Details of the Researcher

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Takuro Ito
Section
The Center for Academic Resources and Archives
Job title
Assistant Professor
Degree

Research History 3

  • 2020/05 - Present
    Tohoku University　The Center for Academic Resources and Archives

  • 2018/04 - 2020/05
    Kyoto University　Graduate School of Agriculture

  • 2016/04 - 2018/03
    Tokyo University of Agriculture and Technology　United Graduate School of Agricultural Science

Education 3

  • Tokyo University of Agriculture and Technology　United Graduate School of Agricultural Science　Department of Biological Production Science

    2015/04 - 2018/03

  • Ibaraki University　Graduate School of Agriculture

    2013/04 - 2015/03

  • Ibaraki University　College of Agriculture

    2009/04 - 2013/03

Committee Memberships 6

  • 日本植物園協会　国際交流推進委員会委員

    2026/05 - Present

  • Phytokeys　Subject Editor

    2024/11 - Present

  • Journal of Plant Research Editorial Board Member

    2024/01 - Present

  • 青森県環境影響評価審議会委員

    2022/04 - Present

  • 日本植物学会　広報委員

    2021/03 - 2023/03

  • 日本植物分類学会　第23回大会実行委員長

    2024/03 -

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Professional Memberships 3

  • THE ECOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN

  • THE BOTANICAL SOCIETY OF JAPAN

  • JAPANESE SOCIETY FOR PLANT SYSTEMATICS

Research Interests 8

  • 台湾

  • 小笠原諸島

  • 琉球列島

  • Sedum

  • Phylogeography

  • Crassulaceae

  • Adaptive evolution

  • Phylogenetic systematics

Research Areas 2

  • Life sciences / Evolutionary biology /

  • Life sciences / Biodiversity and systematics /

Awards 13

  1. 第24回日本植物分類学会 奨励賞

    2025/03　日本植物分類学会

  2. 第11回 日本植物分類学会 大会発表賞 (口頭発表)

    2017/03　日本植物分類学会

  3. East Asian Plant Diversity and Conservation 2016 Best Poster Award

    2016/08

  4. 第19回 日本植物分類学会 大会発表賞（口頭発表）

    2026/03　日本植物分類学会

  5. 第19回 日本植物分類学会 大会発表賞（ポスター発表）

    2026/03　日本植物分類学会

  6. 第19回 日本植物分類学会 大会発表賞（ポスター発表）

    2026/03　日本植物分類学会

  7. 菌根研究会2025年大会 最優秀発表賞

    2025/11　菌根研究会

  8. 第18回 日本植物分類学会 大会発表賞（ポスター発表）

    2025/03　日本植物分類学会

  9. 森林遺伝育種学会第13回大会 最優秀発表賞

    2024/11　森林遺伝育種学会

  10. 第17回 日本植物分類学会 大会発表賞（ポスター発表）

    2024/03　日本植物分類学会

  11. 第17回 日本植物分類学会 大会発表賞（口頭発表）

    2024/03　日本植物分類学会

  12. 第16回 日本植物分類学会 大会発表賞 (ポスター発表)

    2023/03　日本植物分類学会

  13. 日本生態学会第70回大会 ポスター賞優秀賞

    2023/03　日本生態学会

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Papers 47

  1. Salix ×azusaensis, a New Hybrid between S. caprea and S. rupifraga Peer-reviewed

    Wataru FUKAYA, Takuro ITO, Satoshi KIKUCHI, Mineaki AIZAWA, Masayuki MAKI

    The Journal of Japanese Botany　101　(4)　207-216　2026/08

    DOI： 10.51033/jjapbot.ID0371 　

  2. Taxonomic revision of Hypericum (Hypericaceae) in Yakushima, Japan with a new miniaturised species, H. yaedakense Peer-reviewed

    Takahashi, D., Suyama, Y., Ishikawa, N., Yamamoto, M., Fukuda, T., Ito, T., Magota, K., Yonekura, K., Yahara, T.

    Acta Phytotaxonomica et Geobotanica　77　(2)　57-72　2026/06

    DOI： 10.18942/apg.202517 　

  3. In vitro root colonization and effects on host growth by fungi isolated from hair roots of Vaccinium wrightii in Amami-Oshima Island, a subtropical region of Japan (Ericaceae) Peer-reviewed

    Sota Sato, Takashi Baba, Dai Hirose, Takuro Ito, Masayuki Maki

    Plant Root　20　9-20　2026/05

    Publisher: Japanese Society for Root Research

    DOI： 10.3117/plantroot.20.9 　

    eISSN： 1881-6754

  4. Detection and validation of QTLs for flowering time in morning glory Peer-reviewed

    Hiroaki Katsuyama, Takuro Ito, Kyousuke Ezura, Emdadul Haque, Atsushi Hoshino, Eiji Nitasaka, Michiyuki Ono, Shusei Sato, Sachiko Isobe, Hiroyuki Fukuoka, Nobuyoshi Watanabe, Tsutomu Kuboyama

    Breeding Science　75　(5)　339-348　2025/12

    Publisher: Japanese Society of Breeding

    DOI： 10.1270/jsbbs.24067 　

    ISSN： 1344-7610

    eISSN： 1347-3735

  5. Phenolic compound diversity reflecting phylogeographic structure of Diapensia lapponica subsp. obovata (Diapensiaceae) populations in Japan Peer-reviewed

    Hyuga Hirano, Toshiyo Kato, Keiichi Noguchi, Hisahiro Kai, Takuro Ito, Takashi Kikuchi, Futa Sakakibara, Yoshinori Murai

    Biochemical Systematics and Ecology　125　105168　2025/11

    DOI： 10.1016/j.bse.2025.105168 　

  6. Detection of introgressed loci from Pinus parviflora var. pentaphylla into P. pumila and their possible roles in adaptation to a warming climate Peer-reviewed

    Yumeko Tarusawa, Takuro Ito, Yuji Isagi

    Global Ecology and Conservation　63　e03886-e03886　2025/11

    Publisher: Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.gecco.2025.e03886 　

    ISSN： 2351-9894

  7. Population genetic structure reveals asymmetric hybridization between Pinus pumila and P. parviflora var. Pentaphylla in the Hakkoda Mountains, Northern Japan Peer-reviewed

    Yumeko Tarusawa, Takuro Ito, Yuji Isagi

    Scientific Reports　15　(1)　37677　2025/10/28

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41598-025-21433-4 　

    eISSN： 2045-2322

  8. Sedum diversiflorum sp. nov. (Crassulaceae), a new species with variable merosity from the Satsunan Islands, Kagoshima, Japan Peer-reviewed

    Takuro Ito, Masatsugu Yokota, Mizuho Endo, Akitoshi Iwamoto, Masayuki Maki, Goro Kokubugata

    Nordic Journal of Botany　e04877　2025/09

    DOI： 10.1002/njb.04877 　

  9. Genomic analysis highlights the conservation significance of Torenia concolor (Linderniaceae) from the periphery of its distribution range Peer-reviewed

    Yuji Isagi, Taiga Shimizu, Yukihiro Kobayashi, Yoshihisa Suyama, Chinatsu Tokuhiro, Goro Kokubugata, Takuro Ito, Kuo-Fang Chung, Atsushi Abe, Takashi Makino, Michimasa Yamasaki

    Journal of Plant Research　138　(6)　959-969　2025/08/19

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s10265-025-01659-z 　

    ISSN： 0918-9440

    eISSN： 1618-0860

    More details Close

    Abstract Biodiversity status assessments are typically conducted on a regional basis. Consequently, there are numerous species that are rare in one region but ubiquitously present in another country or administrative region. Correctly assessing the conservation status and value of such “endangered species” is essential to achieve better biodiversity conservation through the appropriate and efficient use of socioeconomic resources. A comparative genomic analysis was conducted on Torenia concolor , which is widely distributed in Southeast and East Asia, but has a limited population in Japan, specifically on Amami Oshima Island. This population has not yet been established as a conservation priority due to the possibility that it may have originated from cultivated plants. We hypothesized that the population was not due to a human-induced distribution; indeed, our findings indicate that the Amami Oshima population is derived from a natural distribution and is phylogenetically unique, retaining comparable genetic diversity with more abundant populations and exhibiting no increase in deleterious variations in their genome. These findings highlight the unique conservation significance of the Amami Oshima population. Furthermore, the findings suggest that this population, being genetically robust, may be sustainably conserved through minimal intervention strategies, such as maintaining current habitat conditions and monitoring population size, as the accumulation of deleterious mutations is comparable to that of the Taiwanese population. This study highlights the importance of accurate assessment of genomic status and contributes to a broader understanding of conservation strategies for regionally rare species.

