. 歴史的な降雪変化が日本の多雪依存植物チョウジギクの個体群に与えた遺伝的影響

    増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 廣田峻, 陶山佳久, 沢和浩, 福本繁, 石原正恵, 阿部晴恵, 坪井勇人, 丹後亜興, 森小夜子, 阪口翔太

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  4. 標本ゲノミクスで明らかになったアキノキリンソウのユーラシア拡散史

    阪口翔太, Alexey P SEREGIN, Elena MARCHUK, John SEMPLE, Li PAN, Yinqiong QIU, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 陶山佳久, 廣田俊, 石川直子, Olga CHERNYAGINA, Hyeokjae CHOI, 中臺亮介, 重信秀治, 山口勝司, 伊藤元己

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  5. ヤブツバキとユキツバキの分子系統地理

    阿部晴恵, 上野真義, 松尾歩, 廣田峻, 陶山佳久, 三浦弘毅, Yunguang SHEN, Monghuai SU, Zhong lang WANG

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  6. シカの採食圧が屋久島矮小植物群を生んだ？-シカの嗜好性と植物体サイズの関係

    高橋大樹, 陶山佳久, 瀬戸口浩彰, 阪口翔太

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  7. ヤクシカ糞中の植物DNA分析：高木由来の餌を主食し副食効果で林床植物を減らす

    東悠斗, 廣田峻, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本生態学会第69回大会　2022年3月14日

  8. 近縁な4種のアブラムシが形成する虫こぶにおける捕食者防御戦略の進化

    水木まゆ, 金子洋平, 雪江祥貴, 陶山佳久, 廣田峻, 澤進一郎, 久保稔, 山尾僚, 笹部美知子, 池田紘士

    本生態学会第69回大会　2022年3月14日

  9. 二次的接触帯で近縁ハダニ2種は交雑しているのか？

    湖中翔大, 松本尚樹, 廣田峻, 陶山佳久, 津村義彦, 佐藤幸恵

    日本生態学会第69回大会　2022年3月14日

  10. 最新の河川景観遺伝学を用いた冷水性魚類の遺伝子流動規定要因の解明

    中島颯大, 鈴木啓明, 中津川誠, 松尾歩, 陶山佳久, 中村太士

    日本生態学会第69回大会　2022年3月14日

  11. MIG-seq法を用いたゲノムワイドSNPデータによる保全ゲノミクス研究

    陶山佳久

    日本生態学会第69回大会　2022年3月17日

  12. 雌雄異花同株多年生草本ムカゴイラクサの集団維持機構 ―種子とムカゴに着目して―

    辻本隆太郎, 松尾歩, 陶山佳久, 大原雅

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  13. 東南アジアの開花・結実フェノロジーの緯度勾配

    永濱藍, 田金秀一郎, 陶山佳久, 北村俊平, 矢原徹一

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  14. チュウゴクザサ更新初期過程における密度依存性の影響

    谷口直, 松尾歩, 富松裕, 蒔田明史, 岡野邦宏, 陶山佳久, 齋藤智之, 柴田昌三, 鈴木準一郎, 立木佑弥

    日本生態学会第69回大会　2022年3月15日

  15. 自然林におけるVOCsを介したブナの植物間コミュニケーション

    萩原幹花, 塩尻かおり, 陶山佳久, 松尾歩, 石原正恵

    日本生態学会第69回大会　2022年3月14日

  16. 矮化オオバコの集団ゲノム解析

    石川直子, 阪口翔太, 高橋大樹, 廣田峻, 陶山佳久, 伊藤元己

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月5日

  17. MIG-seq 解析を利用したオキナグサの分子系統地理学的研究

    西藤大朗, 陶山佳久, 松尾歩, 藤井紀行, 池田啓, 岩崎貴也, Andrey E. Kozhevnikov, Zoya, V. Kozhevnikova, Jae-Hong Pak, KyungChoi, Tian-Gang Gao, 副島顕子

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月5日

  18. 京都御苑固有植物カワセミソウの進化的起源と姉妹種サギゴケの遺伝構造

    山本将也, 長澤耕樹, 伊東拓朗, 陶山佳久, 髙橋大

    2022年3月5日

  19. 満鮮要素オカオグルマの分布変遷史の解明

    坂場友香, 陶山佳久, 松尾歩, 池田啓, 藤井紀行, 藤井伸二, 副島顕子

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月5日

  20. MIG-seq による日本産スミレ属タチツボスミレ亜節植物の系統関係の推定

    Jiaxin YU, 瀬戸口浩彰, 増田和俊, 堀江健二, 陶山佳久, 廣田峻, 阪口翔太

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月5日

  21. 屋久島矮小植物の起源と成立要因の解明―ヤクシカによる採食圧と矮小化の関係―

    高橋大樹, 陶山佳久, 瀬戸口浩彰, 阪口翔太

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月6日

  22. 日本列島におけるスゲ属 2 節の種多様性形成要因の解明

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 沢和浩, 堀江健二, 永野惇, 陶山佳久, 松尾歩, 綱本良啓, 阪口翔太

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月6日

  23. 標本ゲノミクスで明らかになった広義アキノキリンソウのユーラシア拡散史

    阪口翔太, Alexey P SEREGIN, Elena MARCHUK, John SEMPLE, Li PAN, Yinqiong QIU, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 陶山佳久, 廣田峻, 石川直子, Olga CHERNYAGINA, Hyeokjae CHOI, 中臺亮介, 重信秀治, 山口勝司, 伊藤元己

    2022年3月6日

  24. 絶滅危惧植物カンランの域外保全に向けた遺伝解析

    西原美佳, 阪口翔太, 長澤淳一, 市河三英, 廣田峻, 陶山佳久, 遊川知久, 平塚健一, 山下幸司, 橋本 季正, 矢部幸太, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月5日

  25. ヤマハハコ(広義)における地理的分化・生態的分化に関する分子系統学的解析

    保尊大志, 伊東拓朗, 藤井伸二, 高橋大樹, 松尾歩, 陶山佳久, 牧雅之

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  26. フシノハアワブキ(広義)の隔離分布形成過程の検証

    村上将希, 伊東拓朗, 浅川彬, 山田孝幸, 田金秀一郎, 藤井伸二, 松尾歩, 陶山佳久, 牧雅之

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  27. 本産スイレン亜属の系統地理学的解析

    内藤芳香, 岩崎貴也, 加藤将, 首藤光太郎, 陶山佳久, 廣田峻, 志賀隆

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  28. 倍数性複合体シロヨメナ群の成立過程の解明2-倍数体を含む遺伝構造の解析-

    高添清登, 伊藤元己, 松尾歩, 朴宰弘, 陶山佳久, 王思琪, 副島顕子

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  29. 分子系統解析に基づく日本産イバラモ属の分類学的再検討

    軒原開, 藤井伸二, 伊東拓朗, 松尾歩, 陶山佳久, 福岡豪, 角野康郎, 牧雅之

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  30. 日本産ヤマハハコ属(キク科)の分類学的再検討

    片岡利文, 米岡克啓, 藤原泰央, 加藤英寿, 廣田峻, 陶山佳久, 矢原徹一, 村上哲明

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  31. 全国全種サンプリングとMIG-seqによる日本の野生植物の分類学的再検討 トダシバ属を例に

    佐藤広行, 布施健吾, 田金秀一郎, 廣田峻, 藤井伸二, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本植物分類学会第21回大会　2022年3月4日

  32. 湿原植物群集におけるバイオマス生産の時間的安定性の決定要因

    石井直浩, 巻島大智, 須藤瑠衣, 谷口快海, 後藤亮仁, 河井勇高, 彦坂幸毅, 陶山佳久, 佐々木雄大

    日本生態学会第69回大会　2022年3月14日

  33. 遺伝的適地適木を目指した宮城県産スギ精英樹と在来系統の地域性評価

    小沼拓矢, 内山憲太郎, 河部恭子, 陶山佳久

    第131回日本森林学会大会　2020年3月28日

  34. MIG-seqデータ解析パイプラインの開発

    倉島治, 廣田峻, 松尾歩, 伊藤元己, 大林夏湖, 佐藤光彦, 木下晃彦, 宮崎和弘, 福井陸夫, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  35. 改良されたMIG-seq法の概要

    陶山佳久, 松尾歩, 佐藤光彦, 廣田峻

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  36. MIG-seqによるシイタケ品種の識別と特異的マーカーの開発

    佐藤光彦, 木下晃彦, 松尾歩, 宮崎和弘, 福井陸夫, 倉島治, 大林夏湖, 伊藤元己, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  37. MIG-seq法を用いた個体・品種・集団・種の遺伝的識別

    松尾歩, 佐藤光彦, 廣田峻, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  38. MIG-seq法を用いた日本産低地性2倍体タンポポ全種の集団遺伝学的解析

    満行知花, 渡邊幹男, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  39. 倍数性植物ドクダミの遺伝的多様性と個体群構造

    井上(高橋)みずき, 飛田空, 佐藤光彦, 松尾歩, 陶山佳久, 瀬戸口浩彰

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  40. 植物標本とマルチシーケンス技術が紐解く北方樹種グイマツの系統分化と利用

    石塚航, 松尾歩, 陶山佳久, 新田紀敏, 田畑あずさ, 小野清美, 原登志彦

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月8日

  41. 絶滅危惧種の分布フロント個体群を対象としたゲノムワイド解析

    芝林真友, 國府方吾郎, 阿部篤志, 横田昌嗣, 遊川知久, 陶山佳久, 内貴章世, 栗田和紀, 永野惇, 本庄三恵, 井鷺裕司

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  42. 繁殖様式の異なるクロモジ属樹種間の遺伝的多様性の比較

    中村瑞穂, 名波哲, 伊東明, 陶山佳久, 廣田峻, 松尾歩

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  43. MIG-seq分析による亜高山性針葉樹オオシラビソの集団遺伝学的解析

    志村厚樹, 菊地紘, 津村義彦, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  44. 新規全ゲノム解読に基づくニューカレドニア産シソ科植物の比較デモグラフィー

    河合良弥, 伊津野彩子, 陶山佳久, Gildas GÂTEBLÉ, 井鷺裕司

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  45. ベトナム南部の熱帯山地林における樹木の展葉・開花・結実フェノロジー

    永濱藍, 田金秀一郎, Nguyen Van NGOC, Hoang Thi BINH, Truong Quang CUONG, Nguyen Thi Anh THU, 土屋考人, Meng ZHANG, Hoang Viet THANH, Nguyen Cuong THINH, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 森塚絵津子, 遠山弘法

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  46. 琉球諸島における非固有性の国内希少植物を対象とした保全遺伝学的解析

    德弘千夏, 井鷺裕司, 伊東拓朗, 國府方吾郎, 阿部篤志, 内貴章世, 松尾歩, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  47. 湿原植物群集における種多様性と遺伝的多様性の比較解析

    石井 直浩, 松尾 歩, 廣田 峻, 後藤 亮仁, 谷口 快海, 河井 勇高, 須藤 瑠衣, 巻島 大智, 彦坂 幸毅, 佐々木 雄大, 陶山 佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  48. MIG-seq分析によるニューカレドニア産シソ科Oxera属の隠蔽種の発見

    長岡麟平, Gildas Gâteblé, 井鷺裕司, 陶山佳久

    日本生態学会第67回全国大会　2020年3月7日

  49. Identification of evolutionarily significant units in Dioon sonorense leads to the description of Dioon vovidesii, a new cycad species from Northwestern Mexico

    Gutiérrez-Ortega José Said, Jiménez-Cedillo Karen, Pérez-Farrera Miguel Angel, Martínez José F., Molina-Freaner Francisco, 今井涼介, 津田吉晃, 松木悠, 陶山佳久, 綿野泰行, 梶田忠

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  50. ベトナム中部高原地帯における維管束植物の多様性評価

    小栗恵美子, 田金秀一郎, 須貝杏子, 陶山佳久, Bui Hong Quang

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  51. 木曽川河川敷に生育する渓流型二ガナの分類学的研究

    神野百香, 中村公美, 須山知香, 中川さやか, 伊藤元己, 陶山佳久, 松尾歩, 高橋弘, 植田邦彦, 吉田國二

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  52. 満鮮要素オカオグルマの系統地理学的研究

    坂場友香, 陶山佳久, 松尾歩, 池田啓, 藤井紀行, 藤井伸二, 副島顕子

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  53. ベトナム南部の山地林におけるブナ科とクスノキ科の種多様性とフェノロジー

    永濱藍, 田金秀一郎, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 森塚絵津子, Nguyen Van Ngoc, Hoang Thi Binh, Meng Zhang, 永益英敏, 内貴章世, 遠山弘法, 矢原徹一

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  54. MIG-seq解析を用いた草原性植物種シロスミレの分布変遷過程

    山本隆聖, 藤井紀行, 陶山佳久, 松尾歩, いがりまさし, 副島顕子

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  55. 満鮮要素植物ツチグリのMIG-seq解析を用いた分子系統地理学的解析

    小畠彪, 仁木教陽, 平良玲央奈, 竹下(村山)香織, 陶山佳久, 松尾歩, 佐藤光彦, 副島顕子, 岩崎貴也, 池田啓, 藤井紀行

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月3日

  56. ラオス南部・Bolaven台地における植物多様性インベントリー

    田金秀一郎, Phetlasy Souladeth, Dueanta Kongxaysavath, 陶山佳久, 田中伸幸, 永濱藍, 鈴木英治

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月3日

  57. 襲速紀要素 3 種を用いた比較分子系統地理学

    竹下(村山)香織, 渡邊幹男, 満行知花, 松尾歩, 岩崎貴也, 陶山佳久, 藤井紀行

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  58. 中部山岳における広義エゾフウロのrefugia within refugiaは複数回移入によって形成された

    倉田正観, 阪口翔太, 廣田峻, 陶山佳久, 西田佐知子, 伊藤元己

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  59. 北海道絶滅危惧植物の極東ロシアとの比較による固有性の検証と，遺伝的保全単位の解明―レブンソウ・フタナミソウ・キリギシソウについて―

    土屋さくら, 田村紗彩, 福田知子, Alexander A.Taran, Svetlana I. Chabanenko, Vyacheslav Yu. Barkalov, Olga A. Chernyagina, Ekaterina A. Petrunenko, Elena A. Marchuk, Pavel V. Krestov, Svetlana N. Bondarchuk, 村井良徳, 西川洋子, 島村崇志, 松尾歩, 陶山佳久, 佐藤 謙, 冨士田裕子, 中村剛

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月2日

  60. 日本におけるスゲ属2節の種多様性形成過程の解明

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 沢和浩, 堀江健二, 永野惇, 陶山佳久, 松尾歩, 綱本良啓, 阪口翔太

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月1日

  61. 水生植物トリゲモとオオトリゲモの種分化と集団分化:MIG-seq法及び系統培養株を用いた検討

    緑川昭太郎, 岩崎貴也, 加藤将, 陶山佳久, 松尾歩, 志賀隆

    日本植物分類学会第19回大会　2020年3月1日

  62. スギの遺伝資源保全を目的とした地域在来系統探索のための集団遺伝学的解析

    小沼拓矢, 内山憲太郎, 廣田俊, 松尾歩, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第64回大会　2019年12月21日

  63. 八甲田山系の湿原植物群集における種多様性と遺伝的多様性の比較解析

    石井直浩, 廣田 峻, 松尾歩, 佐藤光彦, 後藤亮仁, 谷口快海

    日本生態学会東北地区会第64回大会　2019年12月21日

  64. ゲノムワイドSNP分析によるニューカレドニア産シソ科Oxera属における隠蔽種の発見

    長岡麟平, 佐藤光彦, 廣田峻, 松尾歩, Gildas Gâteblé, 井鷺裕司, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第64回大会　2019年12月21日

  65. 分断された植物集団の存続可能性評価：遺伝的多様性の時間動態は何によって決まるのか

    都築洋一, 佐藤光彦, 松尾歩, 陶山佳久, 大原雅

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  66. 湿原植物群集における種・遺伝子レベルの多様性比較による保全単位の策定

    石井直浩, 松尾歩, 廣田峻, 後藤亮仁, 谷口快海, 河井勇高, 須藤瑠衣, 巻島大智, 彦坂幸毅, 佐々木雄大, 陶山佳久

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  67. シロスミレとその変種ホソバシロスミレの遺伝構造解析と分布変遷過程の考察

    山本隆聖, 藤井紀之, 陶山佳久, 松尾歩, いがりまさし, 副島顕子

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  68. 日本産低地性２倍体タンポポのうち遺伝的に最も分化しているのはどれか？―MIG-seq法による６系統11集団798遺伝子座の集団遺伝学的解析

    満行知花, 渡邊幹男, 陶山佳久

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  69. ミトコンドリアのハプロタイプを共有する宝石サンゴ２種のMIG-seq解析による種境界の検証

    高田健司, 谷中絢貴, 野中正法, 岩瀬文人, 菊地泰生, 陶山佳久, 長井敏, 安田仁奈

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  70. ニューカレドニア産準固有属Oxera（シソ科）の個体群動態推定のためのde novo全ゲノムアセンブル

    河合良弥, 伊津野彩子, 陶山佳久, Gildas Gâteblé, 井鷺裕司

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  71. MIG-seq法を用いた地域在来系統の探索により示された「南三陸杉」の固有性

    小沼拓矢, 内山憲太郎, 廣田峻, 松尾歩, 陶山佳久

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  72. MIG-seq法による個体・品種の識別のためのデータ処理技術開発

    佐藤光彦, 松尾歩, 木下晃彦, 宮崎和弘, 福井陸夫, 陶山佳久

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  73. MIG-seq法によるゲノム情報により示されたニューカレドニア産シソ科Oxera palmatinerviaの近縁隠蔽種の可能性

    長岡麟平, 佐藤光彦, 廣田峻, 松尾歩, Gildas Gâteblé, 井鷺裕司, 陶山佳久

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  74. 南ベトナム熱帯山地林の種多様性とフェノロジー 招待有り

    永濱藍, 田金秀一郎, 陶山佳久, 矢原徹一

    第51回種生物学シンポジウム　2019年12月7日

  75. MIG-seq法による水生植物トリゲモとオオトリゲモの系統関係の解明

    緑川昭太郎, 陶山佳久, 松尾歩, 志賀隆

    日本陸水学会甲信越支部会　2019年11月30日

  76. MIG-seq：微生物個体・集団・種のDNA情報解析に利用できるゲノムワイドSNP分析 招待有り

    陶山佳久

    北海道大学低温科学研究所・共同利用・共同研究拠点・研究集会「環境微生物学における革新的手法および生態系保全における活用法」　2019年11月29日

  77. Development of cultivar-specific DNA markers for Lentinula edodes (Berk.) Pegler based on SNP data via a MIG-seq approach

    2019年10月3日

  78. Genetic diversity and DNA barcoding of teak in the Mekong for improvements of growth and wood quality

    2019年9月24日

  79. イボニシC 型・P 型は別種か? SNP 解析による遺伝構造比較

    福森啓晶, 伊藤萌, 松尾歩, 陶山佳久, 小島茂明, 狩野泰則

    2019年度日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会　2019年9月20日

  80. 八甲田湿原における泥炭蓄積速度の環境依存性

    谷口快海, 石井直浩, 後藤亮仁, 河井勇高, 巻島大智, 陶山佳久, 佐々木雄大, 彦坂幸毅

    日本植物学会第83回大会　2019年9月16日

  81. Introduction of next-generation biodiversity assessment using MIG-seq 招待有り

    陶山佳久

    The 11th APBON Workshop -Asia-Pacific Biodiversity Observation Network　2019年7月26日

  82. Next-generation sequencing method compared with the internal transcribed spacer (ITS) results: Application to identify the agarwood species

    Marlina Ardiyani, Wita Wardani, Lulut Dwi Sulistyaningsih, Yoshihisa Suyama

    2019年6月27日

  83. 作製後 15 年程度が経過した微小昆虫の乾燥標本を対象とした分子系統解析における MIG-seq 法の利用可能性

    江口克之, 小栗恵美子, 佐々木崇徳, 松尾歩, 陶山佳久

    日本動物分類学会第55回大会　2019年6月9日

  84. MIG-seq法：次世代シーケンサーを用いた手軽なゲノムワイド塩基配列分析 招待有り

    陶山佳久

    日本農芸化学会2019年度東京大会　2019年3月26日

  85. 衰退過程にあるスズタケの景観的遺伝構造：MIG-seqによる解析

    鈴木智之, 綱本良啓, 松尾歩, 下野綾子, 久本洋子, 蒔田明史, 陶山佳久

    第130回日本森林学会大会　2019年3月22日

  86. MIG-seq法を用いたシイタケ品種のDNA識別

    松尾歩, 廣田峻, 宮崎和弘, 木下晃彦, 福井陸夫, 倉島治, 伊藤元己, 陶山佳久

    第130回日本森林学会大会　2019年3月22日

  87. 島嶼環境においてヒメネズミはオニグルミを採 食するのか？

    小林郁奈, 松尾歩, 廣田峻, 陶山佳久, 阿部晴恵

    第130回日本森林学会大会　2019年3月21日

  88. 佐渡島と本州におけるヤマアカガエルの遺伝的分化の検証

    小池南, 松尾歩, 廣田峻, 岸田治, 陶山佳久, 阿部晴恵

    第130回日本森林学会大会　2019年3月21日

  89. 佐渡島の多雪環境がヒノキアスナロの樹形と群落構造に与える影響

    内木翔大, 阿部晴恵, Yoichi Hasegawa, 松尾歩, 陶山佳久, 崎尾均

    第130回日本森林学会大会　2019年3月21日

  90. MIG-seq分析による宮城県産スギ精英樹クローン間の遺伝的関係解析

    小沼拓矢, 河部恭子, 山崎修宜, 今野幸則, 松尾歩, 廣田峻, 陶山佳久

    第130回日本森林学会大会　2019年3月21日

  91. ツバキ節を中心とする形態比較およびMIG- seqを用いた分子系統解析

    片山瑠衣, 松尾歩, 廣田峻, 陶山佳久, 阿部晴恵

    第130回日本森林学会大会　2019年3月21日

  92. ブナ天然分布北進最前線集団における由来推定の試み

    北村系子, 津田吉晃, 今井亮介, 松尾歩, 陶山佳久

    第130回日本森林学会大会　2019年3月22日

  93. チシマザサ個体群の長期動態:一斉枯死後の回復過程とクローン成長の寄与

    富松裕, 谷口稜太郎, 工藤恵梨, 金子悠一郎, 松尾歩, 齋藤智之, 陶山佳久, 蒔田明史

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  94. MIG-seq法を用いた絶滅危惧植物の保全遺伝学的解析

    陶山佳久

    第66回日本生態学会大会　2019年3月15日

  95. 東南アジアの植物多様性評価

    田金秀一郎, 満行知花, 陶山佳久, 矢原徹一

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  96. 太平洋におけるアオウミガメ北限個体群の構造解析

    浜端朋子, 近藤理美, 松尾歩, 陶山佳久, 河田雅圭

    第66回日本生態学会大会　2019年3月18日

  97. mtDNA及びゲノムワイドSNPに基づくモリアオガエルの分子系統

    阿部晴恵, 塩崎大, 廣田峻, 陶山佳久, 長谷川雅美

    第66回日本生態学会大会　2019年3月18日

  98. MIG-seqとマルチDNAバーコーディングによるNGSベースの種・品種識別

    松尾歩, 廣田峻, 綱本良啓, 満行知花, 岡野邦宏, 陶山佳久

    第66回日本生態学会大会　2019年3月18日

  99. 極東ロシアー日本列島におけるキスゲ属植物の遺伝的集団構造解析

    廣田峻, Pavel KRESTOV, Irina KRESTOVA, Kuchina VALENTINA, 新田梢, 安元暁子, 中村剛, 矢原徹一, 陶山佳久

    第66回日本生態学会大会　2019年3月18日

  100. 湿原生態系における花の面的分布を広域的に把握する:ドローンと機械学習を用いた試み

    後藤亮仁, 巻島大智, 須藤瑠衣, 石井直浩, 谷口快海, 河合勇高, 内田圭, 陶山佳久, 彦坂幸毅, 佐々木雄大

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  101. 湿原の縮小・分断化と湿原植物の多様性：局所絶滅の遅れに着目して

    巻島大智, 須藤瑠衣, 後藤亮仁, 石井直浩, 谷口快海, 河井勇高, 内田圭, 陶山佳久, 彦坂幸毅, 佐々木雄大

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  102. 八甲田湿原における泥炭蓄積速度の環境依存性

    谷口快海, 石井直浩, 後藤亮仁, 河井勇高, 巻島大智, 須藤瑠衣, 陶山佳久, 佐々木雄大, 彦坂幸毅

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  103. 在来緑化植物ヨモギの形態および遺伝的組成の地理的変異と緑化法面における個体の由来

    我妻総, 下野嘉子, 今西純一, 陶山佳久, 松尾歩, 満行知花, 綱本良啓, 冨永逹

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  104. 糞のDNA 試料によるヤクシカ餌植物組成の個体間・地域間・季節間比較

    東悠斗, 矢原徹一, 陶山佳久

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  105. 日本に雌株しかいない雌雄異株植物ヤマコウバシの地理的な遺伝構造

    中村瑞穂, 名波哲, 陶山佳久, 廣田峻, 松尾歩, 伊東明

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  106. MIG-seq法による八甲田山系湿原優占植物種の遺伝的多様性解析

    石井直浩, 松尾歩, 廣田峻, 後藤亮仁, 谷口快海, 河井勇高, 須藤瑠衣, 巻島大智, 彦坂幸毅, 佐々木雄大, 陶山佳久

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  107. 硫気孔原土壌への進出による遺伝的帰結

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 後藤隼, 福島慶太郎, 井鷺裕司, 陶山佳久, 綱本良啓, 阪口翔太

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  108. 同所的に生育するエチゼンダイモンジソウとダイモンジソウの遺伝構造比較

    孫田佳奈, 阪口翔太, 廣田峻, 綱本良啓, 陶山佳久, 赤井賢成, 瀬戸口浩彰

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  109. 同所的近縁種の多い熱帯樹木(Syzygium属)の交雑解析

    辰巳茉優, 奥野聖也, Sylvester Tan, Mohizah Mohamad, 永野惇, 手塚あゆみ, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 名波哲, 伊東明

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  110. 多雪がヒノキアスナロの樹形と遺伝構造に与える影響

    内木翔大, 松尾歩, 陶山佳久, Yoichi Hasegawa, 阿部晴恵, 崎尾均

    第66回日本生態学会大会　2019年3月17日

  111. 南三陸スギが地域固有の在来系統である可能性：DNA分析による全国のスギ天然林との比較から 招待有り

    陶山佳久, 小沼拓矢, 内山憲太郎

    南三陸サスティナビリティー学講座　2019年3月12日

  112. MIG-seq: an efficient tool for the study of genetic differentiation among individuals, populations and species 招待有り

    Yoshihisa Suyama

    西南大学生命科学院セミナー　2019年3月10日

  113. ヤシャビシャクの富士山集団における著しい遺伝的分化

    阪口翔太, 髙橋大樹, 瀬戸口浩彰, 山下由美, 沢和浩, 田村淳, 玉木一郎, 渡辺洋一, 大石満, 松尾歩, 陶山佳久, 井鷺裕司

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月9日

  114. ニュージーランドのキク科 Celmisia 属におけるMIG-seqを用いた系統解析

    牛久由夏, 石川直子, 中浜直之, 倉島治, 陶山佳久, 伊藤元己, 2019

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  115. MIG-seq解析を用いた襲􏰁􏰁速紀要素ハガクレツリフネの分子系統地理学的検証と集団動態推定

    村山-竹下香織, 渡邊幹男, 満行知花, 松尾歩, 岩崎貴也, 陶山佳久, 藤井紀行

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  116. 遺伝子浸透は極限植物の種形成に関与したか?：ヤマタヌキランとその近縁種を対象にした多種動態解析

    長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 牧雅之, 沢和浩, 堀江健二, 福島慶太郎, 陶山佳久, 松尾歩, 綱本良啓, 阪口翔太

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月8日

  117. オチフジは本当に日本固有種か？

    高野温子, 阪口翔太, 松尾歩, 陶山佳久, Pan Li, Guohua Xia, Xi Liu, 井鷺祐司

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  118. ベトナムのランビアン山における樹木の種構成と開花・結実フェノロジー

    永濱藍, 田金秀一郎, Zhang Meng, 土屋考人, 陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻, 森塚絵津子, Nguyen Van Ngoc, Hoang Thi Binh, 永益英敏, 内貴章世, 遠山弘法, 矢原徹一

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  119. ロスミレとその変種ホソバシロスミレの遺伝構造解析と分布変遷過程の考察

    山本隆聖, 藤井紀行, 陶山佳久, 松尾歩, いがりまさし, 高石あすか, 副島顕子

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  120. 暖地性シダ植物マツバランの系統地理解析：特に神奈川県産個体の由来に着目して

    小玉あすか, 山本薫, 大西亘, 松尾歩, 陶山佳久, 岩崎貴也

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  121. ゲノムワイドなSNP情報を用いた水生植物アギナシ(オモダカ科)の集団遺伝解析

    坪田和真, Hyeok-Jae Choi, 陶山佳久, Polina A. Volkova, 松尾歩, 綱本良啓, 廣田峻, 志賀隆

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  122. ハビタットの違いは遺伝構造に影響するか；滝に生きるエチゼンダイモンジソウと姉妹種の比較

    孫田佳奈, 阪口翔太, 廣田峻, 綱本良啓, 陶山佳久, 赤井賢成, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会第18回大会　2019年3月7日

  123. 次世代シーケンシング技術を用いた食用きのこ品種のDNA鑑定技術開発 招待有り

    陶山佳久

    次世代育種技術研究開発プラットフォーム総会・意見交換会　2019年3月1日

  124. 生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の原理からその研究事例まで 招待有り

    陶山佳久

    信州大学理学部理学科生物学コース第274回教室セミナー　2019年2月1日

  125. Advanced approaches to the study of genetic and phylogenetic diversity in tropical forests 国際会議 招待有り

    陶山 佳久

    Workshop on the ecological research of plant diversity and forest ecosystem in Bidoup - Nui Ba National Park and surrounding areas　2018年12月23日

  126. ニュージランドのキク科Celmisia 属におけるMIG-seqを用いた系統解析

    牛久由夏, 石川直子, 中浜直之, 倉島治, 陶山佳久, 伊藤元己

    第50回種生物学シンポジウム　2018年12月7日

  127. MIG-seq 法を用いた分子系統地理学的解析による未知のスギ地域在来系統の発見

    小沼拓矢, 内山憲太郎, 陶山佳久

    第50回種生物学シンポジウム　2018年12月7日

  128. MIG-seqとマルチプレックスDNAバーコーディングによる分子系統・集団遺伝解析 招待有り

    陶山 佳久

    第50回種生物学シンポジウム　2018年12月7日

  129. コーラルトライアングルを中心としたオニヒトデとマンジュウヒトデの集団ゲノム比較解析

    袰岩美月, Coralie Taquet, Suharsono, Handoko Adi Susanto, Miguel Fortes, Jamaluddin Jompa, Niphon Phongsuwan, Catherine Vogler、Gert, Wörheide、 John Benzie, Ywee Chieh, Danwei Huang, Davide Seveso, 陶山佳久, 湯淺英知, 東村幸浩, 長井敏, 満行知花, 灘岡和夫, 安田仁奈

    日本DNA多型学会第27回学術集会　2018年12月5日

  130. MIG-seq法：次世代シーケンサーを用いた手軽なゲノムワイド塩基配列分析

    陶山佳久, 松尾歩, 廣田峻

    日本DNA多型学会第27回学術集会　2018年12月5日

  131. アオサンゴの隠蔽系統分布と異時的種分化の可能性

    谷中絢貴, Zoe Richards, Sen-Lin Tang, 和田直久, 陶山佳久, 菊地泰生, 井口亮, 本郷悠貴, 安田仁奈

    日本DNA多型学会第27回学術集会　2018年12月5日

  132. 次世代シーケンサーを用いた手軽な分子系統・集団遺伝解析 招待有り

    陶山 佳久

    日本生態学会東北地区会第63回弘前大会　2018年12月1日

  133. 日本国内における宝石サンゴの集団遺伝構造の解明

    高田健司, 野中正法, 岩瀬文人, 菊地泰生, 陶山佳久, 安田仁奈

    日本サンゴ礁学会第21回大会　2018年11月22日

  134. 生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の原理からその研究事例まで

    陶山 佳久

    首都大学東京「系統進化特別講義」兼セミナー　2018年11月22日

  135. MIG-seq: a simple method for genome-wide sequencing 国際会議 招待有り

    陶山 佳久

    Instituto de Ecología Seminar　2018年11月15日

  136. 森林遺伝育種学的研究のためのMIG-seq（multiplexed ISSR genotyping by sequencing）法の開発 招待有り

    陶山 佳久

    森林遺伝育種学会第7回大会　2018年11月9日

  137. MIG-seq and multiplexed DNA barcoding: efficient tool for phylogeography and conservation genetics 国際会議

    The 2nd International Academic Conference on the Formation Mechanism of Plant Diversity and Conservation of Endangered Plants in East Asia　2018年11月3日

  138. 生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の原理からその研究事例まで 招待有り

    陶山 佳久

    熊本大学生命科学講座公開セミナー　2018年10月24日

  139. MIG-seqによるメドハギ類の緑化用種子および緑化法面生育個体の遺伝的特徴の解析

    今西純一, 今西亜友美, 陶山佳久, 井鷺裕司

    第49回日本緑化工学会大会　2018年9月15日

  140. 在来緑化植物ヨモギの外国産緑化個体と在来個体間の形態及び遺伝的組成の違い

    我妻総, 下野嘉子, 今西純一, 陶山佳久, 満行知花, 綱本良啓, 冨永達

    第49回日本緑化工学会大会　2018年9月15日

  141. 同所的に生育するエチゼンダイモンジソウとダイモンジソウの遺伝構造比較

    孫田佳奈, 阪口翔太, 廣田峻, 綱本良啓, 陶山佳久, 赤井賢成, 瀬戸口浩彰

    日本植物学会第82回大会　2018年9月14日

  142. MIG-seq法：次世代シーケンサーを用いた手軽なゲノムワイド塩基配列分析

    陶山 佳久

    イルミナ iSchoolプロフェッショナルウェビナー　2018年9月5日

  143. MIG-seq and multiplexed DNA barcoding: an efficient combination for molecular phylogenetic analysis 国際会議

    陶山 佳久

    7th International Legumue Conference　2018年8月29日

  144. 生物の地域性を活かした豊かな未来を目指して 招待有り

    陶山 佳久

    未来の暮らし方を育む泉の創造シンポジウムin志摩-地域の自然とライフスタイル-　2018年7月21日

  145. Genetic diversity, population demography and adaptation of Oxera baladica (Lamiaceae) and an undescribed species in New Caledonia 国際会議

    The 8th East Asian Federation of Ecological Societies (EAFES) International Congress　2018年4月21日

  146. Local-scale genetic structure and kinship in the sleeper goby, Eleotris oxycephala, an amphidromous migratory fish, in the Sagami River System, Japan 国際会議

    The 8th East Asian Federation of Ecological Societies (EAFES) International Congress　2018年4月21日

  147. Spatial genetic structure in alpine populations of an endangered gentian, Gentiana yakushimensis 国際会議

    The 8th East Asian Federation of Ecological Societies (EAFES) International Congress　2018年4月21日

  148. MIG-seq: a simple method for genome-wide sequencing 国際会議 招待有り

    陶山 佳久

    The IEG Seminar series ‘Frontiers in Ecology and Evolution’　2018年4月3日

  149. 類似分布を有する近縁ツツジ属2種の対照的な個体群動態史

    渡辺洋一, 小野悦生, 綱本良啓, 陶山佳久, 上原浩一

    第129回日本森林学会大会　2018年3月26日

  150. 森林生態・遺伝育種学的研究のための分子生物学的分析手法の開発と普及 招待有り

    陶山 佳久

    第129回日本森林学会大会　2018年3月26日

  151. 牡鹿半島狐崎浜沿岸におけるアラメ個体群間の遺伝子交流と遊走子の分散距離

    鈴木はるか, 青木智也, 満行知花, 綱本良啓, 陶山佳久, 吾妻行雄, 青木優和

    日本藻類学会第42回大会　2018年3月23日

  152. MIG-seq法を用いた在来２倍体タンポポの遺伝的集団構造

    満行知花, 渡邊幹男, 陶山佳久

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  153. 屋久島の国有林におけるヤクシカの餌植−次世代シーケンサーを用いたヤクシカ糞の植物DNA解析−

    東悠斗, 矢原徹一, 陶山佳久

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  154. ニューカレドニアで適応放散したシソ科植物Oxera baladicaの全分布域を対象とした遺伝的集団構造解析

    藤田琴実, 満行知花, 綱本良啓, 井鷺裕司, Gildas Gâteblé, 陶山佳久

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  155. 東南アジア熱帯林構成種における多数の新種発見に活かされるMIG-seq

    満行知花, 田金秀一郎, 遠山弘法, 間瀬慶子, 矢原徹一, 松尾歩, 陶山佳久

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  156. 地史の生き証人、ニホンザリガニの更なる進化史：MIG-seqだから分かったこと

    小泉逸郎, 満行知花, 綱本良啓, 西川潮, 川井唯史, 大高明史, 陶山佳久

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  157. MIG-seqで加速する絶滅危惧植物の保全遺伝学的データ取得

    綱本良啓, 廣田峻, 石井直浩, 小沼拓矢, 陶山佳久

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  158. 改良MIG-seq法の概要

    陶山佳久, 綱本良啓, 満行知花

    第65回日本生態学会大会　2018年3月14日

  159. 日華区系におけるイワユキノシタ属の隔離分布形成史と繁殖システムの進化

    阪口翔太, 髙橋大樹, 瀬戸口浩彰, 綱本良啓, 陶山佳久, Yingxiong Qiu, Pan Li, Ruisen Lu, 井鷺裕司

    日本植物分類学会第17回大会　2018年3月8日

  160. 北海道夕張岳蛇紋岩地に固有の絶滅危惧植物ユウバリクモマグサ(ユキノシタ科)の雑種仮説の検証

    田村紗彩, 福田知子, Elena A. Pimenova, Ekaterina A. Petrunenko, Pavel V. Krestov, Svetlana N. Bondarchuk, Olga A. Chernyagina, 陶山佳久, 綱本良啓, 松尾歩, 坪井勇人, 高橋英樹, 西川洋子, 島村崇志, 冨士田裕子, 中村剛

    日本植物分類学会第17回大会　2018年3月8日

  161. 風穴地は間氷期レフュージアとして機能したか:風穴地特異的植物の系統地理学的解析

    宮嵜泰輔, 五百川裕, 松尾歩, 陶山佳久, 鎌田憲太郎, 木村拓真, 丹羽真一, 牧雅之

    日本植物分類学会第17回大会　2018年3月8日

  162. A taxonomic study of Quercus langbianensis complex based on morphology, and DNA barcodes of classic and next generation sequences

    Hoang Thi Binh, Nguyen Van Ngoc, 田金秀一郎, 遠山弘法, 間瀬慶子, 満行知花, Joeri Sergej Strijk, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本植物分類学会第17回大会　2018年3月8日

  163. A taxonomic study of Lithocarpus elegans, L. hancei and its relatives (Fagaceae) in Southeast Asia, based on next generation DNA barcodes and morphological observations

    Nguyen Van Ngoc, Hoang Thi Binh, 田金秀一郎, 遠山弘法, 間瀬慶子, 満行知花, Joeri Sergej Strijk, 陶山佳久, 矢原徹一

    日本植物分類学会第17回大会　2018年3月8日

  164. 硫気孔原植物ヤマタヌキランの起源と遺伝的特性

    長澤耕樹, 阪口翔太, 牧雅之, 福島慶太郎, 井鷺裕司, 陶山佳久, 綱本良啓, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会第17回大会　2018年3月8日

  165. 生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術—その応用による豊かな社会の創造— 招待有り

    陶山 佳久

    ネイチャーテクノロジー研究会　2018年2月20日

  166. 生物の地域性を活かした豊かな未来を目指して

    未来の暮らし方を育む泉の創造シンポジウムin北上　2017年12月16日

  167. MIG-seq法の概要とその多様性生物学研究への応用 招待有り

    陶山 佳久

    東京大学大学院総合文化研究科広域システム科学特別セミナー　2017年12月14日

  168. MIG-seq分析によるキタダケソウ属３種の種識別と遺伝的集団構造解析

    小沼拓矢, 綱本良啓, 阿部晴恵, 中村 剛, 陶山佳久

    第49回種生物学シンポジウム　2017年12月2日

  169. ニューカレドニアで適応放散したシソ科Oxera属植物のゲノムワイドSNP分析

    藤田琴実, 満行知花, 綱本良啓, 井鷺裕司, Gildas Gâtebl, 陶山佳久

    第49回種生物学シンポジウム　2017年12月2日

  170. MIG-seq法によって明らかになった2倍体、倍数体在来タンポポの種間分化

    満行知花, 陶山佳久

    第49回種生物学シンポジウム　2017年12月2日

  171. 日本におけるキスゲ属の遺伝的集団構造

    廣田峻, 三木望, 陶山佳久

    第49回種生物学シンポジウム　2017年12月2日

  172. Genome-wide DNA barcoding: new concept of species identification tool using next-generation sequencing 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Chika Mitsuyuki, Motomi Ito, Tetsukazu Yahara

    7th International Barcode of Life Conference　2017年11月20日

  173. 生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の原理からその研究事例まで 招待有り

    陶山 佳久

    第26回Qecoセミナー　2017年11月16日

  174. MIG-seq: an efficient PCR-based method for genome-wide genotyping 国際会議

    Yoshihisa Suyama

    IUFRO 2017 Genetics & Genomics of Fagaceae　2017年11月1日

  175. A taxonomic study of Quercus langbianensis complex based on morphology, and DNA barcodes of classic and next generation sequences 国際会議

    Hoang Thi Binh, Nguyen Van Ngoc, Shuichiro Tagane, Hironori Toyama, Keiko Mase, Chika Mitsuyuki, Joeri S. Strijk, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara

    IUFRO 2017 Genetics & Genomics of Fagaceae　2017年11月1日

  176. 生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の原理からその研究事例まで 招待有り

    陶山 佳久

    宮崎大学テニュアトラック推進セミナー　2017年10月6日

  177. 森の命の多様性を次世代に残す 招待有り

    陶山 佳久

    エフエム仙台forever green project仙台北山輪王寺の森体験ツアー講演会　2017年9月24日

  178. MIG-seqによるホトトギス属の系統分類：特にむかごを形成するTricyrtis sp.の系統的位置づけについて

    中舛理玖, 井上康彦, 陶山佳久, 綱本良啓, 阪口翔太, 瀬戸口浩彰

    日本植物学会第81回大会　2017年9月8日

  179. Bamboo studies using MIG-seq: a novel genome-wide sequencing method 国際会議

    Yoshihisa Suyama

    International Meeting on Research wrap-up in temperate and tropical bamboos　2017年9月6日

  180. MIG-seq: an efficient genome-wide sequencing method for conserveation genetics of mangroves 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Gstavo Maruyma Mori, Chika Mitsuyuki, Yoshihiro Tsunamoto

    Workshop for Mangrove Conservation Genetics 2017　2017年7月26日

  181. MIG-seq: efficient PCR-based method for genome-wide sequencing using NGS 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Gstavo Maruyma Mori, Chika Mitsuyuki, Yoshihiro Tsunamoto

    XIX International Botanical Congress　2017年7月26日

  182. 在来緑化植物ヨモギの外国産緑化個体と在来個体間の形態および遺伝構造の比較

    我妻総, 下野嘉子, 今西純一, 陶山佳久, 満行知花, 綱本良啓, 冨永逹

    日本雑草学会第56回大会　2017年4月15日

  183. MIG-seq法による熱帯林樹木の保全遺伝学的研究

    満行知花, 綱本良啓, 陶山佳久

    第128回日本森林学会大会　2017年3月26日

  184. 地域産の遺伝子資源を活かした農林水産業と自然再生

    陶山佳久

    自然共生社会ワークショップ（秋田市）　2017年3月22日

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    本人の講演

  185. MIG-seqの原理と概要

    陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

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    本人の発表

  186. ニューカレドニア産希少植物Oxera属樹種間・種内の遺伝的関係解析

    藤田琴実, 満行知花, 綱本良啓, 井鷺裕司, Gildas Gâtebl, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  187. 小笠原諸島の希少植物タイヨウフウトウカズラの実生の遺伝的多様性 -SSR/MIG-seq による解析と比較

    成田あゆ, 兼子伸吾, 陶山佳久, 綱本良啓, 小牧義輝, 葉山佳代, 坂入祐子, 井鷺裕司

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  188. 有害赤潮藻Chattonella属3 種のMIG-seq 法による識別

    長井敏, 満行知花, 河地正伸, 出村幹英, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  189. MIG-seq の特徴を生かした研究と、今後の可能性

    綱本良啓, 丹野たかね, 斎藤遥花, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  190. MIG-seq 法のバージョンアップ：複数種を用いた検討によるライブラリー構築方法の改良

    綱本良啓, 満行知花, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  191. グッピーの“少数派好き”が受ける恩恵：カラーパターンの違いは遺伝的距離を反映するか？

    稲田垂穂, 青木翔子, 酒井祐輔, 満行知花, 鶴井香織, 辻和希, 陶山佳久, 河田雅圭

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  192. 相模川水系におけるカワアナゴ Eleotris oxycephalaの食性と集団構造

    山川宇宙, Leanne Faulks, 今井亮介, 陶山佳久, 加納光樹, 津田吉晃, 今孝悦

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  193. 草原における植物の種多様性と生態系機能の関係を土壌メタゲノム解析から読み解く

    吉原佑, 佐々木雄大, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  194. MIG-seq 法を用いたクスノキ科シロダモ属の系統関係解析

    満行知花, 田金秀一郎, 矢原徹一, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  195. MIG-seq 法によって明らかになった琵琶湖での劇的な形態の変化：タニシ科貝類を例として

    平野尚浩, 齊藤匠, 中井克樹, 綱本良啓, 陶山佳久, 千葉聡

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  196. 特異な分布を示す海浜性の絶滅危惧植物バシクルモンにおける地理的遺伝構造

    大谷雅人, 満行知花, 池田明彦, 指村奈穂子, 陶山佳久

    第64回日本生態学会大会　2017年3月14日

  197. MIG-seqを用いた日本産ハナシノブ属の遺伝的類縁関係の推定

    横川昌史, 綱本良啓, 陶山佳久

    日本植物分類学会第 16 回大会　2017年3月9日

  198. ゲノムワイド塩基配列多型検出のためのMIG-seq法試料として、さく葉標本から抽出したDNAは使用可能か?