  10. A New Species, Chrysosplenium brevifilamentosum (Saxifragaceae), from Kyushu, Japan Peer-reviewed

    Sugiyama, Y., Ito, T., Yamashiro, T., Fujii, S., Igari, M., Maki, M.

    Acta Phytotaxonomica et Geobotanica　76　(2)　111-126　2025/08

    DOI： 10.18942/apg.202507 　

  11. Ploidy Analysis of Two Lineages Within the Histiopteris incisa Complex in the Japanese Archipelago Peer-reviewed

    Wataru Shinohara, Ryutaro Koda, Katsuhiro Yoneoka, Kaoru Yamamoto, Takuro Ito, Noriaki Murakami

    American Fern Journal　115　(2)　142-153　2025/05/12

    Publisher: American Fern Society

    DOI： 10.1640/0002-8444-115.2.142 　

    ISSN： 0002-8444

  12. New Species of Thalictrum (Ranunculaceae) from Okinawa Island in Japan and Its Phylogenetic Implications Peer-reviewed

    KANAE MICHIMOTO, MASATSUGU YOKOTA, ATSUSHI ABE, SHINJI FUJII, DAIKI TAKAHASHI, SATOSHI KAKISHIMA, CHIH CHIEH YU, TAKURO ITO, MASAYUKI MAKI

    Phytotaxa　696　(1)　55-70　2025/03/28

    Publisher: Magnolia Press

    DOI： 10.11646/phytotaxa.696.1.3 　

    ISSN： 1179-3155

    eISSN： 1179-3163

    More details Close

    This study aims to compare Thalictrum (Ranunculaceae) plant species, tentatively identified as T. minus, from the Yambaru region of Okinawa Island, Japan, with closely related species using morphometric and molecular phylogenetic analyses. Morphological observations revealed that the unique plants from Okinawa Island had clavate filaments and thickened roots. These traits differed significantly from those of typical T. minus, which have filamentous filaments and slender roots. Molecular phylogenetic analyses revealed that the unique plant on Okinawa Island is sister to T. urbaini, endemic to Taiwan, and formed a separate clade from those containing T. minus. Based on current morphological comparisons and molecular phylogenetic analyses, the unique plant on Okinawa Island was concluded to be a previously undescribed species, newly named Thalictrum yambaruense. Furthermore, our molecular phylogenetic analyses of Thalictrum in Japan and Taiwan revealed that T. tuberiferum var. yakusimense, endemic to Yakushima Island, Japan, is phylogenetically distinct from T. tuberiferum var. tuberiferum. Therefore, we propose elevating the taxonomic status of T. tuberiferum var. yakusimense to the species level as T. yakusimense.

  13. New record of Sedum mukojimense (Crassulaceae) on Chichi-jima Island, the Bonin Islands

    Ito, T., Goto, M., Inoue, M., Sato, S., Maki, M.

    Ogasawara research　51　57-69　2025/03

  14. Phylogeographical Analyses of Angelica dahurica (Apiaceae) in Japan and Korea: Insights into the Indigenous Status of Japanese Wild Populations Invited Peer-reviewed

    Shoki Murakami, Akira Asakawa, Takuro Ito, Tao Fujiwara, Satoshi Kakishima, Masato Watanabe, Jeon-Keum Seon, Shinji Fujii, Masayuki Maki

    Journal of Japanese Botany　100　(6)　475-488　2025

  15. Effects of soil and phylogeny on sulfur and phosphorus concentrations in wild plants on volcanic and non-volcanic soils in Japan Peer-reviewed

    Takafumi Mizuno, Daichi Kondo, Hiroto Kasai, Jun Yamashita, Takuro Ito, Yoshinori Murai, Antony van der Ent, Atsushi Hashimoto, Toshihiro Watanabe

    Soil Science and Plant Nutrition　1-11　2024/07/22

    Publisher: Informa UK Limited

    DOI： 10.1080/00380768.2024.2381636 　

    ISSN： 0038-0768

    eISSN： 1747-0765

  16. Phylogenetic relationships and divergence time of Hydrangea sect. Macrophyllae (Hydrangeaceae) revealed by genome-wide SNPs Peer-reviewed

    Shoki Murakami, Takuro Ito, Tatsuya Uemachi, Shinji Fujii, Ayumi Matsuo, Yoshihisa Suyama, Masayuki Maki

    Plant Systematics and Evolution　310　(4)　2024/07/04

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1007/s00606-024-01902-5 　

    ISSN： 0378-2697

    eISSN： 1615-6110

    More details Close

    Abstract Hydrangea sect. Macrophyllae comprises deciduous shrubs including two species with seven infraspecific taxa distributed throughout the Japanese Archipelago and adjacent areas. In this study, we revealed a phylogeny of Hydrangea sect. Macrophyllae by using a larger dataset of genome-wide SNPs than those employed in a previous study and by adding more comprehensive taxa/populations, which cover the entire distribution of the section. We then revised the taxonomic treatment of sect. Macrophyllae based on the higher-resolution phylogenetic trees obtained in this study. The phylogenetic trees estimated in this study showed five major clades, suggesting that H. serrata var. minamitanii and var. yesoensis should be treated as independent species from other H. serrata, that H. serrata var. australis and var. yakushimensis could be subclassified under the major clades and that var. angustata could be a synonym of var. serrata. The divergence time of these major clades was estimated to be in the Pleistocene.

  17. New Flavonoids from the leaves and stems of Sedum formosanum (Crassulaceae) Peer-reviewed

    Takayuki Mizuno, Takahisa Nakane, Hari Prasad Devkota, Takuro Ito, Goro Kokubugata, Tsukasa Iwashina

    Phytochemistry Letters　61　198-207　2024/06

    Publisher: Elsevier BV

    DOI： 10.1016/j.phytol.2024.05.003 　

    ISSN： 1874-3900

  18. Intraspecific divergence in a coastal plant, Euphorbia jolkinii, at a major biogeographic boundary in East Asia Peer-reviewed

    Hiroyuki Iwata, Takuro Ito, Jong‐Soo Park, Goro Kokubugata, Akihiro Kakezawa, Takahide Kurosawa, Akihiro Nishimura, Hiroshi Noda, Koji Takayama

    American Journal of Botany　111　(5)　e16327　2024/05/09

    Publisher: Wiley

    DOI： 10.1002/ajb2.16327 　

    ISSN： 0002-9122

    eISSN： 1537-2197

    More details Close

    Abstract Premise Quaternary climatic fluctuations and long‐distance seed dispersal across the sea are critical factors affecting the distribution of coastal plants, but the spatiotemporal nature of population expansion and distribution change of East Asian coastal plants during this period are rarely examined. To explore this process, we investigated the genome‐wide phylogenetic patterns of Euphorbia jolkinii Boiss. (Euphorbiaceae), which grows widely on littoral areas of Japan, Korea, and Taiwan. Methods We used plastome sequences and genome‐wide single nucleotide polymorphisms in samples across the species range to reveal phylogeographic patterns and spatiotemporal distributional changes. We conducted ecological niche modeling for the present and the last glacial maximum (LGM). Results Genetic differentiation was observed between the northern and southern populations of E. jolkinii, separated by the major biogeographic boundary, the Tokara Gap. These two groups of populations differentiated during the glacial period and subsequently intermingled in the intermorainic areas of the central Ryukyu Islands after the LGM. Ecological niche models suggested that the potential range of E. jolkinii was restricted to southern Kyushu; however, it was widespread in the southern Ryukyu Islands and Taiwan during the LGM. Conclusions This study provides evidence of genetic differentiation among coastal plant populations separated by the prominent biogeographical boundary. Although coastal plants are typically expected to maintain population connectivity through sea‐drifted seed dispersal, our findings suggest that genetic differences may arise because of a combination of limited gene flow and changes in climate during the glacial period.