    伊藤元己, 加藤俊英, 森重剛志, 上原浩一, 海老原淳, 綱本良啓, 満行知花, 陶山佳久

    日本植物分類学会第 16 回大会　2017年3月9日

  199. 海洋島における内陸性オオハマボウ集団の遺伝構造

    高山浩司, 山本崇, 加藤英寿, 陶山佳久, 梶田忠

    日本植物分類学会第 16 回大会　2017年3月9日

  200. ゲノムワイド SNP 解析によるムカゴ を形成するホトトギス属植物の系統的位置づけ

    中舛理玖, 井上康彦, 陶山佳, 綱本良啓, 阪口翔太, 瀬戸口浩彰

    日本植物分類学会第 16 回大会　2017年3月9日

  201. 次世代型シークエン サーを用いた日本におけるアザミ属(Cirsium)の系統解析

    森重剛志, 渡辺洋一, 伊藤元己, 加藤俊英, 陶山佳久, 綱本良啓, 満行知花, 上原浩一

    日本植物分類学会第 16 回大会　2017年3月9日

  202. 地域に残る「生物の伝統」を「売り」にする

    陶山佳久

    南三陸町ワークショップ　2017年2月23日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  203. MIG-seq法：NGSによる簡便な遺伝的多型解析

    陶山佳久

    第３回ゲノム多様性解析ワークショップ　2016年12月5日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  204. MIG-seqライブラリ構築法の改良

    満行知花, 綱本良啓, 陶山佳久

    第48回種生物学シンポジウム　2016年12月2日

  205. Mix cropping trial of determinate and indeterminate soybean cultivars in Kawatabi Field Science Center 国際会議

    Ayumi Sadaike, Momoko Ogawa, Koki Homma, Takayuki Nakajima, Toyoaki, Ito, Yoshihisa Suyama, Shinji Iizuka, Isao Karube, Yoshiaki Motoyama

    he 14th International Symposium on Integrated Field Science　2016年11月27日

  206. ニューカレドニア産希少植物 Oxera 属樹種の保全遺伝学的研究

    藤田琴実, 満行知花, 綱本良啓, 井鷺裕司, Gildas Gâtebl, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第61回大会　2016年10月29日

  207. 湿原および山岳氷河の堆積物から得られた植物試料を対象とした古代DNA分析

    丹野たかね, 高原光, 中澤文男, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第61回大会　2016年10月29日

  208. 巨大樹木ジャイアントセコイアの個体内における体細胞間ゲノム変異の検出

    斎藤遥花, 満行知花, 綱本良啓, 石井弘明, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第61回大会　2016年10月29日

  209. 1995年に一部が同調開花・枯死したチシマザサ個体群におけるジェネットの多様性と空間分布

    大矢陽太, 富松裕, 陶山佳久, 松尾歩, 蒔田明史

    日本生態学会東北地区会第61回大会　2016年10月29日

  210. Improvement of MIG-seq: as an effective method for conservation genetics of Mangroves 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Yoshihiro Tsunamoto, Chika Mitsuyuki

    The 3rd International Workshop for Conservation Genetics of Mangroves - Toward the Conservation Genetics of Mangroves on a Global Scale -　2016年10月18日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  211. Discrimination of the three Chattonella species, C. antiqua, C. marina, C. ovata using multiplexed ISSR genotyping by sequencing (MIG-seq) analysis 国際会議

    Nagai, S, Urushizaki, S, Kawachi, M, Mitsuyuki, C, Suyama, Y

    The 17th International Conference on Harmful Algae　2016年10月9日

  212. イタドリにみられる地理的変異の解明―在来緑化植物の地域性の検討に向けて―

    木村元則, 今西純一, 今西亜友美, 井鷺裕司, 陶山佳久, 柴田昌三

    第47回日本緑化工学会大会　2016年9月22日

  213. アイスコアに含まれる花粉を利用した植物種の古代ゲノム解析の可能性

    日本地球惑星科学連合大会2016　2016年5月22日

  214. MIG-seq: rapid SNP genotyping for conservation genetics using NGS 国際会議

    Yoshihisa Suyama

    The 7th EAFES International Congress　2016年4月19日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  215. Genetic status and its implication for conservation in two critically endangered plant species in Korea: Euchresta japonica and Hydrangea luteovenosa 国際会議

    Çhoi, H. J, Kaneko, S, Yokogawa, M, Suyama, Y, Isagi, Y

    The 7th EAFES International Congress　2016年4月19日

  216. 落葉広葉樹クリにおける種子散布制限と尾根ごと に異なる遺伝的組成

    長谷川陽一, 高田克彦, 陶山佳久, 清和研二

    第127回日本森林学会大会　2016年3月27日

  217. ホンシャクナゲとキョウマルシャクナゲの交雑起源集団における花形態の標高クライン

    玉木一郎, 渡辺洋一, 松木 悠, 陶山佳久, 水野瑞夫

    第127回日本森林学会大会　2016年3月27日

  218. 生物多様性を守るためのDNA分析

    陶山佳久

    環境省 環境研究総合推進費 戦略的研究開発領域 「アジア規模での生物多様性観測・評価・予測に関する総合研究（S-9）」公開講演会：生物多様性観測・評価・予測研究の最前線５～アジアの生物多様性はどこまでわかったか～　2016年3月25日

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    本人の講演

  219. MIG-seq法によるゲノムワイドSNP分析によって明らかになったレブンアツモリソウの遺伝的な島内分化

    伏見愛雄, 松木悠, 河原孝行, 高橋英樹, 伊澤岳師, 陶山佳久

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

  220. 伊豆から小笠原諸島におけるヒサカキの遺伝的構造

    阿部晴恵, 須貝杏子, 松木悠, 陶山佳久

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

  221. クローナル植物モウソウチクを用いた低線量放射線の遺伝的影響評価

    兼子伸吾, 松木悠, 猪瀬礼璃菜, 陶山佳久, 井鷺裕司

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

  222. 分断化された二次草地に生息する昆虫個体群の空間遺伝構造

    宮下 直, 今藤夏子, 谷川明男, 清川紘樹, 中島一豪, 陶山佳久, 松木 悠, 坂入一瑳, 長谷川雅美

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

  223. NGS を利用したチシマザサのジェネット内SNPs変異

    岡野邦宏, 松尾歩, 蒔田明史, 鈴木準一郎, 陶山佳久, 井上みずき

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

  224. MIG-seq を用いた集団遺伝学的解析:動物プランクトンへの適用

    牧野渡, 松木悠, 陶山佳久, 占部城太郎

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

  225. 同一樹木個体内における体細胞間ゲノム変異の探索

    陶山佳久

    第63回日本生態学会大会　2016年3月20日

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    本人の講演

  226. Single-pollen genotyping using the next-generation sequencing 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Yu Matsuki, Fumio Nakazawa

    The 13th International Symposium on Integrated Field Science: Conservation and Utilization of Biodiversity　2016年3月9日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  227. Unveiling the genetic variation of the Western hemisphere mangrove genus Rhizophora 国際会議

    Gustavo Maruyama Mori, Mariana Vargas, Stephanie Karenina Bajay, Koji Takayama, Yu Matsuki, Rafael Silva Oliveira, Yoshihisa Suyama, Anete Pereira de Souza, Maria Imaculada Zucchi, Tadashi Kajita

    The 13th International Symposium on Integrated Field Science: Conservation and Utilization of Biodiversity　2016年3月9日

  228. Local genetic differentiation within Rebun Island in Cypripedium macranthos var. rebunense revealed by genome-wide SNP analysis using MIG-seq 国際会議

    Manato Fushimi, Yu Matsuki, Takayuki Kawahara, Hideki Takahashi, Takeshi Izawa, Yoshihisa Suyama

    The 13th International Symposium on Integrated Field Science: Conservation and Utilization of Biodiversity　2016年3月9日

  229. Population genetic analysis for identifying hybrid origin of a dwarf bamboo species in Sasaella 国際会議

    Takamasa Kanno, Yoshihisa Suyama

    The 13th International Symposium on Integrated Field Science: Conservation and Utilization of Biodiversity　2016年3月9日

  230. Conservation genetics of three endangered species of the genus Oxera in the south of New Caledonia 国際会議

    Kotomi Fujita, Yuji Isagi, Gildas Gâteblé, Manato Fushimi, Yoshihisa Suyama

    The 13th International Symposium on Integrated Field Science: Conservation and Utilization of Biodiversity　2016年3月9日

  231. Plant paleogenetics with plant macro-remains from the Last Glacial Maximum 国際会議

    Takane Tanno, Hikaru Takahara, Yoshihisa Suyama

    The 13th International Symposium on Integrated Field Science: Conservation and Utilization of Biodiversity　2016年3月9日

  232. DNA分析によるベルーハ氷河（アルタイ山脈・ロシア）中のマツ属花粉の種同定

    中澤文男, 陶山佳久, 伊村智, 本山秀明

    第6回極域科学シンポジウム　2015年11月19日

  233. Genetic differentiation among local populations of Oxera baladica 国際会議

    Oxera baladica, la Fontaine d’or de Nouvelle-Calédonie　2015年11月12日

  234. 全ゲノム増幅法を用いたベルーハ氷河（アルタイ山脈・ロシア）中のマツ属花粉の種同定

    中澤文男, 陶山佳久, 伊村智, 本山秀明

    雪氷研究大会（2015・松本）　2015年9月13日

  235. 次世代シーケンサーを用いたSNPs分析によるきのこ品種間の遺伝的類縁関係の解析

    菅野(陶山)愛美, 松木 悠, 木村栄一, 鴫原 隆, 陶山佳久

    日本きのこ学会第19回大会　2015年9月4日

  236. An effective PCR-based method for genome-wide SNP genotyping using NGS platform 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Yu Matsuki

    11th Clonal Plant Workshop (Clone 2015)　2015年8月4日

  237. Species identification of Pinus pollen found in a glacier using a whole genome amplification method 国際会議

    Fumio Nakazawa, Yoshihisa Suyama, Satoshi Imura, Hideaki Motoyama

    国際第四紀学会第19回大会　2015年7月26日

  238. MIG-seq: an effective PCR-based method for genome-wide SNP genotyping using NGS platform 国際会議

    Workshop of Young Scientists on Biodiversity and Conservation Biology in Southwest China: Advances in Conservation Genetics　2015年7月10日

  239. MIG-seq：次世代シーケンサーを用いた新たなSNP検出・ジェノタイピング手法

    陶山佳久, 松木悠

    平成27年度環境研究総合推進費「アジアの森林における遺伝子・種多様性アセスメント」拡大アドバイザリー会合　2015年7月5日

  240. ウシルーメン液による植物バイオマス可溶化処理の次世代シーケンサーによる菌叢解析

    馬場保徳, 松木悠, 森裕美, 陶山佳久, 多田千佳, 福田康弘, 齋藤雅典, 中井裕

    日本畜産環境学会第13回大会　2015年6月20日

  241. 次世代シーケンシング分析による海岸林再生用タブノキ苗木の集団遺伝学的解析と産地間生長比較

    三浦正嗣, 陶山佳久

    第126回日本森林学会大会　2015年3月26日

  242. 次世代シーケンサーを用いた山岳氷河中樹木花粉のDNA分析

    松木悠, 中澤文男, 陶山佳久

    第62回日本生態学会大会　2015年3月18日

  243. 自然草原における生物多様性消失シナリオによる生態系機能の変化について

    佐々木雄大, 吉原佑, 高橋昌也, 陶山佳久, Nyambayar Dashzeveg, Xiaoming Lu, Yongfei Bai

    第62回日本生態学会大会　2015年3月18日

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    国際共同研究

  244. 蝶の分布北限の北上と停滞におよぼす遺伝子流動の影響

    長太伸章, 角山智昭, 矢後勝也, 松木悠, 陶山佳久, 牧野能士, 河田雅圭

    第62回日本生態学会大会　2015年3月18日

  245. 森林の防災機能と多面的機能を生かした農村の提案 国際会議

    長南友也, 成田佳寿美, 菅波眞央, 佐藤郁奈, 陶山佳久

    第３回国連防災世界会議公式パブリック・フォーラム（Model Village をつくろう〜新しい農業と安心・安全で豊かな農村の姿を目指して〜）　2015年3月14日

  246. 海岸林再生用タブノキ苗木の集団遺伝学的解析と産地間生長比較

    三浦正嗣, 陶山佳久

    平成26年度東北森林生態研究会　2015年3月11日

  247. 同一樹木個体内における体細胞間ゲノム変異の検出

    伊豆畝, 佐竹暁子, 日浦勉, 陶山佳久

    平成26年度東北森林生態研究会　2015年3月11日

  248. Development of a novel method for conservation genetics with next-generation sequencing: Multiplexed ISSR (inter-simple sequence repeat) Genotyping by sequencing (MIG-seq) 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Yu Matsuki

    Contribution of Genetics to Plant Conservation: International Seminar in Jardim Botânico do Rio de Janeiro　2015年2月6日

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    本人の講演

  249. Development of a novel method for conservation genetics with next-generation sequencing: Multiplexed ISSR (inter-simple sequence repeat) Genotyping by sequencing (MIG-seq) 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Yu Mastuki

    Contribution of Genetics to Plant Conservation: Brazil-Japan International Workshop 2015　2015年2月2日

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    本人の発表

  250. 次世代シーケンシング分析による絶滅危惧植物レブンアツモリソウの集団遺伝学的解析

    伏見愛雄, 松木悠, 河原孝行, 高橋英樹, 伊澤岳師, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第59回大会　2014年12月13日

  251. 絶滅危惧植物レブンアツモリソウのNGS-SNP分析による集団遺伝学的解析

    伏見愛雄, 松木悠, 河原孝行, 高橋英樹, 伊澤岳師, 陶山佳久

    第46回種生物学シンポジウム　2014年12月5日

  252. NGS-SNP分析を用いた集団遺伝学的解析によるササ類の雑種起源の検証

    菅野敬雅, 米倉浩司, 松木悠, 陶山佳久

    第46回種生物学シンポジウム　2014年12月5日

  253. 全ゲノム増幅法を用いた氷河中の花粉の同定

    中澤文男, 陶山佳久, 伊村智, 本山秀明

    第5回極域科学シンポジウム　2014年12月2日

  254. 全ゲノム増幅法を用いた氷河中の花粉1粒ずつの同定

    中澤文男, 陶山佳久, 伊村智, 本山秀明

    日本地球惑星科学連合2014年大会　2014年4月28日

  255. ゲノム増幅法を用いた氷河中の花粉1粒ずつの同定

    中澤文男, 陶山佳久, 伊村智, 本山秀明

    日本地球惑星科学連合2014年大会　2014年4月28日

  256. Phylogeographic analysis of Machilus thunbergii for restoration planting in coastal forests damaged by tsunami 国際会議

    Yoshihisa Suyama

    The 6th EAFES International Congress　2014年4月9日

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    本人の発表

  257. 地域性種苗を用いた津波被災林再生植樹のためのタブノキの系統地理学的解析と植栽試験

    小笠原玄記, 高野義智, 陶山佳久

    第125回日本森林学会大会　2014年3月26日

  258. 次世代DNAシーケンシングによる森林分子生態学的研究

    陶山佳久

    第125回日本森林学会大会　2014年3月26日

  259. 花粉一粒分析を用いた植物生態学的研究

    阿部晴恵, 陶山佳久

    第61回日本生態学会大会　2014年3月14日

  260. 受粉花粉の直接遺伝解析に基づくアゲハチョウを介した送粉パターンの解明

    廣田峻, 新田梢, 陶山佳久, 安元暁子, 矢原徹一

    第61回日本生態学会大会　2014年3月14日

  261. 広域同調開花したチュウゴクザサの更新初期過程—ジェネット構造と繁殖成功度に注目してー

    松尾歩, 富松裕, 陶山佳久, 鈴木準一郎, 齋藤智之, 柴田昌三, 蒔田明史

    第61回日本生態学会大会　2014年3月14日

  262. ササ3種の遺伝学的解析によるアズマザサの雑種起源説の検証

    菅野敬雅, 陶山佳久

    第45回種生物学シンポジウム　2013年11月29日

  263. チマキザサの小規模単独開花ジェネットを対象としたゲノム内変異の探索

    伏見愛雄, 陶山佳久

    第45回種生物学シンポジウム　2013年11月29日

  264. 氷河中の花粉１粒ずつの全ゲノム増幅

    中澤文男, 陶山佳久

    第4回極域科学シンポジウム　2013年11月12日

  265. モンゴルの草原における構成植物種を対象とした遺伝的多様性調査

    高橋昌也, 佐々木雄大, 吉原佑, 梶原惟央璃, Nyambayar Dashzeveg, Tserendejid Ayush, 陶山佳久

    日本生態学会東北支部会第58回大会　2013年10月19日

  266. DNA分析によるササ類の属間雑種の検証

    菅野敬雅, 陶山佳久

    日本生態学会東北支部会第58回大会　2013年10月19日

  267. ササの開花遺伝子に関わるエピジェネティック変異の探索

    伏見愛雄, 陶山佳久

    日本生態学会東北支部会第58回大会　2013年10月19日

  268. 山岳氷河アイスコアから得られた樹木花粉のDNA分析

    松木悠, 陶山佳久

    日本生態学会東北支部会第58回大会　2013年10月19日

  269. Whole genome amplification法による氷河中の花粉１粒ずつのゲノム増幅

    中澤文男, 陶山佳久

    雪氷研究大会（2013・北見）　2013年9月17日

  270. 褐藻綱コンブ目カジメのマイクロサテライトによる集団構造解析

    伊藤知子, 菅野愛美, 陶山佳久, 神山梓, 阪本真吾, 木島明博, 稲葉一男, 青木優和

    日本藻類学会第37回大会　2013年3月27日

  271. 津波被災地の海岸林再生に用いるタブノキの遺伝的地域性の解析

    小笠原玄記, 高野義智, 陶山佳久

    第124回日本森林学会大会　2013年3月25日

  272. モンゴルの放牧地に生育する低木Caraganaの遺伝的多様性とクローン構造

    高橋昌也, 吉原佑, 陶山佳久

    第60回日本生態学会大会　2013年3月5日

  273. 林冠の光環境がチシマザサ一斉更新個体群のジェネット動態に与える影響

    松尾歩, 富松裕, 山月融心, 陶山佳久, 蒔田明史

    第60回日本生態学会大会　2013年3月5日

  274. デュオダイコガミーと自家不和合性がクリの個体内・集団内の開花フェノロジーに与える影響

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    第60回日本生態学会大会　2013年3月5日

  275. チョウセンキバナアツモリソウの保全遺伝学的研究

    九石太樹, 陶山佳久

    第60回日本生態学会大会　2013年3月5日

  276. DNA analysis for section identification of a pine pollen grain from the Belukha glacier, Altai Mountains, Russia 国際会議

    Nakazawa, F, J. Uetake, Y. Suyama, R. Kaneko, N. Takeuchi, K. Fujita, H. Motoyama, S. Imura, H. Kanda

    Third International Symposium on the Arctic Research　2013年1月14日

  277. タケとササの分子生態学

    陶山佳久

    第44回種生物シンポジウム　2012年12月7日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  278. 一斉開花後のササ群落は何年で回復するのか？チシマザサ実生由来奴隷個体群30年間の動態

    蒔田明史, 齊藤智之, 陶山佳久, 鈴木準一郎, 牧田肇

    第44回種生物シンポジウム　2012年12月7日

  279. ベルーハ氷河中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析によって明らかになった花粉の長距離輸送

    中澤文男, 陶山佳久, 竹内望, 藤田耕史, 伊村智, 本山秀明

    第35回極域気水圏シンポジウム　2012年11月29日

  280. Effects of spatial genet structure on sexual reproduction in monocarpic bamboos 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Tomoyuki Saitoh, Aya Nishiwaki, Shozo Shibata, Akifumi Makita

    The 10th Clonal Plant Workshop　2012年10月12日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の発表

  281. How long does it take for the full recovery after synchronous flowering and death of Sasa kurilensis, a dwarf bamboo? – Estimation based on three decade’s demography 国際会議

    Akifumi Makita, Tomoyuki Saitoh, Yoshihisa Suyama, Jun-Ichirou Suzuki, Hajime Makita

    The 10th Clonal Plant Workshop　2012年10月12日

  282. ベルーハ氷河中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析から導き出された花粉長距離輸送の可能性

    中澤文男, 陶山佳久, 竹内望, 藤田耕史, 伊村智, 本山秀明

    雪氷研究大会（2012・福山）　2012年9月23日

  283. DNA analysis for identification of a Pinus pollen grain at subsection level from the Belukha glacier, Altai Mountains, Russia 国際会議

    Nakazawa, F, Y. Suyama, N. Takeuchi, K. Fujita, S. Imura, H. Kanda, H. Motoyama

    13th International Palynological Congress and 9th International Organisation of Palaeobotany Conference - IPC/IOPC 2012　2012年8月23日

  284. タケ・ササ類における一斉開花枯死の周期性とそのずれ

    陶山佳久

    日本進化学会第14回東京大会　2012年8月21日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  285. 亜節レベルでの同定を目的としたベルーハ氷河中のマツ属花粉1粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 陶山佳久, 竹内望, 藤田耕史, 伊村智, 神田啓史, 本山秀明

    日本地球惑星科学連合大会　2012年5月20日

  286. Both butterflies and hawkmoths mediate selection on red flower color against yellow: evidence from genotyping individual pollen grains on the stigma 国際会議

    Hirota, S, Nitta, K, Suyama, Y, Kawakubo, N, Yasumoto, A.A, Yahara T

    Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ & The 5th EAFES International Congress　2012年3月17日

  287. Genetic diversity and reproductive success among small isolated populations of Primula jesoana on Sado Island 国際会議

    Abe, H, Ohtani, M, Suyama, Y, Homma, K, Sakio, H

    Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ & The 5th EAFES International Congress　2012年3月17日

  288. Genetic status and its conservative implications of a critically endangered species in Korea, Euchresta japonica (Leguminosae), based on ubiquitous genotyping. 国際会議

    Choi, H.J, Kaneko, S, Yokogawa, M, Song, G.P, Kim, D.S, Kang, S.H, Suyama, Y, Isagi, Y

    Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ & The 5th EAFES International Congress　2012年3月17日

  289. Ubiguitous genotyping on critically endangered Hydrangea luteovenosa in Korea. 国際会議

    T. Ito, Choi, H. J, Suyama, Y, Kaneko, S, Song, G.P, Kang, S.H, Kim C.S, Isagi Y

    Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ & The 5th EAFES International Congress　2012年3月17日

  290. Inbreeding depression in L. japonicum var.abeanum showing distance polymorphism between stigma and anthers. 国際会議

    Yokota, S, Yahara, T, Suyama, Y

    Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ & The 5th EAFES International Congress　2012年3月17日

  291. 遺伝子から見る森

    陶山佳久

    次世代へ繋ぐ「人と自然との共生」を考えるハローウッズシンポジウム2012　2012年3月1日

    詳細を見る 詳細を閉じる

    本人の講演

  292. 48年周期で一斉開花枯死による更新を繰り返すタケ

    第43回種生物学シンポジウム　2011年12月9日

  293. アゲハもスズメガも赤花を選択する？：花粉一粒ジェノタイピングを用いた送粉成功評価

    廣田峻, 新田梢, 陶山佳久, 川窪伸光, 安元暁子, 矢原徹一

    第43回種生物学シンポジウム　2011年12月9日

  294. 絶滅危惧植物ゴヨウザンヨウラクとその近縁種の集団遺伝学的解析

    小笠原玄記, 阿部晴恵, 牧雅之, 堀江佐知子, 陶山佳久

    第43回種生物学シンポジウム　2011年12月9日

  295. 遺伝的多様性が生態系機能に与える効果：ヨシによる水質浄化システムを用いた検討

    富松裕, 陶山佳久, 中野和典

    第43回種生物学シンポジウム　2011年12月9日

  296. 節レベルでの同定を目的としたベルーハ氷河中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 竹内望, 藤田耕史, 本山秀明, 神田啓史

    第2回極域科学シンポジウム　2011年11月16日

  297. Soil faunal diversity in the beds of full-scale vertical flow constructed wetland. 国際会議

    Kazunori Nakamura, Kazunori Nakano, Tokuo Yano, Yoshihisa Suyama, Osamu Nishimura

    International forum for ecosystem adaptability science Ⅲ　2011年11月

  298. Forest molecular ecology: Gene flow, genetic structure and conservation genetics of Fagus crenata 国際会議

    Korea National Arboretum Symposium　2011年10月28日

  299. Forest molecular ecology: Gene flow, genetic structure and conservation genetics of Fagus crenata 国際会議

    Semyung University International Symposium　2011年10月27日

  300. 鉛直流型人工湿地ろ過層内における微生物及び動物相の解析

    中村和德, 中野和典, 矢野篤男, 陶山佳久, 西村修

    第２７回日本微生物生態学会　2011年10月8日

  301. 節レベルでの識別を目的としたベルーハ氷河中のマツ属花粉１粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 竹内望, 藤田耕史, 本山秀明, 神田啓史

    雪氷研究大会　2011年9月19日

  302. Procedure for Single-Pollen Genotyping in Ecological Research 国際会議

    XVIII International Botanical Congress 2011　2011年7月23日

  303. ベルーハ氷河に含まれるマツ属花粉1 粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 竹内望, 藤田耕史, 本山秀明, 神田啓史

    日本地球惑星科学連合2011年大会　2011年5月22日

  304. 八甲田山田代平のシバ草地に侵入しているブタナの遺伝学的解析

    十亀彩, 杉浦俊弘, 小島達也, 森大祐, 横川輝, 馬場光久, 陶山佳久

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  305. チシマザサ更新個体群における20年目からのクローン競争と成長の過程

    齋藤智之, 陶山佳久, 鈴木準一郎, 西脇亜也, 蒔田明史

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  306. 高山における絶滅危惧植物保全のための全個体ジェノタイピング

    陶山佳久, 阿部晴恵

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  307. ササの"部分開花"は1ジェネットだけの開花なのか？～秋田県内26ヶ所の調査結果から～

    蒔田明史, 佐藤綾香, 井上みずき, 佐藤朋華, 品川朋仁, 松尾歩, 陶山佳久

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  308. 湖底に堆積する動物プランクトン遺骸（ミジンコ休眠卵鞘）の遺伝解析手法の開発

    石田聖二, 大槻朝, 陶山佳久, 占部城太郎

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  309. 日本産ササ類における地理的・形態的・遺伝的変異

    松尾歩, 蒔田明史, 陶山佳久

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  310. 低投入型放牧の有用性：野草地と改良草地における生産性と多様性の比較からの検討

    佐々木雄大, 吉原佑, 陶山佳久, 中静透

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  311. アゲハを介した送粉過程：花粉1粒DNA解析を用いた各花形質の送粉貢献度の測定

    廣田峻, 新田梢, 陶山佳久, 川窪伸光, 安元暁子, 矢原徹一

    第58回日本生態学会大会　2011年3月8日

  312. アゲハ類・スズメガ類による花形質への選択：花粉一粒PCRに基づいた送粉成功の評価

    廣田峻, 新田梢, 陶山佳久, 川窪伸光, 安元暁子, 矢原徹一

    第42回種生物学シンポジウム　2010年12月10日

  313. 本産ササ類における形態および葉緑体DNAの変異と類似の把握

    松尾歩, 陶山佳久, 蒔田明史

    第42回種生物学シンポジウム　2010年12月10日

  314. Application of an inexpensive and high-throughput genomic DNA extraction method for the molecular ecology of zooplanktonic remains 国際会議

    Ishida, S, Ohtsuki, H, Suyama, Y, Urabe, J

    International Forum for Adaptability Science II: Technologies for a Sustainable Society　2010年11月30日

  315. DNA解析を利用した生態学

    第39回教材生物ワークショップ　2010年11月16日

  316. DNA分析による氷河試料中のマツ属花粉の分類

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 竹内望, 藤田耕史, 本山秀明, 神田啓史

    日本花粉学会第51回大会　2010年10月8日

  317. 氷河試料中のマツ属花粉１粒ずつDNA 分析（２）

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 竹内望, 藤田耕史, 本山秀明, 神田啓史

    雪氷研究大会（2010）　2010年9月26日

  318. DNA analysis of a single Pinus pollen grain in a glacier for identification of the species 国際会議

    Nakazawa F, J. Uetake, Y. Suyama, R. Kaneko, N. Takeuchi, K. Fujita, H. Kanda

    International Symposium on Snow, Ice and Humanity in a Changing Climate　2010年6月21日

  319. 種レベルでの花粉分析を目的とした氷河中のマツ属花粉1粒ずつのDNA分析（2）

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 藤田耕史, 神田啓史

    日本地球惑星科学連合2010年大会　2010年5月23日

  320. 48年周期で一斉開花したタケ（Melocanna baccifera）群落のジェネット構造と親子解析

    陶山佳久, 齋藤智之, 西脇亜也, 蒔田明史, 柴田昌三

    第121回日本森林学会大会　2010年4月2日

  321. タケ・ササ類の開花様式の概念整理

    蒔田明史, 鈴木準一郎, 陶山佳久

    第121回日本森林学会大会　2010年4月2日

  322. 越冬地の野生ツル集団におけるコクシジウム原虫の分子疫学的調査

    本間一, 陶山佳久, 中井裕

    第149回日本獣医学会学術集会　2010年3月26日

  323. 高山における絶滅危惧植物の全個体ジェノタイピングに基づく保全策の構築‐ヤクシマリンドウを例に

    阿部晴恵, 手塚賢至, 荒田洋一, 斎藤俊浩, 手塚田津子, 陶山佳久

    第57回日本生態学会大会　2010年3月15日

  324. アゲハとスズメガによる花色・花香の選択：花粉一粒PCRを用いた実測

    廣田峻, 新田梢, 陶山佳久, 川窪伸光, 安元暁子, 矢原徹一

    第57回日本生態学会大会　2010年3月15日

  325. Clonal structure and reproductive behavior in a mass flowering population of Melocanna baccifera (Bambusoideae) 国際会議

    Yoshihisa Suyama, Tomoyuki Saitoh, Aya Nishiwaki, Akifumi Makita, Shozo Shibata

    IUFRO Kuala Lumpur 2010　2010年3月7日

  326. Predicting the impact of late-acting inbreeding depression on future genetic variability: an example of the isolated, small population of Sakhalin spruce (Picea glehnii Mast.) 国際会議

    Tomita, M, Suyama, Y, Sugita, H

    IUFRO Kuala Lumpur 2010　2010年3月7日

  327. Expanded home range of pollinator birds facilitates greater pollen flow of Camellia japonica in a forest heavily damaged by volcanic activity. 国際会議

    Harue Abe, Saneyoshi Ueno, Yoshihiko Tsumura, Yoshihisa Suyama, Masami Hasegawa

    International Forum for Ecosystem Management Applying to Ecosystem Adaptability Science I　2010年2月21日

  328. Predicting future genetic variability of a small population of long-living tree from current genetic and demographic data: an example from an isolated, small population of Sakhalin spruce (Picea glehnii Mast.) 国際会議

    Tomita, M, Suyama, Y, Sugita, H

    International Forum for Ecosystem Management Applying to Ecosystem Adaptability Science I　2010年2月21日

  329. Utility of single pollen genotyping 国際会議

    INTERNATIONAL SYMPOSIUM “Toward Developing Global Genetic Diversity Assessments”　2010年2月6日

  330. 遺伝的地域特性に配慮した森林管理

    日本生態学会東北地区会第54回大会（宮城大会）　2009年12月19日

  331. アゲハ類・スズメガ類による花形質への選択：花粉一粒PCR に基づいた送粉成功の評価

    廣田峻, 新田梢, 陶山佳久, 川窪伸光, 安元暁子, 矢原徹一

    第41回種生物学シンポジウム　2009年12月11日

  332. DNA analysis of a single Pinus pollen grain in a glacier 国際会議

    Nakazawa F, J. Uetake, Y. Suyama, R. Kaneko, N. Takeuchi, K. Fujita, H. Kanda

    2009 AGU Fall Meeting　2009年12月

  333. Characteristics of water use in Fagus crenata among 3 sites throughout Japan 国際会議

    Tateishi, M, T. Kumagai, Y. Utsumi, Y. Suyama, T. Hiura

    2009 AGU Fall Meeting　2009年12月

  334. 2）Nakazawa F., J. Uetake, Y. Suyama, R. Kaneko and H. Kanda: DNA analysis of a single pollen grain to determine provenance of modern pollen in Antarctic snow 国際会議

    Nakazawa F, J. Uetake, Y. Suyama, R. Kaneko, H. Kanda

    The 2nd International Symposium on the Dome Fuji ice core and related topics　2009年11月

  335. 氷河試料中のマツ属花粉1粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 植竹淳, 陶山佳久, 金子亮, 竹内望, 藤田耕史, 神田啓史

    第32回極気気水圏シンポジウム　2009年11月

  336. The relationship between reproductive success and clonal structure in a simultaneous flowering population of the monocarpic dwarf bamboo, Sasa veitchii var. hirsta. 国際会議

    A. Mastuo, Y. Suyama, S. Shibata, A. Makita

    7th International Symposium on Integrated Field Science　2009年10月10日

  337. ブナの遺伝的地域性〜最近の分子系統地理学的研究成果より

    陶山佳久, 高橋誠

    日本植物学会第73回大会　2009年9月17日

  338. 氷河試料中のマツ属花粉1粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 陶山佳久, 植竹淳, 竹内望, 藤田耕史, 神田啓史

    雪氷研究大会　2009年9月

  339. The epidemiological survey of coccidia in wild crane flocks in Japan by fecal DNA based identification of crane species and individual bird 国際会議

    Honma H, Suyama Y, Murakoshi F, Oishi R, Matsubara R, Tada C, Nakai Y

    22nd World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology conference　2009年8月8日

  340. 分子生態学概論ー手法編ー

    第137回農林交流センターワークショップ「分子データを用いた遺伝構造解析」　2009年8月3日

  341. リボソームRNA遺伝子領域による野生ツル集団におけるコクシジウム原虫の系統学的、分子疫学的解析

    本間一, 陶山佳久, 渡辺ユキ, 松本文雄, 中井裕

    日本進化原生生物研究会（JSEP）第4回研究会　2009年7月4日

  342. Genet structure and reproductive behavior in a mass flowering population of Melocanna baccifera (Bambusoideae) after a 48-year flowering interval 国際会議

    Y. Suyama, T. Saitoh, A. Nishiwaki, A. Makita, S. Shibata

    9th Clonal Plant Symposium　2009年7月1日

  343. Changes in clonal structure and genetic diversity through the long-lived life history of monocarpic bamboos 国際会議

    A. Makita, A. Matsuo, Y. Suyama, J-I. Suzuki

    9th Clonal Plant Symposium　2009年7月1日

  344. Effects of vegetative growth on reproductive success in a mass-flowering population of the monocarpic dwarf bamboo, Sasa veitchii var. hirsta 国際会議

    A. Mastuo, Y. Suyama, S. Shibata, A. Makita

    9th Clonal Plant Symposium　2009年7月1日

  345. Clonal population dynamics for 28 years in Sasa kurilensis seedling after mass flowering 国際会議

    T. Saitoh, Y. Suyama, A. Nishiwaki, J-I. Suzuki, A. Makita

    9th Clonal Plant Symposium　2009年7月1日

  346. 種レベルでの花粉分析を目的とした氷河中のマツ属花粉1粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 陶山佳久, 植竹淳, 竹内望, 藤田耕史, 神田啓史

    日本地球惑星科学連合大会　2009年5月

  347. 南極に飛来する花粉の起源推定を目的とした花粉1粒ずつのDNA分析

    中澤文男, 陶山佳久, 植竹淳, 神田啓史

    日本地球惑星科学連合大会　2009年5月

  348. 糞便DNA解析による野生ツル集団の種、個体識別とコクシジウム検出

    本間一, 陶山佳久, 中井裕

    第78回日本寄生虫学会大会　2009年3月26日

  349. Gene flow analysis with pericarp, cotyledon and pollen DNA in Fagus crenata

    Y. Suyama

    第120回日本森林学会大会　2009年3月25日

  350. ササの部分開花は単一ジェネットの開花か？～部分開花地における開花・非開花稈のジェネット識別～

    松尾歩, 陶山佳久, 品川朋仁, 佐藤朋華, 蒔田明史

    第120回日本森林学会大会　2009年3月25日

  351. 一斉開花年の異なるチュウゴクザサ集団間の遺伝的組成の比較

    斉藤誠子, 柴田昌三, 松尾 歩, 住吉千夏子, 井鷺裕司, 陶山佳久, 西脇亜也, 蒔田明史

    第120回日本森林学会大会　2009年3月25日

  352. ブナの地理的変異と広葉樹種苗

    高橋誠, 平岡 宏一, 原正利, 藤井紀行, 渡邉敦史, 武津英太郎, 小山泰弘, 片井秀幸, 陶山佳久, 戸丸信弘

    第120回日本森林学会大会　2009年3月25日

  353. 複数産地由来の苗木が植栽されたブナ造林地における生育状況の比較－地域性種苗を用いる必要性を示す実例として－

    小山泰弘, 陶山佳久

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  354. インド・ミゾラム州に分布するタケ（Melocanna baccifera）の一斉開花・更新時を対象とした分子生態学的解析

    陶山佳久, 齋藤智之, 西脇亜也, 蒔田明史, 柴田昌三

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  355. 自殖・近親交配は稚樹個体群のデモグラフィーに影響を与えるか？アカエゾマツ孤立個体群の全個体遺伝子解析

    富田基史, 陶山佳久, 杉田久志

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  356. クリの花粉・果皮・実生のDNA分析による花粉・種子散布パターンの解析

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  357. チュウゴクザサの一斉開花個体群を対象とした遺伝的多様性解析

    松尾歩, 陶山佳久, 齋藤智之, 住吉千夏子, 斎藤誠子, 井鷺裕司, 柴田昌三, 鈴木準一郎, 西脇亜也, 蒔田明史

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  358. 一斉開花後28 年間にわたるチシマザサ実生由来個体群のクローン動態

    齋藤智之, 陶山佳久, 西脇亜也, 鈴木準一郎, 蒔田明史

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  359. 異なる場所に生育するブナの蒸散特性

    立石麻紀子, 熊谷朝臣, 内海泰弘, 陶山佳久, 日浦勉

    第56回日本生態学会大会　2009年3月17日

  360. 植物個体群の全個体ジェノタイピングから得られるもの

    ISMシンポジウム「生態系のリスク管理と適応にむけた統計分析とその現状」　2009年3月9日

  361. 遺伝的地域特性に配慮した植林のための保全遺伝学的研究～宮城県

    日本植物学会東北支部第21回大会福島大会公開シンポジウム　2008年12月13日

  362. 花粉一粒DNA分析法の分子生態学的利用

    第133回農林交流センターワークショップ「分子データを用いた遺伝構造解析」　2008年11月11日

  363. 48年周期で一斉開花するタケ

    第15回日本時間生物学会学術大会　2008年11月8日

  364. アカエゾマツ孤立個体群の繁殖システム：近交弱勢と繁殖成功パターンに着目して

    富田基史, 陶山佳久, 関剛, 杉田久志

    日本生態学会東北地区会第53回大会　2008年11月8日

  365. Gene Flow, genetic structure and conservation genetics of Fagus crenata 国際会議

    The 8th IUFRO International Beech Symposium　2008年9月8日

  366. Phylogeography of Fagus crenata revealed by chloroplast SNPs 国際会議

    M. Takahashi, M. Hara, N. Fujii, Y. Suyama, A. Watanabe, E. Fukatsu, N. Tomaru

    The 8th IUFRO International Beech Symposium　2008年9月8日

  367. Magnitude of early inbreeding depression of an isolated, relict population of Sakhalin spruce (Picea glehnii Mast.) 国際会議

    M. Tomita, Y. Suyama

    IUFRO-CTIA 2008 JOINT CONFERENCE　2008年8月24日

  368. 階層ベイズモデルを用いた親子関係と繁殖パターンの同時推定

    富田基史, 陶山佳久

    第119回日本森林学会大会　2008年3月26日

  369. 一斉開花したチュウゴクザサ群落におけるクローン構造と繁殖努力

    松尾歩, 陶山佳久, 住吉千夏子, 井鷺裕司, 長谷川尚史, 斎藤誠子, 柴田昌三, 阿部佑平, 齋藤智之, 西脇亜也, 鈴木準一郎, 蒔田明史

    第119回日本森林学会大会　2008年3月26日

  370. 分子生態学的手法を利用した植物のクローン構造とジーンフロー解析

    陶山佳久

    日本草地学会仙台大会小集会　2008年3月24日

  371. チシマザサとチュウゴクザサのクローン構造

    松尾歩, 住吉千夏子, 斉藤誠子, 山月融心, 陶山佳久, 蒔田明史

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  372. 48年ごとに咲くタケ・・インド・ミゾラム地方のメロカンナの一斉開花・更新

    柴田昌三, 池田邦彦, 陶山佳久, 齋藤智之, 長谷川尚史, 箕口秀夫, 西脇亜也, 蒔田明史

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  373. タケササ類の開花・更新時を対象とした分子生態学的解析

    陶山佳久

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  374. クリの訪花昆虫に付着した花粉一粒ずつのDNA分析による送粉パターンの解析

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  375. 三宅島の噴火がヤブツバキの繁殖をめぐる花粉媒介系に与えた影響－鳥類が運ぶ花粉粒の直接遺伝解析

    阿部晴恵, 上野真義, 山本裕, 陶山佳久, 津村義彦, 長谷川雅美

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  376. 葉緑体SNPによるブナの系統地理学的な研究－分布域全体をほぼ網羅したハプロタイプ地図の作成－

    高橋誠, 原正利, 藤井紀行, 陶山佳久, 津田吉晃, 小山泰弘, 片井秀幸, 小谷二郎, 斎藤真己, 上野満, 伊藤聡, 小山浩正, 西川浩己, 小澤創, 宮崎祐子, 瀧井忠人, 和田覚, 島田博匡, 花岡創, 吉丸博志, 松本麻子, 渡邉敦史, 武津英太郎, 岩泉正和, 福田陽子, 橋本光司, 戸丸信弘

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  377. 早池峰山のアカエゾマツ孤立小集団の更新メカニズム：種子散布・近交弱勢は稚樹の個体群構造に影響するか？

    富田基史, 陶山佳久, 関剛, 杉田久志

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  378. タケ類の一斉開花直前の個体群構造ーインド・ミゾラム州におけるMelocanna baccifera

    齋藤智之, 池田邦彦, C.H.モンプイヤ, 陶山佳久, 西脇亜也, 蒔田明史, 柴田昌三

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  379. ブナの水利用様式の地理変異

    立石麻紀子, 熊谷朝臣, 陶山佳久, 日浦勉

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  380. 花粉を介した遺伝子流動の時空間的不均一性 ～ブナ花粉は風と共にさりぬ～

    花岡創, 富田基史, 袴田康子, 陶山佳久, 向井譲

    第55回日本生態学会大会　2008年3月14日

  381. 花粉一粒のDNA分析方法

    陶山佳久

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

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    本人の講演

  382. 花粉1粒の直接遺伝解析に基づくホオノキ訪花昆虫の送粉効率評価

    松木 悠, 舘野隆之輔, 柴田銃江, 陶山佳久, 井鷺裕司

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

  383. クリ花粉一粒ずつのマイクロサテライト分析による花粉流動解析

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

  384. ハイマツ・キタゴヨウ交雑帯における交配パターン：花粉分散から種子形成まで

    綿野泰行, 朝川毅守, 伊東めぐみ, 陶山佳久

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

  385. ブナの遺伝的地域特性に配慮して種苗配布範囲設定に関する分子系統地理学的研究

    菅野学, 陶山佳久, 原正利, 高橋誠, 渡邊敦史, 清和研二

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

  386. ブナ個体群密度がブナの花粉散布及び種子生産に与える影響

    沼野直人, 陶山佳久

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

  387. 早池峰山のアカエゾマツ孤立集団における繁殖成功パターンの推移

    富田基史, 陶山佳久, 関剛, 杉田久志

    第54回日本生態学会大会　2007年3月19日

  388. ブナ植林による遺伝子攪乱の可能性とホームサイトアドバンテージの検証

    菅野学, 陶山佳久

    第３８回種生物学シンポジウム　2006年12月1日

  389. ブナ植林に使用された種苗の分子系統地理学的由来とその生育実態

    菅野学, 陶山佳久, 原正利, 高橋誠, 渡邊敦史, 清和研二

    日本生態学会東北地区会第51回大会　2006年11月25日

  390. 大面積調査地におけるブナ個体群の遺伝構造

    沼野直人, 陶山佳久

    日本生態学会東北地区会第51回大会　2006年11月25日

  391. 早池峰山のアカエゾマツ集団の交配パターン

    富田基史, 陶山佳久, 関剛, 杉田久志

    日本生態学会東北地区会第51回大会　2006年11月25日

  392. Genetic structure of natural and planted populations of Fagus crenata in Miyagi prefecture, Japan 国際会議

    Manabu Kanno, Yoshihisa Suyama, Masatoshi Hara, Makoto Takahashi, Atsushi Watanabe

    Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation　2006年10月1日

  393. Effects of population density on pollen flow in the wind-pollinated tree, Fagus crenata 国際会議

    Naoto Numano, Yoshihisa Suyama

    Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation　2006年10月1日

  394. Heterogeneous pattern of pollen flow and mating success in a small, isolated population of Picea glehnii Masters in Mt. Hayachine, northern Japan 国際会議

    Motoshi Tomita, Yoshihisa Suyama, Takeshi Seki, Hisashi Sugita

    Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation　2006年10月1日

  395. Construction of high-resolution chloroplast haplotype map in Fagus crenata for phylogeography and conservation 国際会議

    M. Takahashi, A. Watanabe, S. Goto, E. Fukatsu, Y. Goto-Fukuda, M. Kanno, Y. Suyama, N. Tomaru

    Population Genetics and Genomics of Forest Trees: From Gene Function to Evolutionary Dynamics and Conservation　2006年10月1日

  396. 種子の遺伝子型解析によって明らかとなったアポイ岳におけるハイマツ・キタゴヨウ・自然雑種間の交配パターン

    伊東めぐみ, 朝川毅守, 綿野康行, 陶山佳久

    日本植物学会第70回大会　2006年9月13日

  397. 体表付着花粉の遺伝子型解析によるホオノキ訪花昆虫の送粉特性解析

    松木悠, 井鷺裕司, 陶山佳久, 舘野隆之輔, 柴田銃江

    第117回日本森林学会大会　2006年4月1日

  398. ブナ林の分断化がブナ種子の充実率及び遺伝的組成に与える影響

    沼野直人, 陶山佳久, 清和研二

    第117回日本森林学会大会　2006年4月1日

  399. 分子系統地理学的解析を用いた宮城県内におけるブナ苗木の流通許容範囲の推定

    菅野学, 陶山佳久, 原正利, 高橋誠, 渡邊敦史, 清和研二

    第117回日本森林学会大会　2006年4月1日

  400. Gene dispersal and relative fertility in Fagus crenata revealed by parentage analysis with pericarp and cotyledon DNA 国際会議

    Yoshihisa Suyama

    2nd Scientific Congress of East Asian Federation of Ecological Societies　2006年3月25日

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    本人の発表

  401. 北海道の亜高山性針葉樹林におけるエゾマツの繁殖構造および花粉動態

    富田基史, 斉藤秀之, 陶山佳久

    第53回日本生態学会大会　2006年3月24日

  402. 花粉一粒ずつを対象としたＤＮＡ分析によるクリの送粉パターンの解明

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    第53回日本生態学会大会　2006年3月24日

  403. 多年生草本レンゲショウマの種子生産に影響をおよぼす要因の解析

    木村恵, 鈴木まほろ, 陶山佳久

    第53回日本生態学会大会　2006年3月24日

  404. 森林の更新動態解明のための新しい分子生態学的アプローチ

    陶山佳久

    日本植物学会第69回大会　2005年9月20日

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    本人の講演

  405. マイクロサテライト分析による親子特定技術を利用したブナ実生個体群の動態解析

    陶山佳久, 丸山 薫, 富田瑞樹, 高橋 誠, 清和研二

    第7回日本進化学会大会　2005年8月26日

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    本人の発表

  406. Population dynamics of seedlings of Fagus crenata revealed by parentage analysis with microsatellite DNA 国際会議

    Suyama, Y, K. Maruyama, M. Tomita, M. Takahashi, K. Seiwa

    The Ecological Society of America 90th Annual Meeting held jointly with the IX International Congress of Ecology　2005年8月7日

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    本人の発表

  407. 分子生態学的アプローチによるブナ天然林の更新過程の解析

    陶山佳久

    平成17年度林木育種推進東北地区協議会　2005年7月25日

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    本人の講演

  408. DNA分析により種子親特定されたブナ実生個体群の4年間の動態

    陶山佳久, 丸山 薫, 富田瑞樹, 高橋 誠, 清和研二

    第１１６回日本森林学会大会　2005年3月27日

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    本人の講演

  409. 山林火災跡地におけるＶＡ菌根菌の18ＳｒＤＮＡ解析

    三宅彩子, 堀越孝雄, 陶山佳久, 井鷺裕司

    第52回日本生態学会大会　2005年3月27日

  410. クリにおける2タイプの雄花の開花が訪花昆虫の行動に与える影響

    長谷川陽一, 陶山佳久, 清和研二

    第52回日本生態学会大会　2005年3月27日

  411. オニグルミにおける花粉流動パターンの2年間の比較

    木村恵, 陶山佳久, 清和研二, Keith Woeste

    第52回日本生態学会大会　2005年3月27日

  412. 分断化されたブナ個体群における遺伝的多様性の喪失に関する研究

    沼野直人, 陶山佳久, 山本志保, 富田瑞樹, 清和研二

    第１１６回日本森林学会大会　2005年3月27日

  413. Mating system and pollen flow in a heterodichogamous tree, Juglans ailanthifolia 国際会議

    Kimura, M, Y. Suyama, K. Seiwa, K. Woeste

    the First EAFES International Congress　2004年10月20日

  414. Gene dispersal and relative fertility in Fagus crenata: Male vs. female function 国際会議

    Y. Suyama, K. Maruyama, K. Seiwa, M. Tomita, J. Takahashi, M. Takahashi, N. Ueno

    Population, Evolutionary and Ecological Genomics of Forest Trees　2004年9月13日

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    本人の発表

  415. マイクロサテライトマーカーによる花粉一粒を対象とした遺伝子型解析

    井鷺裕司, 近藤俊明, 松木悠, 陶山佳久

    第51回日本生態学会大会　2004年8月25日

  416. 分子マーカーを用いたブナ林の種子・花粉散布パターンの解析

    陶山佳久, 丸山薫, 清和研二, 高橋誠, 富田瑞樹, 高橋淳子, 上野直人

    第一回東北大学バイオサイエンスシンポジウム　2004年5月14日

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    本人の発表

  417. ブナにおける雄・雌機能としての遺伝子散布パターンと繁殖成功

    丸山薫, 清和研二, 高橋誠, 富田瑞樹, 高橋淳子, 上野直人

    第115回日本林学会大会　2004年3月31日

  418. ブナ天然林における種子親別ブナ実生の生存に影響する環境要因

    丸山薫, 陶山佳久, 清和研二, 富田瑞樹

    第115回日本林学会大会　2004年3月31日

  419. 落葉広葉樹の個体サイズごとの空間分布パターン

    山崎実希, 寺原幹生, 加納研一, 陶山佳久, 清和研二

    第115回日本林学会大会　2004年3月31日

  420. 落葉広葉樹天然林の樹木の分布パターンに与える地形の影響

    寺原幹生, 山崎実希, 加納研一, 陶山佳久, 清和研二

    第115回日本林学会大会　2004年3月31日

  421. 同一河川におけるオニグルミ集団間の花粉流動解析

    木村恵, 陶山佳久, 清和研二, Keith Woeste

    第115回日本林学会大会　2004年3月31日

  422. 落葉広葉樹天然林において地形が高木種の分布パターンに与える影響

    寺原幹生, 山崎実希, 加納研一, 陶山佳久, 清和研二

    第35回種生物学シンポジウム　2003年12月12日

  423. Seed and pollen dispersal in Japanese beech: exact identification of parental trees with pericarp and cotyledon DNA 国際会議