  19. Salvia guidongensis sp. nov.: unraveling a critical evolutionary link in East Asian Salvia from Central China integrating morphology, phylogeny, and plastid genomics Peer-reviewed

    Yan-Bo Huang, Zhe-Chen Qi, Jie-Ying Feng, Bin-Jie Ge, Cun-Zhong Huang, Yu-Qing Feng, Jing Wu, Pu-Rui Wei, Takuro Ito, Goro Kokubugata, Pan Li, Yu-Kun Wei

    Frontiers in Plant Science　15　1332443　2024/03/05

    Publisher: Frontiers Media SA

    DOI： 10.3389/fpls.2024.1332443 　

    eISSN： 1664-462X

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    Introduction Salvia L., representing the largest genus within the mint family, is noted for its global distribution of approximately 1000 species, with East Asia, and particularly China, recognized as a critical center of diversity for the genus. Methods Our research was conducted through extensive fieldwork in Guidong County, Hunan Province, China, where we identified a previously undescribed species of Salvia. The identification process involved detailed morphological observations, phylogenetic analyses, and plastid genomics. Results The newly discovered species, Salvia guidongensis, exhibits unique characteristics not commonly observed in the East Asian lineage of Salvia, including dual floral colors within natural populations—either pale purple or pale yellow. Morphologically, while it shares similarities with members of sect. Glutinaria, S. guidongensis is distinct in its floral morphology, stature, and specific foliar traits. Phylogenetic analysis places S. guidongensis in a unique clade within the East Asian lineage of Salvia, suggesting it may serve as an important evolutionary link. Additionally, we explored the plastome features of S. guidongensis, comparing them with those of closely related species. Discussion The discovery of S. guidongensis not only entriches the taxonomic tapestry of Salvia but also provides critical insights into the biogeography and evolutionary pathways of the genus in East Asia. By integrating morphological and molecular data, we validate the novel status of S. guidongensis and highlight its significance in bridging taxonomic and evolutionary gaps within Sect. Glutinaria of Salvia.

  20. Double migration of the endangered Tricyrtis formosana (Liliaceae) in Japan Peer-reviewed

    Kaori Tsunenari, Takuro Ito, Masatsugu Yokota, Mayu Shibabayashi, Chiharu Endo, Kuo-Fang Chung, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Atsushi Abe, Akiyo Naiki, Hiroaki Setoguchi, Takashi Makino, Yuji Isagi

    Scientific Reports　14　(1)　957　2024/01/10

    Publisher: Springer Science and Business Media LLC

    DOI： 10.1038/s41598-024-51431-x 　

    eISSN： 2045-2322

    More details Close

    Abstract The Ryukyu Islands of Japan are a biodiversity hotspot due to geographical and historical factors. Tricyrtis formosana is a perennial herbaceous plant that commonly found in Taiwan. But only a few populations have been identified in a limited habitat on Iriomote Island, while populations of unknown origin occur near human settlements in an area on the main island of Okinawa. To better understand these populations of the phylogenetic uniqueness and intrinsic vulnerability, we conducted comparative analyses including (1) phylogeny and population structure with MIG-seq data, (2) photosynthesis-related traits of plants grown under common conditions and (3) transcriptome analysis to detect deleterious variations. Results revealed that T. formosana was split into two clades by the congeners and that Iriomote and Okinawa populations independently derived from ancestral Taiwanese populations in each clade. Photosynthetic efficiency was lowest in the Iriomote population, followed by Okinawa and Taiwan. Transcriptome analysis showed that the Iriomote population accumulated more deleterious variations, suggesting intrinsic vulnerability. These results indicate that each T. formosana population in Japan is phylogenetically unique and has been independently dispersed from Taiwan, and that the Iriomote population presents a high conservation difficulty with a unique photosynthesis-related characteristic and a larger amount of deleterious variations.

  21. Development and characterization of expressed sequence tag-simple sequence repeat markers for Anaphalis margaritacea var. yedoensis (Asteraceae) Peer-reviewed

    Taishi Hoson, Shoki Murakami, Takuro Ito, Masuyuki Maki

    Genes & Genetic Systems　98　(5)　259-265　2023/10/01

    Publisher: Genetics Society of Japan

    DOI： 10.1266/ggs.23-00037 　

    ISSN： 1341-7568

    eISSN： 1880-5779

  22. A new record of Ardisia×walkeri, a hybrid of A. japonica and A. pusilla, (Primulaceae) from Jeju Island, Korea Peer-reviewed

    Takuro Ito

    Journal of Species Research　12　(3)　258-265　2023/08/31

    DOI： 10.12651/JSR.2023.12.3.258 　

  23. Phylogenetic Background and Taxonomic Status of Crepidiastrum lanceolatum (Asteraceae) Sold as a Traditional Vegetable in Okinawa Prefecture, Japan Revealed by MIG-seq SNP Data Peer-reviewed

    Goro Kokubugata, Satoshi Kakishima, Takuro Ito, Yukiko Saito, Chikako Ishii, Kuo-Fang Chung, Mina L. Labuguen, Aurea Lopez-Feliciano, Masatsugu Yokota

    Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series B　49　(2)　73-82　2023/05

  24. Plastome-based backbone phylogeny of East Asian Phedimus (Subgenus Aizoon: Crassulaceae), with special emphasis on Korean endemics Peer-reviewed

    Yongsung Kim, Seon-Hee Kim, JiYoung Yang, Myong-Suk Cho, Marina Koldaeva, Takuro Ito, Masayuki Maki, Seung-Chul Kim

    Frontiers in Plant Science　14　1089165　2023/03/14

    Publisher: Frontiers Media SA

    DOI： 10.3389/fpls.2023.1089165 　

    eISSN： 1664-462X

    More details Close

    Although the monophyly of Phedimus has been strongly demonstrated, the species relationships among approximately 20 species of Phedimus have been difficult to determine because of the uniformity of their floral characteristics and extreme variation of their vegetative characters, often accompanied by high polyploid and aneuploid series and diverse habitats. In this study, we assembled 15 complete chloroplast genomes of Phedimus species from East Asia and generated a plastome-based backbone phylogeny of the subgenus Aizoon. As a proxy for nuclear phylogeny, we reconstructed the nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer (nrDNA ITS) phylogeny independently. The 15 plastomes of subg. Aizoon were highly conserved in structure and organization; hence, the complete plastome phylogeny fully resolved the species relationships with strong support. We found that P. aizoon and P. kamtschaticus were polyphyletic and morphologically distinct or ambiguous species, and they most likely evolved from the two species complex. The crown age of subg. Aizoon was estimated to be 27 Ma, suggesting its origin to be in the late Oligocene; however, the major lineages were diversified during the Miocene. The two Korean endemics, P. takesimensis and P. zokuriensis, were inferred to have originated recently during the Pleistocene, whereas the other endemic, P. latiovalifolium, originated in the late Miocene. Several mutation hotspots and seven positively selected chloroplast genes were identified in the subg. Aizoon.

  25. A new species of succulent plant discovered in limestone areas of Kyushu, Japan: Sedum kawaraense（Crassulaceae） Peer-reviewed

    Takuro Ito, Hironobu Kanemistu, Taishi Hoson, Tetsukazu Yahara

    Phytotaxa　587　(2)　149-160　2023/03

    Publisher: Magnolia Press

    DOI： 10.11646/phytotaxa.587.2.4 　

    ISSN： 1179-3155

    eISSN： 1179-3163

    More details Close

    An unknown species of the genus Sedum was discovered in Kawara-dake and Ryu-ga-hana, limestone mountains in Kyushu, Japan. The present study aimed to clarify the taxonomic status of the unknown Sedum species through morphological and ecological comparisons and molecular phylogenetic analysis using ITS sequences based on comprehensive taxon sampling of sect. Sedum in East Asia. Morphologically and ecologically, the unknown species was most similar to S. lipingense in China, but was distinguished by having larger spatulate rosulate leaves and more flowers per flowering stem. Phylogenetically, it belonged to a clade with four Chinese endemics including S. lipingense and two other species widely distributed in East Asia. The clade showed polytomy at the base, but the unknown species was genetically differentiated from the other species. Therefore, we describe the unknown species from Kawara-dake as a new species, S. kawaraense.

  26. The contrary conservation situations of two local critically endangered species, Vaccinium emarginatum (Ericaceae) and Elatostema platyphyllum (Urticaceae), growing on the eastern edge of the distribution Peer-reviewed

    Mayu Shibabayashi, Taiga Shimizu, Chinatsu Tokuhiro, Yoshihisa Suyama, Shota Sakaguchi, Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Kuo-Fang Chung, Jun’ichi Nagasawa, Toshiaki Shiuchi, Goro Kokubugata, Atsushi Abe, Akiyo Naiki, Atsushi J. Nagano, Yuji Isagi

    Frontiers in Ecology and Evolution　11　1093321　2023/01/26

    DOI： 10.3389/fevo.2023.1093321 　

    ISSN： 2296-701X

    eISSN： 2296-701X

  27. Sedum ryukyuense, a Replacement Name for Sedum uniflorum (Crassulaceae) Peer-reviewed

    Takuro ITO

    The Journal of Japanese Botany　97　(4)　207-211　2022/08/20

    DOI： 10.51033/jjapbot.97_4_11180 　

    ISSN： 0022-2062 2436-6730

  28. The complete chloroplast genome sequence of Thalictrum aquilegiifolium var. sibiricum (Ranunculaceae) Peer-reviewed

    Kanae Michimoto, Takuro Ito, Masayuki Maki

    Mitochondrial DNA Part B　7　(6)　1171-1173　2022/06/03

    Publisher: Informa UK Limited

    DOI： 10.1080/23802359.2022.2088309 　

    ISSN： 2380-2359

    eISSN： 2380-2359

  29. The complete chloroplast genome of a coastal plant, Euphorbia jolkinii (Euphorbiaceae) Peer-reviewed

    Hiroyuki Iwata, Takuro Ito, Goro Kokubugata, Koji Takayama

    Mitochondrial DNA Part B　7　(3)　569-570　2022/03/04

    Publisher: Informa {UK} Limited

    DOI： 10.1080/23802359.2022.2055502 　

    eISSN： 2380-2359

  30. The complete chloroplast genome sequence of Anaphalis margaritacea var. yedoensis (Asteraceae) and phylogenetic relationships within Gnaphalieae Peer-reviewed

    Taishi Hoson, Takuro Ito, Masayuki Maki

    Mitochondrial DNA Part B　7　(3)　563-565　2022/03/04

    Publisher: Informa {UK} Limited

    DOI： 10.1080/23802359.2022.2048213 　

  31. Plastome phylogenomics of Allaeanthus, Broussonetia and Malaisia (Dorstenieae, Moraceae) and the origin of B. × kazinoki Peer-reviewed

    Wen-Hsi Kuo, Shih-Hui Liu, Chiung-Chih Chang, Chia-Lun Hsieh, Yi-Hsuan Li, Takuro Ito, Hyosig Won, Goro Kokubugata, Kuo-Fang Chung

    Journal of Plant Research　135　203-220　2022/03

    DOI： 10.1007/s10265-022-01369-w 　

  32. Development of microsatellite markers for Meliosma arnottiana (Sabiaceae) disjunctively distributed in the Japanese archipelago Peer-reviewed

    Shoki Murakami, Takuro Ito, Akira Asakawa, Shinji Fujii, Masayuki Maki

    Journal of Forest Research　1-4　2021/06/22

    Publisher: Informa UK Limited

    DOI： 10.1080/13416979.2021.1941561 　

    ISSN： 1341-6979

    eISSN： 1610-7403

  33. Refugia during the last glacial period and the origin of the disjunct distribution of an insular plant Peer-reviewed

    Takayuki Yamada, Goro Kokubugata, Shinji Fujii, Chien‐Fan Chen, Akira Asakawa, Takuro Ito, Masayuki Maki

    Journal of Biogeography　48　(6)　1460-1474　2021/06

    Publisher: Wiley

    DOI： 10.1111/jbi.14090 　

    ISSN： 0305-0270

    eISSN： 1365-2699

  34. Niche conservatism promotes speciation in cycads: the case ofDioon merolae(Zamiaceae) in Mexico Peer-reviewed

    José Said Gutiérrez‐Ortega, María Magdalena Salinas‐Rodríguez, Takuro Ito, Miguel Angel Pérez‐Farrera, Andrew P. Vovides, José F. Martínez, Francisco Molina‐Freaner, Antonio Hernández‐López, Lina Kawaguchi, Atsushi J. Nagano, Tadashi Kajita, Yasuyuki Watano, Takashi Tsuchimatsu, Yuma Takahashi, Masashi Murakami

    New Phytologist　227　(6)　1872-1884　2020/09

    DOI： 10.1111/nph.16647 　

    ISSN： 0028-646X

    eISSN： 1469-8137

  35. Radiation history of Asian Asarum (sect. Heterotropa, Aristolochiaceae) resolved using a phylogenomic approach based on double-digested RAD-seq data Peer-reviewed

    Yudai Okuyama, Nana Goto, Atsushi J Nagano, Masaki Yasugi, Goro Kokubugata, Hiroshi Kudoh, Zhechen Qi, Takuro Ito, Satoshi Kakishima, Takashi Sugawara

    Annals of Botany　126　(2)　245-260　2020/07/24

    DOI： 10.1093/aob/mcaa072 　

    ISSN： 0305-7364

    eISSN： 1095-8290

  36. A new species of succulent plants from the Muko-jima group of the Bonin Islands, Japan: Sedum mukojimense (Crassulaceae) Peer-reviewed

    TAKURO ITO, MASAFUMI GOTO, HIDETO NAKANO, GORO KOKUBUGATA

    Phytotaxa　450　(2)　188-198　2020/06/25

    Publisher: Magnolia Press

    DOI： 10.11646/phytotaxa.450.2.4 　

    ISSN： 1179-3155

    eISSN： 1179-3163

    More details Close

    A taxonomic re-examination of Sedum boninense, which is endemic to the Muko-jima and Chichi-jima groups of the Bonin Islands, Japan, was carried out. Morphological and physiological comparisons revealed differences between plants from the Muko-jima and Chichi-jima groups in the shape and size of leaves and underground bulb scale leaves, plant habit, habitat and flowering season. Molecular phylogenetic analysis using the ITS region revealed that the plants from respective island groups formed sister clades. Therefore, the plant from Muko-jima group is described as a new species of S. mukojimense.

  37. Sedum formosanum subsp. miyakojimense (Crassulaceae), a new subspecies from Miyako-jima Island of the Ryukyu Islands, Japan. Peer-reviewed

    Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Masatsugu Yokota, Goro Kokubugata

    Phytokeys　148　51-70　2020

    Publisher: Pensoft Publishers

    DOI： 10.3897/phytokeys.148.48957 　

    ISSN： 1314-2011

    eISSN： 1314-2003

    More details Close

    We re-examined the taxonomic status of plants treated as Sedum formosanum (Crassulaceae) from Miyako-jima Island of the Ryukyu Islands, Japan, using morphological comparison and molecular phylogenetic analyses with related species. In morphology, plants from Miyako-jima Island bore a close resemblance to the other plants of S. formosanum, but differed in being perennial, polycarpic, and having lateral axillary branches. Molecular analyses based on ITS of nrDNA and six regions of cpDNA sequencing indicated that the Miyako-jima plants formed a distinct subclade. This subclade was part of a polytomy with three other subclades comprising nine taxa endemic to Taiwan and S. formosanum from other areas, including the type locality. Therefore, we propose and describe the Miyako-jima plants as a new subspecies, Sedum formosanum subsp. miyakojimense.

  38. Three Independent Migrations of Dodonaea viscosa (Sapindaceae) to Japan Archipelago Revealed by Molecular Data Peer-reviewed

    Goro Kokubugata, Takuro Ito, Yumiko Hirayama, Noriaki Murakami, Mina L. Labuguen, Aurea Lopez-Feliciano, Masatsugu Yokota

    Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series B　45　(4)　137-145　2019/11

  39. Evolutionary origin of a periodical mass-flowering plant. International-journal Peer-reviewed

    Satoshi Kakishima, Yi-Shuo Liang, Takuro Ito, Tsung-Yu Aleck Yang, Pei-Luen Lu, Yudai Okuyama, Mitsuyasu Hasebe, Jin Murata, Jin Yoshimura

    Ecology and evolution　9　(8)　4373-4381　2019/04

    DOI： 10.1002/ece3.4881 　

    More details Close

    The evolutionary origin of periodical mass-flowering plants (shortly periodical plants), exhibiting periodical mass flowering and death immediately after flowering, has not been demonstrated. Within the genus Strobilanthes (Acanthaceae), which includes more than 50 periodical species, Strobilanthes flexicaulis on Okinawa Island, Japan, flowers gregariously every 6 years. We investigated the life history of S. flexicaulis in other regions and that of closely related species together with their molecular phylogeny to reveal the evolutionary origin of periodical mass flowering. S. flexicaulis on Taiwan Island was found to be a polycarpic perennial with no mass flowering and, in the Yaeyama Islands, Japan, a monocarpic perennial with no mass flowering. Molecular phylogenetic analyses indicated that a polycarpic perennial was the ancestral state in this whole group including S. flexicaulis and the closely related species. No distinctive genetic differentiation was found in S. flexicaulis among all three life histories (polycarpic perennial, monocarpic perennial, and periodical plant). These results suggest that among S. flexicaulis, the periodical mass flowering on Okinawa Island had evolved from the polycarpic perennial on Taiwan Island via the monocarpic perennial in the Yaeyama Islands. Thus, the evolution of life histories could have taken at the level of local populations within a species.