    K. Maruyama, K. Seiwa, M. Tomita, J. Takahashi, M. Takahashi, N. Ueno

    International Symposium “Diversity of Reproductive System in Plants: Ecology, Evolution and Conservation”　2003年10月16日

  424. Genetic structure and pollen flow in Heterodichogamous Juglans ailanthifolia 国際会議

    Kimura, M, Y. Suyama, K. Seiwa

    International Symposium “Diversity of Reproductive System in Plants: Ecology, Evolution and Conservation”　2003年10月16日

  425. Isolation of DNA from subfossil pollen 国際会議

    L. Parducci, M. Lascoux, K. Bennett

    Introducing genetic and palaeogenetic approaches in plant palaeoecology and archaeology　2003年9月5日

  426. ブナ林における種子と花粉の動き：果皮と子葉のDNA分析による正確な親個体特定

    丸山薫, 清和研二, 富田瑞樹, 高橋淳子, 高橋誠, 上野直人

    日本進化学会第５回大会　2003年8月1日

  427. Clonal structure of Sasa palmata population by AFLP analysis in Fagus crenata forest understorey 国際会議

    T. Saitoh, K. Seiwa, Y. Suyama

    7th Clonal Plant Workshop　2003年8月1日

  428. Dynamics of clonal structure in a Bamboo cohort during 21 years in the regeneration process after mass flowering 国際会議

    A. Makita, Y. Suyama, T. Saitoh, A. Nishiwaki

    7th Clonal Plant Workshop　2003年8月1日

  429. 雌性先熟・雄性先熟個体をもつオニグルミの繁殖生態

    木村恵, 陶山佳久, 清和研二, 上野直人, 後藤晋, 松井理生, 高橋康夫, Keith Woeste

    日本進化学会第５回大会　2003年8月1日

  430. クリ実生の母樹の特定

    佐藤元紀, 清和研二

    第114回日本林学会大会　2003年3月27日

  431. 胞子を材料とした、アーバスキュラー菌根菌の種間および種内変異のPCR-DGGE法による検出

    佐藤航一, 陶山佳久, 斎藤雅典, 菅原和夫

    2003年度日本草地学会大会　2003年3月24日

  432. Molecular approaches to the analysis of regeneration process of forest trees 国際会議

    Y. Suyama, K. Maruyama, J. Takahashi, M. Tomita, M. Takahashi, N. Ueno, K. Seiwa

    The 50th annual Meeting of the Ecological society of Japan　2003年3月19日

  433. 雌雄異株性樹木オノエヤナギの個体群動態と性比の推移

    上野直人, 陶山佳久, 清和研二

    第50回日本生態学会大会　2003年3月19日

  434. マイクロサテライトマーカーを用いたオニグルミ低密度林分での花粉流動解析

    木村恵, 陶山佳久, 後藤晋, 松井理生, 高橋康夫, 清和研二, Keith Woeste

    第50回日本生態学会大会　2003年3月19日

  435. 並作年と豊作年におけるブナの種子散布パターンの解析—マイクロサテライトマーカーを用いた種子親特定−

    富田瑞樹, 陶山佳久, 平吹喜彦, 上野直人, 清和研二

    第50回日本生態学会大会　2003年3月19日

  436. Outcrossing rates of Shorea curtisii: comparison between undisturbed and selectively logged compartments in Semangkok Forest Reserve 国際会議

    Lee, C.T, Norwati, M, Lee, S.L, Obayashi, K, Tsumura, Y, Suyama, Y, Niiyama, K

    the Seventh Round-Table Conference on Dipterocarps　2002年10月7日

  437. Identification of the maternal trees for current-year seedlings of Fagus crenata based on microsatellite analysis 国際会議

    M. Tomita, J. Takahashi, M. Takahashi, N. Ueno, K. Seiwa

    VIII INTECOL International Congress of Ecology　2002年8月11日

  438. Reproductive effort, reproductive success and pollen flow in heterodichogamous Juglans ailanthifolia 国際会議

    Kimura, M, Y. Suyama, K. Seiwa, K. Woeste

    VIII INTECOL International Congress of Ecology　2002年8月11日

  439. Intraspecific diversity of Thysanophora penicillioides and genetic structure in the species population 国際会議

    Iwamoto S, Tokumasu S, Ogawa Y, Suyama Y, Kakishima M

    Seventh International Mycological Congress　2002年8月11日

  440. 分子マーカーを用いた集団内のジーンフロー解析および個体識別

    個体群生態学会研究集会「初夏の学校」　2002年6月1日

  441. DNA多型解析を用いた森林植物の生活史研究

    平成14年度日本菌学会関東支部年次大会　2002年4月20日

  442. ヒノキ根株腐朽病を起こすキンイロアナタケの感染戦略

    田端雅進, 陶山佳久, 阿部恭久

    第113回日本林学会大会　2002年4月2日

  443. AFLP分析を用いたチシマザサ実生由来個体群のジェネット構造解析

    齋藤智之, 陶山佳久, 蒔田明史, 西脇亜也, 清和研二

    第113回日本林学会大会　2002年4月2日

  444. クリの種子散布・実生定着に与える下層植生の影響—磁石による追跡調査—

    佐藤元紀, 清和研二, 陶山佳久, 加納研一

    第113回日本林学会大会　2002年4月2日

  445. DNAで見る植物の生活史—花粉・種子・個体群構造の動きが見えるー

    第49回生態学会大会自由集会「フェノロジー研究会」　2002年3月30日

  446. ブナ天然林におけるブナ当年生実生の種子親特定

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  447. 生理的統合機能をもつチマキザサの空間分布パターン

    齋藤智之, 陶山佳久, 西脇亜也, 清和研二

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  448. ササ群落は20年間で回復したか？一斉開花枯死後のチシマザサ群落実生由来個体群のクローン構造

    蒔田明史, 齋藤智之, 陶山佳久, 西脇亜也, 牧田肇

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  449. Neobalanocarpus heimii（フタバガキ科）におけるマイクロサテライトマーカーを用いた繁殖様式及び近交弱勢の評価

    内藤洋子, 小沼明弘, 岩田洋佳, 陶山佳久, 清和研二, 奥田敏統, Lee S.L, Norwati M, 津村義彦

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  450. 河川の本流・支流に形成されたオノエヤナギ個体群間の遺伝的多様性比較

    戸澤宗孝, 陶山佳久, 上野直人, 清和研二

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  451. オニグルミ自然個体群における花粉親としての繁殖成功の実測

    木村恵, 陶山佳久, 清和研二, Keith Woeste

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  452. イチイ・キャラボクにおける葉緑体DNAの超多型塩基配列と地理的分布

    近藤俊明, 陶山佳久, 井鷺祐司

    第49回生態学会大会　2002年3月25日

  453. マイクロサテライトマ−カ−を用いたオニグルミ自然個体群の花粉流動解析

    木村 恵, 陶山佳久, 清和研二, Keith Woeste

    第33回種生物学シンポジウム　2001年12月7日

  454. アロザイム・mtDNA・cpDNAの分析によるモミ属の系統と多様性解析

    第10回バイテク林木育種研究会　2001年4月5日

  455. クリの種子散布に与える下層植生の影響〜磁石による追跡調査〜

    佐藤元紀, 清和研二, 陶山佳久, 加納研一

    第112回日本林学会大会　2001年4月2日

  456. キャラボク群落内で見出された超多型葉緑体DNA塩基配列

    井鷺裕司, 陶山佳久

    第48回日本生態学会大会　2001年3月26日

  457. オニグルミの雌性・雄性先熟個体間における繁殖努力と繁殖成功の比較

    木村 恵, 陶山佳久, 清和研二

    第48回日本生態学会大会　2001年3月26日

  458. 生育段階の異なるオノエヤナギ個体群におけるジェネットおよびラメットレベルの性比

    上野直人, 陶山佳久, 清和研二

    第48回日本生態学会大会　2001年3月26日

  459. AFLP分析を用いたブナ林内におけるチマキザサ個体群のクローン構造解析

    齋藤智之, 陶山佳久, 清和研二

    第48回日本生態学会大会　2001年3月26日

  460. オオシラビソ落葉生息菌Thysanophora penicillioides におけるrDNA-ITS領域の集団遺伝学的解析

    岩本晋, 陶山佳久, 徳増征二

    第48回日本生態学会大会　2001年3月26日

  461. Neobalanocarpus heimii (フタバガキ科)におけるマイクロサテライト多型を用いた繁殖機構の分析

    内藤洋子, 陶山佳久, 清和研二, 奥田敏統, S. L. Lee, M. Norwati, 小沼明弘, 津村義彦

    第48回日本生態学会大会　2001年3月26日

  462. 植物繁殖生態学におけるAFLPの利用法〜クローン識別・父性解析・性比の解析〜

    木村恵, 齋藤智之, 上野直人, 清和研二

    第32回種生物学シンポジウム　2001年2月9日

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共同研究・競争的資金等の研究課題 60

  1. 日本列島の森林生態系の形成過程の解明

    津村 義彦, 東城 幸治, 竹中 將起, 内山 憲太郎, 森 英樹, 戸丸 信弘, 阪口 翔太, 百原 新, 陶山 佳久, 松井 哲哉, 石濱 史子, 後藤 晋

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

    研究機関：University of Tsukuba

    2024年4月1日 ～ 2029年3月31日

  2. 生物間相互作用によるBVOCの改変

    塩尻 かおり, 韓 慶民, 山尾 僚, 陶山 佳久, 松岡 俊将

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

    研究機関：Ryukoku University

    2023年4月1日 ～ 2028年3月31日

  3. 集団ゲノミクス解析を用いたニューカレドニアの隠蔽種発見による植物保全遺伝学の展開

    陶山 佳久, 井鷺 裕司, 高橋 大樹, 松尾 歩

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))

    研究機関：Tohoku University

    2021年10月7日 ～ 2027年3月31日

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    生物多様性ホットスポットとして知られるニューカレドニアにおいて、急速に失われつつある自然植生を構成する固有植物の１群であるAcropogon属の現地分布調査およびDNA分析用試料の採取を計画した。ただし、初年度は新型コロナウイルス感染症の影響を考慮して渡航の計画は立てず、海外共同研究者がすでに保有している乾燥標本等を利用し、予備データとしてのDNA分析およびデータ解析を実施した。具体的には、合計28種から採取された137サンプルの提供を受けたが、そのうち押し葉標本から採取された23種54サンプルについては保存状態が悪く、そのうち1種2サンプルのみからデータを取得することができた。一方、DNA分析用サンプルとしてシリカゲルによる乾燥が行われた27種89サンプルについては、最終的に19種および推定未記載種1種の47サンプルについて、分子系統解析用のMultiplexed ISSR Genotyping by sequencing（MIG-seq）法（Suyama & Matsuki, 2015）を用いたゲノムワイドDNA分析によってデータ取得を行うことができた。データ解析の結果、全体として既知の分類知見にほぼ合致した系統関係が得られたとともに、種が不明であった3サンプルについては種名が推定され、同定間違いについても2サンプルで判明した。そのほか、未記載種である可能性が高いと考えられる1サンプルも明らかとなった。以上のことから、これまで全く調べられていなかったAcropogon属の分子系統関係の基礎データが得られたといえる。なお、このデータ取得は日本側の若手研究者が担当し、試料提供側研究者も、新たに加わった若手研究者であったため、この分野の未来を担う若手研究者の養成という視点においても十分な成果が得られた。

  4. 造礁サンゴ類の見えない多様性-その可視化と成因推定および将来予測

    安田 仁奈, 岩崎 渉, 栗原 晴子, 深見 裕伸, 目崎 拓真, 陶山 佳久, 長井 敏, 山北 剛久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：The University of Tokyo

    2023年4月1日 ～ 2026年3月31日

  5. 日本産針葉樹全種の遺伝的多様性統合解析

    陶山 佳久, 北村 系子, 津村 義彦, Worth James, 内山 憲太郎, 青木 裕一, 戸丸 信弘, 岩泉 正和, 高橋 大樹, 逢沢 峰昭, 玉城 聡

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Tohoku University

    2023年4月1日 ～ 2026年3月31日

  6. ゲノム内の特異系統シグナルで探る植物の適応放散プロセス

    井鷺 裕司, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyoto University

    2022年4月1日 ～ 2026年3月31日

  7. 次世代DNAバーコーディングによる近縁生物混合試料の構成解析

    陶山 佳久

    2021年7月9日 ～ 2024年3月31日

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    本研究では、本研究代表者らが開発した次世代シーケンシング技術であるMultiplexed ISSR Genotyping by sequencing（MIG-seq）法（Suyama & Matsuki, 2015）を用い、種内レベルの近縁な生物組織の混合試料の構成を明らかにする技術開発を実施している。その第一歩として、2021年度には１）加工食品における混入品種の識別技術開発と、２）古代遺跡の堆積土壌を対象とした古代植生解析のため試料採取を実施した。 加工食品における混入品種の識別に関しては、食用マメの2品種を粉砕して混合し、混合試料を構成する2品種を特定する技術開発を進めた。その前段階として、20品種以上の食用マメから抽出したDNAを用いてMIG-seq法によってDNA品種識別するためのデータを取得した。その結果、ある品種とその突然変異品種と考えられている品種間以外では明瞭に品種識別が可能であることがわかった。そこで、それらの品種の中から2品種を選び、合計4つの組み合わせで2品種のマメを粉砕して混合した模擬混合試料を作成した。この模擬試料を対象としてMIG-seq法による構成品種の特定を試みたところ、それら4つの組み合わせ試料すべてにおいて、混合した2品種を正確に特定することができた。さらに、試験的に市販の加工食品における品種の特定を試みたところ、１つの製品については2品種の構成によって99％以上の配列が説明できることがわかり、少なくとも主要構成品種の特定はほぼ可能であることがわかった。 古代遺跡の堆積土壌を対象とした古代植生解析については、奄美諸島の徳之島に所在する縄文時代からの遺跡発掘に参加し、その堆積土壌から古代DNA分析用の試料を採取した。この分析については極めて困難が予想されるため、今後技術開発を進めていく予定である。

  8. 標高上下間での植物の遺伝的分化と、送粉昆虫が分化の維持に果たす役割

    市野 隆雄, 陶山 佳久

    2019年4月1日 ～ 2024年3月31日

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    本年度は、まず、長野県の4つの山域を中心にキツリフネ葉サンプルの採取を行い、MIG-seq法を用いてゲノムワイドなSNPs探索を行い、得られたデータについて集団遺伝解析を行なった。その結果、各山域を単位とする遺伝的なまとまりが検出された一方、開花時期の異なる集団間での遺伝的な構造は認められなかった。加えて、距離による遺伝的隔離の傾向が認められた。これらの結果は、開花時期の集団間変異は山域ごとに独立に生じ、同一山域の集団間では遺伝子流動が維持されていることを示している。ただ、一部の調査地域（松本市、安曇野市）では、距離的に近い2集団の間で遺伝的分化が大きいという現象を見出した。これらの近距離2集団では、開花時期が互いに大きく異なっていた。 次に、東日本各地から採取したウツボグサ葉サンプルについて、MIG-seq法によって探索したSNPsを用いた系統解析を行った。その結果、東日本のウツボグサは大きく二つの系統に分けられた。そのうち長野県のほとんどの集団を含む一系統においては単系統性が支持され、距離による遺伝的隔離の傾向が認められた。しかし、もう一方の系統では北海道と長野県の集団が近縁になるなど地理的に明瞭な遺伝構造が見出されなかった。 最後に、オドリコソウとキバナノヤマオダマキについて、長野県の複数山域で花-訪花者の形態的なサイズマッチングの調査、および集団遺伝解析を行った。まず、両種とも、どの山域でも大型の訪花者が訪れる植物集団は花サイズが大型であり、小型の訪花者が訪れる植物集団は花サイズが小型であった。次に、両種とも、集団間の花サイズの類似度と遺伝的な類似度には関連性がなかった。これらの結果から、花サイズは、地域ごとの平均的な訪花者サイズに適応して山域間で独立に進化していることが示された。

  9. アリの捕食がもたらすアブラムシ口吻長の進化：自然界における「育種」

    市野 隆雄, 陶山 佳久

    2021年7月9日 ～ 2023年3月31日

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    本年度は、まず、mtDNAのCOII遺伝子系統樹で単一系統であることが確認されているクチナガオオアブラムシ類の1系統において、品種間分化が起こっていることを明らかにした。国内の20地点において、この系統の624個体を採集し、MIG-seq法を用いて得られた334SNPsの情報から系統樹を作成し、寄主植物種および随伴アリ種との対応関係を調べた。その結果、アブラムシは主に随伴アリ種の違いよりも寄主植物種の違いによって、系統内で品種間分化していることが明らかになった。 次に、ヤノクチナガオオアブラムシの口吻長が遺伝形質であるかどうかを明らかにするため、6つのコロニーから合計265個体を採取し、MIG-seq法を用いて得られた251SNPsを元にクローン解析を行った。その結果、アブラムシをコロニー内でクローンを識別することはできなかった。この原因は今後の課題となる。 最後に、アリが口吻のより短いヤノクチナガオオアブラムを選択的に捕食しているかどうかを明らかにするため、野外観察と形態計測を行った。まず、口吻が長い幼虫個体ほど多くの師管液を吸汁することができ、それに伴ってより多くの甘露を排泄することを明らかにした。次に、アリが口吻の短いアブラムシを選択的に捕食しているかどうかを明らかにすることを目的として野外調査を行った。松本市内において3つのヤノクチナガオオアブラムシコロニーを用いて、アリに捕食されているアブラムシと捕食されていないアブラムシを採取した。その後、各サンプルの口吻長と、体サイズの指標として頭幅、触角長、中後脚のふ節長を測定した。その結果、アリが体サイズに対して口吻長の短いアブラムシを選択的に捕食する場合があることが明らかになった。

  10. 腸管を基軸とした幼若雛の健全育成を支えるニワトリ粘膜免疫学の創成

    野地 智法, イスラム ジャヒドゥル, 佐藤 幹, 喜久里 基, 陶山 佳久, 松尾 歩

    2021年7月9日 ～ 2023年3月31日

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    ニワトリ（鶏）の免疫学に関する教科書には、骨髄で造血幹細胞から分化したB細胞前駆細胞は、排泄腔近傍に存在するファブリキウス嚢でB細胞へと分化し、その後、脾臓やパイエル板（回腸終末部）、盲腸扁桃（盲腸基部）といった免疫臓器で機能すると記載されている（Avian Immunology 2nd Edition）。一方で、我々は、広大な表面積を有する盲腸にも成熟したB細胞が多数集積する濾胞構造が広範囲に発達していることを見出し、盲腸扁桃やパイエル板とは異なる、腸管に発達する新たな免疫臓器（Cecal patches: CP）の存在を明らかにしてきた。加えて、経時的に実施した形態学的解析を通して、CPは盲腸扁桃と同様に孵化後に形態形成されること、腸管の免疫機能に深く関わるIgA（免疫グロブリンのサブクラスの１つ）を産生する形質細胞へのB細胞からの最終分化が、盲腸扁桃やパイエル板以上に、CPで盛んに行われていることを見出し、既存の教科書には記載されていない、孵化後の鶏の腸管内で発達するCPを中心とした粘膜免疫システムの存在を提唱してきた。 <BR> そこで本研究では、孵化1, 2, 3, 5, 7 週間後の肉用鶏（Ross308系）より、盲腸を採材・固定し、CPの形態形成を組織学的に解析した。また、組織切片をIgM, IgA, IgYをマーカーとした免疫組織化学染色に供することで、抗体産生細胞の局在変化も比較解析した。その結果、CP形成が開始される時期は、盲腸扁桃の発達時期よりも少し遅く、孵化2週齢以降であることが明らかになった。このことは、盲腸扁桃とCPの形態形成を促す刺激は異なっている可能性を強く示唆していた。さらには、CPで濾胞構造が発達する時期は3週齢前後であり、同時期に濾胞内でB細胞からIgA産生細胞への最終分化が起きていることも明らかになった。

  11. 植物化石由来のDNA配列から復元する最終氷期以降の亜高山帯性樹木の生存・絶滅過程

    渡辺 洋一, 百原 新, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Chiba University

    2020年4月1日 ～ 2023年3月31日

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    本年度は、化石で球果が多産するマツ科ツガ属の亜寒帯性針葉樹コメツガを対象に化石からの遺伝実験を進めた。コメツガは現在では本州の亜高山を中心に分布するが、最終氷期にはより低標高に分布を下げ、西は九州南部まで分布を広げていたことが化石から確認されている。国内には同属の近縁種ツガも分布するが、現在はほぼ分布を棲み分けている。ただし、球果化石は必ずしも部位の欠失がなく同定がしやすい状態であるとは限らないため、DNA配列での種間・種内系統の識別を目指し葉緑体DNA（父性遺伝）およびミトコンドリアDNA（母性遺伝）について複数種で利用可能なPCRプライマーの設計および検証を行った。 特に化石由来のDNAは長期の埋没によりDNAの断片化や変性が生じているため、さらに150-200bpほどの短い配列を増幅し、かつその中に変異部位を含むする改変したPCRプライマーを設計し化石由来のDNAでの増幅・配列決定を進めた。その結果、葉緑体DNAの領域では化石由来のDNAでPCRを増幅を行い配列の決定ができた。葉緑体DNAの領域では現生のツガ属の種間で変異のあることが確認できていたが、化石（コメツガ）由来のDNAはコメツガであることが確認された。次いで、ミトコンドリアDNAの領域では化石由来のDNAでのPCR増幅は確認できたが、精度の高い配列を決定することができなかった。これはミトコンドリアDNAの多型領域に多くの挿入欠失型の変異が存在するため、もしくは未知の変異があるために増幅が安定しなかった可能性が考えられる。ミトコンドリアDNAの領域では種内系統を識別するような変異が現生個体で確認されていて有用だが、この化石由来のDNAでの検証はまだ終了していない。

  12. 長寿命樹木にみられる幹細胞ゲノムの多様性分析

    佐竹 暁子, 陶山 佳久, 谷 尚樹

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

    研究機関：Kyushu University

    2017年6月30日 ～ 2022年3月31日

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    植物には、何百年・何千年と生き続ける長寿命のものがある。このような長寿命植物では無限に分裂可能な幹細胞が数多く散在するとともに、ゲノムの体細胞間変異が無視できないほど蓄積されていることがこれまで報告されてきた。本研究課題では、このゲノム体細胞間変異を、動けない植物が多様な次世代を創出する戦略としてとらえそれを実証する。 <BR> ●平成29年度は、主に寿命が約2倍異なるシラカンバ（Betula platyphylla）とダケカンバ（B. ermanii）を対象にした分析と、突然変異蓄積プロセスをとらえた数学モデルの構築および解析を行った。北海道大学雨竜演習林を調査地とし種あたり新規に3個体を伐採し芽サンプルを異なる枝より採取した。各枝の長さと年輪情報より齢を推定したところ、シラカンバは平均樹齢70年、ダケカンバは平均樹齢170年であった。寿命の異なる種間比較に絶好のサンプルを準備することができた。 ●実証データで今後示される変異の蓄積パターンを説明するために、突然変異率、枝分岐までに必要な細胞分裂数、芽を形成する幹細胞集団サイズをパラメータとした数学モデルを構築し、枝分岐後の経過時間に依存した突然変異数の推移を予測した。 ●北米に生息し体積世界一の樹木として知られるジャイアントセコイアを対象に、生態学的木登り調査によってすでに採取された枝サンプルを整理し、Migseqによる塩基配列情報の取得を実施した。

  13. 湿原植物群集の過去50年間の多様性の変化と絶滅の負債の定量化に基づく保全策の提案

    佐々木 雄大, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Yokohama National University

    2018年4月1日 ～ 2021年3月31日

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    本研究では、青森県八甲田山系に多数点在する湿原群を対象に、植物相調査、環境要因調査、植物の機能形質（葉の面積や重量、化学組成など）の調査を行った。 種分布と環境要因の関係性から種分布モデルを構築し、過去から現在にかけての湿原の面積減少の空間パターンをベースにした面積減少シミュレーションを行った。結果、面積減少に伴う種の消失は単純な比例関係にはなく、湿原ごとに多様性変化のパターンに差が生じる可能性が示唆された。また、湿原植物の種多様性は、対象湿原の周りにどの程度の数の湿原が過去に存在していたかに依存しており、現在の湿原植物相の多様性が過去の景観の影響を強く受けていることが示唆された。