  40. Reconsiderations of distribution and taxonomic status of inflaspecific taxa in Sedum japonicum (Crassulaceae) based on morphological and molecular data Peer-reviewed

    Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Goro Kokubugata

    Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series B　44　(2)　1-11　2018/08

  41. Unique parallel radiations of high-mountainous species of the genus Sedum (Crassulaceae) on the continental island of Taiwan Peer-reviewed

    Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Koh Nakamura, Kuo-Fang Chung, Qin-er Yang, Cheng-Xin Fu, Zhe-Chen Qi, Goro Kokubugata

    Molecular Phylogenetics and Evolution　113　9-22　2017/08

    DOI： 10.1016/j.ympev.2017.03.028 　

    ISSN： 1055-7903

    eISSN： 1095-9513

  42. Sedum danjoense (Crassulaceae), a new species of succulent plants from the Danjo Islands in Japan Peer-reviewed

    Takuro Ito, Hiroki Nakanishi, Yoshiro Chichibu, Kiyotaka Minoda, Goro Kokubugata

    Phytotaxa　309　(1)　23-34　2017/06

    DOI： 10.11646/phytotaxa.309.1.2 　

    ISSN： 1179-3155

    eISSN： 1179-3163

  43. Confirmation of the occurrence of Portulaca okinawensis var. amamiensis (Portulacaceae) in Kakeroma Island of the Ryukyu archipelago, Japan. Peer-reviewed

    Goro Kokubugata, Takuro Ito, Masastugu Yokota

    Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series B　42　(2)　67-71　2016

    Publisher: National Museum of Nature and Science

    ISSN： 1881-9060

  44. Taxonomic reconsideration of Celtis biondii var. insularis in the Miyako Island Group of the Ryukyus based on morphological and molecular data. Peer-reviewed

    The Journal of Phytogeography and Taxonomy　63　(1)　67-75　2016

    Publisher:

    ISSN： 0388-6212

  45. Taxonomic reexamination of Portulaca boninensis (Portulacaceae) in the Bonin (Ogasawara) Islands of Japan using molecular and morphological data Peer-reviewed

    Goro Kokubugata, Hidetoshi Kato, Duilio Iamonico, Hana Umemoto, Takuro Ito, Koh Nakamura, Noriaki Murakami, Masatsugu Yokota

    Phytotaxa　217　(3)　279-287　2015/06

    DOI： 10.11646/phytotaxa.217.3.5 　

    ISSN： 1179-3155

    eISSN： 1179-3163

  46. Nuclear and plastid DNA data confirm that Sedum tosaense (Crassulaceae) has a disjunct distribution between Pacific mainland Japan and Jeju Island, Korea Peer-reviewed

    Takuro Ito, Koh Nakamura, Chan-Ho Park, Gwan-Pil Song, Ayako Maeda, Yuki Tanabe, Goro Kokubugata

    Phytotaxa　177　(4)　221-230　2014/09

    DOI： 10.11646/phytotaxa.177.4.3 　

    ISSN： 1179-3155

    eISSN： 1179-3163

  47. Taxonomic reexamination of Sedum formosanum (Crassulaceae) in Japan, Taiwan, and the Philippines based on molecular data. Peer-reviewed

    The Journal of Phytogeography and Taxonomy　62　(1)　1-9　2014

    Publisher:

    ISSN： 0388-6212

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Misc. 3

  1. 日本産マンネングサ属（ベンケイソウ科）の分類学的再検討 Invited

    伊東拓朗

    植物地理・分類研究　74　(1)　17-31　2026/05

  2. マンネングサ属（ベンケイソウ科）の特異な生き様に着目した植物進化研究 Invited

    伊東拓朗

    植物地理・分類研究　67　(2)　117-125　2019

  3. 男女群島固有の新種ダンジョマンネングサについて

    中西弘樹, 伊東拓朗

    長崎県生物学会誌　(82)　4‐5　2018/06/30

    ISSN： 0387-4249

Books and Other Publications 6

  1. INDOOR JUNGLE Issue no.09 アロエ、多様性の美学

    伊東拓朗

    エムピージェー　2026/03

  2. INDOOR JUNGLE Issue no.05 南アフリカ・ビザールプランツ

    伊東拓朗

    エムピージェー　2025/03

  3. 趣味の山野草 2019年 09月号

    伊東拓朗

    栃の葉書房　2019/08

  4. 日本の多肉植物スタートBOOK

    伊東拓朗

    栃の葉書房　2018/06

  5. 趣味の山野草 2017年 04月号

    伊東拓朗

    栃の葉書房　2017/03

  6. 台灣山岳 117巻 12-1月号

    伊東拓朗, 游旨价

    台灣山岳　2015/11

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Presentations 112

  1. 南西諸島および小笠原諸島に分布する広義イワザンショウの進化史

    伊東 拓朗, 深谷 航, 井上 正隆, 牧 雅之, 國府方 吾郎

    日本植物学会第90回大会　2026/09

  2. Origins of Endemism on a Young Continental Island: Testing In Situ Diversification vs. Multiple Colonizations in Taiwanese Berberis

    2026/03

  3. 海洋島に進出したガクアジサイにおける種子散布能力低下プロセスの検討

    村上将希, 伊東拓朗, 上町達也, 藤井伸二, 堀江佐知子, 牧雅之

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  4. 特異な分布パターンを示すキバナアキギリの分布成立過程を考察する

    生田睦稀, 伊東拓朗, 藤井伸二, 山城考, 澁澤圭佑, 原田泰地, 深谷航, 保尊大志, 牧雅之

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  5. セリ科シシウド属トウキ類の多様性と 分化プロセスの解明

    澁澤圭佑, 伊東拓朗, 藤井伸二, 渡邊将人, いがりまさし, 髙橋大樹, 田金秀一郎, 深谷航, 牧雅之

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  6. 葉緑体DNAに基づくカラマツソウ属の形態的，生態的進化過程の検証

    道本佳苗, 髙橋大樹, 藤井伸二, 游旨价, 伊東拓朗, 牧雅之

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  7. 全ゲノム情報で紐解く日本産ヤナギ属の多様化過程

    深谷航, 伊東拓朗, 菊地賢, 逢沢峰昭, 牧雅之

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  8. Alpine origin, but persistence of Lagotis glauca in lowland, Rebun Island: successional arrest through ecological filtering by substrate rather than microclimateAlpine origin, but persistence of Lagotis glauca in lowland, Rebun Island: successional arrest through ecological filtering by substrate rather than microclimate

    Kaili YU, Yoshinori, MURAI, KOKUBUGATA, Tomoko FUKUDA, Chernyagina A OLGA, Seiji MURAYAMA, Masaaki OZEKI, Takuro ITO, Ken SATO, Koh, NAKAMURA

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  9. 東北アジアに分布するゲンカイツツジ-エゾムラサキツツジ種複合体の落葉性-半常緑性の南北分化の共通圃場試験

    冨田 優子, 福田 知子, 國府方 吾郎, 伊東 拓朗, 村井良徳, Myounghai Kwak, 中村 剛

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  10. ワタヨモギにおける雑種集団の特定と単系統性の検証