  14. 生体防御物質から明らかにするスギの環境適応と自然選択

    内山 憲太郎, 韓 慶民, 陶山 佳久, 楠本 倫久, 金谷 整一

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Forest Research and Management Organization

    2018年4月1日 ～ 2021年3月31日

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    全国のスギ天然林由来の挿し木苗が集植されている茨城県千代田苗畑において、生体防御物質の測定を行った。スギ天然林の４つの遺伝グループが含まれる６集団（鯵ヶ沢（日本海側北部）、山之内、安蔵寺（日本海側南部）、河津、新宮（太平洋側）、屋久島）の計56クローンを解析対象とした。 テルペノイド測定用のサンプルを８月に採取し、ヘキサンを溶媒としたメスアップ法によりテルペノイドの抽出を行い、ガスクロマトグラフィーによりジテルペン類の分析を行った。その結果、日本海側系統の北部ならびに屋久島においてジテルペンの量と種類において特徴的な違いが認められた。また、未同定の成分も検出され、スギ針葉内には地域により成分の種類ならびに量に地理的変異があることが示された。 また、カロテノイドの測定では、光ストレスの程度の把握が必要となるため、まず遺伝グループを代表する３集団に対して、8月と11月に光合成速度の測定を行った。その結果、太平洋側系統である新宮集団においてのみ、11月まで光合成速度が低下しないことが明らかとなった。このことは、試験地のある太平洋側環境下では、太平洋側系統の個体のみ遅くまで光合成を行っていることを示しており、光合成能力に関して、環境への適応が起こっていることが示唆された。また、カロテノイド測定用に夏季、秋季、冬季の３回にわたり針葉を採取し、液体クロマトグラフィー分析に供試した。 上記防御物質の測定対象個体に対し制限酵素断片配列の網羅的解析（ddRAD）を用い、ゲノムワイドなDNA多型情報を取得した。その結果、5000座を超える遺伝子座のDNA変異を特定した。また、他種において上記成分の合成に関わると予想される候補遺伝子のスギの相同遺伝子を特定し、61遺伝子座のDNA解析用のプライマーを設計した。

  15. ゲノムに残されたデモグラフィー情報の比較解析で探る生物多様性の環境変動応答

    井鷺 裕司, 陶山 佳久, 伊津野 彩子

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyoto University

    2018年4月1日 ～ 2021年3月31日

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    018年6月にニューカレドニアを訪れ、海外共同研究者の研究機関で栽培されている植物個体から ゲノム解読用のサンプルとしてOxera pulchella subsp. grandiflora, O. neriifolia subsp. neriifolia, O. pancheri, O. sulfurea, O. palmatinervia, O. bravicalyx, O. balansae, O. baladicaをえた。2018年11月にはニューカレドニア本島南部を中心に集団解析用の解析試料を採集した。 Oxera属植物の新規全ゲノム解読はOxera balansaeを対象に行なった。正確性には劣るがロングリードの読み取りが可能なMINionシーケンサーと、正確で大量のデータは得られるがショートリードの読み取りが可能なIlluminaシーケンサーを組み合わせることで、N50 = 0.5M 程度のゲノム解読を行うことが出来た。全ゲノム情報をもとにO. balansae, O. baladica, O. sulfrea, O pulchell subsp. grandifloraの4種について、過去数百万年間の個体群サイズの変動（デモグラフィー）をPSMC法によって復元した。その結果、これらの種は、四国程度の面積の島に生育しているものの、生活型や生育地が異なった種は個体群動態が大きく異なるという興味深い事実が明らかになった。 集団解析としては、Oxera rugosa、O. pulchella、O. pancherii、O. palmatiberviaの4種を対象としてゲノム縮約解読を行い、現存する個体群の遺伝的多様性、個体群間の遺伝的分化、分類群間の系統関係を明らかにした。これらのうち2種では、隠蔽種の可能性のある明瞭に異なる遺伝的組成をもつ個体群を発見した。

  16. 東南アジア産樹木の種多様性・系統多様性・形質多様性の地理的パターン

    矢原 徹一, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Kyushu University

    2018年4月1日 ～ 2021年3月31日

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    熱帯雨林において樹木種の多様性が高いことはよく知られているが、実際には熱帯雨林でも樹木種の多様性には大きな地域差がある。本研究はこの地域差が、気温・雨量・地形要因にどのように影響されているかを解明することを最終目標としている。2019年度においては、インドシナ半島でもっとも高い樹木種の多様性が見られるベトナム南部山地のBidoup Nui Ba国立公園において、５か所の森林調査区内の樹木の展葉・開花・結実フェノロジーを調査し、気温・雨量の変化に対して代表的な樹種がどのように応答しているかを検討した。5調査区全体の観察対象91種すべてが4月（雨季始め）に展葉したが、観察期間中に開花した種は70種にとどまり、一年の中で明瞭なピークは見られなかった。この結果から、熱帯山地林には1年周期で明瞭な季節性を示す種と温帯林の一部の種に見られる「成り年」を示す種が共存している可能性が示された。また、とくに多様性が高いブナ科・クスノキ科に注目して、プロット内の樹種をMIG-seq解析と形態観察によって正確に識別し、各樹種の分布と地形要因の関係を検討した。ブナ科・クスノキ科のいずれにおいても、調査区内でふつうに見られる種の中に未記載種が確認された。さらに、ブナ科ではコナラ属において祖先的な系統的位置にある未記載種が発見され、クスノキ科では、Actinodaphne, Neolitesa属に近縁な新属が確認された。このような固有性の高い樹木相は、調査区間での高いβ多様性を示した。この事実は、調査区間での地形の違いと関係していることが示唆された。

  17. 東南アジアの森林植物を対象とした種および遺伝子多様性の包括的解析

    陶山 佳久, 舘田 英典, 矢原 徹一

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Tohoku University

    2016年4月1日 ～ 2019年3月31日

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    生物多様性ホットスポットである東南アジアの森林を対象として、網羅的（全植物種）かつ包括的（種および遺伝子）生物多様性解析を行う研究を行った。材料として、すでに分担者らが東南アジア各地の森林において収集したDNA分析用試料を利用し、代表者らが開発したゲノムワイドなDNA塩基配列分析法であるMultiplexed ISSR Genotyping by sequencing（MIG-seq）法を用いた分子系統関係の解析を行った。本年度は、昨年度までに実施したクスノキ科、ブナ科に関するMIG-seq解析をさらに進めると同時に、マメ科に関する解析を進めた。その結果、マメ科では「属」がおそらく多系統である場合が多く、「属」内で共有座が十分に確保できない場合が多いことがわかった。そこでITS、rbcL等の葉緑体遺伝子間領域などの複数のDNAバーコード領域を次世代シークエンサーによって同時決定する技術を開発して解析を進めた。具体的には、バーコード配列による系統解析によって近縁なサンプルをグルーピングしたうえでMIG-seq解析を行うという手順を確立した。この方法により、マメ科シタン属では34種中5種が、ハカマカズラ属では43種中10種が、Spatholobus属では29種中10種が新種であることを明らかにした。さらに、東南アジアで特に種数が多いアカネ科ルリミノキ属にこの方法を適用した結果、146種中77種（53%）が新種であることがわかった。これらの結果から、本研究で開発した方法は、種分化が著しいグループの多様性解析に幅広く適用できることが確認された。クスノキ科ではITSにもとづく解析結果を論文として発表し、MIG-seqにもとづく論文を投稿中である。またブナ科では、マテバシイ属の新種を発表した。

  18. 温帯林の種多様性創出における病原菌と菌根菌の相対的重要性

    清和 研二, 陶山 佳久, 深澤 遊

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku University

    2016年4月1日 ～ 2019年3月31日

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    1. 病原菌と菌根菌の効果が及ぶ範囲の推定 イタヤカエデとコナラが優占する林分が直線的に隣接する場所を選定し、両林分の境界線から距離別にイタヤカエとコナラ２種を両林分に播種した。この実験は、ギャップと林内で行った。コナラは外生菌根菌とイタヤカエデはアーバスキュラー菌根菌に感染していた。ギャップでは２種ともに同種の親木に近いほど菌根菌の感染率や感染実生の成長量が高くなった。逆に、親木（境界）から離れるに従って、感染率や菌根菌の成長促進効果が減少した。 林内ではコナラはすべてネズミに食害されデータは得られなかったが、イタヤカエデはギャップとは逆の傾向を示し、同種成木に近いほど病原菌による死亡率も増加した。この結果は、光環境によってPlant-soil feedback (PSF)の方向性が異なるといった仮説を裏ずけるものである。 <BR> 2. 老熟林試験地(6ha)の動態調査による空間分布パターンの解析 老熟した天然林に設定した大面積試験地(6ha)でブナ・ミズナラ・トチノキ・クリ・ミズキ・ウワミズザクラの6種の当年生から成木まですべての個体の位置とサイズを2003年に測定した。2015年（H27年）には13年後の再測を行った。それぞれの種において、成木と実生の空間分布パターンL関数で解析した。相対優占度の高いブナ、トチ、クリでは成木の近くに実生が多く同所的に分布し、一方、優占度の低いミズキ・ウワミズザクラでは排他的に分布した。外生菌根菌タイプは正のPSFをアーバスキュラー菌根菌タイプは負のPSFを示し、それが個体群の空間分布パターンに大きく作用することを明らかにした。

  19. 一斉更新過程における”陣取り”の役割ータケササ類のクローン特性の進化と適応的意義

    蒔田 明史, 鈴木 準一郎, 陶山 佳久, 富松 裕, 立木 佑弥, 齋藤 智之, 井上 みずき

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Akita Prefectural University

    2015年4月1日 ～ 2019年3月31日

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    長寿命一回繁殖性植物であり、広域同調開花するという特異的なタケササの生活史を理解するために、クローン特性が更新成功にどのように関わっているかを明らかにすることは重要である。本研究では、一斉開花枯死後のササの更新過程に着目し、クローン特性が群落形成過程に果たす役割を検証した。叢生型地下茎で株立ちする熱帯のタケとは異なり、北半球温帯のタケは水平に伸長する単軸型地下茎を有する。一斉枯死後に、林床という不均質な環境下でただ一度の更新機会で確実に成功するためにクローン特性がどう機能しているかを明らかにし、それをもとにタケササ類の地下茎伸長様式の進化モデルを提唱し、クローン特性の進化とその適応的意義に迫ることが本研究の目的である。 本年度は、１）混合型の地下茎を有し、1995年に一斉開花枯死した十和田湖畔ブナ林でのチシマザサ実生由来個体群の動態調査を継続した。近年急速に回復が進む閉鎖林冠下でのササ群落の回復に寄与している侵入ジェネット(Matsuo et al. 2018)の地下茎の追跡を行い、それらが林冠ギャップなど明るい場所から侵入してきたものであることを示した（Tomimatsu et al.投稿中）。このことは混合型地下茎をもつことが不均質な環境を有するブナ林内での群落回復に大きく寄与していることを意味する。２）これらの成果をもとに、北京で開催されたBamboo & Rattan Congress2018に招待され講演を行い、中国他世界のタケ研究者と交流した。その後、再度中国での現地踏査・交流セミナーを行い、タケ研究ネットワークの構築に努めた。従来のタイの研究者との交流も含め、熱帯～温帯へのタケササのクローン構造の変化と開花習性の進化についての更なる研究推進体制を作ることができた。

  20. 島からの再移入仮説に基づくフォッサマグナ要素植物の形成と適応進化プロセス

    阿部 晴恵, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    研究機関：Niigata University

    2015年4月1日 ～ 2019年3月31日

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    フォッサマグナとは「大きな溝」を意味し、糸魚川から静岡構造線東側の地溝帯に名付けられたものである。この地溝帯の南半分の地域には、この地域に分布が限られた植物が数多くある。そのため、日本の植物区系を論じる際には、この地域をフォッサマグナ地区として区別し、これらの植物をフォッサマグナ要素植物という。これらの種は第四紀の激しい気候変動のもとで、火山活動によるオープンな環境で分化した種類と考えられている。しかしながら、生物の進化には環境要件だけではなく、歴史的な影響が重要であり、これらの地史がフォッサマグナ要素植物を形成した要因については議論がされていない。 南部フォッサマグナには非常にユニークな地史が存在する。伊豆諸島は太平洋プレートの沈み込み帯に沿って、フィリピン海プレート上に形成された海洋島である。伊豆半島、丹沢山地、富士山北側の御坂山地および巨摩山地も、かつては現在の伊豆諸島と同様に島であり、順にプレート運動によって北上し、本土(本州)に衝突・付加したと推定されている。島は進化の実験場として知られる通り、伊豆諸島にも固有種が多く存在することが明らかになっている。島から大陸への再移入は、①海を越えた分散、②海水面の上下動による陸橋の形成・消失(陸橋島の場合）、③島そのものの大陸への衝突・付加に大きく分けられるが、古伊豆島で種分化をした種は、①や③のルートで本土に再移入し、現在のフォッサマグナ要素植物の一部を形成していると予測される。実際に、動物では本プロセスによる再移入が証明されているが、植物については証明されていない。このため、本研究では、島嶼での進化、島の移動・付加による再移入というプロセスを考慮した分子系統地理学的研究を行うことで、フォッサマグナ要素植物というユニークな植物種群の形成史解明を行うことを目的とする。

  21. 動物の暑熱ストレス耐性向上のための包括的研究：生体と腸内細菌叢の統合制御

    豊水 正昭, 大塚 彰, 陶山 佳久, 喜久里 基

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku University

    2015年4月1日 ～ 2018年3月31日

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    本研究では、暑熱下の肉用鶏の生産性低下の機序を明らかにし、生産性改善のための飼料資材を提案する。暑熱感作した鶏では、骨格筋で発生する活性酸素により骨格筋タンパク質分解は亢進し、脾臓ではT細胞数の低下が観察され、代謝と免疫システムの恒常性のためエネルギー要求が高まった。なお、暑熱感作後期で回腸ではStreptococcus属が減少、Natronincola属が増加傾向を示した。カシューナッツ殻油CNSL給与による生産性改善を検討したところ、暑熱CNSL給与で改善傾向にあった。暑熱感作による腸管の免疫関連遺伝子発現の上昇がCNSL給与で緩和されており、CNSLの生産性改善効果の一部が説明された。

  22. 次世代シーケンサーを用いた種間共有SNP解析による雑種起源ササ類の遺伝学的検証

    陶山 佳久, 蒔田 明史, 米倉 浩司, 菅野 敬雅

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究機関：Tohoku University

    2015年4月1日 ～ 2017年3月31日

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    生物種間の雑種の起源について遺伝学的に検証するためには、親種間で共有する核ゲノムDNAマーカーが必須である。しかし、種間共有できるマーカーを多数得るのは、これまでの技術では一般に困難であった。そこで本研究では、次世代シーケンサーを用いた新たなDNA分析手法（MIG-seq法）により、簡便に共有マーカーを得て、これまで容易には解決できなかったササ類における雑種起源の一例を明らかにした。さらに別の生物種（ツツジ属）における雑種起源の推定も実施し、本研究の手法が雑種起源の検証法として有効であることを示した。

  23. 比較保全ゲノミクスに基づくニューカレドニアの生物多様性創出機構解析と保全

    井鷺 裕司, 陶山 佳久, 内山 憲太郎

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyoto University

    2014年4月1日 ～ 2017年3月31日

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    ニューカレドニアにおける生物多様性の実態と創出メカニズムを明らかにするために、ニューカレドニアにおいて、多様な形質を示す30種程度に種分化しているOxera属（シソ科）を解析対象分類群として、保全ゲノミクス的解析を行った。RNA-seqによって翻訳されている塩基配列情報を解読・解析することで、種分化や環境適応に関与している可能性のある遺伝子座を推定した。Oxera属のほぼ全種について網羅的なサンプリングを行い、縮約ゲノム情報を元に、有効な保全策につなげるために、種間関係、種内の遺伝的分化、種内個体群の分岐時期と有効サイズなどを明らかにした。

  24. チシマザサ集団を用いたミューテーションクロックの開発

    井上 みずき, 蒔田 明史, 陶山 佳久, 鈴木 準一郎, 齋藤 智之

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究機関：Akita Prefectural University

    2014年4月1日 ～ 2016年3月31日

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    齢が概ね明らかなチシマザサ（ Sasa kulirensis）を用いて、次世代シークエンサーを利用した改変GBS法によって網羅的なSNPs情報を得えることで、高精度な齢の推定方法を確立することを目的とした。 十和田湖周辺より採取した齢の異なるチシマザサを用いて、同一個体内の異なるラメットから4～8試料/個体、計24試料を解析した。共通座における個体内のSNPsの検出数には、齢や個体による差が認められなかったがSNPsの多様性は齢が古い個体でわずかに高いことが分かったことから、得られたSNPs情報が齢の推定に有用である可能性が示唆された.

  25. クローナル植物を用いた低線量放射線被曝の遺伝的評価

    兼子 伸吾, 松木 悠, 猪瀬 礼璃菜, 陶山 佳久, 井鷺 裕司

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    研究機関：Fukushima University

    2013年4月1日 ～ 2016年3月31日

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    原発事故の被災地域における低線量放射線被ばくの蓄積が、そこに生育する植物の塩基配列の変異に与える影響についてはほとんど明らかにされていない。本研究では、日本各地に遺伝的に同一な個体が生育するモウソウチクを対象として、様々な放射線量の地域からサンプルを収集し、次世代シーケンサーから得られる大量の塩基配列データによって、生育地の空間線量と塩基配列の突然変異数との関係を評価した。 その結果、空間線量の増加に伴う変異量の増加は認められなかった。したがって、比較的空間線量が高い環境で生育しているモウソウチクであっても、事故後に塩基配列の突然変異を急激に蓄積しているということはないと考えられた。

  26. 山岳氷河の掘削試料から得られた樹木花粉のＤＮＡ分析による古森林遺伝学的研究 競争的資金

    陶山 佳久, 中澤 文男, 牧野 能士, 松木 悠

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Tohoku University

    2012年4月1日 ～ 2016年3月31日

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    山岳氷河から得られた雪氷試料中に存在する花粉のDNA分析によって、過去に分布した樹木の遺伝的情報を直接取得し、樹木個体群の分布変遷史を時空間的に明らかにしようとする研究のための基礎技術開発を行った。まず、花粉一粒ずつに含まれるゲノムDNAを全ゲノム増幅法によって増幅して、ゲノム内の複数領域のDNA分析に用いるための技術を完成させた。また、次世代シーケンサーを用いてゲノム全体から網羅的に塩基配列を得る新たな手法を開発し、MIG-seq法として発表した。これらの技術を氷河から得られた花粉の分析に応用した。

  27. 絶滅危惧植物の保全遺伝学的研究 競争的資金

    制度名：Global Environment Research Fund

    2009年4月 ～ 2016年3月

  28. 多様性創出新機構の探索：同一個体内ゲノムの体細胞間変異の定量化

    佐竹 暁子, 陶山 佳久, 日浦 勉

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究機関：Hokkaido University

    2014年4月1日 ～ 2015年3月31日

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    北海道大学苫小牧研究林の林冠観測用クレーンシステムを利用して樹高約20m，樹齢150年以上のミズナラとカエデを対象に，異なる枝位置から各3反復ずつ葉と花組織の採取を行った．得られたサンプルから全DNAを抽出し，次世代シーケンサーを用いて大規模塩基配列を取得した結果，約1500遺伝子座において総数100,000塩基の配列情報を取得した．塩基置換が生じた配列を探索した結果，同一個体あたり最大2個の突然変異が検出された．突然変異が観察された位置を分析した結果，一度突然変異が生じるとそれは後に形成された枝に引き継がれていることが確認されたため，同一個体内におけるモザイク状ゲノム構成の存在が示唆された．

  29. 非モデル植物におけるゲノムスキャン解析のための基盤塩基配列データ迅速構築法の開発

    陶山 佳久, 松木 悠, 中澤 文男

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究機関：Tohoku University

    2013年4月1日 ～ 2015年3月31日

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    単一の植物個体から得られた花粉一粒ずつのDNAを材料として、迅速に高密度連鎖地図を構築する方法の技術開発を行った。まずその基礎となる手法として、次世代シーケンサーによって通常のゲノムDNA試料からゲノム網羅的に一塩基多型（SNP）マーカーを得る新手法を開発した。この手法を花粉DNAの解析に応用し、１個体のユリ科植物から得られた花粉を材料としてSNPの検出を行った。その遺伝分離を解析した結果、期待分離比どおりに検出された226座のSNPマーカーが得られ、新手法による連鎖地図の構築が可能であることが確かめられた。

  30. 植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学

    矢原 徹一, 陶山 佳久, 舘田 英典, 手島 康介, 三村 真紀子

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Kyushu University

    2012年4月1日 ～ 2015年3月31日

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    対照的な適応戦略を持つ姉妹種の間で、どのような遺伝的変化が生じているかを、次世代シークエンサーを活用して解析した。キスゲ属の姉妹種（アゲハチョウ媒の昼咲き赤花種ハマカンゾウとススメガ媒の夜咲き黄花種キスゲ）では、赤い色素であるアントシアニンの量と発現量が相関する遺伝子群を同定した。これらのうち、調節遺伝子の変化によって赤花から黄花への進化が起きたことが支持された。キイチゴ属の姉妹種（落葉性・温帯性のヤクシマキイチゴと常緑性・暖帯性のリュウキュウイチゴ）では、赤色光受容体の抑制遺伝子が2種間で大きく分化していることが判明し、光受容体の抑制が落葉性・温帯性の違いに関与していることが示唆された。

  31. 温帯性Ｂａｍｂｏｏの開花周期はなぜ長いのか？ジェネット混在型競争回避仮説の検証

    蒔田 明史, 鈴木 準一郎, 陶山 佳久, 齋藤 智之, 井上 みずき, 柴田 昌三, 西脇 亜也, 井鷺 裕司, 松尾 歩, 立木 佑弥, 菅野 敬雅, 大倉 知夏

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Akita Prefectural University

    2011年4月1日 ～ 2015年3月31日

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    長寿命一回繁殖性の植物であるbambooの中でも、北半球の温帯性タケササ類は、ひときわ開花周期をもつことが知られている。なぜ熱帯に比べて温帯では開花周期が長期化したのか。それを明らかにするために、ジェネット混在型競争回避仮説を提唱し、その検証を試みた。その結果、水平な地下茎を伸ばすことでジェネットが巨大化しても有性繁殖時の繁殖成功度が下がらないことが実証され、また、理論研究でも長い地下茎をもつことが開花周期の長期化に結びつくことが示唆され、この仮説の有効性が支持された。

  32. 菌類との相互作用に基づく種多様性維持メカニズムの解明と生態系機能に関する研究

    清和 研二, 齋藤 雅典, 林 誠二, 陶山 佳久, 深澤 遊

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku University

    2011年4月1日 ～ 2014年3月31日

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    落葉広葉樹林における種多様性維持メカニズムを実生と敵対する病原菌ならびに共生する菌根菌との関係から明らかにした。暗い林内では、成木下では種特異的な病原菌（立ち枯れ病・葉の病気）による同種実生の高い死亡率が見られ、種多様性を高めるメカニズムが見られた。一方、ギャップでは半数の種では同種実生の高い死亡率が見られたが、半数では菌根菌感染により同種実生の成長促進が見られ、種多様性を低下させるメカニズムが見られた。 間伐強度を3段階に変えたスギ人工林では、種多様性の回復度合が高まるにつれ水源涵養機能（水浸透能）と水質浄化能力が高まる事を明らかにした。

  33. 最終氷期以降の分布拡大に伴う森林樹木の遺伝的適応に関する集団遺伝学的研究

    舘田 英典, 矢原 徹一, 津村 義彦, 猪股 伸幸, 楠見 淳子, 手島 康介

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyushu University

    2010年 ～ 2012年

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    現在の西日本低地の主要な植生である照葉樹林は、最終氷期後にレフュージア(避難地)から分布を広げたと考えられている。本研究は照葉樹林構成樹種であるイスノキ,サカキ、カラスザンショウと北アメリカ湿地林のヌマスギが、この分布変化に伴ってどのように進化したかを明らかにするために、遺伝子情報を使った調査を行った。その結果、照葉樹林構成樹種の中でも種によって異なる進化の歴史を持っていることがわかった。また少数ながら適応への関与が示唆される遺伝子が同定された。

  34. 樹木の花粉化石DNA情報を利用した森林分布変遷史の解析

    陶山 佳久, 中澤 文男

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    研究機関：Tohoku University

    2010年 ～ 2012年

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    湖底堆積物や山岳氷河に含まれる古代花粉試料のDNA分析により、花粉試料の種識別や種内系統に関する情報を取得する研究を行った。湖底堆積花粉のDNA分析では、スカンジナビア半島の北方針葉樹が最終氷期から生き残っていたことを明らかにした。また、花粉分析法と堆積物DNA分析による古植生解析の比較を行った。山岳氷河から得られた花粉のDNA分析では、形態からは同定できない節レベルの識別に成功した。これらの成果は、堆積花粉のDNA分析による過去の植物の遺伝情報取得法として新たな提案となる。

  35. 林床におけるササの優占メカニズムの解明-個体単位の資源獲得様式と成長の関係-

    齋藤 智之, 蒔田 明史, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    研究機関：Forestry and Forest Products Research Institute

    2009年 ～ 2012年

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    ササが弱光環境である林床でも繁茂できるメカニズムを光資源の分布 とササの現存量の分布パターンの違いから検討した。ギャップから周囲の林内に向けて開空度 とチマキザサの現存量を連続的に調べ,二者の分布の関係を解析した。光資源、ササの現存量は 共に,ギャップからの距離に強く依存した分布パターンを示した。弱光環境である林床に分布し たことの解釈としては,ササが弱光下でも高い同化能力を持つこと,ギャップ部位からの転流に よって成長が補償されたことの二点が示唆される。

  36. 大規模操作実験と地理的環境勾配を用いた令温帯林生態系機能の地理分化の解明

    日浦 勉, 村岡 裕由, 三枝 信子, 陶山 佳久, 彦坂 幸毅, 内海 泰弘, 佐野 淳之, 中路 達郎, 中村 誠宏

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Hokkaido University

    2009年 ～ 2011年

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    主要構成種(ブナ、ミズナラ、コナラ、ダケカンバ)の遺伝的変異に基づいた森林群集の生食連鎖と腐食連鎖応答を、地理的環境勾配に対する生産者の生理的応答とともに明らかにした。また地球温暖化に対する冷温帯森林生態系の応答を明らかにするため、樹木の地下部と地上部を暖める人工的な温暖化現象を複数地域で作り出し、森林生態系の生産性や物質循環、生物多様性、食物網などへの影響を解明した。

  37. 協調的送粉形質のシフトに関する実験分子生態学的研究:キスゲ属をモデルに

    矢原 徹一, 舘田 英典

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyushu University

    2009年 ～ 2011年

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    F2雑種の分離から、ハマカンゾウ(蝶媒)とキスゲ(蛾媒)の開花時間と花色の違いは、主要遺伝子によることを明らかにした。花粉一粒ごとの遺伝子型を決定することに成功し、蝶・蛾の花色に対する選好が、実際に花色への淘汰圧として作用していることを実証した。実証データに基づいて、進化プロセスのシミュレーションを行い、開花時間の違いが自然選択及び生殖隔離の両方に効果のある形質であることを明らかにした。

  38. インドミゾラム州における竹類の大面積一斉開花枯死が地域の生態系と焼畑に及ぼす影響

    柴田 昌三, 蒔田 明史, 箕口 秀夫, 西脇 亜也, 長谷川 尚史, 齋藤 智之, 神崎 護, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Kyoto University

    2008年 ～ 2011年

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    インド、ミゾラム州で、竹(Melocanna baccifera)が大面積一斉開花枯死した地域において、開花後の当該種の回復過程を、植生の変化、群落内のクローン構造の変化を追跡する他、開花範囲の広域レベルでの把握、焼畑農業の生産と開花のタイミングとの関係の検討、ネズミ個体群の変化を調査した。その結果、自生地域の開花が数年にわたって波状に起こっていること、焼畑農業の実施がこの種の回復にプラスに利いていること、ネズミ個体群の変動は数年で収束すること、等が明らかになった。

  39. 生物多様性が生態系機能に与える効果:水質浄化システムを用いた検討

    富松 裕, 陶山 佳久, 中野 和典

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Research Activity start-up

    研究種目：Grant-in-Aid for Research Activity start-up

    研究機関：Tohoku University

    2009年 ～ 2010年

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    生物多様性の減少は, さまざまな生態系機能に対して影響を及ぼす可能性がある。本研究では, 汚水処理用の人工湿地を模した小規模な系を用いて, 植栽するヨシの遺伝的多様性を操作する実験を行った。その結果, 遺伝的多様性が高い実験区の方が, 生育後のヨシの一次生産量が大きく, 排水中の窒素濃度が低くなる傾向が見られた。本実験の結果は, 植栽したヨシの遺伝的多様性が, ヨシの一次生産量だけでなく, ヨシや根圏に生育するバクテリアを通じた水質の浄化効率にまで影響を及ぼし得ることを示している。

  40. ササはなぜ一斉開花するのか?遺伝的多様性に果たす一斉開花の役割の解析

    蒔田 明史, 陶山 佳久, 鈴木 準一郎, 井鷺 裕司, 斎藤 智之, 西脇 亜也, 柴田 昌三

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Akita Prefectural University

    2008年 ～ 2010年

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    ササ類は長寿命一回繁殖性植物であり、100年以上にわたって栄養繁殖を繰り返した後に、広範囲にわたって一斉開花枯死する。しかし、旺盛な地下茎の伸長を繰り返し、長期にわたって排他的な群落を形成し続けることのできるササが、どうして一斉開花して枯死しなければならないのだろうか。この疑問に対し、本研究ではササ群落のジェネット空間分布構造に注目して遺伝構造を解析し、遺伝的多様性という観点からタケ・ササ類の開花習性の進化について議論した。

  41. 対照的な集団構造を持つ樹種での遺伝子進化特性に関する集団遺伝学的研究

    舘田 英典, 陶山 佳久, 津村 義彦, 矢原 徹一

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyushu University

    2007年 ～ 2009年

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    生物種間には小集団への分割の有無(集団構造)や生活様式等に関する違いが見られる。本研究ではこのような違いがどのように遺伝子進化に影響を与えるかを、それぞれ特徴を持つ3樹木種(ヒノキ科、ミカン科)を材料とし遺伝的変異を調査することにより調べた。その結果、それぞれの種が集団構造や集団の歴史が反映された遺伝的構造を持つことが明らかになり、またその構造や生活様式を反映して特徴的に働く自然淘汰の例を見つけることが出来た。

  42. 葉緑体ゲノムのSNPを用いたブナの分子系統地理学的・環境適応的研究

    高橋 誠, 陶山 佳久, 原 正利, 渡邉 敦史, 戸丸 信弘

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Forestry and Forest Products Research Institute

    2007年 ～ 2009年

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    森林に対するニーズの多様化に伴い、広葉樹造林が拡大しつつある。広葉樹については種苗配布に関するルールがない現状にある。地域固有の適応的変異の保全のためには遺伝子撹乱のリスクを回避し、適切な種苗を用いることが重要である。ブナを対象樹種として、葉緑体ゲノム上のDNA多型を探索しSNPマーカーを開発した。また、分布域全体を網羅する698地点の4,321個体から分析用試料を採取し、葉緑体DNAのLSC領域の3領域の18SNPを分析し、ハプロタイプを明らかにした。ハプロタイプの類縁関係を明らかにするとともに、得られたデータを用いて精細なハプロタイプ地図を作成した。

  43. 送粉シンドロームのシフトに関する実験進化生態学的研究:キスゲとハマカンゾウを例に

    矢原 徹一, 川窪 伸光, 陶山 佳久, 舘田 英典, 舘田 英典

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Kyushu University

    2007年 ～ 2008年

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    夜咲き種キスゲ(夜咲き/黄色い花/甘い花香)と昼咲き種ハマカンゾウ(昼咲き/赤い花/花香なし)の花形質の違いは少数の主要遺伝子の支配によること、また、送粉者が花香よりも花色を頼りに訪花することが明らかになった。昼咲き種から夜咲き種の進化は、突然変異により開花時間が昼から夜に変化し、送粉者の花色への選好性が淘汰圧として働き、蛾の誘引をより強めるために花香の突然変異が起きたのではないかと考えられる。

  44. ブナの地理変異に基づいた冷温帯林生態系機能と環境応答の解明

    日浦 勉, 陶山 佳久, 彦坂 幸毅, 熊谷 朝臣, 内海 泰弘, 陶山 佳久, 彦坂 幸毅, 熊谷 朝臣, 内海 泰弘

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Hokkaido University

    2007年 ～ 2008年

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    日本列島に広く分布するブナは光合成窒素利用効率、窒素生産力、窒素滞留時間、夏場の蒸散速度、水利用効率、リター分解速度、摂食機能群ごとの葉の食害度など様々な機能的性質に地理的な変異を持つことが明らかとなった。これらの形質は遺伝的にも固定されていると考えられることから、現在のブナ林生態系は環境変動に対してある程度可塑的に応答するものの、温暖化など急速な変化に対しては脆弱な側面もあると考えられた。

  45. 木材遺体・年輪年代学・植物遺体DNAの新たな考古植物学研究拠点の形成と展開

    鈴木 三男, 大山 幹成, 米倉 浩司, 陶山 佳久, 能城 修一, 田中 孝尚, 小林 和貴, 吉田 明弘, 星野 安治, 陶山 佳久, 能城 修一

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Tohoku University

    2005年 ～ 2008年

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    東北大学植物園所蔵のさく葉標本・木材標本・資料等を活用して、遺跡出土植物遺物、特に樹木について古植物学、年輪年代学および分子系統学等の研究拠点を形成した。その成果は多岐にわたるが、特に1) 遺跡出土材の樹種データベース作成、2) スギおよびヒバの樹木年輪標準暦作成、3) 日本・中国・韓国のウルシのDNAの分子系統解析、があげられる。これらについては順次論文、植物園HP等により公表していっている。

  46. インド・ミゾラム州における竹類ムーリーの大面積開花に関する生態的研究

    柴田 昌三, 蒔田 明史, 神崎 護, 箕口 秀夫, 陶山 佳久, 長谷川 尚史, 齋藤 智之

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

    研究機関：Kyoto University

    2005年 ～ 2007年

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    インド・ミゾラム州を中心とする地域に自生する竹であるムーリー(Melocanna baccifera)の48年周期での開花を予想し、開花前からの竹林の生態的動態の把握を試みた。竹類は開花を予測することが困難であることから、開花前からの動態を把握することが最大の研究目的となった。調査地を設定したのは、ミゾラム州内のサイランとマミットである。調査の結果、調査地においては予想どおり、2006-2007年に対象種の開花が認められ、開花前の竹林動態や調査地におけるクローンマップを作成することができた。調査地では、一斉開花の前年と後年にも、一部の稈で小規模な開花が認められたが、これらの開花はクローンの系統とはまったく無関係に発現していた。また、開花・結実の全過程を詳細に把握することができた。これらの情報は、開花を捉えることが困難とされてきた竹類の調査データとしては世界で初めての詳細なものである。また、開花結実後の実生回復過程の初期段階も追跡することができた。一方、それらが周辺生態系に与える影響として、ネズミの個体群動態の把握を試みたほか、広域の開花状況の推移、地元の基幹的な農業形態である焼畑農業との関係なども把握することができた。広域の開花状況によって、自生地すべてにおいて開花が同時に起こるのではなく、大面積にわたる一斉開花が2005-2006年に起こる地域が東側にある一方、2007-2008年に起こる地域も西側にあることが確認され、大面積開花地は東から西に向かって大きく移動していくことが推定された。

  47. 東北地方の落葉広葉樹林の多様性維持メカニズムの解明とその再生プログラムの構築

    清和 研二, 陶山 佳久, 小山 浩正, 杉田 久志

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku University

    2005年 ～ 2007年

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    I.広葉樹天然林における種多様性維持機構の解明 種多様性に富む広葉樹天然林に設定した大面積試験地(宮城6ha)を用いて、種多様性に関与する複数の要因の解析を同時に行った。6ha試験地を600個の10m×10mの方形区に区分し、それぞれの水分、栄養塩(N)濃度、光量、リター量、ササ、低木の被度など無機環境の調査を行ない、これらの環境要因が実生・稚樹の分布や種多様性に与える影響をL関数、多重ロジステックモデルやSEM(構造方程式モデル)などを用いて解析した。主要5種では、実生・稚樹の分布には実生密度や親木からの距離などの要因が影響し,次第に水分、栄養塩(N)濃度、光量などが大きく作用することが明らかになった。 また、生物的な要因が実生・稚樹の分布や種多様性に与える影響の解析するために、落葉広葉樹8種の播種試験を行い、複数種におけるJanzen-Connell仮説の検証とその作用機構の解明をおこなった。その結果、実生の死亡は同種の親木下で高く他種の下では低いという結果6種で得られた。さらにコレトトリカム属菌の種特異的な感染を検定したところ、多犯性と言われてきたこの菌の種特異性が示唆された。 II.種多様性回復過程の解析と有用広葉樹生産の指針の作成 スギ人工林に間伐強度を変えた9haの試験地を設定した。今年度は種多様性の回復過程の調査を行なったところ、間伐3年目では、強度間伐ほどより種多様性が増加していることが明らかになった。広葉樹の侵入過程で隣接広葉樹からの距離と強度間伐が重要であることを明らかにした。

  48. 花粉1粒を対象とした遺伝子型判別による樹木の送粉過程解析

    井鷺 裕司, 陶山 佳久, 柴田 銃江

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    2005年 ～ 2007年

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    送粉過程の実態の解明は、森林生態系の維持・更新機構の理解と適切な管理のために重要であるが、送粉過程に関して、個々の花粉粒レベルで、その移動距離、パターン、遺伝的性質に関する詳細な解析が行われた例はなく、これまで、間接的な方法で解析が行われているに過ぎない。本研究では、これらの事項を明らかにするために、まず、個々の花粉粒を対象に複数遺伝子座の遺伝子型を決定する技術を開発した。花粉粒に含まれる核ゲノムのコピー数は少ないけれども、本研究によって開発した手法によって、90%以上の遺伝子座において正確な遺伝子型の決定が可能であった。 マイクロサテライトマーカーを用いた解析によって、樹冠において採集された訪花昆虫の体表面に付着している花粉について、個々の花粉粒ごとに遺伝解析を行い、昆虫タイプごとに、送受粉効率、花粉親の多様性、遺伝的な構成などを、これまでに行われてこなかったレベルで、詳細に解析した。その結果、従来、優秀な送粉者として機能していると考えられてきたマルハナバチ類が、ホオノキにとっては、自家受粉をもたらす花粉を多く運んでいることが判明した。また、あまり活発に行動しないため、自家受粉をもたらすとされていたハナムグリ類が、遺伝的に多様な花粉を体表に付着しており、送粉者として有効に機能していることが分かった。昆虫タイプごとの真の送粉効率や機能を理解するためには、この様に、従来の行動観察だけでは十分でなく、本研究で行ったような、花粉粒単位の遺伝解析が有効であることが明らかになった。

  49. 一斉枯死後のササ群落は何年で回復するのか-群落形成期におけるクローン動態の解明-

    蒔田 明史, 西脇 亜也, 鈴木 準一郎, 陶山 佳久, 齋藤 智之

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Akita Prefectural University

    2004年 ～ 2007年

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    本研究は、わが国の森林動態に重要な役割を占めていると考えられるササの一斉開花現象に注目し、一斉開花枯死後の群落回復過程におけるササのクローン動態を明らかにし,一斉枯死したササ群落の回復に何年を要するかを明らかにしようとするものである。本研究では、開花履歴が明らかにされている数カ所のチシマザサ個体群を対象として、分子生態学的手法を併用してササの個体としての動態記載を目的とした。調査対象個体群は(1)戸隠(長野県)チシマザサ1974年開花(2)八甲田(青森県)チシマザサ1979年開花(3)十和田(秋田県)チシマザサ1995年開花(4)大見(京都府)チュウゴクザサ2007年開花である。 1)マイクロサテライトマーカーの開発とDNA解析 ササ数種を対象として,マイクロサテライトマーカーの開発・改良を行い,上記対象個体群から得られたサンプルからのDNAを抽出し,クローン構造等の解析を行い,現在とりまとめ中である。 2)genetを単位としたデモグラフィー手法の開発 継続調査地での全稈サンプリングによるクローン分析を併用することにより,genetを単位とした個体群動態の追跡方法を開発し,発生後20数年を経た実生由来個体群でも完全に群落は回復しておらず,自己間引きが継続していることを明らかにした。 3)更新に伴うクローン構造の変化 チシマザサは巨大クローンを形成すること,発生後10年を経た実生由来個体群で,光条件とクローン構造に関連があり,好条件下にある成長の良いクローンが将来優占する可能性があることを明らかにした。

  50. ハイマツ・キタゴヨウ交雑帯のデモグラフィック・ジェネティックス 競争的資金

    制度名：Special Coordination Funds for Promoting Science and Technology

    2003年4月 ～ 2006年3月

  51. ハイマツ・キタゴヨウ交雑帯のデモグラフィク・ジェネティックス

    綿野 泰行, 朝川 毅守

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Exploratory Research

    研究機関：Chiba University

    2003年 ～ 2005年

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    ハイマツとキタゴヨウの交雑帯では、父性遺伝の葉緑体DNAはキタゴヨウからハイマツへ、そして母性遺伝のミトコンドリアDNAはハイマツからキタゴヨウへと、方向性を持った遺伝子浸透が起こっている。本研究では、両種が混生し、今まさに交雑が進行中と推定されるアポイ岳をフィールドとした。自然下での交雑の実体を、様々な方法で解析し、両者の間にどのような生殖的隔離が存在するのかを明らかにすることで、遺伝子浸透のパターンが形成されるメカニズムを解き明かす事を目的として解析を行った。 1)アポイ岳交雑帯の遺伝的構造:アポイ岳では、ハイマツ型mtDNAのキタゴヨウへの遺伝子浸透が顕著であり、全ての個体がハイマツ型mtDNAを持っていた。核遺伝子マーカーによって同定された雑種はほとんどがキタゴヨウ型cpDNAを持ち、標高では、7-8合目に集中していた。 2)花粉プールの時期・標高における変化:同標高においては、ハイマツの開花はキタゴヨウに1〜2週間先行するが、異標高では2種の開花時期は重なる。この開花フェノロジーの差異が花粉プールの組成に与える影響を探るため、花粉1粒ごとのPCR解析による葉緑体DNA(cpDNA)のタイピングを行った。その結果、花粉をトラップした2, 5, 6, 7合目全てにおいて、ハイマツ型cpDNAとキタゴヨウ型cpDNAが混在する時期が存在することが明らかとなった。 3)種子形成における花粉選択:母樹が純粋なハイマツやキタゴヨウの場合、同種の花粉のみから種子が形成されていることが判明した。花粉プールにおける混在の結果から、選択的受粉機構が存在するものと考えられる。一方、雑種の種子からは、ハイマツ型とキタゴヨウ型の両方のcpDNAが検出される。おそらく、雑種は花粉選択性を失い、雑種を経由して、遺伝子浸透が進行するものと考えられる。

  52. 分子マーカーを用いたブナ天然林の生物多様性の成立メカニズムに関する研究

    清和 研二, 陶山 佳久, 菊沢 喜八郎, 正木 隆

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku University

    2003年 ～ 2004年

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    1.ブナ林の主要構成種であるブナ、ウワミズザクラにおいてJanzen-Connellメカニズムが作用していることを野外調査から明らかにした。 2.ブナ天然林で優占するブナ、ミズナラ、ホウノキそれぞれの実生・稚樹・林冠木間の開葉タイミングの違いを調査したところ、種間のフェノロジーの違いが種間の置き換わりや多種共存系の創出に大きな影響を与えていることを明らかにした。 3.ブナ林を構成する低木種であるノリウツギの個体群動態を調べ,下層種の生活史特性は林冠を優占するブナのダイナミクスに適応した戦略をもつことを明らかにした。 4.ブナを主要構成種とする林分に6haの試験地を設定し、地形と種多様性の関連性を解析したところ、尾根筋の種多様性が高いことが明らかになった 5.圃場試験と天然林における調査の結果、ブナ実生の生存や成長には光量(ササによる被陰)、種子サイズ、出現・開葉時期が大きく影響することがわかった。 6.現直後のブナ実生に付着した種子親由来の組織である果皮のDNAを分析してその種子親を特定した。ブナ天然林における豊作翌春の出現実生数として、種子親1個体あたり0〜18000、平均2232.5個体という推定値が示された。また、出現時においては97%の実生が種子親の周囲30m以内に分布しており、種子親-実生間距離の平均値は11.0mであった。 7.DNAによる父性解析から、種子親の個体サイズ、種子サイズ、実生生産数、種子散布距離、実生生存率の間には密接な関係があることが分かった。つまり、小サイズの種子親は大種子少産・短距離散布型で、その実生生存率は高い傾向があった。一方、大サイズの種子親は小種子多産・遠距離散布型で、その実生生存率は低いが生存実生数は多く、遠距離に到達した実生の生存率は高いことが分かった。 8.ブナ保残帯の遺伝的多様性を調べたところ、対照区と大きな違いはなかった。

  53. 分子マーカーを用いた非破壊的な種子散布モニタリング方法の開発

    清和 研二, 陶山 佳久

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Exploratory Research

    研究機関：Tohoku University

    2003年 ～ 2004年

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    1.クリを含む落葉広葉樹林(70×40m)に出現したクリ実生199個体のうち172個体について付着した果皮を発見することが出来、DNA抽出したが、品質の悪いものもあり15サンプルについては遺伝子型の判定が出来なかった。遺伝子型の判明した157個体のうち母樹候補木のいずれかと一致したものは約3割の50個体に過ぎなかった。それらは調査区に生育する6母樹由来の実生であると判定された。各母樹の実生数は多いものからそれぞれ23,11,7,4,3,2個体であった。これは各母樹ごとの適応度の直接的な推定を行なった画期的なものだと言える。しかし、個々の母樹ごとに特定できた実生数が極めて少ないのが実態であり、その後の死亡率の高さから多回繁殖型の樹木の適応度を推定するにはもっと大きなサンプルサイズと複数年の調査が必要だと考えられた。また、個々の母樹それぞれの子個体数が少ないため、実生の生存に及ぼす遺伝的要因と環境要因の影響をそれぞれ抽出することは今回は不可能であった。 2.これまでの種子散布追跡手法との比較:別途にこれまで良く用いられてきた種子散布追跡試験を行ない,本手法との比較を行なった。クリの母樹ごとに種子を採取し磁石を埋め込み後、金属探知期で散布から実生出現までの過程を追跡した。金属探知期での追跡は種子の数次にわたる貯食・散布・捕食の過程を逐次明らかにし、散布者の行動様式や活動場所を解析するには適していることが明らかになった。しかし、最終的にはほぼ全て捕食されてしまうので、最終的にどの親の子個体がどこでどれだけ発芽してくるのかを明らかにすることは出来なかった。これらの結果からもDNAを用いた本手法は今後の種子散布研究に重要になってくるものと考えられる。

  54. 花粉化石のDNA分析による森林植生変遷史の遺伝学的解析

    陶山 佳久, 清和 研二, 吉丸 博志, 高原 光

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Exploratory Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Exploratory Research

    研究機関：Tohoku University

    2003年 ～ 2004年

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    スウェーデン中部の湖から得られた湖底堆積物を材料として、異なる2時代(約100年前と10000年前)の堆積層からマツ属花粉を収集し、これらの花粉化石を試料としてDNA分析を行った。この分析によって、異なる時代に成立したヨーロッパアカマツ集団を対象とした遺伝的組成の比較が可能になる。つまり、過去の森林について遺伝的多様性や遺伝的構造に関する情報を解析し、森林植生変遷史に遺伝学的な情報を盛り込むことができる。 葉緑体DNA上のマイクロサテライト領域を含む約220塩基の領域を対象として、約100年前の試料500粒についてDNAの増幅を試みたところ、そのうち7粒から塩基配列データが得られた。また、約1万年前の試料301粒のうち4粒から得られ、合計11粒の花粉化石から塩基配列データが得られた。同様に約105塩基の領域について増幅を試みたところ、約100年前の試料234粒のうち4粒から、約1万年前の試料408粒のうち5粒から、合計9粒の花粉化石から塩基配列データが得られた。また、湖底堆積物を得た湖の周囲に現在生育しているヨーロッパアカマツ30個体を材料として、220塩基の領域についてのハプロタイプを調べた。 得られた配列は多型性に富んでおり、約220塩基の領域については16種類、約105塩基の領域については7種類のハプロタイプが検出された。現生のサンプルを合わせて解析した約220塩基の領域については、現生・100年前・1万年前で共通のハプロタイプが検出されたことから、後氷期を通じて調査対象地である湖の周辺で同じ系統が生き延びたことを示唆するものと考えられる。 本研究により、花粉化石のDNA分析が可能であることが示されただけでなく、植物集団の時・空間的な動態について、遺伝的データが直接得られることが示されたと言える。

  55. 放牧地植物と共生するVA菌根菌のDNA解析による群集構造の解明

    菅原 和夫, 陶山 佳久, 斎藤 雅典, 西脇 亜也, 小島 知子

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku University

    2002年 ～ 2004年

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    本研究では遺伝子情報を用いたアーバスキュラー菌根菌(以下AMF)同定法を確立し、この手法を基に、わが国の草原のAMF群集構造の地理的変異および変動要因の解析を行った。まず広範囲のAMFをPCR増幅できる新たなAMF特異的プライマーを設計し、継代培養胞子を材料としてPCR-DGGE法による優占菌種の同定を試みた。その結果、従来のプライマーでは困難とされている種を含むAMFのDNA増幅が可能で、特異的バンドも得られ、また多試料処理をも可能とするAMF群集構造の解析法が開発された。次に旧本列島南北9箇所の草地よりススキおよびシバを採集し、同法を用いAMF群集構造の地理的変異を調べた。なお採集地に、アロフェン質黒ボク土、非アロフェン質黒ボク土および黄色土草地が入るよう考慮した。その結果、ススキとシバ草地のAMF群集構造はGlomus-Ab, Ac, Ad群を主とし、Glomus-B群、Acaulosporaceaeの存在が確認された。Glomus-Ab群は宿主・生育環境を問わず、広く分布していたが、Glomus-Ac、Ad群は宿主によって出現頻度が異なったが、アロフェン質・非アロフェン質とも存在が確認された。根圏土壌の胞子組成は、どの草地ともGlomus rubiforme, Glosmus sp., Acaulospora koskei様の胞子が優占し、菌根形成菌組成とは必ずしも一致しなかった。次にシロクローバ人工草地を用いてAMF群集構造の変動要因解析に関する試験を行った。シロクローバ草地のAMF群集構造は造成初期から優占しているGlomus-B群やAcaulosporaceaeに加えて、群落の形成につれてGlomus-Ab, Ad群も優占化し、また高レベルの土壌可給態リン酸濃度は菌種を単純化させ、群集構造に大きく影響することが明らかとなった。すなわち安定した群落の草原のAMF主要菌種はほぼ類似しているが、植物種・土壌環境(特に可給態リン濃度)・造成年次などにより変動することが示された。以上最終年にあたりこれまでの成果を報告した。

  56. 花粉化石のDNA分析 競争的資金

    制度名：Grant-in-Aid for Scientific Research

    2003年4月 ～

  57. 河川の人為的改変が河畔林の種多様性・遺伝的多様性に与える影響

    清和 研二, 小池 孝良, 菊沢 喜八郎, 陶山 佳久, 柳井 清治

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    研究機関：Tohoku Univ.