    新里 守礼, 小川誠, 石井千賀子, 伊東拓朗, 中村剛, 國府方吾郎

    日本植物分類学会第25回大会　2026/03

  11. 亜熱帯性ツツジ科植物ギーマにおける根分離菌株の二者培養を用いた共生能力検証

    佐藤創太, 馬場隆士, 廣瀬大, 伊東拓朗, 牧雅之

    菌根研究会2025年大会　2025

  12. 異なる土壌pH環境に生育するスノキ属植物の菌根菌相比較

    佐藤 創太, 馬場 隆士, 伊東 拓朗, 牧 雅之

    第61回根研究集会　2025

  13. Genetic Differentiation in Edaphic Endemic Thalictrum Driven by Climatic Change

    2025

  14. ため池減水裸地に特異的に分布するカヤツリグサ属植物の起源推定

    2025

  15. MIG-seq解析を用いた日本産広義カラマツソウ種内分類群の実体解明

    2025

  16. 伊豆諸島に進出した複数種における種子散布能力と遺伝的分化パターンの比較検証

    2025

  17. 広義ハマウドにおける系統地理学的解析と種子散布能力の集団間比較

    2025

  18. メタバーコーディングによる生育土壌pHの異なるスノキ属植物のエリコイド菌根菌相比較

    2025

  19. なぜウマノスズクサは日本で結実しないのか

    2025

  20. 琉球列島におけるツツジ科スノキ属のメタバーコーディングによるエリコイド菌根関連菌相解明

    佐藤 創太, 馬場 隆士, 伊東 拓朗, 國府方 吾郎, 牧 雅之

    菌根研究会2024年大会　2024

  21. 日本各地のイワウメ(イワウメ科)のフェノール化合物の地理的変異

    HIRANO Hyuga, KATO Toshiyo, NOGUCHI Keiichi, KAI Hisahiro, ITO Takuro, MURAI Yoshinori

    2024

  22. 植物における分散能力の変化:海洋島進出は分散能力の低下をもたらすか?

    2024

  23. ハイマツの気候変動レジリエンス:種間浸透交雑由来の適応的遺伝子

    2024

  24. ウスバサイシン節の保全遺伝学的研究

    2024

  25. 樹木の環境適応における種間浸透交雑の進化生態学的研究

    2024

  26. Probing the Role of Adaptive Introgression in Timberline Ecosystems' Response to Climate Changes Using Exome Capture Sequencing

    2024

  27. ベンケイソウ科メノマンネングサにおける異質倍数体形成過程の検証

    2024

  28. 種子植物 126 科 206 種の標本種子の発芽・生存可能性評価

    2024

  29. イヌビワ−イヌビワコバチ−イヌビワオナガコバチ共生系における比較系統地理学的解析

    2024

  30. 風穴地植物集団の起源の解明:異なる散布様式の種間比較

    2024

  31. 大津波が植物集団の遺伝的多様性に与えた影響:津波前後および地域間の比較解析

    2024

  32. 塩性湿地に特異的にみられるハママツナの系統地理学的解析

    2024

  33. 日本に広域分布するミヤマキケマン近縁分類群の系統地理学的解析

    2024

  34. 広義アキカラマツにおける風媒花と虫媒花のシフトに関する形態形質と遺伝学的解析

    2024

  35. シシウドおよびその近縁分類群の遺伝的分化

    2024

  36. 小笠原固有種ムニンテンツキおよび近縁種群の分類学的再検討

    2024

  37. ガクアジサイにおける海洋島進出過程の検証:分散能力の喪失は起こるか?

    2024

  38. 生態と分布に基づくコテングノコウガイ属菌の進化プロセスに関する考察

    2024

  39. 屋久島高標高域より発見されたオトギリソウ属未記載種

    2024

  40. 礫河原に特異的に生育するカワラハハコにおけるメタ個体群維持機構の検証

    2024

  41. 北日本に優占するハルニレは南方系: 遺伝構造と低温応答の緯度分化が示す分布拡大仮説

    2024

  42. ユキノシタ科ネコノメソウ属イワボタン列における分化プロセスの検証

    2024

  43. 邦産ビャクシン属ネズミサシ節における網羅的分子系統地理解析

    2024

  44. 日本と韓国で確認されたヤブコウジとツルコウジの雑種オオツルコウジ

    國府方吾郎, 柿嶋聡, 伊東拓朗, PARK Chan-ho, 阿部篤志, 石井千賀子, SONG Gwan-Pil

    日本植物学会第87回大会　2023/09

  45. Stepping-stone colonization pattern of Hydrangea macrophylla (Hydrangeaceae) on Japanese oceanic islands: Is gradual loss of dispersal ability underway?

    2023

  46. The ecological divergence processes of Anaphalis margaritacea var. yedoensis (Asteraceae), exclusively inhabiting gravel riverbanks, inferred by demographic modeling analysis

    2023

  47. 地史および人為によって形成された琉球列島における リュウキュウチク節分類群の遺伝的集団構造

    2023

  48. 植物標本と蛍光X線分析を用いた野生植物の元素集積傾向の解析(5)土壌の違いが野生植物の各種元素の集積量と相関性に与える影響

    2023

  49. 日本の島嶼域に隔離分布するオキナワハイネズ近縁種群の分子系統地理学的解析

    ポスター賞優秀賞　2023

  50. 局所環境のちがいがハイマツーキタゴヨウの種間交雑にもたらす影響

    2023

  51. Geographic Variation of Anti-stress Compounds Isolated from Sedum japonicum var. senanense

    2023

  52. 礫河原環境に特異的に生育するカワラハハコの起源を探る

    2023

  53. 沖縄島産アキカラマツ(キンポウゲ科)の分類群学的再検討

    2023

  54. 葉緑体DNAからみるウスバサイシン節の種間および種内の遺伝構造

    2023

  55. 4倍体キク科ヤマジノギク種群および近縁種の集団遺伝学的解析

    2023

  56. 与論島及びトカラ列島に産するマンネングサ属の未記載分類群

    2023

  57. バラ科シモツケ属の分子系統学・系統地理学的解析

    2023

  58. 東アジアで隔離分布する希少種ハコベマンネングサの種内系統解析

    2023

  59. ヒロハテイショウソウとテイショウソウの気候変動に伴う異所的種分化

    2023

  60. 日本産アジサイ属アジサイ節における異所的種分化過程の解明：いつ，どこで起きたか？

    2023

  61. 隔離分布種ハクサンボクにおける分子系統地理学的解析

    2023

  62. ため池減水裸地に優占するカヤツリグサ属植物に関する分子系統学的解析

    2023

  63. Population Genetic Structure of a Bamboo Taxon, Pleioblastus Sect. Pleioblastus, in the Ryukyu Islands Formed by Geohistory and Human Activity