    2000年 ～ 2002年

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    近年、河畔林は河川改修などによって生物の多様性が急激に減少してきている。河川改修によって生じる立地環境の変化や生育場所の断片化は水辺植物の繁殖成功に影響し、ひいては個体群の遺伝的多様性や種多様性を劇的に減少させている。一方、河畔林の存在は多様な環境保全機能をもつばかりでなく、水生昆虫や魚類のエサとなる落葉や食葉性昆虫を供給し、食物連鎖の中の一次生産者として水生生物の多様性を保証しており、その保全は緊急の課題である。本研究は、河畔林において優占種個体群の繁殖様式・遺伝的多様性ならびに水生生物への食物供給機能を、自然度の高い河畔林で精査することによって、河畔林構成種の生物多様性・遺伝的多様性の維持メカニズムを明らかにした。 特に雌雄異株のヤナギ科樹木においては、性比の変動要因を明らかにする共に、有性繁殖および無性繁殖における繁殖戦略の性差を明らかにすることができた。また河畔生樹木であるオニグルミの開花調査から、オニグルミは雄先熟タイプと雌先熟両タイプの二つの開花タイプが混在するヘテロダイコガミーという種であることを明らかにした。さらに両タイプの繁殖投資量はほぼ等しく、また開花期間も相補的交配を保証していることを明らかにした。さらには両林分とも雄先熟・雌先熟両タイプが相補的に交配を行っていることを分子マーカーを用いて明らかにし、交配可能範囲を示す有効花粉飛散距離を明らかにした。北海道ゴキビル川とその河口域で、山から海への食物連鎖の実態解明を安定同位体を用いて調べたところ、海に流れ込んだ樹木の葉を海のベントスが食べ、さらにそれらを魚類が食べることが実証された。しかし、餌植物や捕食者の組成さらには食物網自体にも大きな季節変動があることが示唆された。 本研究の知見は、人為的な河川改変が河畔林群集の生物種の多様性、個体群の遺伝的多様性の保全のための基礎的知見を提供しうるものと考えられる。

  58. ブナ林の分子生態学的研究 競争的資金

    制度名：Grant-in-Aid for Scientific Research

    2001年4月 ～

  59. 群落形成過程におけるクローナル植物同齢個体群の遺伝的多様性の動態

    蒔田 明史, 陶山 佳久, 鈴木 準一郎, 西脇 亜也

    提供機関：Japan Society for the Promotion of Science

    制度名：Grants-in-Aid for Scientific Research

    研究種目：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    研究機関：Akita Prefectural University

    2000年 ～ 2001年

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    本研究は、典型的な長寿命クローナル植物であるササの群落形成期におけるgenetレベルの動態を記載することにより、クローナル植物の生活史を通じた遺伝的多様性の動態を明らかにしようとしたものである。そのために、一斉開花時からの履歴の判明している個体群を用いて、一斉開花期から群落形成終期までのクローン構造の変化を解析した。 1.1995年に十和田湖南岸域で一斉開花したチシマザサの開花個体から採集保存してあった葉をサンプルとしDNA解析を行い、一斉開花現象が多数個体による同時開花であることを確認した。 2.発生後21年を経たチシマザサ実生由来個体群に対して、掘り取り調査とDNA解析を併用して個体密度の推定やクローン構造の解析を行った。その結果、1)930個体/m^2発生した実生の個体密度は、20年間で10数個体/m^2程度にまで減少したこと、2)群落高や稈密度は開花前の集団に近づいているものの、genet間の成長の差は著しく、広域を1個体が占有するような大きなクローンは見られず、個体間競争により自己間引きが継続中であることなどが明らかになった。 本研究により、(1)AFLPフィンガープリント法はクローナル植物の動態解析にとって大変強力なツールであること、(2)多数個体による一斉開花により明らかに遺伝的多様性が高まること、(3)実生発生後20年あまりで、群落サイズはほぼ回復したものの、個体を単位としてみれば激しい個体間競争が継続しており、ササ群落が平衡状態に達するにはまだかなりの時間を要することなどが明らかになった。また、本研究を通して、フィールド(永久方形区)での継続調査とDNA解析を併用することにより、クローン動態を直接観察するための手法を開拓した。今後、この手法の導入により、これまで全く知られてこなかったササ群落の全生活史を通じたクローン動態の解明が行える見通しがついた。

  60. 化石花粉中のDNA分析による古植生の復元

    陶山 佳久

    1997年 ～ 1998年

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    本研究ではマツ科樹木の化石花粉を対象として、化石花粉中DNAのPCR増幅および塩基配列分析を行った。前年度の研究において1065粒中14粒の化石花粉について目的部位のDNA増幅が見られ、これらのサンプルについてその塩基配列を調べた。しかしながら、本年度にそれらの塩基配列を詳細に検討した結果、少なくとも一部のサンプルについては現生花粉の混入による増幅であると結論づけざるを得なかった。この結果を重大に受けとめ、すべての分析手順を見直した。その結果、コンタミネーションの原因を特定することができ、本分析手法の改善を行うことができた。そこで、新しい手法に従ってあらためて化石花粉からのDNA増幅を試みた。材料として、3カ所の湿原堆積物、深層湖底堆積物および表層湖底堆積物の様々な層から採取した化石花粉を用いた。合計840粒の化石花粉についてDNA増幅を試みたが、すべてのサンプルで増幅は見られなかった。すなわち、今回分析に用いた化石花粉についてはDNAの保存性が極めて低いと考えられた。そこで化石花粉内部の保存性を左右する堆積条件等について検討し、化石花粉中のDNA分析に適した材料の条件を推定した。現在、現段階でこの分析に最も適したと考えられる材料を用いてDNA増幅を試みている。 本研究の補助金交付期間内では、残念ながら最終目的である「古植生の復元」までたどり着くことはできなかったが、目的の一つであった「分析方法の確立」については大きな成果が得られた。これらの成果をふまえ、今後も研究を継続する予定である。

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社会貢献活動 25

  1. 東京大学大学院総合文化研究科 広域システム科学特別セミナー

    2017年12月14日 ～

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    「MIG-seq法の概要とその多様性生物学研究への応用」と題する講演。

  2. 第26回Qecoセミナー

    2017年11月16日 ～

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    「生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の原理からその研究事例まで」と題する講演。

  3. 宮崎大学テニュアトラック推進セミナー

    2017年10月6日 ～

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    「生物の個体・集団・種を識別できる新しいDNA分析技術：MIG-seq法の開発秘話からその研究事例まで」と題する講演。

  4. エフエム仙台forever green project仙台北山輪王寺の森体験ツアー

    2017年9月24日 ～

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    一般参加者向けの講演および森林観察の講師

  5. 東北大学教育関係共同利用拠点シンポジウム

    2017年3月13日 ～

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    教育関係共同利用拠点として認定されている東北大学・川渡フィールドセンターの「食と環境のつながりを学ぶ複合生態フィールド教育拠点」が主催するシンポジウムを企画運営した。講演とパネルディスカッションを通して、「フィールド体験からの学び」について理解を深め、野外教育と共同利用拠点活動の発展に寄与しようとするもの。

  6. 2016仙台ツリーケアワークショップ講演

    2016年11月19日 ～

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    「地域による遺伝子の違いを生かした植樹の重要性」と題する講演

  7. forever green project 里山体験ツアー2016

    2016年5月22日 ～

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    エフエム仙台と農学研究科 附属複合生態フィールド教育研究センターとの共催。一般公募の参加者19名を連れて森林観察のツアー

  8. 津波防災シンポジウム2015—子どもたちと描く千年希望の未来

    2015年11月5日 ～

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    「遺伝的地域性を考慮した植樹の重要性」と題した講演を行った。

  9. forever green project 里山体験ツアー

    2015年5月24日 ～

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    エフエム仙台と農学研究科 附属複合生態フィールド教育研究センターとの共催。一般公募の参加者22名を連れて森林観察のツアー

  10. スカンディナビア半島 氷河期に針葉樹分布

    2012年5月15日 ～

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    Science誌に掲載された研究成果の報道

  11. 次世代へ繋ぐ「人と自然との共生」を考えるハローウッズシンポジウム2012

    2012年3月1日 ～

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    本田技研工業株式会社 青山本社ビルで開催されたシンポジウムの基調講演およびパネルディスカッション

  12. 第39回農学カルチャー講座

    2011年1月31日 ～

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    講座

  13. 宮城県高等学校理科研究会生物部会 第39回教材生物ワークショップ

    2010年11月16日 ～

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    講演「DNA解析を利用した生態学」ー48年ぶりに一斉開花したインドのタケを調べる

  14. フィールドセンター開放講座2010「おいしい」はつながっている

    2010年7月25日 ～

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    講座

  15. フィールドセンター開放講座「生きもののつながり・食のつながり」

    2009年7月19日 ～

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    ササ等の植物を中心とした生き物のつながりに関する講座 ウシや牛乳生産等を中心としたつながりに関する講座

  16. 緑化は善か（上）「ブナ林 植樹で弱る」

    2009年4月2日 ～

  17. 大崎市立鳴子小学校４・５学年総合学習

    2008年11月27日 ～

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    活動１：シイタケを栽培する活動 活動２：バターを作る活動 活動３：シイタケとバターを味わう

  18. 福島県立安積高等学校第２学年大学模擬授業

    2008年9月25日 ～

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    高校生を対象に、大学の模擬授業を行った。

  19. フィールドセンター開放講座「ウシの親子・木の親子・ヒトの親子」２回目

    2008年8月3日 ～

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    ウシの親子に関する講座 木の親子に関する講座

  20. 大崎市立鳴子小学校教職員研修

    2008年8月1日 ～

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    夏の森林の観察 動物とふれあう活動

  21. フィールドセンター開放講座「ウシの親子・木の親子・ヒトの親子」

    2008年7月27日 ～

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    ウシの親子に関する講座 木の親子に関する講座

  22. 大崎市古川太陽保育園体験学習２回目

    2008年7月16日 ～

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    活動１：夏の森林観察路の散策 活動２：センターの生き物にふれあう活動

  23. 大崎市立鳴子小学校４学年総合学習２回目

    2008年6月26日 ～

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    活動１：春の森林観察路の散策 活動２：センターの生き物にふれあう活動 活動３：リコーダー演奏

  24. 大崎市古川太陽保育園体験学習１回目

    2008年6月17日 ～

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    活動１：夏の森林観察路の散策 活動２：センターの生き物にふれあう活動

  25. 大崎市立鳴子小学校４学年総合学習１回目

    2008年5月1日 ～

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    活動１：春の森林観察路の散策 活動２：センターの生き物にふれあう活動

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メディア報道 68

  1. 未来に向けた過去の生物のDNA分析

    FM仙台

    2017年12月31日

    メディア報道種別: その他

  2. 未来の暮らし考察：東北大と共同シンポ 講演や実践事例発表

    岩手日日新聞

    2017年12月17日

    メディア報道種別: 新聞・雑誌

  3. 心豊かな生活 力合わせ：北上・未来創造シンポジウム

    岩手日報

    2017年12月17日

    メディア報道種別: 新聞・雑誌

  4. 落葉広葉樹の落ち葉について

    FM仙台

    2017年11月26日

    メディア報道種別: その他

  5. 紅葉の彩りについて

    FM仙台

    2017年10月29日

    メディア報道種別: その他

  6. 輪王寺の森体験ツアー報告

    FM仙台

    2017年10月1日

    メディア報道種別: その他

  7. フィールド環境学の体験より

    FM仙台

    2017年9月24日

    メディア報道種別: その他

  8. 自然の中で耳をすます体験：アメリカでのヌマスギ調査の経験から

    FM仙台

    2017年8月27日

    メディア報道種別: その他

  9. 種の保存法

    FM仙台

    2017年7月30日

    メディア報道種別: その他

  10. 里山体験ツアー報告

    FM仙台

    2017年6月25日

    メディア報道種別: その他

  11. 新緑の美しさと、120年目のササの一斉開花

    FM仙台

    2017年5月28日

    メディア報道種別: その他

  12. 外来種を駆除することの難しさ

    FM仙台

    2017年4月30日

    メディア報道種別: その他

  13. 野外環境教育と未来

    FM仙台

    2017年3月26日

    メディア報道種別: その他

  14. 自然公園などでゴミを拾うこと

    FM仙台

    2017年2月26日

    メディア報道種別: その他

  15. 海辺の小さな生き物がもつ大きな力と大切さ

    FM仙台

    2017年1月29日

    メディア報道種別: その他

  16. 樹木の全個体調査の体験から

    FM仙台

    2016年12月21日

    メディア報道種別: その他

  17. 東北・宮城の自然環境（落葉樹の落ち葉に関する話題）

    FM仙台

    2016年12月1日

    メディア報道種別: その他

  18. 植樹活動における問題

    FM仙台

    2016年11月27日

    メディア報道種別: その他

  19. マングローブを守る研究

    FM仙台

    2016年10月30日

    メディア報道種別: その他

  20. 森林におけるコケにまつわる生物間相互作用の研究

    FM仙台

    2016年9月25日

    メディア報道種別: その他

  21. 実りに感じる自然の豊かさ

    FM仙台

    2016年8月27日

    メディア報道種別: その他

  22. 環境に配慮した産業を実現するために

    FM仙台

    2016年7月31日

    メディア報道種別: その他

  23. 生物多様性の地域資源としての伝統野菜

    FM仙台

    2016年6月26日

    メディア報道種別: その他

  24. forever green project里山体験ツアー報告

    FM仙台

    2016年5月29日

    メディア報道種別: その他

  25. 東北の自然に関する解説

    FM仙台

    2016年5月18日

    メディア報道種別: その他

    詳細を見る 詳細を閉じる

    forever green project special week

  26. 落葉広葉樹林帯の春の芽吹き

    FM仙台

    2016年4月24日

    メディア報道種別: その他

  27. オーストラリアの自然保護

    FM仙台

    2016年3月27日

    メディア報道種別: その他

  28. 自然保護に関わる仕事

    FM仙台

    2016年2月28日

    メディア報道種別: その他

  29. 絶滅危惧植物を守る研究

    FM仙台

    2016年1月31日

    メディア報道種別: その他

  30. 過去の自然と未来の自然

    FM仙台

    2015年12月27日

    メディア報道種別: その他

  31. 東北・宮城の自然環境

    FM仙台

    2015年12月1日

    メディア報道種別: その他

  32. 郷土の生き物を守る動き：ニューカレドニアでの調査から

    FM仙台

    2015年11月29日

    メディア報道種別: その他

  33. Des chercheurs japonais étudient la plante Oxera baladica

    Les Nouvelles Calédoniennes（ニューカレドニア新聞）

    2015年11月14日

    メディア報道種別: 新聞・雑誌

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    ニューカレドニアで行っている希少種保全のための調査に関する報道

  34. 地域に根付いた樹木（津波震災シンポジウム2015-4）

    FM東京

    2015年11月12日

    メディア報道種別: その他

  35. 未来への責任（津波震災シンポジウム2015-3）

    FM東京

    2015年11月11日

    メディア報道種別: その他

  36. 郷土の未来の環境のためにできること

    FM仙台

    2015年10月25日

    メディア報道種別: その他

  37. 生物多様性が高いといいことがあるのか

    FM仙台

    2015年9月27日

    メディア報道種別: その他

  38. 千年希望の丘の植樹

    FM仙台

    2015年9月13日

    メディア報道種別: その他

  39. 見渡す限り広がる景色の意味

    FM仙台

    2015年8月30日

    メディア報道種別: その他

  40. 生物多様性を守るためにできること：国際的な取り組みと消費者としての行動

    FM仙台

    2015年7月26日

    メディア報道種別: その他

  41. レブンアツモリソウの保全遺伝学的研究の紹介

    FM仙台

    2015年6月28日

    メディア報道種別: その他

  42. とうほく一番物語56「日本一広い東北大農場」

    河北新報

    2015年6月28日

    メディア報道種別: 新聞・雑誌

  43. ブナ林の生態に関する研究の紹介

    FM仙台

    2015年5月31日

    メディア報道種別: その他

  44. 日本の森林と自然再生のための植樹に関する話題

    FM仙台

    2015年5月29日

    メディア報道種別: その他

  45. 自然再生のための植樹に関する話題

    FM仙台

    2015年5月22日

    メディア報道種別: その他

  46. 適地適木に関する話題

    FM仙台

    2015年5月15日

    メディア報道種別: その他

  47. 東北地方の森林の四季に関する話題

    FM仙台

    2015年5月8日

    メディア報道種別: その他

  48. 日本の森林構成種に関する話題

    FM仙台

    2015年5月1日

    メディア報道種別: その他

  49. 東北地方の森林植生に関する研究の紹介

    FM仙台

    2015年4月26日

    メディア報道種別: その他

  50. 世界の森林と森林再生に関する話題

    FM仙台

    2015年4月24日

    メディア報道種別: その他

  51. 森林再生に関する話題

    FM仙台

    2015年4月17日

    メディア報道種別: その他

  52. 天然林と人工林に関する話題

    FM仙台

    2015年4月10日

    メディア報道種別: その他

  53. 世界の森林事情に関する話題

    FM仙台

    2015年4月3日

    メディア報道種別: その他

  54. ブラジルでの保全遺伝学的研究の紹介

    FM仙台

    2015年3月29日

    メディア報道種別: その他

  55. 森林の多目的機能と保全に関する話題

    FM仙台

    2015年3月27日

    メディア報道種別: その他

  56. 森林保全に関する話題

    FM仙台

    2015年3月20日

    メディア報道種別: その他

  57. 森林が持つ防災機能の紹介

    FM仙台

    2015年3月13日

    メディア報道種別: その他

  58. 森林の多目的機能の紹介

    FM仙台

    2015年3月6日

    メディア報道種別: その他

  59. ニューカレドニアの希少植物に関する研究の紹介

    FM仙台

    2015年2月22日

    メディア報道種別: その他

  60. ニューカレドニアの希少植物調査の紹介

    FM仙台

    2015年1月25日

    メディア報道種別: その他

  61. 年を数える植物に関する研究の紹介

    FM仙台

    2014年12月28日

    メディア報道種別: その他

  62. モミの木に関する研究の紹介

    FM仙台

    2014年12月21日

    メディア報道種別: その他

  63. 植物の遺伝的地域性の保全に関する研究の紹介

    FM仙台

    2014年11月30日

    メディア報道種別: その他

  64. 植物の地史的分布変遷に関する研究の紹介

    FM仙台

    2014年10月26日

    メディア報道種別: その他

  65. 植物の遺伝的地域性に関する研究の紹介

    FM仙台

    2014年9月27日

    メディア報道種別: その他

  66. 「千年希望の丘」に植樹した木々の生育に関する研究の紹介

    FM仙台

    2014年8月23日

    メディア報道種別: その他

  67. ブナ林「子孫維持」に工夫

    読売新聞

    2005年6月25日

    メディア報道種別: 新聞・雑誌

  68. 新みやぎ人「木々のなぞ解く”森の探偵”」

    読売新聞

    2002年3月21日

    メディア報道種別: 新聞・雑誌

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その他 13

  1. 生物多様性を活かした生物生産技術に関する研究

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    生物多様性を活かした生物生産試験の実施と、そのメカニズムおよび効果の解析、生産予測・最適化・省力化等関連技術の開発、および開発技術の実用化・普及（商品化）に関する研究

  2. 遺伝情報解読ブレークスルーを活用した「種の保存法」指定種の最適保全管理

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    国内希少野生動植物種を将来にわたって維持するために必要な、遺伝的特徴の個体モニタリングを多数サンプルで継続して行えるように、ゲノム情報の新たな縮約解読方法を開発・改良する。

  3. チョウセンキバナアツモリソウ遺伝子解析業務

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    チョウセンキバナアツモリソウの遺伝子解析業務

  4. チョウセンキバナアツモリソウ遺伝子解析業務

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    チョウセンキバナアツモリソウの遺伝子解析業務

  5. アジアの森林における遺伝子・種多様性アセスメント

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    （１）特定の分類群・機能群を対象とする、戦略的に重要な観測データのデータベース化、遺伝子・種多様性の現状と、損失速度の推 定、ホットスポット、保全に必要な面積、保全の方法などについての政策提言を行う。 （２）遺伝子配列データから熱帯林の種・系統多様性を評価する方法を開発し、アジア・太平洋地域の樹木レッドデータブック編集・ホットスポット特定に寄与する。 （３）気候変動下での適応的進化を定量的に評価する方法を開発する。

  6. 絶滅危惧植物の全個体ジェノタイピングに基づく生物多様性保全に関する研究

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    絶滅危惧植物の保全のために、残存するすべての個体について網羅的に、生育位置、繁殖状況、遺伝子型に関する調査を行い、その情報をもとに、遺伝解析と数理解析によって、合理的な生物多様性保全策を検討する。

  7. 大規模操作実験と地理的勾配を用いた冷温帯林生態系機能の地理分化の解明

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    主要構成種の遺伝的変異に基づいた森林群集の生食連鎖と腐食連鎖応答を、地理的環境勾配に対する生産者の生理的応答とともに明らかにする。

  8. 極限環境の生物多様性と生態系変動に関する研究

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    （協力内容）アイスコア中の花粉を材料としたDNA分析

  9. インドミゾラム州における竹類の大面積一斉開花枯死が地域の生態系と焼畑に及ぼす影響

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    竹類Melocanna bacciferaの一斉大面積開花の生態的特性および焼畑地における挙動に関する研究

  10. 遺伝的多様性の評価技術を用いた自然再生の遺伝的ガイドラインに関する研究

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    遺伝的多様性の評価技術を用いて、自然再生に高頻度で用いられる樹木について遺伝的多様性を考慮した種子の移動のガイドラインの作成を行なう。

  11. マツタケ胞子分離により得られた菌糸体のDNA分析

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    マツタケ胞子の分離により得られた培養菌糸体の特性を明らかにすることを目的として、マイクロサテライト分析を行った。

  12. 古代ウルシ属内果皮のDNA分析

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    縄文時代遺跡から出土したウルシ属の内果皮を種同定することを目的として、ウルシ属内の種識別が可能な葉緑体DNAの領域を探索し、遺跡試料のDNA分析を行う。

  13. ウミグモの分子系統解析

    詳細を見る 詳細を閉じる

    ウミグモ鋼の分子系統を明らかにすることを目的として、DNA塩基配列分析を行った。

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