    2022

  64. 広義ユキワリソウ(サクラソウ科)種内分類群の系統関係と分類学的検討

    2022

  65. 日本海浜における海流散布植物イワタイゲキ(トウダイグサ科)の地理的遺伝構造

    2022

  66. 植物標本と蛍光X線分析を用いた野生植物の元素集積傾向の解析(4)日本の野生植物におけるイオウとリンの集積傾向とその正の相関

    2022

  67. オキナワハイネズ(Juniperus taxifolia var. lutchuensis)を中心とした国内ビャクシン属種群の分子系統地理学的解析

    2022

  68. 日本産イワベンケイ属の自生地と栽培条件下におけるフェノール成分量の変動

    2022

  69. ハママンネングサ（Sedum formosanum）のシュート構成に関する形態学的解析

    2022

  70. 京都御苑固有植物カワセミソウの進化的起源と姉妹種サギゴケの遺伝構造

    2022

  71. イヌビワとその単食性昆虫イヌビワシギゾウムシの比較系統地理学的解析

    2022

  72. ソクシンラン属植物における共生菌の多様性

    2022

  73. ユキノシタ科ネコノメソウ属の分子系統解析を用いた分類学的再検討

    2022

  74. 渓流沿い植物アオヤギバナの収斂進化に関するトランスクリプトーム比較解析

    2022

  75. 新種発見が紐解く小笠原諸島に分布するマンネングサ属種群の進化史

    2022

  76. 日本産イワベンケイ属のフェノール化合物とその変異

    2022

  77. ヤマハハコ（広義）における地理的分化・生態的分化に関する分子系統学的解析

    2022

  78. フシノハアワブキ（広義）の隔離分布形成過程の検証

    2022

  79. 分子系統解析に基づく日本産イバラモ属の分類学的再検討

    2022

  80. 日本列島におけるテンナンショウ属の適応放散に送粉者相の転換が果たした役割

    2021

  81. 日本に2度やってきた国内絶滅危惧種タイワンホトトギス個体群

    2021

  82. 日本列島におけるテンナンショウ属の適応放散に送粉者相の転換が果たした役割

    2021

  83. 網羅的タクソンサンプリングに基づく分子系統解析から見えてきた日本産テンナンショウ属マムシグサ節の多様性と分類学的課題

    2021

  84. 日本産イバラモ属の分子系統解析ー見過ごされてきた日本新産分類群についての検討ー

    2021

  85. 日本産イラクサ属の分子データに基づく新分類群の発見と系統地理学的検討

    2021

  86. ヤマアジサイ（広義）および近縁種ガクアジサイにおける遺伝的分化と分布変遷

    2021

  87. 多様な環境に適応したキク科ヤマジノギク種群および近縁種の遺伝的関係

    2020

  88. マンネングサ属種群の小笠原諸島における海洋島進化プロセス

    2020

  89. ゲノムワイドSNPデータに基づく系統解析から明らかになるテンナンショウ属の多様化と送粉様式の進化

    2020

  90. 絶滅危惧種の分布フロント個体群を対象としたゲノムワイド解析

    2020

  91. 琉球諸島における非固有性の国内希少植物を対象とした保全遺伝学的解析

    2020

  92. RAD-seq解析により明らかになったハママンネングサ種内における隠蔽系統の存在

    2019

  93. ニッチ保護主義は,メキシコにおけるソテツ Dioon merolae (Zamiaceae)の生態学的種形成を促進する

    2019

  94. ユキモチソウのキノコ擬態による近縁種との生殖隔離

    2019

  95. ハウチワノキにおける核DNAデータを用いた小笠原・琉球への進入追跡

    2019

  96. 磯間岳固有ではなかったサツママンネングサ

    2018

  97. 海岸性マンネングサ属における特殊な分散様式の発見

    2017

  98. ユキモチソウ(サトイモ科:テンナンショウ属)で発見された驚くべき送粉様式

    2017

  99. 亜熱帯性海岸植物ハママンネングサは複数分類群を内包する―男女群島および宮古島から発見された2新種―

    2017

  100. 台湾高山におけるマンネングサ属 (ベンケイソウ科)の特殊な平行適応放散

    2017

  101. Unique parallel radiations of high-mountainous species of the genus Sedum (Crassulaceae) on the continental island of Taiwan

    Ito, T., C.C. Yu, K.F. Chung & G. Kokubugata

    XIX International Botanical Congress　2017

  102. なぜ台湾産マンネングサ属の適応放散は起きたのか？

    2016

  103. 台湾産マンネングサ属の平行的な適応放散と光合成型シフト

    2016

  104. Unique parallel radiations of genus Sedum (Crassulaceae) in a continental island of Taiwan

    Ito, T., C.C. Yu, K. Nakamura, K.F. Chung, Q. Yang, C.X. Fu, Z.C. Qi & G. Kokubugata

    East Asian Plant Diversity and Conservation 2016　2016

  105. 形態および分子データをもちいた小笠原産マルバケヅメクサの分類再検討

    2015

  106. 広義 Sedum japonicum（ベンケイソウ科）における分子系統解析を用いた分類学的再検討

    2015

  107. 適応放散を起こした台湾産マンネングサ属種の各種光合成様式タイプ

    2015

  108. ヤハズマンネングサ(ベンケイソウ科)の高知と済州島における隔離分布の検証

    2014

  109. アサガオにおける花色の濃さQTLとアントシアニン生合成関連遺伝子のマッピング

    2014

  110. 琉球列島産マンネングサ属2種の分子系統解析を用いた分類学的再検討

    2014

  111. 台湾高山に分布するマンネングサ属の系統地理

    2014

  112. EST-SSRとEST-SNPを用いたアサガオ連鎖地図の作成

    2013

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Research Projects 20

  1. 小笠原諸島を舞台とした植物における島症候群の進化パタンと駆動要因の包括的解明

    伊東拓朗, 髙橋大樹, 村上将希

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 基盤研究(B)

    2026/04 - 2030/03

  2. 河口慧海将来植物標本に注目したヒマラヤ・チベット伝統医学の異分野融合的研究

    加藤諭, 菊谷竜太, 髙浦佳代子, 伊東拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 挑戦的研究（萌芽）

    2026/07 - 2029/03

  3. ミュゼオミクスが解く津波からの植物集団の再生：撹乱は破壊か創造か

    牧 雅之, 山城孝, 藤井伸二, 伊東拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 挑戦的研究（萌芽）

    2026/07 - 2028/03

  4. 干潟特有の植物種集団における遺伝的多様性とその決定要因に関する網羅的・多面的研究

    牧 雅之, 伊東 拓朗, 藤井 伸二, 山城 考

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 基盤研究(B)

    Institution: 東北大学

    2025/04 - 2028/03

  5. 琉球低地と台湾高地に産する植物の分布成立過程の追跡と環境適応の解明

    國府方 吾郎, 傳田 哲郎, 中村 剛, 奥山 雄大, 伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 基盤研究(B)

    Institution: 独立行政法人国立科学博物館

    2024/04 - 2028/03

  6. 日露中韓共通の絶滅危惧植物の適応可能性を最大化する，東北アジアスケール保全単位

    中村 剛, 國府方 吾郎, 福田 知子, 村井 良徳, 伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 基盤研究(B)

    Institution: 北海道大学

    2024/04 - 2028/03

  7. 植物特性評価に基づいてブリトゥン島の荒野林を効果・効率的に保全する

    國府方 吾郎, 堤 千絵, 中村 剛, 伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 国際共同研究加速基金(海外連携研究)

    Institution: 独立行政法人国立科学博物館

    2023/09 - 2028/03

  8. 海洋島嶼におけるサンショウ属の被食防衛形質喪失過程の検証

    伊東拓朗

    Offer Organization: 市村清新技術財団

    System: 植物研究助成

    2026/04 - 2027/03

  9. 小笠原諸島の生態系保全に係る官学連携事業「エコロ知カルネットワーク」

    伊東拓朗

    Offer Organization: 東京都環境局

    2021/04 - 2027/03

  10. マンネングサ属種群における異質倍数体形成がもたらす環境適応メカニズムの検証

    伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業 若手研究

    Category: 若手研究

    Institution: 東北大学

    2022/04 - 2026/03

  11. 大規模撹乱と野生植物集団の遺伝的多様性：巨大津波を想定した前向き・後ろ向き研究

    牧 雅之, 伊東 拓朗, 藤井 伸二, 山城 考

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業

    Category: 基盤研究(B)

    Institution: 東北大学

    2022/04/01 - 2025/03/31

    More details Close

    本研究課題では大きく分けて3つのテーマを設定している．一つ目のテーマは，東日本大震災に伴う大津波の前後で植物集団の遺伝的組成がどのように変化したかを明らかにするものであり，津波以前に収集した集団サンプルと，大津波後に収集した集団サンプルの遺伝的特性を比較することを予定している．このテーマについては，海岸に特異的に見られるハマヒナノウスツボを対象に解析を行う予定であり，本年度は大津波以前に採取した集団とほぼ同じ地点で新たに集団サンプリングを用いて，ゲノム縮約的手法を行い，この種の場合には津波前後で大きな遺伝的多様性の変化が生じていない可能性を示唆するデータが得られている． 二つ目のテーマは，大津波の影響を受けた地域と受けていない地域で，同じ種の集団をサンプリングし，集団遺伝学的特性を比較することである．本年度は，北海道から九州までの範囲で，海岸に特異的な数種について集団サンプリングを行った．そのうち，数種についてゲノム縮約的手法による解析を行った結果，大津波の影響を強く受けている東北地方の集団と日本海側の集団の間に遺伝子流動が確認され，大津波後の撹乱によってできた空白地域に新たに集団が成立した可能性が示唆された．ただし，そのパターンには必ずしも共通性が見られるわけではないことが示唆された．引き続き，異なるハビタットに生育する複数種の植物を順次解析していくことで，大津波が沿岸域の植物集団の遺伝的組成に与えた影響に関する傾向を明らかにする予定である． 三つめのテーマは，実際の遺伝学的解析をもとに，今後予想される南海トラフに伴う大津波の影響を受ける集団について予想を行う課題であり，これについては今後研究を進める予定である．

  12. 琉球列島の荒野林に産する植物の現状把握に基づく保全指針の提示

    國府方 吾郎, 伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業 基盤研究(C)

    Category: 基盤研究(C)

    Institution: 独立行政法人国立科学博物館

    2021/04/01 - 2024/03/31

    More details Close

    沖縄島における荒野林の現状調査を行ったところ、島中部に存在していた荒野林が土地開発によって消滅していることが判明した。その情報を関係機関と共有するとともに、沖縄島の残された荒野林の保全を強化する必要があることを提言した。また、琉球固有で従来から個体数が少ないリュウキュウヒメハギは、これまでよりも個体数が激減していることから、その減少要因を特定し、種レベルでの保全を更に強化する必要があることが示唆された。 久米島において、自然の荒野林と1990年代の人為的伐採によってつくられた裸地における植物調査を行ったところ、後者には前者に特産する種が少ないことが示された。また、前者にはほとんど生育しない帰化種であるセンダグザ属が後者で多く認められた。これらの結果より、自然の荒野林と人工的な裸地との環境・栽培比較調査を行い、帰化種の出現に影響する要因を特定する必要があることが示唆された。荒野林に産する複数種において、自生地外保全のための栽培実験を行ったところ、タヌキアヤメなどはある程度の土壌保湿が必要であることが示され、荒野林に産する各種で最適な栽培環境がやや異なることが示された。 シンチクヒメハギについて台湾産を含めた解析したところ、南方から琉球列島への進入が示唆された。また、荒野林と常緑広葉樹林で著しい葉形態変異を示すギーマについて、先行調査によって琉球列島の主要な島から採集したサンプルをもとに次世代シーケンサーを用いて解析を行ったところ、各荒野林で認められる葉矮小化は独立して起こっている可能性が示唆された。更に、オオマツバシバの琉球列島内における集団間の遺伝的固有性・多様性を解析するため、小笠原固有のマツバシバおよび台湾・中国に産するタイワンマツバシバを国内外協力者から提供してもらい、今後の解析に備えた。

  13. 気候帯を超えて分布する植物種の周縁的種分化プロセスの検証

    伊東 拓朗

    Offer Organization: 市村清新技術財団

    System: 植物研究助成

    2022/04 - 2024/03

  14. 収蔵施設および分類群横断的調査に基づく博物館標本種子の発芽可能性の総合評価

    志賀 隆, 伊東 拓朗, 首藤 光太郎

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業 基盤研究(B)

    Category: 基盤研究(B)

    Institution: 新潟大学

    2021/04 - 2024/03

  15. 消滅の危機にあるブリトゥン島の荒野林における植物保全に関する緊急研究

    國府方吾郎

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 二国間交流事業

    2020/04 - 2023/03

  16. Oceanic island evolution in genus Sedum with specialized oceanic current dispersal ability Competitive

    Ito Takuro

    Offer Organization: Japan Society for the Promotion of Science

    System: Grants-in-Aid for Scientific Research

    Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

    2019/04/01 - 2022/03/31

    More details Close

    It is well known that plant species on oceanic islands undergo an habitat shift from coastal to montane habitats, associated with a loss of the ability of long-distance dispersal (LDD) of "seeds and fruits". Since the montane species Sedum boninense, endemic to the Bonin Islands, is sister to the coastal species S. uniflorum from the Ryukyu Archipelago and there is a coastal population on the Muko-jima Islands, I examined the evolutionary process of this species group as a model for the oceanic island evolution. The results showed that the Muko-jima Island pop. was a new species "Sedum mukojimense". In the past, S. uniflorum reached the Bonin Islands through the dispersal of "bulbs" by ocean currents, and S. mukojimense is thought to have speciated after secondary contact between S. boninense and S. uniflorum. Sedum boninense lost its LDD ability in the process of shifting to a montane habitat, and therefore underwent oceanic island evolution with both generality and uniqueness.

  17. 台湾産マンネングサ属の平行適応放散をモデルにした網羅的な適応進化プロセスの検証 Competitive

    伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費

    Category: 特別研究員奨励費

    2018/04/25 - 2021/03/31

    More details Close

    ベンケイソウ科マンネングサ属は東アジア地域を一つの多様性の中心に持ち，中でも大陸島台湾の高地環境おいて，劇的に異なる光・水分環境に進出し，種多様化を遂げている．これまでの申請者の研究から，台湾固有のマンネングサ属種は2系統存在し，各系統で異なる光・水分環境に生育する種が急速に進化し，かつ2系統で独立して類似生態シフトと適応形質（葉形態及び光合成特性）を獲得した急速な種多様化（平行適応放散）を遂げていたことが明らかになっている．しかしながらその種分化や適応放散プロセスの解明には至っていないため，本研究では当該種群をモデルとした，網羅的な環境-形態-生理-ゲノムデータに基づく非生物環境への適応放散/進化メカニズムの解明を目的として研究を進めている． 今年度は台湾の現地に設置済みの温度，湿度，照度計から環境データの収集を行う予定であったが，新型コロナウイルスの影響により海外渡航がかなわず，現地調査ができなかった．また不足していた集団解析用植物サンプルの調達もできなかったため，一部研究計画に支障がでてしまった．ゲノム解析について，追加で4種のゲノムリシーケンスを行い，昨年度の計画と併せて台湾産マンネングサ属全14種のリシーケンスデータを取得した．全14種について，別途葉緑体前ゲノムの構築を完了した．さらに１種について第三世代シーケンサーを用いたロングリード配列の取得を行い，ショートリードのリシーケンスデータを組み合わせてリファレンスゲノムの構築を行った．構築したドラフトゲノムを基に，リシーケンスデータを使用して集団動態解析を行い，不完全なデータではあるものの利用できる環境データおよび形態データを用いてその関連を検証している．

  18. 多様な光合成様式がマンネングサ属の種多様化をもたらしたことを検証する Competitive

    伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本学術振興会

    System: 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費

    Category: 特別研究員奨励費

    Institution: 東京農工大学

    2016/04/22 - 2018/03/31

    More details Close

    ベンケイソウ科マンネングサ属は東アジア地域を一つの多様性の中心に持つ。中でも亜熱帯・熱帯域に位置し、発達した高山を有する大陸島台湾は著しく同属種の固有種率が高く、特に高地環境の異なる光・水分環境に生育し、種分化を遂げている。本研究課題ではこれらの種多様化の要因を探るため、分子系統解析を用いた詳細な種間関係の推定と、多様な光合成様式をもつ本属の特徴に着目した適応形質の探索、それに関連する遺伝子群を検出・配列比較を行った。 核・葉緑体複数領域に基づく東アジア産同属種の系統解析の結果、台湾固有種は2系統からなり、それぞれ類似したニッチシフトと急速な種多様化を遂げていた。さらにRAD-seqを用いた配列比較の結果、より明瞭に種間の関係性を認識できた。分岐年代推定の結果、2系統の急速な種多様化は、特に高地性の種でほぼ同時期の約80万年前に開始しており、山脈形成に伴う爆発的な種多様化の成立を示唆した。祖先形質復元の結果、各系統はそれぞれ中国東部と日本の系統が独立的に移入したことを示唆した。 適応形質の探索のため、安定炭素同位体比解析を用いて光合成特性の評価を行った結果、明乾燥環境種はweak CAM型、暗湿潤環境種はC3型光合成を駆動している可能性があり、光合成特性と環境の関連が示唆された。葉形態比較では、異なる環境に生育する種間で、乾燥ストレスや光合成効率の点から各環境に適応的な葉断面構造などの葉形態を持つことが明らかになった。適応形質に関連した遺伝子群の探索については、現在データ解析を行っており、一定の結果を得ている。 以上より、台湾産マンネングサ属種は2つの系統が独立的に急速な種多様化をとげ、湿度や光環境に対して適応的な光合成特性や葉形態を獲得した特殊な平行適応放散が起きたと考えられる。またその成立には高山を有する大陸島という台湾の環境特性が深く関与していると考えられる。

  19. 特殊な光合成様式をもつマンネングサ(Sedum) 属における適応遺伝子の探索 Competitive

    伊東 拓朗

    Offer Organization: 日本科学協会

    System: 笹川研究助成学術研究部門

    2015/04 - 2016/03

  20. 台湾と日本に分布している絶滅危惧植物の分類問題を検証する Competitive

    伊東 拓朗

    Offer Organization: 公益財団法人交流協会

    System: 若手研究者交流事業（台湾）

    2014/07 - 2014/08

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Teaching Experience 10

  1. 短期プロジェクト: 生態と進化（東北大学）

  2. 生態学実習（東北大学）

  3. 生物学演習I（東北大学）

  4. 先端生態発生適応科学特論Ⅲ（東北大学）

  5. 分子・細胞生物学特選科目（東北大学）

  6. 博物館実習（東北大学）

  7. 進化学実習（東北大学）

  8. 植物系統分類学実習（東北大学）

  9. 自然科学総合実験（東北大学）

  10. 基礎ゼミ（東北大学）

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